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        肺腺癌中SPG20基因甲基化檢測(cè)及臨床意義

        2022-02-15 07:23:54趙寶山孫光蕊邢志君張志民梁宗英
        關(guān)鍵詞:水平檢測(cè)

        趙寶山,孫光蕊,邢志君,張志民,張 旭,梁宗英

        (承德醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院胸外科,承德 067000)

        肺腺癌是全世界范圍內(nèi)最常見(jiàn)的惡性腫瘤,且發(fā)病年齡的年輕化趨勢(shì)愈加明顯[1]。肺腺癌具有放化療不敏感、血行轉(zhuǎn)移早的特點(diǎn),致使患者的總體預(yù)后不佳[2-3]。因此,提高肺腺癌的早期診斷率、發(fā)現(xiàn)評(píng)估預(yù)后的新指標(biāo)和新靶點(diǎn)是肺腺癌治療的重中之重[4-5]。痙攣性截癱20(SPG20)是發(fā)現(xiàn)于肌肉截癱中的基因,其編碼的蛋白在細(xì)胞分裂周期的異常作用與腫瘤的發(fā)生具有相關(guān)性[6];研究[7-9]表明,SPG20甲基化與結(jié)直腸癌、肝癌和胃癌之間存在密切關(guān)系,并作為早期事件。目前對(duì)于SPG20基因在肺腺癌組織內(nèi)甲基化修飾的研究未見(jiàn)報(bào)道。本研究通過(guò)檢測(cè)肺腺癌組織內(nèi)SPG20甲基化水平,探討其甲基化與肺腺癌發(fā)生和發(fā)展的相關(guān)性。

        1 資料與方法

        1.1 標(biāo)本來(lái)源

        選取2018年2月至2019年8月承德醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院胸外科進(jìn)行手術(shù)治療的70例原發(fā)肺腺癌患者。其中男性27例,女性43例;≥60歲者38例,<60歲者32例;吸煙患者22例,不吸煙患者48例;按照IASLC第八版制定的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行TNM分期[3]:Ⅰ期23例,Ⅱ期32例,Ⅲ期15例;組織學(xué)分級(jí):高分化4例,中分化58例,低分化8例;有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移11例,無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移59例。實(shí)驗(yàn)組:70例肺腺癌組織;對(duì)照組:70例正常肺組織(距癌組織>6 cm,經(jīng)術(shù)后病理鑒定)。

        1.2 主要試劑和儀器

        甲基化修飾試劑盒(德國(guó)QIAGEN公司);焦磷酸測(cè)序試劑(CST公司);DNA提取試劑盒(北京全式金生物技術(shù)股份有限公司);Wizard Cleanup DNA純化回收系統(tǒng)(美國(guó)Sigma公司)、2×SYBR qPCR Master Mix(美國(guó)Promega公司)、PCR擴(kuò)增儀(美國(guó)MJ Research公司)、Real-time PCR儀(MX3000P)(美國(guó)Startagene公司)。

        1.3 實(shí)驗(yàn)方法

        1.3.1 DNA提取 取肺腺癌組織及癌旁組織標(biāo)本100 mg,按照基因組DNA提取試劑盒說(shuō)明和步驟分別提取DNA,并采用紫外分光光度計(jì)檢測(cè)提取的DNA含量和純度。提取后-20℃保存DNA。

        1.3.2 亞硫酸氫鈉處理 取純化的DNA樣品20μL,以DNA重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化試劑盒對(duì)組織和血清樣本DNA進(jìn)行亞硫酸鹽修飾。將DNA置于95℃水浴中加熱20 min,再冰浴20 min,置于42℃、濃度為3 mol·L-1的NaOH溶液中溫浴20 min。先加入NaHSO3處理液,50℃恒溫16 h。再添加1 mL 37℃的樹(shù)脂,將混勻后的液體真空抽濾后,以80%異丙醇洗滌,析出DNA,以NaOH、冰乙醇、醋酸鉸沉淀后,以80%乙醇洗滌,低溫保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3.3 甲基化特異性聚合酶鏈反應(yīng) 甲基化引物由華大基因設(shè)計(jì)并合成。SPG20甲基化引物:F:5’-AGGAAGTATGAAAGAATGTATTGTAAAG-3’;R:5’-CCCCTCAAAATTAAACAACCTTTCTCTACA-3’。反應(yīng)體系為50μL,甲基化的反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性3 min,94℃變性30 s,50℃退火,72℃延伸1 min,40個(gè)循環(huán),最后一個(gè)循環(huán)72℃延伸7 min。

