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        牛卵形巴貝斯蟲(chóng)吉林株HSP70基因的擴(kuò)增測(cè)序及系統(tǒng)進(jìn)化分析

        2022-03-07 10:35:50張瑾涵吳銀礴田萬(wàn)年呂樹(shù)臣
        貴州畜牧獸醫(yī) 2022年1期

        張瑾涵, 吳銀礴, 田萬(wàn)年, 呂樹(shù)臣

        (吉林農(nóng)業(yè)科技學(xué)院動(dòng)物科技學(xué)院,吉林 吉林 132101)

        卵形巴貝斯蟲(chóng)病是經(jīng)蜱傳播,由卵形巴貝斯蟲(chóng)(Babesiaovata)寄生于牛紅細(xì)胞內(nèi)引起的血液原蟲(chóng)病[1]。本病具有明顯的季節(jié)性,一般外地引進(jìn)牛感染發(fā)病較為嚴(yán)重,主要臨床癥狀為高熱、貧血、黃疸、血紅蛋白尿[2,3]。1980年,Minami等首次從日本牛的血液中分離到卵形巴貝斯蟲(chóng)[1]。1986、1994年,我國(guó)相繼在河南省盧氏縣、甘肅省張家川回族自治縣飼養(yǎng)牛群中發(fā)現(xiàn)該病并分離到卵形巴貝斯蟲(chóng)[1]。目前對(duì)卵形巴貝斯蟲(chóng)病的診斷主要通過(guò)臨床癥狀和血液涂片鏡檢方法,由于染色劑及相似病原體等因素,易出現(xiàn)誤診。隨著現(xiàn)代分子生物學(xué)的迅速發(fā)展,出現(xiàn)了卵形巴貝斯蟲(chóng)PCR診斷方法[4]。正常生理?xiàng)l件下,熱休克蛋白(Heat shock protein,HSP)在生物體內(nèi)的表達(dá)量較低,當(dāng)機(jī)體處于病原感染或應(yīng)激狀態(tài)時(shí)其表達(dá)量顯著升高[5]。相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),HSP70基因在生物體進(jìn)化過(guò)程中具有高度保守性,目前已應(yīng)用于梨形蟲(chóng)基因序列系統(tǒng)進(jìn)化分析[6]。本試驗(yàn)通過(guò)對(duì)卵形巴貝斯蟲(chóng)吉林株HSP70基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增測(cè)序和系統(tǒng)進(jìn)化分析,為卵形巴貝斯蟲(chóng)的分類(lèi)鑒定提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 病料樣品來(lái)自吉林省琿春地區(qū)放牧的8頭發(fā)病黃牛(主要表現(xiàn)為貧血),分別采集每頭牛的頸靜脈血10 mL,置于無(wú)菌肝素管中,-20 ℃保存。

        1.2 主要試劑、儀器血液DNA提取試劑盒、DNA膠回收試劑盒、DL 2 000 DNA Marker[均購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司]、TaqPreMix(購(gòu)自華美生物工程有限公司)、PCR儀(型號(hào):大龍TC1000-G)、電泳槽(型號(hào):DYCP-31BN)、低溫離心機(jī)(型號(hào):Sigma 3K30)。

        1.3 血液DNA的提取(1)取抗凝血150 μL加入含有細(xì)胞裂解液300 μL的離心管(容積1.5 mL)中,靜置5 min,13 000 r/min離心7 min,棄去上清液。(2)在離心管中加入細(xì)胞裂解液300 μL,再加入蛋白沉淀液100 μL,充分顛倒混勻,13 000 r/min 離心5 min。(3)將上清液倒入含有異丙醇300 μL的新離心管中,13 000 r/min 離心1 min。(4)棄去上清液,加入70%乙醇300 μL,13 000 r/min 離心 1 min,棄去上清液,自然晾干,最后加入雙蒸水(ddH2O) 50 μL,-20 ℃保存?zhèn)溆?。上述均? ℃低溫離心。

        1.4 引物設(shè)計(jì)與合成以卵形巴貝斯蟲(chóng)HSP70DNA序列(GenBank登錄號(hào):XM_029011319)為參考序列,應(yīng)用軟件Oligo 6.0設(shè)計(jì)特異引物。上游引物:5’-ATGTCTGCTCCGGCTATTGGTA-3’;下游引物:5’-TTAGTCCACCTCCTCGACAGTG-3’。預(yù)擴(kuò)增片段大小1 947 bp,引物退火溫度55 ℃。引物由吉林省庫(kù)美生物科技有限公司合成。

        1.5 PCR擴(kuò)增及測(cè)序?qū)β研伟拓愃瓜x(chóng)吉林株HSP70基因進(jìn)行擴(kuò)增,PCR反應(yīng)體系25 μL:ddH2O 9.5 μL,TaqPreMix 12.5 μL,DNA 模板2 μL,上、下游引物(濃度10 μmol/L)各0.5 μL。PCR反應(yīng)程序:94 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性35 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,共35個(gè)循環(huán);72 ℃終延伸4 min。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物按DNA回收試劑盒說(shuō)明書(shū)方法進(jìn)行回收,送吉林省庫(kù)美生物科技有限公司測(cè)序。

