李東原,王艷梅,吳博,閆美宏,畢華
(延安大學(xué)醫(yī)學(xué)院組織學(xué)與胚胎學(xué)教研室,陜西 延安716000)
放射治療是乳腺癌局部治療的重要手段,術(shù)前/術(shù)后放療對改善腫瘤局部控制率、降低局部復(fù)發(fā)率、延長患者長期生存期具有重要意義[1]。然而,放射抵抗可導(dǎo)致乳腺癌放射治療失敗。因此,關(guān)于乳腺癌放療抵抗的潛在機制值得探討。轉(zhuǎn)錄組分析顯示,人類基因組中大于97%轉(zhuǎn)錄為非編碼RNA(ncRNA),其中長鏈ncRNA(lncRNA)、微小RNA(miRNA)已被證實與乳腺癌細胞的異常增殖、轉(zhuǎn)移和放化療抵抗有關(guān)[2-3]。lncRNA 前列腺癌相關(guān)ncRNA 轉(zhuǎn)錄本1(PCAT1)是一種致癌因子,研究指出lncRNA PCAT1 高表達與胃癌順鉑耐藥、結(jié)直腸癌5-氟尿嘧啶耐藥相關(guān),敲減lncRNA PCAT1 可抑制癌細胞增殖、遷移和侵襲,并逆轉(zhuǎn)化療耐藥[4-5]。抑制lncRNA PCAT1 表達還可增加膠質(zhì)瘤肝細胞放射敏感性[6]。前期研究表明乳腺癌中l(wèi)ncRNA PCAT1 表達增加[7],然而lncRNA PCAT1 對乳腺癌細胞增殖、凋亡以及放療抵抗的影響并不清楚。miR-329-3p 是宮頸癌抑癌因子,研究指出過表達miR-329-3p 對宮頸癌細胞增殖、遷移和侵襲具有抑制作用[8-9]。生物信息學(xué)分析顯示miR-329-3p 為lncRNA PCAT1 潛在下游靶基因?;谝陨涎芯亢皖A(yù)測,本研究推測lncRNA PCAT1 可能靶向miR-329-3p 在乳腺癌中發(fā)揮作用。本研究對乳腺癌細胞中l(wèi)ncRNA PCAT1 和miR-329-3p 表達水平進行檢測,并分析干擾lncRNA PCAT1 或過表達miR-329-3p 對乳腺癌細胞增殖、凋亡和放射敏感性的影響,以期為乳腺癌提供有效放療增敏靶點。
乳腺癌細胞系MCF-7、T47D、Bcap-37 以及人正常乳腺上皮細胞MCF-10A 購于武漢普諾賽生命科技公司;miRNA 熒光定量PCR 檢測試劑盒購于北京博凌科為生物公司;第一鏈cDNA 合成試劑盒、SYBR Green master mix 試劑盒、噻唑藍(MTT)試劑盒購于北京百奧萊博生物科技公司;miR-329-3p 模擬物(mimics)及其陰性對照(miR-NC)、miR-329-3p 抑制物(anti-miR-329-3p)及其陰性對照(anti-miR-NC)、針對lncRNA PCAT1 的小干擾RNA(si-lncRNA PCAT1)及其陰性對照(si-NC)、雙熒光素酶報告載體購于廣州銳博生物公司;膜聯(lián)蛋白V-異硫氰酸熒光素(Annexin V-FITC)/碘化丙啶(PI)試劑盒購于上海貝博生物公司;兔源CyclinD1、Cleaved-caspase-3、γ-H2AX 抗體、羊抗兔IgG 二抗購于上海艾博抗生物公司。
1.2.1 細胞培養(yǎng) 用MEM 培養(yǎng)基培養(yǎng)MCF-7 細胞,用RPMI-1640 培養(yǎng)基培養(yǎng)T47D、Bcap-37 細胞,培養(yǎng)基中添加10%胎牛血清和1%青鏈霉素雙抗。用DMEM/F12 培養(yǎng)基培養(yǎng)MCF-10A 細胞,培養(yǎng)基中添加5%馬血清和1%青鏈霉素雙抗。每周更換2~3 次培養(yǎng)液,按照1∶4 比例傳代培養(yǎng),選擇對數(shù)期細胞進行后續(xù)研究。