        1.3.4 Pyrosequencing的檢測(cè) 2μL反應(yīng)結(jié)合珠加入到96孔PCR反應(yīng)板中,結(jié)合38μL緩沖液、40μL PCR產(chǎn)物;充分混勻后于室溫放置10 min。PCR產(chǎn)物和結(jié)合珠混懸液應(yīng)用真空泵吸取,依次放入乙醇、NaOH及沖洗緩沖液中均5 s。將探頭上結(jié)合珠以及PCR產(chǎn)物放入40μL退火緩沖液中,85℃變性2 min,冷卻到室溫,使模板與引物退火雜交。應(yīng)用Pyrosequencing軟件序列設(shè)計(jì)信息計(jì)算劑量,于試劑艙內(nèi)依次放入底物混合物,酶混合物,4種dNTP(QIAGEN)。將96孔反應(yīng)板和試劑艙放進(jìn)Pyrosequencing檢測(cè)儀(PyroMark Q96 ID,QIAGEN)中進(jìn)行反應(yīng),Pyro Q-CpG軟件將自動(dòng)分析每一個(gè)位點(diǎn)的甲基化狀態(tài)。以4個(gè)CpG位點(diǎn)甲基化改變平均值作為甲基化結(jié)果,以正常肺組織作為對(duì)照組;閾值為對(duì)照組甲基化發(fā)生率平均數(shù)+對(duì)照組樣本標(biāo)準(zhǔn)差×2(18.9)。

        1.3.5 qRT-PCR檢測(cè)SPG20mRNA的相對(duì)表達(dá)量 將組織總RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,按照RT-PCR試劑盒說(shuō)明書(shū)操作進(jìn)行qPCR反應(yīng),反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性2 min;95℃變性10 s,60℃退火30 s,共40個(gè)循環(huán)。以GAPDH為內(nèi)參基因,采用2△△CT法計(jì)算SPG20mRNA相對(duì)表達(dá)量。

        1.3.6 免疫組化檢測(cè)SPG20蛋白表達(dá)量 將組織蠟塊4μm切片,二甲苯脫蠟,梯度乙醇浸泡,滴加3%H2O2,室溫放置10 min。破膜后,將切片放入檸檬酸緩沖液,置于微波爐中高溫修復(fù)抗原12 min。切片自然冷卻后,滴加山羊血清,室溫放置20 min進(jìn)行封閉。清洗后,在濕盒中加入一抗(兔抗人SPG20單克隆抗體,1∶1 000)孵育4℃過(guò)夜。室溫條件下,加入二抗(山羊抗兔)孵育30 min。DBA顯色,蘇木素復(fù)染細(xì)胞核。免疫組化結(jié)果判斷標(biāo)準(zhǔn):根據(jù)細(xì)胞膜、細(xì)胞質(zhì)染色程度和著色陽(yáng)性細(xì)胞所占百分比進(jìn)行評(píng)價(jià)計(jì)分(每張切片高倍鏡下隨機(jī)觀察10個(gè)視野);染色強(qiáng)度評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)(A):無(wú)色(0分),淡黃色(1分),棕黃色(2分),棕褐色(3分)。著色陽(yáng)性細(xì)胞所占百分比評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)(B):1分(陽(yáng)性細(xì)胞≤10%),2分(陽(yáng)性細(xì)胞10%~50%),3分(陽(yáng)性細(xì)胞50%~75%),4分(陽(yáng)性細(xì)胞>75%)。以A+B所得分?jǐn)?shù)作為評(píng)判標(biāo)準(zhǔn):0~2分為陰性,3~4分為陽(yáng)性,5~7分為強(qiáng)陽(yáng)性。

