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        應(yīng)用不平衡法檢測(cè)贛南地區(qū)原發(fā)性肺腺癌ALK融合突變

        2022-01-06 07:09:54鐘煒祥韋晰鳳
        腫瘤防治研究 2021年12期
        關(guān)鍵詞:贛南腺癌標(biāo)本

        鐘煒祥,韋晰鳳

        0 引言

        肺癌是目前我國(guó)發(fā)病率和死亡率最高的惡性腫瘤,作為非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)繼表皮生長(zhǎng)因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突變之后被發(fā)現(xiàn)的第二大突變基因—棘皮動(dòng)物微管相關(guān)蛋白4-間變淋巴瘤激酶(echinoderm microtubule-associated protein-like 4-anaplastic lymphoma kinase,EML4-ALK)融合基因在NSCLC發(fā)生、發(fā)展、預(yù)后及轉(zhuǎn)歸中扮演著重要角色,尤其是肺腺癌最具有特點(diǎn)的致癌基因。文獻(xiàn)[1-4]報(bào)道不同地區(qū)的NSCLC患者中EML4-ALK融合突變存在差異,目前贛南地區(qū)尚無(wú)ALK融合基因的相關(guān)報(bào)道。本研究通過(guò)不平衡法(即基于3'端和5'端的表達(dá)水平不平衡策略的qRT-PCR方法)檢測(cè)贛南地區(qū)原發(fā)性肺腺癌組織中ALK融合基因的表達(dá)情況,回顧性分析其臨床病理特征,旨在探討贛南地區(qū)原發(fā)性肺腺癌ALK融合基因的特點(diǎn),科學(xué)指導(dǎo)此類(lèi)患者優(yōu)選靶向用藥。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料

        選取贛南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院2016年—2020年經(jīng)病理檢查確診為原發(fā)性肺腺癌的病例233例,其中男127例(54.51%),女106例(45.49%),平均年齡(60.3±10.618)歲,中位年齡61歲(34~89歲);無(wú)吸煙史142例(60.94%),有吸煙史91例(39.06%);臨床分期按國(guó)際肺癌研究協(xié)會(huì)第八版國(guó)際肺癌TNM分期標(biāo)準(zhǔn)執(zhí)行:Ⅰ期42例(18.02%)、Ⅱ期17例(7.30%)、Ⅲ期21例(9.01%)、Ⅳ期153例(65.67%)。入組患者分布于贛南地區(qū),均為初治,未接受過(guò)化療、放療或靶向治療。

        1.2 方法

        1.2.1 篩選病例 經(jīng)外科手術(shù)切除或CT引導(dǎo)下經(jīng)皮肺穿刺活檢或電子支氣管鏡活檢組織標(biāo)本233例,其中石蠟切片組織標(biāo)本201例,新鮮活檢組織標(biāo)本32例。經(jīng)贛南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院科學(xué)研究倫理委員會(huì)審查批準(zhǔn)(編號(hào):LLSC-2021081601)。

        1.2.2 標(biāo)本固定 由醫(yī)院病理科進(jìn)行石蠟包埋固定,按至少5 μm厚度切取病理白片15張外送。32例新鮮組織標(biāo)本離體后儲(chǔ)存在RNAfixer組織保存液中固定后外送。經(jīng)患者知情同意后,233例樣本先后外送至浙江鼎晶醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所進(jìn)行ALK融合基因檢測(cè)。

        1.2.3 總RNA提取 采用組織RNA抽提kit(Qiagen)試劑盒提取樣本總RNA,紫外分光光度儀測(cè)定模板總RNA的濃度(>30 ng/μl)和純度(OD260/OD280值為1.8~2.0)。

        1.2.4 反轉(zhuǎn)錄(reverse transcription,RT)合成cDNA 參照M-MLV反轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書(shū)設(shè)置RT程序:25℃ 5 min;42℃ 60 min;75℃ 5 min;4℃ 5 min。

        1.2.5 Real-time PCR體系 RT產(chǎn)物通過(guò)SYBR Green PCR master mix(Applied Biosystems)試劑進(jìn)行PCR反應(yīng),反應(yīng)體系中加入熒光物質(zhì)并采用ABI 7500 PCR儀檢測(cè)。PCR程序參照人EML4-ALK融合基因檢測(cè)試劑盒(real time PCR)使用說(shuō)明書(shū)進(jìn)行設(shè)置:(1)UNG酶反應(yīng):50℃ 2 min 1個(gè)循環(huán);(2)預(yù)變性:95℃ 10 min 1個(gè)循環(huán);(3)變性:95℃ 15 s;退火、延伸及檢測(cè)熒光(熒光通道為FAM)60°C 32 s,共45個(gè)循環(huán);(4)溶解曲線(xiàn)(60℃~95℃按1%的速度遞增,此階段吸收熒光信號(hào)):95℃ 15 s 1個(gè)循環(huán);60℃ 1 min 1個(gè)循環(huán);95℃ 30 s 1個(gè)循環(huán);60℃ 15 s 1個(gè)循環(huán)。引物序列見(jiàn)表1。