1.2.2 實時定量PCR(RT-qPCR) 檢測lncRNA PCAT1 和miR-329-3p 表達 用TRIzol 試劑分離MCF-10A 細胞、MCF-7、T47D 以及Bcap-37 細胞總RNA,用第一鏈cDNA 合成試劑盒進行逆轉(zhuǎn)錄,以其產(chǎn)物為模板利用SYBR Green master mix 試劑盒進行RT-qPCR,2-ΔΔCt方法檢測lncRNA PCAT1 表達。采用miRNA 熒光定量PCR 檢測試劑盒檢測miR-329-3p表達。lncRNAPCAT-1上游引物5’-AATGGCATGAACCTGGGAGGCG-3’,下游引物5’-GGCTTTGGGAAGTGCTTTGGAG-3’;內(nèi)參β-actin 上游引物5’-TGGACTTCGA GCAGGAAATGG-3’,下游引 物 5’-ACGTCGCACTTCATGATCGAG-3’。miR-329-3p 上游引物5’-GTGGAACAGACCTGGTAAAC-3’,下游引物5’-CAAGTGCGAGTCGTGCAGT-3’;內(nèi)參U6 上游引物5’-CTCGCTTCGGCAGCACA-3’,下游引物5’-AACGCTTCACGAATTTGG T-3’。
1.2.3 細胞轉(zhuǎn)染和分組 將對數(shù)期T47D 細胞按照2×105個/孔接種于96 孔板,將si-NC、si-lncRNA PCAT1、miR-NC、miR-329-3p mimics、anti-miR-NC、anti-miR-329-3p、si-lncRNA PCAT1+anti-miR-NC、si-lncRNA PCAT1+anti-miR-329-3p 按照Lipofectamine 2000 說明轉(zhuǎn)染60%匯合的T47D 細胞,依次記為si-NC組、si-lncRNA PCAT1組、miR-NC組、miR-329-3p組、anti-miR-NC組、anti-miR-329-3p組、si-lncRNA PCAT1+anti-miR-NC組。轉(zhuǎn)染后培養(yǎng)48 h,按照1.2.2方法步驟提取總RNA,檢測轉(zhuǎn)染效果。未轉(zhuǎn)染的T47D 細胞記為正常對照(NC)組。
1.2.4 MTT 實驗檢測細胞活力 將轉(zhuǎn)染48 h 的T47D 細胞按照2×103個/孔接種于96 孔板中,48 h后,每孔中添加20 μL 的MTT 培養(yǎng)2 h,酶標儀在波長為490 nm 處檢測吸光度(A)值。
1.2.5 流式細胞術(shù)檢測細胞凋亡 用1×結(jié)合緩沖液調(diào)整轉(zhuǎn)染48 h 細胞密度為1×106個/mL。取5 μL的Annexin V-FITC、PI 加入到100 μL 細胞懸液中,避光染色10 min。補加1×結(jié)合緩沖液至500 μL。流式細胞儀檢測細胞凋亡情況。
1.2.6 克隆形成實驗檢測細胞存活分數(shù) 將轉(zhuǎn)染48 h 的T47D 細胞按照5×102個/孔接種于6 孔板中,按照源靶距為100 cm,劑量率為5 Gy/min,照射野為10 cm×10 cm 給予細胞不同照射劑量(0、2、4、6、8 Gy),射野完全覆蓋平板。放入細胞培養(yǎng)箱培養(yǎng),每隔1 天觀察細胞1 次,約14 d 左右出現(xiàn)肉眼可見細胞集落時終止培養(yǎng)。用甲醛固定細胞集落15 min,再用姬姆薩染色30 min。顯微鏡下統(tǒng)計細胞集落數(shù),大于50個細胞的集落記為有效克隆。克隆形成率(PE)=有效克隆數(shù)/細胞接種數(shù)×100%。存活分數(shù)(SF)=照射組細胞PE 和對照組細胞PE的比值。分析細胞存活分數(shù)繪制細胞存活曲線,采用單擊多靶模型求出放射生物學(xué)參數(shù)D0、Dq、SF2、SER 值。放射增敏比為干擾(過表達)前組D0 和干擾(過表達)后組D0 比值
