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        矮珍珠硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因GeNRT2.1的克隆和功能研究

        2022-03-30 06:50:32黃赳師雙峰張二特李梅于躍劉昱輝
        生物技術(shù)進(jìn)展 2022年2期
        關(guān)鍵詞:水稻植物

        黃赳,師雙峰,張二特,李梅,于躍,劉昱輝

        中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所,北京100081

        氮是葉綠素、核酸和氨基酸的重要組成部分,是植物必需的營(yíng)養(yǎng)元素,通常情況下,施用氮肥會(huì)顯著促進(jìn)植物的生長(zhǎng)和發(fā)育。硝酸鹽是大多數(shù)陸生植物的主要氮源[1],硝酸鹽在土壤中的分布是不均勻的,差異可達(dá)100 倍以上[2]。植物中有兩個(gè)硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)(nitrate transport system,NTS),分別為高親和轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)(high-affinity transport system,HATS)和低親和轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)(low-affinity transport system,LATS)[3-4]。當(dāng)外界硝酸鹽濃度大于1 mmol·L-1時(shí),植物利用LATS 吸收硝酸鹽;當(dāng)外界硝酸鹽濃度低于1 mmol·L-1時(shí),植物利用HATS 系統(tǒng)吸收硝酸鹽[5]。NRT 是植物根系從土壤中吸收并在植物體內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)硝酸鹽的關(guān)鍵蛋白,根據(jù)其作用環(huán)境的不同分為NRT1 蛋白家族和NRT2蛋白家族。大部分的NRT2均屬于HATS 蛋白家族,大部分的NRT1 均屬于LATS 蛋白家族[6]。NRT 蛋白在高等植物中普遍以多基因家族的形式存在,不同的NRT 蛋白表達(dá)部位不同,功能也存在明顯差異,如AtNRT1.2在根表皮細(xì)胞中表達(dá),負(fù)責(zé)從土壤中吸收硝酸鹽[7];AtNRT1.4在葉中表達(dá),與硝酸鹽積累有關(guān)[8];AtNRT1.5在根部表達(dá),主要功能是促進(jìn)硝酸鹽向地上部分運(yùn)輸[9]。

        水稻是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中氮肥使用量最多的作物,氮肥的過(guò)量施用雖然提高了水稻的產(chǎn)量但也引起了嚴(yán)重的環(huán)境污染問(wèn)題[10-11]。已有研究表明,在轉(zhuǎn)基因水稻中組成型表達(dá)OsNRT2.1,可促進(jìn)水稻對(duì)硝酸鹽的吸收和水稻的營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng),但對(duì)水稻的產(chǎn)量無(wú)明顯影響[12],而過(guò)表達(dá)OsNRT2.3b的水稻在中 氮(135 kg·N·hm-2)條件下,產(chǎn)量增加了22.78%[13]。克隆NRT基因,培育過(guò)表達(dá)NRT轉(zhuǎn)基因水稻,在保證水稻產(chǎn)量和品質(zhì)的前提下,減少氮肥施用,將極大減輕對(duì)自然環(huán)境造成的污染和壓力。

        矮珍珠(Glossostigma elatinoides)是透骨草科水生植物,其在美國(guó)甚至被認(rèn)定為外來(lái)入侵物種[14]。矮珍珠根系的生長(zhǎng)環(huán)境與水稻類似,因此矮珍珠根部特異表達(dá)的NRT 蛋白在功能上可能與水稻中的NRT 更接近,但相比水稻,矮珍珠還具有快速生長(zhǎng)的特性,因此從矮珍珠這一新物種中克隆根部特異表達(dá)的NRT基因,對(duì)培育氮高效利用轉(zhuǎn)基因水稻具有重要意義。本研究通過(guò)對(duì)速生水生植物的篩選,發(fā)現(xiàn)矮珍珠具有生長(zhǎng)速度快、耐低氮等特點(diǎn)。本研究從矮珍珠中克隆了GeNRT2.1基因,并對(duì)GeNRT2.1表達(dá)的組織特異性和功能進(jìn)行了初步的研究,旨在通過(guò)對(duì)GeNRTs基因的克隆和研究,豐富NRT基因資源,為培育氮高效利用轉(zhuǎn)基因水稻提供理論依據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1 材料和試劑

