楊軍,孔祥瑞,王讓劍
(福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所/國(guó)家茶樹(shù)改良中心福建分中心/農(nóng)業(yè)部福建茶樹(shù)及烏龍茶加工科學(xué)觀測(cè)實(shí)驗(yàn)站,福建 福州 350013)
福建省內(nèi)茶樹(shù)種質(zhì)資源遺傳多樣性豐富,存在大量野生茶樹(shù)種質(zhì)資源。其中,尤溪野生茶位于福建尤溪縣湯川鄉(xiāng)赤基村騰峰山苦竹林中,灌木為主,少量小喬木,較直立,花冠白色(少數(shù)淡黃色)[1],制成茶形似雀舌,湯色碧綠,香氣清醇,滋味甘甜,沖泡五、六次仍清爽可口[2];云霄野生茶位于福建云霄縣火田鎮(zhèn)大帽山,對(duì)云霄縣野生茶樹(shù)子房的茸毛數(shù)量、茸毛長(zhǎng)度、子房外壁紋飾等調(diào)查發(fā)現(xiàn),該地區(qū)種質(zhì)資源子房外壁紋飾以凹陷型為主,存在禿房野生茶種質(zhì)資源群體[3]。同時(shí),茶樹(shù)是山茶科山茶屬茶組的多年生常綠木本植物[4],且為異花授粉植物,具有高度雜合性,雜交結(jié)實(shí)率低[5],遺傳基礎(chǔ)復(fù)雜,茶樹(shù)種質(zhì)資源傳統(tǒng)鑒定方法時(shí)間長(zhǎng)、鑒定難度大。EST-SSR分子標(biāo)記在茶樹(shù)種質(zhì)資源鑒定與利用方面上有著廣泛應(yīng)用[6-10],尤其在野生茶樹(shù)種質(zhì)資源鑒定方面有大量研究。彭靖茹[11]等研究表明廣西省9份野生古茶與15份茶樹(shù)栽培種屬于2個(gè)類群,親緣關(guān)系較遠(yuǎn);陳立杰[12]等基于群體結(jié)構(gòu)分析結(jié)果顯示,貴陽(yáng)花溪古茶樹(shù)資源分為喬木型與灌木型,且由喬木型向灌木型進(jìn)化;安紅衛(wèi)[13]等認(rèn)為遺傳變異存在于144份貴州茶樹(shù)種質(zhì)資源個(gè)體間,不同海拔群體間存在較強(qiáng)的基因交流;有研究分別對(duì)安徽省太平猴魁茶產(chǎn)區(qū)柿大茶群體種[14]、廣西省野生茶樹(shù)種質(zhì)資源[15]、云南西雙版納茶資源[16]、云南大葉茶種質(zhì)資源[17]和四川大邑移栽野生大茶樹(shù)[18]進(jìn)行分組與遺傳多樣性分析。因此目前野生大茶樹(shù)種質(zhì)資源鑒定主要集中在遺傳多樣性、資源間親緣關(guān)系與基因交流等方面。本研究對(duì)云霄、尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源進(jìn)行分組、親緣關(guān)系與遺傳多樣性研究,旨在對(duì)云霄、尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源進(jìn)行鑒定與篩選,為茶樹(shù)種質(zhì)資源保護(hù)與利用提供初步依據(jù)。
參試材料來(lái)源于福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所與福建省云霄縣、尤溪縣,福建省茶樹(shù)品種資源與云霄、尤溪地方野生茶樹(shù)種質(zhì)資源共66個(gè)(表1),采集各材料一芽二葉鮮葉后用液氮迅速冷凍處理,保存在-80℃冰箱中備用。
表1 66份供試材料的名稱與來(lái)源Table 1 Names and origins of 66 specimens collected
1.2.1 農(nóng)藝性狀調(diào)查
農(nóng)藝性狀調(diào)查參考陳亮等[19]撰寫(xiě)的《茶樹(shù)種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)》。
1.2.2 基因組DNA的提取
采用改進(jìn)的CTAB法[20]提取茶樹(shù)基因組DNA。用1.0%的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行茶樹(shù)基因組分子量大小檢測(cè),用756-MC型紫外分光光度計(jì)測(cè)定茶樹(shù)基因組DNA的純度(OD260/280比值)。
1.2.3 引物合成
參照文獻(xiàn)[21]引物序列,序列由上海Sangon公司合成,引物信息見(jiàn)表2。
表2 29對(duì)SSR引物及其序列Table 2 Nucleotide sequences of 29 primer pairs
