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        15 份黑、紫色小麥種質(zhì)資源的遺傳差異及籽粒花青素含量

        2022-02-13 09:11:04楊麗娟任星旭蔣志凱
        河南農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年12期
        關(guān)鍵詞:黑麥花青素紫色

        楊麗娟,付 亮,任星旭,朱 坤,蔣志凱

        (河南省新鄉(xiāng)市農(nóng)業(yè)科學(xué)院/河南省強(qiáng)筋小麥繁育工程技術(shù)研究中心,河南 新鄉(xiāng) 453000)

        黑色小麥和紫色小麥籽粒種皮和糊粉層富含花青素而呈現(xiàn)黑、紫色[1]?;ㄇ嗨厥屈S酮類水溶性天然色素,對植物具有防止紫外線輻射、防止病害等多種生理功能。食物中的花青素對人類具有抗氧化、保護(hù)肝臟、抗癌、預(yù)防心腦血管疾病等多種功效[2-3]。黑、紫色小麥中蛋白質(zhì)以及鈣、鐵、鋅、硒等微量元素含量都顯著高于普通小麥[4-5],是功能型食品和保健型食品的理想原材料。隨著生活水平提高,消費者對糧食的需求正在發(fā)生深刻的變化,從吃得飽向吃得好、吃得健康轉(zhuǎn)變,美味、營養(yǎng)、美觀的有色食品受到了市場青睞。黑、紫色小麥具有高鐵、鋅、鉀、鎂、鉀鈉比、氨基酸、纖維和富硒鉻、多色苷等突出特點[6-7],其推廣應(yīng)用有助于通過傳統(tǒng)食物有效預(yù)防貧血、糖尿病、心腦血管等病癥[8],在飲食結(jié)構(gòu)改善和特定人群營養(yǎng)狀況改良方面將發(fā)揮重要作用。

        彩色小麥?zhǔn)切←溣N的珍貴種質(zhì)資源,通過雜交育種或雙單倍體育種等現(xiàn)代生物育種技術(shù)對彩色小麥種質(zhì)資源加以利用,選育出高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、抗病且適宜產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用的彩色小麥品種是一個大有前景的研究方向。國內(nèi)黑、紫色小麥品種多采用周黑麥1 號[9]、漯珍1 號[10-11]、中普黑麥1 號[12]等少數(shù)骨干親本選育而成,遺傳背景不夠明確。目前,關(guān)于普通小麥種質(zhì)資源遺傳多樣性分析的研究較多[13-17],而關(guān)于彩色小麥種質(zhì)資源遺傳多樣性分析的研究尚未見報道。單核苷酸多態(tài)性(SNP)標(biāo)記普遍存在于生物基因組中,在基因組中分布廣、密度高,遺傳穩(wěn)定,易于檢測而且分型簡單[18]。SNP 標(biāo)記在育種中可應(yīng)用于遺傳多樣性檢驗和基因分型,可以真實反映品種間的親緣關(guān)系[19-20]。為了明確黑、紫色小麥種質(zhì)間的遺傳關(guān)系進(jìn)而從中選擇親本材料,采用15K SNP 芯片數(shù)據(jù)分析15 份黑、紫色小麥種質(zhì)資源的遺傳差異,并測定籽粒中的花青素含量,為黑、紫色小麥雜交育種親本選擇提供理論依據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1 試驗材料

        供試黑、紫色小麥品種(系)為特色小麥1(紫色,T1)、特色小麥2(紫色,T2)、特色小麥3(黑色,T3)、特色小麥4(黑色,T4)、特色小麥5(黑色,T5)、漯珍1號(黑色,LZ1)、紫色小麥(黑色,ZM)、蜀紫麥1801(紫色,SZ)、衛(wèi)輝黑小麥(黑色,WHH)、周黑麥1 號(黑色,ZH1)、豫州黑麥1 號(紫色,YZH1)、稷紫黑麥9 號(黑色,JZH9)、永黑麥1 號(黑色,YH1)、豫州黑麥2 號(紫色,YZH2)、同盟黑小麥(黑色,TMH),均由河南省新鄉(xiāng)市農(nóng)業(yè)科學(xué)院提供。其中,漯珍1 號和周黑麥1 號為商業(yè)品種,其他為農(nóng)藝性狀已穩(wěn)定的品系。供試對照品種為中國春(CS)和新麥26(XM26),均由河南省新鄉(xiāng)市農(nóng)業(yè)科學(xué)院提供。試驗在河南省新鄉(xiāng)市農(nóng)業(yè)科學(xué)院輝縣試驗基地進(jìn)行,所有材料均于2020年10月15日播種,生育期管理同一般大田管理,2021 年6 月2 日人工收獲麥穗,各材料用單穗脫粒機(jī)脫粒,避免混雜。

