孔文平,李 裕,郭錦材,李 燦,朱湘成,5,陳同強(qiáng),*
(1.中南大學(xué)湘雅國(guó)際轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)聯(lián)合研究院,湖南 長(zhǎng)沙 410083;2.長(zhǎng)沙市口腔醫(yī)院,湖南 長(zhǎng)沙 410006;3.食品安全監(jiān)測(cè)與預(yù)警湖南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,湖南 長(zhǎng)沙 410111;4.湖南省食品質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)研究院,湖南 長(zhǎng)沙 410000;5.組合生物合成與天然產(chǎn)物藥物湖南省工程研究中心,湖南 長(zhǎng)沙 410011)
真菌是農(nóng)業(yè)和食品行業(yè)中的主要微生物污染源之一,普遍存在于食品的生產(chǎn)、加工、包裝、貯藏和運(yùn)輸?shù)拳h(huán)節(jié)。真菌毒素則是真菌污染后所產(chǎn)生的次級(jí)代謝產(chǎn)物,具有強(qiáng)毒性、致癌性、神經(jīng)毒性和免疫抑制等作用,會(huì)對(duì)人和動(dòng)物的健康造成嚴(yán)重威脅[1]。目前已被發(fā)現(xiàn)的真菌毒素約有400 種,全球約25%的農(nóng)作物受到真菌毒素污染的影響,每年由真菌毒素造成的經(jīng)濟(jì)損失高達(dá)數(shù)千億美元[2]。與食品和農(nóng)產(chǎn)品相關(guān)的真菌毒素主要包括赭曲霉毒素、伏馬菌素、黃曲霉毒素、玉米赤霉烯酮和嘔吐毒素等,常見真菌毒素的化學(xué)結(jié)構(gòu)如圖1所示。
圖1 常見真菌毒素的化學(xué)結(jié)構(gòu)Fig. 1 Chemical structure of common mycotoxins
赭曲霉毒素是全球公認(rèn)在食品和動(dòng)物飼料中最常見的污染物之一,根據(jù)其特征官能團(tuán)的不同,可以分為赭曲霉毒素A(ochratoxin A,OTA)、OTB、OTC和OTD,OTA是赭曲霉毒素家族中毒性最強(qiáng)的成員,不僅可抑制人類胚胎干細(xì)胞的吸附、存活和增殖,還能夠誘導(dǎo)細(xì)胞的程序性死亡和氧化應(yīng)激,被國(guó)際癌癥機(jī)構(gòu)列為“2B”類致癌物[3]。由于OTA理化性質(zhì)穩(wěn)定,不易被降解破壞,在很多食品,如谷物、咖啡、葡萄酒、干果、堅(jiān)果等食物中都有檢出[4],為此世界很多國(guó)家都出臺(tái)了食品中OTA含量的限量標(biāo)準(zhǔn)[5-6](表1),其中:歐盟規(guī)定,嬰幼兒食品中OTA含量不超過0.5 μg/kg,谷物制品和未加工谷物中OTA含量分別不超過3.0、5.0 μg/kg;中國(guó)規(guī)定,谷物、豆類和咖啡豆中OTA含量均不超過5.0 μg/kg,葡萄酒和速溶咖啡中OTA含量分別不超過2.0、10.0 μg/kg;國(guó)際食品法典委員會(huì)(Codex Alimentarius Commission,CAC)規(guī)定,小麥、大麥和黑麥原糧中OTA含量不超過5.0 μg/kg。目前國(guó)內(nèi)外對(duì)OTA的防控研究主要集中于OTA的定性和定量檢測(cè),采用的檢測(cè)方法主要包括薄層色譜法[7]、高效液相色譜法(high performance liquid chromatography,HPLC)[8]、HPLC-串聯(lián)質(zhì)譜法[9]、酶聯(lián)免疫法[10]和核酸適配體法[11]等,但是上述方法不僅操作繁瑣、耗時(shí)費(fèi)力、靈敏度低,而且只能靶向于OTA本身,無法在食品或農(nóng)產(chǎn)品被污染前進(jìn)行有效預(yù)警,從而避免造成經(jīng)濟(jì)損失。
