戴 艷,陳穎茜,蘇 舒,錢 龍,吳柳暉,張洪宇,范 淼,楊智云
(1.中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院放射科,廣東廣州 510080;2.中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院兒科,廣東廣州 510080;3.GE醫(yī)療磁共振科研部,北京 100000)
許多神經(jīng)退行性疾病或精神神經(jīng)發(fā)育異常疾病都伴隨著顱內(nèi)成分的體積改變,故腦分割及體積定量測定是中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病臨床及科研中的重要環(huán)節(jié)[1-2]。目前常用的分割方法是基于3D 薄層掃描所得到的T1WI(T1 weighted image)結(jié)構(gòu)像,借助FSL、FreeSurfer 等軟件,基于灰白質(zhì)信號對比及預(yù)設(shè)的腦結(jié)構(gòu)模板進(jìn)行分割測定。但此類分割方法無法對灰白質(zhì)信號對比不明顯的區(qū)域進(jìn)行分割,如腦干,且會受到形態(tài)變異、灰白質(zhì)對比度欠佳等因素的影響,在部分人群如中樞神經(jīng)系統(tǒng)尚在發(fā)育中的兒童中,有出現(xiàn)計算誤差的可能[3]。隨著磁共振技術(shù)的發(fā)展,有越來越多的磁共振序列及后處理方法可以實現(xiàn)顱內(nèi)組織分割及定量測量,如近年來發(fā)展的集成磁共振成像(SyMRI,synthetic magnetic resonance imaging)技術(shù),不僅可在一次掃描內(nèi)獲得T1、T2、PD的定量圖像,且其根據(jù)白質(zhì)、灰質(zhì)的信號模板,可將每個體素內(nèi)的信號分成白質(zhì)、灰質(zhì)和其它成分(NON,即non-WM,GM,CSF),以此對腦組織進(jìn)行分割及體積測定[4]。該分割方法雖然是基于組織信號推論的算法,其衍生方法也在體外組織學(xué)層面通過了驗證[5-6],但在腦組織分割的臨床實踐中,該方法是否準(zhǔn)確可靠,與傳統(tǒng)的基于T1 圖像腦分割的一致性是否良好,目前尚未有文獻(xiàn)報道。本研究擬以基于傳統(tǒng)的T1 圖像分割為標(biāo)準(zhǔn),研究基于SyMRI 在正常兒童及青年的腦結(jié)構(gòu)分割中的一致性。本研究可為集成磁共振的臨床應(yīng)用及腦功能研究提供參考,具有重要意義。
本研究為前瞻性研究,通過中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院倫理委員會的批準(zhǔn)(批準(zhǔn)文號:【2019】328)及中國臨床試驗中心注冊號(Identifier:ChiCTR2100048109),所有受檢者檢查前均簽署了知情同意書,未成年志愿者由其法定監(jiān)護(hù)人簽署知情同意書。本研究于2019 年4 月至2020 年3 月在中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院采集50名健康兒童志愿者及30名成年人的圖像。
由于FreeSurfer 軟件無法分析5 歲以下兒童的腦結(jié)構(gòu)相,故本研究的納入標(biāo)準(zhǔn)為:①兒童年齡介于6~14 歲之間,青年人年齡介于15~45 歲之間(世界衛(wèi)生組織標(biāo)準(zhǔn));②既往無任何顱腦相關(guān)疾病病史,無任何精神發(fā)育相關(guān)疾病病史;③在常規(guī)MRI序列中無肉眼可見腦結(jié)構(gòu)性病變者。
排除標(biāo)準(zhǔn)為:①有因幽閉恐懼癥等無法堅持MRI掃描者;②既往有任何已知的可能導(dǎo)致腦結(jié)構(gòu)發(fā)育異常的相關(guān)病史者;③在常規(guī)MRI序列中發(fā)現(xiàn)有腦結(jié)構(gòu)像病變者。
