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        基于LSEIR模型定量評估廣州市新冠疫情防控效果*

        2022-01-19 08:38:12歐春泉
        中國衛(wèi)生統(tǒng)計 2021年6期
        關(guān)鍵詞:廣州市反應(yīng)時間規(guī)模

        史 晨 楊 琳 錢 俊 羅 雷 歐春泉△

        【提 要】 目的 模擬并比較不同防控措施的干預(yù)效果,為新冠疫情防控措施的制定提供科學參考。方法 考慮動態(tài)有效接觸率及輸入病例的影響,構(gòu)建LSEIR模型,估計廣州市新型冠狀病毒傳播的基本參數(shù),評估不同干預(yù)措施對疫情的影響。結(jié)果 截至2020年3月17日,廣州共確診354例,以輸入病例為主。LSEIR模型R2為0.94。模擬估計廣州綜合防控效率約為94%,而若防控效率降低為80%、70%,疫情規(guī)模將擴大11.96%、24.73%。若杜絕發(fā)病者輸入,疫情規(guī)模下降29.24%;若使發(fā)病者提前4天被發(fā)現(xiàn),疫情規(guī)模下降15.83%。若采取綜合防控措施的應(yīng)急反應(yīng)時間慢5天,疫情規(guī)模擴大29.01%;若快5天,疫情規(guī)模下降21.36%。若新冠疫苗接種率為30%、50%、70%時,本地疫情規(guī)模將分別下降37.85%、57.70%、76.24%。結(jié)論 謹防輸入,采取有力監(jiān)控措施,縮短應(yīng)急反應(yīng)時間,提高綜合防控效率是關(guān)鍵。新冠疫苗的研發(fā)和一定的人群接種率是防止新冠傳播的最高效措施。

        當前新型冠狀病毒在全球廣泛傳播,各地區(qū)紛紛出臺防控政策,迫切需要評估各類干預(yù)措施對疫情的影響。國內(nèi)外有不少研究估計防控下有效再生數(shù)的變化[1-6],這在一定程度上能反映總體干預(yù)的效果,但無法分辨各類具體干預(yù)的實際效果。傳統(tǒng)的SEIR模型假設(shè)日均有效接觸率為常數(shù),而在實際防控工作中,由于不同防控措施在不同階段加入,有效接觸率會隨時間變化。曹志冬等[7]引入logistic曲線模擬時變有效接觸率,提出LSEIR模型,評估2003年廣州市SARS疫情的防控,但2003年廣州市SARS以廣泛的社區(qū)傳播為主,而廣州市新冠以輸入為主[8]。因此,本研究在考慮輸入病例影響下引入LSEIR模型,基于廣州市個體數(shù)據(jù)建模,模擬不同干預(yù)情況下新冠的傳播規(guī)模,旨在定量分析不同防控措施的效果,對疫情防控提供指導(dǎo),同時也為其他地區(qū)的研究提供方法學的參考。

        資料與方法

        1.資料來源

        從廣州市疾控中心獲得廣州市所有新冠確診病例信息,時間截至2020年3月17日,之后基本為境外輸入病例,不納入分析。收集的信息包括人口學特征、來穗日期、發(fā)病日期、病例類型(按照發(fā)病前14天是否到過新冠流行的國家或地區(qū)區(qū)分本地病例及輸入病例)等。根據(jù)輸入病例來穗日期和發(fā)病日期確定其輸入時的身份。具體防控措施和啟動時間從廣州市人民政府網(wǎng)站獲取(http://www.gz.gov.cn/xw/tzgg/index.html),見圖1。

        圖1 廣州市新增新冠發(fā)病人數(shù)與主要干預(yù)措施的時間軸

        2.模型構(gòu)建

        由圖1得知,疫情前期由于缺乏及時有效的防控措施,日新增發(fā)病人數(shù)迅速升高;此后由于全省啟動防控一級響應(yīng)、要求群眾戴口罩以及封閉管理小區(qū)等干預(yù)措施的實施,日新增感染人數(shù)逐漸下降。這些措施主要影響到人群的有效接觸率,另外,若不區(qū)分輸入病例影響會高估新冠病毒在本地的傳播能力。因此,我們在SEIR模型基礎(chǔ)上引入logistic曲線模擬時變有效接觸率,且考慮輸入病例的影響,得到改進的logistic-SEIR(LSEIR)模型。人群轉(zhuǎn)化過程如圖2。

        圖2 LSEIR模型狀態(tài)轉(zhuǎn)移圖

        模型包含四類人群:易感者(S);潛伏者(E);發(fā)病者(I);移出者(R)。在隔離措施下,不考慮隔離者與易感者發(fā)生接觸,假設(shè)易感者流入流出差值變化不大,建立如下動力學模型:

        3.參數(shù)估計

        圖1可看出傳染病高峰期在疫情發(fā)生后20天左右。國內(nèi)大型研究報道:新冠潛伏期中位數(shù)為4天[10],發(fā)病到隔離、治療的平均時間為7天[11],以既往研究[9]作為參考,考慮上述先驗知識以及廣州市具體情況的不同,將模型中參數(shù)初始范圍設(shè)定為:0≤a≤1、0≤b≤1、0≤c≤2、15≤d≤35、0≤σ≤0.3、0.1≤γ≤0.3。通過循環(huán)迭代,根據(jù)均方誤差最小求出參數(shù)最優(yōu)估計值。

