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        印記基因與腫瘤的發(fā)生

        2022-04-07 13:19:16謝艷穎胡雪峰
        生物學通報 2022年3期
        關鍵詞:小鼠

        謝艷穎 胡雪峰

        (1福建省福州第三中學濱海校區(qū) 福建福州 350207 2福建師范大學生命科學學院,福建省發(fā)育與神經生物學重點實驗室 福建福州 350117)

        表觀遺傳是指生物體的基因序列不改變,而基因的表達發(fā)生可遺傳變化的一種現象,普遍存在于生物體的生長發(fā)育過程中,印記基因是表觀遺傳現象的一種。本文概述了印記基因的結構、表達機制及其表達異常與腫瘤的關系。

        1 印記基因簡介

        印記基因的發(fā)現起始于20世紀70年代報道的父源特異性染色體消除現象,90年代科學家鑒定出3種小鼠的印記基因。隨著研究深入,科學家逐步探明了印記基因的結構及其表達機制。

        1.1 印記基因的發(fā)現 1971年,在研究節(jié)肢動物時,克勞斯(Crouse)發(fā)現決定性別的關鍵因素父源特異性染色體消除,提出“染色體印記”的概念[1]。同時,庫珀(Cooper)注意到有袋類哺乳動物父源X染色體的特異性失活,也稱其為“染色體印記”。1974年,約翰遜(Johnson)在研究17號染色體突變的小鼠時發(fā)現,染色體印記不是X染色體特有的現象,而是廣泛存在于基因組中。

        20世紀80年代,麥格拉斯(McGrath)和索特(Solter)等通過小鼠的細胞核移植實驗發(fā)現,2個原核分別來自父方和母方時,胚胎能正常發(fā)育。若是單親二倍體(2個原核均來自父方或母方),胚胎死亡。后續(xù)的實驗證明,在一種性別中發(fā)現的被標記的許多基因在另一性別中未被標記,因而只有來自父母雙方的基因同時存在,才能互補,使后代正常發(fā)育。但胚胎中存在2個相同的標記基因時,就會導致幼崽死亡,這為哺乳動物基因組印記的存在提供了有力的證據。1991年,科學家陸續(xù)發(fā)現了小鼠的3種印記基因,通過定位克隆,鑒定出Igf2r(insulin-like growth factor type 2 receptor),通過基因敲除鑒定出Igf2(insulin-like growth factor type 2)與H19。

        1.2 印記基因簇 迄今為止,約有150個印記基因被定位到17條小鼠染色體上,其中包括X染色體。經鑒定,超過80%的印記基因聚集在16個基因組區(qū)域,稱為印記基因簇。已鑒定出7個印記基因簇,這7個印記基因簇都包含3個及以上的印記基因。每個印記基因簇都由一個印記控制中心(imprinted control center,ICR)控制,該區(qū)域具有親本特異性表觀遺傳修飾,例如,DNA甲基化和翻譯后組蛋白修飾等。DNA甲基化是公認的一種賦予親本特異性的表觀遺傳修飾[2]。ICR中攜帶有甲基化印記的DNA序列,稱為差異性DNA甲基化區(qū)域(differentially DNA methylated region,DMR)。DNA甲基化印記發(fā)生在配子中,體細胞中僅存于一個親本染色體上。除了ICR和多個印記基因,大部分印記基因簇都至少含有一個長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)。lncRNA本身不編碼蛋白質,卻能調控基因的表達。在印記基因簇中,ICR通常與lncRNA的啟動子重疊。

        1.3 印記基因的表達機制 印記基因簇的結構各異,致使不同印記基因的表達受不同機制的調控。根據調控的結果,可將印記基因分為父源印記基因與母源印記基因兩大類。父源印記基因是指父源等位基因抑制而母源等位基因表達的基因,與抑制胚胎發(fā)育有關,例如,Igf2r、H19[3-4]。母源印記基因則是父源等位基因表達而母源等位基因受抑制的基因,與促進胚胎發(fā)育有關,例如,Igf2。

        1.3.1 lncRNA模型 lncRNA介導的表達模型適用于Igf2r印記基因簇。Igf2r位于小鼠17號染色體,是父源印記基因。作為Igf2的一種受體,與其結合后被溶酶體降解,起到抑制生長的作用。在母本染色體上,甲基化的ICR含有l(wèi)ncRNA的啟動子,致使lncRNA無法表達,但不影響其他印記基因的表達。而父本染色體ICR未甲基化,lncRNA可表達,使同側的印記基因沉默。這種機制可能是lncRNA與啟動子重疊,導致某種形式的轉錄干擾或通過覆蓋局部染色體區(qū)域而招募抑制性組蛋白。

        1.3.2 絕緣子模型 絕緣子介導的表達模型適用于Igf2/H19印記基因簇。Igf2與H19位于小鼠17號染色體遠端,其中Igf2是母源印記基因,H19位于Igf2下游,是父源印記基因。Igf2/H19受H19上游DMR調控,共用一個增強子,增強子位于H19下游。在母本染色體中,DMR未甲基化,DMR區(qū)域有潛在的CCCTC結合位點,可結合絕緣子CTCF因子,形成絕緣子,以阻斷增強子和Igf2啟動子的作用,但不影響其與H19啟動子的作用,使得H19能順利表達。在父本染色體中,H19的啟動子區(qū)域甲基化,H19沉默,不形成絕緣子,增強子作用于Igf2啟動子,Igf2表達。

