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        基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討麻黃-全蝎配伍治療咳嗽變異性哮喘的作用機(jī)制

        2022-03-17 08:23:12喬伊娜劉夢(mèng)輝陳瓊芳馮曉純
        關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)庫(kù)信號(hào)

        喬伊娜,劉夢(mèng)輝,陳瓊芳,馮曉純

        (1.長(zhǎng)春中醫(yī)藥大學(xué),長(zhǎng)春 130117;2.長(zhǎng)春中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院,長(zhǎng)春 130021)

        咳嗽變異性哮喘(cough variant asthma,CVA)是一種特殊類型的哮喘,咳嗽是其主要的臨床癥狀,發(fā)病機(jī)制與哮喘相似,據(jù)我國(guó)流行病調(diào)查研究[1]顯示,CVA是導(dǎo)致小兒慢性咳嗽(病程>4周)的第二大病因。有研究[2-3]顯示,6~14歲兒童中1/3~1/2的CVA患兒最終會(huì)發(fā)展為典型哮喘;咳嗽的性質(zhì)主要為干咳、夜間咳嗽、運(yùn)動(dòng)后咳嗽等;與典型哮喘相比,CVA疾病程度較輕[4],發(fā)病機(jī)制包括氣道持續(xù)慢性炎癥、氣道高反應(yīng)性、氣道重塑等,根據(jù)其臨床特殊表現(xiàn),發(fā)病機(jī)制還包括咳嗽敏感性增高;CVA[5]四季均可發(fā)病,以春冬季節(jié)好發(fā),病程一般在1~2個(gè)月。近年來,中醫(yī)藥治療該病的臨床優(yōu)勢(shì)逐漸被研究和報(bào)道,中醫(yī)藥治療CVA較西醫(yī)復(fù)發(fā)率低、遠(yuǎn)期療效更好,可以彌補(bǔ)西醫(yī)治療的不足[6-7]。

        CVA病因病機(jī)復(fù)雜且涉及面廣,單基因-單靶點(diǎn)的藥物治療模式遠(yuǎn)不能應(yīng)對(duì)病機(jī)復(fù)雜的病證。中藥方劑配伍是在中醫(yī)治病“整體觀念”的指導(dǎo)下依據(jù)其獨(dú)特的“四氣五味”、君臣佐使加減變化治療疾病,這與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)基于“藥物-靶點(diǎn)-疾病”網(wǎng)絡(luò)分析的整體性與系統(tǒng)綜合性相吻合[8-9]。然而,這兩味藥如何協(xié)同發(fā)揮作用,其機(jī)制尚不明確,基于此,本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探討麻黃和全蝎有效成分配伍治療CVA作用機(jī)制,為對(duì)該藥的藥效成分篩選和進(jìn)一步研究提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 麻黃、全蝎化學(xué)成分研究

        利用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)分析平臺(tái)TCMSP(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php)、中藥綜合數(shù)據(jù)庫(kù)TCMID(http://www.megabionet.org/tcmid/)分別收集麻黃、全蝎(TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)未收錄)的主要化學(xué)成分,以口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%、類藥性(drug-likeness,DL)≥0.18為條件[10]篩選有效活性成分,OB和DL是藥物活性成分在研究、開發(fā)中的兩個(gè)重要參數(shù),分別反映了藥物在體內(nèi)吸收與已有藥物的類似性、開發(fā)成藥的可能性;使用PubChem數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)對(duì)化合物名稱和分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行核對(duì),并用SwissTargetPrediction網(wǎng)站(http://www.swisstargetprediction.ch/)預(yù)測(cè)其靶點(diǎn),通過查閱文獻(xiàn)手動(dòng)篩選不符合條件但是含量高或活性強(qiáng)的化合物。

        1.2 CVA靶點(diǎn)的收集

        Genecards(https://www.gene cards.org/)是一個(gè)以基因?yàn)橹行牡臄?shù)據(jù)庫(kù),以cough variant asthma為關(guān)鍵詞查詢并下載有關(guān)的全部基因,并挖掘文獻(xiàn)報(bào)道[11]補(bǔ)充全蝎的化學(xué)成分膽甾醇(MOL000953-cholesterol),篩除其中重復(fù)項(xiàng)。由于靶點(diǎn)信息來源于不同物種及存在命名不規(guī)范等現(xiàn)象,因此,先對(duì)蛋白進(jìn)行基因信息標(biāo)準(zhǔn)化,本文使用Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.uniprot.org/)的搜索功能,將物種設(shè)置為Human,將檢索得到的所有靶點(diǎn)校正為基因名稱。

