宦麗君,王鵬云
華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院附屬梨園醫(yī)院檢驗(yàn)科,湖北武漢 430077
細(xì)胞色素P450-2C19(由CYP2C19基因編碼)是細(xì)胞色素P450超家族的一種具有高度遺傳異質(zhì)性的同工酶,參與多種臨床藥物的代謝調(diào)控,包括氯吡格雷、伏立康唑、質(zhì)子泵抑制劑、抗抑郁藥、卡里索羅多和地西泮等[1-2]。已鑒定的可造成CYP2C19酶活性改變的單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn)有20多個(gè),其中最常見(jiàn)且已用于臨床診斷的為CYP2C19*2(681G>A)和CYP2C19*3(636G>A)這2個(gè)SNP位點(diǎn)[3]。CYP2C19基因多態(tài)性具有明顯的地域、民族差異,可能對(duì)其診斷價(jià)值產(chǎn)生一定的影響。通過(guò)研究CYP2C19基因多態(tài)性,了解其基因分布差異,可為開(kāi)發(fā)新藥、臨床合理用藥、減少藥物不良反應(yīng)等提供理論依據(jù)。
1.1一般資料 選擇2016年7月至2021年4月在本院遵醫(yī)囑接受CYP2C19基因多態(tài)性臨床檢測(cè)的1 036例患者為研究對(duì)象,其中男606例,女430例;年齡60~98歲,平均(74.9±12.3)歲。所有研究對(duì)象均為湖北地區(qū)常駐漢族居民,相互之間無(wú)血緣關(guān)系。
1.2方法
1.2.1基因組DNA提取 采用層析柱式血液基因組提取試劑盒,從2 mL乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝外周血中提取基因組DNA,具體方法參考產(chǎn)品說(shuō)明書。
1.2.2基因分型 采用PCR-熒光探針?lè)▽?duì)2個(gè)位點(diǎn)的基因進(jìn)行分型。PCR反應(yīng)試劑購(gòu)于武漢友芝友醫(yī)療科技有限公司。反應(yīng)體系為25.0 μL,包括DNA模板2.0 μL,反應(yīng)液23.0 μL(含有PCR 緩沖液、dNTPs、特異性引物和探針、內(nèi)標(biāo)引物)。PCR反應(yīng)程序:37 ℃ UNG處理10 min,95 ℃預(yù)變性5 min,然后95 ℃ 15 s、62 ℃ 60 s反應(yīng)40個(gè)循環(huán),反應(yīng)結(jié)束時(shí)采集熒光信號(hào)。反應(yīng)結(jié)束后,根據(jù)擴(kuò)增曲線,劃定合適的基線和熒光閾值,得到不同通道Ct值并進(jìn)行結(jié)果判讀,確定每份標(biāo)本各個(gè)位點(diǎn)的基因型。
1.2.3基因型的判定 以CYP2C19*2位點(diǎn)為例,ROX通道為內(nèi)標(biāo)基因,所有檢測(cè)中ROX通道Ct值≤38。FAM通道Ct值≤36,VIC通道Ct值>36或無(wú)Ct值,即表示為GG野生型;FAM、VIC通道Ct值均≤36,則為GA雜合突變型(慢代謝雜合型);而VIC通道Ct值≤36,F(xiàn)AM通道Ct值>36或無(wú)Ct值,即表示為AA純合突變型(慢代謝純合型)。
1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 20.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理及統(tǒng)計(jì)分析。計(jì)數(shù)資料以例數(shù)和百分率表示,各基因型頻率在不同性別、地區(qū)、民族間的比較采用χ2檢驗(yàn)。以P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1湖北地區(qū)老年漢族人群CYP2C19基因等位基因頻率和基因型頻率分布 基因分型結(jié)果顯示,*2位點(diǎn)等位基因G和A的頻率分別為68.05%和31.95%。*3位點(diǎn)等位基因G的頻率為94.88%,等位基因A的頻率為5.12%。見(jiàn)表1。
表1 CYP2C19 基因*2和*3位點(diǎn)等位基因頻率和基因型頻率分布[n(%)]
2.2不同性別湖北老年漢族人群CYP2C19*2、*3基因型比較 1 036例湖北地區(qū)老年漢族人中,CYP2C19*2和*3位點(diǎn)基因型野生型占40.35%,*2和*3的等位基因頻率分別為31.95%、5.12%。606例男性中,*2和*3位點(diǎn)的等位基因頻率分別為32.34%和5.28%;430例女性中,*2和*3位點(diǎn)的等位基因頻率分別為31.40%和4.88%。各基因型在男女群體間的分布比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=2.56,P=0.77)。見(jiàn)表2。