        1.2 基因組DNA提取與15K芯片分析

        2020 年11 月,在田間取新鮮彩色小麥種質(zhì)葉片,液氮速凍后交由中玉金標(biāo)記(北京)生物技術(shù)股份有限公司完成基因組DNA提取和中麥芯1號15K SNP 芯片分析。中麥芯1 號是中玉金標(biāo)記(北京)生物技術(shù)股份有限公司運用Affymetrix?Axiom 平臺開發(fā)的穩(wěn)定性較高的小麥育種專用芯片,共有13 947個標(biāo)記,基本均勻覆蓋小麥全基因組,每條染色體上2個標(biāo)記間的物理距離平均為1 M。對DQC(數(shù)據(jù)質(zhì)控)>82%和CR(標(biāo)記檢出率)>95%的樣品進(jìn)行SNP位點質(zhì)控,獲取9 227個標(biāo)記,將此批檢測數(shù)據(jù)與公司種質(zhì)資源庫數(shù)據(jù)合并,進(jìn)行miss(缺失率)<10%和maf(最小等位基因頻率)>5%過濾,最終獲得7 116 個可用標(biāo)記,作為有效SNP 位點進(jìn)行統(tǒng)計分析。將SNP 分型數(shù)據(jù)分別記為1(純合AA)、2(雜合AB)、3(純合BB)和0(缺失),建立原始矩陣。用NTSYS-PC 2.1 軟件計算材料間遺傳相似度,使用Treebest軟件的NJ-tree模型構(gòu)建進(jìn)化樹[21]。

        1.3 籽?;ㄇ嗨睾繙y定

        以中國春和新麥26為對照,將待測小麥樣品籽粒用粉碎機(jī)進(jìn)行粉碎,過孔徑250 μm 的篩,稱取樣品1.00 g 于50 mL 具塞比色管中,加入提取液定容至刻度,搖勻1 min,超聲提取30 min,于沸水浴中水解1 h,取出冷卻,用提取液再次定容,靜置,取上清液,用0.45 μm水相濾膜過濾,4 ℃保存待測,有效期3 d。參考NY/T 2640—2014,采用HPLC 法測定彩色小麥籽粒中飛燕草色素、矢車菊色素、矮牽牛色素、天竺葵色素、芍藥素和錦葵色素等6種花青素含量[22],進(jìn)一步計算總花青素含量。所用高效液相色譜儀為1260 高效液相色譜儀(美國Agilent 公司)。色譜柱:Zorbax SB-C18 4.6 mm×250 mm×5μm,美國Agilent 公司);流動相:A 為1%甲酸水溶液,B為1%甲酸乙腈溶液;檢測波長:530 nm;柱溫35 ℃,進(jìn)樣量20 μL。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 15份黑、紫色小麥種質(zhì)資源的遺傳多樣性分析

        由表1可知,15份黑、紫色小麥種質(zhì)資源的SNP標(biāo)記雜合率均低于3%,純合度較高,且各種質(zhì)資源田間長勢整齊。

        表1 15份黑、紫色小麥種質(zhì)資源的SNP標(biāo)記雜合率Tab.1 Heterozygosity rates of 15 germplasm resources with black or purple grain based on SNP markers %

        本研究共獲得9 227 個SNP 位點,對分型結(jié)果進(jìn)行分析后,獲得7 116 個有效SNP 位點(圖1),多態(tài)性比率為77.12%。每條染色體上的SNP 位點數(shù)為128~682 個,在A、B、D 基因組上不均勻分布。B基因組中SNP位點最多,有3 216個,其中,3B染色體上SNP 位點最多,有682 個。D 基因組中SNP 位點最少,有1 544 個,其中,4D 染色體上SNP 位點最少,有128個。