表1 國(guó)內(nèi)外食品中OTA的限量標(biāo)準(zhǔn)Table 1 Chinese and international limit standards for OTA in food
相較于對(duì)真菌毒素本身的檢測(cè),直接對(duì)產(chǎn)毒真菌進(jìn)行檢測(cè)能夠前置化干預(yù)其對(duì)食品的污染及對(duì)人類、動(dòng)物的危害,能夠在產(chǎn)毒真菌污染食品早期、未產(chǎn)生毒素前發(fā)現(xiàn)問題,以便及時(shí)采取措施。食品中產(chǎn)毒真菌鑒定方法有形態(tài)學(xué)觀察和生化鑒定等,前者存在需要對(duì)真菌純化培養(yǎng)、實(shí)驗(yàn)操作步驟繁瑣、主觀依賴性強(qiáng)、專業(yè)性要求高和靈敏度低等缺陷。也有研究者使用飛行時(shí)間質(zhì)譜儀對(duì)產(chǎn)毒真菌進(jìn)行鑒定,而這需要非常完備的質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫,但是產(chǎn)毒真菌的多樣性給數(shù)據(jù)庫的建立帶來巨大挑戰(zhàn),因此亟需一種快速、高效的產(chǎn)毒真菌鑒定方法來保障食品真菌污染方面的質(zhì)量與安全。
乳制品因其富含營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)受到全世界各國(guó)人民的喜愛,據(jù)統(tǒng)計(jì),在過去的25 年中,世界乳制品總產(chǎn)量增長(zhǎng)37.5%[12]。而世界各國(guó)人民生活水平的提高使得各類乳制品的消費(fèi)量在未來相當(dāng)長(zhǎng)的時(shí)間將依舊保持穩(wěn)定增長(zhǎng),市場(chǎng)上可供選擇的乳制品種類也會(huì)越來越多,如含有益生菌的乳制品越發(fā)受到消費(fèi)者的歡迎,但是其在生產(chǎn)過程中可能受到其他真菌的污染,產(chǎn)生一些真菌毒素,如OTA類化合物。為了保證乳制品等食品的安全,需要對(duì)OTA的潛在污染風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行評(píng)估,隨著合成生物學(xué)的快速發(fā)展,越來越多的真菌測(cè)序完成,真菌毒素的生物合成途徑被闡明[13-14]。本研究基于基因探針掃描技術(shù)建立更加高效、準(zhǔn)確的方法對(duì)乳制品中OTA的污染進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估,在OTA產(chǎn)生的源頭進(jìn)行有效監(jiān)控,旨在彌補(bǔ)傳統(tǒng)方法在OTA檢測(cè)中存在的缺陷,更好地保障消費(fèi)者的健康和安全。
純牛乳 湖南省長(zhǎng)沙市某大型超市。
共選擇6 株食品中常見的真菌,其中:赭曲霉菌(Aspergillus ochraceus)、黃曲霉菌(Aspergillus flavus)、土壤伊莎酵母(Issatchenkia terricola)和釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)來源于上海保藏生物技術(shù)中心,生長(zhǎng)于馬鈴薯葡萄糖肉湯(potato dextrose broth,PDB)培養(yǎng)基;串珠鐮孢菌(Fusarium moniliforme)來源于北京生物保藏中心,生長(zhǎng)于酵母浸出粉胨葡萄糖瓊脂(yeast peptone dextrose agar,YPD)培養(yǎng)基;冠突散囊菌(Aspergillus cristatus)為本實(shí)驗(yàn)室前期從茯磚茶中分離得到的菌株,生長(zhǎng)于40%蔗糖麥芽浸膏(M40Y)培養(yǎng)基。
真菌基因組提取試劑盒 杭州博日科技有限公司,T3 Super Mix、瓊脂糖、DNA Marker 北京擎科生物科技有限公司。