1.2.4 PCR擴(kuò)增和產(chǎn)物鑒定
PCR反應(yīng)體系為:ddH2O 18.8 μL,10×Buffer(Mg2+)2.5μL,dNTP(10 mmol·L-1)0.5 μL,上、 下 游 primer(10 μmol·L-1) 各 0.5 μL,Taq polymerase(0.5 U)0.2 μL,模板 DNA 2 μL。PCR反應(yīng)于美國(guó)ABI-9600型擴(kuò)增儀上進(jìn)行,熱循環(huán)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性4 min,使模板DNA充分變性,然后進(jìn)入下列溫度循環(huán):94℃變性45 s,不同溫度條件退火60 s,72℃延伸75 s,重復(fù)35個(gè)熱循環(huán);72℃延伸10 min,最后4℃保存。
引物統(tǒng)一在反向引物(R)的5’段標(biāo)記熒光(FAM/TAMRA),由上海百力格生物科技有限公司合成。擴(kuò)增產(chǎn)物 0.5 μL,GeneScan? 500 ROX? 0.5 μL,HiDi 9 μL,混勻后使用ABI公司3730XL進(jìn)行毛細(xì)管電泳。
采用ABI公司的GeneMapper4.0軟件,選擇GeneScan? 500 ROX?作為分子量標(biāo)準(zhǔn),對(duì)每一個(gè)擴(kuò)增出的條帶記錄大小。運(yùn)用PopGen3.2軟件計(jì)算Shannon信息指數(shù)(I)和Nei’s基因多樣性指數(shù)(H)。運(yùn)用NTSYSpc2.1中的Tree plot程序進(jìn)行聚類分析。利用GenAlEx 6.4.1(Peakall and Smouse,2006)進(jìn)行分子方差分析(analysis of molecular variances,AMOVA)分析。
從表3中看能出,云霄、尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源在葉面、葉片長(zhǎng)寬比性狀上差異不大。兩地茶樹(shù)種質(zhì)資源在葉面性狀上皆為微隆起與隆起,葉片長(zhǎng)寬比均屬于長(zhǎng)橢圓形(2.5<長(zhǎng)寬比<3.0)。在葉身性狀、葉緣性狀、葉面積、葉齒數(shù)、葉脈對(duì)數(shù)等方面上有所差異。云霄茶樹(shù)種質(zhì)資源葉身多為平與稍背卷,葉緣多為微波與波狀,尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源多為平與內(nèi)折,葉緣多為平與微波;云霄茶樹(shù)種質(zhì)資源葉面積范圍11.29~58.74 cm2,平均值為28.56 cm2,說(shuō)明云霄茶樹(shù)種質(zhì)資源多為中葉種(20 cm2<葉面積<40 cm2),少量種質(zhì)資源為大葉種;尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源葉面積范圍18.89~84.01 cm2,平均值為41.94,說(shuō)明尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源多為大葉種(40 cm2<葉面積<60 cm2),少量種質(zhì)資源為特大葉種;云霄茶樹(shù)種質(zhì)資源葉齒數(shù)平均值大于尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源,葉脈數(shù)平均值小于尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源。
表3 農(nóng)藝性狀調(diào)查結(jié)果Table 3 Agronomic characteristics of germplasms
(接表3)
66個(gè)參試材料可以劃分為4個(gè)類群(圖1)。類群A主要為八仙茶、早春毫與云霄地方茶樹(shù)種質(zhì)資源,說(shuō)明云霄地方茶樹(shù)種質(zhì)資源與八仙茶、早春毫親緣關(guān)系相對(duì)較近;類群B與類群C內(nèi)的主要茶樹(shù)品種資源按照不同茶類聚類在一起,類群B主要為福建省烏龍茶品種資源,類群C主要為福建省紅、綠茶品種資源,推測(cè)茶樹(shù)品種適制性與茶樹(shù)品種的親緣關(guān)系相關(guān);類群D皆為尤溪地方茶樹(shù)種質(zhì)資源,單獨(dú)形成一個(gè)聚類,說(shuō)明尤溪地方茶樹(shù)種質(zhì)遺傳背景比較特殊,屬于當(dāng)?shù)卦铇?shù)種質(zhì)資源,有待進(jìn)一步鑒定與挖掘。
