華敏敏, 施惠娟, 茹彥飛
(1)上海市生物醫(yī)藥技術(shù)研究院,國家衛(wèi)生健康委員會計(jì)劃生育藥具重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,復(fù)旦大學(xué), 上海 200032; 2)西湖大學(xué)生命科學(xué)與生物醫(yī)學(xué)浙江省實(shí)驗(yàn)室,浙江省結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/浙江省生長調(diào)控和轉(zhuǎn)化研究 重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,生命科學(xué)學(xué)院, 杭州 310024)
精子是一類高度特異化的細(xì)胞,它的發(fā)育起始于睪丸中的原始生殖細(xì)胞,經(jīng)歷一系列復(fù)雜的精子發(fā)生過程,最終在附睪中發(fā)育為成熟精子。成熟精子經(jīng)由受精過程與卵子結(jié)合,在將父源性的遺傳信息傳遞給子代的同時(shí),還會傳遞大量的表觀遺傳信息,包括DNA甲基化、組蛋白修飾及非編碼RNA等,這些信息的改變并不依賴于DNA序列的變化。表觀遺傳信息與遺傳信息一起,共同參與了受精過程及早期胚胎的發(fā)育,并可能最終影響子代的健康[1-4]。
依據(jù)已有的發(fā)育生物學(xué)及流行病學(xué)數(shù)據(jù),環(huán)境因素可能是影響子代健康的重要因素[5]。從蠕蟲到哺乳動物,包括人類,親本的生活環(huán)境可影響子代的健康[6, 7]。Anway等[8]最先證明,對孕期大鼠進(jìn)行環(huán)境因素——內(nèi)分泌干擾物(vinclozolin)——的暴露可導(dǎo)致子代雄性大鼠睪丸DNA甲基化水平發(fā)生改變,同時(shí)引起精子質(zhì)量的下降,且這些改變可持續(xù)至F4代。另有在人群樣本中研究發(fā)現(xiàn),吸煙以及營養(yǎng)狀況的改變可導(dǎo)致可遺傳的健康變化。例如,子代較易出現(xiàn)糖尿病和心血管疾病等[9, 10]。此外,來自不同實(shí)驗(yàn)室的研究均表明,環(huán)境暴露包括高脂飲食(high fat diet, HFD)[1, 11]、低蛋白飲食(low protein diet, LPD)[4]和心理壓力[12, 13]等,可引起父代表型變化,并可通過父代生殖系統(tǒng)以非孟德爾遺傳的方式傳遞給后代。以上結(jié)果均提示,環(huán)境暴露可能引起親本生殖細(xì)胞(精子或卵子)表觀遺傳信息的變化,從而影響自身的發(fā)育與健康。雖然這種環(huán)境暴露不直接作用于子代,但其產(chǎn)生的獲得性性狀可通過生殖細(xì)胞傳遞給子代,同時(shí)對子代的健康產(chǎn)生影響,這種現(xiàn)象即被稱為跨代遺傳[14, 15]。
對于哺乳動物而言,遺傳是一個(gè)復(fù)雜的調(diào)控過程,從雄性表觀遺傳學(xué)角度,驗(yàn)證跨代遺傳有一定的挑戰(zhàn)性:首先,配子經(jīng)過表觀遺傳重編程,并通過受精過程,實(shí)現(xiàn)表觀遺傳信息的傳遞。其次,血睪屏障的存在阻礙了體細(xì)胞與生殖細(xì)胞之間的生物信息交流(乃至子代)。此外,由于精子和卵子的體積相差懸殊,傳統(tǒng)的遺傳觀點(diǎn)認(rèn)為,與母系相比,父系對子代的貢獻(xiàn)較為有限。但雌性環(huán)境暴露研究中遇到的困難在于,難以區(qū)分環(huán)境因素作用的對象是卵子還是胚胎[16]。相比之下,雄性環(huán)境暴露則相對簡單,主要通過精子影響子代。因此是研究跨代遺傳相關(guān)機(jī)制的較為理想的模型[17]。
傳統(tǒng)觀念認(rèn)為,許多新陳代謝相關(guān)疾病(例如糖尿病)既與遺傳相關(guān),也與患者的生活方式及環(huán)境相關(guān),僅部分與遺傳變異相關(guān)。但越來越多的研究證實(shí),表觀遺傳在其中發(fā)揮一定的作用。因此,理解跨代遺傳的可能機(jī)制,可為研究人類相關(guān)疾病奠定基礎(chǔ)。本綜述主要討論哺乳動物中的雄性相關(guān)的跨代遺傳,并重點(diǎn)探討精子小非編碼RNAs(small noncoding RNAs, sncRNAs)作為表觀遺傳調(diào)控因子,在跨代遺傳中的可能機(jī)制。
