姜莉莉,武海斌,宮慶濤,張甘雨,王雅紅,孫瑞紅*
(1.山東省果樹研究所/山東省現(xiàn)代設(shè)施果樹技術(shù)創(chuàng)新中心,山東 泰安 271000;2.泰安市板栗協(xié)會,山東 泰安 271035)
板栗(Castanea mollissima B L)屬殼斗科(Fagaceae)栗屬(Castanea),其果實(shí)具有較高的營養(yǎng)和保健價(jià)值,深受消費(fèi)者的喜愛,素有“木本糧食”之稱[1]。中國是世界板栗第一生產(chǎn)大國,種植面積和產(chǎn)量均位居世界首位[2]。
由于板栗大多種植在山區(qū)或坡地上,缺水少路,管理不便,板栗病害發(fā)生嚴(yán)重,一直是困擾栗農(nóng)的重要難題,也是影響板栗質(zhì)量收益的主要因素[3]。同時(shí),部分板栗種植區(qū)與水源保護(hù)區(qū)毗鄰,病蟲害化學(xué)防控受到限制,安全、精準(zhǔn)防控技術(shù)亟待完善[4]。
栗疫病是由子囊菌亞門核菌綱球殼目間座殼科隱叢殼屬栗疫病菌Cryphonectria parasitica (Murr.) Barr.寄生引起的真菌病害,嫁接不久、生長環(huán)境貧瘠的栗樹易感此病,易成片發(fā)生,甚至導(dǎo)致樹死園毀[5]。任菲等[6]報(bào)道,盾殼霉屬病原菌Coniothyrium phrinum可引發(fā)板栗葉斑病,鏈格孢屬病原菌Alternaria alternata可引起板栗葉焦枯病。姜淑霞等[7]報(bào)道,擬莖點(diǎn)霉屬病原菌Phomopsis mollissmae可侵染板栗引起褐緣葉枯病,并易誘發(fā)板栗疫病。板栗內(nèi)腐病又稱栗種仁斑點(diǎn)病,可在栗果外觀正常的情況下,在種仁上產(chǎn)生壞死性病斑,使果仁失去食用價(jià)值[8]。張馨方等[9]報(bào)道,內(nèi)腐病病原菌從6月中旬授粉期開始侵入板栗花柱和栗苞,8月中旬以后侵入的病菌數(shù)量逐漸增多,但在近成熟期病菌才侵入種仁。內(nèi)腐病由多種病原菌復(fù)合侵染所致,包括膠孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)、聚生小穴殼菌(Dothiorella grgaria)等。
山東省是我國板栗主產(chǎn)區(qū)之一,栽培歷史悠久,品種資源豐富[10]。泰山周邊地區(qū)分布著豐富的古板栗資源,可為板栗良種選育提供豐富且優(yōu)質(zhì)的種質(zhì)來源[11]。本研究采用高通量測序技術(shù),分析比較了泰安市岱岳區(qū)祝陽鎮(zhèn)麻塔村古栗與同村種植的“紅栗2號”[12]5年生樹不同物候期及部位的微生物群落結(jié)構(gòu)差異,比較了采收期果實(shí)營養(yǎng)成分差異,并進(jìn)行了相關(guān)性分析,以期為探索板栗病害的成災(zāi)機(jī)理和科學(xué)防控提供理論依據(jù)。
試驗(yàn)區(qū)選址于山東省泰安市岱岳區(qū)祝陽鎮(zhèn)麻塔村(117°21′15″E,36°11′50″N),為山地板栗園。分別隨機(jī)選取3株樹齡30年以上的古栗樹和樹齡5年的“紅栗2號”進(jìn)行取樣,每株為一個(gè)重復(fù)。供采樣板栗樹于2020年5月中旬噴施50%多菌靈可濕性粉劑(山東華陽農(nóng)藥化工集團(tuán)有限公司)1000倍液和1%阿維·吡蟲啉乳油(順毅股份有限公司)1000倍液,采用常規(guī)栽培管理。
分別于2020年8月26日(膨果期,p)和9月12日(成熟期,c)采集果實(shí)和葉片。以蘸有0.2 mol/L磷酸緩沖液的無菌拭子擦取板栗葉片(y)和果實(shí)(g)表面的微生物,將拭子置于無菌離心管中,干冰保存送樣。真菌和細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的高通量分析由北京諾禾致源生物信息科技有限公司完成。
