王譽博,李子孝,3,4,王擁軍,3,4
在我國,卒中是居民死亡和成人致殘的首位病因,其中缺血性卒中患者比例超過80%,70%~80%的患者因功能殘疾不能獨立生活,為我國的經(jīng)濟帶來了沉重負擔(dān)[1]。在缺血性卒中帶來的患者、家庭及社會的負擔(dān)日益加重的背景下,現(xiàn)有的靜脈溶栓及血管內(nèi)取栓等治療方法,都無法徹底修復(fù)卒中帶來的神經(jīng)功能損傷。缺血性卒中后神經(jīng)功能缺損大多認為與局部腦血流量的顯著減少導(dǎo)致氧氣和營養(yǎng)物質(zhì)的缺乏并導(dǎo)致細胞死亡相關(guān),目前許多研究表明氧化應(yīng)激在其中發(fā)揮了重要作用[2]。
氧化應(yīng)激是指體內(nèi)氧化與抗氧化作用失衡的一種狀態(tài),被認為是導(dǎo)致衰老和疾病的一個重要因素。缺血性卒中后,在腦缺血/再灌注過程中會產(chǎn)生大量的氧自由基(氧化劑),引起氧化應(yīng)激,導(dǎo)致氧化性神經(jīng)元死亡,尤其是線粒體功能障礙等[3]。因此,抑制氧化應(yīng)激可能成為缺血性卒中治療的新方向。
表觀遺傳學(xué)是研究基因的核苷酸序列不發(fā)生改變的情況下基因表達的可遺傳變化,這些變化包含不同的基因表達模式[4]。表觀遺傳過程利用廣泛的機制促進染色質(zhì)狀態(tài)的形成和維持,主要包括DNA甲基化、組蛋白修飾和非編碼RNA等[4-7]。除此之外,表觀遺傳過程的特殊在于其是可逆的,其染色質(zhì)的狀態(tài)是動態(tài)的,會根據(jù)局部環(huán)境的變化做出反應(yīng)[4]。綜上,了解表觀遺傳調(diào)控如何影響血管神經(jīng)單元中的氧化應(yīng)激,對尋找缺血性卒中的特異性治療靶點具有重要意義。
DNA甲基化主要是指CpG島胞嘧啶上第5位碳原子的甲基化過程,通常能夠在不改變DNA序列的前提下,通過轉(zhuǎn)錄抑制來調(diào)節(jié)全局和特異性基因表達,是最早被發(fā)現(xiàn)和研究最廣泛的表觀遺傳調(diào)控機制之一[8]。在一項利用表觀基因組全關(guān)聯(lián)研究方法(epigenome-wide association studies,EWAS)評估DNA甲基化與缺血性卒中關(guān)系的研究中,研究者使用Infinium 450K和EPIC BeadChip在一個隊列(252例缺血性卒中患者和43位正常者)中評估了差異甲基化位置(differentially methylated positions,DMPs)和差異甲基化區(qū)域(differentially methylated regions,DMRs),在另一個隊列(618例缺血性卒中患者和243位正常者)中評估了重復(fù)的DMPs和卒中亞型之間的關(guān)系,使用EpiDISH在相關(guān)CpG位點上分析了差異甲基化細胞類型(differentially methylated cell-type,DMCT),最終,使用孟德爾隨機化方法對相關(guān)CpG位點進行了通路富集分析和因果關(guān)系分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn):所有重復(fù)的DMPs都與心源性、動脈粥樣硬化血栓形成和不明原因的卒中風(fēng)險增加相關(guān);DMCT分析表明,自然殺傷細胞在其中發(fā)揮了重要作用;通路富集分析顯示氧化應(yīng)激等特定途徑基因過表達[9]。
DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNA methyltransferases,DNMT)是介導(dǎo)DNA甲基化的重要因素,包括DNMT3A和DNMT3B(從頭甲基化)以及DNMT1(維持甲基化)[10]。