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        PCI 對RelA的影響及血運(yùn)重建后的作用機(jī)制研究

        2022-04-23 06:39:00曹培東
        醫(yī)學(xué)信息 2022年8期
        關(guān)鍵詞:水平分析

        曹培東,桂 春

        (廣西醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院心內(nèi)一科,廣西 南寧 530021)

        動脈粥樣硬化(atherosclerosis)是一種以強(qiáng)烈的免疫活性為特征的炎癥性疾病,經(jīng)皮冠狀動脈介入治療(percutaneous coronary intervention,PCI)是臨床上最常見的治療動脈粥樣硬化性狹窄的方法。隨著對該病認(rèn)識的加深,選擇性免疫調(diào)節(jié)干預(yù)可能是抗動脈粥樣硬化治療的新方向,然而血運(yùn)重建后的免疫調(diào)節(jié)的相關(guān)機(jī)制尚未明確。RelA 又稱NF-κB3、MGC131774 和p65,是NF-κB 家族的5 個成員之一。NF-κB 轉(zhuǎn)錄因子家族作為連接免疫和炎癥的中心介質(zhì),是先天和后天免疫反應(yīng)的關(guān)鍵參與者[1]。其中,RelA 轉(zhuǎn)錄因子對調(diào)節(jié)T 細(xì)胞活化和穩(wěn)定至關(guān)重要[2]。本研究旨在驗(yàn)證PCI 對RelA 水平的影響,分析血運(yùn)重建后RelA 可能的作用機(jī)制,現(xiàn)報(bào)道如下。

        1 材料與方法

        1.1 材料 收集2019-2021 年廣西醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院收治的冠狀動脈狹窄≥90%的14 例動脈粥樣硬化患者冠脈支架植入術(shù)前和術(shù)后的血清樣本,患者均無心梗、中風(fēng)、糖尿病病史。人磷酸化核轉(zhuǎn)錄因子p65(pNF-KB P65)酶聯(lián)免疫分析(ELISA)試劑盒從上海酶聯(lián)生物科技有限公司購買。人冠狀動脈平滑肌細(xì)胞(HCASMCs)由武漢普諾賽生命科技有限公司提供。RelA-RNAi 慢病毒及陰性對照病毒購買于上海吉凱基因。

        1.2 ELISA 檢測及篩選目的基因 采用Elisa 法檢測術(shù)前和術(shù)后血清中RelA的水平,每例重復(fù)3 次。芯片數(shù)據(jù)GSE28829 來自開放數(shù)據(jù)庫GEO,包含13 個早期和16 個晚期頸動脈粥樣硬化斑塊樣本。利用GEO2R分析GSE28829,選擇校正后P<0.05 和|logFC|≥1的基因。在開放訪問網(wǎng)站PubMed2ensembl 中輸入“血運(yùn)重建(revascularization)”“免疫調(diào)節(jié)(immunoregulation)”提取所有非重復(fù)基因。三者交集為目的基因。

        1.3 功能富集分析 利用在線工具DAVID 對目的基因進(jìn)行功能富集分析,其中基因本體論(GO)對涉及生物過程(BP)、細(xì)胞成分(CC)和分子功能(MF)的基因進(jìn)行注釋[3];京都基因和基因組百科全書(KEGG)處理基因組、生物途徑、疾病和藥物[4]。

        1.4 構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)和分析關(guān)鍵基因(Hub gene)使用開放數(shù)據(jù)庫STRING 評估目的基因的PPI 信息,綜合得分>0.4的被選為顯著[5]。使用軟件Cytoscape 3.8.2 構(gòu)建PPI 可視化網(wǎng)絡(luò)[6]。分子復(fù)合物檢測(MCODE)用于發(fā)現(xiàn)給定網(wǎng)絡(luò)中緊密連接的節(jié)點(diǎn),篩選并可視化PPI 網(wǎng)絡(luò)中的重要模塊基因,篩選條件為等級截止=2,k-core=2,節(jié)點(diǎn)分?jǐn)?shù)截止=0.2,最大深度=100(degree cut-off=2,k-core=2,node score cut-off=0.2,max depth=100)。PPI 中的Hub 基因通過CytosHubba 根據(jù)最大團(tuán)簇中心性(MCC)原則,選擇最短路徑中的前6 個基因并進(jìn)行功能富集分析。