于2020年10月3日采集2種板栗的成熟果仁,用于養(yǎng)分含量測定。
提取樣本基因組DNA,以瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA的純度和濃度,以無菌水將其濃度調(diào)整至1 ng/μL。以此基因組DNA為模板,使用帶Barcode的16 S V4區(qū)引物(515F/806R)和ITS1區(qū)引物(ITS1-1F-F/ITS1-1F-R)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR產(chǎn)物根據(jù)濃度進(jìn)行等量混樣,以瓊脂糖凝膠電泳純化后進(jìn)行膠回收。構(gòu)建文庫,經(jīng)Qubit定量和檢測合格后,進(jìn)行Ion S5TMXL(Thermofisher)上機(jī)測序。
對數(shù)據(jù)進(jìn)行低質(zhì)量剪切,截去Barcode和引物序列,去除嵌合體序列,得到有效數(shù)據(jù)。以Uparse 7.0.1001軟件對各樣品的有效數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類,將一致性高于97%的序列聚類為OTUs,選取頻數(shù)最高的序列作為代表性序列。用Mothur方法與SSUrRNA數(shù)據(jù)庫對OTUs序列進(jìn)行物種注釋分析,獲得分類學(xué)信息,并分別在界kingdom、門phylum、綱class、目order、科family、屬genus、種species共7個(gè)分類水平統(tǒng)計(jì)各樣本的群落組成。以數(shù)據(jù)量最少的樣本為標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行均一化處理,并以此進(jìn)行后續(xù)的α-和β-多樣性分析。
使用Qiime軟件計(jì)算Chao1、Shannon、Simpson、 ACE、Goods-coverage和PD_whole_tree 指數(shù),使用R軟件(版本號2.15.3)繪制稀釋曲線。采用R軟件的corr.test函數(shù)計(jì)算物種和環(huán)境因子的Spearman相關(guān)系數(shù)值并檢驗(yàn)其顯著性,使用pheatmap函數(shù)進(jìn)行可視化。
可溶性淀粉含量測定采用碘顯色法[13],可溶性總糖含量測定采用蒽酮比色法[14],脂肪含量測定采用索氏抽提法[15]。
由圖1可知,隨著測序深度的增加,各樣本的稀釋曲線均逐漸趨緩,表明測序深度已達(dá)到要求,能夠反映各樣本的細(xì)菌和真菌群落結(jié)構(gòu)組成。
由表1可知,對細(xì)菌而言,古栗膨果期和成熟期葉片和果實(shí)的α-多樣性指數(shù)均高于紅栗,表明古栗樹體的細(xì)菌多樣性、豐度和優(yōu)勢度高于紅栗;其中成熟期古栗果實(shí)(gl.g.c)最高,Shannon、Simpson、Chao1和ACE指 數(shù) 分 別 為5.242、0.858、1010.069和1019.654,膨果期紅栗果實(shí)(hl.g.p)最低,分別為1.700、0.449、217.546和221.063。對真菌而言,紅栗和古栗各生育期和部位的α-多樣性指數(shù)差異不大,其中膨果期古栗葉片(gl.y.p)最高,Shannon、Simpson、Chao1和ACE指 數(shù) 分 別 為5.382、0.950、721.374和712.740。
圖1 紅栗和古栗不同物候期各部位樣本的16 S和ITS稀釋曲線
