張文華,但漢東,李曉麗,黃子旭,宋宗明
回旋狀脈絡(luò)膜視網(wǎng)膜萎縮(gyrate atrophy of choroid and retina,GA)是一種罕見的常染色體隱性遺傳性疾病,是由于編碼線粒體酶鳥氨酸轉(zhuǎn)氨酶(ornithine aminotransferase,OAT)的OAT基因(OMIM 258870)突變引起的,該酶是精氨酸和鳥氨酸轉(zhuǎn)化為主要的興奮性和抑制性神經(jīng)遞質(zhì)谷氨酸和γ-氨基丁酸的關(guān)鍵酶。流行病學(xué)研究顯示,GA的全球發(fā)病率約為1/1500000[1],其主要的眼部癥狀和體征包括夜盲、高度近視、早期白內(nèi)障形成以及脈絡(luò)膜視網(wǎng)膜環(huán)形萎縮、黃斑病變等,萎縮性病變具有扇形或花環(huán)狀邊界,因此稱為“回旋狀”[2]。
OAT基因定位在常染色體10q26.13,全長22kb[3-4]。30多年前,第一次在GA患者中發(fā)現(xiàn)了OAT突變[5],OAT基因在脈絡(luò)膜視網(wǎng)膜中高度表達(dá),尤其在視網(wǎng)膜色素上皮層活性最高[6-7]。HGMD(Human Gene Mutation Database)數(shù)據(jù)庫顯示該基因存在68種不同的致病性突變,突變基因位點(diǎn)分布在整個基因序列中,沒有明顯的突變熱點(diǎn),大部分突變類型為錯義突變,其次是無義突變和移碼變異,還有剪接變體和一種影響ATG起始密碼子的突變[1]。雖然目前已明確多種變異類型,但仍有很多致病性突變尚未發(fā)現(xiàn)。本研究采用全外顯子組測序檢測一個中國GA家系兩代人(共6名家庭成員)的致病突變,通過對每名家庭成員進(jìn)行常規(guī)眼科檢查及全外顯子組測序分析來探究與該家系GA相關(guān)的致病性變異及分子學(xué)病因。
1.1對象回顧性分析2019-06/2021-08于我院治療的GA患者的臨床資料。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)明確診斷為GA,全外顯子組測序分析顯示存在OAT基因新型致病性變異;(2)參與本研究的親屬與確診患者存在血緣關(guān)系、能夠配合所有檢查。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)合并其他眼部疾病的患者;(2)接受過內(nèi)眼手術(shù)、受過眼部外傷的患者。所有患者均就診于河南省立眼科醫(yī)院,本研究經(jīng)醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會審查通過,研究內(nèi)容符合《赫爾辛基宣言》的宗旨,所有參與者或其監(jiān)護(hù)人均已簽署知情同意書。
1.2方法
1.2.1臨床檢查對先證者及其相關(guān)的家庭成員采集詳盡的家族史及臨床數(shù)據(jù),進(jìn)行最佳矯正視力、眼壓、裂隙燈顯微鏡和檢眼鏡、彩色眼底照相以及頻域光學(xué)相干層析成像(SD-OCT)等眼科檢查,并通過氣相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀測定外周血液中鳥氨酸的濃度。
1.2.2全外顯子組測序和生物信息學(xué)分析抽取該家系中6名家庭成員的外周血樣本,每個血液樣本約5mL,采用QIAamp DNA Blood Mini Kit(51106)從全血中提取DNA,通過Qubit及瓊脂糖凝膠電泳測定提取的DNA樣本含量及質(zhì)量。應(yīng)用Roche SeqCap EZ MedExome Kit進(jìn)行目標(biāo)區(qū)域捕獲,使用Illumina Hiseq X-ten二代測序儀對富集的文庫進(jìn)行PE150測序,平均測序深度為100X,測序后得到FASTQ格式的原始數(shù)據(jù),再進(jìn)行生物信息學(xué)分析,在二代測序檢測出的突變位點(diǎn)中進(jìn)行Sanger驗(yàn)證排除假陽性。
