張家豪，陸潔淼，丁鈺婷，秦路平，朱 波

西紅花根際可培養(yǎng)細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)、多樣性及分布規(guī)律

張家豪，陸潔淼，丁鈺婷，秦路平*，朱 波*

浙江中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院，浙江 杭州 311402

探討西紅花根際可培養(yǎng)細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)及其分布規(guī)律。收集浙江建德、上海崇明、陜西澄城西紅花球莖根際土，用傳統(tǒng)涂布法分離根際細(xì)菌，分析根際細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)、多樣性及其與球莖生長(zhǎng)性狀、土壤理化因子間的相關(guān)性。共分離得到西紅花根際細(xì)菌2450株，劃分為65個(gè)分類(lèi)單元，歸屬到4個(gè)門(mén)，6個(gè)綱，17個(gè)科，28個(gè)屬，31種；其中最優(yōu)勢(shì)門(mén)為厚壁菌門(mén)（Firmicutes，相對(duì)頻率為66.76%），最優(yōu)勢(shì)屬為芽孢桿菌屬（相對(duì)頻率為57.71%）；產(chǎn)地和土壤理化因子影響西紅花根際細(xì)菌多樣性和菌群結(jié)構(gòu)，陜西澄城2根際細(xì)菌多樣性指數(shù)最高（′＝2.590 1），土壤有效磷含量與多樣性指數(shù)呈最大正相關(guān)（＝0.910，＜0.05）；有機(jī)質(zhì)與蒼白桿菌屬分離頻率呈最大負(fù)相關(guān)（＝?0.956，＜0.01）；球莖縱徑與菌群多樣性指數(shù)顯著相關(guān)（＝?0.806，＜0.05）；球莖鮮質(zhì)量與根際細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)顯著相關(guān)，其中球莖鮮質(zhì)量與芽孢桿菌屬分離頻率呈最大正相關(guān)（＝0.793，＜0.05）。西紅花根際可培養(yǎng)細(xì)菌資源豐富，產(chǎn)地土壤理化因子、球莖鮮質(zhì)量與西紅花根際細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)和多樣性顯著相關(guān)，高豐度芽孢桿菌屬可能對(duì)西紅花球莖生長(zhǎng)起有益作用。

西紅花；根際細(xì)菌；菌群結(jié)構(gòu)；多樣性；土壤理化因子

西紅花系鳶尾科番紅花屬植物西紅花L.的干燥柱頭，具有活血化瘀、涼血解毒、解郁安神的功效，可用于經(jīng)閉癥瘕、產(chǎn)后瘀阻、溫毒發(fā)斑、憂郁痞悶、驚悸發(fā)狂[1]。現(xiàn)代藥理學(xué)研究表明西紅花具有抗血栓、抗抑郁、抗阿爾茨海默病等作用，臨床效果顯著[2-4]。

西紅花植株是三倍體不育植株[5]，只能通過(guò)西紅花球莖無(wú)性繁殖，一個(gè)西紅花球莖只能開(kāi)4～6朵花，每采收110 000～170 000朵花才能收獲1 kg干燥的西紅花柱頭[6]，產(chǎn)量極低，大量依賴進(jìn)口。西紅花球莖地下生長(zhǎng)物候期為每年11月至笠年5月，因此根際微生物對(duì)西紅花球莖生長(zhǎng)發(fā)育至關(guān)重要。已有研究表明，根際細(xì)菌可以通過(guò)產(chǎn)生生長(zhǎng)素、固氮、溶磷等作用[7-9]，促進(jìn)植物的生長(zhǎng)、發(fā)育和代謝[10]，韓麗珍等[11]發(fā)現(xiàn)根際細(xì)菌sp. P5 灌根可以增加花生幼苗鮮質(zhì)量35.12%。此外，根際細(xì)菌多樣性和菌群結(jié)構(gòu)的改變可以影響宿主抗病性、抗非生物脅迫能力、生長(zhǎng)和品質(zhì)[12-15]，Hou等[14]研究發(fā)現(xiàn)根際施以67種核心菌群可以促進(jìn)擬南芥在弱光條件下生長(zhǎng)但不增強(qiáng)其抗病性，施以116種其他菌群增強(qiáng)了擬南芥的抗病性但不調(diào)控其生長(zhǎng)，表明根際不同菌群結(jié)構(gòu)的功能具有差異。分析根際微生物多樣性和菌群結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系對(duì)開(kāi)發(fā)微生物資源，保護(hù)藥用植物資源具有長(zhǎng)遠(yuǎn)意義。