表1 紅栗和古栗不同物候期和部位的細(xì)菌和真菌α-多樣性指數(shù)的比較
由圖2可知,紅栗和古栗膨果期果實(shí)(hl.g.p和gl.g.p)的尾孢屬Cercospora相對豐度均較高,紅栗成熟期葉片和果實(shí)(hl.y.c和hl.g.c)的鏈格孢菌Alternaria相對豐度均較高,古栗成熟期果實(shí)(gl.g.c)的墊殼孢屬Coniella相對豐度最高,紅栗膨果期葉片和古栗成熟期葉片(hl.y.p和gl.y.c)的莖點(diǎn)霉屬Phoma相對豐度較高,古栗膨果期葉片和果實(shí)(gl.y.p和gl.g.p)的枝孢屬Cladosporium相對豐度較高,紅栗成熟期葉片(hl.y.c)的柱隔孢屬Ramularia相對豐度較高,古栗成熟期葉片(gl.y.c)的短梗霉屬Aureobasidium相對豐度最高。
由圖3可知,古栗膨果期葉片(gl.y.p)的青枯菌屬Ralstonia相對豐度較高,果實(shí)(gl.g.p)的甲基桿菌屬M(fèi)ethylobacterium相對豐度較高。紅栗成熟期果實(shí)(hl.g.c)的滑柱菌屬Herpetosiphon相對豐度較高。古栗成熟期葉片(gl.y.c)的假單胞菌Pseudomonas相對豐度較高,果實(shí)(gl.g.c)鏈球菌屬Streptococcus和根瘤菌屬Allorhizobium相對豐度較高。
由表2可以看出,紅栗果實(shí)的可溶性總糖、可溶性淀粉和粗脂肪含量分別為29.70 mg/g、392.41 mg/g和0.48%,均顯著高于古栗的6.63 mg/g、322.42 mg/g和0.29%??梢娂t栗的營養(yǎng)成分含量遠(yuǎn)高于古栗。
表2 紅栗和古栗養(yǎng)分含量的比較
圖2 紅栗和古栗不同物候期和部位的真菌相對豐度
圖3 紅栗和古栗不同物候期和部位的細(xì)菌相對豐度
2.6.1 板栗細(xì)菌相對豐度與養(yǎng)分含量的相關(guān)性分析 由圖4可以看出,板栗果實(shí)理研菌科Rikenellaceae相對豐度與淀粉含量呈顯著負(fù)相關(guān),與脂肪含量呈極顯著負(fù)相關(guān)。短波單孢菌屬Brevundimonas相對豐度與脂肪含量呈顯著正相關(guān)。埃希氏桿菌屬Escherichia相對豐度與脂肪含量呈顯著負(fù)相關(guān)。鞘氨醇單孢菌Sphingomonas相對豐度與淀粉和脂肪含量呈顯著正相關(guān)。鏈球菌Streptococcus相對豐度與淀粉和脂肪含量呈顯著負(fù)相關(guān)。根瘤菌Allorhizobium相對豐度與脂肪含量呈顯著正相關(guān)。
2.6.2 板栗真菌相對豐度與養(yǎng)分含量的相關(guān)性分析 由圖5可知,板栗果實(shí)座囊菌綱Dothideomycetes相對豐度與糖、淀粉和脂肪含量均呈顯著負(fù)相關(guān)。
傳統(tǒng)的病原菌分離鑒定方法僅能研究可培養(yǎng)微生物,而對不可培養(yǎng)的微生物種類及豐度無法進(jìn)行系統(tǒng)分析。高通量測序技術(shù)通過PCR擴(kuò)增,對目標(biāo)區(qū)域的DNA富集后進(jìn)行序列測定,能夠較為全面和準(zhǔn)確地反映微生物群落結(jié)構(gòu),已成為近年來分析微生物多樣性的常用且有效手段[16]。路穎等[17]采用高通量測序技術(shù),分析了泰山4種優(yōu)勢造林樹種刺槐、麻櫟、油松和赤松葉片凋落物分解對凋落物內(nèi)細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響,發(fā)現(xiàn)細(xì)菌群落多樣性受凋落物化學(xué)性質(zhì)影響,尤其是初始碳氮比和木質(zhì)素氮比。李志杰等[18]以多環(huán)芳烴污染鹽堿土壤為研究對象,采用高通量測序技術(shù),分析了翅堿蓬根際與非根際土壤的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)翅堿蓬能夠有效降低根際土壤鹽含量并改善碳氮比,提高嗜鹽堿多環(huán)芳烴降解微生物的關(guān)鍵基因豐度。