親代經(jīng)歷的特定環(huán)境暴露可影響子代健康。該現(xiàn)象最早是通過人群中的流行病學(xué)調(diào)查得出的。例如,有研究發(fā)現(xiàn),1944~1955年間荷蘭大饑荒時(shí)期,母親在懷孕期間遭受饑餓可導(dǎo)致孩子新陳代謝相關(guān)疾病的比例顯著增加[18]。男性方面,2006年P(guān)embrey等[10]研究發(fā)現(xiàn),父親若有早年吸煙史,其兒子青少年時(shí)期的身體質(zhì)量指數(shù)(body mass index, BMI)較高。對來自瑞典Overkalix地區(qū)的人群進(jìn)行連續(xù)3代觀察的研究顯示,祖父的飲食習(xí)慣與其孫輩的健康狀況及其死亡率相關(guān)[9]。
大量動物實(shí)驗(yàn)同樣表明,父代環(huán)境暴露可影響子代表型。在飲食相關(guān)暴露中,父代高脂飲食(high fat diet,HFD)將導(dǎo)致F1代雌鼠葡萄糖不耐受[19]。父代低蛋白飲食(low protein diet,10vs.19 %蛋白質(zhì)飲食,根據(jù)體重計(jì)算)會導(dǎo)致子代肝中膽固醇合成異常[20]。對雄鼠在交配前進(jìn)行饑餓處理,將導(dǎo)致其子代血糖水平降低[21]。還有研究顯示,父代的心理壓力會提高子代的壓力敏感性,同時(shí)子代皮質(zhì)醇水平及葡萄糖代謝出現(xiàn)異常[6, 12, 22]。近幾年,也有許多關(guān)于毒性物質(zhì)暴露的相關(guān)研究。例如,在四氯化碳(carbon tetrachloride,CCl4)導(dǎo)致雄性大鼠肝損傷的模型中,其子代肝臟的成纖維細(xì)胞減少[7];若對雄性小鼠進(jìn)行乙酰苯氣味暴露,其所產(chǎn)子代同樣會對該物質(zhì)敏感[23];父代尼古丁暴露后,子代對尼古丁以及其他有毒物質(zhì)(例如可卡因)的代謝耐受提高[24]。同時(shí),子代肝臟中多個(gè)與有毒物質(zhì)清除相關(guān)的基因表達(dá)水平升高,且子代對毒性物質(zhì)的耐受表型將不僅僅局限于尼古丁相關(guān),而是廣譜耐受。值得注意的是,在大多數(shù)研究中,父代環(huán)境暴露相關(guān)的跨代遺傳表現(xiàn)為子代對疾病的敏感性升高。
精子核具有高度壓縮的致密結(jié)構(gòu),體積約為普通體細(xì)胞的1/6。隨著受精過程的完成,父代表觀遺傳信息可通過精子傳遞至受精卵,乃至子代[17]。在這個(gè)漫長的過程中,組蛋白被魚精蛋白替換,精子細(xì)胞DNA本身及其相關(guān)蛋白質(zhì)發(fā)生了表觀遺傳修飾。例如,DNA甲基化、組蛋白修飾,以及sncRNAs調(diào)控等。它們共同作用,改變了精子中的表觀遺傳信息,在精子染色質(zhì)重塑、合子、胚胎、胎兒乃至子代的發(fā)育過程中發(fā)揮重要的作用。
目前,關(guān)于“精子傳遞表觀遺傳”的觀點(diǎn)尚存在爭議,主要是因?yàn)楹献优c原始生殖細(xì)胞(primary germ cell, PGC)中存在表觀遺傳重編程。這其中,包括2個(gè)獨(dú)立的階段:從PGCs發(fā)育至胚胎性腺(E10.5-E12.5),以及受精后的合子到胚胎植入前的桑椹胚階段。該過程可擦除大部分環(huán)境暴露所產(chǎn)生的表觀遺傳標(biāo)記。DNA甲基化產(chǎn)生的m5C,由DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶(DNA methyltransferase, DNMT)催化,可通過脫氨基或是羥基化作用,實(shí)現(xiàn)脫甲基化[25]。有研究表明,環(huán)境暴露后,精子DNA甲基化的類型發(fā)生變化,但這些DNA甲基化的改變在其后代中檢測不到[26]。表觀遺傳重編程還包括組蛋白修飾的擦除,在精子形成過程中,組蛋白H4高度乙?;癁榻M蛋白被魚精蛋白替換提供基礎(chǔ);同時(shí),這種重編程對維持精子功能至關(guān)重要。有研究表明,線蟲中的H3K4me2去甲基化酶LSD1/KDM1對組蛋白的作用,可避免將錯(cuò)誤的信息傳遞給后代[27]。此外,值得注意的是印跡基因的保留,意即其在受精后可逃逸重編程,并將特定的父代表型,以及異常的甲基化印跡通過精子傳遞給子代,這些印跡基因?qū)ε咛ゼ捌浣M織器官的發(fā)育有著深遠(yuǎn)的影響[28]。一項(xiàng)關(guān)于輔助生殖技術(shù)(assisted reproductive technologies, ART)的研究表明,不育(尤其是少精癥)患者的精子,在ART治療過程中可將印跡基因錯(cuò)誤地傳遞給子代,并導(dǎo)致后代的健康風(fēng)險(xiǎn)升高[29]。以上研究結(jié)果提示,精子中可能存在表觀遺傳信息的傳遞,能夠逃脫表觀遺傳重編程,參與跨代遺傳。近年來,關(guān)于精子sncRNAs在哺乳動物跨代遺傳中的研究越來越多,提示它們或許會作為重要的表觀遺傳調(diào)控因子參與其中。本綜述主要就該部分內(nèi)容展開討論。
