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        河南地區(qū)1 182例經(jīng)典型骨髓增殖性腫瘤患者群體特征及實驗室檢查結(jié)果回顧性分析

        2022-06-14 02:55:02唐婉王小樂袁小庚韓雪瑩張暋
        河南醫(yī)學(xué)研究 2022年10期
        關(guān)鍵詞:基因突變骨髓測序

        唐婉,王小樂,袁小庚,韓雪瑩,張暋

        (鄭州金域臨床檢驗中心有限公司,河南 鄭州 450016)

        骨髓增殖性腫瘤(myeloproliferative neoplasm,MPN)是一組起源于造血干細(xì)胞的惡性克隆性疾病,特征表現(xiàn)為一系或多系成熟髓系細(xì)胞過度增殖,常伴有肝、脾腫大和出血傾向、血栓形成及髓外造血[1]。根據(jù)2016年第4版WHO造血與淋巴系統(tǒng)腫瘤分類目錄,經(jīng)典的MPN包括費(fèi)城染色體(philadelphia chromosome,Ph)陰性的真性紅細(xì)胞增多癥(polycythemia vera,PV)、原發(fā)性血小板增多癥(essential thrombocythemia,ET)、原發(fā)性骨髓纖維化(primary myelofibrosis,PMF)和BCR-ABL融合陽性的慢性髓細(xì)胞性白血?。╟hronic myelogenous leukaemia,CML)[2];臨床診斷分型除血常規(guī)檢驗外,還依賴細(xì)胞形態(tài)學(xué)、免疫學(xué)、細(xì)胞遺傳學(xué)和分子生物學(xué)檢測技術(shù),即MICM診斷體系。骨髓活檢和骨髓涂片用于辨別骨髓細(xì)胞形態(tài)和病理特征,流式細(xì)胞術(shù)用于辨識骨髓血細(xì)胞免疫表型,而染色體核型分析和驅(qū)動基因突變檢測則有助于疾病分型及預(yù)測預(yù)后[3]。

        本研究整理回顧所收集的經(jīng)典型MPN確診病例的基本信息和各項檢查結(jié)果,按疾病亞型分組,分析MICM框架下多種檢測方法聯(lián)合應(yīng)用在MPN診斷、分型、預(yù)后中的臨床價值。

        1 資料與方法

        1.1 資料收集2019年1月至2021年5月河南省轄各市縣(包括17個地級市和1個省直轄縣級市)醫(yī)療機(jī)構(gòu)送檢鄭州金域臨床檢驗中心有限公司的已確診或疑診為MPN的病例,結(jié)合臨床信息及在本公司實驗室獲得的骨髓病理及分子檢測結(jié)果,排除診斷為其他或疾病未明的,最終篩選出1 182例可確診為MPN的病例,患者年齡1~89歲,中位年齡63歲,其中男560例,女622例。

        1.2 方法實驗室檢測方案依據(jù)MICM診斷體系,結(jié)合骨髓形態(tài)學(xué)、免疫學(xué)、細(xì)胞遺傳學(xué)和分子生物學(xué)等多技術(shù)平臺檢測優(yōu)勢,為MPN的診斷分型提供客觀依據(jù)。

        1.2.1 骨髓活檢和骨髓涂片法 采用骨髓活檢和骨髓涂片法辨別骨髓細(xì)胞形態(tài)和病理特征。骨髓活檢組織標(biāo)本經(jīng)預(yù)處理后包埋并制成切片,采用蘇木精-伊紅染色法和網(wǎng)狀纖維染色法進(jìn)行常規(guī)染色,光鏡下觀察并描述鏡下所見;骨髓涂片標(biāo)本進(jìn)行瑞氏吉姆薩染色,低倍鏡下觀察200個有核細(xì)胞,對所觀察的細(xì)胞進(jìn)行分類并計數(shù)。

        1.2.2 流式細(xì)胞術(shù) 采用流式細(xì)胞術(shù)識別骨髓血細(xì)胞免疫表型,檢測抗體包括CD2、CD3、CD4、CD5、CD8、CD10、CD11b、CD13、CD14、CD15、CD16、CD19、CD20、CD33、CD34、CD36、CD45、CD56、CD7、CD64、CD117、CD71、CD41、HLA-DR、IgG1、Kappa、Lambda、CD38、CD138等,取EDTA抗凝骨髓100μL分別加入相應(yīng)的抗體組合試管中,充分混勻、孵育、裂解紅細(xì)胞、洗滌及固定,在FC500-MXP流式細(xì)胞儀上進(jìn)行檢測并分析。

