楊 雄 史正軍 趙長林
(1. 西南林業(yè)大學(xué)生物多樣性保護(hù)學(xué)院,云南 昆明 650233;2. 西南林業(yè)大學(xué)化學(xué)工程學(xué)院,云南 昆明 650233)
木質(zhì)素在自然界中含量非常豐富,它是一種擁有極其復(fù)雜結(jié)構(gòu)的天然高分子化合物,在高等植物細(xì)胞壁中木質(zhì)素廣泛存在,是僅次于纖維素的一種生物多聚體化合物[1-2],微生物難以降解木質(zhì)素的原因在于木質(zhì)素中各種生物學(xué)穩(wěn)定的復(fù)雜鍵型[3]。如何高效率的利用這類作物資源為目前所研究的熱點課題,傳統(tǒng)工業(yè)制備纖維素材料的方法不僅浪費大量的化學(xué)資源和能源,產(chǎn)生的制漿廢液也污染環(huán)境[4-5];白腐真菌是目前應(yīng)用廣泛的、公認(rèn)安全環(huán)保且無公害的可以將木質(zhì)素降解為簡單無機物的一類微生物[6]。木材腐朽真菌主要包括白色腐朽菌和褐色腐朽菌2種[7-8],其中白色腐朽真菌是木材腐朽真菌中最大的類群,包括大部分木生擔(dān)子菌、少數(shù)子囊菌和半知菌[9-13],大多白腐菌可產(chǎn)生漆酶和錳過氧化物酶,極少數(shù)能產(chǎn)生木質(zhì)素過氧化物酶[14-16],使木質(zhì)素發(fā)生側(cè)鏈氧化斷裂、β-芳醚鍵斷裂、芳香環(huán)氧化開裂以及苯環(huán)上脫甲氧基或甲基化反應(yīng)而降解[17];同時木材腐朽真菌也是森林生物多樣性的重要組成部分,在森林生態(tài)系統(tǒng)中起著關(guān)鍵的降解還原作用,能維持森林生態(tài)系統(tǒng)的物質(zhì)循環(huán)和能量流動[18-20]。
巨龍竹(Dendrocalamus sinicus)屬禾本科竹亞科牡竹屬竹種,熱帶巨大型叢生竹,為我國特有物種,發(fā)現(xiàn)于云南省西南部臨滄、西雙版納地區(qū),其生長速度快、經(jīng)濟用途廣、生態(tài)效益顯著,作為一種特色明顯的資源植物具有很大的開發(fā)潛力和廣泛的應(yīng)用前景[21-26];因該物種發(fā)現(xiàn)時間較晚,分布地區(qū)科研資金投入不足、科研水平相對落后,對巨龍竹深入開發(fā)應(yīng)用欠缺,尤其在巨龍竹木質(zhì)素降解研究方面還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠[27-28],如巨龍竹在制漿造紙、人造板材和生物精煉工業(yè)領(lǐng)域有極高的開發(fā)潛力,但由于木質(zhì)素的存在導(dǎo)致纖維素在分離過程中呈現(xiàn)耗能高、污染大、耗時多、產(chǎn)量低、其不僅浪費資源同時污染環(huán)境[4-5,29]。因此,針對目前存在木質(zhì)素限制竹資源高效深度開發(fā)利用,傳統(tǒng)物理化學(xué)預(yù)處理方法既不經(jīng)濟又不環(huán)保的問題,本研究提出利用生物方法降解竹材中的木質(zhì)素觀點,并利用固體發(fā)酵法和化學(xué)測定法篩選高效降解巨龍竹木質(zhì)素的菌株;采用形態(tài)學(xué)與分子系統(tǒng)學(xué)相結(jié)合方法將該菌株鑒定;通過主成分分析揭示存在的降解類型;運用紫外掃描法揭示木質(zhì)素初步降解機制。
野外調(diào)查并采集白色腐朽真菌,并記錄采集編號、采集地點、寄主信息,將新鮮標(biāo)本帶回實驗室進(jìn)行分離純化,將分離純化出的白色腐朽真菌菌株保存于4 ℃冰箱備用。本研究共分離純化出可用于巨龍竹竹材降解的菌株30號(表1),現(xiàn)保藏于西南林業(yè)大學(xué)真菌標(biāo)本館(SWFC)。巨龍竹材料采自于云南省臨滄市的滄源地區(qū)。
表 1 供試白腐菌株Table 1 The information for the test strain of white rot fungi
續(xù)表 1
1.2.1竹材的固體發(fā)酵
1)將新鮮的巨龍竹切成約3 cm×1 cm×0.3 cm的竹片,放入烘箱105 ℃烘干至恒質(zhì)量。
