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        海蘭褐蛋雞ZP3基因結(jié)構(gòu)及其在卵泡中表達規(guī)律分析

        2021-12-31 01:08:46朱帥鵬王東雪孫君衛(wèi)杜振偉孫桂榮李文婷
        畜牧獸醫(yī)學(xué)報 2021年12期
        關(guān)鍵詞:分析

        朱帥鵬,王東雪,劉 聰,孫君衛(wèi),杜振偉,孫桂榮,李文婷

        (河南農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院,鄭州 450046)

        卵透明帶蛋白(ZP)是圍繞在卵子周圍的一層糖蛋白基質(zhì)[1],其結(jié)構(gòu)與功能是以幾種蛋白之間相互作用為基礎(chǔ)[2]。ZP糖蛋白最早是在初級卵泡中合成[3],被轉(zhuǎn)化酶處理之后分泌到細胞外[4],在細胞外ZP蛋白受到水解酶切割形成單體(ZP1、ZP2、ZP3和ZP4),其中ZP3是精子的最初受體[5-6],它對卵子的生成、精卵結(jié)合以及早期胚胎發(fā)育都具有重要的作用[7]。ZP3與精子蛋白受體結(jié)合引發(fā)頂體反應(yīng)[8],促進精卵結(jié)合從而完成受精[9],除此之外ZP3還參與阻止多精入卵,有助于子宮內(nèi)受精卵的貼附[10]。

        ZP3可以與ZP1、ZP2、ZP4分別結(jié)合形成3種二聚體[11],構(gòu)成ZP蛋白的結(jié)構(gòu)框架,缺乏ZP1蛋白的卵母細胞不能形成正常的ZP組織[12],缺乏ZP3的雌性小鼠不能形成ZP蛋白[13],ZP3的突變會使其與ZP2之間作用機制受到影響,會導(dǎo)致女性空卵泡綜合征[14]進而引起人類不育[15],同時有研究證實,ZP3變異與綿羊[16]、豬等的產(chǎn)羔數(shù)、產(chǎn)仔數(shù)顯著相關(guān)。在小鼠中敲除ZP3后不能形成卵透明帶蛋白[17],研究者們因此認為,ZP3蛋白可能是免疫不育的潛在靶抗原[18]。

        目前有多種動物的ZP3 cDNA序列得到擴增,如褐家鼠、草原兔尾鼠、牦牛、野豬、歐洲兔等。但關(guān)于雞ZP3基因研究較少,因此,本試驗通過對海蘭褐蛋雞ZP3全長克隆,對其編碼區(qū)序列進行分析和功能結(jié)構(gòu)域預(yù)測,并和多種不同物種的編碼序列進行比對分析構(gòu)建基因進化樹,為雞ZP3及其功能的研究提供理論依據(jù)。通過構(gòu)建海蘭褐蛋雞ZP3在不同組織、不同發(fā)育階段卵泡以及不同發(fā)育階段的卵泡顆粒細胞和卵泡膜細胞的表達譜,分析ZP3在雞卵泡發(fā)育過程中的表達特征,為ZP3基因在卵泡發(fā)育過程中作用的研究提供基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        50周齡(50 W)海蘭褐蛋雞6只,其生長健康狀況相似且產(chǎn)蛋率均達到了70%以上。頸部脫臼致死,并取其心、肝、肺、腎、胸肌、腿肌、卵巢組織,收集50 W海蘭褐蛋雞各等級卵泡分離膜細胞和顆粒細胞,提取總RNA之后用于后續(xù)試驗。

        1.2 主要試劑及儀器

        氯仿、異丙醇、DEPC水溶液、無水乙醇、RNA提取試劑Trizol、胰蛋白酶(Solarbio),青鏈霉素混合液(Solarbio),胎牛血清、DMEM高糖培養(yǎng)基(BI),熒光倒置顯微鏡(Nikon,Japan),反轉(zhuǎn)錄試劑盒、RACE試劑盒(TaKaRa),熒光定量試劑(南京諾唯贊生物科技有限公司);4 ℃離心機、細胞培養(yǎng)箱、超微量分光光度計(美國Thermo公司),定量PCR儀(LightCycler96,瑞士Roche公司)等。

