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        腹膜透析患者超濾衰竭相關(guān)外泌體來源miRNA的初步篩選

        2022-05-16 04:03:18吳旭吳煒飛程志群范德墉
        浙江醫(yī)學 2022年7期
        關(guān)鍵詞:透析液外泌體肌酐

        吳旭 吳煒飛 程志群 范德墉

        隨著人口老齡化進程加速,世界范圍內(nèi)慢性腎臟?。╟hronic kidney disease,CKD)的發(fā)病率逐年上升。我國流行病學調(diào)查研究顯示成人CKD的患病率為10.8%,其中腎臟替代治療患者以每年11.0%以上的幅度遞增[1]。腹膜透析作為腎臟替代治療的主要方式之一使用率逐年上升。超濾衰竭是腹膜透析常見的并發(fā)癥,是導致腹膜透析失敗轉(zhuǎn)血液透析的重要原因之一[2]。隨著腹膜透析齡的增長,超濾衰竭的發(fā)生率逐漸增高。外泌體是由活細胞分泌的直徑為30~150 nm的小囊泡,廣泛存在于血清、血漿、唾液、尿液、羊水以及其他生物體液中[3]。miRNA是一類重要的內(nèi)源性非編碼單鏈小RNA分子,長度為18~24個核苷酸,通過與靶mRNA特異性結(jié)合導致靶mRNA降解或抑制其翻譯,從轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控靶基因的表達[4]。研究表明,miRNA參與腹膜纖維化的發(fā)生,導致超濾衰竭,患者不得不退出腹膜透析[5-8]。而外泌體能夠攜帶并遞送miRNA至靶細胞進而影響細胞的生物學行為,其參與炎癥、細胞增殖、分化和凋亡等多種生物學過程,從而調(diào)節(jié)多種病理生理過程,并且其雙層膜結(jié)構(gòu)能夠保證miRNA在體液中的穩(wěn)定性[9]。因此外泌體來源的miRNA更適合作為疾病的生物標志物?;诖?,本研究通過檢測腹膜超濾衰竭患者腹膜透析流出液(peritoneal dialysis effluent,PDE)中外泌體來源miRNA的差異表達譜,探尋可能與腹膜透析超濾衰竭相關(guān)的重要miRNA,以期進一步闡明腹膜超濾衰竭的發(fā)生機制,現(xiàn)報道如下。

        1 對象和方法

        1.1 對象 選取2000年1月至2019年11月在湖州市中心醫(yī)院腎內(nèi)科規(guī)律隨診的腹膜透析患者30例。排除標準[10]:(1)患者臨床資料不全;(2)入組前 3個月內(nèi)有腹膜炎病史;(3)伴有腹腔出血;(4)合并有腫瘤或嚴重的心、肝、肺疾病;(5)正在使用糖皮質(zhì)激素或免疫抑制劑。其中15例患者腹膜平衡試驗提示超濾衰竭,為觀察組,另15例患者腹膜平衡試驗提示無超濾衰竭,為對照組。超濾衰竭判斷標準:4.25%葡萄糖透析液留腹4 h后超濾量<400 ml[2]。本研究經(jīng)湖州市中心醫(yī)院醫(yī)學倫理委員會批準(批件號:20191002-01),患者均簽署知情同意書。

        1.2 方法

        1.2.1 一般資料收集 收集患者性別、年齡、置管日期、原發(fā)病、24 h尿量、腹膜透析相關(guān)性感染總次數(shù)、有無糖尿病、有無高血壓病等一般資料。

