李 彤,邵慧慧,韓嘉寧,王雪蓮,胡增輝,吳 靜*
(1 北京農(nóng)學(xué)院 園林學(xué)院,北京 102206;2 北京林木分子設(shè)計(jì)育種高精尖創(chuàng)新中心,北京 102206)
花香不僅是植物重要的觀(guān)賞特性,也是植物體內(nèi)重要的次級(jí)代謝產(chǎn)物,對(duì)植物的防御和繁衍有重要意義。光照作為重要的環(huán)境因子,對(duì)花香成分的合成和釋放起著調(diào)控作用[1]。研究發(fā)現(xiàn),‘金盞銀臺(tái)’水仙花香中的化合物數(shù)量隨著光強(qiáng)的增加表現(xiàn)先增大后減小的規(guī)律,在低光強(qiáng)下花香成分更多,而花香中不同化合物種類(lèi)的相對(duì)含量隨光強(qiáng)則表現(xiàn)不同的變化規(guī)律[2]。黑暗條件下桂花清香、甜香氣息不足可能是持續(xù)黑暗導(dǎo)致芳樟醇及其氧化物、反式-β-羅勒烯等萜烯類(lèi)物質(zhì)釋放比例降低的原因[3];梔子的香氣成分種類(lèi)隨著遮光率的增加而減少,其中萜烯類(lèi)物質(zhì)隨著遮光率的增加先增加后減少[4];藍(lán)光也能夠促進(jìn)萜烯類(lèi)揮發(fā)物的合成和釋放,茶葉中的揮發(fā)性萜烯在藍(lán)光照射下顯著增加,藍(lán)光處理下墨西哥薄荷精油主要成分倍半萜的合成途徑也更加活躍[5-6]。但是光調(diào)控花香揮發(fā)性物質(zhì)合成和釋放的機(jī)制及信號(hào)途徑尚不清楚。
PIFs(phytochrome-interacting factors)是一種bHLH型轉(zhuǎn)錄因子,作為光形態(tài)建成的負(fù)調(diào)控因子[7],主要響應(yīng)溫度及紅光信號(hào)。PIF4是高溫條件下促進(jìn)擬南芥生長(zhǎng)必不可少的轉(zhuǎn)錄因子,PIF5在高溫誘導(dǎo)的適應(yīng)機(jī)制中也有一定作用[8]。PIFs與(遠(yuǎn))紅光受體PHYA/B(Phytochromes A/B)形成的模塊具有多種調(diào)控功能,研究發(fā)現(xiàn)擬南芥表皮可通過(guò)phyB-PIF4-生長(zhǎng)素途徑控制植株心皮和氣孔發(fā)育等[9]; PIFs也可與藍(lán)光受體光敏色素CRYs(cryptochromes)相互作用調(diào)節(jié)一系列轉(zhuǎn)錄過(guò)程,PIF4被證明可與CRY1、CRY2相互作用以調(diào)節(jié)植物蔭蔽反應(yīng),調(diào)控?cái)M南芥下胚軸伸長(zhǎng)[10-11]。而且PIFs在植物的次生代謝調(diào)控中也發(fā)揮重要的作用,MEP(methylerythritol phosphate)和MVA(mevalonate)是植物萜烯合成的兩條關(guān)鍵途徑[12]。研究表明PIF5可對(duì)萜烯的生物合成進(jìn)行調(diào)控[13],在pif1、pif3、pif4、pif5單突變體和pifQ突變體中,DXS1、DXR、HDR基因表達(dá)水平顯著升高,提示PIFs是負(fù)調(diào)控因子,ChIP-qPCR進(jìn)一步證實(shí)了PIFs對(duì)DXS1和DXR的直接調(diào)控[14]。在更早的研究中發(fā)現(xiàn)PIFs可能是通過(guò)直接結(jié)合DXS、DXR、HDS、HDR啟動(dòng)子的PBE-BOX原件來(lái)參與MEP途徑的調(diào)控[15]。