圖1 遺傳相似系數(shù)聚類圖Fig. 1 Dendrogram on genetic similarity
從表4中看出,A-D群體中類群C的Shannon遺傳多樣性指數(shù)最高,類群C主要為福建省綠茶品種,其中福云系列茶樹(shù)品種具有云南大葉種遺傳背景,增加類群C的遺傳多樣性;尤溪、云霄茶樹(shù)種質(zhì)資源Shannon遺傳多樣性指數(shù)均高于類群B,類群B主要為福建省烏龍茶品種資源,因此,尤溪、云霄茶樹(shù)種質(zhì)資源遺傳多樣性較為豐富。
表4 對(duì)比4個(gè)群體遺傳多樣性Table 4 Genetic diversity of 4 groups
(接表4)
Hardy-Weinberg遺傳偏離指數(shù)D主要反映Ho(觀測(cè)雜合度)和He(期望雜合度)之間的平衡關(guān)系,D值越接近0,基因型的分布就越接近于平衡狀態(tài),D值大于0說(shuō)明存在雜合子過(guò)剩,D值小于0,說(shuō)明存在雜合子缺失現(xiàn)象[22]。其中,類群A的Ho與對(duì)應(yīng)的He相當(dāng),說(shuō)明類群A基因型的分布就越接近于平衡狀態(tài),說(shuō)明云霄地方茶樹(shù)種質(zhì)資源群體相對(duì)穩(wěn)定;類群B、C的Ho大于對(duì)應(yīng)的He,說(shuō)
明存在雜合子過(guò)剩,由類群B、C內(nèi)主要為福建省茶樹(shù)品種,品種之間親緣關(guān)系相對(duì)較近等原因造成,基因型的分布就未處于平衡狀態(tài);類群D的Ho小于對(duì)應(yīng)的He,說(shuō)明存在雜合子缺失現(xiàn)象,類群D單獨(dú)為尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源,與外來(lái)資源遺傳交換較少,親緣關(guān)系較遠(yuǎn),因此可能存在雜合子缺失。
Wright[23]等認(rèn)為種群間的遺傳分化系數(shù)FST值越大,種群的分化程度越高,F(xiàn)ST≤0.05時(shí),兩群體幾乎無(wú)分化;0.05<FST≤0.15時(shí),種群中度分化;0.15<FST≤0.25,種群發(fā)生明顯分化;當(dāng)FST>0.25時(shí),種群極度分化。FST越接近0,種群間越相似,越接近于1,分化越顯著。由表5中可以看出,類群D(主要為尤溪地方茶樹(shù)種質(zhì)資源)與類群A、類群B、類群C間的FST值為0.15~0.25,說(shuō)明尤溪地方茶樹(shù)種質(zhì)資源與其它類群發(fā)生明顯分化;類群B與類群C間的FST為0.589,非常接近0.05,說(shuō)明類群B與類群C幾乎無(wú)分化;類群A與類群B、類群C的FST值為0.05~0.15,說(shuō)明類群A(主要為云霄地方茶樹(shù)種質(zhì)資源)與類群B、類群C處于中度分化。
表5 4個(gè)類群之間遺傳分化系數(shù)(對(duì)角線以下)和基因流(對(duì)角線以上)Table 5 Genetic difference (below diagonal line) and gene flow (above diagonal line) among 4 groups
基因流(Nm)則可衡量群體間基因交流的水平。不同地理種群的基因流用Nm值表示,一般當(dāng)Nm>4時(shí),表明種群之間的基因流比較充分;若Nm<1,則表明種群可能由于遺傳漂變而發(fā)生了分化[24]。類群D與類群C的Nm為1.0489,非常接近1,說(shuō)明類群D與類群C間可能由于遺傳漂變而發(fā)生了分化;類群B與類群C的Nm為3.9918,非常接近4,表明類群B與類群C間的基因流比較充分。
不同群體遺傳變異的分子變異分析結(jié)果見(jiàn)表6,不同地理種群間的遺傳分化(Fst)變異較大(Fst=0.207,P<0.001);不同個(gè)體間的遺傳分化(Fit)變異較大(Fit=0.220,P<0.001)。78%遺傳變異主要發(fā)生在個(gè)體間,而群體間的遺傳變異為21%,1%遺傳變異發(fā)生在群體內(nèi)個(gè)體間,說(shuō)明參試材料的遺傳變異主要來(lái)自于不同群體間和個(gè)體間,群體內(nèi)個(gè)體間遺傳分化(Fis)變異較小。