        1.2.2 臨床指標檢測 (1)血生化指標:采集患者清晨空腹靜脈血,采用全自動生化分析儀檢測血肌酐、血尿素氮、血尿酸、血清白蛋白、TC、血清校正鈣、血磷、全段甲狀旁腺激素(intact parathyroid hormone,iPTH)、Hb、CRP。(2)總尿素清除指數(shù)(Kt/V)及殘余腎功能:通過PD Adquest 2.0軟件計算總Kt/V;殘余腎功能(ml/min)=(尿肌酐/血肌酐+尿尿素氮/血尿素氮)×24 h尿量×7×0.5[11]。(3)腹膜功能:采用標準腹膜平衡試驗評估腹膜功能,具體方法如下:患者做腹膜平衡試驗的前夜進行標準的連續(xù)性不臥床腹膜透析治療;試驗當天,患者取坐位,在20 min內(nèi)將昨晚留腹的腹膜透析液引流出來,計量。然后患者取臥位,將2 000 ml透析液灌入腹腔,以此定為0 h,在透析液腹腔保留0 h和2 h,收集透析液標本,從腹腔內(nèi)引流出200 ml液體倒入液袋,上下顛倒2~3次,搖勻后抽取10 ml液體測定肌酐和葡萄糖濃度,剩余的190 ml液體重新灌入腹腔;留腹2 h,抽取血標本,送檢血肌酐;留腹4 h后,患者取坐位,用20 min排空腹腔內(nèi)的透析液,稱重并計量,將透析液袋倒轉(zhuǎn)2~3次,搖勻后抽取10 ml液體,檢測4 h的 PDE的肌酐與葡萄糖。計算0 h、2 h、4 h透析液與血液中肌酐的比值;計算2 h、4 h與0 h透析液中葡萄糖濃度的比值[2]。

        1.2.3 外泌體的分離與鑒定 實驗委托上海研載生物技術(shù)公司進行。兩組患者中隨機各抽取3例,收集其500 ml留腹過夜的PDE,4℃超速離心法分離外泌體[12]。具體如下:將PDE以300 g離心10 min,3 000 g離心15 min,12 000 g離心30 min,小心吸取上清液至新管中,去除細胞或細胞碎片。用0.22 μm過濾器過濾,12 000 g離心60 min,去除上清液,留下外泌體粗提沉淀。用PBS重懸沉淀,10 000 g離心60 min,仔細去除上清液,保留的沉淀用200 μl PBS重懸以獲得外泌體。

        參照Jan等[13]的方法鑒定外泌體。使用透射電子顯微鏡觀察外泌體形態(tài)及納米顆粒追蹤分析(nanoparticle tracking analysis,NTA)技術(shù)檢測外泌體大小[14-15]。具體如下:將重新懸浮的5~10 μl外泌體溶液(預先用2.5%戊二醛固定)滴加到銅網(wǎng)上,室溫吸附5 min左右,然后向銅網(wǎng)上滴加10 μl染色液(飽和醋酸雙氧鈾溶液),在室溫下對外泌體染色處理1 min,在銅網(wǎng)上滴加雙蒸水后室溫靜置5 min,重復1次,將銅網(wǎng)在室溫下晾干,上透射電子顯微鏡觀察。外泌體的大小和顆粒密度是通過NanoSight NS300納米粒徑分析儀(英國Malvern Panalytical公司)進行測量。樣品在PBS中稀釋。使用1×1013個顆粒/ml校準珠對外泌體制劑的密度進行歸一化。采用Western blot法鑒定外泌體表面標志物熱休克蛋白70(heat shock protein 70,HSP70)、CD63和CD81蛋白[16]。配制 10%的十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳膠,融解RIPA裂解液,加入苯甲基磺酰氟。加入等體積裂解液,置于冰上放置30 min,每隔10 min搖勻1次,充分裂解外泌體。將蛋白液與上樣緩沖液一起混勻后,放入100℃水浴5~6 min,離心,放置冰上,待上樣。恒壓電泳上層膠60 V,30 min,下層膠110 V,120 min,電泳結(jié)束后需要將凝膠上的蛋白轉(zhuǎn)移至聚偏二氟乙烯膜上,5%脫脂牛奶封閉2 h,孵育一抗[CD81(武漢愛博泰克生物科技有限公司)、CD63(英國 Abcam 公司)、HSP70(美國 Proteintech公司)均按1∶1 000稀釋],4℃搖床,過夜,洗滌緩沖液洗膜3次,用結(jié)合辣根過氧化物酶標記驢抗山羊IgG二抗(上海碧云天生物技術(shù)有限公司)室溫孵育1 h,洗膜后使用電化學發(fā)光試劑在超敏化學發(fā)光成像系統(tǒng)(美國GE公司)下顯影。

