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        中國(guó)驢品種資源現(xiàn)狀及其分子遺傳育種研究進(jìn)展

        2022-01-20 03:51:02韓瑞麗張獻(xiàn)珍
        中國(guó)畜牧雜志 2022年1期
        關(guān)鍵詞:德州種質(zhì)基因組

        韓瑞麗,張獻(xiàn)珍,李 明*

        (1.河南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,河南鄭州 450046;2.長(zhǎng)垣職業(yè)中等專業(yè)學(xué)校農(nóng)學(xué)院,河南長(zhǎng)垣 453400)

        在人類文明發(fā)展史中,驢()在農(nóng)耕、運(yùn)輸、飲食等領(lǐng)域做出了重要貢獻(xiàn),驢和馬的雜交后代騾子具有優(yōu)良的性能,比如騾子的體力、生命力和抗病力比驢強(qiáng),飼料利用率高,體質(zhì)結(jié)實(shí),肢蹄強(qiáng)健,富持久力,易于駕馭,同時(shí)也為種間雜交及雜種優(yōu)勢(shì)學(xué)說(shuō)提供了有力證明。據(jù)史料記載,中國(guó)在公元前4 000年左右殷商銅器時(shí)代就馴養(yǎng)驢,并開始繁殖其雜種,由于數(shù)量稀少而被當(dāng)作稀貴家畜。我國(guó)是驢資源極為豐富的國(guó)家,中國(guó)驢有著獨(dú)特性能和經(jīng)濟(jì)研究?jī)r(jià)值,如藏驢的耐低氧性,德州驢的肉用、皮用性能,及大多驢品種具有耐粗飼、抗逆性等特性。此外,驢肉鮮美,驢皮又是制作阿膠至關(guān)重要的材料,同時(shí)具有競(jìng)技、康養(yǎng)、文化等新時(shí)期豐富的社會(huì)功能,因此驢種質(zhì)資源在畜禽種質(zhì)資源中有獨(dú)特地位。

        近30年來(lái),伴隨著農(nóng)業(yè)機(jī)械化快速發(fā)展,驢的主要用途役用性能廢退,全國(guó)驢存欄量急劇減少。一直以來(lái),驢沒有專門化的皮、肉、奶用品種,其相關(guān)經(jīng)濟(jì)性狀的遺傳基礎(chǔ)方面的研究也極為缺乏。由于家驢在我國(guó)很少有規(guī)?;B(yǎng)殖,缺乏科學(xué)系統(tǒng)的性能記錄、飼養(yǎng)管理和選育,導(dǎo)致驢種質(zhì)水平逐年降低。但隨著社會(huì)發(fā)展及人民生活水平的提高,以阿膠為代表的驢產(chǎn)品暢銷,驢皮價(jià)格持續(xù)走高,加上驢肉需求量越來(lái)越大,養(yǎng)驢效益逐年提高,養(yǎng)驢業(yè)逐漸成為我國(guó)畜牧業(yè)的特色產(chǎn)業(yè)?;诖?,本文針對(duì)我國(guó)驢品種資源概況、保護(hù)利用存在的問題以及驢分子遺傳育種方面的研究進(jìn)展進(jìn)行綜述,以期為驢品種的選育、保護(hù)、開發(fā)利用提供參考。

        1 我國(guó)驢品種、類型及其重要價(jià)值

        中國(guó)驢遺傳資源豐富,據(jù)《馬驢駝品種志》記載,我國(guó)驢地方品種共24個(gè),驢品種名稱及產(chǎn)地見表1。

        表1 我國(guó)驢品種名稱及產(chǎn)地

        驢按其體型特征可分為大型驢、中型驢和小型驢3種類型。大型驢的體高高于130 cm,體重在260 kg 左右,主要分布在平原地區(qū),比如山東的德州驢、陜西關(guān)中驢、山西的晉南驢和廣靈驢等。中型驢品種的體高在110~130 cm,體重在180 kg 左右,主要分布在高原地區(qū),比如陜西省的佳米驢、甘肅省的慶陽(yáng)驢和平原地區(qū)河南省的沁陽(yáng)驢等。小型驢體高低于110 cm,體重在130 kg 左右,包括新疆驢、云南驢、涼州驢、川驢和青海毛驢等,小型驢分布范圍較廣,主要分布在西藏、新疆、內(nèi)蒙古、甘肅、寧夏、陜西以及四川、云南等地。從地區(qū)分布可以看出,南方地區(qū)及東部沿海地區(qū)幾乎不養(yǎng)驢。