金魚(yú)草 (AntirrhinummajusL.)是玄參科金魚(yú)草屬多年生草本植物,因其花色艷麗、品種豐富、生長(zhǎng)周期短而成為研究花卉的模式植物[16]。金魚(yú)草花香的主要物質(zhì)有萜烯物質(zhì)月桂烯、羅勒烯和苯甲酸甲酯等苯環(huán)型/苯丙素類(lèi)物質(zhì)[17]。課題組前期工作表明,用不同光強(qiáng)、光質(zhì)處理金魚(yú)草花朵會(huì)使其花香釋放量差異變化,基于PIF4對(duì)光信號(hào)的響應(yīng)以及對(duì)萜烯合成途徑的調(diào)控作用,本實(shí)驗(yàn)以‘馬里蘭’金魚(yú)草為實(shí)驗(yàn)材料,運(yùn)用病毒誘導(dǎo)基因沉默 (virus-induced gene silencing,VIGS)技術(shù),將AmPIF4基因編碼區(qū)片段構(gòu)入煙草脆裂病毒載體獲得重組DNA,侵染金魚(yú)草并測(cè)定基因表達(dá)量;煙草是外源基因瞬時(shí)表達(dá)的首選植物,目前已在多個(gè)方面優(yōu)化條件,煙草葉片能瞬時(shí)表達(dá) GFP[18],從而檢測(cè)蛋白在細(xì)胞中的定位;以自動(dòng)熱吸附氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(automatic thermal desorption gaschromatography/mass spectrome,ATD-GC/MS)檢測(cè)金魚(yú)草主要花香物質(zhì)的變化,為后續(xù)研究金魚(yú)草花香代謝的調(diào)控奠定基礎(chǔ)。
‘馬里蘭’金魚(yú)草的栽培與養(yǎng)護(hù)方法同韓嘉寧等[19],本氏煙草(Nicotianabenthamiana)種子由本實(shí)驗(yàn)室收集并常溫保存。實(shí)驗(yàn)所用pNC-Green-SubC、pNC-GFP、pTRV載體均為北京農(nóng)學(xué)院園林學(xué)院分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室現(xiàn)有保存材料,pclone007 Blunt Simple載體和大腸桿菌(E.coli)感受態(tài)DH5α購(gòu)于北京擎科生物科技有限公司,農(nóng)桿菌GV3101菌株購(gòu)于上海唯地生物技術(shù)有限公司。
1.2.1AmPIF4基因片段克隆金魚(yú)草RNA提取、cDNA合成及反轉(zhuǎn)錄、qRT-PCR檢測(cè)方法及反應(yīng)體系同韓嘉寧等[19]。在金魚(yú)草基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(http://bioinfo.sibs.ac.Cn/Am/download-v2.php)內(nèi)查找AmPIF4基因序列(登錄號(hào)Am03g17770),選取AmPIF4基因編碼區(qū)為目標(biāo)片段,用Snapgene設(shè)計(jì)含有BamHⅠ和XbaⅠ酶切位點(diǎn)的同源臂引物pTRV2-AmPIF4-F和pTRV2-AmPIF4-R(表1),以cDNA為模板進(jìn)行克隆,擴(kuò)增程序:98 ℃預(yù)變性3 min;98 ℃ 10 s;56 ℃ 15 s;72 ℃ 1 min,進(jìn)行35個(gè)循環(huán); 72 ℃延伸3 min。瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證并純化回收PCR產(chǎn)物。
表1 引物序列
1.2.2AmPIF4基因表達(dá)分析AmPIF4基因時(shí)空表達(dá)分析:(1)采集花蕾期、初開(kāi)期、半開(kāi)期和盛開(kāi)期4個(gè)時(shí)期的花朵,以AmUBI(ubiquitin)為內(nèi)參基因進(jìn)行定量分析,引物見(jiàn)表1;(2)采集金魚(yú)草植株不同器官及組織樣品[根、莖、葉、萼片、子房、花藥、花絲、雌蕊、上瓣與下瓣(將金魚(yú)草花瓣三瓣部分定義為上瓣,兩瓣部分為下瓣)、花筒],進(jìn)行qRT-PCR檢測(cè);侵染后AmPIF4基因表達(dá)分析:提取侵染后金魚(yú)草花瓣上下瓣混樣作為樣品,方法同上。