sncRNAs,長度< 50 nt,是調(diào)控基因表達(dá)的表觀遺傳因子之一,可以通過與翻譯機(jī)器相互作用和/或通過降解其靶mRNA(message RNA)發(fā)揮功能。隨著實(shí)驗(yàn)方法與技術(shù)的發(fā)展,例如高通量技術(shù)及RNA測序技術(shù)(RNA sequencing, RNA-seq),人們在哺乳動物成熟精子中發(fā)現(xiàn)及鑒定到大量精子sncRNAs,主要為tRNA來源的小RNAs(transfer RNA-derived small RNAs,tsRNAs,也被稱為tRFs,tRNA fragments),其次為rRNA來源的小RNAs(risbosome-RNA derived small RNAs, rsRNAs)與微RNA(microRNAs, miRNAs),及PIWI蛋白相互作用RNAs(PIWI-interacting small RNAs, piRNAs)等[30-33]。
精子sncRNAs重要成員之一是tRNA來源的小RNAs,或被稱為tRNA fragments(tRFs)(29~34 nt),主要來源于成熟tRNA或是pre-tRNA的5′-端,在許多細(xì)胞類型中均有表達(dá),在精子細(xì)胞中表達(dá)尤其豐富[1, 4, 30, 31]。通過小鼠精子RNA-seq分析發(fā)現(xiàn),它在成熟精子中表達(dá)比例最高,是成熟精子sncRNAs的主要組分,但是目前其功能尚不十分明確[31]。在其他哺乳動物(例如人類與大鼠)成熟精子中,同樣表達(dá)大量tsRNAs[34]。tsRNAs可根據(jù)其在tRNAs的來源分為5類[35]:5′-tRNA halves、3′-tRNA halves、5′-tRFs(tRNA-derived RNA fragment)、i-tRFs(internal tRFs)及3′-tRFs。tsRNAs最初被認(rèn)為是tRNAs的隨機(jī)降解產(chǎn)物。最近的研究顯示,tsRNAs的生成是被高度調(diào)控的過程,具有一定的位點(diǎn)特異性,在某些細(xì)胞中來源于一些特定的tRNAs類型[36]。在缺少輔助生殖技術(shù)的情況下,將精子sncRNAs用T4多核苷酸激酶(polynucleotide kinase,PNK)處理后,環(huán)磷酸鹽從RNA的3′-端脫落,從而可以復(fù)制這些RNA序列,使得tsRNAs的表達(dá)水平升高。這表明,在雄性生殖系統(tǒng)中,RNaseA和/或RNase T家族內(nèi)切酶參與tsRNAs的加工過程[37]。tsRNAs可在轉(zhuǎn)錄水平、轉(zhuǎn)錄后水平以及翻譯水平調(diào)控基因的表達(dá)[38]。tsRNAs在精子中的相關(guān)功能目前尚不清楚,推測不同類型的tsRNAs可能通過不同的作用機(jī)制發(fā)揮作用。
rsRNAs是新近發(fā)現(xiàn)的一類在成熟精子中大量表達(dá)的sncRNAs,來源于rRNAs的5′-端部分。在RNA聚合酶Ⅰ(RNA polymeraseⅠ, PolⅠ)的作用下,由前體rRNAs(45S pre-rRNAs)轉(zhuǎn)錄而來,并最終生成一系列的rsRNAs,包括18S、5.8S、28S rsRNAs[39]。在哺乳動物中,rRNAs基因(rDNAs)由許多重復(fù)序列(nucleolar organizer regions, NORs)成簇組成,中間有間隔序列(long intergenic spacers, IGSs),可通過改變轉(zhuǎn)錄頻率或是轉(zhuǎn)錄本基因拷貝數(shù)來調(diào)控rRNAs的生成,例如改變DNA甲基化水平、組蛋白修飾、核小體的位置等方式激活/沉默rRNAs的轉(zhuǎn)錄與表達(dá),從而影響生物體的發(fā)育與分化[39]。目前研究表明,成熟精子中的rsRNAs主要來源于28S,稱之為rsRNA-28S,約為21~45 nt,其主要在小鼠附睪尾部成熟精子中大量表達(dá)[30, 40, 41]。此外,在脂多糖(lipopolysaccharide, LPS)誘導(dǎo)的急性炎癥小鼠精子中,rsRNA-28S大量表達(dá),表明其高表達(dá)可能和炎癥反應(yīng)相關(guān)[40]。由于目前關(guān)于精子rsRNAs的研究才剛剛起步,其在精子細(xì)胞中的表達(dá)及功能還有待進(jìn)一步的探索。
