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        生化發(fā)光分析儀最優(yōu)檢測路徑的動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法研究*

        2022-04-20 08:51:24魯子鵬孫鳳云蘇昂劉
        傳感技術(shù)學(xué)報(bào) 2022年2期
        關(guān)鍵詞:規(guī)劃法微孔分析儀

        魯子鵬孫鳳云蘇 昂劉 劍

        (山東大學(xué)控制科學(xué)與工程學(xué)院生物醫(yī)學(xué)工程研究所,山東 濟(jì)南 250061)

        生化發(fā)光分析儀是一種集成光學(xué)、電子學(xué)和生物化學(xué)等多學(xué)科門類的綜合性測量儀器[1],其檢測結(jié)果是臨床醫(yī)生診斷疾病的重要依據(jù)。 近年來,在市場需求和科技發(fā)展的雙重驅(qū)動(dòng)下,國產(chǎn)生化分析儀得到快速發(fā)展。 然而與國外進(jìn)口設(shè)備相比,國產(chǎn)儀器仍普遍存在自建檢測系統(tǒng)性能難以保障,檢測精度不高,用戶體驗(yàn)差等問題,其中復(fù)雜的檢測過程是造成這些缺陷的重要原因[2]。

        用于生化檢測的微孔板上有幾十甚至幾百個(gè)微孔檢測位點(diǎn),如圖1(a)所示。 但是在實(shí)際應(yīng)用中往往只有部分微孔是放有樣本的有效檢測位點(diǎn),如圖1(b)所示(●為假設(shè)有效檢測位點(diǎn))。 在此情況下,如果逐一檢測每個(gè)微孔位點(diǎn),檢測效率必然很低,浪費(fèi)大量的時(shí)間。 除此之外,過長時(shí)間的檢測過程還會導(dǎo)致檢測誤差的增大。 因?yàn)樯磻?yīng)產(chǎn)生的光學(xué)信號往往隨時(shí)間動(dòng)態(tài)衰減,檢測過程花費(fèi)的時(shí)間越多,則檢測后面有效位點(diǎn)時(shí)帶來的誤差越大。因此,根據(jù)有效檢測位點(diǎn)的位置合理規(guī)劃一條檢測線路對于提高生化分析儀檢測效率、減少檢測誤差具有重要意義。

        圖1 生化發(fā)光分析儀96 孔微孔板和微孔板平面圖

        最優(yōu)檢測線路的選擇過程就是路徑規(guī)劃求最優(yōu)解的過程,路徑規(guī)劃分為全局規(guī)劃和局部規(guī)劃[3],本文檢測路線選擇符合全局路徑規(guī)劃適用條件。 目前常用于路徑規(guī)劃的算法有枚舉法[4],蟻群算法[5],混沌優(yōu)化算法[6],F(xiàn)loyd 算法[7],遺傳算法[8-9]等。 但這些算法并不適合生化分析儀微孔檢測的最優(yōu)路徑規(guī)劃。 以枚舉法為例,枚舉法的實(shí)現(xiàn)過程是將探針移動(dòng)的所有路徑找到然后比較路徑長度,選取長度最短的路徑作為最優(yōu)路徑。 整個(gè)計(jì)算過程較為繁瑣,只適合路徑數(shù)量較少的路徑選擇問題。 而蟻群算法、混沌算法等算法也因?yàn)橛?jì)算量大、過程復(fù)雜等缺點(diǎn)無法用于微孔板的最優(yōu)路徑規(guī)劃問題。

        除了上述的幾種算法外,還有一種專門用于多階段決策問題的算法——?jiǎng)討B(tài)規(guī)劃法[10]。 動(dòng)態(tài)規(guī)劃法由美國數(shù)學(xué)家貝爾曼(Bellman R E)等人基于最優(yōu)化原理[11]提出,通過拆分問題,定義狀態(tài)之間的關(guān)系,將多階段決策轉(zhuǎn)換成一系列中間狀態(tài)的決策問題[12]。 相比于其他算法,動(dòng)態(tài)規(guī)劃法的優(yōu)勢在于運(yùn)算過程簡單且重復(fù)運(yùn)算量少。 在求解過程中,每個(gè)中間狀態(tài)只求解一次,并且前一中間狀態(tài)的解將為下一中間狀態(tài)求解提供線索,通過求解過程的層層遞進(jìn),最終獲取系統(tǒng)最優(yōu)解。 因?yàn)閯?dòng)態(tài)規(guī)劃法的求解過程只依賴相鄰中間狀態(tài)的解,不必進(jìn)行大量重復(fù)運(yùn)算,所以得到了廣泛應(yīng)用。