缺血性卒中后導(dǎo)致機體氧化應(yīng)激水平升高,產(chǎn)生大量的活性氧(reactive oxygen species,ROS)/活性氮(reactive nitrogen species,RNS),ROS/RNS可直接對胞嘧啶進行化學(xué)修飾,將5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5-mC)氧化為5-羥甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5-hmC),抑制DNMT1和甲基化CpG結(jié)合蛋白(methyl-CpG binding proteins,MBP)結(jié)合到DNA,改變甲基化模式[11]。此外,過氧化物還會引起核堿基修飾,如5-氯胞嘧啶可模擬5-mC并在CpG序列中誘導(dǎo)不正確的DNMT1甲基化,導(dǎo)致基因沉默。這些研究均證明缺血性卒中后氧化應(yīng)激和表觀遺傳調(diào)控之間存在聯(lián)系[12-13]。
Hcy代謝對于DNA甲基化至關(guān)重要,是表觀遺傳調(diào)控機制中的關(guān)鍵途徑。Hcy水平升高已被認為是缺血性卒中的危險因素[14-15]。Hcy代謝受損常引起血漿中Hcy濃度升高(高同型半胱氨酸血癥),導(dǎo)致氧化還原失衡和氧化應(yīng)激增加[16],誘發(fā)動脈粥樣硬化斑塊形成,進而引發(fā)各種心腦血管事件,主要包括缺血性心臟病和缺血性卒中[17]。
除此之外,缺血性卒中后氧化應(yīng)激會導(dǎo)致神經(jīng)細胞整體DNA甲基化水平升高,而DNMT抑制劑可以減輕缺血后氧化應(yīng)激引起的神經(jīng)損傷[18]。例如,5-Aza-脫氧胞苷(5-Azadeoxycytidine,5-Aza-dC)通過抑制DNA甲基化縮小了大腦中動脈栓塞(middle cerebral artery occlusion,MCAO)模型小鼠的腦梗死體積,具有神經(jīng)保護作用,這可能與缺血后神經(jīng)細胞功能恢復(fù)有關(guān),但其中的具體機制仍不明確[19]。同時,也有研究者有不同的發(fā)現(xiàn):在一項關(guān)于血液DNA甲基化和缺血性卒中的研究中,研究者發(fā)現(xiàn)缺血性卒中患者普遍存在血液長散布核元件-1(long interspersed nuclear elements-1,LINE-1)的低甲基化,同時縱向分析顯示,LINE-1甲基化水平較低的人發(fā)生缺血性心臟病和缺血性卒中的風(fēng)險較高且總死亡率較高[20]。
綜上所述,DNA甲基化和缺血性卒中后氧化應(yīng)激存在顯著的聯(lián)系,但其中所涉及的具體表觀遺傳機制仍有待更深入的研究。
越來越多的研究表明組蛋白修飾在心腦血管發(fā)育、骨骼形成等多種生物學(xué)過程中扮演著重要的角色,尤其在調(diào)控神經(jīng)細胞的生命周期中具有重要地位[21-22]。細胞內(nèi)組蛋白包裹DNA形成核小體,多種組蛋白修飾酶可改變DNA構(gòu)象,導(dǎo)致核小體重新定位,進而激活或抑制轉(zhuǎn)錄。組蛋白修飾包括乙?;?去乙酰化、甲基化/去甲基化和磷酸化等。研究者發(fā)現(xiàn)組蛋白修飾酶的調(diào)節(jié)在缺血性卒中中有重要作用。
2.1 組蛋白乙酰化/去乙?;?組蛋白乙?;?去乙?;且粋€重要的翻譯后修飾,其所引起的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)重塑是表觀遺傳調(diào)控的重要機制[23]。組蛋白乙?;?去乙酰化與轉(zhuǎn)錄激活/抑制有關(guān),并分別被兩個作用相反的酶調(diào)控,即組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(histone acetyltransferase,HATs)和組蛋白去乙酰酶(histone deacetyltransferase,HDACs)[24]。動物實驗證明HDACs在缺血性卒中過程中發(fā)揮作用,多種HDACs的表達水平隨著時間的推移而發(fā)生不同的改變:急性腦缺血后HDAC1和HDAC2表達水平呈時間依賴性下降;HDAC5的表達水平在再灌注3 h后呈時間依賴性下降;HDAC6和HDAC11的表達水平在再灌注3 h內(nèi)升高,但隨著時間的推移,其表達水平也開始下降[25-26]。一項針對缺血性卒中及其亞型的歐洲人群全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome-wide association study,GWAS)發(fā)現(xiàn),編碼HDACs蛋白的HDAC9基因變異可導(dǎo)致卒中發(fā)生風(fēng)險顯著升高[27]。