2)將上述烘干后的竹片取出5 g(精確到0.000 1 g)分別放入培養(yǎng)皿中寫上標(biāo)簽,依次加入適量的水,充分淹沒浸泡12 h。
3)到達(dá)規(guī)定時間后,瀝干表面水分,121 ℃滅菌30 min備用。
4)取供試菌株菌柄餅(約1 cm2)接種在裝有2%麥芽浸粉培養(yǎng)基的250 mL三角瓶中,28 ℃濕度75%靜置培養(yǎng)。
5)待菌絲長滿培養(yǎng)基表面,放入上述滅菌的5 g竹片,用接種針將其均勻分布于培養(yǎng)基表面,放入恒溫恒濕箱培養(yǎng)箱,溫度28 ℃、濕度75%靜置培養(yǎng)30 d;每個菌種2個重復(fù),未接種的2組竹片作為空白對照組。
6)30 d后取出樣品,洗去木片表面的菌絲(洗的過程應(yīng)防止竹材的細(xì)小部分掉落,影響失重率的測定),105 ℃風(fēng)干至恒質(zhì)量[30]。
1.2.2竹材化學(xué)組分的測定
用定性濾紙將上述風(fēng)干后的樣品包好并用棉線捆牢,參照國標(biāo)GB/T 2677.6—1994[31]加入苯醇混合液進(jìn)行抽提,每小時約4次循環(huán),抽提時間為6 h,然后將抽提好的樣本放入烘箱105 ℃烘至恒質(zhì)量,參照國標(biāo)GB/T 2677.10—1995[32]測定綜纖維素含量,參照國標(biāo)GB/T 2677.8—1994測定Klason木素含量[30]。
1.2.3失重率、木質(zhì)纖維素降解率及選擇系數(shù)的計算
1.3.1主成分分析方法
利用SPSS數(shù)據(jù)分析軟件,將竹材失重率及各化學(xué)變量提取2個主成分并計算其主成分得分系數(shù)。根據(jù)得分系數(shù)計算出每株菌的主成分得分,并做出主成分分析散點圖[30]。
1.3.2紫外掃描分析方法
1)取1 g過40目標(biāo)準(zhǔn)篩的竹粉與適量的質(zhì)量體積分?jǐn)?shù)2%的麥芽浸粉培養(yǎng)基裝入到三角瓶中(250 mL)滅菌備用;
2)向上述滅菌后的三角瓶中接入供試菌株的菌餅(約1 cm2),放入培養(yǎng)箱恒溫恒濕靜置培養(yǎng)20 d。未接種的作為對照組,處理同上;
3)培養(yǎng)20 d后,向每個三角瓶中加入50 mL 95%乙醇,瓶口覆蓋上錫箔紙,50 ℃發(fā)酵1 h;
4)發(fā)酵結(jié)束后放入冰箱中冷卻至室溫;
5)取2 mL菌液放于離心管中,10 000 r/min離心2 min;
6)取上清液以1∶10的比例與95%乙醇混合稀釋;
7)室溫下測220~400 nm的光譜值[30]。
1.4.1DNA提取、PCR擴增及系統(tǒng)發(fā)育分析
OMEGA HP Fungal DNA Kit試劑盒用于SWFU 000072菌株DNA基因組提取[33]。本研究選用ITS基因片段完成系統(tǒng)發(fā)育分析,引物ITS5/ITS4[34],訂購在生工生物工程(上海)股份有限公司。ITS片度PCR程序參考木腐菌系統(tǒng)發(fā)育研究[33],產(chǎn)物純化和測序均送至北京擎科生物科技有限公司昆明分公司。
DNA序列用MAFFT version 7(http://mafft.cbr.jp/alignment/server)進(jìn)行比對,手工校正和去掉兩端參差排列后保存為NBRF/PIR格式文件,再用ClustalX 1.83[35]將NBRF/PIR格式文件轉(zhuǎn)化為NEXUS格式文件以及PHYLIP格式文件;經(jīng)過編輯后用于系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建。系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建采用PAUP* 4.0b10[36]中的最大簡約法(maximum parsimony analysis);設(shè)置如下:1)非模糊排列的缺失位點處理為新特征(new state);2)模糊排列位點不予采用;3)進(jìn)行1 000次自持分析[37];4)所有特征等權(quán);5)采用啟發(fā)式搜索方式(heuristic search);(6)Max-trees設(shè)為5 000,其他參數(shù)采用默認(rèn)值[37]。