        1.3.7 Western blot檢測(cè)SPG20蛋白表達(dá)量 提取蛋白,BCA蛋白濃度測(cè)試計(jì)算樣本蛋白濃度。以蛋白+去離子水120μL中含蛋白900μg,計(jì)算并配制蛋白液120μL,制作電泳蛋白上樣液。按序號(hào)各孔加入電泳蛋白上樣液15μL,留適當(dāng)位置加入預(yù)染Marker。連接電泳裝置,以80 V電壓電泳至蛋白樣品適度進(jìn)入分離膠,電壓轉(zhuǎn)為120 V電泳至Marker分條寬度適度。切取目標(biāo)條帶Marker附近適當(dāng)寬度,按膠大小剪膜,并剪切右上角標(biāo)記膜正面,以正面貼近膠。以正極→濾紙→PVDF膜→膠→濾紙→負(fù)極順序制作“三明治”。4℃、90 V轉(zhuǎn)膜70 min。將PVDF膜取出并移入TBST洗膜液中。用水平搖床搖晃平皿,搖床設(shè)定為80 r·min-1,洗膜5 min。取出膜后置于5%脫脂奶粉TBST溶液中,封閉2 h。用平頭鑷子將膜取出,置于裝有TBST液的平皿中。將水平搖床設(shè)定為80 r·min-1,平皿放在水平搖床上洗膜;每次5~10 min,每次更換TBST液,重復(fù)洗膜3次。按比例孵育一抗(按SPG20抗體1∶1 000;GAPDH抗體1∶1 000),搖勻后,4℃過(guò)夜??贵w稀釋液為T(mén)BST溶解2.5%脫脂奶粉。次日水平搖床用TBST液快速洗膜3次,每次10 min。按1∶2 000比例混勻后,孵育二抗,室溫孵育2 h。用平頭鑷子將膜取出,置于裝有TBST液的平皿中。將水平搖床設(shè)定為80 r·min-1,平皿放在水平搖床上洗膜;每次5~10 min,每次更換TBST液,重復(fù)洗膜3次。置入暗室顯像系統(tǒng)發(fā)光顯像。通過(guò)凝膠成像系統(tǒng)對(duì)條帶進(jìn)行掃描,根據(jù)灰度值進(jìn)行定量分析。以總蛋白內(nèi)GAPDH蛋白條帶作為內(nèi)參對(duì)照。目的蛋白相對(duì)表達(dá)量=目的蛋白條帶灰度值/總蛋白中GAPDH蛋白條帶灰度值×100%。

        1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        采用SPSS 21.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。計(jì)數(shù)資料以百分比(%)表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn);計(jì)量資料用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(x±s)表示,組間比較采用t檢驗(yàn);甲基化水平與表達(dá)量之間的相關(guān)性采用Spearman相關(guān)分析。P≤0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 肺腺癌和正常肺組織中SPG20甲基化水平比較

        焦磷酸測(cè)序法檢測(cè)結(jié)果顯示:SPG20基因在肺腺癌和正常肺組織中均可發(fā)生甲基化。肺腺癌組織中甲基化率高于正常肺組織甲基化率(P<0.01),見(jiàn)表1。

        表1 肺腺癌和正常肺組織中SPG20甲基化水平比較[例(%)]

        2.2 肺腺癌和正常肺組織中SPG20 mRNA表達(dá)量比較

        實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果顯示,70例肺腺癌組織中SPG20mRNA相對(duì)表達(dá)量(1.22±0.47)低于正常肺組織(5.79±1.13)(P<0.05),見(jiàn)圖1。

        圖1肺腺癌和正常肺組織中SPG20 mRNA表達(dá)量比較

        2.3 肺腺癌和正常肺組織中SPG20蛋白表達(dá)陽(yáng)性率比較

        免疫組化結(jié)果顯示,SPG20蛋白主要表達(dá)于細(xì)胞核內(nèi),細(xì)胞質(zhì)內(nèi)少量表達(dá)。SPG20在腺癌組織中呈低表達(dá)甚至不表達(dá),其陽(yáng)性率為24.29%(17/70),而正常肺組織中SPG20則呈高表達(dá),其陽(yáng)性率高達(dá)68.57%(48/70)。SPG20在肺腺癌組織中的陽(yáng)性表達(dá)低于正常肺組織(P<0.05),見(jiàn)圖2。

