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        云南半細(xì)毛羊精子冷凍前后轉(zhuǎn)錄組表達(dá)差異分析

        2022-03-17 10:08:52梁家充呂春榮洪瓊花吳國權(quán)權(quán)國波
        中國畜牧獸醫(yī) 2022年3期
        關(guān)鍵詞:精子細(xì)胞因子測序

        梁家充,呂春榮,洪瓊花,吳國權(quán),權(quán)國波

        (云南省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院,昆明 650224)

        精液冷凍保存技術(shù)大大提高了人工授精技術(shù)的效率,充分發(fā)揮了優(yōu)秀種公畜的繁殖潛能,大大加快了畜禽品種改良進(jìn)程。此外,精液冷凍保存對(duì)于優(yōu)秀畜禽種質(zhì)資源保護(hù)具有非常重要的意義[1-3]。哺乳動(dòng)物精子對(duì)冷凍損傷非常敏感,冷凍過程中,由冰晶形成引起的物理性損傷、化學(xué)毒性以及氧化損傷等直接破壞精子的結(jié)構(gòu)功能和抗氧化能力,導(dǎo)致精子受精能力下降,并可能影響胚胎質(zhì)量[4]。

        云南半細(xì)毛羊是中國自主培育的第一個(gè)粗檔半細(xì)毛羊新品種,填補(bǔ)了中國無粗檔半細(xì)毛羊新品種的空白。開展精液冷凍保存研究對(duì)于其種質(zhì)資源保護(hù)和加快育種改良速度具有重要意義。然而,對(duì)于綿羊精子冷凍損傷機(jī)制和低溫生物學(xué)特性研究方面仍滯后于其他家畜,如牛、豬等。目前,影響哺乳動(dòng)物凍精存活能力的遺傳機(jī)制仍需進(jìn)一步探討。精子細(xì)胞中RNA表達(dá)譜變化可能與精子冷凍損傷存在一定關(guān)聯(lián),這也成為目前精子冷凍保存研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)之一。有研究發(fā)現(xiàn),外界環(huán)境應(yīng)激可以引起成熟精子轉(zhuǎn)錄組發(fā)生變化[5]。而且,mRNA表達(dá)水平與精子生育力具有一定相關(guān)性。當(dāng)前,公牛精子和人精子的轉(zhuǎn)錄組分析已經(jīng)應(yīng)用于精子質(zhì)量的評(píng)判[6]。Ashish等[7]研究表明,微球蛋白(B2M)、溶質(zhì)載體家族2成員5(GLUT5)、蘋果酸脫氫酶1(MDH1)和三磷酸腺苷酶質(zhì)膜Ca2+運(yùn)輸4(ATP2B4)等基因的表達(dá)水平在水牛凍融精子中變化顯著。Kasimanickam等[8]研究發(fā)現(xiàn),精子尾部的外層致密纖維(ODF2)和亮氨酸脫羧酶1(LDC1)的表達(dá)水平在高生育力荷斯坦牛精子比低生育力個(gè)體高2倍,而且,金屬肽酶抑制劑(TIMP)、磷脂酶Cζ1(PLCz1)、腺苷酸激酶1(AK1)、小核核糖核蛋白多肽N 2(SNRPN2)和整合蛋白β5(IB5)表達(dá)水平在荷斯坦牛凍融精子中的表達(dá)量較高。Arangasamy等[9]證明荷斯坦牛精子的含伴侶蛋白的T-復(fù)合蛋白1和亞單位8(CCT8)表達(dá)水平與受胎率呈顯著負(fù)相關(guān),而磷脂酰乙醇胺結(jié)合蛋白1(PEBP1)和富含胱氨酸的分泌蛋白2(CRISP2)表達(dá)水平與受胎率呈正相關(guān)。此外,CDC28蛋白激酶調(diào)節(jié)亞單位2(CKS2)、真核翻譯延伸因子1γ(EEF1G)、真核翻譯起始因子1 (EIF1)、G2期/S期應(yīng)答相關(guān)蛋白1抗體(GTSE1)和魚精蛋白1(PRM1)的全長mRNA轉(zhuǎn)錄物可能被用來作為評(píng)價(jià)新鮮精子和冷凍精子功能的潛在標(biāo)記物[10]。

        本研究以云南半細(xì)毛羊作為研究對(duì)象,使用高通量轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),對(duì)其精子冷凍前后mRNA差異表達(dá)規(guī)律進(jìn)行研究,從而為綿羊精子冷凍損傷機(jī)制研究和冷凍保存技術(shù)體系優(yōu)化提供必要的理論基礎(chǔ)和分子標(biāo)記物。