miRNAs是目前研究較多的一類精子sncRNAs。其特征為具有發(fā)卡結(jié)構(gòu),長度約為22 nt。miRNAs來源于幾百個(gè)帶有發(fā)卡結(jié)構(gòu)的核苷酸轉(zhuǎn)錄本,轉(zhuǎn)錄形成pri-miRNAs(primary miRNAs, pri-miRNAs)后,在RNase Ⅲ Drosha的作用下產(chǎn)生miRNAs前體(precursor miRNAs, pre-miRNAs)。pre-miRNAs含有1個(gè)發(fā)卡結(jié)構(gòu),長度約為70~100 nt,這些pre-miRNAs在輸出蛋白5(exportin 5)的幫助下出核進(jìn)入胞質(zhì),在胞質(zhì)中由RNase Ⅲ Dicer切割形成成熟miRNAs。成熟miRNAs與Argonatue(Ago2)形成RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合物(RNA-induced silencing complex, RISC),通過堿基互補(bǔ)配對定位于靶mRNA的3′-非編碼區(qū)(3′-untranslated region, 3′-UTR),最終導(dǎo)致靶mRNA降解或是翻譯抑制,從而在表觀遺傳水平下調(diào)基因的表達(dá)[42-46]。值得注意的是,miRNA-mRNA是一個(gè)較為復(fù)雜調(diào)控網(wǎng)絡(luò),一個(gè)miRNA可以靶向許多mRNAs;同時(shí),1個(gè)mRNA也可以被許多miRNAs調(diào)控。
piRNAs也是精子細(xì)胞中時(shí)空特異性表達(dá)的一類sncRNAs。成熟的piRNAs由長的單鏈轉(zhuǎn)錄本切割產(chǎn)生,長度為24~32 nt,主要成簇分布在長度在20~90 kb的基因簇上。piRNAs的來源主要為:基因組中的piRNA簇或轉(zhuǎn)座子區(qū)域、內(nèi)含子及外顯子序列。piRNAs具有以下特性:可特異性地與PIWI家族蛋白質(zhì)成員相互作用,5′-末端具有很強(qiáng)的U堿基偏好性;3′-末端被2′-O-Me修飾,以保護(hù)其免受核酸外切酶降解[47]。在哺乳動物中,piRNAs生成途徑主要有2種:初級生成途徑和次級生成途徑[48]。目前認(rèn)為,PIWI/piRNA主要具有沉默抑制基因組遺傳元件,調(diào)控基因表達(dá),調(diào)控蛋白質(zhì)翻譯及蛋白質(zhì)穩(wěn)定性等作用[49, 50]。研究發(fā)現(xiàn),在mili缺失突變的小鼠睪丸中,L1 elements的甲基化水平明顯下降,表明piRNAs可能參與介導(dǎo)了L1 elements的甲基化修飾[51]。piRNAs還能通過序列不完全互補(bǔ)配對識別靶mRNA,以一種類似miRNA的機(jī)制介導(dǎo)其翻譯抑制,在小鼠精子發(fā)育后期mRNA大規(guī)模清除[50]。此外,小鼠PIWI/piRNA還能通過與翻譯起始因子eIF3F相互作用,介導(dǎo)精子發(fā)育中huR結(jié)合的mRNA翻譯[49]等。目前僅在線蟲中發(fā)現(xiàn)了piRNAs介導(dǎo)的環(huán)境暴露相關(guān)跨代遺傳現(xiàn)象[52],Rechavi等[53]發(fā)現(xiàn),在饑餓情況下,線蟲piRNAs生成增加,營養(yǎng)相關(guān)基因表達(dá)發(fā)生變化,且變化可持續(xù)至F3代。Belicard 等[54]研究發(fā)現(xiàn),提高線蟲的培養(yǎng)溫度(從20 ℃提高至25 ℃),piRNAs的生成將會減少,并可導(dǎo)致基因表達(dá)變化,該變化同樣可持續(xù)至F3代。在同樣的培養(yǎng)條件下,病菌感染則會使線蟲piRNAs生成的增加,子代的健康狀況也得到了一定程度的恢復(fù)。但哺乳動物中相關(guān)研究報(bào)道則較少。
