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        歐李(Cerasus humilis)內(nèi)生固氮細(xì)菌篩選、鑒定及特性研究

        2022-04-25 12:40:30王占軍王辛有苑力暉
        草地學(xué)報(bào) 2022年4期
        關(guān)鍵詞:固氮菌歐李內(nèi)生

        白 潔, 姚 拓*, 雷 楊, 王占軍, 王辛有, 苑力暉

        (1.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)草業(yè)學(xué)院, 甘肅 蘭州 730070; 2.寧夏農(nóng)林科學(xué)院荒漠化治理研究所, 寧夏回族自治區(qū) 銀川 750000;3.蘭州植物園, 甘肅 蘭州 730070)

        歐李(Cerasushumilis)是一種生長(zhǎng)于我國(guó)北方荒漠草原、沙地邊緣的矮灌木。具有抗寒、抗旱,再生能力強(qiáng)的特點(diǎn)。由于歐李成叢快、覆蓋率高、根系發(fā)達(dá),常被選做生態(tài)脆弱區(qū)的恢復(fù)樹(shù)種[1]。王鵬飛等[2]研究發(fā)現(xiàn),栽植歐李對(duì)黃土丘陵溝壑區(qū)灌下土壤理化性質(zhì)有不同程度改善。此外,歐李枝葉質(zhì)地柔軟,含有豐富的鈣、糖和蛋白質(zhì)等營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),是牛羊所喜食的優(yōu)質(zhì)飼料[3]?;诖?,歐李對(duì)緩解生態(tài)建設(shè)和畜牧業(yè)可持續(xù)發(fā)展之間的矛盾具有重要意義[4]。

        歐李經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期的自然選擇,具有較強(qiáng)的適應(yīng)性,可在土壤較為貧瘠的條件下正常生長(zhǎng)[5]。趙貝貝對(duì)歐李樹(shù)體礦質(zhì)營(yíng)養(yǎng)研究發(fā)現(xiàn),歐李主根與須根系中氮含量最高,高于磷、鉀、鎂、鐵等元素[6],推測(cè)定殖于其根系中的固氮微生物發(fā)揮著重要作用。因此從其根系中分離篩選出內(nèi)生固氮菌的概率較高。定殖于植物根系的內(nèi)生固氮菌,占據(jù)著植物組織內(nèi)有利于營(yíng)養(yǎng)供應(yīng)和微環(huán)境穩(wěn)定的生態(tài)位,避免了化合態(tài)氮的抑制及土著微生物的競(jìng)爭(zhēng),較根外環(huán)境更有利于形成高效固氮系統(tǒng),可充分發(fā)揮固氮效能[7-8]。該系統(tǒng)為宿主植物提供氮素來(lái)源的同時(shí)增加了土壤肥力[9]。方華舟等[10]用含固氮菌的復(fù)合菌劑處理稻田土壤后,有效促進(jìn)了土壤氮、磷、鉀轉(zhuǎn)換,提高了土壤養(yǎng)分含量。研究發(fā)現(xiàn),內(nèi)生固氮菌還可通過(guò)溶磷、分泌植物生長(zhǎng)素(Indole acetic acid,IAA)和鐵載體等改善宿主植物營(yíng)養(yǎng)吸收,進(jìn)而促進(jìn)植物生長(zhǎng)并提高產(chǎn)量[11-12]。韓梅等[13]從健康玉米植株中分離純化出2株內(nèi)生固氮菌,接種后發(fā)現(xiàn)對(duì)玉米苗期的生長(zhǎng)有明顯的促進(jìn)作用。

