樊景超,閆燊,劉婷婷,滿芮,李好先,曹尚銀*
1.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)信息研究所,北京 100081
2.國(guó)家農(nóng)業(yè)科學(xué)數(shù)據(jù)中心,北京 100081
3.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹(shù)研究所,鄭州 450009
數(shù)據(jù)庫(kù)(集)基本信息簡(jiǎn)介
images/BZ_206_745_1986_1110_2071.pngimages/BZ_206_1110_1986_2267_2071.pngimages/BZ_206_745_2071_1110_2151.pngimages/BZ_206_1110_2071_2267_2151.pngimages/BZ_206_745_2151_1110_2232.pngimages/BZ_206_745_2231_1110_2312.pngimages/BZ_206_1110_2151_2267_2232.pngimages/BZ_206_745_2311_1110_2392.pngimages/BZ_206_1110_2231_2267_2312.pngimages/BZ_206_1110_2311_2267_2392.pngimages/BZ_206_745_2391_1110_2472.pngimages/BZ_206_1110_2391_2267_2472.png images/BZ_206_745_2472_1110_2552.pngimages/BZ_206_1110_2472_2267_2552.pngimages/BZ_206_745_2554_1110_3179.pngimages/BZ_206_1111_2554_2267_3179.png
images/BZ_207_273_295_737_771.pnghttp://dx.doi.org/10.12205/A0002.20201216.22.ds.0031(石榴)http://dx.doi.org/10.12205/A0002.20201216.22.ds.0032(柿子)http://dx.doi.org/10.12205/A0002.20201216.22.ds.0033(桃)http://dx.doi.org/10.12205/A0002.20201216.22.ds.0034(杏)http://dx.doi.org/10.12205/A0002.20201216.22.ds.0035(櫻桃)http://dx.doi.org/10.12205/A0002.20201216.22.ds.0036(棗)images/BZ_207_273_770_737_851.png科技基礎(chǔ)性工作專項(xiàng)(2012FY110100)數(shù)據(jù)庫(kù)(集)組成本數(shù)據(jù)集主要由石榴、核桃、獼猴桃、李、杏、棗、山楂、葡萄、桃、櫻桃、蘋(píng)果、柿、梨、板栗14個(gè)樹(shù)種共計(jì)1707個(gè)地方品種資源的實(shí)地照片組成。以樹(shù)種為單位建立子數(shù)據(jù)集,每個(gè)子數(shù)據(jù)集中包含各個(gè)品種的資源調(diào)查編號(hào)信息(xlsx格式)和以該編號(hào)、品種名命名的文件夾,每個(gè)文件夾中包含該品種大生境、小生境、整樹(shù)及葉、花、果以及突出種質(zhì)特性部位的照片(jpg格式)。