本研究采用高通量測序技術(shù),分析了板栗不同物候期和部位的真菌和細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)。真菌相對豐度比較發(fā)現(xiàn),紅栗和古栗膨果期果實(shí)(hl.g.p和gl.g.p)的尾孢屬Cercospora相對豐度均較高,該屬真菌可引起玉米灰斑?。?9]、甘蔗褐斑?。?0]等病害,但對板栗果實(shí)的危害尚未見報(bào)道。紅栗成熟期葉片和果實(shí)(hl.y.c和hl.g.c)的鏈格孢菌Alternaria相對豐度均較高,表明受板栗葉焦枯病侵染的風(fēng)險(xiǎn)較大[6]。古栗成熟期果實(shí)(gl.g.c)的墊殼孢屬Coniella相對豐度最高,該屬真菌可引起石榴干腐?。?1]、葡萄白腐病等病害,也包括栗生墊殼孢菌[22]。紅栗膨果期葉片和古栗成熟期葉片(hl.y.p和gl.y.c)的莖點(diǎn)霉屬Phoma相對豐度較高,該屬真菌可引起板栗褐緣葉枯病,并易誘發(fā)板栗疫病和內(nèi)腐病。古栗膨果期葉片和果實(shí)(gl.y.p和gl.g.p)的枝孢屬Cladosporium相對豐度較高,該屬病原菌可引起番茄葉霉?。?3]和多種作物果實(shí)腐爛[24]。紅栗成熟期葉片(hl.y.c)的柱隔孢屬Ramularia相對豐度較高,該屬真菌可引起山萵苣白腐病等病害[25]。古栗成熟期葉片(gl.y.c)的短梗霉Aureobasidium相對豐度最高,該屬真菌作為益生菌被廣泛報(bào)道[26-27]。細(xì)菌相對豐度比較發(fā)現(xiàn),古栗膨果期葉片(gl.y.p)的青枯菌屬Ralstonia相對豐度較高,該屬病原菌可引起煙草青枯病等病害[28]。古栗膨果期果實(shí)(gl.g.p)的甲基桿菌屬M(fèi)ethylobacterium相對豐度較高。紅栗成熟期果實(shí)(hl.g.c)的滑柱菌屬Herpetosiphon相對豐度較高。古栗成熟期葉片(gl.y.c)的假單胞菌Pseudomonas相對豐度較高,果實(shí)(gl.g.c)鏈球菌屬Streptococcus和根瘤菌屬Allorhizobium相對豐度較高,均可作為益生菌使用[29-30]。綜合比較可以發(fā)現(xiàn),紅栗受鏈格孢菌等真菌侵染風(fēng)險(xiǎn)較高,古栗樹體益生菌相對豐度較高。
圖4 板栗細(xì)菌相對豐度與養(yǎng)分含量的相關(guān)性分析
圖5 板栗真菌相對豐度與養(yǎng)分含量的相關(guān)性分析
不同產(chǎn)地和品種的板栗中各營養(yǎng)成分含量均有較大差異。本研究通過養(yǎng)分含量測定發(fā)現(xiàn),紅栗果實(shí)的可溶性總糖、可溶性淀粉和脂肪含量均顯著高于古栗??梢娊?jīng)過科研人員的多年品種選育,板栗的營養(yǎng)成分性狀已得到系統(tǒng)優(yōu)化和改良。相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn),短波單胞菌屬相對豐度與脂肪含量呈顯著正相關(guān),埃希氏桿菌屬相對豐度與脂肪含量呈顯著負(fù)相關(guān),鞘氨醇單孢菌相對豐度與淀粉和脂肪含量呈顯著正相關(guān),鏈球菌相對豐度與淀粉和脂肪含量呈顯著負(fù)相關(guān),根瘤菌相對豐度與脂肪含量呈顯著正相關(guān)。
江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)2022年2期