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        基于改進(jìn)K-Means聚類與水平集的木材橫截面管孔分割

        2022-04-26 03:24:06程昱之鐘麗輝何鑫王遠(yuǎn)李朝蘭
        森林工程 2022年1期
        關(guān)鍵詞:管孔圖像分割

        程昱之 鐘麗輝 何鑫 王遠(yuǎn) 李朝蘭

        摘 要:針對(duì)管孔隨機(jī)分布且大小不一導(dǎo)致管孔分割魯棒性不高,及木纖維、木射線和軸向薄壁組織等噪聲對(duì)管孔分割效果影響較大的問題,本研究提出一種改進(jìn)K-Means聚類與水平集的木材橫截面管孔分割算法。采用改進(jìn)K- Means聚類對(duì)管孔區(qū)域進(jìn)行粗分割,有效地區(qū)分管孔區(qū)域與木纖維、木射線以及軸向薄壁組織等噪聲區(qū)域。再對(duì)粗分割結(jié)果采用水平集算法進(jìn)行精分割。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,平均每張木材橫截面微觀圖像有98.8%的管孔被準(zhǔn)確有效地分割出來,且分割出的管孔與實(shí)際管孔基本吻合。相比之下,本研究提出的改進(jìn)分割算法較其他算法,每張木材微觀圖像的平均管孔分割準(zhǔn)確率提高了1.7%。該算法有效地解決傳統(tǒng)K-Means聚類算法在圖像分割時(shí)噪聲影響大和初始聚類中心的隨機(jī)性問題,在針對(duì)大小不一且隨機(jī)分布的管孔分割過程中魯棒性更高,具有良好的分割性能。

        關(guān)鍵詞:改進(jìn)K-means聚類算法;水平集;木材橫截面;管孔;圖像分割

        中圖分類號(hào):S781??? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A?? 文章編號(hào):1006-8023(2022)01-0042-10

        Segmentation of Wood Cross-section Pore Based on

        Improved K-Means Clustering and Level-set

        CHENG Yuzhi1, ZHONG Lihui2*, HE Xin2, WANG Yuan1, LI Chaolan1

        (1.School of Machinery and Transportation, Southwest Forestry University, Kunming 650224, China;

        2.College of Big Data and Intelligent Engineering, Southwest Forestry University, Kunming 650224, China)

        Abstract:Aiming at the problem that the pores are randomly distributed and have different sizes, which leads to low robustness of pore segmentation, and the noise such as wood fiber, wood ray and axial parenchyma has great influence on the pore segmentation effect, this study proposes an improved K-Means clustering and level-set algorithm for wood cross-section pore segmentation. The improved K-means clustering was used to segment the pore area coarsely, which effectively distinguished the pore area from noise areas such as wood fiber, wood ray and axial parenchyma. Then, the improved level-set algorithm was used for fine segmentation of the coarse segmentation results. The experimental results showed that 98.8% of the pores were segmented accurately and effectively in each microscopic image of wood cross-section, and the segmented pores were basically consistent with the actual pores. In contrast, compared with other algorithms, the improved algorithm proposed in this study improved the average segmentation accuracy of each wood microscopic image by 1.7%. This algorithm can effectively solve the problems of noise influence and randomness of the initial clustering center of traditional K-means clustering algorithm in image segmentation, and has higher robustness and good segmentation performance in the segmentation process of pores with different sizes and random distribution.