果樹(shù)產(chǎn)業(yè)作為世界農(nóng)產(chǎn)品三大支柱之一,其種質(zhì)資源是進(jìn)行新品種培育和基礎(chǔ)理論研究的重要源頭[1]。種質(zhì)資源的收集、調(diào)查工作一直都受到各國(guó)政府的重視和支持。種質(zhì)資源作為基礎(chǔ)理論研究、培育新品種等的重要資源,開(kāi)展相關(guān)研究不僅可以保留瀕臨滅絕的物種,保存對(duì)人類和自然具有重要、甚至是未知作用的基因,而且可以為其他學(xué)科的研究和科技創(chuàng)新提供研究材料和重要的科學(xué)數(shù)據(jù)。因此,各國(guó)都積極地進(jìn)行收集、鑒定和保存工作。國(guó)際植物遺傳資源研究所(IPGRI)、美國(guó)國(guó)家植物遺傳資源局(PGRB)、日本國(guó)力遺傳資源中心等都是各國(guó)收集、保存和研究種質(zhì)資源的專門(mén)部門(mén)。
我國(guó)是世界上最為重要的果樹(shù)起源中心之一,世界各國(guó)廣泛栽培的梨、桃、核桃、獼猴桃等落葉果樹(shù)樹(shù)種多源于我國(guó)[2]。農(nóng)家品種又稱為地方品種,是在特定地區(qū)經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期栽培和自然選擇而形成的品種,對(duì)所在地區(qū)的氣候和生產(chǎn)條件一般具有較強(qiáng)的適應(yīng)性,并包含豐富的基因型,具有豐富的遺傳多樣性,常存在特殊優(yōu)異的性狀基因,是果樹(shù)品種改良的重要基礎(chǔ)和優(yōu)良基因來(lái)源。發(fā)達(dá)國(guó)家已經(jīng)將其原產(chǎn)果樹(shù)樹(shù)種的地方品種進(jìn)行了詳細(xì)的調(diào)查和收集。新中國(guó)成立后,黨和政府十分重視果樹(shù)事業(yè)的發(fā)展。國(guó)務(wù)院在1956年擬定的全國(guó)科技遠(yuǎn)景規(guī)劃中提出“要調(diào)查、收集、保存、利用我國(guó)豐富的果樹(shù)品種資源”。農(nóng)業(yè)農(nóng)村部原農(nóng)業(yè)部也發(fā)出了“關(guān)于全面收集整理各地農(nóng)作物農(nóng)家品種工作的通知”。到1960年,全國(guó)已有18個(gè)?。▍^(qū))基本完成了野外調(diào)查任務(wù)。由于首次普查任務(wù)的成果因?yàn)闅v史的原因大多得而復(fù)失,1979年果樹(shù)資源考察工作又提上日程,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院組織了對(duì)西藏、云南、湖北等?。▍^(qū))的考察工作,這部分工作中最具代表性的是中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹(shù)研究所牽頭成立全國(guó)獼猴桃資源調(diào)查組,組織各省級(jí)自治區(qū)有關(guān)研究單位開(kāi)展的全國(guó)獼猴桃資源大普查。這次普查基本摸清了我國(guó)分步驟云南、西藏等27個(gè)省市自治區(qū)的獼猴桃屬植物資源。
由于歷史原因,野外資源考察工作未能保存足夠的圖像資料。即使有圖像資料,其色彩、清晰度等各方面也存在很多失真的地方。而且當(dāng)時(shí)沒(méi)有GPS導(dǎo)航設(shè)備,一些有關(guān)資源地域分布的描述并不確切。
通過(guò)收集網(wǎng)絡(luò)信息、查閱文獻(xiàn)、果樹(shù)志等途徑,從文字信息上大體掌握我國(guó)主要落葉果樹(shù)優(yōu)勢(shì)產(chǎn)區(qū)的地域分布,確定科學(xué)調(diào)查的主要區(qū)域和基本范圍。在實(shí)地走訪主要落葉果樹(shù)種植地區(qū)的過(guò)程中,一方面直接對(duì)當(dāng)?shù)厝诉M(jìn)行詢問(wèn),另一方面是通過(guò)當(dāng)?shù)亓謽I(yè)站、農(nóng)業(yè)局等單位協(xié)助調(diào)查,以此科學(xué)有效地確定調(diào)查的主要區(qū)域和主要樹(shù)種。本研究數(shù)據(jù)采集和處理過(guò)程包括農(nóng)家品種拍攝和數(shù)據(jù)處理及入庫(kù)。