        1 材料與方法

        1.1 稀釋液

        本試驗(yàn)所使用的精液基礎(chǔ)稀釋液主要成分包括:224.0 mmol/L Tris、66.6 mmol/L檸檬酸、55.5 mmol/L葡萄糖,均購自Sigma公司。冷凍稀釋液配方為在基礎(chǔ)稀釋液中添加10%新鮮蛋黃、5%甘油、100 000 IU青霉素和100 000 IU鏈霉素。冷凍稀釋液用Tris調(diào)整pH至7.0。將冷凍稀釋液于15 000×g下離心1 h,取上清用0.45 μm的一次性濾器過濾,最后于4 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2 主要試劑和儀器

        RNA濃度檢測試劑盒(Qubit?3.0 Flurometer)購自賽默飛世爾科技公司;RNA樣品片段分布檢測試劑盒(Agilent 2100 High Sensitivity DNA Assay Kit)購自美國安捷倫科技有限公司。電刺激采精儀(EJ6CCGS)購自北京倍特雙科技有限公司;0.45 μm一次性過濾器購自密理博公司;0.25 mL塑料細(xì)管購自IMV卡蘇科技股份有限公司。

        1.3 精液采集和處理

        采用電刺激采精儀采集3只成年、健康云南半細(xì)毛羊公羊精液。采集后10 min內(nèi)運(yùn)至實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行質(zhì)量評(píng)價(jià)。采集的精液質(zhì)量應(yīng)該滿足以下標(biāo)準(zhǔn):精液量0.75~2 mL,最低精子密度2×109/mL,精子活力在75%以上。將3份新鮮精液樣本各分成2份,一份直接用于RNA提取處理,分別編號(hào)為F1、F2和F3;另一份進(jìn)行冷凍保存,分別編號(hào)為T1、T2和T3。精液冷凍保存的處理方法:在精液中緩慢加入同溫度的冷凍稀釋液,將精子密度稀釋至2×108/mL,將稀釋后的精液分裝于0.25 mL塑料細(xì)管,然后以0.01 ℃/min的速度緩慢降溫至5 ℃,并于該溫度下平衡3 h,然后將冷凍細(xì)管于液氮蒸汽中預(yù)凍10 min,最后直接將冷凍細(xì)管投入液氮中保存7 d。解凍時(shí),將冷凍細(xì)管投入37 ℃水浴中30 s,解凍后分別提取RNA。

        1.4 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序及文庫構(gòu)建

        為了純化精子細(xì)胞,根據(jù)Gandini等[11]描述的方法,通過Percoll密度梯度離心法去除精漿、未成熟生殖細(xì)胞、上皮細(xì)胞以及相關(guān)的冷凍保護(hù)劑成分。最后將獲得的細(xì)胞沉淀保存于-80 ℃。

        使用第二代RNA轉(zhuǎn)錄本5′-端的轉(zhuǎn)換機(jī)制(Smart-Seq2)方法直接進(jìn)行擴(kuò)增[12],得到雙鏈cDNA產(chǎn)物。使用RNA濃度檢測試劑盒和RNA樣品片段分布檢測試劑盒,對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行質(zhì)量評(píng)估。然后以cDNA作為起始原料進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組文庫構(gòu)建。構(gòu)建好的文庫用Hiseq2500測序儀進(jìn)行測序。

        1.5 測序數(shù)據(jù)處理及生物信息學(xué)分析

        測序所得原始下機(jī)序列(Raw reads),通過去除低質(zhì)量序列、去除接頭污染等過程完成數(shù)據(jù)處理,得到可用于后續(xù)分析的高質(zhì)量序列(Clean reads)。 后續(xù)所有分析都是基于Clean reads。 本研究采用DE Seq進(jìn)行基因差異表達(dá)分析,并選取差異率(|log2Ratio|≥1)和P<0.05的基因作為差異表達(dá)基因。使用GO數(shù)據(jù)庫對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行GO功能注釋;使用KEGG數(shù)據(jù)庫對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行信號(hào)通路分析。