1.2.3Sanger驗(yàn)證和共分離分析根據(jù)變異位點(diǎn)信息在UCSC(http://genome.ucsc.edu/)在線工具上查找對應(yīng)的基因組序列,利用Prime Primer 5軟件設(shè)計引物。引物在PCR過程中用于擴(kuò)增樣本中包含變異位點(diǎn)的基因片段。將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,觀察條帶并判斷產(chǎn)物的大小與擴(kuò)增情況。利用Axygen的AxyPrep PCR Clean up Kit(AP-PCR-250)對PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化,通過Qubit對回收的PCR產(chǎn)物進(jìn)行定量后再進(jìn)行第二輪PCR,即Sanger PCR。然后利用BigDye XTerminatorTMPurification Kit(4376486)對產(chǎn)物進(jìn)行純化,利用ABI的Applied Biosystems?3730xl DNA Analyzer進(jìn)行測序,最后在Sanger測序峰圖上找出需要測序的位點(diǎn),并判斷是否有變異。
2.1臨床表現(xiàn)該家系中共6名家庭成員參與研究。先證者(Ⅲ:3)為6歲女童,因自幼視力差,近1a來視力明顯下降伴夜盲就診。既往無特殊病史。否認(rèn)父母近親結(jié)婚史及家族性遺傳學(xué)疾病史。患者發(fā)育正常,神經(jīng)系統(tǒng)未見異常。最佳矯正視力:右眼-5.75DS/-2.75DC*180=0.4;左眼-5.50DS/-3.25DC*5=0.25。眼壓:右眼14.7mmHg;左眼16.2mmHg。裂隙燈顯微鏡檢查雙眼前節(jié)未見異常,玻璃體輕度混濁;眼底檢查可見周邊部視網(wǎng)膜色素上皮細(xì)胞和脈絡(luò)膜毛細(xì)血管萎縮,視網(wǎng)膜脈絡(luò)膜萎縮呈鋪路石樣改變,病灶邊界清楚,形態(tài)不規(guī)則,萎縮病灶之間的視網(wǎng)膜正常(圖1)。SD-OCT檢查雙眼可見視網(wǎng)膜神經(jīng)上皮囊樣改變,視網(wǎng)膜劈裂且劈裂累及黃斑,右眼和左眼中心凹厚度分別為439、483μm(圖2)。外周血鳥氨酸濃度為360.57μmol/L(參考范圍41~290μmol/L[8])。先證者的叔叔(Ⅱ:1)、父親(Ⅱ:2)、母親(Ⅱ:3)、哥哥(Ⅲ:1)、姐姐(Ⅲ:2)均無任何異常癥狀或體征。先證者因其臨床表現(xiàn)與體征被診斷為GA。
圖1 先證者眼底照相結(jié)果 可見雙眼周邊部視網(wǎng)膜呈鋪路石樣改變,視網(wǎng)膜、脈絡(luò)膜萎縮,部分萎縮病灶相互融合成片,邊緣呈花瓣狀,黃斑區(qū)可見劈裂。A:右眼;B:左眼。
圖2 先證者SD-OCT檢查結(jié)果 雙眼可見神經(jīng)上皮囊樣改變,視網(wǎng)膜劈裂且劈裂累及黃斑,右眼和左眼中心凹厚度分別為439、483μm。A:右眼;B:左眼。