        1.3 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

        將獲得的中藥-疾病共有基因輸入String(https://string-d b.org/)數(shù)據(jù)庫(kù)的Multiple proteins搜索功能中,選擇“Homo sapiens”,根據(jù)得到的蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜程度調(diào)整“minimum required interaction score”,隱藏游離節(jié)點(diǎn)進(jìn)行麻黃-全蝎治病靶點(diǎn)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建(PPI)。并通過網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵傩苑治鲕浖﨏ytoscape 3.7.1軟件構(gòu)建成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò),使藥物-成分-靶點(diǎn)關(guān)系可視化,使用插件Network Analyzer分析網(wǎng)絡(luò)的靶點(diǎn)度值(Degree),Degree高的節(jié)點(diǎn)很可能在整個(gè)網(wǎng)絡(luò)中起到關(guān)鍵作用,可用于評(píng)價(jià)麻黃、全蝎中成分和靶點(diǎn)的重要程度。

        1.4 基因本體(GO)富集及KEGG通路富集

        本研究采用David v 6.8數(shù)據(jù)庫(kù)(https://david.ncifcrf.gov/)對(duì)麻黃-全蝎治病靶點(diǎn)進(jìn)行GO功能生物過程富集分析和KEGG通路富集分析。從通路角度闡釋麻黃-全蝎治療CVA的科學(xué)內(nèi)涵。

        2 結(jié)果

        2.1 麻黃-全蝎成分及靶點(diǎn)預(yù)測(cè)結(jié)果

        通過TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù),根據(jù)設(shè)定的ADME參數(shù)標(biāo)準(zhǔn)得到麻黃潛在活性成分23個(gè)、靶點(diǎn)245個(gè);通過TCMID數(shù)據(jù)庫(kù),全蝎納入成分5個(gè)、靶點(diǎn)16個(gè),去掉重復(fù)靶點(diǎn)后共131個(gè),兩者共有靶點(diǎn)為9個(gè)。

        2.2 麻黃-全蝎、CVA靶點(diǎn)預(yù)測(cè)結(jié)果

        利用Genecards數(shù)據(jù)庫(kù)檢索并下載CVA疾病有關(guān)的全部基因,共得到2 242個(gè)靶點(diǎn)基因。使用Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)校正所有靶點(diǎn)名稱,將麻黃-全蝎活性化學(xué)成分潛在靶點(diǎn)與CVA作用靶點(diǎn)進(jìn)行整合,得到麻黃-全蝎治療CVA靶點(diǎn)67個(gè)。

        2.3 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建結(jié)果

        通過Cytoscape3.7.1構(gòu)建麻黃-全蝎-活性化合物-治病靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖,由156個(gè)節(jié)點(diǎn)和284條邊組成,節(jié)點(diǎn)代表活性成分或作用靶點(diǎn),粉色六邊形代表麻黃活性成分,綠色六邊形代表全蝎活性成分,藍(lán)色菱形代表靶點(diǎn)基因,見圖1;從化合物角度,排名前6的化合物依次為木犀草素(MOL000006-luteolin)、槲皮素(MOL000098-quercetin)、山奈酚(MOL000422-kaempferol)、β-谷 甾 醇(MOL000358-beta-sitosterol)、豆 甾 醇(MOL000449-stigmasterol)、膽甾醇等,可能是麻黃-全蝎治療CVA的關(guān)鍵化合物。從靶點(diǎn)角度,絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶(AKT1)擁有最大度42,表明該靶點(diǎn)可能是麻黃-全蝎治療CVA的重要潛在靶點(diǎn)。

        圖1 麻黃-全蝎-活性化合物-治病靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖

        將67個(gè)麻黃-全蝎治病靶點(diǎn)輸入String中,保持minimum required interaction score為默認(rèn)值后hide disconnected nodes in the net-work,得到67個(gè)靶點(diǎn)蛋白并通過Cytoscape3.7.1構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)圖,網(wǎng)絡(luò)中共有67個(gè)節(jié)點(diǎn),329條邊,平均自由度為9.82,見圖2。超過平均自由度的蛋白質(zhì)有25個(gè),取前十個(gè)為核心蛋白,如AKT1、表皮生長(zhǎng)因子(EGFR)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(Src)、雌激素受體(ESR1)等。利用Cytoscape3.7.1軟件構(gòu)建核心蛋白PPI網(wǎng)絡(luò)圖,見圖3。