1.2.7 免疫印跡法檢測CyclinD1、Cleaved-caspase-3和γ-H2AX 表達 使用RIPA 緩沖液提取各組T47D細胞總蛋白。分析蛋白濃度后,將適量蛋白樣品與5×上樣緩沖液按照1∶4 比例混勻,經(jīng)95 ℃水浴5 min變性。聚丙烯酰胺凝膠電泳分離蛋白后,半干轉(zhuǎn)膜法將蛋白轉(zhuǎn)移到PVDF 膜。室溫環(huán)境下,將膜置于孵育盒中,加入5%脫脂牛奶封閉膜2 h,再用稀釋的CyclinD1 或Cleaved-caspase-3 或γ-H2AX 一抗溶液孵育膜2 h,最后用稀釋的二抗溶液孵育1 h。暗室內(nèi)滴加化學(xué)發(fā)光顯色液進行顯色反應(yīng)。Imagel J 軟件分析各條帶灰度值,采用目的蛋白和內(nèi)參β-actin灰度值的比值表示相應(yīng)蛋白表達水平。
1.2.8 雙熒光素酶報告實驗 為檢測lncRNA PCAT1 和miR-329-3p 結(jié)合特異性,將含有miR-329-3p 結(jié)合位點的lncRNA PCAT1 野生序列或突變序列克隆到熒光素酶報告質(zhì)粒,構(gòu)建野生型/突變型熒光素酶報告載體(WT/MUT-lncRNA PCAT1)。將T47D 細胞接種到24 孔培養(yǎng)板,將WT/ MUTlncRNA PCAT1 與miR-329-3p mimics 或miR-NC 共轉(zhuǎn)染60%匯合細胞。培養(yǎng)48 h 后裂解細胞,使用雙熒光素酶測定系統(tǒng)檢測相對熒光素酶活性。
采用SPSS 19.0 軟件進行統(tǒng)計分析。每組設(shè)置3個平行試驗,重復(fù)3 次。計量數(shù)據(jù)滿足正態(tài)分布以表示。兩組數(shù)據(jù)間的比較采用獨立樣本t檢驗;多組數(shù)據(jù)間的比較采用單因素方差分析,進一步兩兩比較采用LSD-t檢驗。P<0.05 表示差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
為了檢測lncRNA PCAT1、miR-329-3p 在乳腺癌細胞內(nèi)的表達情況,通過RT-PCR 方法對乳腺癌細胞內(nèi)lncRNA PCAT1、miR-329-3p 水平進行分析,發(fā)現(xiàn)與MCF-10A 細胞比較,乳腺癌細胞系MCF-7、T47D、Bcap-37 中l(wèi)ncRNA PCAT1 表達量顯著升高(P<0.05),miR-329-3p 表達量顯著降低(P<0.05)。見表1。
表1 乳腺癌細胞系中l(wèi)ncRNA PCAT1、miR-329-3p表達(,n=9)
表1 乳腺癌細胞系中l(wèi)ncRNA PCAT1、miR-329-3p表達(,n=9)
注:與MCF-10A 比較,*P<0.05;MCF-10A:正常乳腺上皮細胞
與si-NC 和NC組比較,si-lncRNA PCAT1組T47D細胞lncRNA PCAT1表達量、細胞活力、CyclinD1 蛋白表達量顯著降低(P<0.05),凋亡率、γ-H2AX 和Cleaved-caspase-3 蛋白表達量顯著升高(P<0.05),見表2、圖1A 和圖1B。在2、4、6、8 Gy劑量下,與轉(zhuǎn)染si-NC 比較,轉(zhuǎn)染si-lncRNA PCAT1組T47D 細胞存活分數(shù)顯著降低(P<0.05),放射增敏比為1.265,見表2 和圖1C。