本研究以西紅花根際土為研究對(duì)象，對(duì)西紅花根際細(xì)菌進(jìn)行分離、純化與鑒定，探討菌群結(jié)構(gòu)與多樣性，分析其與產(chǎn)地、球莖大小的相關(guān)性，為后續(xù)篩選功能菌株菌群提供參考依據(jù)。

1 材料與儀器

1.1 材料

西紅花球莖采自浙江省建德市、上海市崇明區(qū)、陜西省澄城縣，各2組，分別編號(hào)1、2。經(jīng)浙江中醫(yī)藥大學(xué)張巧艷教授鑒定為鳶尾科番紅花L.的球莖。

1.2 試劑與儀器

細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒[天根生化科技（北京）有限公司]；2×Taq Mix（＋Dye）（莫納生物科技有限公司）；Regular Agarose G-10（BIOWEST，基因有限公司）；DL2 000 DNA Marker [寶日醫(yī)生物技術(shù)（北京）有限公司]。FA2204B型萬(wàn)分之一電子天平（上海天美天平儀器有限公司）；YP10002型電子天平（上海佑科儀器儀表有限公司）；YXQ-LS-75S II型立式壓力蒸汽滅菌鍋（上海博迅實(shí)業(yè)有限公司）；LM I-100型霉菌培養(yǎng)箱（上海龍躍儀器設(shè)備有限公司）；MC-100B型立式恒溫?fù)u床（上海牟測(cè)儀器科技有限公司）；GenoSens 1850型凝膠成像分析系統(tǒng)（上海勤翔科學(xué)儀器有限公司）；1300 Series A2型生物安全柜（美國(guó)Thermo Fisher Scientific公司）；Veriti 96 Well Thermal Cycler型PCR儀（美國(guó)Thermo Fisher Scientific公司）；Centrifuge 5427R型臺(tái)式高速冷凍離心機(jī)（德國(guó)Eppendorf公司）；F-500型火焰光度計(jì)（上海元析儀器有限公司）；SpectraMax 190型全波長(zhǎng)酶標(biāo)儀（美國(guó)Molecular Devices公司）。

2 方法

2.1 土壤理化因子測(cè)定

按照吳恙等[16]的方法，取西紅花球莖根際土。水土比5∶2，以水為浸提劑，采用pH計(jì)測(cè)定土壤pH；采用重鉻酸鉀容量法測(cè)定土壤有機(jī)質(zhì)含量[17]；采用Olsen法測(cè)定土壤有效磷[18]；采用標(biāo)準(zhǔn)酸滴定法測(cè)定土壤堿解氮[19]；采用火焰光度計(jì)測(cè)定速效鉀[20]。

2.2 球莖生長(zhǎng)性狀的測(cè)定

用直尺測(cè)量西紅花球莖縱徑、橫徑，用電子天平測(cè)量西紅花球莖鮮質(zhì)量。按照球莖鮮質(zhì)量進(jìn)行編號(hào)如下：浙江建德1（球莖鮮質(zhì)量＜25 g）、浙江建德2（球莖鮮質(zhì)量＞30 g）、上海崇明1（球莖鮮質(zhì)量＜25 g）、上海崇明2（球莖鮮質(zhì)量＞25 g）、陜西澄城1（球莖鮮質(zhì)量＜10 g）、陜西澄城2（球莖鮮質(zhì)量＞15 g），每組50個(gè)。

2.3 根際細(xì)菌的分離與純化

用無(wú)菌水將根際土配制成0.1～10?6濃度梯度的混懸液，涂布于培養(yǎng)基上分離根際細(xì)菌[21]，NA培養(yǎng)基用于分離普通細(xì)菌，改良高氏1號(hào)培養(yǎng)基用于分離放線菌。