        圖2 麻黃-全蝎治療CVA PPI網(wǎng)絡(luò)圖

        圖3 麻黃-全蝎核心蛋白PPI網(wǎng)絡(luò)圖

        2.4 核心靶點(diǎn)的GO富集分析及KEGG通路富集分析結(jié)果

        對(duì)PPI網(wǎng)絡(luò)中的67個(gè)靶點(diǎn)蛋白進(jìn)行GO富集分析,GO-BP富集共202個(gè)條目,圖4為顯著性前20的富集結(jié)果,圖4橫坐標(biāo)表示每個(gè)條目中涉及的核心靶點(diǎn)的數(shù)目,顏色從紅到藍(lán)表示P值由大到小。麻黃-全蝎治病靶點(diǎn)富集結(jié)果涉及炎癥反應(yīng)、氧化還原反應(yīng)、酪氨酸磷酸化途徑、蛋白質(zhì)對(duì)細(xì)胞核的正調(diào)控、雌二醇反應(yīng)、細(xì)胞凋亡及內(nèi)環(huán)境穩(wěn)態(tài)、細(xì)胞因子分泌、內(nèi)皮細(xì)胞增殖、組織重塑等的調(diào)控,表明麻黃-全蝎治病靶點(diǎn)可能參與了CVA的病理和生理過程。對(duì)PPI網(wǎng)絡(luò)中的67個(gè)靶點(diǎn)蛋白進(jìn)行KEGG通路富集分析,通路富集共得到39條通路,圖5為顯著性前20的富集結(jié)果。氣泡圖中節(jié)點(diǎn)的顏色與大小由P值和相關(guān)聯(lián)基因的數(shù)量決定,顏色從綠色到紅色反應(yīng)P值從大到小,節(jié)點(diǎn)從小到大反應(yīng)相關(guān)聯(lián)基因的數(shù)量從少到多。麻黃-全蝎治病靶點(diǎn)主要參與PI3KAKT信號(hào)通路、VEGF信號(hào)通路、FoxO信號(hào)通路、cGMP-PKG信號(hào)通路、Rap1信號(hào)傳導(dǎo)通路等。

        圖4 GO富集分析的生物過程

        圖5 麻黃-全蝎治療CVA預(yù)測(cè)靶點(diǎn)的KEGG通路富集圖

        3 討論

        中醫(yī)認(rèn)為本病主要以風(fēng)邪為外感病因,病機(jī)本質(zhì)為外感失治、邪郁于肺導(dǎo)致的肺失宣降、肺氣上逆、氣道攣急,隨著病情的遷延不愈發(fā)展為慢性咳嗽,久病導(dǎo)致病邪入絡(luò),阻礙氣血運(yùn)行?!杜R證指南醫(yī)案》中明確提出“久病入絡(luò)”“久痛入絡(luò)”,可用蟲類藥物治療久病傷絡(luò)的疾?。蝗?,始見于《蜀本草》,其通過甾體衍生物、生物堿等特殊化學(xué)成分發(fā)揮作用。此外,全蝎中的氨基酸、脂質(zhì)、鎂、鈣微量元素等營(yíng)養(yǎng)成分也對(duì)藥理活性有重要貢獻(xiàn)[12]。

        在臨床上治療CVA患者常用麻黃、全蝎為君藥再配合其他藥物加減,麻黃發(fā)表散寒,宣肺平喘,全蝎息風(fēng)解痙,通絡(luò)止痛。現(xiàn)代藥理學(xué)研究證明[11,13],麻黃-全蝎都具有抗炎、抗菌、抗病毒、抗腫瘤等眾多作用,全蝎還有抗癲癇、抗驚厥、抗凝、抗菌、鎮(zhèn)痛消炎、促生長(zhǎng)、提高免疫力等多種作用。李海燕等[14]通過動(dòng)物實(shí)驗(yàn)證實(shí)全蝎提取物可以降低小鼠支氣管肺泡灌洗液中嗜酸粒細(xì)胞、中性粒細(xì)胞的比例,對(duì)支氣管哮喘引起的炎癥疾病有治療作用。

        在本研究中,成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)顯示麻黃-全蝎治療CVA的關(guān)鍵成分有木犀草素、槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇、膽甾醇等,既往研究[15-16]也證實(shí)木犀草素能通過抑制TGF-β1mRNA及NF-κB等的表達(dá)減輕支氣管炎癥的嚴(yán)重程度,而槲皮素能通過調(diào)節(jié)Th1/Th2表達(dá)平衡,下調(diào)氣道上皮組織中TLR4/NF-κB的表達(dá)可減輕炎癥細(xì)胞的浸潤(rùn)、影響突觸功能從而抑制大鼠氣管收縮治療哮喘[17],全蝎中的成分由于數(shù)據(jù)庫(kù)納入的成分、靶點(diǎn)都極少,無法得出全蝎全部有效成分的靶點(diǎn),其中膽甾醇是得到的確定有效成分,屬于一類甾體衍生物。2012年,膽甾醇首次在全蝎中被發(fā)現(xiàn)[18],有研究證明[19]膽甾醇廣泛分布于人體血液中,是體內(nèi)激素產(chǎn)生的重要原料基礎(chǔ),能維持人體正常的生命活動(dòng);膽甾醇衍生物還具有抗菌、抗病毒、消炎等作用[20],推測(cè)是全蝎在CVA治療中發(fā)揮抗炎藥理活性的物質(zhì)基礎(chǔ)。因此,麻黃-全蝎關(guān)鍵成分有抗菌、抗病毒、抑制炎癥反應(yīng)、抑制支氣管痙攣等作用,在CVA治療中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。