        1.5 TRRUST 數(shù)據(jù)庫驗(yàn)證 結(jié)合位點(diǎn)TRRUST v2,根據(jù)用戶輸入的功能/途徑/表型基因,查詢關(guān)鍵調(diào)控因子并進(jìn)行優(yōu)先排序[7]。

        1.6 實(shí)時定量PCR 將RelA-RNAi 慢病毒和陰性對照病毒分別轉(zhuǎn)染HCASMCs,提取總RNA,用紫外分光光度計(jì)測定其濃度和純度。用2-△△ct法分析mRNA的相對表達(dá)水平。

        1.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 使用SPSS 23.0 統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,計(jì)量資料以()表示,采用獨(dú)立樣本配對t檢驗(yàn),以P<0.05 表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 PCI 手術(shù)前后RelA 水平比較 以標(biāo)準(zhǔn)品的水平為橫坐標(biāo),OD 值為縱坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,并計(jì)算樣品中RelA 水平(表1、圖1)。術(shù)前RelA 水平為(13.59±2.69)μg/L,術(shù)后RelA 水平為(9.71±2.28)μg/L,支架置入前后RelA 差值為(3.88±3.68)μg/L,差值95%CI:1.75~6.01。術(shù)前RelA 水平高于術(shù)后,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=3.939,P=0.002)。

        圖1 RelA 水平的ROC 曲線圖

        表1 血清樣本中RelA的濃度(,μg/L)

        表1 血清樣本中RelA的濃度(,μg/L)

        2.2 目的基因的功能富集分析 利用GEO2R 分析,獲得217 個與“動脈粥樣硬化”相關(guān)的基因。在PubMed2ensembl 中獲得了581 個與“血運(yùn)重建”相關(guān)的基因,615 個與“免疫調(diào)節(jié)”相關(guān)的基因。三者之間的10 個重疊基因?yàn)槟康幕颍▓D2)。對其功能富集分析可見,目的基因主要通過白細(xì)胞跨內(nèi)皮遷移途徑參與防御反應(yīng)(圖3)。

        圖2 目的基因圖

        圖3 目的基因的功能富集分析

        2.3 Hub 基因的獲得與功能分析 基于STRING 數(shù)據(jù)庫構(gòu)建的可視化PPI 網(wǎng)絡(luò)(圖4),模塊基因(圖5),由8 個節(jié)點(diǎn)和24 條邊組成。根據(jù)MCC 方法篩選的6 個Hub 基因,包括PTPRC、ITGAM、VCAM1、MMP9、CXCR4 和SPP1,并均屬于模塊基因(圖6)。富集分析顯示,模塊基因與目的基因的作用方向一致,其中關(guān)鍵基因主要富集在白細(xì)胞的跨內(nèi)皮遷移途徑中(表2)。

        表2 模塊基因的功能富集分析(前2 名)

        圖4 目的基因的PPI 網(wǎng)絡(luò)

        圖5 模塊基因

        圖6 關(guān)鍵基因

        2.4 可調(diào)控關(guān)鍵基因的轉(zhuǎn)錄因子分析 在TRRUST數(shù)據(jù)庫中,MMP9、VCAM1、CXCR4 均受RelA的靶向調(diào)節(jié),見表3。

