程浩洋,李長(zhǎng)輝
1 遼寧中醫(yī)藥大學(xué) 遼寧沈陽 110000
2 遼寧中醫(yī)藥大學(xué)附屬第一醫(yī)院 遼寧沈陽 110000
隨著新世紀(jì)的到來,我國居民的飲食結(jié)構(gòu)和生活方式隨著時(shí)代的發(fā)展而改變,繁忙的生活帶來焦慮情緒和不規(guī)律的飲食,今年來流行的高油脂、高熱量飲食所導(dǎo)致的肥胖嚴(yán)重威脅著我們的健康。根據(jù)《中國成人超重和肥胖癥預(yù)防控制指南》中的診斷標(biāo)準(zhǔn),我們認(rèn)為BMI在 25.0到29.9之間為超重,BMI≥30即為肥胖[1]。2005年全國肥胖調(diào)查發(fā)現(xiàn),男性肥胖率23%,女性肥胖率22.7%,男性超重率6.6%,女性超重率7.6%,城市肥胖率和超重率均高于農(nóng)村[2]。郭春雷的研究顯示,我國兒童超重率逐年顯著提升,截至2014年已達(dá)7.3%[3]。基于1997-1998年12地區(qū)老年肥胖人口調(diào)查推測(cè),我國老年群體男性超重率為32.92%,女性超重率為34.84%[4]。由此可見我國肥胖與超重在各個(gè)年齡段各個(gè)區(qū)域都有較高的發(fā)病率,肥胖作為多種疾病如高血壓、2型糖尿病、冠心病、睡眠呼吸暫停等的高危因素,大大威脅現(xiàn)代居民的健康,尋求干預(yù)肥胖進(jìn)展的手段已迫在眉睫。我國中醫(yī)藥對(duì)肥胖的認(rèn)識(shí)已有千年之久,早在《黃帝內(nèi)經(jīng)》中對(duì)肥胖類型的認(rèn)識(shí)即有脂人、膏人、肉人之別,李東垣的《脾胃論》中有“脾胃俱旺,能食而肥;脾胃俱虛,則不能食而瘦”,指出患者常由于食欲旺盛為最初原因引起肥胖,隨著病情的演進(jìn),諸如痰濁、濕熱、血瘀等病理產(chǎn)物的出現(xiàn),肥胖的治療手段也根據(jù)具體證型而調(diào)整。其中黃連-黃芩以苦寒燥濕瀉熱為主要功效,是濕熱內(nèi)蘊(yùn)證型肥胖的常用藥對(duì),首見于《傷寒雜病論》中協(xié)熱下利之葛根芩連湯證?,F(xiàn)代對(duì)其藥理學(xué)研究與觀察從未中斷,其中段陽泉所做的臨床療效觀察顯示,以二陳湯為基礎(chǔ)方,針對(duì)濕熱證型加黃連、黃芩、澤瀉等,經(jīng)3個(gè)月的治療,患者體重下降15公斤[5]?,F(xiàn)代藥理學(xué)研究認(rèn)為,黃連調(diào)節(jié)腸道菌群結(jié)構(gòu),促進(jìn)有益菌群的增多,減少有害菌,以減輕慢性炎癥反應(yīng),有著防治肥胖和延緩糖尿病并發(fā)癥的積極療效[6]。陳美珍[7]通過動(dòng)物實(shí)驗(yàn)研究表明,黃芩素改善胰島素抵抗,其機(jī)制可能是抑制TNF-α、IL-1β、IL-6等炎癥因子表達(dá),減輕炎癥反應(yīng),黃芩苷能夠促進(jìn)NF-K B活化來減少炎癥因子釋放以減輕肥胖導(dǎo)致ASP時(shí)的肝損傷,其機(jī)制仍需進(jìn)一步研究[8]。黃連堿對(duì)飲食誘導(dǎo)肥胖小鼠的體重有一定的控制作用,其機(jī)制是抑制LPS/TLR-4通路,緩解肝臟炎癥反應(yīng),減少脂質(zhì)在脂肪細(xì)胞中的合成與積累[9]。黃連素能夠減輕氧化應(yīng)激,降低PAH1的表達(dá)降低細(xì)胞內(nèi)甘油三酯水平[10]。由此可見黃連-黃芩藥對(duì)治療肥胖及其并發(fā)癥的全面性,但許多機(jī)制尚有許多不明之處。本研究欲以網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方式探究本藥對(duì)治療肥胖的基因位點(diǎn)和作用通路,以從系統(tǒng)性視角分析其作用機(jī)理。
藥 物 數(shù) 據(jù) 庫 TCMSP:https://tcmspw.com,Pubchem:https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/,Uniprot:https://www.uniprot.org/。 疾 病 數(shù) 據(jù) 庫 Genecards:https://www.genecards.org/。