        2 結(jié) 果

        2.1 轉(zhuǎn)錄組測序及基因區(qū)域分布

        使用Illumina Hiseq2500高通量測序技術(shù)對(duì)6個(gè)云南半細(xì)毛羊精子樣本的cDNA文庫測序,共獲得623 399 754條原始測序序列(表1)。對(duì)原始序列進(jìn)行處理過濾得到514 313 802條高質(zhì)量的Clean reads,為原始數(shù)據(jù)量的82.50%。 將獲得的測序序列與參考基因組進(jìn)行比對(duì),共有401 795 877條(78.00%)的Reads可以與參考基因組匹配,112 517 925條(22.00%)的Reads與參考基因組不能匹配。 在匹配的Reads中,有349 923 779條(87.09%)的Reads是唯一匹配序列;有8 361 907條(2.08%)的Reads是匹配多個(gè)位置序列;有43 510 191條(10.83%)的Reads是錯(cuò)配序列(圖1)。唯一匹配序列中,有7 610 278條(2.17%)外顯子(圖2)。

        表1 測序數(shù)據(jù)分析

        圖1 比對(duì)序列分布Fig.1 Alignment sequence distribution

        圖2 唯一比對(duì)序列在參考基因組區(qū)域分布統(tǒng)計(jì)Fig.2 Distribution statistics of unique alignment sequences in reference genome region

        2.2 差異表達(dá)基因分析

        新鮮組和冷凍組精子之間差異表達(dá)基因個(gè)數(shù)為1 213個(gè),其中冷凍精子上調(diào)基因5個(gè),分別為:25線粒體運(yùn)載家族A48(SLC25A48)、心臟病相關(guān)轉(zhuǎn)錄本2(HEAT-2)、 136序列相似的家族成員A(FAM136A)、初級(jí)纖毛形成(PIFO)和3-羥基丁酸脫氫酶1(BDH1);

        下調(diào)基因1 208個(gè),其中基因表達(dá)量差異最大的10個(gè)基因分別為:C-C基序趨化因子3(LOC101114535)、微球蛋白(B2M)、原癌基因AP-1轉(zhuǎn)錄因子亞單位(FOS)、生長停滯和DNA損傷誘導(dǎo)β(GADD45B)、亞精胺/亞精胺N1乙酰轉(zhuǎn)移酶1(SAT1)、Ⅰ類組織相容性抗原(MHCⅠ)、熱休克蛋白90α家族A類成員1(HSP90AA1)、羥基羧酸受體2(HCAR2)、纖溶酶原激活劑(PLAU)和ATP酶H+轉(zhuǎn)運(yùn)輔助蛋白1(ATP6AP1)。

        2.3 差異表達(dá)基因的GO功能注釋

        對(duì)2個(gè)處理組差異表達(dá)基因進(jìn)行GO功能注釋分析,包括生物過程(biological processes,BP)、細(xì)胞組分(cellular components,CC)及分子功能(molecular functions,MF)3 大類。結(jié)果表明,冷凍前后差異表達(dá)基因中共有1 156個(gè)基因得到GO功能注釋,共涉及56個(gè)分類(圖3)。在3種GO分類中,分別富集22、17和17種生物功能。在生物過程分類中,763個(gè)基因參與細(xì)胞過程(cellular process),709個(gè)基因參與生物調(diào)節(jié)(biological regulation),647個(gè)基因參與單生物過程(single-organism process),528個(gè)基因參與代謝過程(metabolic process),375個(gè)基因參與應(yīng)激反應(yīng)(response to stimulus),另外,分別有53和2個(gè)基因參與與精子相關(guān)的生殖過程(reproductive process)和生殖(reproduction)。在細(xì)胞組分分類中,1 018個(gè)基因來源于細(xì)胞部分(cell part),661個(gè)基因分布于細(xì)胞器(organelle),479個(gè)基因來源于細(xì)胞器部分(organelle part),453個(gè)基因分布于質(zhì)膜(membrane),432個(gè)基因參與質(zhì)膜部分(membrane part)。在分子功能分類中,696個(gè)基因參與結(jié)合(binding),366個(gè)基因參與催化(catalytic),106個(gè)基因參與分子傳感器(molecular transducer),96個(gè)基因參與分子功能調(diào)控(molecular function regulator),80個(gè)基因參與酶調(diào)控(enzyme regulator)。另外,11個(gè)基因參與包括精子冷凍損傷相關(guān)的氧化還原反應(yīng)。