        表1 Real-time PCR引物序列Table 1 Primer sequences of real-time PCR

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        本組資料為計(jì)數(shù)資料,以百分?jǐn)?shù)表示。應(yīng)用SPSS24.0軟件,采用χ2檢驗(yàn)或確切概率法進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 ALK融合基因的表達(dá)情況

        入組233例樣本,共檢測(cè)出21例ALK基因融合,表達(dá)率為9.01%,見(jiàn)圖1。

        圖1 ALK融合突變Real-time PCR圖Figure 1 Real-time PCR pictures of ALK fusion mutation

        2.2 ALK融合突變與肺癌患者臨床病理特征的關(guān)系

        女性、N1-3患者ALK融合基因表達(dá)率為13.2%(14/106)、12.5%(18/144),均顯著高于男性(5.5%)、N0(3.4%)患者,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);ALK融合基因在新鮮組織標(biāo)本、年齡<55歲、無(wú)吸煙史以及M1期患者中的表達(dá)率相對(duì)較高,但未達(dá)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);ALK融合基因的表達(dá)與TNM分期、T分期、是否手術(shù)治療以及腫瘤分布位置均無(wú)相關(guān)性(P>0.05),見(jiàn)表2。

        表2 贛南地區(qū)肺腺癌患者ALK基因融合與臨床病理特征的關(guān)系Table 2 Relation between ALK fusion and clinicopathological characteristics of patients with lung adenocarcinoma in Gannan region

        2.3 ALK融合突變與肺癌常見(jiàn)部位轉(zhuǎn)移的關(guān)系

        在153例M1期病例中,肺癌常見(jiàn)轉(zhuǎn)移部位按發(fā)生率大小依次是骨轉(zhuǎn)移、腦轉(zhuǎn)移、對(duì)側(cè)肺轉(zhuǎn)移、胸膜播散(惡性胸水、心包積液或胸膜結(jié)節(jié))/腎上腺轉(zhuǎn)移以及肝轉(zhuǎn)移,亞組分析均未發(fā)現(xiàn)ALK融合突變與肺癌常見(jiàn)部位轉(zhuǎn)移的相關(guān)性(均P>0.05),見(jiàn)表3。

        表3 贛南地區(qū)153例M1期肺腺癌患者ALK基因融合與肺癌常見(jiàn)部位轉(zhuǎn)移的關(guān)系Table 3 Relation between ALK fusion and metastasis of common sites of lung cancer in 153 M1-stage patients with lung adenocarcinoma in Gannan region

        3 討論

        目前肺癌的診療已邁入了精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時(shí)代,EML4-ALK是繼EGFR之后第二受關(guān)注的基因,也是NSCLC中最常見(jiàn)的ALK融合基因,亦是在NSCLC中第一個(gè)發(fā)現(xiàn)的融合基因激酶抑制靶點(diǎn)。在EML4-ALK融合基因中,EML4的N端與ALK胞內(nèi)的絡(luò)氨酸激酶區(qū)發(fā)生融合,導(dǎo)致ALK融合基因異常表達(dá),此外融合伴侶EML4可促進(jìn)融合蛋白的二聚和低聚反應(yīng),導(dǎo)致ALK酪氨酸激酶區(qū)及下游PI3K/AKT及MAPK等信號(hào)通路激活,從而引起細(xì)胞異常增殖和分化[5]。在NSCLC中被發(fā)現(xiàn)的ALK融合基因還包括KIF5B-ALK、TFG-ALK、KLC1-ALK等[6-7]。近年來(lái),針對(duì)ALK融合基因的靶向治療藥物發(fā)展迅速,克唑替尼[8]、阿來(lái)替尼[9]、勞拉替尼[10]等ALK-TKIs的臨床使用顯著改善了ALK陽(yáng)性晚期NSCLC患者的生存,對(duì)ALK融合突變 NSCLC具有類(lèi)似于EGFR-TKIs的療效,ALK-TKIs通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合于ALK激酶區(qū),阻斷ALK下游的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,從而達(dá)到治療效果。