        Keywords:Improved K-means clustering; level-set; wood cross-section; pore; image segmentation

        0 引言

        在闊葉材橫截面微觀圖像中能夠觀察到管孔、木射線、生長(zhǎng)輪、木纖維和軸向薄壁組織等木材微觀結(jié)構(gòu),其中管孔是木材研究領(lǐng)域最重要的特征之一[1-2]。管孔不僅能夠作為分析木材蒸騰作用與木材解剖特征之間聯(lián)系的研究要素[3],而且也是研究環(huán)境氣候變化對(duì)木材生長(zhǎng)和木材解剖特征具體影響的參考依據(jù)[4],此外管孔分割是微觀木材圖像中提取管孔特征量和進(jìn)行木材樹種自動(dòng)識(shí)別的關(guān)鍵步驟[5-7]。因此,微觀木材圖像中的管孔分割有著重要的研究意義。

        近些年來應(yīng)用于管孔分割的算法主要有數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)、區(qū)域生長(zhǎng)和聚類算法等[8-11]。Qi等[9]運(yùn)用開閉運(yùn)算等數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)算法對(duì)管孔進(jìn)行分割,該算法分割出了大多數(shù)管孔,但出現(xiàn)了圖像邊緣細(xì)節(jié)丟失,如較小的管孔被當(dāng)作噪聲去除或是較大的管孔部分組織缺失。在此之后,Roncancio等[10]通過結(jié)合多尺度模型的形態(tài)學(xué)處理和模糊C均值算法分割木材圖像,雖然考慮相同類別的2個(gè)像素在給定尺度下的灰度差隨著尺度的增加而減小來改善分割效果,但該算法無法去除木材圖像中的大部分噪聲。Espinosa等[11]運(yùn)用形態(tài)學(xué)處理,并根據(jù)灰度共生矩陣(Gray-Level Co-occurrence Matrix ,GLCM)提取的木材圖像灰度特征對(duì)木材圖像實(shí)現(xiàn)K-Means聚類進(jìn)行管孔分割,該算法分割出的管孔較為飽滿,但存在部分管孔的漏分和管孔組織缺失。Shen 等[12]通過檢測(cè)閉合區(qū)域的平均面積得出最適合的結(jié)構(gòu)元素,并運(yùn)用形態(tài)學(xué)算法對(duì)管孔進(jìn)行分割,但還是會(huì)出現(xiàn)小孔漏分、大孔誤分的情況。由于木材橫截面微觀圖像中管孔數(shù)量較多,形態(tài)各異且分布不均勻,此外木纖維和軸向薄壁組織從橫截面看去也是一個(gè)個(gè)相對(duì)較小的孔洞,從而對(duì)管孔進(jìn)行分割較為困難。綜上所述,現(xiàn)階段對(duì)于微觀木材圖像中管孔的分割依然是研究的熱點(diǎn)和難點(diǎn)。

        針對(duì)管孔漏分、誤分,去除木纖維、木射線以及軸向薄壁組織等噪聲和傳統(tǒng)K-Means聚類初始聚類中心隨機(jī)性的問題,本研究提出了一種基于改進(jìn)K-Means聚類與水平集的管孔分割算法。首先,繪制木材圖像的RGB(紅(red,R),綠(green,G),藍(lán)(blue,B))分量繪制顏色直方圖,其次,根據(jù)顏色直方圖上對(duì)應(yīng)峰值和波谷的中心點(diǎn)確定3類目標(biāo)區(qū)域的初始聚類中心點(diǎn),第1類為軸向薄壁組織和木纖維,第2類為管孔,第3類為生長(zhǎng)輪和木射線。再次,根據(jù)初始聚類中心點(diǎn)進(jìn)行K-Means初始聚類,迭代結(jié)束后將3類區(qū)域顏色編碼,最后應(yīng)用水平集算法分割管孔區(qū)域。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,本研究提出的改進(jìn)算法很好地解決了管孔漏分、誤分和噪聲去除的問題,同時(shí)有效地分割出了管孔區(qū)域。

        1 材料與方法

        1.1 實(shí)驗(yàn)環(huán)境

        硬件設(shè)備:CPU為Inter Core i5-7300HQ,顯卡為NVIDIA GTX 1050 2G,內(nèi)存為DDR4 12GB;軟件環(huán)境,操作系統(tǒng)為Windows 10,Python 3.7,OpenCV 4.4.0.44;數(shù)據(jù)來源為日本森林?jǐn)?shù)據(jù)庫(https://db.ffpri.go.jp/WoodDB/JWDB/home.php)。該數(shù)據(jù)庫成立于1928年,現(xiàn)有木材標(biāo)本29 000余號(hào),隸屬270科,2 050屬,8 500種;切片標(biāo)本約90 000號(hào)[13]。表1為本研究所用到的木材樹種信息表。