在對原始圖像進(jìn)行回顧分析后,兒童受試者中剔除因T1WI 結(jié)構(gòu)相或SyMRI 頭動偽影較大影響后處理分析的圖像各6例,最終納入38例兒童受試者及全部30 例青年受試者的T1-FSPGR 圖像及集成磁共振圖像。兒童受試者年齡均在6~13 歲之間,中位年齡8 歲,其中包括6 例女性及32 例男性。成年受試者年齡均在22~26 歲之間,中位年齡25歲,包括15例女性及15例男性。
所有受試者均采用美國GE Pioneer 3.0T MR掃描儀進(jìn)行頭部MRI 檢查,采用32 通道頭部相控陣線圈。T1 成像使用3D 快速擾相梯度回波序列(FSPGR),F(xiàn)OV=256 mm×256 mm,1 mm 等體素,層數(shù)192,TR=8.6 ms,TE=13 ms,采集時間4 min 16 s。SyMRI 成像采用多延遲多回波(MDME)序列,TR=10 205.0 ms,TE=21 及95 ms,F(xiàn)OV=25.6 cm,F(xiàn)OV=256 mm×256 mm,2 mm 等體素,無層間距,ETL 16,掃描方向:橫斷位,采集時間5 min 28 s。同時采集常規(guī)T2WI 及T2-FLAIR 序列圖像以供臨床診斷。
1.3.1 T1-FSPGR 數(shù)據(jù)處理 使用dcm2nii 軟件將T1-FSPGR 掃描數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為NIFTI 格式,隨后導(dǎo)入FreeSurfer 軟 件(https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/,V7.1.0),軟件包自動進(jìn)行去皮、標(biāo)準(zhǔn)化校正等過程,輸出腦組織分割測量后的結(jié)果。計算耗時約6 h/例。結(jié)果中可自動得到總灰質(zhì)體積(grey matter volume,GMV),顱內(nèi)體積(intracranial volume,ICV),但無法自動獲得總白質(zhì)體積(white matter volume,WMV)[7]。WMV 由大腦白質(zhì)體積、雙側(cè)小腦半球白質(zhì)體積、胼胝體體積及腦橋體積加和而得[8]。腦實質(zhì)體積(brain parenchyma volume,BPV)由以上的GMV及WMV加和而得。
1.3.2 SyMRI 數(shù)據(jù)處理 將SyMRI 的掃描數(shù)據(jù)導(dǎo)入SyMR 后處理軟件(v11.2.2,SyntheticMR 公司),計算耗時約1 min/例,可自動分割得出ICV、GMV、WMV、腦脊液體積、其它物質(zhì)體積(即非灰質(zhì)、白質(zhì)、腦脊液的其它物質(zhì))。腦實質(zhì)體積由灰質(zhì)體積、白質(zhì)體積及其它物質(zhì)體積加和而得。同時,SyntheticMR 軟件還可自動計算得到腦內(nèi)的總髓鞘體積(圖1)。
圖1 SyMRI數(shù)據(jù)與T1-FSPGR數(shù)據(jù)處理結(jié)果示意圖Fig.1 Segmentation results of SyMRI and T1-FSPGR images
本研究對兩種分割方法在兒童組及青年組中所獲得的GMV、WMV、BPV、ICV 四個參數(shù)分別進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。本研究數(shù)據(jù)采用SPSS 21.0 進(jìn)行分析。由于兩種分割方法的具體算法及對組分的具體定義存在差異,兩種方法的結(jié)果存在系統(tǒng)性誤差,故本研究參考Lee 等研究[9],使用了以下3 種統(tǒng)計學(xué)方法:①使用配對t檢驗以檢驗2 種分割方法所得的GMV、WMV、BPV、ICV 四個參數(shù)的值是否一致。②使用Pearson 相關(guān)性分析檢測2 種方法所得的值的相關(guān)性。③使用組內(nèi)相關(guān)系數(shù)(interclass correlation coefficient,ICC)一致性檢驗評價2 種不同分割方法的一致性。P<0.05視為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