FlexCycler2多功能聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)儀 德國(guó)耶拿分析儀器股份公司;JY300C凝膠電泳儀 北京君意東方電泳設(shè)備有限公司;GelDoc XR+凝膠成像系統(tǒng) 伯樂生命醫(yī)學(xué)產(chǎn)品有限公司。
1.3.1 基因探針設(shè)計(jì)
從NCBI數(shù)據(jù)庫(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)中搜索有關(guān)赭曲霉毒素生物合成的相關(guān)研究,繪制赭曲霉毒素的生物合成途徑(圖2)。非核糖體肽合成酶(non-ribosomal peptide synthetase,NRPS)下游由OTAhal(OTA halogenase)基因編碼的鹵化酶可以催化OTB的氯原子加成,這被證明是形成毒性更大的OTA的關(guān)鍵步驟,而OTA隨后可以被進(jìn)一步酯化或羥基化后形成其他赭曲霉毒素衍生物OTC和OTD,因此針對(duì)特異性的鹵化酶基因進(jìn)一步分析研究。Aspergillus steynii3.53、Aspergillus westerdijkiaeCECT 2948、碳黑曲霉(Aspergillus carbonarius)350、黑曲霉(Aspergillus niger)3.39和Penicillium nordicumCBS 110.769為5 株產(chǎn)OTA的不同種真菌,OTA的產(chǎn)量及各自鹵化酶基因的表達(dá)量相關(guān)性均已被實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,其鹵化酶(OTAhal)氨基酸序列的GenBank登錄號(hào)分別為MG701897、MG701896、MG701890、MG701892和MG701895[15]。Leptoxyphium fumago和Caldariomyces fumago為2 株含有鹵化酶基因、不產(chǎn)OTA的真菌,其鹵化酶(OTAhal)氨基酸序列的GenBank登錄號(hào)分別為AJ300448.1和KM575843.1[16-17]。通過MEGA軟件進(jìn)行多重序列比對(duì)分析,找出OTAhal結(jié)構(gòu)域特異的一段序列區(qū)域(圖3),進(jìn)行兼并引物設(shè)計(jì):hal-F(5’-GCYGGYATCRCCAGCACCAAGT-3’)和hal-R(5’ATRAACCASACCCAGCCGCTG-3’)。同時(shí),使用真菌通用引物ITS1(5’-TCCGTAGGTGAA CCTGCGGG-3’)和ITS4(5’-TCCTCCGCTTATT GATATGC-3’)驗(yàn)證真菌DNA的提取質(zhì)量及真菌種屬類別。
圖2 OTA的生物合成途徑推測(cè)Fig. 2 Hypothesized OTA biosynthesis pathway
1.3.2 DNA的提取和PCR擴(kuò)增
將購買的菌株進(jìn)行活化后,分別接種在不同的培養(yǎng)基中,28 ℃、220 r/min搖床培養(yǎng)2~3 d。待菌株生長(zhǎng)好后用50 mL離心管收集,4 ℃、5 000 r/min離心收集菌絲體,用蒸餾水清洗除去菌絲表面的培養(yǎng)基。菌絲加液氮研磨成細(xì)粉,采用BioFlux試劑盒進(jìn)行DNA提取,提取流程參考說明書。PCR反應(yīng)體系25 μL,含有DNA模板1 μL、上游引物1 μL、下游引物1 μL和T3 Super PCR Mix 22 μL。PCR反應(yīng)條件:98 ℃、2 min,98 ℃、30 s,60 ℃、30 s,72 ℃、1 min,30 個(gè)循環(huán);72 ℃、5 min。PCR反應(yīng)產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),用凝膠成像儀成像并觀察結(jié)果。