表6 群體內(nèi)和群體間AMOVA分析結(jié)果Table 6 AMOVA for intra-and inter-population variations
本實(shí)驗(yàn)以福建省主要栽培品種為參照對(duì)云霄、尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源進(jìn)行初步鑒定,鑒定結(jié)果顯示,福建主要栽培品種分為2個(gè)類群,分別主要為類群B(烏龍茶類型群)與類群C(綠茶類型群),而云霄、尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源分別形成單一類群,未與參照品種(福建省主栽茶樹(shù)品種)聚類在一起,親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。其中,云霄茶樹(shù)種質(zhì)資源分別與類群B、類群C的遺傳分化的系數(shù)FST值為0.1342、0.1332,處于中度分化;與八仙茶、早春毫(為廣東省鳳凰水仙茶樹(shù)品種的F2代)親緣關(guān)系相對(duì)較近,且王澤涵等[3]鑒定顯示云霄茶樹(shù)種質(zhì)資源中存在子房無(wú)茸毛情況與廣東省鳳凰水仙相似,推測(cè)云霄茶樹(shù)種質(zhì)資源與廣東省鳳凰水仙等類型茶樹(shù)種質(zhì)資源相似。尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源與類群A、類群B與類群C的遺傳分化的系數(shù)FST值均大于0.15,平均值為0.1765,處于明顯分化;與類群B、類群C的Nm分別為1.1049、1.0489,非常接近1,存在遺傳漂變分化,基因交流少。同時(shí),群體間的遺傳變異為21%,且達(dá)到顯著性水平,說(shuō)明云霄、尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源與參照品種的遺傳差異達(dá)到顯著性水平,有必要進(jìn)一步開(kāi)發(fā)其價(jià)值。
茶樹(shù)種質(zhì)資源Shannon多樣性指數(shù)大小是衡量茶樹(shù)種質(zhì)資源遺傳多樣性的重要指標(biāo)之一。38個(gè)湖南黃金茶Shannon多樣性指數(shù)為0.55[25];122個(gè)云南野生茶樹(shù)Shannon多樣性指數(shù)為0.88[26];14份廣西野生茶樹(shù)種質(zhì)資源Shannon多樣性指數(shù)0.97[11];廣東歷史名茶群體種曲江羅坑茶與豐順馬圖茶Shannon多樣性指數(shù)分別為1.22與1.23[27];16個(gè)白化、黃化茶樹(shù)品種Shannon信息指數(shù)0.79[28];云霄茶樹(shù)種質(zhì)資源Shannon多樣性指數(shù)0.95,尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源Shannon多樣性指數(shù)0.86。云霄、尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源遺傳多樣性相對(duì)較高,且云霄茶樹(shù)種質(zhì)資源遺傳多樣性高于尤溪。
基因雜合度是指群體中某個(gè)位點(diǎn)上雜合子的頻率,反映群體的遺傳變異程度,被認(rèn)為是衡量群體遺傳變異的最適參數(shù)[29]。本實(shí)驗(yàn)參試材料的期望雜合度(0.6072)遠(yuǎn)高于觀測(cè)雜合度(0.5231),存在雜合子缺失。其中,類群B與類群C的期望雜合度低于觀測(cè)雜合度,屬于雜合子過(guò)剩,可能部分參照品種(如茗科1號(hào)、金牡丹等)是通過(guò)人工雜交獲得,增加類群B與類群C雜合子數(shù)量;云霄茶樹(shù)種質(zhì)資源的期望雜合度與觀測(cè)雜合度相當(dāng),基因型的分布就越接近于平衡狀態(tài);尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源期望雜合度高于觀測(cè)雜合度,與參試材料一樣存在雜合子缺失。參試材料的雜合子缺失可能由于云霄、尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源與參照品種之間缺少遺傳交流,云霄、尤溪茶樹(shù)種質(zhì)資源開(kāi)發(fā)利用較少,具有當(dāng)?shù)刭Y源的獨(dú)特性。