表2 干擾lncRNA PCAT1 表達抑制乳腺癌細胞T47D 增殖、誘導(dǎo)凋亡和增強放射敏感性(,n=9)
表2 干擾lncRNA PCAT1 表達抑制乳腺癌細胞T47D 增殖、誘導(dǎo)凋亡和增強放射敏感性(,n=9)
注:與si-NC 和NC 比較,*P<0.05
圖1 干擾lncRNA PCAT1 表達抑制乳腺癌細胞T47D 增殖、誘導(dǎo)凋亡和增強放射敏感性
與miR-NC組比較,miR-329-3p組T47D 細胞miR-329-3p 表達量顯著升高(P<0.05),細胞活力、CyclinD1 蛋白表達量顯著降低(P<0.05),凋亡率、γ-H2AX 和Cleaved-caspase-3 蛋白表達量顯著升高(P<0.05),見表4、圖2B。在2、4、6、8 Gy 劑量下,與轉(zhuǎn)染miR-NC 比較,轉(zhuǎn)染miR-329-3p組T47D 細胞存活分數(shù)顯著降低(P<0.05),放射增敏比為1.338,見表5 和圖2A。
表3 低表達lncRNA PCAT1 的T47D 細胞的放射增敏比
圖2 過表達miR-329-3p 抑制乳腺癌細胞T47D 增殖、誘導(dǎo)凋亡和增強放射敏感性
表4 過表達miR-329-3p 抑制乳腺癌細胞T47D 增殖、誘導(dǎo)凋亡和增強放射敏感性(,n=9)
表4 過表達miR-329-3p 抑制乳腺癌細胞T47D 增殖、誘導(dǎo)凋亡和增強放射敏感性(,n=9)
注:與miR-NC 比較,*P<0.05
表5 過表達miR-329-3p 的T47D 細胞的放射敏增敏比
Starbase 預(yù)測PCAT1 靶基因顯示miR-329-3p含有與PCAT1 連續(xù)特異性集合序列,見圖3。與轉(zhuǎn)染miR-NC 比較,轉(zhuǎn)染miR-329-3p 后T47D 細胞WT-lncRNA PCAT1 的相對熒光素酶活性顯著降低(P<0.05),而MUT-lncRNA PCAT1 的相對熒光素酶活性變化無統(tǒng)計學(xué)意義,見表6。pcDNA-lncRNA PCAT1組T47D 細胞miR-329-3p 表達量顯著低于pcDNA-NC組(P<0.05);而si-lncRNA PCAT1組T47D 細胞miR-329-3p 表達量顯著高于si-NC組(P<0.05),見表7。
表6 相對雙熒光素酶活性檢測(,n=9)
表6 相對雙熒光素酶活性檢測(,n=9)
注:與miR-NC 比較,*P<0.05。
表7 RT-qPCR 檢測miR-329-3p 的表達(,n=9)
表7 RT-qPCR 檢測miR-329-3p 的表達(,n=9)
注:與pcDNA-NC 比較,*P<0.05;與si-NC 比較,#P<0.05
圖3 miR-329-3p 和lncRNA PCAT1 結(jié)合進行預(yù)測示意圖
與anti-miR-NC組比較,anti-miR-329-3p組T47D 細胞miR-329-3p 表達量顯著降低,細胞活力、CyclinD1 蛋白表達量顯著升高(P<0.05),凋亡率、γ-H2AX 和Cleaved-caspase-3 蛋白表達量顯著降低(P<0.05);與si-lncRNA PCAT1+anti-miR-NC組比較,si-lncRNA PCAT1 +anti-miR-329-3p組T47D 細胞miR-329-3p 表達量顯著降低,細胞活力、CyclinD1蛋白表達量顯著升高(P<0.05),凋亡率、γ-H2AX 和Cleaved-caspase-3 蛋白表達量顯著降低(P<0.05),見表8、圖4B。