姜玉秋,唐橋斐,閆智永,張爽
變應(yīng)性鼻炎(allergic rhinitis,AR)是個體受到過敏原刺激后,由IgE 介導(dǎo)的炎性疾病。在過去的十年中,我國鼻炎的發(fā)病率從11%升高至17%[1]。盡管鼻炎不是嚴重的疾病,但卻是多種疾病的并發(fā)癥,嚴重影響人們的生活質(zhì)量和工作效率[2]。長鏈非編碼RNA(LncRNAs)是長度>200 個堿基的不編碼蛋白質(zhì)的RNA。研究表明LncRNA PVT1 參與多種炎性疾病進展[3]。LncRNA PVT1在過敏性哮喘時表達量增高,可通過靶向調(diào)節(jié)下游miRNA的表達加劇哮喘期間的炎癥反應(yīng)并導(dǎo)致細胞屏障損傷,進而加速哮喘進展[4-5],推測其可能與AR 發(fā)展也密切相關(guān)。MicroRNA(miRNA)是一類非編碼的小RNA,其結(jié)合至mRNA 的3'非翻譯區(qū)(3'-UTR)來調(diào)節(jié)基因表達[6]。課題組前期研究已經(jīng)證實,miR-149-5p 在AR小鼠鼻黏膜組織中表達減少,并通過靶向Notch1調(diào)控下游蛋白Foxp3和RORγt表達,影響調(diào)節(jié)性T細胞(Treg)∕輔助性T細胞17(Th17)平衡,從而改善AR小鼠鼻部過敏癥狀[7]。幾丁質(zhì)酶-3 樣蛋白1(CHI3L1)屬于糖苷水解酶18 家族蛋白,與哮喘、關(guān)節(jié)炎、鼻炎等疾病密切相關(guān)[8-11]。在嗜酸性粒細胞型鼻竇炎中CHI3L1 的表達量升高,抗炎分子Clara細胞10 ku 蛋白(CC10)可通過降低CHI3L1 的表達達到抑制炎癥的作用,提示CHI3L1可作為嗜酸性粒細胞型鼻竇炎的新型分子標志[9]。本研究旨在探究LncRNA PVT1 作為內(nèi)源性競爭RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)通過競爭性結(jié)合miR-149-5p而上調(diào)靶基因CHI3L1在AR中的作用。
1.1 材料 5 周齡SPF 級BALB∕c 小鼠24 只,購自遼寧長生生物技術(shù)有限公司[合格證號:SCXK(遼)2020-0001],于18~22 ℃、50%~60%濕度的環(huán)境中飼養(yǎng),自由飲食和飲水,適應(yīng)性喂養(yǎng)1 周后進行后續(xù)實驗。人源性胚胎腎細胞株293T 購自上海中喬新舟生物科技有限公司。蘇木精、SYBR Green(Solarbio,中國),曙紅Y、miRNA 第一鏈cDNA 合成(加尾法)試劑盒(Sangon,中國),TRIpure(BioTeke,中國),BeyoRT ⅡM-MLV 反轉(zhuǎn)錄酶(碧云天,中國),全蛋白提取試劑盒、BCA蛋白濃度測定試劑盒、SDS-PAGE凝膠快速制備試劑盒、ECL發(fā)光液、二抗羊抗兔IgG-HRP均購自中國萬類生物,CHI3L1抗體(Abclonal,中國)、PVDF 膜(Millipore,美國)、脫脂奶粉(伊利,中國),小鼠IgE、白細胞介素(IL)-5、腫瘤壞死因子(TNF)-α 酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA)檢測試劑盒(中國聯(lián)科),熒光素酶檢測試劑盒(凱基,中國),慢病毒載體pLVXshRNA1(豐暉生物,中國),氫氧化鋁、卵白蛋白(OVA)購自阿拉?。ㄖ袊琇ncRNA PVT1 沉默序列、引物由南京金斯瑞生物科技有限公司合成。
1.2 方法
1.2.1 造模及分組 24 只BALB∕c 小鼠,采用隨機數(shù)字表法抽取6只作為對照組(不造模),余18只小鼠建立AR模型,采用隨機數(shù)字表法均分為模型組、空載體對照(AR+NC)組、LncRNA PVT1 沉默(AR+shPVT1)組,每組6 只。模型建立:在實驗開始第1、7、14 天腹腔注射500 μL 含有10 μg OVA和1 mg 氫氧化鋁的PBS 溶液(作為基礎(chǔ)致敏);從第21~27天每天給予建模小鼠鼻飼20μL 含有500μg OVA 的PBS 溶液(激發(fā)致敏)。在實驗第22、24、26 天時,于OVA 激發(fā)前2 h 向AR+NC 組小鼠尾靜脈注射空載體慢病毒(109TU∕mL,100μL∕次)[12],向AR+shPVT1組小鼠尾靜脈注射同等劑量的LncRNA PVT1干擾載體慢病毒,向模型組小鼠尾靜脈注射等體 積 的 PBS 溶 液。 LncRNA PVT1 沉 默 序 列 5'-CCCGGATGAAGAGAAGCTACGAACTTCAAGAGAGTTCGTA GCTTCTCTTCATCCTTTTT-3'。對照組小鼠給予等體積的PBS溶液。