交 集 工 具 Venny2.1.0:https://bioinfogp.cnb.csic.es/。PPI網(wǎng)絡(luò)繪制工具 STRING:https://stringdb.org/。GO,KEGG 富 集 工 具 Metascape:https://www.plob.org/tag/metascape。圖表繪制微生信:http://www.bioinformatics.com.cn/??梢暬治鲕浖﨏ytoscape3.8.0。
在中醫(yī)藥數(shù)據(jù)庫TCMSP中查找黃連-黃芩藥對(duì),根據(jù) Lipinski 的 5 規(guī)則,即分子量 <500、-2< 脂水分配系數(shù) < 5、氫鍵供體數(shù)(Hdon)< 5、氫鍵受體數(shù)(Hacc)< 10、旋 轉(zhuǎn) 鍵數(shù)(RBN)< 10 和 ADME(absorption, distribution,metabolism,excretion) 特性,設(shè)置類藥性(DL)≥0.18 和口服生物利用度(OB)≥30%篩選出活性較高的化合物。(來自《中國實(shí)驗(yàn)方劑學(xué)雜志》)并獲取化合物的相應(yīng)靶點(diǎn)MOLID及相應(yīng)數(shù)據(jù),并在Uniprot網(wǎng)站轉(zhuǎn)換為基因名,剔除無效、重復(fù)靶點(diǎn),建立藥物靶點(diǎn)基因集。
獲取疾病靶點(diǎn)。使用Genecards數(shù)據(jù)庫,輸入“Obesity”,得到數(shù)據(jù)庫收錄的肥胖相關(guān)靶基因。搜集肥胖的疾病相關(guān)靶點(diǎn),記錄基因名(gene symbol),并建立肥胖基因集。
4.1 尋找交集基因 將藥物靶點(diǎn)基因與疾病基因集導(dǎo)入Venny2.1.0繪制交集圖,記錄交集基因以建立交集基因集。
4.2 化合物-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)映射 編輯交集基因,明確其中藥-化合物-靶點(diǎn)-疾病關(guān)系,編寫network、type文件,將其導(dǎo)入Cytoscape3.8.0,進(jìn)行可視化分析,并進(jìn)行美觀改良,獲得“化合物-靶點(diǎn)-疾病”網(wǎng)絡(luò)圖。
4.3 交集靶點(diǎn)的PPI網(wǎng)絡(luò)建設(shè) 將交集基因的基因名(gene symbol)導(dǎo)入STRING網(wǎng)站進(jìn)行分析,獲取PPI網(wǎng)絡(luò)圖及tsv文件,將tsv文件導(dǎo)入Cytoscape3.8.0進(jìn)一步分析改良以便于可視化圖表展示。
4.4 GO富集與KEGG富集分析 將交集基因?qū)隡etascape數(shù)據(jù)庫,并選取智人基因(homo sapiens)選項(xiàng),進(jìn)行基因本體(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因和基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,其中,GO 功能富集分析的 BP 為生物學(xué)過程、CC 為細(xì)胞組成、MF 為分子功能。并以表格文件保留富集分析結(jié)果。使用微生信繪制圖表,GO富集中的GOterm、Subgroup、Enrichment sroce,繪制柱狀圖。KEGG富集分析中的 Pathway、Pvalue、Enrichment、count導(dǎo)入微生信,繪制氣泡圖。
黃連化合物成分計(jì)12種,黃芩化合物成分計(jì)30種,二者共有成分共2種為coptisine(黃連堿)與epiberberine(表小檗堿),黃連共計(jì)227個(gè)不重復(fù)藥物靶點(diǎn),黃芩共計(jì)196個(gè)不重復(fù)藥物靶點(diǎn),二者重疊靶點(diǎn)共13個(gè)。