        圖2 肺腺癌和正常肺組織中SPG20蛋白表達(dá)(HE×40)

        2.4 肺腺癌和正常肺組織中SPG20蛋白表達(dá)量比較

        Western blot檢測(cè)結(jié)果顯示,SPG20在肺腺癌組織中低表達(dá),其蛋白表達(dá)量(15.78±1.85)%低于正常肺組織(63.14±2.05)%(P<0.05),見(jiàn)圖3。

        圖3 肺腺癌和正常肺組織中SPG20蛋白表達(dá)量比較

        2.5 肺腺癌組織中SPG20蛋白表達(dá)與甲基化的相關(guān)性

        相關(guān)分析結(jié)果顯示,在肺腺癌組織中,SPG20蛋白表達(dá)水平與SPG20甲基化呈負(fù)相關(guān)(r=-0.457,P<0.01),見(jiàn)表2。

        表2 肺腺癌組織中SPG20蛋白表達(dá)與甲基化的相關(guān)性(例)

        2.6 肺腺癌組織中SPG20甲基化和臨床病理特征的相關(guān)性

        SPG20甲基化水平與肺腺癌TNM分期、組織分化程度及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān)(P<0.05);與患者性別和年齡無(wú)關(guān)(P>0.05),見(jiàn)表3。

        表3 肺腺癌組織中SPG20甲基化和臨床病例特征的相關(guān)性

        3 討論

        肺腺癌是肺癌多種病理類型中最常見(jiàn)的一種,占肺癌發(fā)病率的一半以上[10]。目前針對(duì)肺腺癌患者的手術(shù)、放化療及基因靶向治療雖取得了一定的進(jìn)展,但肺腺癌患者總體預(yù)后仍有待進(jìn)一步提高[11]。肺腺癌的發(fā)生是多個(gè)基因、多個(gè)階段、多個(gè)因素及多種機(jī)制參與的共同結(jié)果[12]。因此,從基因分子學(xué)角度深入分析肺腺癌發(fā)生發(fā)展機(jī)制、發(fā)現(xiàn)評(píng)估預(yù)后的新指標(biāo)和新靶點(diǎn)、提高肺腺癌的遠(yuǎn)期存活率是肺腺癌治療的首要任務(wù)。

        SPG20基因編碼SPG20多功能蛋白,在細(xì)胞分裂周期中起到關(guān)鍵作用,且其異常表達(dá)與腫瘤的發(fā)生密切相關(guān)[6]。SPG20在結(jié)腸癌、食管癌及彌漫大B淋巴瘤組織中均呈現(xiàn)低表達(dá)狀態(tài),且其表達(dá)與患者的預(yù)后密切相關(guān)[13-15]。但關(guān)于SPG20在肺腺癌中的表達(dá)情況未見(jiàn)相關(guān)報(bào)道。本研究通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)肺腺癌中SPG20mRNA表達(dá)水平,結(jié)果顯示,肺腺癌組織中SPG20mRNA表達(dá)水平高于正常肺組織,提示肺腺癌中SPG20在基因轉(zhuǎn)錄水平上受到了抑制。本研究進(jìn)一步通過(guò)免疫組化和蛋白免疫印跡檢測(cè)SPG20蛋白表達(dá)量,結(jié)果顯示,肺腺癌組織中SPG20蛋白呈低表達(dá),而正常肺組織中則呈高表達(dá)。蛋白免疫印跡檢測(cè)結(jié)果同免疫組化檢測(cè)結(jié)果一致,提示肺腺癌中SPG20可能在基因轉(zhuǎn)錄水平上受到了抑制,進(jìn)而導(dǎo)致翻譯和合成的蛋白表達(dá)量下降。研究結(jié)果顯示:肺腺癌組織和正常肺組織中SPG20mRNA和蛋白的差異表達(dá)可能與肺腺癌的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān),但其表達(dá)受到抑制的機(jī)制不明確。