        圖1 小麥各染色體上的SNP位點分布Fig.1 Distributions of SNP loci on each chromosome in wheat

        由表2 可知,15 份小麥種質(zhì)資源之間的遺傳相似度為44.58%~99.94%。遺傳相似度最高的2 份種質(zhì)資源是特色小麥4與漯珍1號,為99.94%;其次是特色小麥3與永黑麥1號(99.43%)、特色小麥1與豫州黑麥1 號(94.65%);豫州黑麥1 號與特色小麥1、豫州黑麥1號與特色小麥2、特色小麥1與特色小麥2、豫州黑麥2 號與特色小麥2 之間的遺傳相似度均高于90%。遺傳相似度最低的2份種質(zhì)資源是豫州黑麥1號與蜀紫麥1801(44.58%);蜀紫麥1801與多數(shù)種質(zhì)資源間的遺傳相似度低于50%,僅與特色小麥3、永黑麥1 號分別達(dá)到了50.7%、50.74%;豫州黑麥2 號與特色小麥3、特色小麥5、紫色小麥、周黑麥1 號、永黑麥1 號之間的遺傳相似度以及同盟黑小麥與豫州黑麥2 號之間的遺傳相似度均低于50%。單份種質(zhì)資源與其他種質(zhì)資源間的遺傳相似度平均值最高的是特色小麥4(71.50%),最低的是蜀紫麥1801(47.60%)。

        表2 15份黑、紫色小麥種質(zhì)資源的遺傳相似度Tab.2 Genetic similarities among 15 germplasm resources with black or purple grain %

        根據(jù)遺傳相似度構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖2),發(fā)現(xiàn)蜀紫麥1801 與其他14 份小麥種質(zhì)資源的遺傳距離較遠(yuǎn),特色小麥4 與漯珍1 號遺傳距離最近。按照遺傳距離遠(yuǎn)近,15份小麥種質(zhì)資源大致可分為3類;Ⅰ類只包括蜀紫麥1801,與其他小麥種質(zhì)資源關(guān)系較遠(yuǎn);Ⅱ類包括永黑麥1 號、特色小麥3、特色小麥5、周黑麥1 號、同盟黑小麥、特色小麥4、漯珍1 號、紫色小麥、稷紫黑麥9 號和衛(wèi)輝黑小麥等10 份種質(zhì)資源,其中,漯珍1 號是永黑麥1 號的母本,也是周黑麥1 號的母本;Ⅲ類包括豫州黑麥2 號、特色小麥2、豫州黑麥1號和特色小麥1等4份種質(zhì)資源,豫州黑麥1 號親本組合為濟(jì)麥22/中普黑麥1 號//濟(jì)麥22,豫州黑麥2 號親本組合為濟(jì)麥22/紫優(yōu)21 號//濟(jì)麥22。Ⅱ類、Ⅲ類部分種質(zhì)資源間有明確的系譜關(guān)系。部分種質(zhì)資源來源系譜不明確,根據(jù)遺傳相似度分析結(jié)果,推斷其為遺傳背景相似品系,例如永黑麥1號與特色小麥3、豫州黑麥1號與特色小麥1、豫州黑麥2號與特色小麥2。

        圖2 15份黑、紫色小麥種質(zhì)資源的系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.2 Phylogenetic tree of 15 germplasm resources with black or purple grain