2.4 細(xì)菌16S分子鑒定

將分離得到的單一菌株通過(guò)單菌落形態(tài)特征包括形態(tài)、顏色、干濕、凹凸等，進(jìn)行分類(lèi)。以天根試劑盒提取細(xì)菌DNA。采用16S rDNA通用引物27F（5’-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’）和1492R（5’-TACGGCTACCTTGTTACGACTT-3’）進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR采用50 μL體系，包括25 μL 2×Taq Mix，21 μL ddH2O，2 μL模板DNA，上下游引物各1 μL[22]。擴(kuò)增結(jié)果經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)合格后，由生工生物工程（上海）股份有限公司進(jìn)行序列測(cè)定。測(cè)序結(jié)果于NCBI進(jìn)行BLAST比對(duì)，采用MEGA 7軟件建立系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，確定分離菌株的分類(lèi)地位。

2.5 根際細(xì)菌多樣性及組成分析

分離頻率以相對(duì)頻率（relative frequency，RF）表示，具體為分離到的某細(xì)菌的菌株數(shù)占分離到總菌株數(shù)的百分?jǐn)?shù)。優(yōu)勢(shì)菌群通過(guò)Camargo指數(shù)（1/S）確定，如果某一菌群的相對(duì)頻率＞1/S，則該菌群為優(yōu)勢(shì)菌群[23]。采用Shannon-Wiener指數(shù)（′）分析根際細(xì)菌的生物多樣性[24]。采用Pielou均勻度指數(shù)（）分析不同物種分布的均勻程度[25]。采用Maragalef指數(shù)（）來(lái)評(píng)價(jià)物種豐富度[26]。

2.6 數(shù)據(jù)分析

采用SPSS軟件對(duì)西紅花生境因子、球莖生長(zhǎng)性狀與根際細(xì)菌RF、多樣性進(jìn)行皮爾遜相關(guān)性分析，結(jié)果以相關(guān)系數(shù)（）表示。

3 結(jié)果與分析

3.1 西紅花根際土壤理化因子

不同產(chǎn)地西紅花根際土壤理化因子存在差異（＜0.05）（表1）。供試西紅花根際土壤堿解氮變幅為77.011～245.431 mg/kg，其中浙江建德2堿解氮含量最大，達(dá)245.431 mg/kg，陜西澄城1球莖最小，質(zhì)量分?jǐn)?shù)僅為77.011 mg/kg。土壤速效鉀平均值為354.299 mg/kg，變幅為76.448～878.290 mg/kg，變幅較大，浙江建德1速效鉀含量（878.290 mg/kg）數(shù)值最大，上海崇明1速效鉀含量（76.448 mg/kg）數(shù)值最小，浙江建德1速效鉀含量約為上海崇明1含量的11.5倍。土壤pH變幅為5.20～8.33，變幅較小，其中陜西澄城1的pH數(shù)值最大，達(dá)8.33。

表1 不同產(chǎn)地西紅花根際土壤理化因子()

Table 1 Physical and chemical properties of C. sativus rhizospheric soil from different habitats ()

采集地點(diǎn)pH有機(jī)質(zhì)/(g·kg?1)有效磷/(mg·kg?1)堿解氮/(mg·kg?1)速效鉀/(mg·kg?1) 浙江建德15.20±0.1319.134±1.09226.072±0.416200.949±5.910 878.290±15.559 浙江建德26.22±0.1521.489±0.62912.215±0.862 245.431±12.552611.921±8.063 上海崇明17.62±0.0622.172±0.08725.625±0.850 156.363±10.018 76.448±5.227 上海崇明28.05±0.1224.100±0.20933.087±1.018113.663±5.992 83.183±7.686 陜西澄城18.33±0.0611.371±0.07851.220±1.296 77.011±7.998 231.828±10.952 陜西澄城28.32±0.0311.251±0.08355.390±1.275127.017±8.351 244.125±10.596