        1.3 引物設(shè)計

        使用引物設(shè)計軟件Oligo7,利用NCBI已知雞CDS區(qū)序列(NM_204389.2)設(shè)計引物F0、R0,用擴增得到的序列設(shè)計巢式PCR引物F1、R1、F2、R2、F3、R3,設(shè)計定量引物F、R,以β-actin作為內(nèi)參基因,引物均由尚亞生物有限公司合成,引物序列見表1。

        表1 引物序列Table 1 Primer sequences

        1.4 ZP3基因全長擴增

        利用RACE試劑盒,以卵泡3′和5′ RACE-cDNA為模板,用通用引物UPM分別與F1、R1進行巢式PCR第一輪擴增,以3′ UTR擴增為例,反應(yīng)體系為50 μL:3′ RACE-cDNA 2.5 μL,10×UPM 5 μL,引物F11 μL,2×Taq Buffer 25 μL,RNase-free ddH2O 16.5 μL。反應(yīng)程序選擇Touchdown程序:第一步95 ℃ 5 min;第二步95 ℃ 30 s,73 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,共20個循環(huán);第三步95 ℃ 30 s,63 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,共20個循環(huán);最后4 ℃保存。將第一輪擴增產(chǎn)物稀釋50倍后作為模板,以通用引物NEST和F2、R2分別進行第二輪巢式PCR,反應(yīng)體系為50 μL:稀釋后產(chǎn)物5 μL,引物F21 μL,引物NEST 1 μL,2×Taq Buffer 25 μL,RNase-free ddH2O 18 μL。PCR反應(yīng)程序:第一步95 ℃ 5 min;第二步95 ℃ 30 s、68 ℃ 30 s、72 ℃ 1 min共20個循環(huán);第三步72 ℃ 10 min;最后4 ℃保存。再將產(chǎn)物稀釋50倍后,以引物NEST分別和F3、R3進行第三輪巢式PCR,步驟及反應(yīng)程序與第二輪巢式PCR一致。將產(chǎn)物進行凝膠電泳分離后,選擇單一條帶進行切膠回收,連接T載體之后進行測序拼接。

        1.5 ZP3基因進化樹構(gòu)建及編碼區(qū)生物信息學(xué)分析

        利用MegAlign軟件對擴增得到的雞ZP3的CDS序列及已有的斑馬魚NM_131331.1、狗NM_001003224.1、牛NM_173974.3、人NM_007155.6、鼠M20026.1、兔NM_001195720.1、豬NM_213893.1 ZP3的核酸序列和氨基酸序列分別進行同源性比對,利用MEGA7構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。同時利用PSIPRED對ZP3氨基酸序列進行蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測,通過SWISS-MODEL在線軟件預(yù)測海蘭褐蛋雞ZP3蛋白三級結(jié)構(gòu),使用ProtParam工具對ZP3理化性質(zhì)進行分析,通過TMHMM對ZP3蛋白進行跨膜區(qū)分析,通過SignaiP-5.0 Server工具對ZP3蛋白進行信號肽檢測,通過EXPASY網(wǎng)站在線分析ZP3蛋白親疏水性。

        1.6 雞原代卵泡顆粒細胞和卵泡膜細胞分離培養(yǎng)與激素處理

        采用本實驗室成熟技術(shù)方法[19]分別收集不同等級卵泡:小白卵泡(SWF:1~3.9 mm)、大白卵泡 (LWF:4~4.9 mm)、小黃卵泡(SYF:5~8 mm)和等級卵泡(F6:9~15 mm、F5:16~20 mm、F4:21~25 mm、F3:26~30 mm、F2:31~35 mm、F1:136~40 mm),分離雞不同等級卵泡顆粒細胞以及膜細胞,接種于培養(yǎng)瓶,待其生長密度達到90%,利用TRIzol消化裂解細胞并提取總RNA進行后續(xù)試驗。取部分等級卵泡顆粒細胞分為4組,分別添加濃度為5、10、50 ng·mL-1的 FSH,對照組添加等量PBS,處理 24 h,去除培養(yǎng)基,用 PBS 進行沖洗后,加入適量TRIzol裂解提取總RNA。