        驢具有重要的役用、肉用、藥用價(jià)值,因而備受人們重視。驢肉鮮香細(xì)嫩,是典型的高蛋白低脂肪食物,富含人體需要的微量元素和維生素。中醫(yī)上,驢肉性平,有補(bǔ)血、益氣功效,主治勞損、風(fēng)眩和心煩等;驢乳味甘、性寒,主治黃疸、風(fēng)熱赤眼等;其含有的動(dòng)物膠、骨膠原能為體弱、病后調(diào)養(yǎng)的人提供良好的營(yíng)養(yǎng)補(bǔ)充。驢皮是制造名貴中藥阿膠的主要原料,具有補(bǔ)血、止血、滋陰潤(rùn)肺的功能。驢產(chǎn)品具有很高的開發(fā)價(jià)值,近幾年來(lái),我國(guó)驢業(yè)發(fā)展緩慢的態(tài)勢(shì)有所改觀,驢產(chǎn)品市場(chǎng)需求的剛性增長(zhǎng)為驢業(yè)發(fā)展帶來(lái)巨大潛力。

        2 我國(guó)驢品種資源數(shù)量、保護(hù)現(xiàn)狀及存在問題

        2018年底我國(guó)驢存欄量為253.28 萬(wàn)頭,占世界驢存欄量(4 412.56萬(wàn)頭)的5.74%。2009—2018年我國(guó)驢存欄量從540.35萬(wàn)頭下降到253.28萬(wàn)頭,下降53.12%,其主要原因是役用功能不斷萎縮以及驢本身的繁殖效率低、繁育速度慢等生物學(xué)特性。2019年,受繁育母驢價(jià)格低的影響,驢存欄量稍有上升,達(dá)260.1萬(wàn)頭;2020年一季度受春節(jié)前集中出欄和新冠肺炎疫情影響,存欄量有所增加。

        鑒于此,近些年國(guó)家也進(jìn)行了積極的保護(hù)工作。2014年,我國(guó)將關(guān)中驢、德州驢、廣靈驢、泌陽(yáng)驢、新疆驢5個(gè)驢種列為《國(guó)家級(jí)畜禽遺傳資源保護(hù)名錄》。建成關(guān)中驢、德州驢、廣靈驢、泌陽(yáng)驢4個(gè)驢種國(guó)家級(jí)保種場(chǎng)。建成關(guān)中驢、德州驢、新疆驢3個(gè)驢品種國(guó)家級(jí)保護(hù)區(qū)。單純的保護(hù)不足以阻擋其瀕危狀態(tài),目前我國(guó)驢品種中70%以上已經(jīng)處于數(shù)量大幅下降或?yàn)l危狀態(tài),大多數(shù)驢品種的性狀退化嚴(yán)重、種質(zhì)差,不同種質(zhì)資源沒有明顯界限,種質(zhì)資源標(biāo)準(zhǔn)缺乏,外血盲目導(dǎo)入。由于長(zhǎng)期以來(lái)驢產(chǎn)業(yè)不受重視,沒有皮、肉、奶專門化品種,相比于其他畜種,驢相關(guān)經(jīng)濟(jì)性狀遺傳基礎(chǔ)研究較為缺乏,因此我國(guó)驢產(chǎn)業(yè)發(fā)展嚴(yán)重滯后于牛羊豬等畜種產(chǎn)業(yè)。高校和研究院所在驢產(chǎn)業(yè)學(xué)科建設(shè)、科研經(jīng)費(fèi)方面投入不足,研究人員出現(xiàn)斷層、科研進(jìn)展緩慢等問題。但隨著驢產(chǎn)品市場(chǎng)行情利好和群眾對(duì)健康養(yǎng)生需求的變化,目前驢產(chǎn)業(yè)又重新得以發(fā)展。近些年來(lái),國(guó)內(nèi)外圍繞驢各方面的研究每年以2 000篇左右的論文發(fā)表,主要涉及驢肉品質(zhì)與胴體性狀、理化特性,驢奶蛋白組分、及驢種群多樣性研究等。最近,國(guó)外也公布了驢基因組水平和染色體級(jí)別的參考基因組。

        3 驢品種分子遺傳育種研究進(jìn)展

        隨著分子生物學(xué)、遺傳學(xué)、基因組學(xué)的發(fā)展,動(dòng)物遺傳育種也由常規(guī)的表型選擇發(fā)展到標(biāo)記輔助選擇、基因組選擇,這些技術(shù)理論的發(fā)展也為挖掘驢重要經(jīng)濟(jì)性狀的功能基因、分子標(biāo)記提供了可能。伴隨著新技術(shù)的發(fā)展,中國(guó)對(duì)于驢品種的分子遺傳育種的研究主要集中在我國(guó)地方驢遺傳多樣性及起源、功能基因、小RNA和主要性狀分子標(biāo)記等方面的研究。