3.2 西紅花球莖生長(zhǎng)性狀

不同產(chǎn)地西紅花生長(zhǎng)性狀存在差異（＜0.05）（表2）。供試西紅花球莖鮮質(zhì)量變幅為8.50～32.05 g，平均鮮質(zhì)量為21.17 g，其中浙江建德2球莖鮮質(zhì)量數(shù)值最大，達(dá)32.05 g，陜西澄城1球莖最小，平均鮮質(zhì)量?jī)H為8.90 g。球莖橫徑平均值為3.88 cm，變幅為2.90～4.59 cm，變幅較大，上海崇明2球莖橫徑（4.59 cm）數(shù)值最大，陜西澄城1球莖橫徑（2.90 cm）數(shù)值最小，上海崇明2橫徑約為陜西澄城1橫徑的1.6倍。球莖縱徑變幅為1.90～3.07 cm，平均值為2.55 cm，其中浙江建德2的縱徑數(shù)值最大，達(dá)3.07 cm。

表2 西紅花球莖生長(zhǎng)性狀()

Table 2 Growth characteristics of C. sativus corm ()

產(chǎn)地橫徑/cm縱徑/cm鮮質(zhì)量/g 浙江建德13.62±0.31c2.55±0.21c17.39±3.42c 上海崇明14.03±0.16b2.52±0.15c21.82±2.04b 陜西澄城12.90±0.26d1.90±0.20e 8.50±1.93d 浙江建德24.50±0.28a3.07±0.36a32.05±5.75a 上海崇明24.59±0.19a2.93±0.19b31.07±1.44a 陜西澄城23.64±0.23c2.30±0.25d16.20±2.68c

不同字母表示差異顯著，＜0.05

Different letters denote significant differences,< 0.05

3.3 根際細(xì)菌的純化與鑒定

共分離得到西紅花根際細(xì)菌2450株，其中NA培養(yǎng)基共分離得到根際細(xì)菌1274株，改良高氏一號(hào)培養(yǎng)基共分離得到根際細(xì)菌1176株。將上述根際細(xì)菌劃分為275個(gè)形態(tài)型。鑒定為65個(gè)分類(lèi)單元，歸屬于4個(gè)門(mén)，6個(gè)綱，8個(gè)目，17個(gè)科，28個(gè)屬，31種（圖1）。其中厚壁菌門(mén)（Firmicutes）占比最大，RF為66.76%，變形菌門(mén)（Proteobacteria）次之，RF達(dá)25.27%，65個(gè)細(xì)菌的16S序列均已提交到GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)，序列號(hào)為MZ026391～MZ026455。

3.4 產(chǎn)地和土壤理化因子與細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)和多樣性的相關(guān)性分析

產(chǎn)地與土壤理化因子影響西紅花根際細(xì)菌多樣性及菌群結(jié)構(gòu)，多樣性指數(shù)最高的為陜西澄城（′＝2.561 7），上海崇明（′＝2.175 1）次之，最低的為浙江建德（′＝1.987 4），見(jiàn)表3。土壤理化因子與西紅花根際細(xì)菌多樣性顯著相關(guān)，其中多樣性指數(shù)與土壤有效磷含量呈最大正相關(guān)（＝0.910，＜0.05）（表4）；上海崇明和浙江建德的優(yōu)勢(shì)門(mén)為厚壁菌門(mén)，而陜西澄城優(yōu)勢(shì)門(mén)為厚壁菌門(mén)和變形菌門(mén)；上海崇明2的芽孢桿菌屬RF值約為陜西澄城2的2.1倍（表3）。土壤理化因子方面，有效磷含量與根際細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)最密切，其與芽孢桿菌屬RF呈最大負(fù)相關(guān)（＝?0.914，＜0.05），與微桿菌屬RF呈最大正相關(guān)（＝0.962，＜0.01）（表4）。

MK-Marker，條帶下方為菌株編號(hào)

表3 不同產(chǎn)地西紅花根際細(xì)菌高分離頻率屬及多樣性比較

Table 3 Comparison of high RF and diversity of C. sativus rhizospheric bacteria from different habits