1.2.2 行為學(xué)評分 于末次致敏20 min后,觀察并記錄各組小鼠流涕、鼻癢狀況和打噴嚏次數(shù)。流涕評分標準:流至前鼻孔計1分,超出前鼻孔計2分,涕流滿面計3分。鼻癢評分標準:輕搔鼻1~2次計1分,介于輕搔鼻和劇烈抓撓鼻面不止之間計2 分,劇烈抓撓鼻面不止計3 分。噴嚏評分標準:1~3個計1 分、4~10 個計2 分,11 個以上計3 分,以上3 項指標合計為總分,總分范圍1~9分,超過5分說明造模成功[13]。
1.2.3 HE染色觀察鼻黏膜組織形態(tài) 小鼠鼻黏膜組織采用4%多聚甲醛溶液固定,梯度乙醇脫水,二甲苯透明,石蠟包埋后制作切片,切片脫蠟至水后進行HE染色,切片脫水透明處理后中性樹膠封片;于光學(xué)顯微鏡下觀察鼻黏膜組織結(jié)構(gòu)變化。
1.2.4 實時熒光定量PCR(qPCR)檢測鼻黏膜組織中LncRNA PVT1、miR-149-5p 及CHI3L1 mRNA 表達 于慢病毒注射48 h 后腹腔注射過量的戊巴比妥鈉(150 mg∕kg)處死小鼠。取各組小鼠的鼻黏膜組織,提取總RNA,檢測RNA濃度和質(zhì)量,反轉(zhuǎn)錄為cDNA,采用SYBR Green 染料法進行Real time PCR。反應(yīng)條件:94 ℃5 min;94 ℃10 s,60 ℃20 s,72 ℃10 s,40 個循環(huán)。根據(jù)結(jié)果的Ct 值采用2-ΔΔCt法分別計算LncRNA PVT1、miR-149-5p 及CHI3L1 mRNA 的相對表達量。qPCR引物序列見表1。
Tab.1 Primer sequence for qPCR表1 qPCR引物序列
1.2.5 Western blot檢測鼻黏膜組織中CHI3L1蛋白表達 取鼻黏膜組織,加入RIPA裂解液冰上靜置5 min,4 ℃,12 000 r∕min,離心10 min,抽取上清液。BCA法測定蛋白濃度后進行十二烷基磺酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE),PVDF 膜轉(zhuǎn)印,5%脫脂奶粉封閉1 h,一抗(1∶500)4 ℃孵育過夜,洗膜后加入二抗(1∶5 000),37 ℃孵育45 min,洗膜后均勻撒上ECL化學(xué)發(fā)光液靜置5 min,轉(zhuǎn)入暗盒中,暗室進行曝光。將膠片進行掃描,用凝膠圖像處理系統(tǒng)(Gel-Pro-Analyzer 軟件)分析目標條帶的光密度(OD)值,計算CHI3L1 蛋白的相對表達量。
1.2.6 ELISA 檢測血清中IgE、IL-5、TNF-α 的水平 于慢病毒注射后48 h 取各組小鼠眼眶靜脈血1 mL,分離管分離血清,按照ELISA 試劑盒說明書進行操作,檢測各組小鼠血清中IgE、IL-5、TNF-α的水平,以標準品濃度為縱坐標,校準后的OD值為橫坐標,根據(jù)標準曲線計算出IgE、IL-5、TNF-α的水平。
1.2.7 雙熒光素酶實驗檢測LncRNA PVT1∕miR-149-5p∕CHI3L1 的靶向調(diào)控關(guān)系 根據(jù)文獻[14]及預(yù)測軟件RNAhybrid(https:∕∕bibiserv.cebitec.uni-bielefeld.de∕rnahybrid∕)的結(jié)合位點構(gòu)建LncRNA PVT1 野生型(WT)和突變型(MT)熒光素酶報告載體,分別與miR-149-5p mimic 或NC mimic共轉(zhuǎn)染至293T 細胞。實驗分組如下:LncRNA PVT1-WT+NC mimic 組、LncRNA PVT1-WT+miR-149-5p mimic 組、LncRNA PVT1-MT+NC mimic 組、LncRNA PVT1-MT+miR-149-5p mimic 組。分別構(gòu)建CHI3L1野生型和突變型熒光素酶報告載體,與miR-149-5p mimic共轉(zhuǎn)染至293T細胞,此外在上述共轉(zhuǎn)染細胞組額外增加LncRNA PVT1-WT 或LncRNA PVT1-MT 熒光素酶報告載體共轉(zhuǎn)染細胞。