首次證明精子RNAs可以影響子代表型的研究是在小鼠模型中進(jìn)行的副突變相關(guān)研究。在該研究中發(fā)現(xiàn),在Kit(酪氨酸激酶受體)轉(zhuǎn)基因的純合雄性小鼠所產(chǎn)生野生型后代中,具有和其父代一樣的表型(尾顏色發(fā)生變化,呈白色)。若將Kit突變小鼠純化的精子RNAs通過顯微注射進(jìn)野生型受精卵,可將父代白尾的突變表型傳遞給子代[55]。該團(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn),若分別將靶向Cdk9和Sox9的RNAs同樣顯微注射進(jìn)野生型受精卵中,這2個(gè)基因的表達(dá)水平會升高,并引起嚴(yán)重的表型變化(分別是心肌肥大和巨人癥)[56]。越來越多的研究證明,sncRNAs是精子中重要的表觀遺傳因子,它們可能參與調(diào)控跨代遺傳。
動物模型方面,目前研究較多的環(huán)境暴露是飲食暴露[57]。低蛋白質(zhì)或是高脂飲食小鼠的成熟精子中sncRNAs表達(dá)水平發(fā)生變化。雄鼠給予低蛋白質(zhì)飲食暴露后,其雄性子代可產(chǎn)生與父代類似的肝的膽固醇生物合成異常,精子中5′-tsRNAs(5′-端tRNA來源的tsRNAs),例如tRF-GlyGCC、tRF-GlyTCC、 tRF-GlyCCC(均為解碼甘氨酸的tRNA來源的5′-tsRNAs,GCC、TCC、CCC為tRNA的反密碼子,下同),tRNA-LysCTT以及tRNA-HisGTT的表達(dá)水平上調(diào),miRNA(let-7c)表達(dá)下調(diào)[4];Carone等[20]對父代低蛋白質(zhì)飲食暴露的小鼠子代的肝細(xì)胞進(jìn)行基因組測序,發(fā)現(xiàn)子代膽固醇及脂質(zhì)代謝相關(guān)基因的表達(dá)發(fā)生改變,其表觀遺傳修飾發(fā)生改變,例如胞嘧啶甲基化修飾,多個(gè)miRNAs的表達(dá)水平(例如miR-210、let-7a、let-7f-1、let-7f-2、miR-21、miR-98、miR-199)也發(fā)生變化。另有研究表明,高脂飲食暴露將導(dǎo)致雄性小鼠精子tsRNAs表達(dá)水平整體升高。同時(shí),將小鼠精子tsRNAs通過顯微注射進(jìn)野生型受精卵,子代將產(chǎn)生和父代類似的新陳代謝表型。這表明,tsRNAs可以作為父代飲食暴露相關(guān)的表觀遺傳信息傳遞者[1, 41]。在大鼠中,高脂飲食暴露同樣可改變精子中一些sncRNAs的表達(dá),包括piRNAs(piR-025883, piR-015935, piR-036085),miRNAs(let-7c, miR-293, miR-880)以及tRNA-GluCTC[58]。Cropley等對雄性小鼠進(jìn)行西方飲食(western diet)暴露,父代小鼠具有肥胖及糖尿病前期病癥表型,所產(chǎn)F1、F2代雄性小鼠即使給予健康飲食,其新陳代謝仍表現(xiàn)異常。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),F(xiàn)1子代小鼠精子中,多個(gè)sncRNAs表達(dá)發(fā)生變化,例如miR-10a、miR-10b表達(dá)顯著上調(diào),tRNA-GlyGCC、tRNA-GluCTC表達(dá)水平明顯降低[11, 59]。若將這些雄性小鼠精子或是睪丸中RNAs顯微注射進(jìn)正常受精卵中,則所產(chǎn)子代可重現(xiàn)這些表型。有趣的是,研究發(fā)現(xiàn),若在野生型受精卵中注射單一的miRNA(miR-19)即可在子代中實(shí)現(xiàn)表型重現(xiàn);該子代和正常雌鼠交配后,部分代謝異常表型在其后代(subsequent generations)中仍會出現(xiàn)[11]。以上研究均表明,精子sncRNAs參與了環(huán)境暴露導(dǎo)致跨代遺傳,尤其是tsRNAs與let-7較易受飲食影響而發(fā)生表達(dá)變化。