1.2.3 侵染后金魚(yú)草花香成分測(cè)定植株在培養(yǎng)間生長(zhǎng) 7 d,觀(guān)察表型變化即花瓣周邊有卷曲、質(zhì)感變硬,但生長(zhǎng)狀態(tài)良好。為了不損傷植物,采用頂空套袋方法收集花香揮發(fā)物,GC-MS 分析花香,具體步驟同趙靜等[17]的實(shí)驗(yàn)方法。
1.2.4AmPIF4基因生物信息學(xué)分析在NCBI上使用blast對(duì)AmPIF4基因序列全長(zhǎng)進(jìn)行同源檢索,下載相似性較高的物種蛋白序列,使用DNAMAN和MAGA7對(duì)序列進(jìn)行同源比對(duì)和進(jìn)化樹(shù)分析;使用ExPASy分析蛋白一級(jí)結(jié)構(gòu)及理化性質(zhì),并使用 SOPMA(https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html)預(yù)測(cè)二級(jí)結(jié)構(gòu)。
1.2.5 AmPIF4亞細(xì)胞定位及pNC-Green-SubC-AmPIF4重組載體構(gòu)建通過(guò)網(wǎng)站(http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/Cell-PLoc-2/)預(yù)測(cè)AmPIF4定位在細(xì)胞核。根據(jù)AmPIF4 的CDS序列設(shè)計(jì)去終止子引物Z-AmPIF4-F和Z-AmPIF4-R,即反向引物中不包含終止密碼子??寺〔⒒厥誔CR產(chǎn)物,連接pclone007后轉(zhuǎn)入DH5α,經(jīng)鑒定后提取陽(yáng)性質(zhì)粒進(jìn)行測(cè)序,得到去除終止子的質(zhì)粒。使用帶有通用接頭的引物JT-AmPIF4-F和JT-AmPIF4-R進(jìn)行擴(kuò)增,同時(shí)使用SfiI (TaKaRa公司)1 μL,Cut Smart Buffer 5 μL, pNC-Green-SubC 載體3 μL,補(bǔ)充無(wú)菌水至20 μL,50 ℃條件酶切 1.5 h。
使用回收擴(kuò)增產(chǎn)物0.75 μL和酶切產(chǎn)物1.75 μL,2×Seaming Less Mix (TaKaRa公司)無(wú)縫連接酶預(yù)混液2.5 μL,50 ℃條件連接15 min后轉(zhuǎn)入DH5α,涂布于含卡那霉素(50 μg/mL)的平板37 ℃過(guò)夜培養(yǎng)。挑取單菌落經(jīng)PCR鑒定提取陽(yáng)性質(zhì)粒進(jìn)行測(cè)序比對(duì),顯示成功構(gòu)建pNC-Green-SubC-AmPIF4重組載體。使用pNC-GFP空載體作為陰性對(duì)照。
1.2.6 病毒重組載體pTRV2-AmPIF4的構(gòu)建對(duì)pTRV2載體進(jìn)行酶切,酶切及連接體系同上。pTRV載體構(gòu)建如圖1所示。
35S.35S啟動(dòng)子;CP.外殼蛋白; Rz.自裂核酶;NOSt. 硝酸鉀合酶終止子圖1 pTRV2-AmPIF4重組載體示意圖35S. 35S promoter; CP. Coat protein; Rz. Self-cleaving ribozyme; NOSt. Nopaline synt hase terminatorFig.1 Schematic diagram of the recombinant vector pTRV2-AmPIF4
1.2.7 農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化與侵染將pTRV2-AmPIF4與pTRV質(zhì)粒采用凍融法分別轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌GV3101后涂布于含卡那霉素(50 μg/mL)與利福平(100 μg/mL)的平板,倒置于28 ℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)48~96 h。挑取單菌落于相應(yīng)抗性及濃度的LB培養(yǎng)基25 mL,28 ℃、200 r/min培養(yǎng)12~24 h。6 000 r/min集菌5 min后加入侵染液(含10 mol/L MgCl2、MES,200 μL/L AS)振蕩懸浮菌體,調(diào)整菌液OD600為1.0左右。將含有pTRV2-AmPIF4、pTRV2與pTRV1的侵染液以1∶1比例混合,黑暗3 h。用一次性注射器對(duì)金魚(yú)草花瓣、莖、葉進(jìn)行注射。