2.2全外顯子組測序結(jié)果全外顯子組測序結(jié)果顯示,先證者的OAT基因存在復(fù)合雜合型突變,在第6外顯子和第10外顯子上分別發(fā)現(xiàn)錯義突變c.722C>T(p.P241L)和無義突變c.1186C>T(p.R396X)。該錯義突變導(dǎo)致所編碼的氨基酸由脯氨酸變?yōu)榱涟彼?。該無義突變使1個編碼氨基酸的密碼子變?yōu)榻K止密碼子,提前終止多肽鏈的合成,導(dǎo)致截短蛋白的產(chǎn)生,從而引起OAT基因表達(dá)異常?;颊叩母赣H(Ⅱ:2)和哥哥(Ⅲ:1)均檢出雜合型p.R396X致病變異,患者的母親(Ⅱ:3)檢出雜合型p.P241L致病變異,其他樣本未檢出。根據(jù)美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)學(xué)會(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)變異分類標(biāo)準(zhǔn),p.R396X為致病變異,p.P241L為可能致病變異(表1)。
表1 高度影響患者表型的變異
2.3Sanger驗(yàn)證與共分離分析Sanger驗(yàn)證結(jié)果顯示,先證者在變異位點(diǎn)OATc.1186C>T出現(xiàn)的變異類型與其父親及哥哥一致,在變異位點(diǎn)OATc.722C>T出現(xiàn)的變異類型與其母親一致。該家系的Sanger驗(yàn)證結(jié)果見圖3,遺傳圖譜見圖4。通過多種算法預(yù)測,在變異位點(diǎn)OATc.722C>T出現(xiàn)的p.P241L錯義變異類型是有害的。這兩種變異在多人口種族數(shù)據(jù)庫中的可匹配人群不多見,除上述變異類型外,不存在可能對患者表型有影響的變異,以及與患者部分臨床表型相關(guān)的其它變異。
圖3 Sanger驗(yàn)證基因測序圖譜 A:Sanger驗(yàn)證對6名家庭成員在突變位點(diǎn)OAT c.1186C>T的基因測序圖譜顯示先證者(Ⅲ:3)與其父親(Ⅱ:2)、哥哥(Ⅲ:1)均檢出雜合型p.R396X致病變異,這種突變類型因堿基G突變?yōu)閴A基A引起。紅色:先證者的突變堿基;黃色:先證者父親和哥哥的突變堿基。B:Sanger驗(yàn)證對6名家庭成員在突變位點(diǎn)OAT c.722C>T的基因測序圖譜顯示先證者(Ⅲ:3)和其母親(Ⅱ:3)檢出雜合型p.P241L致病變異,這種突變類型因堿基G突變?yōu)閴A基A引起。紅色:先證者的突變堿基;黃色:先證者母親的突變堿基。
圖4 OAT基因突變家系的遺傳圖譜 先證者為復(fù)合雜合性突變,該突變類型在家系中呈完全共分離狀態(tài)。圓圈:未受影響的女性;方框:未受影響的男性;單斜線符號:未納入本研究的家庭成員;多斜線符號:檢出雜合型的參與者;黑色實(shí)心圓圈:先證者。
本研究納入的家系成員中,先證者OAT基因的第6外顯子和第10外顯子上分別發(fā)現(xiàn)錯義突變c.722C>T(p.P241L)和無義突變c.1186C>T(p.R396X),這是一種復(fù)合雜合型變異,前者為首次報道的變異類型,來源于其母親,后者來源于其父親,除先證者以外,其余家庭成員均無異常表現(xiàn)。先證者存在接近-6.00D的近視和2.00D以上的散光,以視力下降和夜盲為主要癥狀,晶狀體目前未見異常,眼底表現(xiàn)出典型的回旋狀視網(wǎng)膜脈絡(luò)膜萎縮灶,暫無其他系統(tǒng)的特殊表現(xiàn)。但因先證者年齡小,暫時無法有效配合視野檢查,我們會在隨訪過程中補(bǔ)充。本研究通過全外顯子組測序技術(shù)、生物信息學(xué)分析、Sanger驗(yàn)證及共分離分析,明確了導(dǎo)致GA的基因突變位點(diǎn)及家系遺傳方式。
典型的GA本質(zhì)上是一種眼科疾病,首先會累及周邊部視網(wǎng)膜色素上皮,隨后由周邊部向后極部進(jìn)行性發(fā)展同時伴發(fā)漸進(jìn)性視野縮小,最終導(dǎo)致全脈絡(luò)膜視網(wǎng)膜病變[9]。早期表現(xiàn)為夜盲,青少年時期出現(xiàn)后囊下白內(nèi)障,最遲在60歲時導(dǎo)致失明[10]。眼底照相能夠直觀反映病灶形態(tài)。結(jié)合眼底熒光素血管造影(FFA)有助于GA的早期診斷,F(xiàn)FA所顯示的病變范圍可以超出眼底檢查所見的范圍,有利于發(fā)現(xiàn)位于赤道部小范圍的早期淡黃色病灶[11]。