產(chǎn)地分離頻率（RF＞5%）H′JR 浙江建德1芽孢桿菌屬（65.46%）、類(lèi)芽孢桿菌屬（18.18%）、假單胞菌屬（7.27%）1.841 90.718 12.994 5 上海崇明1芽孢桿菌屬（66.67%）、賴氨酸芽孢桿菌屬（7.02%）、類(lèi)芽孢桿菌屬（7.02%）2.114 30.705 84.699 4 陜西澄城1芽孢桿菌屬（45.63%）、蒼白桿菌屬（32.04%）、微桿菌屬（8.74%）2.361 60.788 34.099 5 浙江建德2芽孢桿菌屬（75.00%）、賴氨酸芽孢桿菌屬（10.71%）、類(lèi)芽孢桿菌屬（5.36%）1.724 30.693 92.732 7 上海崇明2芽孢桿菌屬（73.33%）、農(nóng)桿菌屬（8.89%）1.869 60.708 43.415 1 陜西澄城2芽孢桿菌屬（35.00%）、蒼白桿菌屬（28.33%）、微桿菌屬（10.00%）、無(wú)色桿菌屬（8.33%）2.590 10.850 84.904 9

表4 西紅花根際細(xì)菌多樣性、菌群結(jié)構(gòu)與土壤理化因子、球莖大小的相關(guān)性分析

Table 4 Correlation analysis of C. sativus rhizospheric bacterial diversity and community with physical and chemical properties and growth characteristics

指標(biāo)相關(guān)系數(shù) pH有機(jī)質(zhì)有效磷堿解氮速效鉀鮮質(zhì)量橫徑縱徑 芽孢桿菌屬?0.535 0.951**?0.914* 0.581 0.221 0.793* 0.752* 0.823* 蒼白桿菌屬 0.619?0.956** 0.900*?0.666 0.280?0.767*?0.773*?0.832* 類(lèi)芽孢桿菌屬?0.880* 0.463?0.582 0.585 0.719 0.125 0.132 0.312 微桿菌屬 0.827*?0.794 0.962**?0.822* 0.549?0.578?0.546?0.692 賴氨酸芽孢桿菌屬?0.577 0.518?0.861* 0.854* 0.375 0.523 0.475 0.573 無(wú)色桿菌屬 0.249?0.744 0.625?0.124 0.052?0.380?0.335?0.359 農(nóng)桿菌屬 0.423 0.593?0.087?0.302?0.627 0.611 0.653 0.477 Leclercia屬 0.606 0.213 0.190?0.691?0.756?0.030?0.018?0.190 寡養(yǎng)單胞菌屬 0.724?0.501 0.641?0.401?0.545?0.094?0.030?0.212 假單胞菌屬?0.604?0.201 0.058 0.279 0.711?0.321?0.283?0.122 H′ 0.712?0.843* 0.910*?0.682?0.478?0.724?0.658?0.806* J 0.561?0.917* 0.916*?0.564?0.234?0.677?0.634?0.713 R 0.737?0.503 0.689?0.617?0.690?0.513?0.404?0.627

*表示顯著相關(guān)，*＜0.05**＜0.01

significant correlations are marked with*,*< 0.05**< 0.01

3.5 球莖大小與細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)和多樣性的相關(guān)性分析

球莖大小與根際細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)和多樣性顯著相關(guān)。球莖縱徑與多樣性指數(shù)′呈現(xiàn)顯著負(fù)相關(guān)（＝?0.806，＜0.05）。在相同產(chǎn)地中，浙江建德1的類(lèi)芽孢桿菌屬占比約為浙江建德2的3.4倍（表3）。陜西澄城1的優(yōu)勢(shì)屬為芽孢桿菌屬、蒼白桿菌屬、微桿菌屬，其中蒼白桿菌屬在西紅花根際細(xì)菌中的分布與鮮質(zhì)量呈現(xiàn)顯著負(fù)相關(guān)（＝?0.767，＜0.05）。浙江建德2和上海崇明2的優(yōu)勢(shì)屬為芽孢桿菌屬，共同優(yōu)勢(shì)屬芽孢桿菌屬在浙江建德2的RF約為陜西澄城1的1.6倍，芽孢桿菌屬在西紅花根際細(xì)菌中的分布與西紅花球莖鮮質(zhì)量呈顯著正相關(guān)（＝0.793，＜0.05）（表4）。