pNC-Green-SubC-AmPIF4和pNC-GFP質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化方式同上,菌液OD600為0.8,通過(guò)注射煙草葉片背部進(jìn)行侵染。侵染后的植株在21 ℃、濕度30%培養(yǎng)間黑暗放置12 h后,進(jìn)行16 h光照/8 h黑暗培養(yǎng)7 d。
1.2.8 統(tǒng)計(jì)分析選擇長(zhǎng)勢(shì)良好且一致的實(shí)驗(yàn)材料,從不同植株采集混樣,均進(jìn)行3個(gè)生物學(xué)重復(fù)。所有實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)采用Excel進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,以SPSS22.0 one-way ANOVA進(jìn)行差異顯著性分析。
瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果(圖2)顯示,在約1 500 bp附近出現(xiàn)明亮的條帶,條帶清晰且單一,純化回收目的條帶,測(cè)序結(jié)果表明成功克隆AmPIF4基因編碼區(qū)序列全長(zhǎng),可用于構(gòu)建pTRV2-AmPIF4重組載體。
圖2 AmPIF4基因擴(kuò)增結(jié)果Fig.2 PCR detection result of AmPIF4 gene
AmPIF4基因CDS全長(zhǎng)1 498 bp,由498個(gè)氨基酸組成,預(yù)測(cè)其編碼產(chǎn)物分子量為55.58 kD,等電點(diǎn)為6.44,呈弱酸性。20種氨基酸參與該蛋白的編輯,其中絲氨酸(Ser)含量最高,占11.6%,脯氨酸(Pro)次之,色氨酸(Trp)含量最少,僅有1.2%;AmPIF4包含113個(gè)氨基酸殘基的α-螺旋,占總氨基酸殘基總數(shù)的22.69%;包含24個(gè)氨基酸殘基的延伸鏈,占總氨基酸殘基的4.82%;包含10個(gè)氨基酸殘基的β-折疊,占氨基酸殘基數(shù)的2.01%;包含351個(gè)無(wú)規(guī)則卷曲,占總氨基酸殘基數(shù)的70.48%。
將AmPIF4完整的開(kāi)放閱讀框推測(cè)的氨基酸序列與其他植物進(jìn)行同源檢索(圖3),該序列與芝麻(Sesamumindicum)、旋蒴苣苔(Dorcocerashygrometricum)的相似性分別達(dá)到58.32%和52.30%。用MEGA7.0構(gòu)建進(jìn)化樹(shù),將AmPIF4蛋白與其他18種植物進(jìn)行比對(duì)(圖5),金魚(yú)草與旋蒴苣苔聚為一類(lèi),與芝麻、丹參(Salviamiltiorrhiza)親緣關(guān)系較近。
從GFP信號(hào)檢測(cè)可知,對(duì)照pNC-GFP定位于細(xì)胞的整個(gè)原生質(zhì)體(圖4,A),而pNC-Green-SubC-AmPIF4定位于煙草表皮細(xì)胞的細(xì)胞核(圖4,B),表明AmPIF4特異定位在細(xì)胞核中。
A. pNC-GFP;B. pNC-Green-SubC-AmPIF4圖4 AmPIF4蛋白的亞細(xì)胞定位Fig.4 Subcellular localization of AmPIF4 protein
圖5 AmPIF4蛋白與其他18種植物PIF4蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化分析Fig.5 Phylogenetic analysis of PIF4 proteins of snapdragon and other 18 plants