在兒童組中,通過SyMRI 分割得到的GMV、WMV、BPV、ICV 的值分別為:762.8±67.5(mL)、421.4±56.0(mL)、1 294.2±111.6(mL)、1 451.8 mL±132.0(mL);基于T1-FSPGR 序列圖像分割得到的GMV、WMV、BPV、ICV 的值(表1)分別為:734.8 ±63.4(mL)、491.0 ±57.4(mL)、1 225.8 ±117.0(mL)、1 375.3 ±117.0(mL)。采取配對t檢驗檢查兩組數(shù)據(jù)的一致性,結(jié)果顯示兩個序列分割所得的GM、WM、BPV、ICV 四個參數(shù)的數(shù)值差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。Pearson相關(guān)性分析提示兩種方法的結(jié)果具有較強的相關(guān)性(r值分別為0.691、0.577、0.938、0.796,P<0.001),其中通過兩種方式得到的BPV 的值相關(guān)性最強(圖2)。進(jìn)一步的ICC一致性檢驗結(jié)果表明,在兒童組中基于T1-FSPGR及SyMRI 圖像分割所得的GM、WM、BPV、ICV 四個參數(shù)的ICC95%CI相關(guān)系數(shù)值分別為0.816(0.647,0.905 ),0.732(0.484,0.861),0.968(0.938,0.983),及0.880(0.770,0.938),均表現(xiàn)出良好的一致性。
表1 兒童組中基于SyMRI及T1-FSPGR測定的腦體積對比Table 1 Comparison of brain segmentation results based on SyMRI and T1-FSPGR images in the children group
圖2 兒童組基于SyMRI圖像及T1-FSPGR分割所得到的腦體積對比Fig.2 Scatter diagrams of brain segmentation results in the children group based on SyMRI and T1-FSPGR images
青年組中通過SyMRI分割得到的GMV、WMV、BPV、ICV 的值分別為:688.1±65.1(mL)、458.9 ±37.9(mL)、1 269.3 ±92.8(mL)、1502.4 ±130.3(mL);基于T1-FSPGR 序列分割得到的GMV、WMV、BPV、ICV 的值(表2)分別為:714.7±42.2(mL)、513.6 ±45.4(mL)、1 228.3 ±82.0(mL)、1 576.1 ±135.9(mL)。在青年組中基于T1-FSPGR及SyMRI 圖像分割所得的GMV、WMV、BPV、ICV四個參數(shù)的數(shù)值在配對t檢驗具有統(tǒng)計學(xué)顯著性差異,在Pearson 相關(guān)性分析中表現(xiàn)出較強的相關(guān)性(r值分別為0.657、0.623、0.933、0.881,P<0.001),其中相比于其它參數(shù),BPV的值相關(guān)性最強(圖3)。在青年組中基于T1-FSPGR 及SyMRI 圖像分割所得的GMV、WMV、BPV、ICV 四個參數(shù)的ICC95%CI相關(guān)系數(shù)值分別為0.751(0.476,0.881),0.760(0.496,0.886),0.962(0.920,0.982),及0.936(0.866,0.970),提示兩組數(shù)據(jù)一致性良好。
表2 青年組中基于SyMRI及T1-FSPGR測定的腦體積對比Table 2 Comparison of brain segmentation results based on SyMRI and T1-FSPGR images in the youth group
圖3 青年組基于SyMRI圖像及T1-FSPGR分割所得到的腦體積對比Fig.3 Scatter diagrams of brain segmentation results in the youth group based on SyMRI and T1-FSPGR images