        1.1.1 實(shí)驗(yàn)材料 本實(shí)驗(yàn)所用水生植物材料為小水榕(Anubias nana)、金魚藻(Ceratophyllum demersum)、黑藻(Hydrilla verticillata)、矮珍珠(Glossostigma elatinoides)、香菇草(Hydrocotyle vulgaris)、虎耳草(Saxifraga stolonifera)、南美青竹(Tradescantia albiflora)、綠菊(Cabomba caroliniana)、百葉草(Pterylae Pavo Mutici)、草茨藻(Najas graminea)、宮廷草(Rotala rotundifoliavar)、草甸排草(Lysimachia nummularia)、馬來(lái)眼子菜(Potamogeton wrightii)、小對(duì)葉草(Bacopa monnieri)、青蘋果草(Cardamine lyrata)、直立石龍尾(Limnophila erecta)、紅菊(Cabomba piauhyensis)、水蓑衣(Hygrophila ringens)、水芹(Oenanthe javanica)、五色莧(Alternanthera bettzickiana)。野生型多形漢遜酵母(Hansenula polymorpha)菌株WT、Leu-YNT雙突變型多形漢遜酵母突變體Δynr以及酵母穿梭載體pYNR-EX 均由海南大學(xué)江行玉教授惠贈(zèng)。本實(shí)驗(yàn)所用引物均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,引物序列詳見表1。

        1.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑 SMARTer?RACE 5'/3' Kit 購(gòu)自GeneStar 公司;熒光定量qPCR SYBR 試劑和HiScript?ⅡQ RT 反轉(zhuǎn)錄試劑盒購(gòu)自南京諾唯贊生物科技有限公司。

        1.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器 Bio-Rad PTC-200 PCR 儀購(gòu)自上海艾研生物科技有限公司;ABI 7500 Fast 熒光定量PCR 儀購(gòu)自北京北嘉美儀生物科技有限公司,蔡司激光掃描共聚焦顯微鏡LSM700 購(gòu)自北京悠然睿智系統(tǒng)技術(shù)有限公司。

        1.2 實(shí)驗(yàn)方法

        1.2.1 水生植物的篩選和生長(zhǎng)速度檢測(cè) 將河沙淘洗干凈,滅菌后平鋪至塑料托盤底部,厚度約為2 cm,注入自來(lái)水,使水沒過(guò)河沙約0.3 cm。選擇生長(zhǎng)旺盛、健康狀態(tài)良好的20 種水生植物,用鋒利、無(wú)菌的手術(shù)刀片精準(zhǔn)切割0.5 g 健壯莖枝(確保傷口整齊,且切口與莖枝垂直),快速移栽到蛭石中,置于光照培養(yǎng)箱中,16 h 光照/8 h 黑暗,26/20°C,光照強(qiáng)度22 000 Lux,保持濕度100%。每7天測(cè)定1 次濕重,均設(shè)3 次生物學(xué)重復(fù),連續(xù)觀察4周。

        1.2.2 簡(jiǎn)并引物設(shè)計(jì) 從NCBI 上下載不同植物的NRT 蛋白的氨基酸序列并利用DNAMAN 進(jìn)行序列比對(duì),發(fā)現(xiàn)不同植物NRT 的氨基酸序列存在保守區(qū)域,根據(jù)保守區(qū)域設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物,分別是DeF1/DeR1/、DeF2/DeR2 和DeF3/DeR3,通過(guò)檢索GenBank,未發(fā)現(xiàn)矮珍珠NRT的cDNA和氨基酸序列,為了克隆矮珍珠NRT基因,以根為材料,提取RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA,利用簡(jiǎn)并引物DeF1/DeR1進(jìn)行Touch-down PCR擴(kuò)增,引物序列詳見表1。