        1.2.3 核型分析 采用G顯帶法核型分析觀察染色體異常,應(yīng)用短期培養(yǎng)法培養(yǎng)骨髓細(xì)胞,制成染色體分析標(biāo)本并應(yīng)用G顯帶技術(shù)顯帶,根據(jù)《人類細(xì)胞遺傳學(xué)國際命名體制(ISCN,2009)》進(jìn)行核型描述。

        1.2.4 基因突變檢測 采用實時熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)、熒光原位雜交(fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)、毛細(xì)管電泳、下一代測序(next generation sequencing,NGS)等檢測基因突變。采用Qiagen 51106 QIAamp DNA Blood Mini Kit和52304 QIAamp RNA Blood Mini kit試劑盒分別提取骨髓樣本中DNA和RNA。

        1.2.4.1 實時熒光定量PCR 應(yīng)用ABI 7500實時熒光PCR儀定量分析JAK2 V617F突變及BCR-ABL融合基因。JAK2定量分析采用Qiagen 673613 JAK2 RGQ PCR Kit試劑盒分別對V617F突變型和野生型DNA拷貝數(shù)進(jìn)行定量檢測,通過計算V617F突變型所占百分比,判斷患者JAK2基因V617F突變狀態(tài)。

        BCR-ABL融合基因定性檢測需從骨髓或外周血樣本中提取RNA,使用上海源奇白血病相關(guān)融合基因突變檢測試劑盒進(jìn)行檢測,以ABL基因為內(nèi)參對照,報告BCR-ABL融合基因與內(nèi)參ABL基因的拷貝數(shù)比值,并以百分?jǐn)?shù)的形式表示。檢測范圍覆蓋p190、p210、p230融合型。

        1.2.4.2 毛細(xì)管電泳 采用毛細(xì)管電泳片段分析法檢測CALR基因9號外顯子的插入/缺失突變,下機(jī)數(shù)據(jù)使用GENEMAPPER V5.0分析;Sanger測序法檢測MPL基因W515位點及JAK2基因12、13號外顯子突變,應(yīng)用Sequencher軟件分析測序峰圖,依據(jù)人類基因組變異協(xié)會(Human Genome Variation Society,HGVS)規(guī)則命名變異,毛細(xì)管電泳和Sanger測序所用基因分析儀型號為ABI 3500xL Dx。

        1.2.4.3 NGS 定制探針靶向捕獲MPN相關(guān)基因(ABL1、ASXL1、ATG2B、BLM、CALR、CBL、CDKN2A、CSF3R、DNMT3A、EGLN1、EZH2、IDH1、IDH2、JAK2、KRAS、MPL、MYC、NRAS、PDGFRA、PDGFRB、RUNX1、SETBP1、SF3B1、SH2B3、SRSF2、TET2、TP53、U2AF1)外顯子區(qū)域,KAPA 試劑構(gòu)建文庫,應(yīng)用illumina Novaseq儀器上機(jī)測序,可檢測的突變類型有點突變、小片段插入/缺失、剪切子變異等,測序深度可達(dá)1 000X以上。

        2 結(jié)果

        2.1 河南地區(qū)經(jīng)典MPN患者群體特征在1 182例確診為MPN的病例中,患者年齡范圍為1~89歲,其中男560例(47.3%)、女622例(52.7%);經(jīng)綜合分析臨床信息和實驗室檢查結(jié)果,共有1 134例(95.9%)確診為經(jīng)典型MPN,性別和年齡段分布見表1。

        數(shù)據(jù)顯示,總體上50~79歲的患者人數(shù)最多,占比76.5%。按亞型分類,分別有28.2%、43.2%、16.2%和12.3%的病例確診為PV、ET、PMF和CML。從年齡分布來看,PV和PMF的發(fā)病年齡均不早于30歲,ET可在10歲以后發(fā)病,而CML發(fā)病年齡可提早至1~10歲。統(tǒng)計分析各亞型患者性別比例,PV和PMF組男、女患者占比相當(dāng);ET和CML中男、女患者占比均不同,ET組男、女比例約為2∶3,而CML組為3∶2。對比疾病最高發(fā)年齡段發(fā)現(xiàn)PV和PMF男、女均為60~69歲;而ET和CML有所不同,ET女性患者為70~79歲,較男性患者晚,CML男性患者為50~59歲,較女性患者早。