1.4.2形態(tài)學(xué)研究方法
宏觀研究方法:肉眼直接觀察及在體視顯微鏡下觀察林木腐朽真菌標(biāo)本以下主要特征并拍照記錄:
1)一般特征:一年生/多年生,有柄/菌蓋/平伏反轉(zhuǎn)/平伏,大小,形狀,厚度,質(zhì)地;
2)菌蓋表面:顏色,光滑/粗糙,絨毛/粗毛,環(huán)溝/環(huán)帶,邊緣薄/厚,銳/鈍,孔口形狀及大小。
顯微研究方法:所有顯微研究均在Nikon Eclipse E 100顯微鏡和Leica DM2500(375582)生物正置熒光顯微鏡下進(jìn)行。利用Melzer試劑(簡寫為IKI)、棉藍(lán)試劑(簡寫為CB)和5%氫氧化鉀試劑(簡寫為KOH)作為浮載劑。真菌定名人名稱的縮寫基于國際縮寫標(biāo)準(zhǔn)Authors of Plant Names[38];有關(guān)子實體的顏色術(shù)語則依據(jù)文獻(xiàn)[39]。
采用30株白腐菌對巨龍竹竹片開展降解試驗,經(jīng)過30 d培養(yǎng)后,竹片失重率、綜纖維素降解率、酸不溶木質(zhì)素降解率發(fā)生變化(表2),其中失重率表示白腐菌對巨龍竹的分解力,其失重率越高表明其對巨龍竹的分解能力越強;由表2可知,巨龍竹竹片的失重率從0.45%至18.36%不等,竹材失重率差距較大,其中SWFU 000096的失重率最高為18.36%,表明其對巨龍竹的降解能力最強,兩菌株SWFU 000089,SWFU 000013次之,失重率依次為15.53%,15.45%。當(dāng)Klason木素降解率與綜纖維降解率的比值(脫木質(zhì)素選擇系數(shù)SI)大于1時,則可以判斷木腐菌產(chǎn)生了選擇性脫木質(zhì)化作用[30]。根據(jù)表2中的選擇系數(shù)SI表明,30個菌株中有10株白腐菌對巨龍竹進(jìn)行了選擇性脫木質(zhì)化作用,其菌株編號分別為SWFU 000072、SWFU 000094、SWFU 000013、SWFU 000084、SWFU 000028、SWFU 000086、SWFU 000074、SWFU 000073、SWFU 000097、SWFU 000080,其SI依次為3.10、2.71、2.04、1.80、1.70、1.66、1.25、1.22、1.09、1.05;盡管SWFU 000096對巨龍竹的分解能力最強,但其沒有發(fā)生脫木質(zhì)化作用,它不加選擇地降解了木質(zhì)素和綜纖維素,其綜纖維降解率高達(dá)19.16%;本研究的目的在于篩選高效選擇性降解巨龍竹木質(zhì)素的白腐真菌,所以該菌株不滿足條件。失重率相對于SWFU 000096稍低的3個菌株SWFU 000072、SWFU 000094、SWFU 000013,SI依次為3.10、2.71、2.04,表明這3個株菌對巨龍竹的選擇性脫木質(zhì)化作用更顯著。其中菌株SWFU 000072對酸不溶木素的降解率高達(dá)19.65%,對綜纖維素的降解率僅有6.39%,且對巨龍竹綜纖維損失極少,綜合供試菌株降解巨龍竹的數(shù)據(jù)分析,通過SPSS軟件分析了失重率和選擇性系數(shù)兩者的相關(guān)性,其相關(guān)性系數(shù)為0.450 12,其表明30株白腐菌降解巨龍竹的能力與其選擇性系數(shù)之間沒有明顯的相關(guān)關(guān)系。
表 2 30株白腐菌降解巨龍竹30 d后各組分情況Table 2 Degradation of different component of D. sinicus treated by 30 white rot fungi for 30 days
為進(jìn)一步解析30株白腐真菌對巨龍的降解類型,利用竹材失重率及各化學(xué)變量提取2個主成分(PC),第1主成分和第2主成分分別解釋了85.43%和12.54%的變量,其表明2個主成分能解釋3個指標(biāo)總計97.97%的數(shù)據(jù)量。組分降解率的3個指標(biāo)的數(shù)據(jù)做主成分分析(PCA),其結(jié)果顯示上述3個指標(biāo)。