到達(dá)現(xiàn)場(chǎng)確定調(diào)查對(duì)象后,鑒于品種的開(kāi)花和果實(shí)成熟在不同的時(shí)期,需要分別在開(kāi)花期、果實(shí)成熟期多次實(shí)地拍攝品種的大生境、小生境、整樹(shù)及葉、花、果以及突出種質(zhì)特性部位全部或部分照片。花、葉、果實(shí)也可帶回實(shí)驗(yàn)室,在小型攝影棚內(nèi)拍攝,效果更佳。同時(shí),鑒于品種所處環(huán)境的復(fù)雜性,盡量多拍攝照片,以備后期篩選。另外,如果2次拍攝還不能完全獲得全部特性照片,需要補(bǔ)拍。拍攝照片要求:(1)記錄準(zhǔn)確(種質(zhì)名稱、地點(diǎn)、拍攝者姓名和單位,拍攝時(shí)間);(2)采用數(shù)碼相機(jī),要求拍攝物體主題突出,圖像清晰,相機(jī)像素不低于800萬(wàn);(3)局部拍攝時(shí)應(yīng)加標(biāo)尺;(4)數(shù)碼照片采用jpg格式,照片像素不小于1024×768或768×1024,文件大小不低于3 MB;(5)提交的照片包括:整樹(shù)照片(樹(shù)生境照片、單株照、果園照),枝葉照片(結(jié)果枝、營(yíng)養(yǎng)枝、一年生枝、多年生枝),花的照片(初開(kāi)花、盛開(kāi)花、雄花、雌花、花器官特寫(xiě)),果實(shí)的照片(單果照、切開(kāi)果照、種子照、結(jié)果枝照、整樹(shù)結(jié)果照)。
對(duì)拍攝的照片進(jìn)行人工篩選,照片整理要求:(1)數(shù)碼照片必須在照片名字中標(biāo)注種質(zhì)名稱、地點(diǎn)、拍攝時(shí)間,同時(shí)按照調(diào)查表對(duì)照片進(jìn)行編號(hào);(2)沖印照片,檢查照片質(zhì)量,在照片背面標(biāo)注種質(zhì)名稱、地點(diǎn)、拍攝時(shí)間,同時(shí)將照片編號(hào)附于對(duì)應(yīng)的調(diào)查表后以供專家組審閱。篩選合格的數(shù)碼照片分別導(dǎo)入到以品種唯一編號(hào)(子專題片區(qū)負(fù)責(zé)人姓全拼+名拼音首字母+調(diào)查者姓名拼音首字母+所在地調(diào)查流水號(hào))命名的文件夾中,同時(shí)將編號(hào)信息記錄到對(duì)應(yīng)的“2012年-2017年全國(guó)落葉果樹(shù)農(nóng)家品種資源照片編號(hào)-樹(shù)種”Excel文件中。各個(gè)品種文件夾和編號(hào)信息記錄表再匯總到以樹(shù)種命名的文件夾中。
本數(shù)據(jù)針對(duì)我國(guó)優(yōu)勢(shì)產(chǎn)區(qū)落葉果樹(shù)農(nóng)家品種資源進(jìn)行調(diào)查與收集。優(yōu)勢(shì)產(chǎn)區(qū)包括河南、湖北、湖南、西藏、北京、天津、河北、內(nèi)蒙古、遼寧、吉林、黑龍江、江蘇、廣東、廣西、重慶、貴州、云南、四川、山東、上海、浙江、安徽、福建、江西、山西、陜西、甘肅、青海、寧夏、新疆等落葉果樹(shù)重點(diǎn)分布地區(qū)。收集了2012-2017年間石榴、核桃、獼猴桃、李、杏、棗、山楂、葡萄、桃、櫻桃、蘋(píng)果、柿、梨、板栗14個(gè)樹(shù)種的大生境、小生境、整樹(shù)及葉、花、果以及突出種質(zhì)特性部位全部或部分照片,數(shù)據(jù)以樹(shù)種為單元。圖集包含14個(gè)文件夾,主要通過(guò)對(duì)調(diào)查的落葉果樹(shù)照片資料規(guī)范化測(cè)量、整理而成,部分樣例見(jiàn)圖1、2。
圖1 獼猴桃地方品種果實(shí)照片
圖2 蘋(píng)果樹(shù)地方品種生境照片