        3.1 我國(guó)地方驢遺傳多樣性及起源研究 關(guān)于驢遺傳多樣性和起源,朱文進(jìn)等用29對(duì)微衛(wèi)星分析了我國(guó)地方驢種的遺傳變異及其群體遺傳結(jié)構(gòu),將大型品種關(guān)中驢、晉南驢、廣靈驢、德州驢和中型品種慶陽(yáng)驢聚為一類,中型品種泌陽(yáng)驢、淮陽(yáng)驢和佳米驢聚為另一類。Zhang等研究表明,中國(guó)國(guó)內(nèi)驢種具有較高的遺傳多樣性和雜合度。新疆、慶陽(yáng)、西吉、關(guān)中驢品種之間存在著較近的遺傳距離。系統(tǒng)發(fā)生樹顯示,中國(guó)驢種的遺傳關(guān)系與其地理分布和繁殖歷史是一致的。Zeng等研究表明中國(guó)本土驢雖然遺傳變異豐富,但中國(guó)驢品種間的遺傳分化相對(duì)較低,將12個(gè)驢種分成兩大組:一組包括西吉、新疆、涼州、庫(kù)倫、關(guān)中等驢種;另一組包含了貢沙、德州、泌陽(yáng)、太行、家米、慶陽(yáng)和青海驢種。

        利用線粒體,尤其是mtDNA D-Loop的遺傳多樣性進(jìn)行驢遺傳多樣性研究,孫偉麗等通過對(duì)分布區(qū)域具有典型代表的德州驢、關(guān)中驢、涼州驢和新疆驢95個(gè)個(gè)體mtDNA D-環(huán)進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)中國(guó)家驢可能有2個(gè)母系起源,并提示德州驢保種效果好,新疆驢需要加強(qiáng)保護(hù)。趙朝霞等對(duì)中國(guó)的6個(gè)家驢品種(德州驢、關(guān)中驢、泌陽(yáng)驢、慶陽(yáng)驢、廣靈驢、晉南驢)的mtDNA D-Loop序列進(jìn)行遺傳多樣性的研究,發(fā)現(xiàn)關(guān)中驢、晉南驢的單倍型多樣度較高,德州驢和慶陽(yáng)驢的單倍型多樣度較低。劉建斌等對(duì)中國(guó)9個(gè)家驢品種162個(gè)個(gè)體的mtDNA D-loop區(qū)385bp進(jìn)行遺傳多樣性和系統(tǒng)進(jìn)化分析,表明我國(guó)家驢的遺傳多態(tài)性豐富,我國(guó)家驢的母系起源是非洲野驢中的努比亞野驢和索馬里野驢,亞洲野驢不是中國(guó)家驢的母系祖先。鄭立等研究了河南3個(gè)驢種河南小毛驢、長(zhǎng)垣驢、泌陽(yáng)驢mtDNA D-loop區(qū)序列多態(tài)性及起源進(jìn)化分析,結(jié)果表明河南省3個(gè)驢種具有較豐富的遺傳多樣性,屬于混合母系起源。李慧鋒等對(duì)晉南驢mtDNA D-loop保守區(qū)480 bp的片段進(jìn)行測(cè)序,結(jié)果表明晉南驢具有豐富的遺傳多樣性,但晉南驢群體有一定混雜,急需開展保種工作。伴隨著全基因組測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,Sun等通過對(duì)德州驢和云南驢進(jìn)行全基因組線粒體DNA測(cè)序,結(jié)果支持中國(guó)家驢品種可能起源于索馬里野驢,而非亞洲野驢的假設(shè)。對(duì)驢線粒體序列的分子研究已經(jīng)清楚地確定了兩個(gè)不同的母系譜系。Ma等選用獲得的171個(gè)序列(包括中亞、東亞和非洲的樣本)加上536個(gè)已發(fā)表的序列(包括歐洲、亞洲和非洲的樣本),根據(jù)線粒體全基因組和部分非編碼D環(huán)(d-loop)序列,這兩個(gè)家系被明確地分開,從多樣性衰退推斷的遷徙路線表明,兩個(gè)世系在中國(guó)各地有不同程度的擴(kuò)張。總的來(lái)說(shuō),這兩個(gè)血統(tǒng)沒有同時(shí)被馴化。以上這些研究為我國(guó)驢種質(zhì)資源的保護(hù)、開發(fā)利用提供了重要信息。