        本研究入組病例來(lái)自贛南地區(qū)十八縣市區(qū),以客家人居多,ALK融合基因的表達(dá)率為9.01%(21/233),高于ALK融合基因的整體表達(dá)水平(3%~7%)[11],提示ALK融合突變可能存在一定的區(qū)域或人種差異?;仡櫺苑治霭l(fā)現(xiàn),女性患者ALK融合基因的表達(dá)率明顯高于男性患者(P<0.05),與王惠宇等[12]研究結(jié)果類(lèi)似,Ke等[13]研究亦表明ALK融合基因更多見(jiàn)于女性。ALK融合突變的性別差異可能與雌激素相關(guān),有研究[14]表明雌激素受體表達(dá)增加可能與性別相關(guān)的NSCLC發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)增加有關(guān)。同時(shí),有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(即N1-3)患者ALK融合基因的表達(dá)率顯著高于無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(即N0)患者,Tian等[15]回顧性研究亦表明ALK融合突變肺腺癌患者可能有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移傾向。

        既往研究[16-18]表明ALK融合突變多見(jiàn)于年輕NSCLC患者,且ALK融合突變陽(yáng)性患者的年齡較陰性患者小4~5歲[19-20]。本研究選取55歲作為年齡界定點(diǎn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,未發(fā)現(xiàn)ALK融合突變?cè)诓煌挲g組間的顯著差異(P>0.05)。

        吸煙作為肺癌最密切的致病因素,Sasaki等[21]報(bào)道非吸煙NSCLC患者具有更高的ALK融合突變風(fēng)險(xiǎn)。本研究結(jié)果顯示,ALK融合基因在無(wú)吸煙史患者中的表達(dá)率相對(duì)較高,但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。

        目前,手術(shù)大標(biāo)本和新鮮活檢組織標(biāo)本是肺癌基因檢測(cè)的理想標(biāo)本,腫瘤細(xì)胞含量較多,檢出率更高,結(jié)果更為可靠[22]。本研究比較了新鮮活檢組織和石蠟切片組織標(biāo)本中的ALK融合基因表達(dá)水平,前者相對(duì)較高,但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),可能與入組病例中新鮮活檢組織樣本量比例低有關(guān)。此外,贛南地區(qū)原發(fā)性肺腺癌中ALK融合基因的表達(dá)與臨床分期、T分期、M分期、是否手術(shù)治療以及腫瘤分布位置均無(wú)相關(guān)性,可能與入組病例的篩選、檢測(cè)方法的選擇以及地域、種族差異等因素有關(guān)。

        ALK融合突變一般與腫瘤的惡性程度相關(guān),且更易發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、胸膜轉(zhuǎn)移及腦轉(zhuǎn)移[23],ALK融合突變患者的預(yù)后相對(duì)更差。本研究亞組分析未發(fā)現(xiàn)ALK融合突變與肺癌常見(jiàn)部位(骨、腦、對(duì)側(cè)肺、胸膜播散、腎上腺及肝)轉(zhuǎn)移的相關(guān)性(P>0.05),可能是由樣本量的差異、回顧性研究的偏倚等因素造成的。

        本實(shí)驗(yàn)采用基于3'端和5'端的表達(dá)水平不平衡策略的qRT-PCR方法[24]檢測(cè)腫瘤組織中ALK基因在3'端和5'端的表達(dá)差異,分析二者之間的不平衡現(xiàn)象,進(jìn)而明確是否存在ALK融合基因。只要存在ALK融合基因,即無(wú)論是已知的ALK融合基因,還是新的ALK融合基因,不平衡法就可以檢測(cè)到,而且與腫瘤靶基因高通量測(cè)序、FISH等比較,其檢測(cè)時(shí)間更短,對(duì)儀器設(shè)備和人員要求更低,值得在臨床中廣泛應(yīng)用并積極推廣。

        綜上所述,贛南地區(qū)原發(fā)性肺腺癌患者ALK融合基因的表達(dá)率相對(duì)較高,好發(fā)于女性、有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者。明確贛南地區(qū)原發(fā)性肺腺癌患者ALK融合基因的臨床特點(diǎn),科學(xué)指導(dǎo)贛南地區(qū)NSCLC患者個(gè)體化治療,為此類(lèi)患者優(yōu)選靶向用藥提供理論依據(jù),進(jìn)而建立贛南地區(qū)肺癌靶向治療模式并推廣應(yīng)用于臨床。

        (致謝:感謝鼎晶醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所為本研究提供實(shí)驗(yàn)部分的支持與幫助?。?/p>

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