        在確診為PV的病例中,臨床多描述有紅細(xì)胞增多、全血細(xì)胞增多、三系升高等血象,個別有白細(xì)胞增高,其中7例確診為隱匿性PV,1例伴有腦梗死,1例有慢性乙肝病史。ET患者最顯著的特征有血小板、白細(xì)胞升高,個別病例有頭痛、脾大、消化道出血;1例有腦梗死和高血壓,1例伴有冠心病,2例伴有貧血。PMF患者特征多為白細(xì)胞升高、全血細(xì)胞減少以及骨髓纖維化,部分患者臨床表現(xiàn)有發(fā)熱、脾大或貧血;CML血象多數(shù)表現(xiàn)為白細(xì)胞顯著升高,5例有血小板升高表現(xiàn),81例診斷為慢性期,1例診斷為急性期。其余48例MPN因現(xiàn)有臨床證據(jù)不足或檢測結(jié)果不全無法分型,未進(jìn)行群體特征分析。

        2.2 實驗室檢查結(jié)果統(tǒng)計

        2.2.1 骨髓活檢及骨髓涂片檢測結(jié)果 本研究中,PV、ET、PMF和CML組分別有293例(91.6%)、477例(97.4%)、172例(93.5%)、116例(82.9%)的患者接受了骨髓活檢檢查;分別有218例(68.1%)、264例(53.9%)、94例(51.1%)、76例(54.3%)的患者選擇了骨髓涂片檢查。經(jīng)典MPN 4種亞型中,骨髓活檢檢出率均高于骨髓涂片。見表2。此外,骨髓活檢結(jié)果提示了7例隱匿性PV。在PMF中提示了疾病分級,診斷44例為纖維化前期、10例MF-1級、29例MF-2級和25例MF-3級;在CML中,81例依據(jù)活檢結(jié)果診斷為慢性期。

        表2 PV、ET、PMF、CML骨髓活檢和骨髓涂片檢出率(%)

        2.2.2 常見驅(qū)動基因突變檢測結(jié)果 經(jīng)典型MPN常見的驅(qū)動突變?yōu)镴AK2基因V617F、JAK2基因外顯子12/13、CALR基因外顯子9的缺失/插入突變、MPL基因W515位點突變以及BCR-ABL基因融合。在Ph陰性的MPN中檢出率最高的為V617F突變,在PV中可達(dá)90%以上,在ET和PMF中的檢出率約為70%。JAK2外顯子12/13突變罕見,在PV中檢出率最高,但不及3%。CALR缺失/插入突變僅在ET和PMF中檢出且檢出率相近,主要為缺失52堿基的L367fs*46突變,插入5堿基的K385fs*4突變次之,其他突變類型少見。MPL基因W515同樣僅在ET和PMF中檢出,檢出率均小于5%,氨基酸改變形式以W515L居多,其次為W515K/A/R。CML中僅檢出BCR-ABL基因融合,檢出率為100%。見表3。

        表3 常見驅(qū)動基因突變位點檢出率比較[n(%)]

        PV、ET和PMF組中分別有284、449和167例檢測了上述4種驅(qū)動突變,大部分Ph陰性MPN病例僅檢測到1種驅(qū)動突變,即“單陽型”;少部分病例未檢測到上述任一變異,簡稱為“三陰性”Ph陰性MPN;有極少數(shù)病例檢測到2種驅(qū)動突變,即“雙陽型”。PV組中,有1例JAK2基因V617與12號外顯子共突變;ET組中,有10例JAK2基因V617與CALR基因共突變,1例JAK2基因V617與MPL基因W515共突變,PMF組中發(fā)現(xiàn)2例JAK2基因V617與MPL基因W515突變雙陽性。較PV和PMF組,ET單陽型的比例略低,而三陰型和雙陽型比例略高。見表4。

        表4 Ph陰性MPN驅(qū)動突變類型頻率比較(%)

        2.2.3 核型分析結(jié)果 經(jīng)典型MPN的核型異常均以結(jié)構(gòu)異常為主,主要有缺失、插入、重復(fù)、倒位等。4種亞型相比,CML異常核型檢出率最高,結(jié)構(gòu)異常檢出率超過95%,所有結(jié)構(gòu)異常的病例均檢測到t(9;22)(q34;q11.2),其中2例伴有數(shù)目異常。PV中檢測到+9、-12、-22等數(shù)目異常,ET和PMF中以+8最常見。見表5。

        表5 核型異常檢出率比較[n(%)]

        2.3 MPN相關(guān)基因突變統(tǒng)計在PV、ET、PMF和CML中分別有32例、38例、21例和13例MPN相關(guān)基因檢測NGS套餐檢測結(jié)果,分別占各組全部確診患者的10.0%、7.8%、11.4%和9.3%。

