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        基于網(wǎng)絡藥理學和分子對接探討黃精治療非小細胞肺癌的物質基礎與分子機制

        2022-04-14 08:48:48楊嘉妮朱星枚袁盼盼郭凱麗劉繼平
        中國醫(yī)藥導報 2022年8期
        關鍵詞:黃酮

        楊嘉妮 朱星枚 袁盼盼 郭凱麗 薛 妙 劉繼平 王 川 王 斌

        1.陜西中醫(yī)藥大學陜西省中醫(yī)藥管理局中藥藥效機制與物質基礎重點研究室,陜西咸陽 712046;2.陜西省中藥基礎與新藥研究重點實驗室,陜西咸陽 712046

        非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)約占肺癌的85%[1]。化療及靶向治療有效,但易復發(fā)、易耐藥[2-3]。黃精可治療食管癌、胃癌、直腸癌、肺癌等惡性腫瘤[4-5],協(xié)同化療或靶向藥物治療NSCLC 時,能顯著改善患者生活質量、臨床療效和卡諾夫斯凱計分評分,并減輕毒性,延緩耐藥[6],黃精抗NSCLC 作用的物質基礎及分子機制需進一步討論。黃精成分多樣,對應靶點豐富,具有不確定性,僅依靠傳統(tǒng)實驗方法很難確定其藥效成分及作用機制[7]。網(wǎng)絡藥理學通過構建生物系統(tǒng)網(wǎng)絡,選取特定信號節(jié)點進行多靶點藥物分子設計與分析,可解釋藥物多組分的協(xié)同作用[8-9]。本研究擬通過網(wǎng)絡藥理學方法探究黃精治療NSCLC的有效成分及分子機制,并通過分子對接技術及體外實驗初步驗證。

        1 材料與方法

        1.1 儀器與藥品

        人NSCLC 細胞系A549 購自武漢普諾賽。3’-甲氧基大豆苷元(B31005)、黃芩素(C07M10Y87479)、甘草素(C15H1204)購自上海源葉;順鉑(C19PA3741B)購自北京普西唐;CCK-8(EG20201111)購自南京恩晶;Annexin V-FITC/PI(556547)購自BD Pharmingen。全波長酶標儀(TY2021000834)購自美國伯騰;流式細胞儀(Epics XL-MCL)購自BECKMAN COULTER。

        1.2 黃精活性成分與疾病靶點收集

        檢索中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫與分析平臺(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)獲得黃精活性成分及對應靶點,口服利用度≥30%,類藥性≥0.18。檢索人類基因注釋、人類孟德爾遺傳和治療靶標數(shù)據(jù)庫收集NSCLC靶點。Version 2.1.0 繪制黃精與NSCLC 交集靶點。

        1.3 基因本體(gene ontology,GO)和京都基因和基因組數(shù)據(jù)庫(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析

        將交集靶點輸入DAVID 數(shù)據(jù)庫進行GO 和KEGG 富集分析,富集結果通過柱狀圖和氣泡圖呈現(xiàn)。

        1.4 分子對接驗證

        使用Cytoscape3.6.1 構建“成分-靶點-通路”網(wǎng)絡圖,Network Analyzer 插件篩選黃精抗NSCLC 核心成分(degree≥5)與核心蛋白,利用AutoDock 4.2 進行分子對接,借助Pymol 實現(xiàn)可視化。

        1.5 CCK-8 檢測藥物抗A549 細胞增殖能力

        給予A549 細胞不同濃度的黃精黃酮類核心成分[3'-甲氧基大豆苷元(0、2.22、8.88、3.55×101、1.42×102、5.68×102μg/ml)、黃芩素(0、2.03、4.05、8.10、1.62×101、3.24×101μg/ml)、甘草素(0、6.4、1.28×101、2.56×101、1.024×102、2.048×102μg/ml)][10-12]處理48 h,每孔加入10 μl 的CCK8 溶液,37℃,5%CO2恒溫培養(yǎng)3.5 h,讀取450 nm 吸光值(OD),細胞生存率=[(OD實驗-OD空白)/(OD對照-OD空白)]×100%。每組藥設置5 個復孔,每種藥IC50重復測定5 次。

        1.6 流式細胞術檢測藥物誘導細胞凋亡能力

        給予A549 細胞不同濃度黃精黃酮類核心成分(8.1×101、1.62×102、3.24×102、6.48×102μg/ml)[13]處理48 h,消化、離心后加5 μl Annexin V-FITC 和PI,混勻,避光反應15 min,流式細胞儀檢測細胞凋亡率。每組實驗重復3 次。

        1.7 統(tǒng)計學方法

        采用GraphPad Prism 7.0 進行數(shù)據(jù)分析,計量資料用均數(shù)±標準差(±s)表示,兩組間比較采用t 檢驗,多組間比較采用單因素方差分析。以P <0.05 為差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結果