在2、4、6、8 Gy 劑量下,與轉(zhuǎn)染antimiR-NC 比較,轉(zhuǎn)染anti-miR-329-3p組T47D 細胞存活分數(shù)顯著升高(P<0.05),放射增敏比為0.837;與轉(zhuǎn)染si-lncRNA PCAT1 和anti-miR-NC 比較,轉(zhuǎn)染si-lncRNA PCAT1 和anti-miR-329-3p組T47D 細胞存活分數(shù)顯著升高(P<0.05),放射增敏比為0.737,見表9 和圖4A。
表8 抑制miR-329-3p 能夠逆轉(zhuǎn)lncRNA PCAT1 低表達對T47D 細胞增殖、凋亡和放射敏感性的影響(,n=9)
表8 抑制miR-329-3p 能夠逆轉(zhuǎn)lncRNA PCAT1 低表達對T47D 細胞增殖、凋亡和放射敏感性的影響(,n=9)
表9 各組T47D 細胞的放射敏增敏比
圖4 抑制miR-329-3p 能夠逆轉(zhuǎn)lncRNA PCAT1 低表達對T47D 細胞增殖、凋亡和放射敏感性的影響
si-lncRNA PCAT1組T47D 細胞β-Catenin 蛋白表達量較si-NC組顯著降低(P<0.05);anti-miR-329-3p組T47D 細胞β-Catenin 蛋白表達量較antimiR-NC組顯著升高(P<0.05);si-lncRNA PCAT1+anti-miR-329-3p組T47D 細胞β-Catenin 蛋白表達量較si-lncRNA PCAT1+anti-miR-NC組顯著升高(P<0.05),見表10 和圖5。
圖5 Western Blot 檢測β-Catenin 蛋白表達
表10 Western Blot 檢測β-Catenin 蛋白表達(,n=9)
表10 Western Blot 檢測β-Catenin 蛋白表達(,n=9)
注:與si-NC 比較,*P<0.05;與anti-miR-NC 比較,#P<0.05;與si-lncRNA PCAT1+anti-miR-NC 比較,&P<0.05
近年來,多項研究證實lncRNA 在細胞行為、癌癥發(fā)生、發(fā)病機制、化療和放療抵抗等方面發(fā)揮調(diào)控作用。lncRNA PCAT1 高表達與子宮內(nèi)膜癌國際婦產(chǎn)科協(xié)會(FIGO)分期、肌層浸潤、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、總生存期短呈正相關(guān)[10]。卵巢癌中l(wèi)ncRNA PCAT1 高表達通過靶向NEK2 顯著增加癌細胞的增殖和遷移潛能[11]。在多發(fā)性骨髓瘤中干擾lncRNA PCAT1表達可抑制細胞增殖,誘導(dǎo)細胞凋亡,并增加多發(fā)性骨髓瘤細胞對硼替佐米的敏感性[12]。然而,目前l(fā)ncRNA PCAT1 在乳腺癌中的作用和對細胞放射敏感性影響并未闡明。本研究通過RT-qPCR 檢測乳腺癌細胞中l(wèi)ncRNA PCAT1 表達量,結(jié)果表明,乳腺癌細胞中l(wèi)ncRNA PCAT1 表達較正常乳腺上皮細胞顯著升高,這與前人報道結(jié)果基本吻合[13]。選擇表達差異較大的T47D 細胞進行功能實驗,結(jié)果表明,干擾lncRNA PCAT1 表達顯著下調(diào)促增殖蛋白CyclinD1 表達,上調(diào)凋亡效應(yīng)因子Cleaved-caspase-3表達,抑制T47D 細胞活力,誘導(dǎo)細胞凋亡率。雙鏈斷裂(DSBs)是放療誘導(dǎo)DNA 損傷的重要類型,在DSBs 后組蛋白H2AX 被迅速激活和磷酸化,生成γ-H2AX,過表達miR-22 通過促進γ-H2AX 表達顯著誘導(dǎo)乳腺癌凋亡,并提高其放射敏感性[14]。本研究發(fā)現(xiàn),干擾lncRNA PCAT1 顯著上調(diào)γ-H2AX 表達,增強T47D 細胞的放射敏感性。
