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        蕎麥根際微生物的分離及生物活性檢測

        2022-06-13 09:43:00張婉麗趙雅慧吉慧敏王東勝
        山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年5期
        關(guān)鍵詞:株菌解磷放線菌

        張婉麗,趙雅慧,吉慧敏,王東勝

        (山西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,山西 太原 030031)

        蕎麥(Fagopyrum esculentum Moench),又稱烏麥、三角麥,為蓼科蕎麥屬草本植物。蕎麥原產(chǎn)于中國,主要分布在北方以及西南地區(qū),如陜西、內(nèi)蒙古、云南、四川。蕎麥富含蛋白質(zhì)、維生素、礦物質(zhì)、黃酮類物質(zhì)等,對許多疾病有一定的預(yù)防效果,是一種兼?zhèn)涫秤门c藥用的優(yōu)良作物。隨著社會經(jīng)濟的發(fā)展,人們保健意識的增強,包括蕎麥在內(nèi)的一些小雜糧需求量不斷增大。雖然我國蕎麥種植面積居世界前列,但單位面積產(chǎn)量(850 kg/hm2)相較其他國家卻很低[1-3]。已有學(xué)者通過育種技術(shù)[4]以及轉(zhuǎn)基因技術(shù)[5]對提高蕎麥產(chǎn)量進行研究,但從根際微生物方面改善蕎麥生長條件卻鮮有報道。

        根際概念最早于1904年由德國科學(xué)家Lorenz Hiltner提出,指緊貼于根系的薄層土壤,該處土壤由于受到根系生長代謝的影響,表現(xiàn)出與周圍土體不同的理化性質(zhì)。生長在根際土壤中的微生物稱為根際微生物[6]。根際是植物與土壤進行交互作用的關(guān)鍵點,根際微生物在植物生長和土壤養(yǎng)分循環(huán)中的作用已成為近年來微生物的研究熱點[7-9]。大量研究表明,植物-根際微生物互作對植物健康生長起著重要作用,根系通過富集周圍土壤的特定菌群,造成根際微生物多樣性低于非根際土壤,但數(shù)量卻高于非根際土壤[10]。植 物 的 類 型[11]、生 育 時 期[12]、生 長 環(huán)境[13]均會對根際微生物的種類組成及生態(tài)分布產(chǎn)生影響。同時,根際微生物可以通過促生機制、生防機制來促進植物生長。如溶磷菌可以將環(huán)境中難溶無機磷轉(zhuǎn)換成植物可吸收形式促進種子萌發(fā),增加干重[14];鏈霉菌通過拮抗病原菌降低黃瓜立枯病發(fā)病率,提高種子發(fā)芽率,促進幼苗生長[15];此外,根際微生物還可以影響氮的有效性,將色氨酸轉(zhuǎn)換為吲哚乙酸調(diào)控植物開花時間,以此進一步促進植物生長[16]。

        目前我國許多地區(qū)存在過量及不平衡施肥等問題,一方面會污染環(huán)境,使得土壤理化性質(zhì)發(fā)生改變,土體質(zhì)量下降,農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)受到影響,另一方面還會增加農(nóng)戶生產(chǎn)成本(化肥占生產(chǎn)總物資費用50%左右)[17]。根際益生菌是菌肥的主要菌種來源,在可持續(xù)農(nóng)業(yè)發(fā)展中有著巨大的應(yīng)用潛力。隨著生物技術(shù)的發(fā)展,將有益微生物制作成菌肥來代替一部分化肥越來越成為可能。馬軍妮[18]用婁徹氏鏈霉菌和密旋鏈霉菌制成放線菌菌劑,可提高幼苗總鮮重、葉片凈光合速率和根系誘導(dǎo)酶活性,增強小麥抗逆性、穗粒重等。周冬梅[9]從擬南芥根際中篩選出兩株具有抗旱能力的菌株Burkholderia sp.ARD10和Mitsuaria sp.ARD17,均具有產(chǎn)生EPS和ACC脫氨酶的能力,經(jīng)過對玉米的促生試驗發(fā)現(xiàn),在干旱條件下能顯著提高葉片含水量、脯氨酸積累量以及過氧化物酶(POD)活性,還可提高玉米在干旱脅迫中的激素含量,從而提高干旱耐受性。目前有關(guān)蕎麥根際微生物的報道很少,因此本試驗以蕎麥為研究對象,從其根際土壤篩選出具有抗菌活性、解磷活性及產(chǎn)蛋白酶和淀粉酶能力的菌株,旨在篩選出具有促生功能的有益菌并開發(fā)成菌肥,從而促進蕎麥增產(chǎn)和綠色農(nóng)業(yè)發(fā)展。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        土樣來自晉蕎(苦)5號根際,蕎麥于2020年10月26日采自于山西省晉中市太谷縣侯城鄉(xiāng)孟家莊村(112.595583°E,37.439568°N,海拔769~830 m),密度90萬株/hm2。樣品于-80℃保存。