        在PV組中,32例均檢測到JAK2 V617F突變,其中20例單有V617突變(占比62.5%),4例伴有ASXL1基因突變,6例伴有TET2基因突變,2例伴有ATG2B基因突變,分別各有1例伴有DNMT3A、BLM和IDH2基因突變。在ET組中,22例檢測到JAK2 V617F突變,其中10例單有V617突變,伴有TET2和DNMT3A基因突變的各有3例,另外3例分別伴有BLM、CBL、SF3B1和SRSF2基因突變;7例CALR突變,4例伴有DNMT3A、TET2、SH2B3基因突變中的1種或2種;1例MPL基因突變,其中1例伴有DNMT3A和TET2突變。與PV相比,ET組基因突變譜較復(fù)雜,2~3基因共突變的有18例,占比約50%。在PMF組中,有16例檢測到JAK2 V617F突變,除3例外,其余還伴有其他基因突變,其中9例伴ASXL1基因突變,其他伴隨出現(xiàn)的突變基因有IDH1(2例)、ATG2B(1例)、SF3B1(2例)、KRAS(1例)、DNMT3A(1例)、CSF3R(1例);有4例檢測到CALR突變,其中3例伴TET2,1例伴DNMT3A;1例單獨檢測到MPL突變。共有17例有2種及以上基因突變,其中JAK2伴ASXL1突變最多。在CML組中,僅有5例檢測結(jié)果為陽性,分別為2例ASXL1、1例CBL、1例MYC和1例STAG2單獨突變,基因突變譜較為單一。

        3 討論

        本研究所收集的1 182例河南地區(qū)經(jīng)典型MPN病例覆蓋地區(qū)廣,入組人群年齡范圍較大,具有一定的代表意義。在臨床信息和檢測結(jié)果充分的基礎(chǔ)上95%以上的病例得以確診分型。按照疾病亞型、性別和年齡分組統(tǒng)計有益于辨識不同亞型患者的特征,從而為疾病的預(yù)防和診療提供參考。河南地區(qū)經(jīng)典型MPN高發(fā)年齡為50~79歲,按照發(fā)病率高低排序依次為ET、PV、PMF、CML。PV和PMF男女患者比例相當(dāng),ET女性患者較多,CML可累及嬰幼兒。目前尚未發(fā)現(xiàn)河南或國內(nèi)其他地區(qū)大規(guī)模MPN群體特征統(tǒng)計數(shù)據(jù)的其他報道,無法進(jìn)行比較,本研究所涉及的病例數(shù)及時間范圍畢竟有限,僅供參考。

        本研究表明,詳細(xì)的臨床信息和全面的實驗室檢查結(jié)果對于MPN的診斷分型必不可少。血常規(guī)等檢查結(jié)果作為臨床信息通常由送檢的醫(yī)療機(jī)構(gòu)提供,流式細(xì)胞術(shù)檢測快速,可用于分析骨髓血細(xì)胞免疫表型,分析原始細(xì)胞占比,是輔助診斷重要的技術(shù)之一。骨髓活檢和骨髓涂片是診斷血液病最常用的細(xì)胞形態(tài)學(xué)檢測手段,對疾病的診斷、分型和分期具有重要的參考價值。統(tǒng)計數(shù)據(jù)顯示,接受骨髓活檢檢查的患者人數(shù)占比較骨髓涂片高30% ~40%,骨髓活檢在4種疾病亞型的檢出率普遍在80%以上,PMF中最高,可達(dá)到92%,而骨髓涂片僅能提示10%的PMF。同樣地,PV組骨髓活檢的檢出率高于骨髓涂片。此外,骨髓活檢還有助于CML分期。由此可見,在經(jīng)典型MPN中骨髓活檢更具診斷價值。但仍然建議在條件許可的情況下兩者兼用,避免漏診其他髓系疾?。?-7]。