由花朵形態(tài)特征的變化將金魚(yú)草發(fā)育時(shí)期分為4個(gè)階段:花蕾期、初開(kāi)期、半開(kāi)期和盛開(kāi)期(圖6,A)。從花蕾期到盛開(kāi)期,AmPIF4基因的相對(duì)表達(dá)量逐漸增加,在盛開(kāi)期達(dá)到最高(圖6,B),花蕾期、初開(kāi)期相對(duì)表達(dá)量相差不大,而相比于半開(kāi)期、盛開(kāi)期達(dá)到顯著差異水平。
A. 金魚(yú)草花朵不同發(fā)育時(shí)期;B. 不同發(fā)育時(shí)期AmPIF4基因的相對(duì)表達(dá)量;C. 盛開(kāi)期金魚(yú)草花朵不同器官及組織中AmPIF4基因的相對(duì)表達(dá)。不同小寫(xiě)字母表示差異顯著 (P<0.05),下同圖6 AmPIF4基因的表達(dá)A. Different developmental stages of snapdragon flowers;B.Relative expression level of AmPIF4 gene at four flower developmental stages; C.Relative expression of AmPIF4 gene in different organs of fully opened flower and tissues. Different normal letters on the bar represent significant difference (P<0.05), the same as belowFig.6 qRT-PCR qualitative analysis of AmPIF4 gene
盛開(kāi)期花朵不同組織中,萼片中AmPIF4基因的相對(duì)表達(dá)量最高,其次是子房、雌蕊,差異均達(dá)顯著水平;上瓣與下瓣次之,且上下瓣AmPIF4基因的相對(duì)表達(dá)量基本一致;金魚(yú)草花朵其他組織中花藥的相對(duì)表達(dá)量最高,花絲次之,而花筒最低,差異顯著。
盛開(kāi)期花朵以外其他器官,即根、莖、葉中AmPIF4基因的相對(duì)表達(dá)量的結(jié)果表明,葉片中AmPIF4基因的相對(duì)表達(dá)量在盛開(kāi)期金魚(yú)草植株中最高,與莖中的相對(duì)表達(dá)量差異不顯著,而與根中差異十分顯著(圖6,C)。
綜上所述,AmPIF4基因在盛開(kāi)期金魚(yú)草植株葉片中相對(duì)表達(dá)量最高,花筒中最低。
由圖7可得,在花瓣中重組病毒載體pTRV2-AmPIF4侵染組的AmPIF4基因相對(duì)表達(dá)量較WT下降65%,較陰性對(duì)照組下降45%,差異達(dá)到顯著水平(P<0.05),表明AmPIF4成功被沉默。
WT.野生型;pTRV.陰性對(duì)照;pTRV2-AmPIF4.重組病毒載體圖7 沉默后AmPIF4基因的qRT-PCR結(jié)果WT. Wild type; pTRV. Negative control; pTRV2-AmPIF4. Recombinant virus vectorFig.7 qRT-PCR qualitative analysis of AmPIF4 gene silencing
以WT野生型組、pTRV陰性對(duì)照組和pTRV2-AmPIF4重組病毒載體組植株為實(shí)驗(yàn)材料,圖8顯示了侵染前后金魚(yú)草釋放的主要花香物質(zhì)中苯甲酸甲酯、月桂烯和羅勒烯的相對(duì)含量。其中,pTRV2-AmPIF4重組病毒載體組植株釋放的羅勒烯和苯甲酸甲酯含量與WT野生型組、pTRV陰性對(duì)照組相比均顯著增加,并以羅勒烯的含量增加尤其顯著。
圖8 金魚(yú)草花瓣中各類(lèi)花香物質(zhì)的含量Fig.8 Relative contents of the floral substance in snapdragon petals