        1.2.4 外泌體來源miRNA高通量測序與分析 實驗委托上海研載生物技術(shù)公司進行。參照試劑說明書,使用 RNAiso Plus試劑(日本TAKARA公司)從外泌體中提取總 RNA。每250 μl外泌體樣品加入750 μl Trizol裂解,然后加入200 μl氯仿分離液。在上層液體中加入異丙醇,從外泌體懸浮液中沉淀RNA。用75%乙醇懸浮,4℃ 12 000 g離心5 min。將沉淀溶解在20 μl焦碳酸二乙酯中。通過計算260 nm與280 nm的光密度(OD)比值評估 RNA純度。TruSeq miRNA樣品制備試劑盒(美國Illumina公司)用于 RNA文庫構(gòu)建。 通過 ACGT101-miR軟件(美國LC Sciences公司)進行數(shù)據(jù)預處理。隨后根據(jù)miRbase數(shù)據(jù)庫(http://www.mirbase.org/)從PDE外泌體中鑒定出miRNA。應用DESeq算法篩選差異表達的miRNA,即以1,偽發(fā)現(xiàn)率(false discovery rate,FDR)<0.05為標準。

        1.3 統(tǒng)計學處理 采用SPSS 23.0及GraphPad Prism 7統(tǒng)計軟件。正態(tài)分布的計量資料以表示,組間比較采用兩獨立樣本t檢驗。非正態(tài)分布的計量資料以M(P25,P75)表示,兩組比較采用 Mann-Whitney U 檢驗。計數(shù)資料以頻數(shù)和構(gòu)成比表示,兩組比較采用Fisher確切概率法。P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結(jié)果

        2.1 兩組患者臨床資料比較 兩組患者性別、原發(fā)病、有無合并糖尿病或高血壓及Hb、CRP、TC、血尿素氮、血肌酐、血尿酸、血清校正鈣水平比較差異均無統(tǒng)計學意義(均P>0.05)。與對照組相比,觀察組患者年齡大、透析齡長、首次透析時間早、腹膜透析相關(guān)性感染總次數(shù)多、腹膜轉(zhuǎn)運特性為高轉(zhuǎn)運比例高,血白蛋白、總Kt/V及殘余腎功能均偏低,血磷及iPTH均偏高,差異均有統(tǒng)計學意義(均P<0.05)。見表1。

        表1 兩組患者臨床資料比較

        2.2 PDE外泌體分離后鑒定結(jié)果 NTA結(jié)果顯示,檢測的粒子直徑為50~150 nm,峰值主要集中在142 nm(圖1);Western blot檢測結(jié)果顯示,所提取的外泌體的蛋白條帶與陽性對照條帶分子量相同,外泌體特異性表達 HSP70、CD63和 CD81蛋白(圖 2);透射電子顯微鏡觀察可見PDE來源的外泌體外形呈橢圓形(圖3);熒光染色結(jié)果顯示,PDE來源的外泌體能成功被腹膜間皮細胞攝?。▓D4,見插頁)。

        圖1 PDE外泌體顆粒直徑和濃度分布的NTA結(jié)果

        圖2 外泌體HSP70、CD63和CD81蛋白表達電泳圖(1:陽性對照;2:本研究所提取的外泌體)

        圖3 透射電子顯微鏡下外泌體的形態(tài)(×100 000)

        圖4 共聚焦激光顯微鏡觀察到PKH67標記外泌體被腹膜間皮細胞攝?。ā?00)

        2.3 兩組患者PDE外泌體來源miRNA的差異表達情況 高通量測序結(jié)果顯示,與對照組相比,觀察組PDE外泌體中存在70個有明顯表達差異的miRNA,其中41個表達上調(diào),29個表達下調(diào)(圖5,見插頁),差異均有統(tǒng)計學意義(均P<0.05)。表達上調(diào)、下調(diào)差異倍數(shù)前19位的 miRNA見表2。