1.3.3 人工污染牛乳檢測(cè)
取1 g在28 ℃、220 r/min條件下培養(yǎng)好的赭曲霉菌體,加入1 mL純牛乳,梯度稀釋,在室溫條件下孵育30 min,4 ℃、4 000 r/min離心去除牛乳,用30 mL無菌水清洗菌體,4 ℃、4 000 r/min離心去除上清,重復(fù)多次,直至菌體離心后上清澄清,菌體在液氮中充分研磨,分別取50 mg研磨液,采用1.3.2節(jié)方法提取基因組DNA,用于PCR實(shí)驗(yàn),剩余DNA保藏在-20 ℃。
數(shù)據(jù)處理及繪圖分別采用MEGA 6和Chem Draw 20軟件完成。
OTA生物合成過程中的關(guān)鍵酶編碼基因可作為檢測(cè)OTA產(chǎn)生菌的靶標(biāo)基因。目前,OTA的生物合成途徑已基本闡明,主要涉及到3 種酶:首先,乙酰輔酶A和丙二酰輔酶A在聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)的催化下生成7-甲基蜂蜜曲霉素[13];其次,NRPS催化苯丙氨酸與7-羧基蜂蜜曲霉素環(huán)連接[18];最后在OTAhal參與下,OTB加入氯原子形成OTA[14]。雖然PKS和NRPS的編碼基因也可作為基因探針來識(shí)別真菌毒素生物合成基因簇(biosynthesis gene cluster,BGC),但很容易和其他同樣由PKS或NRPS合成的非毒素次級(jí)代謝產(chǎn)物的BGC混淆,產(chǎn)生假陽性結(jié)果[19],而OTAhal作為催化OTA生成的關(guān)鍵酶,具有一定的特異性,OTAhal是比較理想的靶標(biāo)基因,但是已報(bào)道的OTA產(chǎn)生菌有很多,主要屬于曲霉屬[20]和青霉屬[21]兩大類,它們含有的編碼OTAhal的基因也不完全相同。此外,也存在含有編碼OTAhal的基因、不產(chǎn)OTA的菌株[16]。因此在考慮上述問題的基礎(chǔ)上,通過對(duì)不同的OTAhal編碼基因進(jìn)行多重序列分析比對(duì)(圖3),針對(duì)產(chǎn)OTA菌株中的OTAhal基因序列設(shè)計(jì)特異性引物hal-F/R,對(duì)供試菌株進(jìn)行PCR擴(kuò)增。
圖3 OTAhal基因相似度比對(duì)分析Fig. 3 Similarity comparison of OTAhal genes in OTA producers and nonproducers
由圖4A可知,所有供試菌株均能擴(kuò)增出ITS目標(biāo)條帶,證明菌株DNA提取良好且均為對(duì)應(yīng)菌株。在此基礎(chǔ)上對(duì)hal基因進(jìn)行PCR,由圖4B可知,只有赭曲霉菌能擴(kuò)增出一條約251 bp的基因條帶,其他菌株未擴(kuò)增出該條帶,證明該引物設(shè)計(jì)的特異性和有效性。黃曲霉菌和串珠鐮刀菌也擴(kuò)增出一些非特異性基因條帶,可能是因?yàn)閔al-F/R本身為兼并引物(引物長(zhǎng)度分別為22、21 bp),且黃曲霉菌和串珠鐮刀菌總基因組太大。但是食品中常見的冠突散囊菌、土壤伊薩酵母和釀酒酵母未擴(kuò)增出任何基因條帶。
圖4 引物ITS1/4(A)和引物hal-F/R(B)對(duì)供試菌株DNA的PCR擴(kuò)增圖譜Fig. 4 Electrophoresis images of PCR amplification products with primers ITS1/4 (A) and hal-F/R (B)
檢測(cè)靈敏度關(guān)系到該方法的實(shí)用性,實(shí)驗(yàn)內(nèi)容主要包括兩方面:一是在純培養(yǎng)條件下,對(duì)不同含量的赭曲霉菌基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增;二是在1 ng赭曲霉菌基因組DNA中添加等量其他5 種菌株基因組DNA進(jìn)行干擾,利用兼并引物hal-F/R進(jìn)行目標(biāo)條帶PCR特異性擴(kuò)增。