        ①1~22,生物學(xué)過程;23~39,細(xì)胞組分;40~56,分子功能。②1,細(xì)胞過程;2,生物調(diào)節(jié);3,單組織過程;4,代謝過程;5,應(yīng)激反應(yīng);6,定位;7,細(xì)胞成分組織或生物發(fā)生;8,發(fā)育過程;9,免疫系統(tǒng)過程;10,多細(xì)胞組織過程;11,多組織過程;12,生物黏附;13,運(yùn)輸;14,生殖過程;15,節(jié)律性過程;16,行為;17,信號(hào);18,生長;19,細(xì)胞殺傷;20,激素分泌;21,生殖;22,生物相;23,細(xì)胞部分;24,細(xì)胞器;25,細(xì)胞器部分;26,膜;27,膜部分;28,大分子復(fù)合物;29,胞外區(qū)部分;30,細(xì)胞連接;31,胞外區(qū);32,膜包腔;33,突觸部分;34,突觸;35,細(xì)胞外基質(zhì);36,細(xì)胞;37,類核;38,病毒粒子部分;39,細(xì)胞外基質(zhì)部分;40,結(jié)合;41,催化;42,分子傳感器;43,分子功能調(diào)控;44,酶調(diào)控;45,轉(zhuǎn)運(yùn)體;46,核酸結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子;47,蛋白結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子;48,結(jié)構(gòu)分子;49,鳥苷酸交換因子;50,氧化還原反應(yīng);51,電子載體;52,化學(xué)引誘劑;53,通道調(diào)控;54,翻譯調(diào)控;55,受體調(diào)控;56,蛋白質(zhì)標(biāo)簽①1-22,Biological process;23-39,Cellular component;40-56,Molecular function.②1,Cellular process;2,Biological regulation;3,Single-organism process;4,Metabolic process;5,Response to stimulus;6,Localization;7,Cellular component organization or biogenesis;8,Developmental process;9,Immune system process;10,Multicellular organismal process;11,Multi-organism process;12,Biological adhesion;13,Locomotion;14,Reproductive process;15,Rhythmic process;16,Behavior;17,Signaling;18,Growth;19,Cell killing;20,Hormone secretion;21,Reproduction;22,Biological phase;23,Cell part;24,Organelle;25,Organelle part;26,Membrane;27,Membrane part;28,Macromolecular complex;29,Extracellular region part;30,Cell junction;31,Extracellular region;32,Membrane-enclosed lumen;33,Synapse part;34,Synapse;35,Extracellular matrix;36,Cell;37,Nucleoid;38,Virion part;39,Extracellular matrix part;40,Binding;41,Catalytic;42,Molecular transducer;43,Molecular function regulator;44,Enzyme regulator;45,Transporter;46,Nucleic acid binding transcription factor;47,Protein binding transcription factor;48,Structural molecule;49,Guanyl-nucleotide exchange factor;50,Antioxidant;51,Electron carrier;52,Chemoattractant;53,Channel regulator;54,Translation regulator;55,Receptor regulator;56,Protein tag圖3 差異表達(dá)基因GO功能注釋結(jié)果Fig.3 Go function annotation results of differentially expressed genes

        2.4 差異表達(dá)基因的KEGG通路富集分析

        對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行KEGG通路富集分析,結(jié)果表明,差異表達(dá)基因富集于273個(gè)通路,其中,40個(gè)通路顯著富集(圖4)。與疾病相關(guān)有18個(gè)通路,與生物系統(tǒng)相關(guān)有12個(gè)通路,與細(xì)胞過程相關(guān)有5個(gè)通路,與環(huán)境信息處理相關(guān)有5個(gè)通路。