        麻黃-全蝎治療CVA的關(guān)鍵靶點(diǎn)有25個(gè),其中AKT1和MMP9均參與氣道炎癥反應(yīng)發(fā)生及氣道重塑的過程[21],AKT1作為麻黃-全蝎治療CVA最重要的潛在靶點(diǎn)可以調(diào)節(jié)許多過程,包括代謝、增殖、細(xì)胞存活、生長(zhǎng)和血管的生成,有研究[22]表明,AKT1能促進(jìn)平滑肌細(xì)胞的分化增殖并且能有效地靶向下調(diào)CD38的表達(dá),成為CVA等慢性炎癥性疾病的治療靶點(diǎn),MMP9上也含有NF-κB的結(jié)合位點(diǎn)[23];MPO[24]在氣道炎癥、氣道高反應(yīng)及氣道重塑過程中也發(fā)揮重要作用,由此推測(cè),麻黃-全蝎可能通過這些靶點(diǎn)對(duì)氣道炎癥反應(yīng)、氣道重塑等過程產(chǎn)生影響從而發(fā)揮對(duì)CVA的治療作用。

        通過KEGG通路富集分析發(fā)現(xiàn),麻黃-全蝎治療CVA的關(guān)鍵通路有PI3K-AKT信號(hào)通路、VEGF信號(hào)通路、FoxO信號(hào)通路、cGMP-PKG信號(hào)通路、Rap1信號(hào)傳導(dǎo)通路等。PI3K-AKT[25]信號(hào)通路能促進(jìn)新陳代謝,促進(jìn)氣道平滑肌細(xì)胞的增殖,并且與血管生成有密切關(guān)系;VEGF信號(hào)通路對(duì)血管的形成和生長(zhǎng)起關(guān)鍵作用,在新血管形成過程中,VEGF對(duì)基因表達(dá)起到了誘導(dǎo)作用,還能調(diào)節(jié)血管通透性,是哮喘氣道炎癥和重塑的介質(zhì)[26];FoxO信號(hào)通路[27]除在細(xì)胞存活、死亡、增殖和代謝中起關(guān)鍵作用外,還在免疫相關(guān)細(xì)胞(包括T細(xì)胞、B細(xì)胞、嗜中性粒細(xì)胞和其他非免疫細(xì)胞)的穩(wěn)態(tài)中發(fā)揮關(guān)鍵作用,在慢性炎癥性疾病中調(diào)節(jié)炎癥的淋巴樣譜系,并且能和PI3K-AKT信號(hào)通路共同發(fā)揮抗氧化應(yīng)激作用;cGMP-PKG[28]是細(xì)胞內(nèi)的第二個(gè)信使,它通過介導(dǎo)一氧化氮(NO)和利鈉(NPs)的作用調(diào)節(jié)各種各樣的生理過程,其與氣道平滑肌的收縮關(guān)系密切;有研究報(bào)道[29]Rap1信號(hào)傳導(dǎo)通路能調(diào)節(jié)MAP激酶活性,是與免疫、炎癥相關(guān)的途徑。

        綜上所述,麻黃-全蝎很可能是通過調(diào)控PI3K-AKT信號(hào)通路、VEGF信號(hào)通路、FoxO信號(hào)通路、MMP9、MPO等細(xì)胞因子及氧化還原反應(yīng)、酪氨酸磷酸化途徑等多途徑、多靶點(diǎn)來干預(yù)細(xì)胞代謝的多個(gè)過程,發(fā)揮抑炎作用從而有效治療CVA,通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法對(duì)麻黃-全蝎治療CVA可能作用機(jī)制進(jìn)行預(yù)測(cè),此結(jié)論還需要通過進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)來驗(yàn)證。雖然全蝎作為蟲類藥用于久病入絡(luò)、息風(fēng)解痙有較長(zhǎng)的歷史和較好的療效,但對(duì)其藥理學(xué)機(jī)制研究卻沒麻黃那么充分,得到確定有效的成分、靶點(diǎn)也較少,故全蝎治療CVA的藥理機(jī)制還需進(jìn)一步探究。

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