主成分分析(PCA)結(jié)果為:Klason木質(zhì)素降解率主成分得分系數(shù)PC1=0.345、PC2=1.221,綜纖維降解率主成分得分系數(shù)PC1=0.354、PC2=1.074,失重率主成分得分系數(shù)PC1=0.382、PC2=0.107根據(jù)上述得分系數(shù)利用數(shù)據(jù)處理軟件計算出每株菌的主成分得分,再以表2中30株白腐菌的編號后2位為序號,得出主成分分析散點圖(圖1),其表明當(dāng)PC1的得分越高,失重率、綜纖維素降解率、木質(zhì)素降解率就越大;當(dāng)PC2的得分越高,菌株降解巨龍竹時選擇系數(shù)就越高,結(jié)果表明PC2所反映的是菌株對木質(zhì)素的選擇性降解。本研究主成分分析數(shù)據(jù)變化規(guī)律與微生物在其他植物降解應(yīng)用研究結(jié)果分析趨勢相似[30, 40]。
圖 1 3種指標(biāo)的主成分散點圖Fig. 1 Main dispersion point diagram of 3 indexes
根據(jù)主成分分值高低劃分類型(圖1),30株白腐菌可分為3種主要的降解類型:類型A包含選擇性降解木質(zhì)素的菌株,菌株的選擇系數(shù)也越大,PC2分值也相應(yīng)增高。類型B和C都代表選擇性降解綜纖維素的菌株,但B類型中的菌株對木質(zhì)纖維素的降解能力極其微弱,C類型中的菌株對巨龍竹綜纖維素和木質(zhì)素的降解能力都較強,尤其對綜纖維素的降解能力非常強烈,其降解的強烈程度反映在PC1的分值上,PC1分值越大的菌株則綜纖維素降解率越高。圖1顯示SWFU 000072的PC1得分較低,PC2得分最高,其揭示該菌株擇性降解木質(zhì)素能力在30株白腐菌中最強。
將選擇性系數(shù)大于1的3個菌株SWFU 000072、SWFU 000013、SWFU 000086接種于過40目篩的巨龍竹粉,發(fā)酵20 d后用95%乙醇對的竹粉進(jìn)行提取,對其提取液進(jìn)行紫外光譜掃描,其紫外掃描光譜圖(圖2)表明空白對照組的在260 nm有明顯的吸收峰,該吸收峰代表木質(zhì)素中芳香環(huán)的吸收[41];而其他組別在260 nm處無明顯的吸收峰。
圖 2 乙醇提取液的紫外光譜圖Fig. 2 UV spectrum of ethanol extract
形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果:如圖3a所示:擔(dān)子果1年生,菌蓋表面具粗毛和輪紋,菌肉異質(zhì);如圖3b所示:子實層體初期為孔狀,后期撕裂為齒狀;如圖4所示:菌絲系統(tǒng)三體系,生殖菌絲具索狀聯(lián)合,菌絲在Melzer試劑中無反應(yīng),在棉藍(lán)試劑中無反應(yīng),在KOH試劑中無變化。
圖 3 白腐真菌SWFU 000072擔(dān)子果形態(tài)特征Fig. 3 Basidiomata of specimen SWFU 000072
圖 4 白腐菌株SWFU 000072菌落形態(tài)Fig. 4 Colony characters of white rot fungi strain SWFU 000072
基于宏觀生境特征(圖3)、培養(yǎng)菌落性狀及顯微菌絲數(shù)據(jù)(圖4),鑒定其為Cerrena屬水平。
分子系統(tǒng)學(xué)鑒定結(jié)果:如圖5所示,基于ITS序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹表明,菌株SWFU 000072(GenBank no. MK809429)在系統(tǒng)發(fā)育樹中與分子序列Dai 7 872、Dai 7 359、JXSB1742聚為一個支系,且具有高支持率(100% MP)。因此,該菌株鑒定為Cerrena zonata。
圖 5 白腐菌株SWFU 000072系統(tǒng)發(fā)育樹Fig. 5 The phylogenetic tree of white rot fungi strain SWFU 000072