本數(shù)據(jù)集的質(zhì)量取決于工作路線和流程的合理性,資源調(diào)查和數(shù)據(jù)采集方法的科學(xué)性,以及圖片的拍攝質(zhì)量,所有資源的調(diào)查和采集均是在相關(guān)樹(shù)種領(lǐng)域?qū)<規(guī)ьI(lǐng)下多次訪問(wèn)農(nóng)家品種資源所在地獲取的,果樹(shù)農(nóng)家品種資源鑒定信息參考中國(guó)植物物種數(shù)據(jù)庫(kù)(http://db.kib.ac.cn/)。
通過(guò)組建不同樹(shù)種的聯(lián)合專家組進(jìn)行考察,經(jīng)專家研判以保證調(diào)查農(nóng)家品種資源的可靠性和唯一性。數(shù)據(jù)集照片在種質(zhì)資源原生地考察,實(shí)地拍攝,未經(jīng)加工處理。所有資源的拍攝照片均是多次訪問(wèn)農(nóng)家品種資源所在地獲取的。
在國(guó)家科技部科技基礎(chǔ)性工作專項(xiàng)重點(diǎn)項(xiàng)目“我國(guó)優(yōu)勢(shì)產(chǎn)區(qū)落葉果樹(shù)農(nóng)家品種資源調(diào)查與收集”支持下,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹(shù)研究所聯(lián)合全國(guó)多家科研單位、大專院校的百余名科技人員,利用現(xiàn)代化的調(diào)查手段系統(tǒng)調(diào)查、收集、整理和保護(hù)了我國(guó)主要落葉果樹(shù)地方品種資源并建立了檔案,形成數(shù)據(jù)庫(kù)。這項(xiàng)工作的成果是摸清了我國(guó)果樹(shù)地方品種的家底,為全國(guó)性的果樹(shù)地方品種鑒定和評(píng)價(jià)、優(yōu)良基因挖掘和種質(zhì)創(chuàng)新利用奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
通過(guò)收集網(wǎng)絡(luò)信息、查閱文獻(xiàn)資料等途徑,從文字信息上掌握我國(guó)主要落葉果樹(shù)優(yōu)勢(shì)產(chǎn)區(qū)的地域分布,確定今后科學(xué)調(diào)查的區(qū)域和范圍,做好前期的案頭準(zhǔn)備工作。實(shí)地走訪主要落葉果樹(shù)種植地區(qū),科學(xué)調(diào)查主要落葉果樹(shù)的優(yōu)勢(shì)產(chǎn)區(qū)區(qū)域分布、歷史演變、栽培面積、農(nóng)家品種的種類和數(shù)量、產(chǎn)業(yè)利用狀況和生存現(xiàn)狀等情況,最終形成一套系統(tǒng)的相關(guān)科學(xué)調(diào)查分析報(bào)告。通過(guò)項(xiàng)目的實(shí)施,最終超額完成調(diào)查鑒定收集1450份填補(bǔ)國(guó)內(nèi)瀕臨滅絕或具有特異農(nóng)藝性狀的農(nóng)家品種果樹(shù)資源的既定任務(wù),為我國(guó)果樹(shù)領(lǐng)域資源保存和育種研究提供強(qiáng)有力的溯源性支撐。
致 謝
本數(shù)據(jù)集是由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹(shù)研究所牽頭,全國(guó)22個(gè)研究所和大學(xué)、100多位科技人員同時(shí)參與,很多調(diào)查圖片和品種性狀資料來(lái)之不易,尤其是許多優(yōu)異、瀕危的果樹(shù)地方品種資源多處于偏遠(yuǎn)的山區(qū)村莊,交通不便,需要跋山涉水、歷經(jīng)艱難險(xiǎn)阻才得以調(diào)查收集十分珍貴,在此對(duì)本數(shù)據(jù)集的貢獻(xiàn)者一并表示感謝!
中國(guó)科學(xué)數(shù)據(jù)(中英文網(wǎng)絡(luò)版)2021年4期