由圖5A可知,在赭曲霉菌純基因組DNA條件下,當(dāng)DNA含量高于10-2ng時(shí),以兼并引物hal-F/R進(jìn)行PCR擴(kuò)增,可以檢測(cè)到目標(biāo)條帶,因此該方法的檢出限為10-2ng。由圖5B可知,當(dāng)不同菌株基因組DNA和1 ng赭曲霉菌純基因組DNA混合時(shí),以兼并引物hal-F/R進(jìn)行PCR擴(kuò)增,同樣可以檢測(cè)到目標(biāo)條帶,因此該方法可以在多種菌干擾的條件下保持高靈敏度,具備推廣到實(shí)際檢測(cè)中的潛力。
圖5 純DNA(A)和混合DNA(B)條件下的靈敏度檢測(cè)圖譜Fig. 5 Sensitivity for detection of pure DNA (A) and mixed DNA (B)
為了驗(yàn)證此方法能否快速、準(zhǔn)確檢測(cè)乳制品中赭曲霉毒素產(chǎn)生菌,向牛乳中添加不同量的赭曲霉菌,然后再從中提取基因組DNA,利用ITS1/4引物進(jìn)行ITS目標(biāo)條帶擴(kuò)增。由圖6A可知,基因組DNA提取良好且為赭曲霉菌。在此基礎(chǔ)上利用hal-F/R對(duì)OTAhal基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,由圖6B可知,1 mL牛乳中,即使赭曲霉菌含量只有10-5mg/mL,也能準(zhǔn)確地檢測(cè)出OTAhal基因,進(jìn)而判斷出該乳制品中存在OTA的污染風(fēng)險(xiǎn)。
圖6 引物ITS1/4(A)和引物hal-F/R(B)對(duì)樣品基因組DNA的PCR擴(kuò)增圖譜Fig. 6 Electropherograms of PCR amplification products of genomic DNA from artificially contaminated sample with primers ITS1/4 (A) and hal-F/R (B)
隨著全世界范圍內(nèi)的食品安全問題越來越受重視,OTA的檢測(cè)限量標(biāo)準(zhǔn)必將越來越嚴(yán)格。傳統(tǒng)的檢測(cè)方法成本高、靈敏度低,例如:王宇龍等[22]采用基于核酸適配體的側(cè)流層析技術(shù)檢測(cè)花生與葡萄干中OTA,檢出限為0.51 ng/mL;李克等[23]采HPLC檢測(cè)谷物中OTA,檢出限為0.11 μg/kg;孫月等[24]采用HPLC-質(zhì)譜檢測(cè)糧食中的OTA,檢出限為0.25 μg/kg;王興龍等[25]采用穩(wěn)定同位素直接稀釋-超高效液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜法測(cè)定葡萄酒中OTA,檢出限為0.10 μg/L。而且上述方法針對(duì)的是已被OTA污染食品的含量檢測(cè),無法在OTA污染前作出相應(yīng)的預(yù)警,減少經(jīng)濟(jì)損失。本研究所建立的方法可彌補(bǔ)這方面的缺陷,不僅檢測(cè)效率高,而且靈敏度也較高。雖然赭曲霉菌、黃曲霉菌和串珠鐮刀菌出現(xiàn)了一些非特異性條帶,但此問題或許可以通過延長(zhǎng)兼并引物或者縮短延伸時(shí)間來克服。此外,在不增加實(shí)驗(yàn)步驟的前提下,為進(jìn)一步提高準(zhǔn)確性,還可以在OTA生物合成途徑的其他關(guān)鍵酶編碼基因上設(shè)計(jì)特異性引物,比如PKS和NRPS的相關(guān)區(qū)域,通過多重引物PCR的方法來實(shí)現(xiàn)更高的準(zhǔn)確度。
通過在OTAhal基因區(qū)域設(shè)計(jì)探針,運(yùn)用PCR技術(shù)有效檢測(cè)出乳制品中OTA產(chǎn)毒真菌,本研究可作為乳制品中OTA潛在污染的快速、準(zhǔn)確評(píng)判方法,為乳制品中OTA的污染提供有效預(yù)警,為保障我國(guó)乳制品安全做出貢獻(xiàn)。