表2 不同性別 CYP2C19 基因*2 和*3位點(diǎn)基因型和等位基因頻率分布[n(%)]
2.3不同地區(qū)漢族人群 CYP2C19*2、*3基因型比較 本研究結(jié)果與文獻(xiàn)報(bào)道的中國(guó)其他9個(gè)地區(qū)漢族人群基因型比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見(jiàn)表3。
表3 不同地區(qū)漢族人群 CYP2C19 基因*2 和*3位點(diǎn)基因型分布比較[n(%)]
2.4不同民族人群CYP2C19*2、*3基因型比較 將本研究及上述中國(guó)其他9個(gè)地區(qū)漢族人群數(shù)據(jù)分析,與其他民族人群基因型比較分析,其中*2等位基因頻率在回族人群中最高,為49.39%,在哈薩克族人群中發(fā)生率最低,為15.42%;*3等位基因頻率在撒拉族人群中最高,為13.64%,在藏族人群中發(fā)生率最低,為1.16%。傣族、畬族、黎族及藏族這4個(gè)民族人群的CYP2C19基因型分布與漢族人群比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。維吾爾族、回族、蒙古族、侗族、撒拉族和哈薩克族這6個(gè)民族人群中的CYP2C19基因型分布與漢族人群比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。不同民族 CYP2C19 基因*2 和*3位點(diǎn)基因型分布比較,見(jiàn)表4。
表4 不同民族 CYP2C19 基因*2 和*3位點(diǎn)基因型分布比較[n(%)]
CYP2C19酶活性的個(gè)體間差異可導(dǎo)致藥物反應(yīng)、藥物活性或解毒的顯著差異,因此了解影響CYP2C19酶活性的遺傳因素非常重要。本研究分析了1 036例湖北地區(qū)老年漢族人CYP2C19*2和*3位點(diǎn)基因型,野生型占40.35%,*2和*3的等位基因頻率分別為31.95%和5.12%,*2 和 *3等位基因攜帶率與日本、韓國(guó)、菲律賓等東亞及東南亞人群攜帶率接近[20],而明顯高于非洲黑種人和歐洲白種人[21],從而也證實(shí)了CYP2C19的基因多態(tài)性分布具有種族和地域差異。
本研究發(fā)現(xiàn),湖北地區(qū)老年漢族人群CYP2C19*2、*3基因型分布與云南等9個(gè)地區(qū)漢族人群比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。傣族、畬族、黎族及藏族這4個(gè)民族人群的CYP2C19基因型分布與漢族人群比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),而維吾爾族、回族、蒙古族、侗族、撒拉族和哈薩克族這6個(gè)民族人群的CYP2C19基因型分布與漢族人群比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。我國(guó)是一個(gè)多民族國(guó)家,不同民族間文化、飲食,尤其是遺傳背景具有一定差異,所以各民族間CYP2C19基因多態(tài)性基因頻率分布也存在一定差異。其中,回族人群*2等位基因頻率最高,野生型*1/*1 的頻率在11個(gè)民族中最低(19.51%);哈薩克族人群野生型和 *3位點(diǎn)純合型突變的發(fā)生率均最高,而*2位點(diǎn)純合突變發(fā)生率為11個(gè)民族中最低;撒拉族人群*2/*3基因型發(fā)生率最高(11.11%)。此外,個(gè)別民族出現(xiàn)某些基因型缺失的情況,如維吾爾族、蒙古族、黎族、侗族、撒拉族人群中均未檢測(cè)到*3/*3 基因型,而藏族人群中未檢測(cè)到*3/*3 和*2/*3基因型,可能由于個(gè)別基因位點(diǎn)突變率低,也與環(huán)境和遺傳因素相關(guān)。
綜上所述,CYP2C19*2、*3位點(diǎn)基因型在我國(guó)不同地域、民族人群差異較大,通過(guò)對(duì)CYP2C19*2、*3位點(diǎn)基因型分型,可預(yù)測(cè)個(gè)體藥物代謝速度,進(jìn)而對(duì)特定藥物治療進(jìn)行個(gè)體化指導(dǎo),也為研制新藥提供基礎(chǔ),促進(jìn)個(gè)性化醫(yī)療的發(fā)展。
國(guó)際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志2021年24期