        DNA甲基化是一種不涉及核苷酸序列變化的、可遺傳的基因表達(dá)方式的共價(jià)修飾,是腫瘤發(fā)生機(jī)制中的表觀遺傳形式之一,與多種腫瘤的發(fā)生和發(fā)展密切相關(guān)[16-17]。研究[18-20]證實(shí),DNA甲基化修飾的紊亂狀態(tài)可能使基因表達(dá)異?;蛘邔?dǎo)致腫瘤發(fā)展、轉(zhuǎn)移、惡化,最終導(dǎo)致患者死亡。DNA甲基化是生物體中調(diào)控基因表達(dá)的常見(jiàn)方式之一,在肺癌[21]、乳腺癌[22]、膠質(zhì)瘤[23]、卵巢癌[24]等腫瘤的發(fā)生和發(fā)展過(guò)程中發(fā)揮著重要作用。SPG20基因發(fā)生甲基化會(huì)造成基因表達(dá)抑制,SPG20蛋白減少或缺失最終導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生。尹建浩等[7]對(duì)結(jié)直腸癌患者糞便中SPG20等基因進(jìn)行了甲基化分析,結(jié)果顯示,SPG20在結(jié)直腸癌患者糞便標(biāo)本中呈明顯的高甲基化狀態(tài),而蛋白則呈低表達(dá)狀態(tài),這對(duì)結(jié)直腸癌的早期診斷和篩查具有重要意義。Zhou等[8]通過(guò)體外實(shí)驗(yàn)證實(shí)了在胃癌中通過(guò)甲基化誘導(dǎo)SPG20沉默可以通過(guò)激活EGFR/MAPK通路,促進(jìn)胃癌細(xì)胞的增殖。研究發(fā)現(xiàn),肝癌組織中SPG20蛋白呈低表達(dá),但其甲基化水平高于癌旁組織,且SPG20的表達(dá)水平與甲基化水平呈負(fù)相關(guān)[9]。目前關(guān)于SPG20基因在肺腺癌組織內(nèi)甲基化修飾的研究未見(jiàn)報(bào)道,試圖用逆轉(zhuǎn)SPG20基因甲基化狀態(tài)來(lái)治療肺腺癌的研究更是國(guó)內(nèi)外的空白。本研究通過(guò)檢測(cè)肺腺癌組織中SPG20基因甲基化水平,并分析了甲基化程度與蛋白表達(dá)及患者臨床病例特征的相關(guān)性。結(jié)果顯示,肺腺癌組織中SPG20基因發(fā)生了甲基化,且癌組織中SPG20甲基化程度高于正常肺組織,SPG20甲基化程度與蛋白表達(dá)水平呈負(fù)相關(guān)。結(jié)合免疫組化和蛋白免疫印跡結(jié)果,提示肺腺癌中SPG20基因的高甲基化抑制了基因的轉(zhuǎn)錄,致使其翻譯、合成的蛋白質(zhì)下降。本研究還發(fā)現(xiàn),SPG20甲基化程度隨著肺腺癌TNM分期和組織分化程度的增加而逐漸增加,且和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。SPG20甲基化在有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移者中表達(dá)升高,提示其可能促進(jìn)了肺腺癌細(xì)胞自身的侵襲和遷移能力,進(jìn)而使肺腺癌的惡性程度增強(qiáng),導(dǎo)致其容易通過(guò)淋巴結(jié)發(fā)生轉(zhuǎn)移。SPG20甲基化可能促進(jìn)了肺腺癌細(xì)胞的無(wú)限制生長(zhǎng)及惡性轉(zhuǎn)化,導(dǎo)致癌細(xì)胞的局部浸潤(rùn)和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。

        綜上所述,SPG20基因在肺腺癌中表達(dá)降低,而其甲基化程度增高,且其高甲基化狀態(tài)與肺腺癌的分期、分化及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。SPG20基因甲基化調(diào)控在肺腺癌的發(fā)病機(jī)制中可能起著關(guān)鍵作用,但具體調(diào)控的分子機(jī)制仍有待進(jìn)一步研究。在今后研究中可以將SPG20甲基化修飾作為切入點(diǎn),深入研究其具體致癌機(jī)制,為肺腺癌的基因靶向治療提供新的理論依據(jù)。

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