        目前,國(guó)內(nèi)外學(xué)者在農(nóng)作物、牧草和林木中都已分離獲得內(nèi)生固氮菌[14-17],但對(duì)于荒漠草原灌木歐李內(nèi)生固氮菌還缺乏相關(guān)報(bào)道。本研究對(duì)從歐李根系分離獲得的內(nèi)生固氮菌進(jìn)行固氮及其他特性研究,篩選出固氮能力較強(qiáng)的菌株,通過(guò)16S rDNA基因序列比對(duì)確定菌株的分類(lèi)地位,以期為歐李固氮微生物接種劑的進(jìn)一步研究和應(yīng)用提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        1.1.1植物材料 2021年1月于寧夏回族自治區(qū)銀川市永寧縣(38.25° N,106.07° E,海拔1 110 m)挑選生長(zhǎng)旺盛的3株3年樹(shù)齡歐李植株,距地面約35 cm處,截取其根系,裝入無(wú)菌自封袋,放置于冰盒中,運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室4℃冰箱中保存,備用。

        1.1.2培養(yǎng)基 無(wú)氮(Nitrogen free medium,NFM)培養(yǎng)基[18]用于內(nèi)生固氮菌的分離及固氮酶活性測(cè)定;King氏液體培養(yǎng)基[19]用于內(nèi)生固氮菌分泌IAA特性測(cè)定;無(wú)機(jī)磷(National botanical research institute’ s phosphate,NBRIP)液體培養(yǎng)基[20]用于內(nèi)生固氮菌溶無(wú)機(jī)磷特性測(cè)定;蒙金娜有機(jī)磷培養(yǎng)基[21]用于內(nèi)生固氮菌解有機(jī)磷特性測(cè)定;LB(luria bertani)固體培養(yǎng)基[19]用于內(nèi)生固氮菌的保存與培養(yǎng)。

        上述培養(yǎng)基均在121℃下,滅菌26 min,固體培養(yǎng)基傾倒于9 cm的滅菌培養(yǎng)皿中。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1內(nèi)生固氮菌分離 將3株歐李根系置于水下沖洗干凈表面泥土和其他雜質(zhì),移入無(wú)菌超凈工作臺(tái),用無(wú)菌水沖洗3次,后用無(wú)菌濾紙吸干表面水分。進(jìn)行75%乙醇3 min,2.5%次氯酸鈉7 min,75%乙醇20 min的三步表面消毒。消毒后的植物根系,用無(wú)菌水沖洗6次,后用無(wú)菌濾紙吸干表面水分,以最后1次無(wú)菌水洗滌液涂布于LB固體培養(yǎng)基上,28℃培養(yǎng)24 h,觀察是否有菌長(zhǎng)出,以此檢測(cè)消毒是否徹底。將3株滅菌根系分別用無(wú)菌刀片切成約為1 g的小塊,用高壓滅菌后的研磨棒和研磨缽在9 mL的無(wú)菌水中研磨,每株植物根系3次重復(fù)。吸取上述織組懸浮液0.1 mL涂布于NFM平板上。接種平板置于28℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)3~7 d。

        1.2.2內(nèi)生固氮菌的初篩 選取NFM培養(yǎng)基中生長(zhǎng)較快,菌落形態(tài)較大的不同單菌落,進(jìn)行反復(fù)四區(qū)劃線(xiàn)[22],純化后的菌株即為固氮菌。將固氮菌懸浮于20%甘油,保存至—80℃冰箱中備用。

        1.2.3內(nèi)生固氮菌固氮酶活性及促生特性測(cè)定 內(nèi)生固氮菌固酶活性采用乙炔還原法測(cè)定[23];溶磷特性采用鉬銻抗比色法測(cè)定[24];合成植物生長(zhǎng)素IAA特性采用Salkowski法測(cè)定[25]。

        1.2.4優(yōu)良內(nèi)生固氮菌株初步鑒定 16S rDNA基因序列擴(kuò)增:通用引物27F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和1492R(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)[26]。PCR反應(yīng)體系(50 μL):2×Taq PCR Master Mix 25 μL,DNA模板4 μL、引物各1.5 μL和ddH2O 18 μL。PCR反應(yīng)條件:94℃ 5 min;94℃ 30 s,55℃ 30 s,72℃ 1 min,32個(gè)循環(huán);72℃ 5 min。PCR產(chǎn)物由蘭州天啟基因生物科技有限公司測(cè)序。將測(cè)序結(jié)果在Ezbiocloud數(shù)據(jù)庫(kù)中與模式菌株進(jìn)行同源性比對(duì)。選取相似度超過(guò)95%的模式菌株相應(yīng)序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,使用MEGA 7.0軟件中ClustalW進(jìn)行多重比對(duì)后,利用鄰近法(Kimura 2-parameter模型;Bootstrap 1000)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。