實驗分組如下:miR-149-5p mimic+CHI3L1 3'UTR WT 組、miR-149-5p mimic+CHI3L1 3'UTR MT 組、miR-149-5p mimic+CHI3L1 3'UTR WT+LncRNA PVT1 WT 組、miR-149-5p mimic+CHI3L1 3'UTR WT+LncRNA PVT1 MT 組。上述各組細胞培養(yǎng)48 h 后,收集細胞加入細胞裂解液,按照熒光素酶檢測試劑盒的操作分別加入各檢測試劑,使用酶標儀讀取各組細胞海腎和螢火蟲熒光強度,以海腎熒光值作為內(nèi)參,計算各組細胞熒光素酶活性的比值。
1.3 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS 17.0 統(tǒng)計軟件進行分析,所有檢測實驗在相同條件下獨立重復(fù)3次,符合正態(tài)分布的計量資料以均數(shù)±標準差(±s)表示,2組間比較采用獨立樣本t檢驗,多組間均數(shù)比較采用單因素方差分析,組間多重比較采用Tukey-q檢驗。P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 行為學(xué)評分 18 只造模小鼠均出現(xiàn)不同程度的流涕、鼻癢和打噴嚏,成功建立AR 模型。與對照組相比,模型組小鼠行為學(xué)評分明顯提高(P<0.05);與模型組比較,AR+NC 組行為學(xué)評分的差異無統(tǒng)計學(xué)意義,AR+shPVT1組行為學(xué)評分顯著降低(P<0.05),見圖1。
Fig.1 Comparison of behavioral scores between the four groups圖1 各組小鼠行為學(xué)評分比較
2.2 組織病理學(xué)改變 對照組鼻黏膜組織結(jié)構(gòu)清晰完整,未見炎性細胞浸潤;與對照組相比,模型組鼻黏膜組織厚度變薄,組織結(jié)構(gòu)致密無序,2個表面的柱狀細胞層大部分減少或丟失淺染,有明顯的炎性細胞浸潤;AR+NC 組與模型組類似,表面的柱狀細胞層丟失,細胞排列散亂,組織結(jié)構(gòu)有丟失,伴隨炎性細胞浸潤。與模型組比較,AR+shPVT1組鼻黏膜組織結(jié)構(gòu)分層明顯,柱狀細胞數(shù)量恢復(fù),層次清晰,染色分明,見圖2。
Fig.2 HE staining of mouse nasal mucosa in each group(×200)圖2 各組小鼠鼻黏膜組織HE染色(×200)
2.3 鼻黏膜組織中LncRNA PVT1、miR-149-5p 和CHI3L1表達水平比較 與對照組比較,模型組鼻黏膜組織中LncRNA PVT1 和CHI3L1 mRNA 表達升高,miR-149-5p mRNA 表達下降(P<0.05);與模型組相比,AR+shPVT1 組小鼠鼻黏膜組織LncRNA PVT1 和CHI3L1 mRNA 的表達水平降低,miR-149-5p 的表達升高(P<0.05);AR+NC 組和模型組鼻黏膜 組 織 中LncRNA PVT1、miR-149-5p、CHI3L1 mRNA 的表達差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05);見表2。Western blot結(jié)果表明,與對照組相比,模型組鼻黏膜組織中CHI3L1 蛋白的表達升高(P<0.05);與模型組相比,AR+shPVT1 組小鼠鼻黏膜組織中CHI3L1 蛋白的表達降低,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),見圖3。
Tab.2 Relative mRNA expressions of LncRNA PVT1,miR-149-5p and CHI3L1 in nasal mucosal tissues in each group表2 各組小鼠鼻黏膜組織中LncRNA PVT1、miR-149-5p和CHI3L1 mRNA相對表達情況 (n=3,±s)
Tab.2 Relative mRNA expressions of LncRNA PVT1,miR-149-5p and CHI3L1 in nasal mucosal tissues in each group表2 各組小鼠鼻黏膜組織中LncRNA PVT1、miR-149-5p和CHI3L1 mRNA相對表達情況 (n=3,±s)