        1.2 試驗方法

        1.2.1 樣品預(yù)處理 輕輕抖落掉與蕎麥根系附著不緊密的土壤,將根與附著土壤一起稱重后,放入90 mL無菌水中洗凈撈出,擦干稱重,兩者重量之差即為根際土壤重量(0.5 g),根際土壤溶液記作10-2。將根際土壤溶液放入錐形瓶搖床振蕩30 min使其充分混勻,使用移液管吸取1mL轉(zhuǎn)入裝有9 mL無菌水試管中,記作10-3,依次稀釋為10-4、10-5。

        1.2.2 根際微生物的分離純化 采用稀釋平板涂布法進行分離。細菌涂布于牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基(BPA)[19],放線菌涂布于高氏一號(GA)[19]、TWYE[20]、ISP2[21]培養(yǎng)基,稀釋梯度均選取10-3、10-4、10-5。真菌接種于馬鈴薯葡萄糖培養(yǎng)基(PDA)[19],稀釋梯度選取10-2、10-3、10-4。每個梯度3個重復(fù),共45(5×3×3)個平板。置于28℃恒溫箱中,細菌培養(yǎng)2~3 d,真菌培養(yǎng)3~4 d,放線菌培養(yǎng)7~8 d。挑取形態(tài)、大小不同的菌株采用平板劃線法進行純化,重復(fù)2~3次,直至出現(xiàn)單菌落。編號后于斜面中保藏備用。

        1.2.3 生物活性檢測

        (1)菌株活化:將保藏真菌接種于PDA培養(yǎng)基中進行活化;細菌、放線菌分別涂布于BPA、GA培養(yǎng)基中進行活化,完成后用6 mm直徑打孔器打孔備用。

        (2)抗菌活性檢測:供試病原菌均由山西師范大學(xué)微生物實驗室提供,分別為大腸桿菌(Escherichia coli)、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、青霉菌(Penicillium sp.)、酵母菌(Saccharomyces cerevisiae)。在接種靶標菌的試管中注入適量無菌水,輕輕抽提攪拌,制成懸菌液。使用移液管將病原細菌懸菌液滴至BPA培養(yǎng)基中,病原真菌滴至PDA培養(yǎng)基中,用涂布器均勻涂開。

        放線菌和真菌采用瓊脂塊法[19]:28℃培養(yǎng)1~2 d,觀察是否產(chǎn)生透明圈,并記錄透明圈直徑。細菌采用對峙法[22]:28℃培養(yǎng)1 d,觀察十字交叉處靶標菌的生長情況。

        (3)酶活性檢測:培養(yǎng)基為H1-1培養(yǎng)基[23],放線菌和真菌采用瓊脂塊法,28℃培養(yǎng)2~3 d;細菌采用點接法[24],37℃培養(yǎng)1~2 d。檢測蛋白酶活性時,可直接觀察透明圈;檢測淀粉酶活性時,滴加適量碘液后觀察菌落周圍是否產(chǎn)生透明圈。

        (4)解磷活性檢測:采用點接法,培養(yǎng)基為磷酸鈣固體培養(yǎng)基[25],28℃培養(yǎng)3~4 d,觀察透明圈。

        1.2.4 菌種鑒定 對所篩選廣譜活性菌株進行鑒定,由上海派森諾基因科技有限公司完成。將所測真菌序列利用NCBI數(shù)據(jù)庫進行BLAST(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)比對,所獲細菌、放線菌序列利用EzBioCloud(https://www.ezbiocloud.net/)數(shù)據(jù)庫進行比對,篩選相似度較高序列通過MEGA 10.2.5軟件進行系統(tǒng)發(fā)育分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 蕎麥根際微生物的種類及數(shù)量