腦組織分割及體積定量測量計算量巨大,人工手動分割測量難以進(jìn)行,一般均需借助計算機。目前腦科學(xué)研究領(lǐng)域中較為公認(rèn)的腦組織體積分割方式均基于T1WI 結(jié)構(gòu)相(如T1-FSPGR 序列等)進(jìn)行[8]。傳統(tǒng)的T1WI 結(jié)構(gòu)像并無定量數(shù)據(jù),進(jìn)行腦組織成分分割需借助預(yù)設(shè)腦結(jié)構(gòu)模板,僅靠相對信號差以鑒別顱內(nèi)成分,對于信號差較小的灰白質(zhì)區(qū)域的鑒別能力較差,如無法對腦干內(nèi)的灰白質(zhì)成分進(jìn)行分割。且傳統(tǒng)結(jié)構(gòu)像獲得的圖像與序列參數(shù)及機型高度相關(guān),無法取得定量數(shù)據(jù)使之與正常參考值做比較,難以進(jìn)行進(jìn)一步的信號分析,故難以用于隨訪觀察及進(jìn)行多中心的研究[10-11]。由于基于傳統(tǒng)的T1WI 結(jié)構(gòu)像進(jìn)行腦結(jié)構(gòu)分割的精度不足,導(dǎo)致在不同的研究中所采用的灰白質(zhì)體積計算公式不同,導(dǎo)致傳統(tǒng)圖像分割方法在不同研究中可重復(fù)性不足。本研究中采用了Guo 等[8]發(fā)表的研究中的計算方式,但與解剖學(xué)上灰白質(zhì)的劃分仍有一定差距。此外,由于計算模型復(fù)雜,計算量大,耗時較長(6 h/例),不利于該方法在臨床應(yīng)用上的推廣。
單獨的定量磁共振序列如T1-mapping、T2-mapping 序列可以解決傳統(tǒng)結(jié)構(gòu)像無法定量的問題,然而傳統(tǒng)的定量圖譜序列掃描時間長,嬰幼兒及依從性差的精神神經(jīng)疾病患者掃描成功率低。且不同參數(shù)的定量序列分別掃描會由于頭部位置的變換導(dǎo)致序列間存在圖像匹配的問題。而SyMRI 可以在一個序列中同時采集多個延遲及多個回波時間的信號,并以此一次性算出T1、T2、PD 及射頻場B1 值[5],耗時短,1 例僅需1 min,從而解決以上問題。
基于SyMRI對腦組織體積進(jìn)行分割的原理為:在獲得的每一個體素內(nèi)生成一個T1-T2-PD 的三維矩陣,基于先期研究的不同的腦組織的T1、T2、PD 信號定量,解析出每個體素內(nèi)的白質(zhì)、灰質(zhì)、腦脊液及其它成分(非白質(zhì)、灰質(zhì)、腦脊液成分)的占比,綜合所有頭顱掃描所得體素信息,即可得到顱內(nèi)體積及灰質(zhì)、白質(zhì)、腦脊液及其它成分的總體積[12]。該模型使用的參數(shù)更多,理論上其腦分割更為精細(xì)及準(zhǔn)確。其計算模型相對簡單,可減少計算負(fù)荷,縮短計算時間。
并且,使用SyMRI技術(shù)可以在較短的時間內(nèi)通過一次掃描內(nèi)同時獲得T1、T2 及PD 的定量圖譜成像,提高了掃描的成功率[13-14],SyMRI 獲得的定量圖像為所采集得信號的定量解析解,理論上不受硬件和具體采集參數(shù)的影響,在不同設(shè)備上采集的圖像均具有良好的可對比性及可重復(fù)性,擴大了數(shù)據(jù)的應(yīng)用范圍[15-16]。
本研究的結(jié)果表明,在兒童組或青年組中,配對t檢驗的結(jié)果均顯示使用SyMRI與T1-FSPGR 序列兩種分割方法所得的值具有統(tǒng)計學(xué)的顯著性差異,分析其原因如下:由于兩種分割方法的原理完全不同,將不可避免地導(dǎo)致兩種方法的結(jié)果存在一定的系統(tǒng)誤差。由于SyMRI 可對不同信號進(jìn)行精確解讀,其對大腦的深部核團(tuán)及腦干的灰白質(zhì)的區(qū)分更佳,因此,其計算出的灰質(zhì)、白質(zhì)所包含的范圍與使用T1-FSPGR 圖像經(jīng)FreeSurfer 處理得到的灰質(zhì)及白質(zhì)的內(nèi)容存在一定的差別,這也可能是造成GMV、WMV 在兩種方法間的相關(guān)性較BPV、IVC 稍低的原因。同時本研究實驗結(jié)果表明,相比于青年組,兒童組中通過兩種方法測量的WMV 的值的一致性更低,這可能是由于兒童白質(zhì)髓鞘化程度不完全,被SyMRI后處理模型誤判所致。