        本文首先對動(dòng)態(tài)規(guī)劃法的兩個(gè)適用條件進(jìn)行解析,然后基于微孔板的自身特性,建立適用于生化分析儀檢測過程的最優(yōu)路徑規(guī)劃數(shù)學(xué)模型,并定義了移動(dòng)路徑的中間狀態(tài)以及狀態(tài)之間的增益取值的計(jì)算方式,最終利用狀態(tài)遞歸方程求得生化分析儀探針移動(dòng)的最優(yōu)路徑。

        1 多孔矩陣檢測路徑動(dòng)態(tài)規(guī)劃適應(yīng)性解析

        動(dòng)態(tài)規(guī)劃法的實(shí)現(xiàn)需要兩個(gè)基本條件,本文結(jié)合圖1(b)對這兩個(gè)基本條件進(jìn)行分析。

        ①最優(yōu)化分析:生化分析儀探針移動(dòng)方向?yàn)閺腁 行到H 行,將包含有效檢測位點(diǎn)的每一行的檢測過程看作一個(gè)中間狀態(tài)。 則對圖1(b)中微孔板的總體檢測過程可以拆分為7 個(gè)狀態(tài),為S1,S2,…,S7,分別對應(yīng)A 行,B 行,C 行,E 行,F(xiàn) 行,G 行以及H 行的檢測,如圖2 所示。 通過計(jì)算,篩選,保留可能達(dá)到總體最優(yōu)解的中間狀態(tài)解,并根據(jù)各中間狀態(tài)的關(guān)系依次獲取解,最終中間狀態(tài)得到的解就是總體最優(yōu)解。

        ②無后效性分析:這七個(gè)中間過程存在遞進(jìn)關(guān)系,相互之間并不獨(dú)立,但每一個(gè)狀態(tài)的最優(yōu)解只與上一狀態(tài)的解有關(guān),與實(shí)現(xiàn)上一狀態(tài)解的過程無關(guān)[13]。 具體來說,生化分析儀的探針檢測完第x行(x取值為A-H 行中任一行)的最優(yōu)路程只與檢測完x-1 行后所選擇的路徑有關(guān),與x-1 行之前選擇的路徑無關(guān)。

        通過分析可知,生化分析儀的探針最優(yōu)路徑?jīng)Q策問題滿足動(dòng)態(tài)規(guī)劃最優(yōu)化原理,具有最優(yōu)子結(jié)構(gòu)、無后效性。 因此,可用動(dòng)態(tài)規(guī)劃法來解決問題。

        2 多孔矩陣檢測路徑動(dòng)態(tài)規(guī)劃建模與求解

        本文基于動(dòng)態(tài)規(guī)劃法和微孔板的自身特性建立了路徑規(guī)劃模型,模型由七個(gè)中間狀態(tài)組成,每個(gè)中間狀態(tài)(如S1)下具有多個(gè)解(由●表示),如圖2所示。 線徑則表示兩個(gè)相鄰中間狀態(tài)的轉(zhuǎn)移關(guān)系,以A03→B05 為例,表示以A03 為起點(diǎn),檢測完B 行的所有有效位點(diǎn)后最終停在B05 位點(diǎn)所需要的最短路徑,A03→B05 對應(yīng)的探針移動(dòng)路徑如圖3 所示。 由圖可知,該路徑長度為11。

        圖2 探針檢測路徑規(guī)劃模型

        圖3 A03→B05 代表的探針移動(dòng)路徑

        模型建立的具體過程如下。

        ①劃分中間狀態(tài)并求解

        中間狀態(tài)的劃分是為了簡化多階段決策問題的計(jì)算過程,中間狀態(tài)的選取既要能描述過程的演變,也要滿足無后效性[14]。 每個(gè)中間狀態(tài)往往有多個(gè)解,但每個(gè)解在整體決策過程中只求一次,結(jié)果會被保存下來,需要時(shí)直接調(diào)用而不必再重新計(jì)算。 該過程可以減少重復(fù)計(jì)算,并且中間狀態(tài)越多,效果越明顯。

        中間狀態(tài)的求解順序并不是唯一的,既可以將S1 當(dāng)作首個(gè)中間狀態(tài),也可以將S7 當(dāng)作首個(gè)中間狀態(tài),即順序標(biāo)號和逆序標(biāo)號,這兩種標(biāo)號方式的結(jié)果是唯一確定的[15],并不影響最終結(jié)果,本文選用順序標(biāo)號進(jìn)行標(biāo)記。