        1.2.3GeNRT2.1基因的克隆 采用Trizol 法,從矮珍珠的根部提取RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA。利用設(shè)計(jì)的簡(jiǎn)并引物DeF1/DeR1/、DeF2/DeR2、DeF3/DeR3 和TaqDNA 聚合酶,通過(guò)Touch-down PCR技術(shù)從cDNA 中克隆GeNRT基因的CDS。反應(yīng)體系(50 μL)為:10×TaqMix Buffer 5 μL,模板cDNA 1 μL,10 μmol?L-1上、下游引物各1 μL,Taq酶1 μL,2 mmol?L-1dNTP5 μL,ddH2O 36 μL。反應(yīng)條件為:95 ℃5 min;94 ℃30 s,50~60 ℃30 s,72 ℃1 min,共30個(gè)循環(huán)(每個(gè)循環(huán)的退火溫度降低1℃);72 ℃10 min。對(duì)獲得的EST 系列進(jìn)行測(cè)序,根據(jù)EST序列重新設(shè)計(jì)序列特異性引物,進(jìn)行3'RACE 和5'RACE 試驗(yàn),根據(jù)中間序列、3'RACE序列和5'RACE 序列進(jìn)行拼接,獲得完整的基因序列,利用Uniport數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.uniprot.org)對(duì)獲得的基因序列進(jìn)行BLAST比對(duì)和分析。

        1.2.4GeNRT2.1基因表達(dá)的組織特異性分析以生長(zhǎng)狀態(tài)一致的矮珍珠為材料,分別用2.0 mmol?L-1和0.5 mmol?L-1硝酸鈉處理2 h,采用Trizol 法分別提取根、莖和葉的RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA。以反轉(zhuǎn)錄后的cDNA 為模板,以Actin5 和Actin3 為內(nèi)參基因引物,以qGeNRT5 和qGeNRT3為GeNRT2.1的特異性引物,采用RT-PCR 方法對(duì)GeNRT2.1進(jìn)行基因表達(dá)量的分析,檢測(cè)目的基因在矮珍珠不同組織中的表達(dá)。PCR反應(yīng)條件和操作步驟詳見說(shuō)明書。

        1.2.5 GeNRT2.1 的亞細(xì)胞定位 為構(gòu)建用于亞細(xì)胞定位分析的植物表達(dá)載體,設(shè)計(jì)引物NRT-F和NRT-R,以矮珍珠cDNA為模板,PCR 擴(kuò)增GeNRT2.1完整的cDNA序列。PCR產(chǎn)物經(jīng)EcoRⅠ/XbaⅠ雙酶切后,連接到經(jīng)相同酶切處理后的載體pRTL-2-GFP中,構(gòu)建得到以CaMV35S 啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)GeNRT2.1-GFP融合蛋白基因表達(dá)的植物表達(dá)載體p35S::GeNRT2.1-GFP。將其轉(zhuǎn)入擬南芥原生質(zhì)體中[15]。轉(zhuǎn)化后的原生質(zhì)體,25 ℃避光誘導(dǎo)18 h 后,用激光共聚焦顯微鏡觀察GFP 熒光在擬南芥原生質(zhì)體中的分布,確定GeNRT2.1 的亞細(xì)胞定位。

        1.2.6 酵母穿梭表達(dá)載體的構(gòu)建 以p35S::GeNRT2.1-GFP為模板,利用引物GeNRT5 和GeNRT3(表1),PCR 擴(kuò)增GeNRT2.1基因,PCR 反應(yīng)體系同1.2.3,反應(yīng)條件:95 ℃5 min;95 ℃30 s,62 ℃30 s,72 ℃1 min,共30 個(gè)循環(huán);72 ℃10 min。經(jīng)SalⅠ/SpeⅠ雙酶切連接到載體pYNR-EX上,獲得以酵母YNR啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)GeNRT2.1表達(dá)的酵母穿梭表達(dá)載體pYNR::GeNRT2.1。

        1.2.7 基因功能互補(bǔ)試驗(yàn) 分別將pYNR-EX和pYNR::GeNRT2.1用電擊法轉(zhuǎn)入雙突變型多形漢遜酵母Δynt的感受態(tài)細(xì)胞中,將菌液涂布于含100 mg?L-1氨芐霉素的YNGH(0.17%無(wú)氨基酸無(wú)硫酸的酵母氮源基礎(chǔ),2%葡萄糖,5 mmol?L-1NH4Cl)平板上,37 ℃培養(yǎng)3~4 d,挑取單菌落,以qGeNRT5 和qGeNRT3(表1)為引物,用PCR 擴(kuò)增篩選獲得酵母陽(yáng)性克隆,PCR 反應(yīng)體系和反應(yīng)條件同1.2.4。