過氧化物酶是神經(jīng)保護性抗氧化酶,可保護神經(jīng)元免受卒中后氧化應(yīng)激失衡造成的損傷。然而,其活性位點半胱氨酸在卒中后因過氧化而失活,失去對神經(jīng)元的保護作用。神經(jīng)突觸活性(synaptic activity)可以促進神經(jīng)元中過度氧化的過氧化物酶(hyperoxidized peroxiredoxins)減少,并誘導(dǎo)硫氧還蛋白(Srxn1)和sestrin 2蛋白(Sesn2)的表達。研究顯示sestrin 2蛋白啟動子通過活性依賴性組蛋白乙酰化激活轉(zhuǎn)錄。通過用組蛋白去乙酰化酶抑制劑曲古抑菌素A(trichostatin A,TSA)處理神經(jīng)元增強組蛋白乙?;?,可以誘導(dǎo)sestrin 2蛋白和硫氧還蛋白的表達[28]。同時,保護劑量的TSA可減少因氧化應(yīng)激而損傷的神經(jīng)元中過氧化的過氧化物酶的生成[28]。
除此之外,在小鼠缺血性卒中模型中發(fā)現(xiàn),缺血再灌注3 h,HDAC3、HDAC6和HDAC11的表達顯著增加,而使用短發(fā)夾RNA(short hairpin RNA,shRNA)選擇性抑制HDAC3或HDAC6,顯著改善了氧化應(yīng)激后皮質(zhì)神經(jīng)元的存活情況,提示缺血性卒中后干預(yù)特定HDAC亞型表達可能成為新的治療方法[26]。研究者在體外細胞實驗中發(fā)現(xiàn),神經(jīng)元細胞和膠質(zhì)細胞在氧-葡萄糖剝奪(oxygen-glucose deprivation,OGD)60 min后,HDAC1、HDAC2、HDAC3表達水平上調(diào),其中HDAC3表達水平上調(diào)幅度最大[29]。也有研究表明HDAC4和HDAC5表達水平在腦缺血/再灌注損傷和OGD模型中均顯著降低,NADPH氧化酶介導(dǎo)的HDAC4和HDAC5表達通過高遷移率族蛋白B1(high mobility group protein 1,HMGB1)信號通路導(dǎo)致腦缺血損傷,因此抑制NADPH氧化酶活性可改善腦缺血/再灌注損傷[30]。這些都表明了HDAC的不同亞型在卒中后氧化應(yīng)激中發(fā)揮不同的作用并參與卒中后氧化應(yīng)激的進程。
研究者在缺血性卒中小鼠實驗?zāi)P椭邪l(fā)現(xiàn)泛HDAC抑制不僅保護神經(jīng)元免受氧化應(yīng)激,并通過促進熱休克蛋白70(heat shock protein 70,HSP70)等神經(jīng)保護因子的表達增加起到一定的治療作用[31]。但HDAC抑制劑對多種中樞神經(jīng)細胞的毒性,阻礙了其在神經(jīng)系統(tǒng)疾病治療中的應(yīng)用。最近有研究表明,神經(jīng)元損傷導(dǎo)致HDAC6表達增加,而抑制HDAC6則可以促進神經(jīng)元的存活和再生,選擇性抑制HDAC6避免了與泛HDAC抑制相關(guān)的細胞死亡[32]。因此,HDAC6可能成為一種潛在的無毒治療靶點,用于改善以氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的神經(jīng)變性和軸突再生不足為特征的包括缺血性卒中在內(nèi)的中樞神經(jīng)系統(tǒng)損傷[32]。
綜上所述,雖然已有部分研究證明了組蛋白乙?;?去乙?;c缺血性卒中后氧化應(yīng)激的關(guān)系,但其特定亞型和具體機制仍不清楚,闡明特定HDAC在大腦中的作用以及開發(fā)特異性的治療策略治療卒中可能會帶來更有益的結(jié)局。
2.2 組蛋白的其他修飾 除了組蛋白乙酰化/去乙?;M蛋白修飾還包括組蛋白甲基化/去甲基化、組蛋白磷酸化和組蛋白泛素化等。同組蛋白乙?;?去乙?;粯?,其他組蛋白修飾方式在卒中后氧化應(yīng)激中的作用機制也未明確。