        ②狀態(tài)決策

        計(jì)算完當(dāng)前中間狀態(tài)的所有解后,就要進(jìn)行狀態(tài)決策,即根據(jù)當(dāng)前狀態(tài)的所有解與下一狀態(tài)之間的增益選擇兩個(gè)狀態(tài)間最合適的移動(dòng)路徑。 其中狀態(tài)增益是指當(dāng)前狀態(tài)轉(zhuǎn)移到下一狀態(tài)所需要的距離,當(dāng)前狀態(tài)下每一個(gè)解都有其對應(yīng)的狀態(tài)增益。

        ③建立狀態(tài)遞歸方程并求最優(yōu)解

        利用中間狀態(tài)的遞歸關(guān)系,求系統(tǒng)最優(yōu)解的過程總共有七個(gè)步驟:

        步驟1 考慮第一個(gè)中間過程:從START 開始,到檢測完A 行所有有效位點(diǎn)整個(gè)過程一共有2 個(gè)解。即探針具有兩條可選路徑,路徑長度分別為9 和6,分別對應(yīng)START→A03,START→A06 兩條路徑。

        步驟2 考慮前兩個(gè)中間過程:第一階段、第二階段走完第A,B 行所有有效位點(diǎn)并停留在B 行任意一個(gè)有效檢測位點(diǎn)這整個(gè)過程一共有3 條路徑,即三個(gè)解,分別用S1,S2,S3來表示,每個(gè)解都由第一個(gè)中間過程的解以及他們對應(yīng)的狀態(tài)增益決定。

        通過比較三個(gè)解的值可以發(fā)現(xiàn),S1的值最小,所以S1為前兩個(gè)中間過程的最優(yōu)解。 對應(yīng)的探針路徑為START→A06→B02,路徑長度為15。

        步驟3 考慮前三個(gè)中間過程:與步驟2 類似,求兩個(gè)解S4,S5:

        通過比較兩個(gè)解的值可以發(fā)現(xiàn),S5為前三個(gè)中間過程的最優(yōu)解,對應(yīng)的路徑為START→A06→B02→C11,路徑長度為25。

        步驟4 考慮前四個(gè)中間過程:與上述步驟類似,求得兩個(gè)解S6,S7的值分別為34,35。 通過比較得出前四個(gè)中間過程的最優(yōu)解對應(yīng)的路徑為START→A06→B02→C11→E04,路徑長度為34。

        步驟5 考慮前五個(gè)中間過程:與上述步驟類似,求得兩個(gè)解S8,S9的值分別為43,42,得出前五個(gè)中間狀態(tài)的最優(yōu)解對應(yīng)的路徑為START→A06→B02→C11→E04→F07,路徑長度為42。

        步驟6 考慮前六個(gè)中間過程:與上述步驟類似,求得最終解S10,S11,S12的值分別為55,59,54,得出前六個(gè)中間過程的最優(yōu)解54,對應(yīng)的路徑為START→A06→B02→C11→E04→F02→G10,路徑長度為54。

        步驟7 考慮前七個(gè)中間過程:與上述步驟類似,求得最終解S13,S14的值分別為62,63,得到前七個(gè)中間過程,也是整體過程的最優(yōu)解為62。

        3 結(jié)果與分析

        根據(jù)上述計(jì)算結(jié)果,從生化分析儀探針的起始位置開始檢測完所有有效位點(diǎn)并最終停留在微孔板H行有效位點(diǎn)所需的最短路徑長度為62,對應(yīng)的路徑有三條。 其中一條為START→A06→B05→C11→E04→F02→G10→H03,如圖4 所示。 另外,圖5 展示了生化發(fā)光分析儀微孔板的有效檢測位點(diǎn)的平面位置,以最優(yōu)路徑START→A06→B05→C11→E04→F02→G10→H03 對應(yīng)的探針具體行進(jìn)軌跡。