        1.7 總RNA反轉(zhuǎn)錄

        反轉(zhuǎn)錄第一步反應(yīng)體系:4 μL 4×gDNA wiper Mix,Total RNA 1 pg-1 μg,添加RNase-free ddH2O至總體系16 μL,設(shè)置反應(yīng)程序為:42 ℃ 2 min,4 ℃ 60 min;第二步反應(yīng)體系:4 μL 5×HiScript Ⅲ qRT SuperMix 加入到上一步產(chǎn)物中,總體系20 μL,設(shè)定反應(yīng)程序為:37 ℃ 15 min,85 ℃ 5 s,4 ℃ 60 min。反應(yīng)結(jié)束后將反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物稀釋兩倍,以便用于后續(xù)的實時熒光定量PCR。

        1.8 ZP3基因qRT-PCR檢測

        以不同組織和細胞樣品cDNA為模板進行熒光定量PCR,總反應(yīng)體系為10 μL:SYBR qPCR Master Mix 5 μL,RNase-free ddH2O 3 μL,上、下游引物各0.5 μL,cDNA 1 μL。反應(yīng)程序為:第一步95 ℃ 5 min;第二步95 ℃ 12 s,60 ℃ 40 s,72 ℃ 30 s,共40個循環(huán),每個待測樣本3個生物學(xué)重復(fù),2個技術(shù)重復(fù)。

        1.9 統(tǒng)計與分析

        采用2-△△Ct法,以β-actin作為內(nèi)參基因,對ZP3基因進行熒光定量 PCR 分析。采用 SPSS24.0 的獨立樣本T-test 法檢驗不同樣本表達量的差異顯著性。

        2 結(jié) 果

        2.1 雞ZP3基因的克隆及cDNA全長獲得

        為分析ZP3結(jié)構(gòu)功能,以雞卵泡cDNA為模板,用引物F0、R0擴增ZP3 CDS區(qū),得到約1 341 bp 的條帶(圖1A),通過回收純化連接T載體進行測序。同時通過RACE試劑盒克隆得到5′ RACE 產(chǎn)物351 bp (圖1B),3′ RACE產(chǎn)物228 bp(圖1C),條帶明亮且單一,說明沒有可變剪切體存在,經(jīng)純化回收連接T載體測序,拼接得到ZP3全長1 415 bp,其中編碼區(qū)1 341 bp,5′ UTR 8 bp,3′ UTR 36 bp,該基因起始密碼子為ATG,終止密碼子為TGA,共編碼446個氨基酸,通過Ensembl網(wǎng)站的BLAST/BLAT分析,該基因位于10號染色體,共有9個外顯子,長度在90~375 bp之間。

        圖1 雞ZP3 基因CDS區(qū)(A)、5′ RACE(B)、3′ RACE(C)產(chǎn)物電泳圖Fig.1 Electrophoresis diagram of CDS region(A),5′ RACE(B)and 3′RACE(C)products of chicken ZP3 gene

        2.2 雞ZP3基因序列分析

        為分析ZP3在不同物種間的同源性,使用MegAlign將擴增得到的雞ZP3基因CDS序列與斑馬魚、狗、牛、人、鼠、兔、豬等7個不同物種ZP3核酸序列進行同源性比對,同源性分別為:60.8%、60.3%、50.4%、60%、57.6%、58.9%、55.5%,氨基酸序列同源性比對顯示同源性分別為:31.4%、47.8%、48.6%、47.9%、45.9%、46.8%、49.5%。使用Mega 7.0 軟件構(gòu)建進化樹,結(jié)果如圖2所示,結(jié)果表明,雞ZP3基因在進化過程中符合物種進化規(guī)律,并且通過系統(tǒng)發(fā)生樹可以得出海蘭褐蛋雞與斑馬魚相距較近,與人和鼠次之,與豬最遠。