此外,視野檢查也有助于判斷疾病進(jìn)展的情況,早期視野可無明顯改變,后期逐漸出現(xiàn)進(jìn)行性向心性視野縮小,形成管狀視野[12]。也有研究報道了發(fā)生于骨骼肌、中樞及周圍神經(jīng)系統(tǒng)的眼外表現(xiàn),然而,在多數(shù)情況下,這些系統(tǒng)的表現(xiàn)是亞臨床的[13]。無脈絡(luò)膜癥(choroideremia,CHM)與GA有類似的臨床表現(xiàn),CHM是由于X染色體長臂上的CHM基因缺失或突變導(dǎo)致的,其男性患者發(fā)病較早,通常癥狀從早期的夜盲癥逐漸發(fā)展為周邊視野缺失,到晚年僅存中心管狀視野,最終失明;而女性患者一般為攜帶者,無臨床癥狀[14]。眼底典型表現(xiàn)為早期視網(wǎng)膜色素上皮細(xì)胞變性,眼底呈椒鹽狀,中期病變逐漸從周邊視網(wǎng)膜向后極部發(fā)展,晚期眼底色素上皮幾乎完全被破壞,脈絡(luò)膜血管消失并萎縮,鞏膜外露,僅殘留黃斑區(qū)一小塊邊界清楚的脈絡(luò)膜[15]。
OAT能將精氨酸和鳥氨酸轉(zhuǎn)化為主要的興奮性和抑制性神經(jīng)遞質(zhì)谷氨酸和γ-氨基丁酸,是該途徑中的關(guān)鍵酶。缺乏這種酶會導(dǎo)致血漿和組織中的鳥氨酸水平升高,進(jìn)而對視網(wǎng)膜產(chǎn)生毒性作用[8]。有研究者認(rèn)為二氫吡咯羧化物(P5C)缺乏或肌酸缺乏對視網(wǎng)膜功能的拮抗作用是重要的致病因素[16]。P5C是鳥氨酸與脯氨酸之間的中間產(chǎn)物,由OAT和P5C合酶合成。生理濃度鳥氨酸對P5C合酶有抑制作用,OAT缺乏會導(dǎo)致鳥氨酸堆積及P5C生成減少。因此,在GA患者中,形成P5C的兩條通路均出現(xiàn)障礙,從而導(dǎo)致脯氨酸合成減少或P5C調(diào)節(jié)作用受損,視網(wǎng)膜細(xì)胞內(nèi)因脯氨酸缺乏而引起眼病[17-18]。此外,精氨酸在甘氨酸轉(zhuǎn)氨酶作用下合成肌酸,但鳥氨酸是甘氨酸轉(zhuǎn)氨酶的強(qiáng)競爭性抑制劑,所以GA患者也會出現(xiàn)肌酸代謝異常進(jìn)而出現(xiàn)相應(yīng)的肌肉病變,如Ⅱ型肌纖維萎縮和肌無力[19]。GA患者血清、尿液、腦脊液、房水中的鳥氨酸濃度可以為正常人的10~20倍[20],通過限制精氨酸的攝入可以限制鳥氨酸的來源,補(bǔ)充維生素B6也是可選擇的治療方法,部分患者經(jīng)過治療可將血清鳥氨酸濃度降低到正常水平,從而減緩病情惡化及視力喪失的進(jìn)度[21]。也有部分患者僅存在GA眼底表現(xiàn),但沒有血液鳥氨酸濃度的升高[22]。本研究中先證者外周血鳥氨酸濃度為360.57μmol/L,高于正常值范圍,目前正通過飲食控制精氨酸的攝入,需定期隨訪。
遺傳性眼病不同變異類型的臨床表現(xiàn)不盡相同,明確基因型和臨床表型之間的關(guān)系有利于輔助基因治療的研究[23]。王曉光等[4]在OAT基因第4外顯子和第10外顯子上發(fā)現(xiàn)雙等位基因突變c.461G>A(p.R154H)和c.1186C>T(p.R396X),該患者除GA眼底表現(xiàn)外,存在綠色和藍(lán)色色盲,雙眼視野向心性縮小,視網(wǎng)膜電圖示視桿細(xì)胞和視錐細(xì)胞的a和b波呈熄滅型,同時合并血鳥氨酸濃度的嚴(yán)重升高。Jalali等[16]在OAT基因第5外顯子發(fā)現(xiàn)純合型突變c.425-1G>A,該患者除GA眼底表現(xiàn)外合并有高鳥氨酸血癥和中度肌無力。本研究中的先證者年齡尚小,目前處于疾病早期階段,隨著疾病的進(jìn)展視力是否會進(jìn)一步下降,是否會出現(xiàn)白內(nèi)障、色盲或其他癥狀仍需隨訪觀察。