        表1 本研究所用PCR引物Table 1 PCR primers used in this study

        1.2.8pYNR::GeNRT2.1酵母吸收硝酸鹽的速率測(cè)定 利用紫外分光光度法測(cè)定培養(yǎng)基中的硝酸鹽濃度,將YNR::GeNRT2.1酵母在YGNH 培養(yǎng)基中培養(yǎng)至過(guò)飽和,離心取菌體,加入YG 培養(yǎng)基,37 ℃氮饑餓處理90 min,離心,棄上清,重懸菌體浮于含有不同濃度NaNO3(50、100、250、500、1 000、1 500 μmol?L-1)的YG 培養(yǎng)基中,使酵母濃度達(dá)到10 mg?mL-1,37 ℃培養(yǎng)150 min。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 速生水生植物的篩選和鑒定

        氮素的利用與植物生長(zhǎng)速度密切相關(guān),為獲得可以在低氮條件下快速生長(zhǎng)的植物材料,本研究首先對(duì)20 種水生植物進(jìn)行了篩選和鑒定,結(jié)果發(fā)現(xiàn),大部分植物在6~10 d 后長(zhǎng)出新葉。生物量在前2 周增長(zhǎng)最快,第3 周增速變緩,第4 周又快速增加,其中矮珍珠具有非常強(qiáng)的生存能力,可以在純凈水中長(zhǎng)期存活,且無(wú)需向水中添加營(yíng)養(yǎng)液,此外,矮珍珠的生長(zhǎng)速度也較快,可以在2 d 內(nèi)長(zhǎng)出一對(duì)完整葉片。由表2 可知,所有植物中28 d內(nèi)鮮重增加最多的是小水榕、黑藻、金魚藻和矮珍珠,濕重分別增加402.00%、376.00%、362.00%和372.00%。

        表2 水生植物的鮮重情況檢測(cè)Table 2 Detection of fresh weight of aquatic plants

        2.2 矮珍珠硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白編碼基因GeNRT2.1的克隆

        利用簡(jiǎn)并引物DeF1/DeR1 進(jìn)行Touch-down PCR 擴(kuò)增,得到1 條大小為663 bp 的EST 序列(圖1),在Uniport 數(shù)據(jù)庫(kù)上對(duì)EST 的序列進(jìn)行BLAST 比對(duì)發(fā)現(xiàn),其與多個(gè)物種的高親和NRT2具有同源性,同源性為70%~80%。根據(jù)該EST 的序列,設(shè)計(jì)3'RACE 和5'RACE 的基因特異性引物H3outer/H3inner 和H5outer/H5inner(表1),通 過(guò)RACE 技術(shù),分別獲得797 bp 的3'序列和992 bp的5'序列(圖1)。將EST 序列、5'-RACE 序列和3'-RACE 序列進(jìn)行拼接,并在GenBank 上進(jìn)行序列BLAST 檢索和分析發(fā)現(xiàn),獲得的cDNA 序列的全長(zhǎng)為2 078 bp,包含228 bp 的5'非翻譯區(qū)、254 bp 的3'非翻譯區(qū)以及1 596 bp 的開放閱讀框,該序列可能編碼一個(gè)由530 個(gè)氨基酸組成的NRT2蛋白。在GenBank上檢索NRT2發(fā)現(xiàn),目前已注冊(cè)的NRT2有51個(gè),其中植物38個(gè),藻類5個(gè),地衣4個(gè),細(xì)菌3 個(gè),真菌1 個(gè),利用MAGE6 進(jìn)行進(jìn)化樹分析,結(jié)果表明該序列與煙草NRT2.1的序列相似度較高(圖2),推測(cè)本研究已成功從矮珍珠中克隆得到NRT2基因,將其命名為GeNRT2.1,并在Genbank上進(jìn)行了注冊(cè)(登錄號(hào):KX230796.1)。