心理壓力同樣會導(dǎo)致精子sncRNAs表達(dá)水平變化,例如早期生活創(chuàng)傷或是慢性壓力等。由于多種神經(jīng)系統(tǒng)疾病與下丘腦-垂體-性腺軸(hypothalamic-pituitary-adrenal axis,HPA軸)相關(guān),例如精神分裂癥和抑郁癥等[60]。因此,心理壓力也可能對生殖系統(tǒng)產(chǎn)生影響。有研究表明,父代遭受長期壓力應(yīng)激后,小鼠精子中9個(gè)miRNAs表達(dá)發(fā)生顯著變化,同時(shí)子代HPA軸應(yīng)答遲緩[12]。研究進(jìn)一步將這9個(gè)miRNAs混合后,顯微注射到正常受精卵中,所產(chǎn)子代同樣表現(xiàn)為HPA軸失調(diào)[13]。另一項(xiàng)研究表明,通過給交配前的雄性小鼠(F0代)持續(xù)4周服用含有糖皮質(zhì)激素(corticosterone, CORT)的水來模擬應(yīng)激狀態(tài)下父代小鼠的生理變化,盡管糖皮質(zhì)激素并不產(chǎn)生父代小鼠的焦慮行為,但其F1雄性小鼠具有類似的焦慮行為,F(xiàn)1雌性小鼠則表現(xiàn)為恐懼消失。有趣的是,父本印記基因Igf2的表達(dá)在F1雄性后代參與應(yīng)激的大腦海馬中表達(dá)增加,但在雌性后代海馬中則表達(dá)下調(diào)。糖皮質(zhì)激素組F2代雄性和雌性小鼠均表現(xiàn)為焦慮程度降低,但只有糖皮質(zhì)激素組F2雄性小鼠抑郁行為增加;與對照組相比,糖皮質(zhì)激素組后代精子中,大量sncRNAs表達(dá)發(fā)生變化,其中主要為miRNAs。其中,3種miRNAs(miR-98、miR-144和miR-190b)表達(dá)水平升高,預(yù)測它們可能與多種生長因子(包括Igf2和Bdnf)相關(guān)[61]。在創(chuàng)傷性壓力小鼠模型中,雄性小鼠暴露于母子分離所帶來的早期生活壓力(maternal separation coupled with unpredictable maternal stress, MSUS),此類壓力現(xiàn)象可傳遞給子代(F1、F2代),使其行為學(xué)以及新陳代謝發(fā)生異常,且F1代小鼠精子中miRNAs表達(dá)水平上調(diào),piRNAs表達(dá)下調(diào)。值得注意的是,在F2、F3代中,雖然具有類似的表型,但精子sncRNAs表達(dá)水平則未見明顯變化。若將父代小鼠精子sncRNAs顯微注射進(jìn)正常受精卵中,所產(chǎn)子代與父代的表型類似[6]。此外,進(jìn)一步的研究顯示,父代早期生活創(chuàng)傷可影響精子sncRNAs以及長非編碼RNAs(long non-coding RNAs, lncRNAs),通過顯微注射的方式,分別將sncRNAs與lncRNAs注射進(jìn)正常受精卵,產(chǎn)生的子代具有不同的表型,sncRNAs組表現(xiàn)為體重異常,抑郁傾向;lncRNAs組表現(xiàn)為新陳代謝異常,較為焦慮[62]。以上研究表明,壓力和應(yīng)激水平的變化可以改變精子sncRNAs表達(dá)水平,并且這些變化可能影響后代的表型。
毒性物質(zhì)暴露也可產(chǎn)生跨代遺傳。例如,雌性大鼠孕前vinclozolin(乙烯菌核利,一種農(nóng)藥)暴露可導(dǎo)致子代大鼠生精細(xì)胞凋亡,腎組織異常等,其F3代雄性大鼠具有類似表型,且精子中大量sncRNAs表達(dá)發(fā)生變化,其中變化最多的是tsRNAs中的5′-halves[63]。若對雌性小鼠孕前進(jìn)行DDT(殺蟲劑)暴露,其表型(例如肥胖)可在子代雄鼠中重現(xiàn),并可傳遞至F3代。其中,每一代小鼠精子的DNA甲基化水平、sncRNAs表達(dá)水平均發(fā)生顯著變化[64]。若父代雄鼠長期酒精暴露,可增加子代雄鼠的酒精耐受以及子代雌鼠的焦慮情緒;同時(shí),通過高通量測序發(fā)現(xiàn),子代精子中tsRNAs、線粒體小RNA以及miRNAs的表達(dá)水平發(fā)生變化;精子sncRNAs的轉(zhuǎn)錄后修飾受到影響,線粒體tRNAs中2種核苷修飾增加,附睪中tRNA甲基轉(zhuǎn)移酶NSun2表達(dá)水平降低[65-67]。由于NSun2是一種5′胞嘧啶甲基的生成酶[68],因此推測酒精暴露可能影響tsRNAs的表達(dá)。
另有其他一些暴露同樣可導(dǎo)致跨代遺傳。例如有研究發(fā)現(xiàn),雄鼠感染弓形蟲后,精子的密度和活動力等均有顯著降低,行為學(xué)實(shí)驗(yàn)顯示大腦受損,神經(jīng)精神行為異常,精子sncRNAs表達(dá)水平也發(fā)生顯著變化,其F1、F2子代同樣具有類似表型;同時(shí),若將父代雄鼠精子sncRNAs通過顯微注射進(jìn)野生型受精卵,所產(chǎn)子代也具有部分類似表型[69]。另有一些暴露對機(jī)體有良性促進(jìn)作用。例如,體育鍛煉與認(rèn)知訓(xùn)練可增加小鼠大腦突觸可塑性,并且該現(xiàn)象會傳遞給子代;進(jìn)一步通過顯微注射實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),該現(xiàn)象可能是通過精子sncRNAs介導(dǎo)的,尤其是miRs-212/132在其中發(fā)揮了重要作用[70]。