        圖2 海蘭褐蛋雞ZP3基因進化樹Fig.2 ZP3 phylogenetic tree of Hailan brown laying hens

        2.3 雞ZP3蛋白結(jié)構(gòu)功能分析

        為研究海蘭褐蛋雞ZP3蛋白質(zhì)理化性質(zhì),使用ProtParam工具對ZP3蛋白理化性質(zhì)進行分析,結(jié)果表明,該基因共編碼446個氨基酸,負電荷殘基總數(shù)45個,正電荷殘基總數(shù)為38個,其中丙氨酸所占比例最大(11.4%),纈氨酸次之(10.3%),甲硫氨酸含量最低(1.1%),總原子數(shù)為6 623,分子式為C2079H3284N608O631S21,體外蛋白半衰期為30 h,不穩(wěn)定系數(shù)為44.91,將其歸類為不穩(wěn)定蛋白,相對分子質(zhì)量為47 565.90,理論PI為5.83。通過PSIPRED在線分析ZP3蛋白二級結(jié)構(gòu),結(jié)果顯示,該蛋白主要由257個氨基酸殘基組成的無規(guī)則卷曲形成,占整個二級結(jié)構(gòu)的57.62%,是二級結(jié)構(gòu)的主要構(gòu)成部分;由137個氨基酸構(gòu)成延伸部分,占整體的30.72%,由52個氨基酸組成α-螺旋并占據(jù)整個結(jié)構(gòu)的11.65%,通過SWISS-MODEL在線軟件預(yù)測海蘭褐蛋雞ZP3蛋白三級結(jié)構(gòu)(圖3A),發(fā)現(xiàn)無規(guī)則卷曲占據(jù)主要成分,與二級結(jié)構(gòu)分析結(jié)果相符合。通過TMHMM和SIGNAIP-5.0 SERVERZP3對ZP3蛋白進行跨膜結(jié)構(gòu)和信號肽分析,結(jié)果表明ZP3蛋白存在一個跨膜區(qū)(圖3B),同時信號肽分析表明存在一個信號區(qū)域(圖3C),表明該蛋白可以進行信息傳導(dǎo),預(yù)測該蛋白可能具有信號傳遞的作用,通過蛋白質(zhì)親水性工具(Protein GRAVY)對其親水性總值進行計算,得到結(jié)果為0.002,表示該蛋白為弱的疏水性蛋白質(zhì)。

        2.4 海蘭褐蛋雞不同組織中ZP3基因的表達分析

        為研究ZP3基因在50 W海蘭褐蛋雞不同組織中的表達情況,采用qRT-PCR 的方法,以β-actin作為內(nèi)參基因,結(jié)果如圖4所示,ZP3在心、肝、肺、腎、卵巢、胸肌、腿肌等組織中均有表達,在卵巢中的相對表達量最高,且顯著高于其它組織(P<0.05),表示ZP3基因可能在卵巢中發(fā)揮重要生理作用。

        A.ZP3的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測;B.ZP3的跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測;C.ZP3的信號肽預(yù)測A.Prediction of ZP3 tertiary structure;B.Prediction of ZP3 transmembrane structure;C.Prediction of ZP3 signal peptide圖3 ZP3蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測分析Fig.3 Prediction analysis of ZP3 protein structure

        小寫字母不同表示差異顯著(P<0.05),下同Different lowercase letters indicate significant differences (P<0.05),the same as below圖4 不同組織中ZP3 的表達Fig.4 Expression of ZP3 in different tissues

        2.5 雞ZP3基因在不同等級卵泡、顆粒細胞、膜細胞的表達

        qRT-PCR檢測ZP3基因在不同等級卵泡、顆粒細胞、膜細胞中的表達,結(jié)果見圖5,在初始卵泡(F6)中表達量較低,隨著卵泡的生長發(fā)育,該基因表達量不斷升高,在F1階段表達量顯著高于F6階段(P<0.05)。

        圖5 不同等級卵泡中ZP3的表達Fig.5 Expression of ZP3 in follicles of different grades

        qRT-PCR檢測ZP3基因在不同等級卵泡顆粒細胞中的表達,結(jié)果見圖6,在卵泡發(fā)育初期基因表達量最低,隨著卵泡的發(fā)育,基因表達量增加,在卵泡發(fā)育近成熟(F1階段),ZP3表達量顯著高于其他階段(P<0.05)。ZP3在不同等級卵泡膜細胞中的表達情況見圖7,卵泡膜細胞ZP3表達趨勢和卵泡顆粒細胞相似,小黃卵泡中表達量最低,在F1階段表達量最高。ZP3總體呈現(xiàn)逐漸上升表達趨勢,并且趨勢與卵泡中表達趨勢一致,但是在顆粒細胞中表達量明顯高于膜細胞,表示該基因主要在顆粒細胞中發(fā)揮主要功能。

        圖6 不同等級卵泡顆粒細胞中ZP3的表達Fig.6 Expression of ZP3 in follicular granulosa cells of different grades