4 討論

西紅花根際可培養(yǎng)細(xì)菌資源豐富，共分離出2 450株細(xì)菌，歸屬于4個(gè)門(mén)，6個(gè)綱，8個(gè)目，17個(gè)科，28個(gè)屬，31種，其中厚壁菌門(mén)分離頻率最高，主要以芽孢桿菌屬為主，這與姜午春[27]分離根際細(xì)菌的結(jié)果一致。變形菌門(mén)細(xì)菌中分離頻率最高的屬為寡養(yǎng)單胞菌屬，該屬細(xì)菌目前已被報(bào)道具有抗病、促生等功能[28]。此外，本研究所得28個(gè)屬，其中屬為一年內(nèi)剛建立的屬[29]，僅作為植物內(nèi)生細(xì)菌被分離[30]。其余屬皆已有在土壤中分離的報(bào)道，其中芽孢桿菌屬、假單胞菌屬為常見(jiàn)根際細(xì)菌[31-32]，有固氮、溶磷、促生等作用[33-35]。本研究鑒定到種水平的細(xì)菌共31種，其中4種為首次從土壤中分離得到，分別是、、、，其中僅作為一種葉際放線菌從土豆的葉際被分離得到[36]。此外，本研究首次從土壤中分離得到細(xì)菌，該菌被報(bào)道對(duì)西紅柿具有較好的促生作用[37]。

產(chǎn)地對(duì)西紅花根際細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)和多樣性存在影響，多樣性指數(shù)：陜西澄城＞上海崇明＞浙江建德，陜西澄城多樣性指數(shù)最高，且蒼白桿菌屬和微桿菌屬RF高于其他產(chǎn)地，為陜西澄城獨(dú)有優(yōu)勢(shì)屬。鄒立思等[38]采用磷脂脂肪酸技術(shù)分析了不同產(chǎn)地太子參根際微生物，報(bào)道不同產(chǎn)地的太子參根際微生物含量及群落結(jié)構(gòu)存在較大差異。土壤理化因子與西紅花根際細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)和多樣性顯著相關(guān)，在本研究中，分析結(jié)果顯示芽孢桿菌屬與有效磷含量存在負(fù)相關(guān)，可能是芽孢桿菌屬細(xì)菌具有促進(jìn)西紅花根系吸收磷元素的功能，劉鵬[38]研究發(fā)現(xiàn)，解淀粉芽孢桿菌一定程度上增加植物對(duì)磷的吸收，增加植株生物量。此外，本研究數(shù)據(jù)顯示速效鉀與根際微生物結(jié)構(gòu)沒(méi)有明顯相關(guān)性，這與王文銅[39]對(duì)花生根際細(xì)菌16S rDNA文庫(kù)進(jìn)行典范對(duì)應(yīng)分析（canonical correspondence analysis，CCA）和冗余分析（redundancy analysis，RDA）的結(jié)果一致。

植物與根際微生物存在著互利共惠的關(guān)系，一方面，植物通過(guò)招募有益的微生物，促進(jìn)自身生長(zhǎng)發(fā)育、提高對(duì)病原菌與非生物脅迫的抗性，另一方面，植物為微生物提供根際共生的棲息場(chǎng)所，并通過(guò)釋放不同的根系分泌物為微生物提供營(yíng)養(yǎng)，影響著根際微生物菌群結(jié)構(gòu)與分布[41-42]。本研究表明西紅花球莖大小與根際細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)密切相關(guān)，芽孢桿菌屬在西紅花根際細(xì)菌中的分布與球莖鮮質(zhì)量呈現(xiàn)正相關(guān)，表明高豐度的芽孢桿菌屬細(xì)菌可能對(duì)西紅花球莖生長(zhǎng)有益。眾多研究也表明芽孢桿菌屬細(xì)菌具有促生功能，如枯草芽孢桿菌、蘇云金芽孢桿菌、巨大芽孢桿菌、解淀粉芽孢桿菌和多粘類(lèi)芽孢桿菌皆被報(bào)道有促生作用，其主要促生機(jī)理通過(guò)產(chǎn)生植物激素促進(jìn)植物生長(zhǎng)[33, 43-45]。陸續(xù)對(duì)得到的根際細(xì)菌進(jìn)行了功能篩選，并獲得了一批功能菌株，如篩選得到的3株根際細(xì)菌SR163、SR253、SR375對(duì)擬南芥有較好的促生作用，其他功能篩選正在進(jìn)行中。本研究為根際細(xì)菌菌群優(yōu)化、土壤修復(fù)及藥用植物共生微生物資源開(kāi)發(fā)提供了參考依據(jù)。