        2 印記基因與腫瘤的發(fā)生

        印記基因的正常表達使生物體能正常發(fā)育,而印記基因中雙親等位基因若同時表達或同時沉默會導致腫瘤的發(fā)生。

        2.1 IGF2/H19與腫瘤的發(fā)生 IGF2與IGF1R結合后激活酪氨酸激酶受體,通過PI3K/AKT通路抑制細胞凋亡,通過RAS/MAP激酶通路促進細胞增殖[5]。母本染色體DMR失調導致IGF2印記丟失(loss of imprinting,LOI),促進IGF2雙等位基因表達,致使細胞過度增殖。在多種腫瘤中發(fā)現,IGF2過表達與腫瘤發(fā)生相關。LOI最初是在Wilms腫瘤中發(fā)現的,隨后發(fā)現,IGF2的LOI現象普遍存在于腫瘤中。IGF2的LOI在結腸癌表現為近端和遠端結腸的彌漫性異常,一些結腸癌患者的正常結腸組織可檢測出IGF2的LOI[6]。Sakatani等[7]構建IGF2印記缺失型小鼠,發(fā)現結腸癌的發(fā)生率提高了2倍,并觀察到癌前病變現象。

        H19能被折疊成一個特殊的二級結構,這使其能與RNA結合蛋白和DNA/染色質修飾因子等相關蛋白結合,調節(jié)相關生理過程。H19于胚胎期高表達,出生后在多數組織中沉默,但腫瘤發(fā)生過程中可重新激活。在許多腫瘤中發(fā)現,H19能通過不同的機制發(fā)揮致癌作用。H19能促進癌細胞增殖并抑制癌細胞死亡。在乳腺癌細胞中,H19促進G1/S轉變[8]。高表達的H19可促進EZH2與促凋亡因子BIK啟動子的結合,抑制BIK的表達。H19也可降低抑癌因子的水平。在膀胱癌細胞中,H19通過miR-675抑制p53表達。在胃癌中,H19導致p53部分失活。H19還能促進癌細胞的遷移、侵襲和轉移。上皮-間質轉化(epithelialmesenchymal transition,EMT)是腫瘤擴散的重要機制,在膀胱癌中,H19與EZH2結合,促進wnt/βcatenin的激活,致使上皮標記E-cadherin表達下降,促進 EMT[9]。

        2.2 CDKN1C位點與腫瘤的發(fā)生 CDKN1C位點位于人類1號染色體上,包含父源印記基因KCNQ1、CDKN1C及母源印記基因KCNQ1OT1,由位于KCNQ1內含子中的KvDMR1調控。

        CDKN1C編碼p57kip2蛋白,其氨基端含有一個CDK抑制結構域[10],可與細胞周期蛋白CDK復合物結合并抑制細胞周期進程。CDKN1C可促進細胞分化,在橫紋肌肉瘤細胞中,轉錄因子MyoD受損,致使p57kip2轉錄減少,成肌細胞分化受阻。CDKN1C可調節(jié)細胞死亡,促進HeLa細胞線粒體凋亡途徑,激活caspase 9和caspase 3。CDKN1C還能抑制膠質瘤細胞遷移和侵襲的能力。

        KCNQ1編碼電壓門控鉀離子通道的一個亞基。鉀離子通道參與許多類型細胞的增殖,在結、直腸癌與肝細胞性肝癌中,KCNQ1過表達抑制細胞的增殖與侵襲。KCNQ1是wnt/β-catenin通路的靶基因與調控因子,在結、直腸癌細胞中,活化的wnt/β-catenin通過直接結合TCF4復合物抑制KCNQ1蛋白的表達,KCNQ1抑制劑引起β-catenin重新進入細胞質,刺激結、直腸癌細胞增殖[11]。

        KCNQ1OT1編碼一個lncRNA,能負性調節(jié)KCNQ1的表達。在結、直腸癌細胞中,β-catenin與KCNQ1OT1啟動子直接結合,使KCNQ1OT1基因的表達顯著提高。在肝細胞性肝癌中,KCNQ1OT1基因敲除降低了GSK3β的磷酸化水平,下調β-catenin,抑制抗凋亡基因Bcl-2的表達[12]。

        2.3 DLK1/MEG3與腫瘤的發(fā)生 DLK1/MEG3位于人類14號染色體上,其中DLK1是母源印記基因,MEG3是父源印記基因,DLK1由IG-DMR調控,MEG3由MEG3-DMR調控。

        DLK1編碼DLK1蛋白,在胎盤組織高表達,在正常組織中沉默,但在多種腫瘤中異常表達。IG-DMR的甲基化異常與肝母細胞瘤、垂體瘤、腎細胞癌等相關。Yin等[13]發(fā)現高表達的DLK1蛋白可使神經膠質瘤細胞的增殖能力明顯增強,上調細胞周期蛋白Cyclin D1、CDK2和E2F4的表達。

        MEG3編碼lncRNA,在許多正常組織中表達,但在腫瘤中表達受抑制。在許多類型的腫瘤中,例如,垂體瘤、成神經細胞瘤、腦膜瘤、肝細胞性肝癌等,均可觀察到MEG3-DMR的高甲基化與MEG3的沉默或表達降低。Braconi等[14]發(fā)現MEG3在肝細胞性肝癌細胞中的表達增強,顯著抑制腫瘤細胞的生長,誘導細胞凋亡。

        3 總結

        印記基因在生物生長發(fā)育過程中起至關重要的作用。通常,印記基因與胚胎發(fā)育有關,表現為促進或抑制胚胎發(fā)育。若印記基因同時表達或沉默,可造成細胞過度增殖或誘導細胞凋亡,導致腫瘤發(fā)生。正是印記基因上攜帶的特異性表觀遺傳標記,使雙親等位基因的表達受到嚴格的調控,才使生物體的各項生命活動正常進行。

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