        表3 可調(diào)控關(guān)鍵基因的轉(zhuǎn)錄因子分析

        2.5 RelA 調(diào)控Hub 基因的mRNA 表達(dá)分析 抑制RelA 可降低HCASMCs 中VCAM1的mRNA 表達(dá),促進(jìn)MMP9 和CXCR4的mRNA 表達(dá),見圖7;引物序列見表4。

        圖7 實(shí)時定量PCR 檢測

        表4 引物序列

        3 討論

        動脈粥樣硬化是一種脂質(zhì)驅(qū)動的中大動脈進(jìn)行性炎癥疾病[8]。隨著人們對疾病的認(rèn)識,有證據(jù)表明[9],動脈粥樣硬化是一種基于病變內(nèi)免疫激活和細(xì)胞因子信號傳導(dǎo)的免疫介導(dǎo)疾病,免疫反應(yīng)參與動脈粥樣硬化的各個階段。目前,動脈粥樣硬化性疾病通常通過血管成形術(shù)和支架術(shù)來實(shí)現(xiàn)血管重建,但介入部位的炎癥反應(yīng)導(dǎo)致的再狹窄可能會再次降低治療效果。因此,動脈內(nèi)膜切除術(shù)和經(jīng)皮介入等血管手術(shù)后再狹窄是動脈粥樣硬化區(qū)抗炎治療的首要條件[10]。隨著免疫抑制劑對T 細(xì)胞免疫抑制作用的發(fā)現(xiàn)和對VSMCs 增殖的抑制,術(shù)后再狹窄以藥物洗脫支架的形式得以預(yù)防[11]。然而,血運(yùn)重建后的免疫調(diào)節(jié)機(jī)制尚未完全闡明。

        RelA/p65 作為NF-κB 家族的成員之一,含量最為豐富,并具有特殊的反式激活結(jié)構(gòu)域,是炎癥反應(yīng)基因的有效轉(zhuǎn)錄激活劑[12],可調(diào)控多個下游靶基因的轉(zhuǎn)錄活性,參與多種重要的細(xì)胞活動。已有研究表明[13],lncRNA H19 可通過上調(diào)RelA 促進(jìn)動脈粥樣硬化。miR-520c-3p 通過下調(diào)RelA 來抑制PDGF-BB介導(dǎo)的增殖、遷移和G2/M 期細(xì)胞百分比的降低,進(jìn)而抑制動脈粥樣硬化斑塊形成[14]。此外,IL-8 誘導(dǎo)的中性粒細(xì)胞胞外陷阱通過激活巨噬細(xì)胞中的NF-κB 信號加重動脈粥樣硬化[15]。本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),PCI 術(shù)后RelA 水平較術(shù)前降低(P<0.05),這可能有利于減輕PCI 術(shù)后的炎癥反應(yīng)。

        此外,本研究中生物信息學(xué)分析表明,參與血運(yùn)重建后的免疫調(diào)節(jié)基因主要與防御反應(yīng)有關(guān),并通過白細(xì)胞跨內(nèi)皮遷移途徑發(fā)揮作用。白細(xì)胞通過激活的靜脈壁遷移是一種基本的免疫反應(yīng),啟動了白細(xì)胞在靜脈壁內(nèi)和通過靜脈壁的極化運(yùn)動,受刺激的血管細(xì)胞將導(dǎo)致一過性屏障的破壞[16]。因此,白細(xì)胞不受控制的跨內(nèi)皮遷移能夠加劇動脈粥樣硬化進(jìn)展[17]。同時,本研究結(jié)果顯示,與免疫調(diào)節(jié)相關(guān)的VCAM1、MMP9 和CXCR4 均受RelA的直接調(diào)控,且RelA的降低抑制了HCASMCs 中VCAM1的mRNA 表達(dá),促進(jìn)了MMP9 和CXCR4的mRNA 表達(dá)。已有研究表明[18-20],VCAM1的表達(dá)能夠促進(jìn)炎癥反應(yīng),加重動脈粥樣硬化病變,CXCR4的表達(dá)則抑制動脈粥樣硬化的炎癥反應(yīng),限制動脈粥樣硬化進(jìn)展。MMP9 在動脈粥樣硬化患者中表達(dá)較高[21],其水平升高不僅與斑塊不穩(wěn)定有關(guān)[22],還可增加炎性細(xì)胞因子的分泌,是心臟重塑中炎癥反應(yīng)的潛在生物標(biāo)志物。因此,PCI 術(shù)后RelA的降低主要通過調(diào)節(jié)白細(xì)胞跨內(nèi)皮遷移途徑參與了免疫調(diào)節(jié)作用。

        綜上所述,PCI 術(shù)后RelA的降低參與了免疫調(diào)節(jié),并主要發(fā)揮抑制炎癥反應(yīng)的作用,但其上調(diào)的MMP9 與斑塊不穩(wěn)定有關(guān),這對PCI 術(shù)后的免疫調(diào)節(jié)治療具有一定的指導(dǎo)意義。

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