隨著組蛋白去甲基化酶(histone demethylase,HDM)的發(fā)現(xiàn),人們對組蛋白甲基化的了解也變得更多[33]。盡管已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了越來越多的組蛋白甲基化酶(histone methylase,HMT)和HDM,但組蛋白甲基化在卒中后的作用仍然不明。在一項動物實驗中,研究者發(fā)現(xiàn)與年輕雌性小鼠相比,年老雌性小鼠星形膠質(zhì)細胞的組蛋白3的四位賴氨酸(histone H3 at lysine 4,H3K4)甲基轉(zhuǎn)移酶活性降低,缺血性梗死體積增大[34]。通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(chromatin immunoprecipitation,ChIP-seq),研究者發(fā)現(xiàn)與年老雌性小鼠相比,年輕雌性小鼠在轉(zhuǎn)錄起始位點的組蛋白第三亞基四號賴氨酸的三甲基化(trimethylation of lysine 4 on histone H3 protein subunit,H3K4me3,轉(zhuǎn)錄增強子)富集的峰增多,而組蛋白第三亞基九號賴氨酸的三甲基化(trimethylation of lysine 9 on histone H3 protein subunit,H3K9me3,轉(zhuǎn)錄抑制子)富集的峰減少,表明缺血后年老雌性小鼠星形膠質(zhì)細胞中染色質(zhì)活性較低[34]。通過H3K4me3富集基因的DAVID聚類分析,研究者將250個基因富集在7個簇中,基因富集最多的簇基因本體論(gene ontology,GO)分析注釋結(jié)果為“細胞運動”,其他簇為“細胞繁殖、細胞凋亡調(diào)節(jié)、DNA損傷、離子結(jié)合、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)和磷酸化調(diào)節(jié)”,同時,京都基因與基因組百科全書(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析發(fā)現(xiàn),血管內(nèi)皮生長因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)表達上調(diào),VEGF是一種血管生成因子,可誘導(dǎo)內(nèi)皮細胞增殖、抑制細胞凋亡并促進細胞遷移,在腦缺血后神經(jīng)發(fā)生、細胞保護和恢復(fù)中起著重要作用[34]。這些數(shù)據(jù)表明隨著年齡的增長,星形膠質(zhì)細胞的染色質(zhì)活性降低,加強了對衰老相關(guān)卒中嚴重程度差異的可能機制的見解。賴氨酸特異性組蛋白去甲基化酶1(lysine-specific demethylase 1,LSD1)是一種染色質(zhì)修飾酶,可特異性去除H3K4上的甲基并誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄抑制,這是表觀遺傳轉(zhuǎn)錄激活的特定標簽之一。研究表明腦缺血再灌注損傷后,LSD1的表達在時間和空間上發(fā)生變化,表明LSD1可能參與卒中后的神經(jīng)再生[35]。同時,LSD1是一種黃素依賴性胺氧化酶,其可以刺激雄激素受體依賴性轉(zhuǎn)錄,將氧氣轉(zhuǎn)化為過氧化氫(hydrogen peroxide,H2O2)[36]。因此,LSD1參與氧化反應(yīng),其在卒中后氧化應(yīng)激調(diào)節(jié)中的作用值得更深入的研究。