肥胖基因靶點(diǎn)9513個(gè),占總基因的99.6%,只與黃連交集靶點(diǎn)89個(gè),占比0.9%,只與黃芩交集靶點(diǎn)37個(gè),占比0.4%,與黃連黃芩共同交集70個(gè),占比0.7%,見圖 1。
圖1 黃連-黃芩藥對(duì)作用靶點(diǎn)與肥胖基因位點(diǎn)Venny圖
利用STRING對(duì)213個(gè)交集基因進(jìn)行分子互相作用,得到3466個(gè)連結(jié)邊數(shù)并繪制分子互相作用網(wǎng)絡(luò)圖,將PPI互質(zhì)網(wǎng)絡(luò)圖導(dǎo)入cytoscape3.8.0進(jìn)行可視化分析,并繪制核心靶點(diǎn)PPI互質(zhì)網(wǎng)絡(luò)圖,取大于2倍degree值的中位數(shù)為核心靶點(diǎn),共計(jì)39個(gè)核心靶點(diǎn) MAPK1、JUN、PRKCA、RELA、MYC、TP53、PRKACA、EGFR、TNF、AKT1、MAPK14、FOS、ESR1、CAV1、TGFB1、STAT1、PRKCB、IFNG、PRKCD、CXCL8、GSK3B、FN1、AR、VEGFA、EGF、RB1、IL1B、IL6、CDKN1A、BCL2、PPARG、CCND1、ERBB2、CASP3、IL2、HSPB1、HSPA5、HIF1A、E2F1。見圖 2-4,表1-2。
圖2 化合物-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)
圖4 核心靶點(diǎn)PPI分子互相作用網(wǎng)絡(luò)
表1 度值前10化合物
表2 度值前10基因靶點(diǎn)
黃連-黃芩藥對(duì)治療肥胖所涉及的生物過程有:有毒物質(zhì)反應(yīng)、受傷反應(yīng)、活性氧代謝過程、脂多糖反應(yīng)、凋亡信號(hào)通路、對(duì)氧氣水平反應(yīng)等。涉及的細(xì)胞成分:膜筏、突觸后膜、受體復(fù)合物、囊泡內(nèi)腔、枝晶膜等。涉及的分子功能:轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、蛋白結(jié)構(gòu)域特異性結(jié)合、蛋白激酶結(jié)合、核受體活性、神經(jīng)遞質(zhì)受體活性、蛋白質(zhì)均二質(zhì)活性等。癌癥的途徑、糖尿病并發(fā)癥中的AGE-RAGE信號(hào)通路、乙型肝炎、蛋白聚糖在癌癥中、IL-17信號(hào)通路、HIF-1信號(hào)通路、鉑金抗藥性、阿米巴病、血清素能突觸、甲狀腺激素信號(hào)通路是治療肥胖的主要作用通路,見圖5-7。
圖5 GO富集分析
圖6 KEGG分析通路可信度排行
圖7 KEGG分析氣泡
根據(jù)本次網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)KEGG富集分析結(jié)果所得通路,將“化合物-疾病-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖所得度值前十名基因位點(diǎn)進(jìn)行對(duì)應(yīng),發(fā)現(xiàn)HIF-1信號(hào)通路、IL-17信號(hào)通路、血清素能突信號(hào)通路極有可能是黃芩-黃連藥對(duì)治療肥胖的作用途徑。
低氧誘導(dǎo)因子具有廣泛的生物效應(yīng),有實(shí)驗(yàn)研究表明,當(dāng)受試小鼠HIF-1通路受抑制時(shí)下丘腦炎癥反應(yīng)增加,降低其葡萄糖攝取能力和基礎(chǔ)代謝率,使體重增加[11]。高糖水平下食欲控制神經(jīng)元中HIF-1的表達(dá)增加,抑制葡萄糖的攝取,使食欲減退[12]。脂肪形成和高胰島素血癥均能促進(jìn)HIF-1αmRNA的表達(dá),加重慢性炎癥反應(yīng)使肥胖加劇[13]。HIF-1信號(hào)通路中的HIF-1α與葡萄糖依賴性促胰島素多肽受體(GIPR)的表達(dá)正相關(guān),GIPR在脂肪細(xì)胞中大量增殖產(chǎn)生IL-6等炎癥因子,破壞脂肪細(xì)胞的胰島素敏感性[14]。諸多研究表明,HIF-1信號(hào)通路對(duì)肥胖的調(diào)控是雙向的,更具體的作用機(jī)制仍需要進(jìn)一步研究。