本研究從30株白腐真菌中篩選出1株高效降解巨龍竹木質(zhì)素的菌株SWFU 000072,經(jīng)過形態(tài)學(xué)與分子系統(tǒng)學(xué)鑒定為Cerrena zonata?;谥鞒煞址治觯≒CA),揭示30株白腐菌存在3種降解類型:選擇性降解木質(zhì)素、選擇性降解綜纖維素、強烈地選擇性降解綜纖維素。通過對巨龍竹粉乙醇提取液進(jìn)行紫外掃描分析表明木質(zhì)素中的芳香環(huán)結(jié)構(gòu)遭到了破壞,進(jìn)而揭示了白腐菌通過破壞木質(zhì)素中的芳香環(huán)結(jié)構(gòu)完成高效降解巨龍竹木質(zhì)素的降解機制。降解木材及農(nóng)林廢棄物木質(zhì)素的真菌在國內(nèi)外相繼報道,如Ceriporiopsis subvermispora,Ganoderma australe,Lentinus edodes,Phanerochaete chrysosporium,Phlebia radiata,Pleurotus ostreatus,Stereum hirsutum,Trametes versicolor,其降解類型屬白色腐朽[30,42-49]。本研究篩選菌株物種為Cerrena zonata,該種隸屬于Cerrenaceae科,Polyporales目,與國內(nèi)已報道多種林木腐朽真菌均為Polyporales目,表明該目物種在降解木材及農(nóng)林廢棄物木質(zhì)素方面具有獨特性,且該種為新整合種類[50],為未來的深入研究提供了特殊材料。利用白腐真菌降解木質(zhì)素研究結(jié)果揭示白腐菌在木材預(yù)處理階段具有節(jié)約資源、減少污染物的排放、提高產(chǎn)能的優(yōu)勢[51-53]。王偉[54]從23株白腐真菌中篩選出3個高效降解黑楊木質(zhì)素的物種,F(xiàn)unalia trogii,Trametes orientalis,Truncospora ochroleuca,并提出了3株白腐真菌降解黑楊的初步降解機制。本研究采用巨龍竹為研究對象,研究表明竹材失重率比木材失重率較低,分析其主要原因為竹材與木材木質(zhì)素不同,竹材屬于典型的禾草類木質(zhì)素[28]。盡管真菌降解木質(zhì)素已研究多年,但研究成果從實驗室走到大田、生產(chǎn)車間還處在瓶頸期,從成果產(chǎn)出到實際轉(zhuǎn)化、產(chǎn)生效益還有待繼續(xù)開展深入研究和探索,盡管困難重重,始終堅信通過創(chuàng)新的、嚴(yán)謹(jǐn)?shù)?、科學(xué)的試驗研究必定能開發(fā)出適合工業(yè)生產(chǎn)的高活性白腐菌株和培養(yǎng)體系,解決木質(zhì)纖維素材料高效利用的瓶頸問題[27,29]。我國竹林面積居世界第一[55],竹資源及其豐富,其孕育了竹資源加工利用及產(chǎn)業(yè)化高效快速發(fā)展的格局,但選擇性去除竹材中的木質(zhì)素極大地限制了竹資源深度利用,已成為竹生物制漿、竹纖維素制備、竹材綜合開發(fā)與利用的卡脖子問題,因此如何高效且有選擇性的去除竹材中木質(zhì)素是一項集基礎(chǔ)科學(xué)研究與產(chǎn)業(yè)應(yīng)用轉(zhuǎn)化于一體亟待解決的問題[28,56]。本研究盡管已篩選出高效降解巨龍竹白腐菌株,但是將其從實驗室研究轉(zhuǎn)移至產(chǎn)業(yè)應(yīng)用轉(zhuǎn)化還需要篩選出適應(yīng)性較強的菌株。
隨著化石資源枯竭,生物質(zhì)資源利用研究日益突顯。對于巨龍竹這種在制漿造紙、人造板材和生物煉制等工業(yè)領(lǐng)域表現(xiàn)出極高的研究開發(fā)價值的可再生資源開發(fā)利用刻不容緩[57],竹木質(zhì)素的去除還是一個未攻克的難題,由于工業(yè)制備纖維素材料時主要靠傳統(tǒng)的高溫高壓、強堿法等方法去除木質(zhì)素,這樣不僅浪費大量的資源和能源也污染環(huán)境。本研究篩選出了能夠選擇性高效降解巨龍竹木質(zhì)素白腐菌株并對其進(jìn)行了鑒定,同時對其初步降解機制進(jìn)行了揭示,為后續(xù)的研究提供一定的理論支持。在后續(xù)的研究中可選定木腐菌固體發(fā)酵培養(yǎng)基成分及培養(yǎng)條件;運用2個或以上菌株同時或先后培養(yǎng)來進(jìn)行預(yù)處理,補足木腐菌在不同降解階段的不同酶系,優(yōu)化共生條件使其脫木質(zhì)程度更高[54]。