        隨著實驗室和臨床研究的進(jìn)展,越來越多的MPN相關(guān)基因及其診斷預(yù)后意義被列入國內(nèi)外指南和共識。本研究中入組病例MPN驅(qū)動基因的檢測率達(dá)90%以上,JAK2 V617F和BCR-ABL融合基因最高,二者變異檢出率也最高,CML中染色體核型異常檢出率達(dá)95%,與BCR-ABL融合基因檢出率基本一致,兩者結(jié)合可作為CML主要診斷依據(jù)。JAK2 V617因在PV、ET和PMF中均有檢出不能作為分型的依據(jù);但根據(jù)目前的研究結(jié)果,攜帶CALR和MPL基因突變的MPN基本可排除PV[8]。Sanger測序及NGS結(jié)果均顯示JAK2 12、13外顯子突變檢出率最低,針對經(jīng)濟(jì)狀況稍差的患者,可在其他診斷證據(jù)不足時再考慮檢測。CALR和MPL基因突變有助于確診MPN,但在鑒別診斷ET和PMF時需結(jié)合其他檢查結(jié)果,如骨髓活檢。約90%以上的MPN僅攜帶1種驅(qū)動基因突變,與PV和PMF相比,ET驅(qū)動基因單陽頻率略低,而三陰性和驅(qū)動突變雙陽性的頻率略高,結(jié)合NGS檢測結(jié)果分析,ET的基因突變譜可能最為復(fù)雜,PMF次之。本次研究未在PV中發(fā)現(xiàn)JAK2與CALR或MPL共突變的情況,NGS結(jié)果也顯示JAK2突變占主導(dǎo)地位,是基因突變譜較為“單純”的亞型。CML組NGS結(jié)果多為陰性,而其驅(qū)動突變的高檢出率證實其突變譜較為單一,但此次入組病例較少,還需更多數(shù)據(jù)加以證實。有文獻(xiàn)報道了JAK2、CALR、MPL單驅(qū)動基因突變及三陰型在PV、ET和PMF中的檢出率[9],本次研究結(jié)果與之對比,基本符合。

        據(jù)統(tǒng)計,絕大多數(shù)疑診為MPN的患者優(yōu)先選擇了快速的驅(qū)動突變檢測小套餐,僅有約10%的患者選擇了NGS檢測的MPN相關(guān)基因套餐。但最新的NCCN指南提示,除經(jīng)典的驅(qū)動基因外,某些基因突變對預(yù)后有重要影響,如在PMF中,CALR突變而ASXL1未突變的類型預(yù)后最好(平均生存期10.4 a),反之最差(平均生存期2.3 a),兩者同時突變或不突變的預(yù)后中等(平均生存期5.8 a)。本研究中有42.9%的PMF患者為ASXL1+/CALR-型,提示預(yù)后較差。在PV中,ASXL1、IDH1/2、RUNX1、SRSF2、SF3B1也是預(yù)后預(yù)測的重要因子。本次研究發(fā)現(xiàn)DNMT3A和TET2突變頻率也較高,在PV、ET及PMF中都有檢出,有文獻(xiàn)報道TET2、DNMT3A為DNA甲基化調(diào)節(jié)因子,可能先于JAK2 V617突變,在推動疾病進(jìn)展中起作用[10]。臨床應(yīng)推薦已初步確診分型的患者進(jìn)一步接受NGS檢測以明確預(yù)后和后續(xù)監(jiān)測。

        各種檢測技術(shù)各有優(yōu)劣,相輔相成。qPCR、毛細(xì)管電泳等技術(shù)檢測速度快,但檢測的基因突變位點有限,通量不高,Sanger測序較NGS快速,但僅能檢測已知突變,靈敏度低,突變頻率低于10%時極大概率漏檢,不適用于療效監(jiān)測。有研究報道,應(yīng)用全外顯子二代測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)了三陰性MPN患者存在非典型驅(qū)動突變和非驅(qū)動基因突變,有助于解釋其發(fā)病機(jī)制[11]。此外,在臨床實踐中NGS對于殘留病灶或疾病進(jìn)展的監(jiān)測以及靶向治療效果預(yù)測方面具有積極作用,可使患者收益[12]。針對經(jīng)濟(jì)條件較好的患者,應(yīng)推廣NGS檢測,有助于發(fā)現(xiàn)更多與疾病相關(guān)的基因突變信息,從而不斷完善疾病數(shù)據(jù)庫,促進(jìn)靶向藥物的開發(fā)及更多的臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用。綜上,全面的實驗室檢查對疾病的確診、分型及預(yù)后具有重要的意義,臨床需要結(jié)合疾病的特征及技術(shù)的優(yōu)劣勢選擇合適的檢查項目,以期快速精準(zhǔn)地獲得診療依據(jù)。

        本研究基于現(xiàn)有數(shù)據(jù)對河南地區(qū)MPN患者的群體特征及實驗室檢查結(jié)果做了一個回顧性統(tǒng)計分析,以期為臨床診療提供一些參考,但礙于臨床信息有限,結(jié)論存在一定局限性,需更多數(shù)據(jù)加以佐證。

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