利益沖突 所有作者均聲明不存在利益沖突

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Community, diversity and distribution of culturable bacteria in rhizosphere of

ZHANG Jia-hao, LU Jie-miao, DING Yu-ting, QIN Lu-ping, ZHU Bo

School of Pharmaceutical Sciences, Zhejiang Chinese Medical University, Hangzhou 311402, China

To explore the rhizospheric bacterial community of Xihonghua () and analyze their correlation with physical and chemical properties ofrhizospheric soil and growth characteristics of.Rhizospheric bacteria were isolated fromrhizospheric soil collected from Zhejiang Jiande, Shanghai Chongming, and Shaanxi Chengcheng by the traditional coating method. Diversity and bacterial community were analyzed and their correlation with habitat factors and growth characteristics were studied.A total of 2 450 strains of rhizospheric bacteria were isolated and divided into 65 taxa belonging to 4 phyla, 6 classes, 17 families, 28 genera, and 31 species. The most dominant phylum was Firmicutes (RF＝66.76%) while the most dominant genus was(RF＝57.71%). Habitat and physical and chemical properties significantly correlation with the diversity and community of the rhizospheric bacteria in. The diversity index of Shaanxi Chengcheng 2 ('＝2.590 1) was the highest. The correlation coefficient of the diversity index with available phosphorus content shows a significant positive correlation (＝0.910,＜0.05). Organic matter is closely related to community structure, whose correlation coefficient withRF ofis the largest (＝?0.956,＜0.01). The longitudinal diameter ofcorm significantly correlation with the diversity index (＝?0.806,＜0.05). Corm fresh weight significantly correlation with the rhizospheric bacterial community. The corm fresh weight had the largest positive correlation with the RF of(＝0.793,＜0.05).There are abundant resources of culturable bacteria in the rhizosphere of. Physical and chemical properties and corm fresh weight significantly correlation with the community and diversity of rhizospheric bacteria in, and the higher abundance ofmay play a beneficial role incorm growth.

L.; rhizospheric bacteria; bacterial community; diversity; soil physicochemical properties

R286.2

A

0253 - 2670(2022)08 - 2499 - 07

10.7501/j.issn.0253-2670.2022.08.027

2021-10-09

浙江中醫(yī)藥大學(xué)人才專(zhuān)項(xiàng)（2021ZR09）；浙江省醫(yī)藥衛(wèi)生科技青年創(chuàng)新人才支持計(jì)劃項(xiàng)目（2022RC052）；浙江省優(yōu)勢(shì)特色學(xué)科（中藥學(xué)）開(kāi)放基金資助項(xiàng)目（ZYAOX2018018）

張家豪（1996—），男，河北石家莊人，碩士研究生，研究方向?yàn)橹兴庂Y源及品質(zhì)評(píng)價(jià)。

秦路平，教授，博士生導(dǎo)師，研究方向?yàn)橹兴庂Y源及品質(zhì)評(píng)價(jià)。E-mail: lpqin@zcmu.edu.cn

朱 波，副研究員，碩士生導(dǎo)師，研究方向?yàn)橹参飪?nèi)生菌。E-mail: zhubo@zcmu.edu.cn

[責(zé)任編輯 時(shí)圣明]