        蕎麥根際土壤中富含大量微生物,共分離出72株菌,其中放線菌39株、真菌18株、細菌15株。從表1可看出根際微生物中細菌數(shù)量最多,約為6.2×108cfu/g,其次是放線菌,約為(3.7~7.1)×107cfu/g,真菌數(shù)量最少,約為3.7×105cfu/g。GA培養(yǎng)基分離得到的放線菌種類最多,占放線菌總數(shù)目的43.6%;ISP2培養(yǎng)基的分離種類最少。

        表1 蕎麥根際土壤微生物數(shù)量

        2.2 蕎麥根際微生物的抑菌活性

        由表2可知,對酵母菌、青霉、大腸桿菌、金黃色葡萄球菌具有拮抗活性的分別有23、5、3、25株。放線菌的拮抗活性較好,在拮抗各靶標菌總數(shù)中分別占82.6%、100.0%、66.7%、76.0%。透明圈直徑(D)與菌落直徑(d)比值越大,透明度越高,證明其拮抗活性越好,其中4株放線菌SI16、SG15、SG22、ST1-1的抗菌活性較好,均具有3種抗菌活性(表3)。

        表2 不同種類菌株拮抗活性篩選結(jié)果

        表3 4株放線菌對4種靶標菌的拮抗能力

        2.3 蕎麥根際微生物的酶活性

        以可溶性淀粉、脫脂奶作為篩選底物,對72株菌進行功能酶活性篩選,其中有15株菌具有蛋白酶活性,占比20.8%;14株菌有淀粉酶活性,占比19.4%;同時具有兩種酶活性的有4株,占比5.6%。對具有蛋白酶活性的菌株測量其透明圈,D/d值越大,透明度越高,證明其活性越高。從表4中可看出SB1、SG13、SG15的蛋白酶活性較好,從表5中可看出SI21、SG2-2、SG15、ST1-1、ST1-2的淀粉酶活性較好。

        表4 蕎麥根際微生物蛋白酶活性篩選結(jié)果

        表5 蕎麥根際微生物淀粉酶活性篩選結(jié)果

        2.4 蕎麥根際微生物的解磷活性

        以Ca3(PO4)2作為難溶性磷酸源,篩選具有解磷活性的菌株,試驗共發(fā)現(xiàn)10株菌(細菌、真菌)具有解磷活性,占比13.9%。從表6中可看出,菌株SB16、SB3-2、SP5解磷效果較好。

        表6 蕎麥根際微生物解磷活性篩選結(jié)果

        2.5 廣譜活性菌株的鑒定

        通過對72株菌進行生物活性檢測,發(fā)現(xiàn)SG15的活性最好,具有5種活性;有3株菌(SI16、SG9、ST1-1)具有4種活性,7株菌(SB2、SP1、SP12、SG2-2、SG16、SG22、ST1-2)具有3種活性,18株菌具有2種活性,20株菌具有1種活性,分別占比1.4%、4.2%、9.7%、25.0%、27.8%(圖1)。三種菌中,放線菌的生物活性最好,有活性菌株占總放線菌株的82.1%,占總活性菌株的65.3%,因此放線菌是一類重要的微生物資源。將具有3種及以上活性的菌株列為廣譜活性菌株,對細菌、真菌和活性最強的5株放線菌進行鑒定,結(jié)果(圖2)表明,放線菌均為鏈霉菌屬,SI16、ST1-1、SG9、SG15、SG22分別與Streptomyces acidiscabies(D63865)、Streptomyces parvus(AB184756)、Streptomyces canus(KQ948708)、Streptomyces coacervatus(AB500703)、Streptomyces paradoxus(AB184628)相似度為99.79%、99.86%、99.86%、98.51%、100.00%。細菌SB2為芽孢桿菌屬,與Bacillus inaquosorum(AMXN01000021)相似度為99.65%。系統(tǒng)發(fā)育分析顯示真菌SP1、SP12聚為一簇,均為鐮刀菌屬,但其形態(tài)明顯不同,所以可能為不同亞種,還需進一步研究(圖3)。