        1.6 系統(tǒng)進(jìn)化分析運(yùn)用MEGA 7.0軟件對(duì)所測(cè)序列與GenBank中的雙芽巴貝斯蟲(chóng)(BabesiabigeminaAB482178)、牛巴貝斯蟲(chóng)(BabesiabovisAF107118)、東方巴貝斯蟲(chóng)(BabesiaorientalisEF512547)、駑巴貝斯蟲(chóng)(BabesiacaballiAB248742)、犬吉氏巴貝斯蟲(chóng)(BabesiagibsoniAB440627)、羊巴貝斯蟲(chóng)(BabesiaovisAB248741)、馬巴貝斯蟲(chóng)(BabesiaequiAB248743)、分岐巴貝斯蟲(chóng)(BabesiadivergensAB248739)、東方泰勒蟲(chóng)(TheileriaorientalisXM_009693862)、環(huán)形泰勒蟲(chóng)(TheileriaannulataXM_948234)、綿羊泰勒蟲(chóng)(TheileriaovisAB248747)、瑟氏泰勒蟲(chóng)(TheileriasergentiD12692)12個(gè)參照序列進(jìn)行比較,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),進(jìn)行同源性及系統(tǒng)進(jìn)化分析。

        2 結(jié)果

        2.1 PCR擴(kuò)增及測(cè)序由圖1可見(jiàn):從病料中分離擴(kuò)增的DNA片段大小為1 947 bp。測(cè)序結(jié)果顯示,卵形巴貝斯蟲(chóng)吉林株HSP70基因與卵形巴貝斯蟲(chóng)日本株(XM_029011319)同源性為99.8%,與雙芽巴貝斯蟲(chóng)同源性為95.12%,與牛巴貝斯蟲(chóng)同源性為 86.72%(見(jiàn)圖2)。

        M:DL 2 000 Marker;1:PCR擴(kuò)增產(chǎn)物;2:陰性對(duì)照?qǐng)D1 HSP70基因PCR擴(kuò)增結(jié)果

        圖2 基于HSP70基因序列的巴貝斯蟲(chóng)同源性分析

        2.2 遺傳進(jìn)化分析由圖3可見(jiàn):卵形巴貝斯蟲(chóng)吉林株HSP70基因與雙芽巴貝斯蟲(chóng)(AB482178)親緣關(guān)系較近,與牛巴貝斯蟲(chóng)(AF107118)及其他蟲(chóng)種親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。

        圖3 基于HSP70基因序列的巴貝斯蟲(chóng)系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)

        3 結(jié)論

        通過(guò)對(duì)卵形巴貝斯蟲(chóng)吉林株HSP70基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,其基因片段大小為1 947 bp;同源性分析表明,與卵形巴貝斯蟲(chóng)日本株(XM_029011319)同源性為99.8%;系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,與雙芽巴貝斯蟲(chóng)親緣關(guān)系較近,與牛巴貝斯蟲(chóng)及其他蟲(chóng)種親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。

        4 討論

        4.1卵形巴貝斯蟲(chóng)病呈世界性分布,我國(guó)河南、甘肅、四川、吉林等地也有該病的報(bào)道,對(duì)牛的危害尤為嚴(yán)重,感染率達(dá)30.52%[7]。隨著我國(guó)養(yǎng)牛業(yè)的發(fā)展和牛的頻繁交易,該病在我國(guó)流行區(qū)域逐漸擴(kuò)大,已成為嚴(yán)重威脅養(yǎng)牛業(yè)發(fā)展的重要疾病之一。白啟等[8]通過(guò)傳播媒介蜱進(jìn)行人工感染試驗(yàn)表明,卵形巴貝斯蟲(chóng)與雙芽巴貝斯蟲(chóng)、牛巴貝斯蟲(chóng)各為單獨(dú)的蟲(chóng)種。

        4.2目前國(guó)內(nèi)有關(guān)卵形巴貝斯蟲(chóng)的研究較少,據(jù)田萬(wàn)年等[9]對(duì)卵形巴貝斯蟲(chóng)18S rRNA序列分析結(jié)果顯示,其與雙芽巴貝斯蟲(chóng)親緣關(guān)系較近,與牛巴貝斯蟲(chóng)親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。本試驗(yàn)通過(guò)對(duì)卵形巴貝斯蟲(chóng)吉林株HSP70基因擴(kuò)增,大小為1 947 bp;測(cè)序結(jié)果顯示其與雙芽巴貝斯蟲(chóng)同源性為95.12%,與牛巴貝斯蟲(chóng)同源性較低(86.72%);系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,卵形巴貝斯蟲(chóng)吉林株HSP70基因與雙芽巴貝斯蟲(chóng)親緣關(guān)系較近,與牛巴貝斯蟲(chóng)及其他蟲(chóng)種親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。這與田萬(wàn)年等[9]對(duì)卵形巴貝斯蟲(chóng)18S rRNA序列分析結(jié)果相一致,與曲志強(qiáng)等[10]基于HSP70基因系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果(雙芽巴貝斯蟲(chóng)與卵形巴貝斯蟲(chóng)親緣關(guān)系較近)相一致。本研究進(jìn)一步證明了卵形巴貝斯蟲(chóng)與雙芽巴貝斯蟲(chóng)、牛巴貝斯蟲(chóng)之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,豐富了卵形巴貝斯蟲(chóng)的遺傳進(jìn)化資料。

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