        2.2 15份黑、紫色小麥種質(zhì)資源的籽?;ㄇ嗨睾糠治?/h3>

        由表3可知,所有黑、紫色小麥種質(zhì)資源籽粒的總花青素含量均高于普通小麥中國春和新麥26。大部分黑、紫色小麥種質(zhì)資源(10份)籽粒中僅含有矢車菊色素、芍藥素、錦葵色素3 種花青素;很少一部分黑、紫色小麥種質(zhì)資源籽粒中除含有矢車菊色素、芍藥素、錦葵色素3 種花青素外,還含有少量飛燕草色素、矮牽牛色素、天竺葵色素。大部分黑、紫色小麥種質(zhì)資源籽粒中矢車菊色素含量均高于芍藥素含量??偦ㄇ嗨睾孔罡叩氖亲仙←?,其次是周黑麥1 號、衛(wèi)輝黑小麥,分別為9.83、9.44、8.94 mg/kg,三者之間差異不顯著,但顯著高于其他種質(zhì)資源,3 份種質(zhì)資源均含有5 種花青素,多于其他種質(zhì)資源含有的花青素種類。在所有種質(zhì)資源中,衛(wèi)輝黑小麥籽粒中含有的天竺葵色素和錦葵色素是最高的,周黑麥1 號籽粒中含有的飛燕草色素和矮牽牛色素是最高的,紫色小麥含有的矢車菊色素和芍藥素是最高的。在所有黑、紫色小麥種質(zhì)資源中,蜀紫麥1801 籽粒中總花青素含量最低,為1.23 mg/kg 其次為豫州黑麥2 號、特色小麥2、豫州黑麥1號、特色小麥1、漯珍1 號,籽粒中總花青素含量也較低,在1.50 ~2.23 mg/kg,6 份種質(zhì)資源間差異不顯著。

        表3 15份黑、紫色小麥種質(zhì)資源的籽?;ㄇ嗨睾縏ab.3 Anthocyanin contents in grains of 15 germplasm resources with black or purple grain mg/kg

        結(jié)合15 份小麥種質(zhì)資源的系統(tǒng)進(jìn)化樹和花青素含量結(jié)果,發(fā)現(xiàn)Ⅰ類(蜀紫麥1801)籽??偦ㄇ嗨睾孔畹停瑑H為1.23 mg/kg;Ⅱ類(永黑麥1 號、特色小麥3、特色小麥5、周黑麥1 號、同盟黑小麥、特色小麥4、漯珍1號、紫色小麥、稷紫黑麥9號和衛(wèi)輝黑小麥)總花青素含量為2.23~9.83 mg/kg;Ⅲ類(豫州黑麥2 號、特色小麥2、豫州黑麥1 號和特色小麥1)總花青素含量為1.50~1.80 mg/kg??梢姡? 類種質(zhì)資源之間總花青素含量有很大差異,總花青素含量表現(xiàn)為Ⅱ類>Ⅲ類>Ⅰ類。

        3 結(jié)論與討論

        目前,利用系譜、農(nóng)藝性狀和分子標(biāo)記分析評價小麥品種遺傳多樣性的研究較多[23-28]。本研究選用廣泛分布在小麥21條染色體上的9 227個SNP位點對15 份黑、紫色小麥種質(zhì)資源進(jìn)行檢測,發(fā)現(xiàn)SNP 位點多態(tài)性比率為77.12%,高于曹廷杰等[28]對河南省96個審定小麥品種的研究結(jié)果,說明本研究15 份材料的遺傳背景較審定品種寬。亓?xí)岳俚萚16]利用SNP 分子標(biāo)記進(jìn)行小麥全基因組掃描,發(fā)現(xiàn)不同年份育成的21 個小麥品種中同一年份的品種一般聚在一起,與系譜關(guān)系吻合。本研究中聚在同一類的部分小麥種質(zhì)資源間有明確的系譜關(guān)系,永黑麥1 號親本來源為漯珍1 號/周麥22,周黑麥1 號親本來源為周麥9 號/漯珍1 號,除了系譜中有共同親本漯珍1號之外,周麥9號還是周麥22的父本,所以在聚類分析中,永黑麥1 號與周黑麥1 號遺傳距離較近,與系譜關(guān)系吻合。但二者與共同親本漯珍1號的遺傳距離較遠(yuǎn),這可能是參與聚類的種質(zhì)資源數(shù)量和類型有限造成的。