        圖1 GeNRT2.1基因的克隆Fig.1 Cloning of GeNRT2.1 gene

        圖2 GeNRT2.1的進(jìn)化樹分析Fig.2 Evolutionary tree analysis of GeNRT2.1

        2.3 矮珍珠GeNRT2.1的生物信息學(xué)分析

        NRT2 蛋白多數(shù)由500 多個(gè)氨基酸組成,通過(guò)中間的親水環(huán)將12 個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域等分為兩組[16],C 端和N 端以及親水環(huán)均位于胞質(zhì)一側(cè)[17]。使用TMHMM-2.0 對(duì)GeNRT2.1 進(jìn)行蛋白質(zhì)的跨膜螺旋預(yù)測(cè),結(jié)果顯示GeNRT2.1 具有親水的N 端和C 末端,中間一個(gè)較長(zhǎng)的親水環(huán)將中部12 個(gè)疏水的跨膜結(jié)構(gòu)域分隔成兩組各6 個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域(圖3A)。通過(guò)SOPMA 對(duì)GeNRT2.1 的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果顯示GeNRT2.1 由170 個(gè)α 螺旋、130 個(gè)延伸鏈,59 個(gè)β 折疊和171 個(gè)自由卷曲組成(圖3B)。對(duì)GeNRT2.1 的氨基酸序列進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),12個(gè)疏水區(qū)對(duì)應(yīng)的氨基酸序列位置分別為67~87、102~118、131~151、159~179、192~211、224~243、281~301、316~336、352~372、381~401、410~430 和441~461(圖3C)。GeNRT2.1 中間的親水區(qū)(244~280,37 個(gè)氨基酸)將GeNRT2.1 的12 個(gè)疏水結(jié)構(gòu)域分為兩組,每組6 個(gè),這與NRT2 家族成員的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)特征完全符合。此外,在GeNRT2.1 的2 跨膜區(qū)與3 跨膜區(qū)之間還存在1 個(gè)GAVCDLLGPR序列,由于基元序列(G-x-x-x-D-x-x-G-x-R)是NRT蛋白所特有的序列,在MFS 超家族成員中高度保守,說(shuō)明克隆得到的GeNRT2.1可能是硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白編碼基因。

        圖3 GeNRT2.1的氨基酸序列和結(jié)構(gòu)分析Fig.3 Amino acid sequence and structure analysis of GeNRT2.1

        2.4 GeNRT2.1在矮珍珠中的表達(dá)特性分析

        為研究GeNRT2.1對(duì)硝酸鹽的響應(yīng)以及在矮珍珠中表達(dá)的組織特異性,分別將矮珍珠放置于含有2.0 mmol?L-1硝酸鈉和0.5 mmol?L-1硝酸鈉的水溶液中處理,觀察根、莖、葉中GeNRT2.1的表達(dá)情況。qRT-PCR 分析發(fā)現(xiàn),2.0 mmol?L-1和0.5 mmol?L-1硝酸鹽處理的矮珍珠,GeNRT2.1在根中的表達(dá)量均最高,其次是葉和莖,此外,0.5 mmol?L-1硝酸鹽處理的矮珍珠根、葉、莖中GeNRT2.1的表達(dá)量分別為2.0 mmol?L-1硝酸鹽處理對(duì)應(yīng)樣本中GeNRT2.1表達(dá)量的1.89、1.93 和2.07倍(圖4)。以上結(jié)果說(shuō)明GeNRT2.1編碼蛋白為高親和硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,主要在根中表達(dá)并發(fā)揮相關(guān)功能。

        圖4 GeNRT2.1在矮珍珠中表達(dá)的組織特異性Fig.4 Tissue specific expression of GeNRT2.1 in Glossostigma elatinoides