        結(jié) 果

        截至2020年3月17日,廣州市共確診354例,以輸入病例為主(71.47%)。確診病例中男性占48.59%,年齡集中在30~59歲(54.52%)。

        圖3 廣州市新冠傳播過程中LSEIR模型的最優(yōu)估計

        圖4A模擬杜絕發(fā)病者輸入對疫情規(guī)模的影響,發(fā)現(xiàn)若無輸入病例,總發(fā)病人數(shù)降為250人,疫情規(guī)模下降29.24%。圖4B表示若“四早”措施有效實施使發(fā)病者提前4天被發(fā)現(xiàn),疫情規(guī)模下降15.83%;若推遲4天,則擴大6.61%。圖4C模擬綜合實施干預(yù)的應(yīng)急反應(yīng)時間快5天和慢3天、5天的影響,可看出應(yīng)急反應(yīng)時間對疫情有較大影響,若不及時采取有效措施,前期疫情將迅速擴大感染。若應(yīng)急反應(yīng)時間比實際慢3天、5天,疫情規(guī)模將分別擴大16.17%、29.01%;若應(yīng)急反應(yīng)時間快5天,疫情規(guī)模下降21.36%。

        估計廣州市現(xiàn)有人為干預(yù)的綜合防控效率約為94%。圖4D模擬了綜合防控效率分別為70%、80%、99%時的影響。雖然綜合防控效率為99%時,疫情規(guī)模也只下降5.50%,但若防控效率有所下降,不僅會擴大疫情規(guī)模,而且會延長疫情的流行期,產(chǎn)生極大危害,若綜合防控效率降低為80%、70%,疫情規(guī)模會擴大11.96%、24.73%。

        圖4 不同干預(yù)情形對廣州市新冠疫情的影響

        模擬發(fā)現(xiàn)疫苗接種對新冠防控有明顯作用。接種率為30%、50%時,本地疫情規(guī)模下降37.85%、57.70%;疫苗接種率達到70%時,本地疫情規(guī)模將下降76.24%。

        討 論

        本文提出了考慮輸入病例的新冠傳播動力模型LSEIR,模型R2為0.94。根據(jù)再生數(shù)的變化圖,可看出在1月24日前后再生數(shù)逐漸下降,這得益于廣東省啟動防控一級響應(yīng),廣州市召開了新冠疫情防控會議,且武漢封城,新冠疫情已引起人群廣泛重視。

        廣州市新冠疫情以輸入病例為主,占總確診病例的71.47%。1例感染者以潛伏者身份于1月10日輸入,且第一例確診病例在1月21日被發(fā)現(xiàn)并隔離,該病例也為輸入病例。由此可見,廣州市新冠疫情是由輸入病例引起本地感染。此外,模擬發(fā)現(xiàn)若無輸入性發(fā)病者,疫情規(guī)模下降29.24%。因此,嚴防輸入是預(yù)防傳染性疾病在本地暴發(fā)的關(guān)鍵。

        我們的模擬顯示若發(fā)病者提前4天被發(fā)現(xiàn),則疫情規(guī)模下降15.83%,由于新冠潛伏期患者或隱性感染者也可能造成疾病傳播[12],因此,監(jiān)測過程中不僅要及時診斷并隔離已發(fā)病的感染者,通過高質(zhì)量的流行病學調(diào)查對密切接觸者進行診斷或隔離也是防控的關(guān)鍵。有研究指出疫情發(fā)展初期采取防控策略,可有效降低醫(yī)療資源需求,若措施更積極、防控效果更好,可短期內(nèi)撲滅疫情[13]。本研究也表明,疫情發(fā)生初期及時采取有效的防控措施不僅可控制疫情的擴散,也一定程度縮短傳染病流行時間。本文估計廣州新冠疫情拐點處參數(shù)d的值約為18.82,疫情流行時間在70天左右,現(xiàn)有綜合防控效率約為94%。但疫情防控工作的完善沒有上限,不斷優(yōu)化防控措施,縮短應(yīng)急反應(yīng)時間,提高綜合防控效率仍是疫情防控工作的重點。

        疫苗接種作為一級防護對于全面遏制新冠傳播至關(guān)重要。疫苗接種在控制疫情的同時,不僅不會犧牲社會活力和經(jīng)濟發(fā)展,且減小抗擊疫情的代價[14]。我們對不同疫苗接種率的模擬顯示,當僅有30%的人群接種時,本地疫情規(guī)模下降37.85%。

        本研究仍然存在一些局限性。本文僅基于一個城市在時間維度上進行研究,若能得到感染者的具體地理信息或獲得多城市數(shù)據(jù),同時在時空維度展開分析,可進一步驗證方法的可行性,并為不同地區(qū)提供有針對性的防控參考。此外,LSEIR模型未區(qū)分人群種類,而在實際疫情發(fā)展過程中不同人群感染率存在差異,有待基于更大的數(shù)據(jù)庫,分析傳染病疫情在不同人群中的傳播。

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