        1.2.5數(shù)據(jù)分析 使用Microsoft Excel 2010進(jìn)行數(shù)據(jù)整理計(jì)算;SPSS 20.0軟件對(duì)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行單因素方差分析(One-Way ANOVA),顯著性水平為P<0.05;圖中數(shù)據(jù)為“平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤”并使用Origin 2021作圖;利用MEGA 7.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 歐李根系內(nèi)生固氮菌的初步篩選

        從歐李根系內(nèi)分離出20株內(nèi)生固氮菌,分別為NS1 14-2,NS1 14-1,NS 8,NS 22,NS 25,NS 26,YNS 3,YNS 10,YNS 6,YNS 1,YNS 4,WNS 26,WNS 24,WNS 22-1,WNS 21,NNS 15,NNS 18,NNS 17,NNS 14和NNS 19。

        2.2 歐李內(nèi)生固氮菌固氮酶活性

        對(duì)20株歐李內(nèi)生固氮菌的固氮酶活性進(jìn)行測(cè)定發(fā)現(xiàn),固氮酶活性范圍在31.45~424.81 nmol C2H4·h-1·mL-1之間,其中菌株NS 25固氮酶活性(424.81 nmol C2H4·h-1·mL-1)顯著高于其他菌株(P<0.05)。其次為菌株NS1 14-2(323.36 nmol C2H4·h-1·mL-1)和菌株NS1 14-1(305.63 nmol C2H4·h-1·mL-1)。此外固氮酶活性在200~300 nmol C2H4·h-1·mL-1之間的菌株有7株,分別為NS 8,NS 26,YNS 6,YNS 1,WNS 21,NNS 15和NNS 19。其他菌株固氮酶活性均小于200 nmol C2H4·h-1·mL-1。結(jié)果表明歐李根內(nèi)具有豐富的固氮微生物資源(圖1)。

        圖1 歐李內(nèi)生固氮菌固氮酶活性

        2.3 歐李內(nèi)生固氮菌溶磷和分泌IAA特性

        通過(guò)測(cè)定20株內(nèi)生固氮菌合成植物生長(zhǎng)素IAA能力發(fā)現(xiàn),植物生長(zhǎng)素IAA合成量在3.86~47.00 μg·mL-1之間,菌株NS 22合成IAA量(47.00 μg·mL-1)顯著高于其他菌株(P<0.05)。其中合成IAA量大于20 μg·mL-1的菌株有5株分別為NS1 14-2,NS 22,NNS 18,NNS 17和NNS 14(圖2)。

        圖2 歐李內(nèi)生固氮菌分泌IAA

        分離菌株解有機(jī)磷量在26.62~99.18 μg·mL-1之間,各菌株培養(yǎng)液pH在3.42~5.52之間,菌株YNS 4(99.18 μg·mL-1),NS 8(78.45 μg·mL-1)和YNS 6(72.88 μg·mL-1)解有機(jī)磷量顯著高于其他菌株(P<0.05),剩余菌株解有機(jī)磷量均小于65 μg·mL-1(圖3)。分離菌株溶無(wú)機(jī)磷量測(cè)定中,各菌株培養(yǎng)液pH值在5.33~6.82之間,菌株WNS 21(20.31 μg·mL-1)和NNS 14(16.12 μg·mL-1)溶無(wú)機(jī)磷量顯著高于其他菌株(P<0.05),剩余菌株溶無(wú)機(jī)磷量均小于17 μg·mL-1(圖4)。供試的20株內(nèi)生固氮菌均能夠同時(shí)解有機(jī)磷和溶無(wú)機(jī)磷,不同菌株溶磷量不同。另外,這些內(nèi)生固氮菌表現(xiàn)出解有機(jī)磷量大于溶無(wú)機(jī)磷量。