        2.5 GeNRT2.1的亞細(xì)胞定位

        植物從土壤中吸收硝酸鹽,需要位于膜上的硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白參與[18]。最早發(fā)現(xiàn)的擬南芥At-NRT1.1 就是定位于細(xì)胞膜上的,屬于質(zhì)子依賴的硝酸鹽共轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)[19]。為研究GeNRT2.1 的亞細(xì)胞定位,利用pRTL-2載體構(gòu)建了以35S 啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)GeNRT2.1-GFP 融合蛋白表達(dá)載體p35S::GeNRT2.1-GFP,將其轉(zhuǎn)化入新鮮制備的擬南芥原生質(zhì)體中,孵育18 h 后用激光共聚焦顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn)GeNRT2.1-GFP 融合蛋白定位于原生質(zhì)體的細(xì)胞膜上(圖5)。

        圖5 GeNRT2.1在擬南芥原生質(zhì)體中的亞細(xì)胞定位Fig.5 Subcellular localization of the GeNRT2.1 in Arabidopsis thaliana protoplasts

        2.6 GeNRT2.1對(duì)YNT基因缺陷型酵母的影響

        將4 種 酵 母(Δynt、WT、ΔYNR-EX和YNR::GeNRT2.1)分別接種于含有0.5 mmol?L-1硝酸鹽的YGNH 培養(yǎng)基中,37 ℃培養(yǎng)24 h,取菌液,用分光光度計(jì)測(cè)定OD600值,分別為0.05±0.03、1.48±0.05、0.05±0.03、1.31±0.04(圖6)?;蛉毕菪徒湍甫nt由于不能吸收硝酸鹽,因此不能正常生長(zhǎng),但GeNRT2.1能使缺陷型酵母Δynt恢復(fù)生長(zhǎng),表明GeNRT2.1在功能上能夠與酵母內(nèi)源的NRT互補(bǔ),具有硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的功能。

        圖6 GeNRT2.1對(duì)基因缺陷型酵母Δynt生長(zhǎng)的影響Fig.6 The effect of GeNRT2.1 on the growth of gene-deficient yeast Δynt

        每30分鐘用分光光度計(jì)測(cè)定A220和A275的值,并計(jì)算出酵母對(duì)硝酸鹽的吸收速率,繪制酵母吸收速率曲線(圖7)。按照Km值等于最大吸收速率50%時(shí)硝酸鹽濃度計(jì)算,GeNRT2.1的Km值為140 μmol?L-1。已知高親和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的Km<1 000 μmol?L-1,低親和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的Km>1 000 μmol?L-1,說(shuō)明GeNRT2.1編碼高親和硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白。

        圖7 GeNRT2.1吸收硝酸鹽的速率Fig.7 Rate of nitrate absorption by GeNRT2.1

        3 討論

        硝酸鹽是植物從土壤中吸收氮素營(yíng)養(yǎng)的主要形式,而硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白NRT 是該過(guò)程的執(zhí)行者和主要限制因子,此外NRT 蛋白也在硝酸鹽從根到地上部的運(yùn)輸過(guò)程起關(guān)鍵作用,表明NRT 蛋白能否發(fā)揮作用與作物的形態(tài)建成、干物質(zhì)積累和產(chǎn)量形成直接相關(guān)。不同物種來(lái)源的NRT 蛋白,在幫助植物吸收硝酸鹽的能力上存在明顯差異。有報(bào)道表明,硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白可以有效提高受體植物的生物量,但不能有效提高作物的產(chǎn)量[20]。但范曉榮等[13]報(bào)道,在田間試驗(yàn)中,增加OsNRT2.3b的表達(dá)可使籽粒產(chǎn)量和氮肥利用效率提高40%。說(shuō)明硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白是利用遺傳改良技術(shù)提高作物氮素利用效率的關(guān)鍵蛋白,同時(shí)說(shuō)明不同來(lái)源的硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白對(duì)植物的產(chǎn)量具有不同的作用。