**P<0.01;a與對照組比較,b與模型組比較,c與AR+NC 組比較,P<0.05。
組別對照組模型組AR+NC組AR+shPVT1組F LncRNA PVT1 1.00±0.00 3.51±0.59a 3.58±0.63a 0.75±0.14bc 34.470**miR-149-5p 1.00±0.00 0.31±0.06a 0.33±0.06a 0.71±0.16abc 41.684**CHI3L1 1.00±0.00 3.12±0.56a 3.09±0.51a 1.83±0.37bc 18.164**
Fig.3 Expression of CHI3L1 protein in mucosa of mice圖3 小鼠鼻黏膜組織CHI3L1蛋白的表達
2.4 血清中IgE、IL-5、TNF-α 的表達水平 ELISA結(jié)果顯示,與對照組相比,模型組小鼠血清IgE、IL-5、TNF-α 水平顯著升高,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05);AR+shPVT1組與模型組相比,血清IgE、IL-5、TNF-α水平均降低(P<0.05),見表3。
Tab.3 Comparison of serum IgE,IL-5 and TNF-α levels between the four groups of mice表3 各組小鼠血清IgE、IL-5、TNF-α水平比較(n=3,±s)
Tab.3 Comparison of serum IgE,IL-5 and TNF-α levels between the four groups of mice表3 各組小鼠血清IgE、IL-5、TNF-α水平比較(n=3,±s)
**P<0.01;a與對照組比較,b與模型組比較,c與AR+NC 組比較,P<0.05。
組別對照組模型組AR+NC組AR+shPVT1組F IgE(μg∕L)33.77±5.59 111.38±17.30a 105.46±16.30a 51.29±8.66bc 26.882**IL-5(ng∕L)23.35±3.60 102.54±17.37a 96.96±15.66a 44.21±7.03bc 30.090**TNF-α(ng∕L)54.61±9.17 227.49±37.36a 235.78±39.65a 103.26±16.70bc 29.465**
2.5 LncRNA PVT1∕miR-149-5p∕CHI3L1 的靶向調(diào)控關(guān)系 RNAhybrid 數(shù)據(jù)庫顯示LncRNA PVT1 和miR-149-5p 以及miR-149-5p 和CHI3L1 之間存 在互補結(jié)合位點,見圖4。雙熒光素酶實驗結(jié)果顯示,與LncRNA PVT1-WT+NC mimic 組相比,LncRNA PVT1-WT+miR-149-5p mimic組的熒光素酶相對活性降低(P<0.05),證實LncRNA PVT1 與miR-149-5p 存在靶向關(guān)系,見圖5A。miR-149-5p mimic+CHI3L1 3'UTR WT 組和miR-149-5p mimic+CHI3L1 3'UTR MT 組相比,熒光素酶活性顯著降低(P<0.05),表明CHI3L1是miR-149-5p的靶基因。miR-149-5p mimic+CHI3L1 3'UTR WT+LncRNA PVT1-MT 組與miR-149-5p mimic+CHI3L1 3'UTR WT+LncRNA PVT1-WT 組相比,熒光素酶活性顯著降低(P<0.05),證實LncRNA PVT1 通過競爭性結(jié)合miR-149-5p,上調(diào)miR-149-5p 靶基因CHI3L1 的表達,見圖5B。
長期以來,非編碼RNA已被證明在多種人類免疫及炎性疾病中起重要作用,一些非編碼RNA已經(jīng)成為炎癥相關(guān)介質(zhì)的重要轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)劑[15-16]。一項針對鼻炎患者鼻黏膜中LncRNA 表達譜的分析發(fā)現(xiàn),與非過敏對照組相比,鼻炎患者鼻黏膜中存在76個差異表達的LncRNA,結(jié)合GO和通路分析表明這些差異表達的LncRNA 在多個與炎癥有關(guān)的通路中富集[15]。