        ①1~18,疾病;19~30,生物系統(tǒng);31~35,細(xì)胞過程;36~40,環(huán)境信息處理。②1,類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎;2,甲型流感;3,肺結(jié)核;4,沙門氏菌感染;5,麻疹;6,丙型肝炎;7,利什曼??;8,EB病毒感染;9,乙型肝炎;10,單純胞疹病毒感染;11,恰加斯病(美國錐蟲病);12,軍團(tuán)菌?。?3,弓形蟲病;14,百日咳;15,炎癥性腸病;16,病毒致癌;17,HTLV-I感染;18,細(xì)菌侵入上皮細(xì)胞;19,細(xì)胞因子-細(xì)胞因子受體相互作用;20,Toll受體信號(hào)通路;21,NF-κB信號(hào)通路;22,NOD樣受體信號(hào)通路;23,RIG-I樣受體信號(hào)通路;24,B細(xì)胞受體信號(hào)通路;25,T細(xì)胞受體信號(hào)通路;26,HIF-1信號(hào)通路;27,Jak-STAT信號(hào)通路;28,脂肪細(xì)胞因子信號(hào)通路;29,MAPK信號(hào)通路;30,胞漿DNA感應(yīng)途徑;31,破骨細(xì)胞分化;32,吞噬體;33,細(xì)胞凋亡;34,溶酶體;35,自然殺傷細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞毒性;36,腫瘤壞死因子信號(hào)通路;37,趨化因子信號(hào)通路;38,集合管酸分泌;39,神經(jīng)營養(yǎng)素信號(hào)通路;40,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的蛋白質(zhì)加工①1-18,Diseases;19-30,Organismal systems;31-35,Cellular processes;36-40,Environmental information processing.②1,Rheumatoid arthritis;2,Influenza A;3,Tuberculosis;4,Salmonella infection;5,Measles;6,Hepatitis C;7,Leishmaniasis;8,Epstein-barr virus infection;9,Hepatitis B;10,Herpes simplex infection;11,Chagas disease (American trypanosomiasis);12,Legionellosis;13,Toxoplasmosis;14,Pertussis;15,Inflammatory bowel disease (IBD);16,Viral carcinogenesis;17,HTLV-I infection;8,Bacterial invasion of epithelial cells;19,Cytokine-cytokine receptor interaction;20,Toll-like receptor signaling pathway;21,NF-kappa B signaling pathway;22,NOD-like receptor signaling pathway;23,RIG-I-like receptor signaling pathway;24,B cell receptor signaling pathway;25,T cell receptor signaling pathway;26,HIF-1 signaling pathway;27,Jak-STAT signaling pathway;28,Adipocytokine signaling pathway;29,MAPK signaling pathway;30,Cytosolic DNA-sensing pathway;31,Osteoclast differentiation;32,Phagosome;33,Apoptosis;34,Lysosome;35,Natural killer cell mediated cytotoxicity;36,TNF signaling pathway;37,Chemokine signaling pathway;38,Collecting duct acid secretion;39,Neurotrophin signaling pathway;40,Protein processing in endoplasmic reticulum圖4 差異表達(dá)基因KEGG通路富集分析Fig.4 Analysis of KEGG pathway enrichment of differentially expressed genes

        3 討 論

        相對(duì)于其他家畜而言,綿羊精子質(zhì)膜不飽和脂肪酸含量相對(duì)較高,這直接導(dǎo)致其對(duì)冷凍損傷高度敏感。冷凍-解凍過程可對(duì)精子結(jié)構(gòu)功能造成廣泛的損傷,包括質(zhì)膜流動(dòng)性降低、質(zhì)膜完整性喪失、膜蛋白功能受損、精子抗氧化活性降低、氧化應(yīng)激和活性氧水平升高、DNA損傷、線粒體損傷、磷脂酰絲氨酸分布改變等[13-16]。近年來的研究發(fā)現(xiàn),精子自身攜帶的RNA在精子發(fā)生、運(yùn)動(dòng)、獲能、受精和早期胚胎發(fā)育等生物學(xué)過程中發(fā)揮著重要作用[17]。目前,關(guān)于綿羊精子轉(zhuǎn)錄組分析的報(bào)道較少。為了研究冷凍-解凍過程對(duì)綿羊精子mRNA表達(dá)模式的影響,本研究采用高通量測序技術(shù)對(duì)綿羊新鮮精子和冷凍精子進(jìn)行系統(tǒng)的mRNA表達(dá)譜分析,共獲得了1 213個(gè)顯著差異表達(dá)基因。由于成熟精子細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄功能處于靜止?fàn)顟B(tài),精子冷凍前后mRNA水平的差異可能是由于冷凍保存過程導(dǎo)致精子中mRNA的降解。有研究表明,冷凍可影響精子RNA轉(zhuǎn)錄組的完整性[18-19]。在本研究中,冷凍前后基因表達(dá)量差異最大的10個(gè)基因中,有5個(gè)基因參與免疫調(diào)節(jié):LOC101114535、B2M、FOS、MHCⅠ和HCAR2;有1個(gè)基因參與溫度信號(hào)刺激:HSP90AA1;有2個(gè)基因參與機(jī)體修復(fù):GADD45B和PLAU,表明mRNA在精子中的差異表達(dá)與冷凍損傷存在一定關(guān)聯(lián)。