        本研究結(jié)果表明,28 d內(nèi),矮珍珠鮮重由0.5 g增加到2.31 g,增加了3.62倍,是20種供試植物中鮮重增加速度比較快的植物,其鮮重增加速度僅次于小水榕、黑藻和金魚藻,推測(cè)其快速生長(zhǎng)的能力可能與其能夠更好地利用水中的氮素有關(guān)。此外,矮珍珠根系的生長(zhǎng)環(huán)境與水稻類似,矮珍珠根部特異表達(dá)的硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在功能上可能與水稻更接近。GenBank檢索未發(fā)現(xiàn)矮珍珠NRT基因及其氨基酸序列,本研究通過(guò)對(duì)不同物種中NRT蛋白保守區(qū)進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),該基因編碼530 個(gè)氨基酸,具有親水的N 端和C 末端,中部12 個(gè)疏水的跨膜結(jié)構(gòu)域,由中間一個(gè)大的親水環(huán)分隔成兩組各6個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域,這與NRT2家族成員的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)特征完全符合。進(jìn)化樹分析發(fā)現(xiàn),GeNRT2.1與煙草NRT2.1 的序列相似度最高,該蛋白屬于NRT2蛋白家族。

        植物通過(guò)位于細(xì)胞膜上的硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白從土壤中吸收硝酸鹽。DsNRT3.1 主要定位于擬南芥根毛細(xì)胞的質(zhì)膜上[21]。本實(shí)驗(yàn)進(jìn)行的GeNRT2.1亞細(xì)胞定位研究結(jié)果表明GeNRT2.1定位于細(xì)胞膜上,這一結(jié)果符合離子轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白大部分是膜蛋白的特征。此外,研究發(fā)現(xiàn)擬南芥根系對(duì)硝酸鹽攝取的調(diào)控主要依賴于NRT2.1/NAR2.1的協(xié)同作用[22],但GeNRT2.1 是否需要與NAR2.1存在協(xié)同作用尚需實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。

        將GeNRT2.1轉(zhuǎn)入YNT基因缺失的缺陷型酵母Δynt中進(jìn)行功能互補(bǔ)試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),表達(dá)GeNRT2.1的Δynt酵母無(wú)論在低濃度硝酸鹽還是在高濃度硝酸鹽條件下均能正常生長(zhǎng)和繁殖,其生長(zhǎng)情況與WT 酵母一致,表明GeNRT2.1在功能上能夠與酵母內(nèi)源NRT互補(bǔ),具有硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的功能。繪制GeNRT2.1轉(zhuǎn)基因酵母對(duì)硝酸鹽的吸收曲線并測(cè)定Km值發(fā)現(xiàn),GeNRT2.1屬于高親和硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族,該結(jié)果與GeNRT2.1序列同源性比對(duì)結(jié)果和GeNRT2.1 二級(jí)結(jié)構(gòu)分析結(jié)果具有一致性。雖然缺陷型酵母表達(dá)系統(tǒng)提供了一種便捷有效的鑒定目的基因功能的系統(tǒng),可以幫助人們快速獲得更加有效的NRT基因,但在自然環(huán)境下,植物易受到天氣、土壤耕作條件、田間管理措施等的干擾和影響,因此,缺陷型酵母表達(dá)系統(tǒng)測(cè)定的Km值與實(shí)際情況存在差異。

        不同的NRT 根據(jù)其功能的不同表達(dá)部位存在差異。如AtNRT1.3 在花、葉、莖中的表達(dá)均較高[23],OsNRT1.1B主要在水稻根中表達(dá)[24]。本研究中,GeNRT2.1在根中的表達(dá)量最高,其次是葉,在莖中的表達(dá)量最低。此外,0.5 mmol·L-1硝酸鹽處理后,GeNRT2.1在根、葉、莖中的表達(dá)量分別是2.0 mmol·L-1硝酸鹽處理后的1.89、1.93 和2.07倍,說(shuō)明GeNRT2.1 編碼蛋白主要在根中表達(dá)并行使功能。

        綜上所述,從矮珍珠中克隆NRT 蛋白編碼基因,利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)轉(zhuǎn)化水稻,可培育GeNRT2.1轉(zhuǎn)基因水稻,對(duì)豐富NRT基因資源,培育氮肥高效利用轉(zhuǎn)基因水稻具有重要意義。本課題組已獲得15 株轉(zhuǎn)GeNRT2.1水稻,今后將對(duì)其農(nóng)藝性狀及生理性狀開展進(jìn)一步研究,探究如何獲得氮營(yíng)養(yǎng)高效的遺傳改良作物。

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