        圖4 最優(yōu)路徑規(guī)劃模型

        圖5 探針的最優(yōu)路徑行進(jìn)軌跡

        為了對比說明動(dòng)態(tài)規(guī)劃法對于路徑規(guī)劃問題計(jì)算量的簡化,本文將動(dòng)態(tài)規(guī)劃法與枚舉法的計(jì)算量進(jìn)行了對比,如表1 所示。 枚舉法需要將所有可能的線路找到并比較其長度,從而求得最短路徑[16],在計(jì)算路徑長度的時(shí)候,勢必會重復(fù)計(jì)算各個(gè)中間過程,造成計(jì)算量的浪費(fèi)。 根據(jù)比較結(jié)果,對于圖1(b)中所示的有效位點(diǎn)檢測路徑規(guī)劃,枚舉法需要進(jìn)行2 016次加法運(yùn)算,遠(yuǎn)大于動(dòng)態(tài)規(guī)劃法的32 次加法運(yùn)算。由此可以看出動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法對于運(yùn)算量的大幅簡化。

        表1 動(dòng)態(tài)規(guī)劃法與枚舉法計(jì)算量對比表

        為了進(jìn)一步驗(yàn)證生化發(fā)光分析儀最優(yōu)檢測路徑動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法的性能,本文選取探針的順序檢測路線和“之字形”檢測路線作為對照組,分別計(jì)算他們的檢測路線所需要的路徑長度和檢測時(shí)長,并與動(dòng)態(tài)規(guī)劃法的最優(yōu)路徑作對比,以此來證明動(dòng)態(tài)規(guī)劃法得到最優(yōu)檢測路線對于檢測效率的提高。

        探針的順序檢測路線是指探針從起點(diǎn)出發(fā),對包含有效檢測位點(diǎn)的有效檢測行進(jìn)行從A 行→H行的順序檢測,對有效檢測行內(nèi)的檢測位點(diǎn)進(jìn)行從左到右的順序檢測,檢測路線如圖6 所示。 以前兩個(gè)有效檢測行為例進(jìn)行說明:A 行中包含A03,A06這兩個(gè)有效檢測位點(diǎn),B 行中包含B02,B05,B08 這三個(gè)有效檢測位點(diǎn),則探針在前兩個(gè)有效檢測行的檢測軌跡為A03→A06→B02 →B05 →B08。

        圖6 探針的順序檢測軌跡

        探針的“之字形”檢測路線是指探針按照從A 行→H 行的順序進(jìn)行檢測,對檢測行內(nèi)的有效檢測位點(diǎn)采用順序逆序交替的方法進(jìn)行檢測,探針的具體移動(dòng)軌跡如圖7 所示。 以前兩個(gè)有效檢測行為例進(jìn)行說明:A 行中包含A03,A06 這兩個(gè)有效檢測位點(diǎn),采用順序檢測法,檢測順序?yàn)锳03→A06;B 行中包含B02,B05,B08 這三個(gè)有效檢測位點(diǎn),采用逆序檢測法,檢測順序?yàn)锽08→B05→B03。 所以探針在前兩個(gè)有效檢測行的檢測軌跡為A03→A06→B08→B05→B03。

        圖7 探針的“之字形”檢測軌跡

        表2 對比了三種探針檢測路線的路徑長度和檢測時(shí)長。 從表2 中可以清晰地看出動(dòng)態(tài)規(guī)劃法的最優(yōu)路徑長度最短,為62 步;順序檢測法得出的檢測路徑最長,為81 步。 相比于順序檢測法,動(dòng)態(tài)規(guī)劃法的檢測效率提高了23.46%,縮短了約18 s 的檢測時(shí)間。 相比于探針的“之字形”檢測路徑,動(dòng)態(tài)規(guī)劃法的最優(yōu)路徑檢測效率提高了1.59%,縮短了約1 s的檢測時(shí)間。 從這三種探針檢測路線的對比中可以得到最優(yōu)檢測路徑的動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法能夠提高檢測效率,減小檢測時(shí)間。

        表2 三種檢測路線對比表

        4 結(jié)束語

        動(dòng)態(tài)規(guī)劃法著眼全局,在逐一得到各個(gè)階段最優(yōu)解的情況下確定全局最優(yōu)解,是一種解決復(fù)雜動(dòng)態(tài)系統(tǒng)最優(yōu)控制的有效工具。 本文首先介紹動(dòng)態(tài)規(guī)劃法基本思想,解析了利用其優(yōu)化多孔矩陣檢測路徑的最優(yōu)化和無后效性條件,建立多孔矩陣檢測路徑規(guī)劃數(shù)學(xué)模型,并給出了最優(yōu)路徑的詳細(xì)求解過程。 與枚舉法相比,動(dòng)態(tài)規(guī)劃法在變量較多時(shí)可顯著降低計(jì)算量,通過快速篩選最優(yōu)路徑縮短檢測時(shí)間,減小信號衰減帶來的誤差,提高分析儀的檢測效率和準(zhǔn)確性。

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