lncRNA 通過多種機制、多途徑在腫瘤進展中發(fā)揮作用。對lncRNA PCAT1 和腫瘤相關(guān)研究分析發(fā)現(xiàn),其機制多與調(diào)控miRNA 表達有關(guān),如lncRNA PCAT1 靶向miR-149-5p 顯著促進結(jié)直腸癌細胞的遷移和侵襲[15]。沉默lncRNA PCAT1 通過調(diào)控miR-128/GOLM1 增強宮頸癌細胞的放射敏感性[16]。本研究通過Starbase 數(shù)據(jù)庫預(yù)測到miR-329-3p 是lncRNA PCAT1 的潛在靶基因。進一步分析顯示,乳腺癌細胞中miR-329-3p 表達量顯著降低,過表達miR-329-3p 顯著下調(diào)CyclinD1 表達,上調(diào)Cleaved-caspase-3 和γ-H2AX 蛋白表達,抑制T47D 細胞活力,誘導(dǎo)細胞凋亡,并增加其放射敏感性,而抑制miR-329-3p 發(fā)揮相反作用,表明miR-329-3p 表達改變除參與乳腺癌細胞惡性生物學(xué)行為外,還參與其放療耐藥表型。與本研究發(fā)現(xiàn)類似,Wang 等[17]證實抑制lncRNA X 染色體失活特異轉(zhuǎn)錄物(XIST)通過上調(diào)miR-329-3p 表達顯著增加膠質(zhì)瘤細胞的放射敏感性,抑制細胞增殖,并誘導(dǎo)細胞凋亡。雙熒光素酶實驗證實lncRNA PCAT1 直接靶向miR-329-3p,在T47D 細胞中miR-329-3p 表達受到lncRNA PCAT1 的負性調(diào)控,提示乳腺癌中可能存在lncRNA PCAT1/miR-329-3p 調(diào)控途徑。已有研究表明,Wnt/β-catenin 信號通路異常激活在乳腺癌發(fā)生和進展中具有促進作用,包括促進細胞增殖、遷移、侵襲、血管生成和化療耐藥[18-19]。lncRNA PCAT-1 通過激活Wnt/β-catenin 信號通路促進急性髓系白血病細胞惡化[20]。本研究發(fā)現(xiàn),干擾lncRNA PCAT-1 表達顯著抑制Wnt/β-catenin 信號通路活化,而抑制miR-329-3p 表達則激活Wnt/βcatenin 信號通路,且抑制miR-329-3p 表達還可逆轉(zhuǎn)干擾lncRNA PCAT-1 表達對T47D 細胞增殖、凋亡、放療敏感性以及Wnt/β-catenin 信號通路活化的影響,這說明lncRNA PCAT-1 可能靶向miR-329-3p 調(diào)控Wnt/β-catenin 信號通路進而影響T47D 細胞增殖、凋亡和放療敏感性。
綜上,乳腺癌細胞中l(wèi)ncRNA PCAT1 表達增加,干擾lncRNA PCAT1 可抑制乳腺癌細胞增殖,誘導(dǎo)細胞凋亡,增加細胞放射敏感性,其機制可能與靶向miR-329-3p 抑制Wnt/β-Catenin 信號通路相關(guān)。因此,lncRNA PCAT1/miR-329-3p/Wnt/β-Catenin 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)可能是乳腺癌有效放療增敏靶點。