        2.1 黃精活性成分及疾病靶點

        TCMSP 數(shù)據(jù)庫獲12 個黃精活性成分和85 個相應靶點,與1693 個NSCLC 靶點交集得到43 個共有靶點,見圖1。靶點映射得8 個有效成分,即3’-甲氧基大豆苷元、黃芩素、甘草素、5,4’-二羥基黃酮、(2R)-7-羥基-2-(4-羥基苯基)-4-黃酮、谷甾醇、β-谷甾醇和薯蕷皂苷。

        2.2 GO 和KEGG 富集分析

        GO 富集分析顯示,生物過程以RNA 聚合酶Ⅱ啟動子轉錄的正向調控、炎癥反應、胚胎植入為主;細胞組成以細胞核、細胞溶質、線粒體為主;分子功能主要富集到序列特異性DNA 結合、類固醇激素受體作用、血紅素結合等功能上。繪制排名前5 的GO 富集分析結果見圖2;排名前20 的KEGG 通路見圖3,涉及癌癥、細胞凋亡、低氧誘導因子-1、腫瘤壞死因子信號通路等通路。

        2.3 分子對接驗證

        黃精抗NSCLC 核心成分主要是黃酮類成分:黃芩素(degree=34)、3’-三甲氧基大豆苷元(degree=17)、甘草素(degree=10)和5,4’-二羥基黃酮(degree=6)。對應7 個關鍵靶點:二羥基黃酮與TP53、AKT 激酶、V-Rel 網(wǎng)狀內皮增生病毒癌基因同源物A、B 細胞淋巴瘤/白血病-2 基因、細胞凋亡相關半胱氨酸肽酶-3、雄激素受體和低氧誘導因子1A。分子對接展示對接結合能最低者(圖4),對接結合能均<-7.5 kcal/mol(表1),說明配體與受體結合穩(wěn)健。

        表1 黃精中黃酮類化合物與主要靶點對接參數(shù)及相應計算結果

        2.4 不同黃酮類物質對A549 細胞的IC50

        不同濃度3’-甲氧基大豆苷元、黃芩素、甘草素處理A549 細胞48 h,3’-三甲氧基大豆苷元、黃芩素、甘草素IC50分別是6.88×10、7.99 和4.34×10 μg/ml。表明黃精黃酮(5,4’-二羥基黃酮因溶解性差,未進行生物學驗證)對A549 細胞有較強的抗增殖能力。

        2.5 流式細胞術測定黃芩素誘導A549 凋亡作用

        黃精中黃芩素抗NSCLC 作用明顯,故流式細胞術選擇研究黃芩素誘導A549 細胞凋亡作用,見圖5。高劑量黃芩素(8.1×10、1.62×102、3.24×102、6.48×102μg/ml)作用A549 細胞48 h 后,給藥組(圖5b~5e)凋亡率高于陽性對照組(順鉑)(圖5f),差異有統(tǒng)計學意義(P <0.05)。

        3 討論

        黃精為我國著名藥食兩用藥材,具有抗腫瘤、抗衰老、調節(jié)免疫等多種藥理作用[14-16]。本文篩選出黃精抗NSCLC 潛在活性成分與張嬌等[17]綜述的黃精中黃酮化合物的化學結構一致,該類成分被證實具有抗腫瘤增殖、誘導細胞凋亡、抑制腫瘤遷移的能力[18-20]。TP53 是重要的抑癌基因[21],AKT 過度活化促進NSCLC的侵襲和轉移,與患者預后不良密切相關[22-24]。分子對接顯示黃芩素、3’-三甲氧基大豆苷元、甘草素、5,4’-二羥基黃酮均與TP53、AKT 具有較好的結合能力,黃精具備多點靶向TP53、AKT 的潛力。B 細胞淋巴瘤/白血病-2 基因、細胞凋亡相關半胱氨酸肽酶-3 則是腫瘤中的凋亡因子[25-27],黃精中黃酮組分可以通過活化B細胞淋巴瘤/白血病-2 基因、細胞凋亡相關半胱氨酸肽酶-3,誘導NSCLC 細胞凋亡,與化療藥物發(fā)揮協(xié)同作用。本文以細胞毒性最強的黃芩素為例,通過流式細胞實驗證實了高劑量黃芩素可以誘導A549 凋亡,與網(wǎng)絡藥理學的預測一致,進一步證實了網(wǎng)絡藥理學的可靠性。實驗中亦嘗試應用低劑量黃芩素作用A549,其誘導凋亡作用不明顯。

        總之,本文首次通過網(wǎng)絡藥理學揭示了黃精抗NSCLC 的物質基礎及可能作用靶點。提出黃精中4 個黃酮類物質可以與NSCLC 相關的7 個靶點緊密結合發(fā)揮抗NSCLC 作用,具有潛在的抗NSCLC 增殖、誘導NSCLC 凋亡的藥理作用。亦為臨床合理應用黃精協(xié)同化療藥物治療NSCLC 提供了新的思路。

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