綜上所述,許多研究證實(shí),環(huán)境暴露可影響精子sncRNAs的表達(dá)(Table 1)。例如,飲食暴露主要影響tsRNAs與let-7表達(dá),壓力主要影響miRNAs表達(dá)等。此外,值得注意的是,由于環(huán)境暴露種類和暴露時(shí)間的不同,可能會導(dǎo)致不同的表觀遺傳因子在其中發(fā)揮主要作用。例如,小鼠從出生到斷奶期間進(jìn)行低蛋白質(zhì)飲食暴露,精子中rDNAs(ribosomal DNAs)的DNA甲基化水平發(fā)生變化[71];然而,若小鼠從斷奶開始低蛋白質(zhì)飲食暴露,其中sncRNAs的表達(dá)水平發(fā)生變化,但是rDNAs的甲基化水平則未見發(fā)生明顯變化[4, 72]。其中具體的作用機(jī)制仍有待進(jìn)一步的研究。
父代環(huán)境因素是如何影響配子表觀遺傳信息以及子代表型的?如上所述,許多研究證實(shí),父代環(huán)境因素可影響精子sncRNAs水平;然而,研究人員對于環(huán)境暴露是如何影響精子sncRNAs表達(dá)的仍知之甚少。已有研究顯示,父代環(huán)境因素可能通過以下途徑影響精子sncRNAs表達(dá)。
環(huán)境暴露可能直接影響sncRNAs表達(dá)。臨床研究表明,在創(chuàng)傷后的壓力失調(diào)及抑郁癥傾向人群中,其血液中的Dicer1表達(dá)水平降低,而壓力刺激相關(guān)的大腦杏仁體活性升高[73]。Dicer1是RNase III 核酸內(nèi)切酶,參與經(jīng)典miRNAs生成途徑[74]。它在精子發(fā)生和維持男性生育力中發(fā)揮作用,在雄性小鼠原始生殖細(xì)胞(primary germ cells, PGCs)中條件性敲除Dicer1,可導(dǎo)致雄性子代PGCs生成異常,精子發(fā)育阻滯在圓形精子階段[75, 76]。Dias等[77]發(fā)現(xiàn),小鼠大腦伏核區(qū)的Dicer1可能參與下游β-catenin/Wnt信號通路,在長期恐懼壓力下的小鼠中,若將Dicer1敲除,壓力相關(guān)表型隨之消失。有研究表明,長期壓力下,小鼠神經(jīng)元細(xì)胞氧化應(yīng)激水平升高,并可通過影響Dicer1的活性,抑制miRNAs的生成,導(dǎo)致miRNAs的表達(dá)水平降低[78];而同時(shí)有研究表明,原發(fā)性不育癥患者體內(nèi),其氧化應(yīng)激水平通常較高[79]。在精子中,Dicer1是否也發(fā)揮類似功能,有待更多的研究。
精子sncRNAs也可通過膜泡(extracellular vesicles, EVs)或類似結(jié)構(gòu)進(jìn)入精子。最近研究發(fā)現(xiàn),附睪小體(epididymosomes, EPs)中有miRNAs與tsRNAs表達(dá),這些sncRNAs可以通過附睪小體與精子的相互作用,從而遷移到精子中。說明附睪可以作為環(huán)境感知器官,將這些信息通過膜泡以sncRNAs的形式傳遞給成熟精子,從而影響子代的表型[15, 80-83]。父代酒精暴露小鼠模型中,附睪小體中tsRNAs變化與精子中的變化類似,提示精子中sncRNAs可能來源于附睪小體[65]。有研究發(fā)現(xiàn),肥胖及精神壓力可引起炎癥[84, 85],在高脂飲食暴露導(dǎo)致的肥胖[86],或心理應(yīng)激情況[87]下,小鼠血睪屏障破壞,體細(xì)胞膜泡加速遷移至發(fā)育的生精細(xì)胞與精子細(xì)胞。在上文中提到的酒精暴露小鼠中,附睪中NSun2表達(dá)水平的降低,可導(dǎo)致附睪小體中tsRNAs水平升高[65]。研究進(jìn)一步將正常小鼠精子與酒精暴露組的精子附睪小體共孵育,并通過IVF(invitrofertilization)產(chǎn)生子代,發(fā)現(xiàn)子代同樣具有父代焦慮表型,并對酒精的敏感度降低。該研究表明,附睪中的附睪小體可將酒精暴露引起的表型傳遞給子代[66]。此外,精液樣本中含有大量微生物[88],可以釋放與附睪小體類似的膜泡,并有可能給改變精子中sncRNAs表達(dá)水平[89]。因此,含有sncRNAs的膜泡作為遷移載體,可介導(dǎo)精子-精子和/或雌性-精子信息交流。類似的研究有望建立新的環(huán)境因素相關(guān)的進(jìn)化機(jī)制。