基于以上原因,僅依賴配對t檢驗以評價兩種分割方法的一致性是不全面的,故本研究進(jìn)一步進(jìn)行了Pearson 相關(guān)性分析及ICC 一致性檢驗,結(jié)果表明,Pearson 相關(guān)性分析的r值絕大多數(shù)均大于0.6,ICC一致性檢驗的值均大于0.7,在BPV、ICV上大于0.8,顯示兩種方法在兒童組及青年組中均有較好的相關(guān)性和一致性,表明SyMRI具有替代傳統(tǒng)的T1-FSPGR 進(jìn)行腦組織結(jié)構(gòu)分割的可行性。由于以往多數(shù)腦結(jié)構(gòu)分析實驗已經(jīng)證明了基于T1-FSPGR 圖像FreeSurfer 分割結(jié)果的可信度,本實驗結(jié)果亦提示,若以傳統(tǒng)T1 結(jié)構(gòu)相分析方法作為標(biāo)準(zhǔn),通過SyMRI 得到的BPV、ICV 的值具有較高的科研及臨床使用價值,但所得GMV、WMV 的值的臨床及科研價值及可重復(fù)性仍需更多的研究去證實。此外,基于SyMRI 的腦組織體積分割僅需要1分鐘左右,相比于基于傳統(tǒng)T1 結(jié)構(gòu)像需要耗費數(shù)個小時的分割方法,具有顯著的時間優(yōu)勢。
SyMRI 可以獲得較傳統(tǒng)的T1 結(jié)構(gòu)像更多的定量信息,以其獲得的數(shù)據(jù)可以對腦組織作更深入的解析?;赪arntjes 等[6]的模型,將每一個體素內(nèi)成分分解為髓鞘成分、細(xì)胞成分、自由水成分及間質(zhì)水成分。通過這個模型可以得到顱內(nèi)的髓鞘總體積,進(jìn)而對髓鞘化程度進(jìn)行定量評估,因此其在神經(jīng)發(fā)育類疾病的應(yīng)用可能存在較大的科研價值和臨床價值。此外,SyMRI 還能在生成T1WI、T2WI圖像上調(diào)節(jié)T1及T2的權(quán)重,以獲得較好的對比,有助于病灶的檢出[17],或生成相位敏感翻轉(zhuǎn)恢復(fù)成像(phase sensitive inversion recovery,PSIR)、單純灰質(zhì)成像等傳統(tǒng)方法難以生成的對比圖像,以對某些特定疾病進(jìn)行更好的診斷[18]。
SyMRI 也有其不足之處:①在進(jìn)行腦組織分割時,由于其分割原理完全依賴于物質(zhì)的信號區(qū)別,導(dǎo)致部分信號類似的物質(zhì)難以被區(qū)別開;病理或生理原因?qū)е滦盘栍胁顒e的同一組織無法正確歸類,如兒童腦組織中髓鞘化不完全的白質(zhì)部分會被劃歸于NON。②據(jù)文獻(xiàn)報道,在較小的兒童中,受灰白質(zhì)發(fā)育不全的影響,現(xiàn)有的后處理方法無法正確地基于SyMRI 圖像區(qū)分灰白質(zhì)及髓鞘[19]。③SyMRI 采集的圖像對頭動較為敏感,頭動偽影會極大地影像腦組織分割的準(zhǔn)確性[15]。④SyMRI 重建所得的T1WI、T2WI 等圖像的信噪比低于傳統(tǒng)的T1WI 及T2WI 圖像。⑤SyMRI 重建所得的FLAIR圖像上,腦實質(zhì)與腦脊液交界處會有偽影,故仍需要采集傳統(tǒng)的FLAIR序列進(jìn)行補充[20]。
本研究的不足之處如下:①本實驗僅對比了6歲以上兒童及青年人中基于SyMRI 技術(shù)與基于T1-FSPGR 圖像的腦組織分割結(jié)果,6 歲以下兒童及正常中老年人的腦結(jié)構(gòu)分割的比較尚待進(jìn)一步研究。②綜合考慮掃描時間及信噪比,SyMRI 在頭顱掃描中一般設(shè)定為2 mm 等體素采集,故其獲得的圖像的分辨率較一般設(shè)置為1 mm 等體素采集的T1-FSPGR 圖像稍低,也可能對腦組織分割的結(jié)果產(chǎn)生一定影響。
綜上所述,本研究結(jié)果表明基于SyMRI技術(shù)的腦組織分割方法,在6~14 歲兒童及青年內(nèi),雖然腦體積測量參數(shù)絕對值與基于傳統(tǒng)T1 圖像的腦分割方法不同,但是兩組數(shù)據(jù)有良好的相關(guān)性及一致性,其中BPV、ICV 的相關(guān)性、一致性最高,可以替代基于傳統(tǒng)T1 圖像的腦分割技術(shù),而且因其掃描時間短、一次掃描可以獲得多個定量參數(shù),具有廣闊的臨床應(yīng)用和科研前景。