        圖1 蕎麥根際72株菌的生物活性篩選結(jié)果

        圖2 基于16S rRNA基因序列的N-J系統(tǒng)發(fā)育樹

        圖3 基于ITS序列的N-J系統(tǒng)發(fā)育樹

        3 討論與結(jié)論

        自然界土壤中富含大量微生物,實驗室條件下的可培養(yǎng)微生物只占很小一部分,未來可通過共培養(yǎng)技術(shù)、改善生長條件等獲取更多的微生物資源。植物-有益微生物互作對雙方均是有利的,根系分泌物可為微生物提供營養(yǎng)來源,而微生物可通過拮抗病原菌、固氮、解磷、解鉀、產(chǎn)酶、產(chǎn)植物激素等幫助植物改善生長條件,獲取更多養(yǎng)分。不同植物種類、土壤環(huán)境、大氣條件都可對根際微生物產(chǎn)生影響[9,26]。將有益微生物應(yīng)用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)有利于改善生態(tài)環(huán)境及提高經(jīng)濟效益,因此開發(fā)未知微生物資源十分重要。

        本研究發(fā)現(xiàn)放線菌與細菌、真菌相比,生物活性較好,有活性菌株占放線菌總數(shù)82.1%,可見放線菌是一類具有重要價值的微生物資源。GA、ISP2、TWYE三種培養(yǎng)基分離的放線菌數(shù)量與種類有所不同,ISP2培養(yǎng)基分離數(shù)量最多,GA培養(yǎng)基分離的種類最多,因此改變培養(yǎng)基成分可能會對分離效果產(chǎn)生影響。王東勝等[27]向GA培養(yǎng)基添加CaCl2,結(jié)果發(fā)現(xiàn)某些土樣放線菌數(shù)量顯著減少,但新種類有所增加。因此后期試驗可通過改變培養(yǎng)基成分獲取蕎麥根際更多的放線菌資源。

        對于拮抗活性檢測,放線菌的抑菌效果最為顯著,有活性菌株占放線菌總數(shù)69.2%,占蕎麥根際總菌株37.5%,且篩選到4株菌同時具有3種拮抗活性。這可能與放線菌可產(chǎn)生大量抗生素有關(guān),抗生素可通過干擾病原菌細胞壁合成、改變細胞內(nèi)部代謝等來拮抗病原菌。事實上,大部分抗生素都是由放線菌產(chǎn)生的,朱榮貴等[28]從塔里木盆地分離得到18株稀有放線菌,其中14株具有抗生素合成基因。放線菌對革蘭氏陽性菌(金黃色葡萄球菌)比對革蘭氏陰性菌(大腸桿菌)的抑制力要強,這可能是因為革蘭氏陰性菌存在外排泵可降低細胞內(nèi)抗生素含量,從而降低其敏感性[29]??莶菅挎邨U菌因其天然無害、性能優(yōu)良,已大量應(yīng)用于動物飼料中[30]。本試驗中芽孢桿菌SB2可拮抗金黃色葡萄球菌、大腸桿菌,與已有報道一致[31];另外菌株SB2還具有良好的解磷活性。微生物來源的蛋白酶與淀粉酶因其種類豐富、生長條件易控等特點在工業(yè)上得到廣泛應(yīng)用[32,33]。放線菌SG15的蛋白酶與淀粉酶活性均較好,具有較高的應(yīng)用潛力。具有解磷活性的菌株中,細菌占比最多(占總解磷菌株70.0%),真菌次之,未檢測到有放線菌具有解磷活性,與前人報道[34]相似,具體解磷機制尚不清楚。有研究顯示以磷酸鈣作為磷源,溶磷圈直徑大小并不能代表菌株真實解磷能力[35],因此試驗還需進一步對解磷菌株在液體培養(yǎng)基中的解磷能力進行測定。

        蕎麥根際存在豐富的微生物資源,本研究篩選到11株具有廣譜生物活性的微生物菌株,后續(xù)可用于開發(fā)功能菌肥。

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