Table 1 Selection of studies providing evidence of transgenerational inheritance of sperm sncRNAs in murine models
環(huán)境暴露還可能影響精子sncRNAs的遷移。游離于膜泡外的體液中的sncRNAs可通過結(jié)合蛋白質(zhì),具有特殊的二級結(jié)構(gòu),或是特定的RNA修飾,從而穩(wěn)定存在[90, 91],并在細(xì)胞間進(jìn)行遷移。有研究發(fā)現(xiàn),特定的5′-tsRNAs可具有G-4偶聯(lián)體結(jié)構(gòu),從而參與神經(jīng)保護(hù)應(yīng)答。有趣的是,含有G-4偶聯(lián)體結(jié)構(gòu)的tsRNAs會被神經(jīng)元細(xì)胞吸收[92]。這表明,該特殊結(jié)構(gòu)可促進(jìn)sncRNAs的跨膜運(yùn)動。該現(xiàn)象意味著,雖然大多數(shù)血清中的tsRNAs都是以游離形式存在于膜泡外,但它們或可通過特定的結(jié)構(gòu)(例如G-4偶聯(lián)體),從而進(jìn)入精子細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)sncRNAs的遷移,為sncRNAs表達(dá)變化提供了新的研究方向。
染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的重塑也會影響sncRNAs的表達(dá)。成熟的精子中包含許多mRNAs與sncRNAs[93]。最近,通過過表達(dá)賴氨酸特異的組蛋白脫甲基酶1(lysine-specific histone demethylase 1,LSD1)轉(zhuǎn)基因小鼠,可以觀察到,父代LSD1過表達(dá)會影響子代的發(fā)育,而后代生殖細(xì)胞系中該基因的表達(dá)缺失,但缺陷表型仍然存在[94]。這些轉(zhuǎn)基因?qū)е碌娜毕莶⒉荒芡ㄟ^CpG島DNA甲基化水平變化而傳遞,而是與子代正常精子中的異常RNAs表達(dá)水平相關(guān)。推測精子RNAs表達(dá)異常可能導(dǎo)致子代表型缺陷。這有可能是由于異常表達(dá)的精子RNAs導(dǎo)致的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)變化,并反過來影響RNAs表達(dá)。目前,在線蟲中已發(fā)現(xiàn)類似的RNA依賴的反饋調(diào)控機(jī)制[52, 95],而在哺乳動物中這一觀點(diǎn)有待進(jìn)一步證實(shí)。
越來越多的證據(jù)表明,在哺乳動物中,父代環(huán)境因素產(chǎn)生的影響可以通過精子傳遞給子代,sncRNAs則可能作為精子中環(huán)境因素相關(guān)的表觀遺傳因子,參與父源性的跨代遺傳。目前,環(huán)境暴露相關(guān)動物研究主要集中在飲食暴露和壓力應(yīng)激等,對人類活動中較為常見酒精暴露和尼古丁暴露等則涉及較少。同時(shí),關(guān)于精子sncRNAs在跨代遺傳中的作用,仍有許多重要的科學(xué)問題待解決。例如,一種環(huán)境暴露是否影響某一類特定的表觀遺傳因子;不同的表觀遺傳因子之間是否存在相互作用;環(huán)境因素是通過何種方式影響精子中sncRNAs表達(dá)變化的?精子中sncRNAs表達(dá)水平的變化是如何影響受精卵,乃至子代健康的?隨著單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)的不斷進(jìn)步,可以對精子與胚胎的sncRNAs進(jìn)行更為詳細(xì)的鑒定分析,所涉及的相關(guān)機(jī)制也將得到深入探索,從而為研究跨代遺傳的獲得性表型提供思路,并通過結(jié)合人群流行病調(diào)查結(jié)果與臨床數(shù)據(jù),為人類生殖健康相關(guān)研究提供新的線索,為相關(guān)疾病(例如糖尿病)的診斷、靶向治療及預(yù)后評估等提供分子靶點(diǎn)。