        1.2 傳統(tǒng)的K-Means聚類算法

        傳統(tǒng)的K-Means聚類算法以距離作為相似性的評(píng)價(jià)指標(biāo),其基本思想是按照距離將樣本聚成不同的簇,簇中各點(diǎn)距簇類中心距離越近,相似度就越大,以得到緊湊且獨(dú)立的簇作為聚類目標(biāo)。該算法能夠快速有效地對(duì)目標(biāo)分類,當(dāng)聚類目標(biāo)較為理想,即簇是密集的或簇與簇之間區(qū)別明顯時(shí),該算法的聚類效果很好。綜上所述,由于木材微觀圖像中各管孔之間的顏色梯度差異較小,管孔便能夠作為理想聚類目標(biāo),所以本研究采用K-Means聚類算法對(duì)木材橫截面微觀圖像進(jìn)行管孔的粗分割[14]。

        首先定義簇類數(shù)K的值,根據(jù)木材橫截面原圖的顏色特征,本研究的目標(biāo)簇類可分為3類,第1類為軸向薄壁組織和木纖維,第2類為管孔,第3類為生長(zhǎng)輪和木射線,所以K為3。其次基于彩色木材圖像的R、G、B 3個(gè)通道分別為x、y、z軸建立空間直角坐標(biāo)系,即x軸表示紅色通道,y軸表示綠色通道,z軸表示藍(lán)色通道,那么木材圖像上的每個(gè)像素點(diǎn)與該空間直角坐標(biāo)系就建立了一一映射的關(guān)系。再次從空間直角坐標(biāo)系中隨機(jī)取出3個(gè)點(diǎn),作為3個(gè)簇各自的簇類中心,即{μ1,μ2,μ3}。計(jì)算所有像素點(diǎn)到3個(gè)簇類中心的距離,其中,距離定義為歐氏距離Ds,r、g、b分別表示紅綠藍(lán)三通道,(rn,gn,bn)為彩色圖片中某像素點(diǎn),(r0,g0,b0)∈{μ1,μ2,μ3}表示某簇類的簇類中心[15]。

        Ds=(rn-r0)2+(gn-g0)2+(bn-b0)2。(1)

        然后將所有像素點(diǎn)劃分至與其距離最小的簇類,確定像素點(diǎn)Xn的簇標(biāo)記λn∈{1,2,3}, n為圖像的像素點(diǎn)數(shù)目,argmin表示求目標(biāo)函數(shù)的最小值,C為簇劃分。

        λn=argmini∈{1,2,3}Ds。(2)

        Cλn=Cλn∪{Xn}。(3)

        最后求出新形成的簇類中心μi′并重復(fù)上述過程,

        μi′=1Ci∑Xn∈CiXn。(4)

        直到簇心不再變化,即μi′=μi自此聚類完成。

        C={C1,C2,C3}。(5)

        1.3 改進(jìn)的K-Means聚類算法

        雖然將樣本映射到RGB顏色特征空間,構(gòu)造了新的映射關(guān)系,打破了聚類的形狀一般只能是球狀的限制。但聚類中心的選擇會(huì)較大程度上影響分類效果,尤其是當(dāng)聚類中心的取值全部位于管孔以外時(shí),管孔區(qū)域會(huì)被整體歸為噪聲。此外,由于初始聚類中心的隨機(jī)生成,可能會(huì)導(dǎo)致分類結(jié)果不一致或?qū)⒛纠w維或軸向薄壁組織被整體分割出來?;诖?,針對(duì)以上問題進(jìn)行算法改進(jìn)。

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