        圖3 歐李內(nèi)生固氮菌解有機(jī)磷

        圖4 歐李內(nèi)生固氮菌溶無(wú)機(jī)磷

        2.4 歐李優(yōu)良內(nèi)生固氮菌初步鑒定

        篩選10株固氮酶活性大于200 nmol C2H4·h-1·mL-1的菌株進(jìn)行鑒定,將測(cè)序結(jié)果在Ezbiocloud數(shù)據(jù)庫(kù)中與模式菌株進(jìn)行相似性比對(duì)。結(jié)果顯示,菌株NS1 14-1,NS1 14-2與短小芽孢桿菌(Bacilluspumilus)模式菌株相似度分別為99.38%和98.90%,并處于同一進(jìn)化分支;菌株NS 25和NS 26與副地芽孢桿菌(Bacillusparalicheniformis)模式菌株相似度分別為99.11%和98.77%,并處于同一進(jìn)化分支;菌株YNS 1與耐寒短桿菌(Brevibacteriumfrigoritolerans)的相似度為99.11%,并處于同一進(jìn)化分支;菌株WNS 21,NNS 15與貝萊斯芽孢桿菌(Bacillusvelezensis)模式菌株相似度分別為99.14%和99.36%,并處于同一進(jìn)化分支;菌株NS 8與梓樹(shù)類(lèi)芽孢桿菌(Paenibacilluscatalpae)模式菌株相似度為98.47%,并處于同一進(jìn)化分支;菌株YNS 6與堅(jiān)強(qiáng)細(xì)胞芽孢桿菌(Cytobacillusfirmus)模式菌株相似度為98.86%,并處于同一進(jìn)化分支;NNS 19與地衣芽孢桿菌(Bacilluslicheniformis)相似度為99.05%,與副地芽孢桿菌和地衣芽孢桿菌模式菌株處于同一進(jìn)化分支(圖5)。

        圖5 基于16S rDNA基因序列構(gòu)建10株內(nèi)生固氮菌系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)

        3 討論

        高效利用固氮微生物的前提是優(yōu)良菌株的挖掘與鑒定。本研究以歐李根系為研究材料,利用無(wú)氮培養(yǎng)基,分離獲得20株內(nèi)生固氮菌。從中篩選出10株固氮酶活性在200~450 nmol C2H4·h-1·mL-1之間的菌株,通過(guò)16S rDNA基因序列進(jìn)行比對(duì),這10株內(nèi)生固氮菌分別屬于芽孢桿菌屬(Bacillus)、類(lèi)芽孢桿菌屬(Paenibacillus)、細(xì)胞芽孢桿菌屬(Cytobacillus)和短桿菌屬(Brevibacterium)。類(lèi)芽孢桿菌屬和芽孢桿菌屬曾多次從小麥、珠芽蓼、蠶豆和馬鈴薯等植物中獲得[27-31]。說(shuō)明該菌屬在植物體內(nèi)生長(zhǎng)數(shù)量多,是內(nèi)生固氮菌的優(yōu)勢(shì)菌群,具有較強(qiáng)的地域廣泛性和作物適應(yīng)性,這對(duì)于今后微生物接種劑的生產(chǎn)應(yīng)用具有重要意義。