除了組蛋白甲基化和乙酰化外,在腦缺血后也會發(fā)生組蛋白磷酸化。研究表明離子型谷氨酸受體的過度激活會增強氧化應(yīng)激,導(dǎo)致缺血和癲癇等神經(jīng)損傷后的神經(jīng)元死亡,而組蛋白翻譯后修飾可能是檢測和修復(fù)氧化應(yīng)激損傷(包括DNA損傷)的關(guān)鍵方式,因此可能會影響以過度釋放谷氨酸為特征的損傷后的神經(jīng)元存活[37]。缺血后過度活躍的谷氨酸受體增加了氧化應(yīng)激并誘發(fā)了神經(jīng)元中的磷酸化組蛋白H2AX(γ-H2AX)增多,γ-H2AX隨著卒中進展而積累,但這種情況可以通過抗氧化劑預(yù)處理得到改善[37]。IκB激酶(inhibitor of kappa B kinase,IKK)復(fù)合物是核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)通路經(jīng)典激活的核心成分,研究發(fā)現(xiàn)在銅/鋅超氧化物歧化酶(Cu/Zn-superoxide dismutase,SOD1)敲除小鼠中,短暫性局灶性腦缺血后,NF-κB誘導(dǎo)激酶(NF-κB inducing kinase,NIK)(IKKα的上游激酶)、磷酸化IKKα(phosphorylation of IKKα,pIKKα)和磷酸化組蛋白H3(phosphorylation of histone H3,pH3)(Ser10)水平增加[38]。進一步研究發(fā)現(xiàn),OGD誘導(dǎo)氧化應(yīng)激后小鼠腦內(nèi)皮細胞中pH3增強,導(dǎo)致細胞死亡。用IKKα小干擾RNA(small interfering RNA,siRNA)治療可顯著減少 OGD后的細胞死亡。這些結(jié)果表明,氧化應(yīng)激相關(guān)的NIK、IKKα和pH3的增加與腦缺血后的細胞死亡有關(guān)[38]。
綜上所述,不同類型的組蛋白修飾在缺血性卒中后氧化應(yīng)激中都發(fā)揮著重要但不確切的作用,需要進一步闡明。
功能性非編碼RNA在基因表達中發(fā)揮著重要作用,可分為長鏈非編碼RNA和短鏈非編碼RNA,其中,短鏈非編碼RNA中的微小RNA(microRNA,miRNA/miR)與多種卒中危險因素有關(guān),包括動脈粥樣硬化和高血壓等[39-40]。miRNA是大約22個核苷酸的小RNA分子,在基因組水平對基因表達進行調(diào)控,主要表現(xiàn)為轉(zhuǎn)錄后負調(diào)控。研究表明,miR-424可縮小缺血/再灌注后的梗死體積并抑制神經(jīng)元凋亡,降低皮質(zhì)中的ROS和丙二醛水平,總體來說miR-424通過抑制氧化應(yīng)激來預(yù)防短暫性腦缺血/再灌注損傷[41]。miR-210是一種受缺氧誘導(dǎo)因子和Akt激酶依賴性途徑調(diào)節(jié)的重要miRNA,研究表明其表達增加與迷走神經(jīng)刺激調(diào)節(jié)腦缺血/再灌注的氧化還原狀態(tài)有關(guān),是針對腦缺血/再灌注損傷神經(jīng)保護的潛在靶點[42]。在小鼠中,miR-137通過抑制Src依賴性MAPK信號通路減弱氧化應(yīng)激、凋亡和炎癥通路,從而對缺血性卒中產(chǎn)生神經(jīng)保護作用[43]。腦組織中最豐富的miRNA為miR-124,研究表明miR-124在腦缺血后的外周血和腦血管內(nèi)皮細胞中表達上調(diào),實驗證實miR-124可通過激活PI3K/AKT/Nrf2通路增加熱休克蛋白表達,從而抑制氧化應(yīng)激和細胞凋亡來保護小鼠嗜鉻細胞瘤細胞株(pheochromocytoma-12,PC-12)免受糖氧剝奪離體腦缺血/再灌注誘導(dǎo)的損傷[44]。
miRNA在缺血性卒中病理生理機制中的作用成為近年來的研究熱點之一,除去單純的機制研究,未來利用miRNA進行靶向治療也可能成為新的探索方向。
缺血性卒中后腦損傷包括卒中后炎癥反應(yīng)、氧化應(yīng)激、線粒體功能紊亂、血腦屏障破壞等導(dǎo)致的細胞死亡和神經(jīng)功能缺損等。近年來,氧化應(yīng)激反應(yīng)在缺血性卒中后腦損傷中的作用越來越受到人們的關(guān)注。大量研究證實卒中后氧化應(yīng)激與表觀遺傳機制之間存在緊密聯(lián)系,但其中的機制是復(fù)雜且不清的,需要更深入的研究探索表觀遺傳機制在卒中后氧化應(yīng)激中的具體作用?;诖?,未來通過干預(yù)表觀遺傳調(diào)控,改善卒中后氧化應(yīng)激失衡帶來的腦損傷,可能成為缺血性卒中治療的新方向。