        3.2 驢重要性狀相關(guān)基因及小RNA組學(xué)研究 Huang等首次描繪了家驢和蒙古野驢的基因組精細(xì)圖譜,其中家驢基因組測(cè)序覆蓋度達(dá)42.4X,拼接得到基因組大小2.36 Gb,Scaffold N50為3.8 Mb。郭怡君對(duì)德州驢和新疆驢皮組織進(jìn)行RNA-seq測(cè)序,進(jìn)行了全基因組范圍內(nèi)的可變剪切圖譜鑒定、可變剪切的基因組織特異性及分析可變剪切食草性物種間差異;并預(yù)測(cè)了新轉(zhuǎn)錄本和lincRNAs,豐富了驢的全基因組注釋結(jié)果。韓浩園等利用RNA-Seq分析了泌陽(yáng)驢和德州驢品種間睪丸組織差異表達(dá)基因及microRNA,結(jié)果表明泌陽(yáng)驢和德州驢品種間差異不明顯,但發(fā)現(xiàn)等6個(gè)基因存在9個(gè)錯(cuò)義突變。劉迥等應(yīng)用RT-qPCR技術(shù)分別檢測(cè)2~3歲健康公、母新疆驢脂肪沉積相關(guān)基因和基 因的組織表達(dá)譜。目前也已對(duì)驢鋅指蛋白()基因、鈣蛋白酶1()基因CDS區(qū)進(jìn)行克隆及生物信息學(xué)分析,并鑒定其在驢各組織中的表達(dá)量。這些研究為我國(guó)驢重要性狀功能基因的研究提供參考。

        3.3 驢重要性狀分子標(biāo)記的研究 驢重要性狀功能基因分子標(biāo)記的研究主要集中在與生長(zhǎng)、與毛色、乳用性狀、皮用性狀相關(guān)的基因。Lai等、侯浩賓等選用與動(dòng)物生長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)的A和作為候選基因挖掘與德州驢生長(zhǎng)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記,結(jié)果顯示基因內(nèi)含子存在3個(gè)插入和2個(gè)缺失,且顯著關(guān)聯(lián)德州驢體重等生長(zhǎng)性狀;NCAPG-DCAF16基因區(qū)域5個(gè)SNPs位點(diǎn)對(duì)生長(zhǎng)性狀均有顯著影響,特別是rs008位點(diǎn)與德州驢體重、體高等重要生長(zhǎng)性狀極顯著相關(guān)。王顏顏等應(yīng)用PCRSSCP技術(shù)對(duì)新疆和田和喀什良種驢群體的基因進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性檢測(cè),結(jié)果顯示基因第3內(nèi)含子有兩種等位基因A和B,存在AA和AB兩種基因型,AB型體高、胸圍和體長(zhǎng)高于AA型。高琦璨研究顯示和基因突變可導(dǎo)致德州驢脊椎數(shù)目的變異,其分別與德州驢腰椎數(shù)和胸椎數(shù)變異相關(guān),可作為標(biāo)記輔助選擇提高選種的效率和準(zhǔn)確性。畢蘭舒等研究表明基因存在g.29764584C>G多態(tài)位點(diǎn),其雜合基因型個(gè)體平均日泌乳量顯著高于野生純合基因型,野生純合基因型個(gè)體乳蛋白率顯著高于雜合基因型,乳糖率差異不顯著。蘇詠梅等利用直接測(cè)序與PCRRFLP技術(shù),Wang等利用全基因組測(cè)序?qū)H毛色相關(guān)的分子標(biāo)記進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)了可以區(qū)分黑色驢與非黑色驢的分子標(biāo)記。這些研究都為驢專門化品種的培育提供了強(qiáng)有力的參考。

        4 小結(jié)和展望

        鑒于目前國(guó)內(nèi)驢品種資源的現(xiàn)狀,對(duì)一些瀕危的驢品種應(yīng)給予重點(diǎn)保護(hù)、多層次多手段保護(hù)。同時(shí),應(yīng)加強(qiáng)對(duì)驢種質(zhì)資源特征特性及其重要經(jīng)濟(jì)性狀的研究,整體提高中國(guó)驢品種的生產(chǎn)水平。近些年,隨著動(dòng)物遺傳育種新技術(shù)的發(fā)展,常見家畜重要性狀形成的遺傳機(jī)制不斷被揭示,如何運(yùn)用在其他畜禽上(尤其是馬屬動(dòng)物)鑒定出來(lái)的重要性狀的功能基因和分子標(biāo)記作為驢品種的候選基因,進(jìn)行功能驗(yàn)證或應(yīng)用是未來(lái)研究的方向之一。伴隨著全基因組測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,定位、分離、克隆出與驢產(chǎn)肉、產(chǎn)奶、產(chǎn)皮、抗病、抗逆性等相關(guān)的功能基因并用來(lái)提高驢的重要經(jīng)濟(jì)性能是未來(lái)研究重點(diǎn)。為此首先需要建立驢品種表型數(shù)據(jù)庫(kù)和種質(zhì)資源基因庫(kù)共享平臺(tái),然后通過對(duì)其重要經(jīng)濟(jì)性狀和特色性狀進(jìn)行系統(tǒng)評(píng)價(jià),為驢種質(zhì)資源保護(hù)利用、專門化品種培育提供理論依據(jù)。

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