        在固氮酶活性測(cè)定中,固氮酶活性最高為菌株NS 25(424.81 nmol C2H4·h-1·mL-1)。傅曉方等[32]從玉米中分離內(nèi)生固氮菌,固氮酶活性最高為591.9 nmol C2H4·h-1·mL-1;李倍金等[33]從高羊茅根系中分離內(nèi)生固氮菌,固氮酶活性最高為2 865 nmol C2H4·h-1·mL-1,表明宿主植物種類(lèi)不同,可能是內(nèi)生固氮菌固氮酶活性出現(xiàn)差異的原因之一。此外內(nèi)生固氮菌NS 25被初步鑒定為副地芽孢桿菌,然而目前關(guān)于副地芽孢桿菌的固氮能力的研究卻鮮見(jiàn)報(bào)道。Ramírez-Cario等[34]研究發(fā)現(xiàn)副地芽孢桿菌對(duì)致使植物感染枯萎病的尖孢鐮刀菌(Fusariumoxysporum)和早疫病的鏈格孢(Alternariaalternata)均具有一定的拮抗能力[35]。Anand等[36]將固氮菌接種于鳳梨后,可顯著增加其葉片中的氮含量。推測(cè)該菌株在為歐李提供氮源方面發(fā)揮出積極作用外,對(duì)歐李真菌性病害的發(fā)生也具有一定的防治作用。

        本研究從歐李根系中分離的內(nèi)生固氮菌,除具有豐富的固氮酶活性之外,還兼具分泌IAA和溶磷的能力。分泌植物生長(zhǎng)素IAA的菌株可通過(guò)刺激植物根毛形成,增加側(cè)根和主根數(shù)量及長(zhǎng)度,形成一個(gè)高度分枝的根系系統(tǒng),從而增強(qiáng)植物對(duì)礦質(zhì)營(yíng)養(yǎng)和水分吸收的能力,并為其他有益微生物附生創(chuàng)造有利條件[37]。Ying等[38]研究發(fā)現(xiàn),IAA產(chǎn)生菌(Pseudomonassp.和Burkholderiasp.)使擬南芥幼苗根系高度分枝,根系變長(zhǎng)。本研究分離的內(nèi)生固氮菌均具有合成IAA的能力,如將這些菌株接種于歐李根部,對(duì)于歐李在極端環(huán)境下吸收更深層土壤中的水分和營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),同時(shí)對(duì)其固著土壤,發(fā)揮治理水土流失的生態(tài)作用具有重要意義。有研究證明,具有溶磷作用的內(nèi)生菌,能夠?qū)ν寥乐杏袡C(jī)磷與難溶性磷酸鹽進(jìn)行溶解[39],有利于宿主植物在磷素較少的土壤中生長(zhǎng)。陸藍(lán)翔等[40]從樟樹(shù)中分離獲得2株溶磷能力較強(qiáng)的菌株(ZS-1和ZS-3),在接種樟樹(shù)扦插苗后,可有效地促進(jìn)其生長(zhǎng)。本研究分離的內(nèi)生固氮菌解有機(jī)磷量最高為99.18 μg·mL-1,溶無(wú)機(jī)磷量最高為20.31 μg·mL-1。說(shuō)明此次分離的內(nèi)生固氮菌株還可通過(guò)提高歐李對(duì)環(huán)境中磷元素吸收利用來(lái)促進(jìn)其生長(zhǎng)。

        另外,綜合20株內(nèi)生固氮菌在固氮酶活性、分泌IAA和溶磷特性測(cè)定結(jié)果發(fā)現(xiàn),部分不同種屬菌株、相同種屬菌株間的特性測(cè)定結(jié)果存在差異,這可能與菌株自身遺傳特性有關(guān)[41]。此外,不同菌株對(duì)最適生長(zhǎng)的培養(yǎng)基組分和培養(yǎng)條件的需求存在很大差異[42],可能也會(huì)導(dǎo)致此現(xiàn)象的發(fā)生。

        4 結(jié)論

        本研究從歐李根系中分離獲得的20株內(nèi)生固氮菌具有固氮酶活性和其他特性(溶磷和分泌植物生長(zhǎng)素IAA),對(duì)歐李的生長(zhǎng)具有一定的促生潛力。從中篩選10株優(yōu)良內(nèi)生固氮菌經(jīng)鑒定共有芽孢桿菌屬(Bacillus)7株、短桿菌屬(Brevibacterium)1株、類(lèi)芽孢桿菌屬(Paenibacillus)1株和細(xì)胞芽孢桿菌屬(Cytobacillus)1株。本試驗(yàn)豐富了固氮微生物接種劑菌種資源庫(kù)。

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