        差異表達(dá)基因GO富集分析結(jié)果顯示,與精子功能密切相關(guān)的功能注釋主要包括生物過程中的細(xì)胞過程、代謝過程、對(duì)刺激的反應(yīng)、生殖過程和生殖等;細(xì)胞組分中的細(xì)胞部分、細(xì)胞器、細(xì)胞器部分、膜和膜部分;分子功能中的氧化還原反應(yīng)。Shangguan等[20]研究了荷斯坦牛精子冷凍前后基因的差異表達(dá),結(jié)果表明,冷凍后精子差異表達(dá)基因主要參與DNA修復(fù)、精子細(xì)胞發(fā)育、溫度應(yīng)激反應(yīng)、細(xì)胞對(duì)DNA損傷應(yīng)激反應(yīng)、雙鏈斷裂修復(fù)、精子發(fā)生和生殖細(xì)胞發(fā)育等生物過程。該結(jié)論與本研究結(jié)果基本相同。

        差異表達(dá)基因KEGG富集分析結(jié)果表明,冷凍前后差異表達(dá)基因參與40個(gè)通路,并且多富集于與炎癥以及疾病相關(guān)的通路。這些差異表達(dá)基因主要富集于由細(xì)菌、病毒和寄生蟲等生物病原體引發(fā)的炎癥相關(guān)通路,例如沙門氏菌感染、甲型流感和弓形蟲病等。此外,差異表達(dá)基因還顯著富集于趨化因子信號(hào)通路、Toll受體信號(hào)通路、吞噬體、NF-κB信號(hào)通路、NOD樣受體信號(hào)通路、B細(xì)胞受體信號(hào)通路、T細(xì)胞受體信號(hào)通路、Jak-STAT信號(hào)通路和MAPK信號(hào)通路。而這些通路都與免疫和炎癥相關(guān)通路密切相關(guān),提示了免疫相關(guān)通路和炎癥通路可能在精子冷凍-解凍過程中發(fā)揮重要作用。本研究中,差異表達(dá)基因還富集于細(xì)胞因子-細(xì)胞因子受體相互作用和細(xì)胞凋亡通路。細(xì)胞因子是一種可溶性細(xì)胞外蛋白或糖蛋白,是細(xì)胞間重要的調(diào)節(jié)因子和動(dòng)員劑。它們參與先天性和適應(yīng)性炎癥宿主防御、細(xì)胞生長、分化以及細(xì)胞死亡等,并影響生殖生理學(xué)的各個(gè)方面[21]。有研究顯示,冷凍-解凍過程可引起水牛[22]、馬[23]和野豬[24]精子的凋亡樣變化,如線粒體膜電位降低、半胱氨酸蛋白酶激活、質(zhì)膜通透性增加和磷脂酰絲氨酸外化[25]。推測,凋亡樣改變是精子質(zhì)量參數(shù)(如精子活力、活力和頂體完整性)顯著下降的主要原因[26-28]。此外,Ran等[29]對(duì)豬和大熊貓冷凍精子的miRNA和mRNA表達(dá)譜進(jìn)行了比較分析,結(jié)果表明,細(xì)胞凋亡、能量代謝、嗅覺傳導(dǎo)途徑、炎癥反應(yīng)以及相關(guān)的細(xì)胞因子-細(xì)胞因子相互作用可能與精子冷凍損傷和冷凍耐受性有關(guān),這與本研究結(jié)果基本一致。

        4 結(jié) 論

        本研究使用Smart-Seq2 RNA擴(kuò)增的方法對(duì)云南半細(xì)毛羊新鮮精子和凍融精子進(jìn)行了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析,共獲得1 213個(gè)差異表達(dá)顯著的基因,其中解凍后1 208個(gè)基因表達(dá)水平顯著下降。差異表達(dá)基因主要參與精子細(xì)胞過程、代謝過程、應(yīng)激反應(yīng)、生殖等生物學(xué)過程。而且,一些基因也參與了精子的氧化還原反應(yīng)。此外,差異表達(dá)基因顯著富集于與精子密切相關(guān)的炎癥、細(xì)胞因子-細(xì)胞因子受體相互作用和細(xì)胞凋亡等相關(guān)通路。本研究從轉(zhuǎn)錄組水平揭示了云南半細(xì)毛羊凍融精子基因的差異表達(dá),對(duì)闡明綿羊精子冷凍損傷機(jī)制有重要的參考價(jià)值,同時(shí)也可以為綿羊凍精制作體系優(yōu)化和凍精質(zhì)量評(píng)級(jí)提供必要的分子標(biāo)記物。

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