        表2 兩組患者PDE外泌體來源差異miRNA表達譜

        圖5 兩組患者PDE外泌體來源miRNA表達差異火山圖

        3 討論

        隨著腹膜透析技術(shù)的不斷發(fā)展及我國政府的大力支持,腹膜透析已成為我國終末期腎臟?。╡nd-stage renal disease,ESRD)患者成熟的腎臟替代治療方式之一[17]。其優(yōu)勢在于能連續(xù)清除毒素、較少影響患者活動和較低的治療費用。然而,持續(xù)暴露于葡萄糖透析液、機械應力、導管并發(fā)癥等均可引起腹膜的炎癥與損傷,從而促使腹膜經(jīng)歷漸進性血管生成和纖維化,促使腹膜有效表面積改變、葡萄糖滲透轉(zhuǎn)導作用下降,最終導致超濾衰竭[18]。外泌體來源miRNA在細胞間物質(zhì)和信號轉(zhuǎn)遞中至關(guān)重要,參與炎癥、細胞增殖、分化和凋亡等多種生物學過程,從而可能調(diào)節(jié)多種病理過程[19]。

        本研究結(jié)果顯示,與對照組相比,觀察組患者年齡大、透析齡長、首次透析時間早、腹膜透析相關(guān)性感染總次數(shù)多、腹膜轉(zhuǎn)運特性為高轉(zhuǎn)運比例高,血白蛋白、總Kt/V及殘余腎功能均偏低,血磷及iPTH均偏高,這與陳嫚等[17]和Sumi等[20]的研究結(jié)果相符。兩組患者PDE外泌體來源miRNA進行高通量測序,并通過生物信息學分析,統(tǒng)計miRNA顯著差異表達情況。結(jié)果顯示,觀察組PDE外泌體中顯著差異表達的miRNA共有70個,其中hsa-miR-125a-3p_R-1、hsa-mir-1273c-p3、hsa-miR-132-3p等 41個表達上調(diào),hsamiR-708-5p、hsa-miR-155-5p_R-1、bta-mir-2904-2-p5等29個表達下調(diào),這說明與對照組相比,腹膜透析超濾衰竭組PDE外泌體來源miRNA表達譜發(fā)生了明顯的變化。

        miR-125a、miR-1273g-3p、miR-708-3p 和 miR-155-5p參與臟器纖維化已有相關(guān)文獻支持。例如,He等[21]研究顯示miR-125a在人酒精和丙型肝炎病毒相關(guān)肝纖維化組織和CCL-4誘導的小鼠肝纖維化組織中的表達均高于正常對照組。使用miRNA微陣列的研究表明,miR-1273g-3p在丙型肝炎病毒相關(guān)肝纖維化患者中表達上調(diào)[22]。特發(fā)性肺纖維化患者的血漿和組織樣本中,miR-708-3p的表達水平是降低的。microRNA-708-3p通過調(diào)節(jié)ADAM17-GATA/STAT3軸,阻斷肺纖維化[23]。亦有研究表明,miR-708在肝纖維化組織中表達是下調(diào)的[24]。miR-155-5p通過抑制SIRT1信號通路促進梗阻性腎病的腎間質(zhì)纖維化[25]。因此推測上述miRNA在逆轉(zhuǎn)腹膜纖維化方面可能也有類似作用,而腹膜纖維化是導致腹膜透析超濾衰竭的常見原因之一,故上述miRNA也可能參與腹膜超濾衰竭。

        綜上所述,腹膜透析超濾衰竭患者外泌體來源miRNA表達譜發(fā)生明顯改變。腹膜透析超濾衰竭患者的PDE外泌體存在多種miRNA表達的失調(diào),提示miRNA可能參與腹膜超濾衰竭的發(fā)生。筆者團隊下一步將對這些差異表達的miRNA進行靶基因的預測及功能分析,進一步探討腹膜透析超濾衰竭的發(fā)生、發(fā)展機制,以期尋找新的防治方法。

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