        圖7 不同等級卵泡膜細胞中ZP3的表達Fig.7 Expression of ZP3 in theca cells of different grades

        2.6 不同濃度FSH對卵泡顆粒細胞中ZP3基因表達的影響

        為研究不同濃度FSH對卵泡顆粒細胞中ZP3表達量的影響,分別采用5、10、50 ng·mL-1濃度的FSH對卵泡顆粒細胞進行處理,24 h后收集細胞樣品,采用熒光定量PCR進行基因表達量檢測,結(jié)果如圖8所示,3種濃度的處理組之間并無顯著差異,但均顯著高于空白對照組(P<0.05)。

        圖8 不同濃度FSH對卵巢顆粒細胞中ZP3 表達的影響Fig.8 Effects of FSH with different concentrations on the expression of ZP3 in ovarian granulosa cells

        3 討 論

        透明帶蛋白在哺乳動物中有著很高的保守性,但是在非哺乳動物中的研究較少。有研究表明,在小鼠及爪蟾中ZP3誘導(dǎo)精子發(fā)生頂體反應(yīng),從而阻止多精受精。在對萍鄉(xiāng)紅鯽的研究中發(fā)現(xiàn),精子和卵子相遇需要一套穩(wěn)定的機制,使精子能夠迅速準確地進入卵子[20]。而ZP3就是其中的一個識別因子,在與精子結(jié)合后,ZP3被修飾而不再具有精子受體活性和頂體反應(yīng)誘導(dǎo)作用[21]。因此,在非哺乳動物中ZP3同樣起到阻止多精受精的作用。在傳統(tǒng)家禽育種中,產(chǎn)蛋率和受精率在很大程度上影響了育種的成本,而如何從分子機制上提高產(chǎn)蛋率和受精率成為了育種的新方向。

        目前ZP3的研究主要集中在精卵結(jié)合方面,有研究證明,在哺乳動物如人和鼠上,ZP3蛋白主要在卵巢組織表達[22],但在家禽上的研究較少,家禽原始卵泡的發(fā)育起始于卵泡顆粒細胞分泌的細胞因子,促進卵母細胞生長,家禽的卵泡結(jié)構(gòu)主要有卵黃膜層、顆粒細胞層、卵泡膜內(nèi)層、卵泡膜外層雞外周組織層[23],其中卵泡顆粒細胞在卵泡生長發(fā)育過程中發(fā)揮重要作用[24],顆粒細胞與膜細胞之間的互作機制是卵巢雌激素形成的基礎(chǔ)[25]。在卵泡發(fā)育過程中,F(xiàn)SH可以促進發(fā)育差的卵泡再次發(fā)育[26],在小鼠模型中,敲除FSH受體可顯著抑制卵泡生成,敲除ZP3會使小鼠卵母細胞發(fā)育失常[27],因此FSH和ZP3之間可能存在互作機制,同時 FSH還可以促進雌二醇分泌,以及通過促進抗凋亡蛋白(如XIAP蛋白和FLIP抑制蛋白)的表達來抑制細胞凋亡[28],雌二醇又可以與顆粒細胞內(nèi)受體結(jié)合形成復(fù)合物通過抑制P53信號通路和相關(guān)蛋白進而抑制凋亡[29],同時雌二醇還可以通過TGF-α影響XIAP進而促進顆粒細胞增殖[30]。對哺乳動物的大量研究表明,顆粒細胞產(chǎn)生的孕酮可以反作用于卵泡顆粒細胞并抑制其凋亡,而顆粒細胞的凋亡是卵泡閉鎖的根本原因[31],卵泡閉鎖與產(chǎn)蛋量緊密相關(guān),減少卵泡的閉鎖在一定程度上可以提高產(chǎn)蛋量。

        4 結(jié) 論

        本試驗獲得的ZP3全長為1 415 bp,其中編碼區(qū)1 341 bp;通過對海蘭褐蛋雞ZP3進行組織表達譜分析表明,基因在卵巢中表達量最高,通過構(gòu)建不同發(fā)育階段卵泡的表達譜,發(fā)現(xiàn)ZP3隨著卵泡發(fā)育,在成熟卵泡中表達量最高,在顆粒細胞層表達量逐漸增加;在FSH處理顆粒細胞后,發(fā)現(xiàn)ZP3表達量顯著上調(diào),本試驗證明FSH可以促進ZP3表達量的增加。基于以上結(jié)果推測,ZP3可能參與調(diào)控雞的產(chǎn)蛋過程,但FSH-顆粒細胞-ZP3之間的具體調(diào)控機制還需后續(xù)研究。

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