另外,由圖8可得,與陰性對(duì)照相比,沉默AmPIF4后金魚(yú)草花瓣主要花香揮發(fā)物成分月桂烯、羅勒烯和苯甲酸甲酯釋放量分別上升了 22%、24%和12%,花香釋放量總體含量上升。說(shuō)明AmPIF4對(duì)金魚(yú)草主要花香成分的合成釋放存在負(fù)調(diào)控作用。
PIFs轉(zhuǎn)錄因子已經(jīng)在多種植物中得到克隆,研究明確MdPIF4在蘋(píng)果溫度響應(yīng)中的作用具有重要意義[20],GmPIF1在大豆形態(tài)建成中起作用,且促進(jìn)黃酮類(lèi)物質(zhì)的產(chǎn)生[21],ZmPIFs是植物避蔭反應(yīng)的正調(diào)控因子,在調(diào)節(jié)玉米光信號(hào)和光形態(tài)建成中具有保守和獨(dú)特的分子特性[22],而PIFs在金魚(yú)草中的作用還未曾報(bào)道。
本研究克隆了金魚(yú)草AmPIF4基因編碼區(qū)序列,農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)化煙草細(xì)胞瞬時(shí)表達(dá)結(jié)果顯示AmPIF4蛋白定位在細(xì)胞核;檢測(cè)到AmPIF4基因在不同的發(fā)育時(shí)期及各個(gè)組織中均有表達(dá),金魚(yú)草花香成分主要在花瓣中合成釋放[17],而不同組織及器官的qPCR結(jié)果顯示AmPIF4在金魚(yú)草植株的葉片、莖等綠色組織及器官中的表達(dá)量高于花瓣,這與MdPIF4在蘋(píng)果葉片中的表達(dá)量最高,其次為根、莖、花,在果實(shí)中的表達(dá)量最低的結(jié)果一致[20]。
最近研究發(fā)現(xiàn),PIFs可通過(guò)光信號(hào)傳導(dǎo)參與植物形態(tài)建成,控制植物生長(zhǎng)發(fā)育。擬南芥在受光后,藍(lán)光和紅光激活的光感受器通過(guò)抑制轉(zhuǎn)錄因子PIFs的活性使下胚軸停止伸長(zhǎng)[23]。同樣,PIFs可以響應(yīng)光及溫度的變化進(jìn)一步影響植物開(kāi)花以及次生代謝等,PIF4轉(zhuǎn)錄因子與植物控制開(kāi)花的基因如ELF、FT等形成復(fù)雜的基因網(wǎng)絡(luò),研究證明其參與調(diào)控日變溫條件下植物早花[24],AtPIF4通過(guò)抑制擬南芥AtPAP1的轉(zhuǎn)錄而負(fù)調(diào)控花青素的積累[25],PIF3也被證明與草莓花青素的積累有關(guān)[26],PIF4和PIF5調(diào)控?cái)M南芥油菜素內(nèi)酯合成[27]。
目前關(guān)于PIFs轉(zhuǎn)錄因子的研究仍然集中在逆境應(yīng)答和形態(tài)建成方面[28],且PIFs對(duì)光信號(hào)響應(yīng)的報(bào)道全部來(lái)自葉片,花瓣中少見(jiàn)。本研究成功地利用同源重組的方法構(gòu)建了pTRV2-AmPIF4載體,使AmPIF4基因在金魚(yú)草植株有效沉默,經(jīng)過(guò)GC-MS花香揮發(fā)物質(zhì)測(cè)定,結(jié)果分析表明,沉默后的金魚(yú)草主要花香物質(zhì)羅勒烯、月桂烯與苯甲酸甲酯含量有不同程度的增加,說(shuō)明AmPIF4對(duì)萜烯類(lèi)花香成分以及苯甲酸甲酯的合成釋放存在負(fù)調(diào)控的作用。
研究為PIF4轉(zhuǎn)錄因子的功能研究提供信息,同時(shí)對(duì)光誘導(dǎo)的花香代謝調(diào)控的研究提供新的思路。植物花香物質(zhì)前體來(lái)自葉片光合產(chǎn)物,而后續(xù)代謝途徑在花瓣中進(jìn)行,PIFs介導(dǎo)的光信號(hào)途徑是否直接調(diào)控萜烯合成途徑與苯丙氨酸代謝途徑仍需進(jìn)一步工作證實(shí),后續(xù)仍需要對(duì)AmPIF4進(jìn)行生物學(xué)功能、調(diào)控途徑以及作用機(jī)制等方面的研究。