miRNA 作為小分子非編碼RNA 參與各種細胞的生長、分化及代謝的進展[17-18]。有研究證實,在哮喘、過敏性鼻炎和特應(yīng)性皮炎中存在特定的miRNA表達譜,并且一些miRNA有望成為過敏性疾病的生物標志及治療的主要靶點[19]。本課題前期研究已經(jīng)證明,在鼻炎小鼠模型中,miR-149-5p 可通過抑制其下游靶基因Notch1 的表達影響Treg∕Th17 細胞的免疫平衡,從而改善鼻炎小鼠的鼻部過敏癥狀[7]。Ma等[4]研究發(fā)現(xiàn),過敏性哮喘中LncRNA PVT1的表達量增高,并通過調(diào)節(jié)下游靶向miRNA的表達加劇哮喘期間的炎癥反應(yīng),導(dǎo)致細胞屏障損傷,進而加速哮喘的進展;但LncRNA PVT1在鼻炎中的作用尚未見報道。本課題組前期通過在線生物信息學(xué)網(wǎng)站發(fā)現(xiàn)LncRNA PVT1 與miR-149-5p 存在結(jié)合位點,因此推測LncRNA PVT1可能通過調(diào)節(jié)miR-149-5p而參與調(diào)節(jié)AR 的進展。本研究采用OVA 致敏建立AR小鼠模型,行為學(xué)評分結(jié)果表明模型組小鼠流涕和打噴嚏的次數(shù)明顯增多并伴有劇烈抓撓鼻面的行為,qPCR 檢測發(fā)現(xiàn)LncRNA PVT1 在小鼠鼻黏膜組織中的表達明顯升高,而miR-149-5p則顯著降低,因此本研究推測LncRNA PVT1可能加速鼻炎的發(fā)生。
Fig.4 The binding sites of LncRNA PVT1 with miR-149-5p and the binding sites of miR-149-5p and CHI3L1圖4 LncRNA PVT1和miR-149-5p結(jié)合位點及miR-149-5p和CHI3L1結(jié)合位點
Fig.5 The targeted regulation of LncRNA PVT1∕miR-149-5p∕CHI3L1圖5 LncRNA PVT1∕miR-149-5p∕CHI3L1的靶向調(diào)控關(guān)系
本研究發(fā)現(xiàn),敲低LncRNA PVT1后鼻炎小鼠流涕和打噴嚏的頻率較模型組有所降低,小鼠鼻黏膜炎性反應(yīng)減輕,上皮結(jié)構(gòu)趨于完整。ELISA 檢測結(jié)果表明,LncRNA PVT1 低表達后血清IgE 和炎性細胞因子IL-5、TNF-α 水平降低,表明干預(yù)LncRNA PVT1表達對鼻炎小鼠的炎癥具有一定的緩解作用。ceRNA 是Salmena 等[20-21]于2011 年提出的非編碼RNA(ncRNA)和信使RNA(mRNA)之間的調(diào)節(jié)機制,LncRNA 可通過競爭性結(jié)合miRNA 來減輕miRNA 對靶基因的抑制作用。目前已在多個領(lǐng)域?qū)υ摍C制進行相關(guān)研究,如LncRNA MEG3 作為miRNA“海綿”競爭性結(jié)合miR-17,上調(diào)其靶基因RORγt 的表達,從而影響過敏性哮喘的炎性細胞平衡[22]。有文獻表明,由巨噬細胞、嗜中性粒細胞等細胞分泌的CHI3L1 在組織損傷、炎癥、組織修復(fù)和重塑中起到重要的作用[8];此外,CHI3L1 在哮喘患者的血清和肺組織中表達升高,且CHI3L1的表達水平與鼻炎及哮喘疾病的嚴重程度相關(guān)[9,23]。本研究發(fā)現(xiàn),模型小鼠的鼻黏膜組織中CHI3L1 mRNA及蛋白的表達水平均顯著增加,敲低LncRNA PVT1的表達后CHI3L1 的表達水平明顯降低,并與miR-149-5p呈現(xiàn)相反趨勢。為了深入探究LncRNA PVT1、miR-149-5p 與CHI3L1 之間的相互作用機制,本課題組又通過雙熒光素酶實驗在細胞水平上驗證LncRNA PVT1 可能通過競爭性結(jié)合miR-149-5p 而促進CHI3L1的表達。
本研究發(fā)現(xiàn),在AR 小鼠中高表達的LncRNA PVT1 可通過ceRNA 機制抑制miR-149-5p 的表達,進而導(dǎo)致CHI3L1的表達升高,鼻黏膜組織炎癥反應(yīng)增加,因而在鼻炎中具有潛在的促炎性作用,LncRNA PVT1∕miR-149-5p∕CHI3L1 通 路 也有 望 成為鼻炎治療的新靶點。