        劉易科等[29]研究發(fā)現(xiàn),多態(tài)性SNP 位點在小麥B基因組中最多、D基因組中最少。張德強(qiáng)等[30]利用SNP 標(biāo)記對周8425B 及其16 份衍生品種和23 份黃淮麥區(qū)主栽品種進(jìn)行全基因組掃描,發(fā)現(xiàn)不同基因組間多態(tài)性SNP 標(biāo)記的分布表現(xiàn)為B>A>D。本研究中SNP 位點在B 基因組中最多、D 基因組中最少,與劉易科等[29]和張德強(qiáng)等[30]結(jié)果相似。這主要是因為普通小麥進(jìn)化過程中D基因組與AABB 基因組形成六倍體小麥時間較短,多態(tài)性較低。

        紫外可見分光光度法[31]和pH 示差法[32]僅可分析總花青素含量,而HPLC 法可以測定6 種花青素的含量[33]。本研究采用HPLC 法測定的小麥籽粒花青素含量更加準(zhǔn)確,類別更加明確。葉琳[34]采用UHPLC-QTOF-MS 測定紫粒小麥科興617籽?;ㄇ嗨睾堪l(fā)現(xiàn),其有11 種花色苷單體,芍藥素為第一主要花色苷,矢車菊色素為第二主要花色苷。本研究中12 份小麥種質(zhì)資源籽粒的第一主要花青素為矢車菊色素,第二主要花青素為芍藥素,與科興617不同,可能是由種質(zhì)資源差異引起的。李杏普等[35]研究發(fā)現(xiàn),藍(lán)、紫粒小麥籽?;ㄇ嗨睾渴瞧胀ㄐ←湹?~6 倍。本研究中15 份黑、紫色小麥種質(zhì)資源籽粒中總花青素含量最低的蜀紫麥1801 和最高的紫色小麥,其總花青素含量分別是普通小麥新麥26的21 倍和165 倍,這為挖掘、利用高花青素含量的種質(zhì)資源提供了理論依據(jù)。

        黑、紫色小麥中存在多個粒色相關(guān)的基因[36-37],本研究中小麥種質(zhì)資源的SNP 位點豐富,為進(jìn)一步挖掘粒色相關(guān)基因提供了依據(jù)。例如:蜀紫麥1801與其他種質(zhì)資源的遺傳差異大,花青素含量較低,可以作為粒色相關(guān)位點的研究材料。高明剛等[38]利用SNP 標(biāo)記進(jìn)行小麥親本評價和雜交組合設(shè)計,已育成10個審定品種。本研究中,基于SNP標(biāo)記的聚類分析將15 份小麥種質(zhì)資源分成3 類,可為雜交組合設(shè)計提供參考。趙善倉[39]研究認(rèn)為,小麥籽粒色素含量由遺傳決定,不同小麥品種籽粒中花青素含量差異顯著。本研究中不同小麥種質(zhì)資源間遺傳差異大、花青素含量差異大,與趙善倉[39]結(jié)論一致。根據(jù)聚類分析結(jié)果,小麥籽粒中總花青素含量表現(xiàn)為Ⅱ類>Ⅲ類>Ⅰ類,3 類之間總花青素含量有很大差異。董亞兵[40]研究認(rèn)為,貴紫麥1 號基因型和花青素含量呈正相關(guān),與本研究結(jié)果一致,這可能是由于控制粒色的基因在系譜相關(guān)品種中的遺傳和選擇引起的。紫色小麥、衛(wèi)輝黑小麥和周黑麥1 號籽粒中花青素種類豐富而且總花青素含量高于其他種質(zhì)資源,可與遺傳相似度低的其他種質(zhì)資源進(jìn)行雜交育種親本組配。

        針對黑、紫色小麥種質(zhì)資源利用,建議繼續(xù)廣泛收集種質(zhì)資源,拓寬育種親本的遺傳基礎(chǔ);應(yīng)用經(jīng)濟(jì)高效的花青素含量檢測技術(shù),篩選花青素含量高的種質(zhì)資源;大力加強(qiáng)種質(zhì)資源的創(chuàng)新研究和利用,利用已有高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)小麥骨干親本與搜集到的優(yōu)異基因資源進(jìn)行聚合雜交,創(chuàng)造新的優(yōu)異中間育種材料;借助分子標(biāo)記輔助選擇、雙單倍體育種等手段加快育種進(jìn)度。

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