IL-17能從基因調(diào)控的方面影響肥胖,通過調(diào)控炎癥基因如 TNF- α,IL-6,IL- β,COX-2,IL-17RA,IL-17RC,CXCL1等在脂肪組織中的表達(dá)以影響代謝[15],例如其中NF-α,IL-6和IL-1β能阻礙胰島素信號(hào)通路的表達(dá)[16]。IL-17抑制小鼠3T3-L1前脂肪細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄因子以及脂質(zhì)、葡萄糖代謝相關(guān)基因的表達(dá)以抑制向脂肪細(xì)胞的分化,對(duì)于已分化的脂肪細(xì)胞,IL-17能減少其攝取葡萄糖[17]。實(shí)驗(yàn)研究,IL-17基因敲除小鼠脂肪細(xì)胞分化減少,脂肪細(xì)胞中促脂肪形成轉(zhuǎn)錄因子和脂肪因子的mRNA表達(dá)受抑制,改善了飲食引起的肥胖、脂肪肝、葡萄糖和脂質(zhì)代謝。其機(jī)制可能是當(dāng)IL-17缺乏時(shí),脾臟和肝臟中的TBK1和IKBKE的表達(dá)降低,以改善代謝功能障礙[18]。Chong Chen[19]的研究表明,血清胰島素,胰島素樣生長(zhǎng)因子1(IGF1)和白介素17(IL-17)之間有一個(gè)共有的基因位點(diǎn)GSK3,使二者常發(fā)生串?dāng)_,將GSK3基因敲除即可阻斷串?dāng)_,可改善胰島素代謝。
血清素能突觸(Serotonergic synapse)又名5-羥色胺能突觸,5-羥色胺(5-HT)在人體內(nèi)作用于不同組織的受體產(chǎn)生多種多樣的作用,近年來發(fā)現(xiàn)其對(duì)減重治療存在巨大的的研究?jī)r(jià)值。針對(duì)肥胖患者而言,5-HT能夠激活胃腸道平滑肌5-HT2受體或腸壁內(nèi)神經(jīng)節(jié)細(xì)胞5-HT4受體均可以引起胃腸道平滑肌收縮,使胃腸道張力增加[20]。目前臨床上已有使用5-HT的主要受體5-HT2CR的激動(dòng)劑改善肥胖和血糖控制[21]。其能夠在孤立腦干核中選擇性激活,以抑制食欲,減少飲食[22]。使用5-HT2CR突變小鼠的實(shí)驗(yàn)研究顯示,突變體在中年時(shí)期表現(xiàn)出較多食物攝取和肥胖癥候群的傾向。對(duì)高脂喂養(yǎng)更敏感,更易發(fā)生肥胖和2型糖尿病[23]。
由此推論可得出,涉及以上三個(gè)通路的高頻核心靶點(diǎn)為 PTGS2、NOS2、PRKACA、PTGS1,涉及此四個(gè)靶點(diǎn)三個(gè)及以上的核心化合物有黃芩素(4)、漢黃芩素(3)、槲皮素(3)、(r)- 加拿大堿(3)、橙黃素 a(3)、醋酸乙酯(3)、5- 羥基 -7,8- 二甲氧基黃酮(3),可推測(cè)以上化合物可能是黃連-黃芩藥對(duì)治療肥胖的主要活性成分。由此推論HIF-1信號(hào)通路參與活性氧代謝過程和對(duì)氧氣水平反應(yīng)恢復(fù)胰島素敏感性,利用IL-17信號(hào)通路影響脂肪的轉(zhuǎn)錄因子減少前脂肪細(xì)胞轉(zhuǎn)化為脂肪細(xì)胞,以及干預(yù)血清素能突觸通路中的神經(jīng)遞質(zhì)與受體結(jié)合以抑制食欲,以上三種模式來達(dá)到減肥療效。本文以應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)系統(tǒng)性探究黃連-黃芩藥對(duì)治療肥胖的作用機(jī)制為主旨研究得出以上結(jié)論,希望能為其進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)研究提供理論基礎(chǔ),為探尋其他中藥組方治療肥胖提供新思路。