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        基于MRI影像組學(xué)預(yù)測肝泡型包蟲病邊緣微血管侵犯

        2021-12-26 02:46:44夏雨薇劉文亞
        關(guān)鍵詞:特征信號模型

        樊 霞,王 健,夏雨薇,劉文亞*

        [1.新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院影像中心,新疆 烏魯木齊 830054;2.慧影醫(yī)療科技(北京)有限公司,北京 100192]

        肝泡型包蟲病(hepatic alveolar echinococcosis,HAE)是多房棘球絳蟲幼蟲感染人體引起的潛在致命性寄生蟲疾病,農(nóng)牧區(qū)多發(fā),未經(jīng)藥物及手術(shù)干預(yù)患者10年生存率僅29%[1]。根治性肝切除術(shù)是治療HAE的首選方法[2],術(shù)中在完整切除病灶的同時,需最大限度保留正常肝組織,避免術(shù)后發(fā)生肝功能衰竭;但肉眼并不能區(qū)分病灶邊緣是否具有活性及微血管侵犯,傳統(tǒng)影像學(xué)雖能于術(shù)前判斷病灶邊界活性[3],但人工閱片受主觀因素影響。影像組學(xué)能從原始圖像中挖掘肉眼不可見的潛在數(shù)據(jù)[4-6],將其用于精確診斷和治療。本研究基于機器學(xué)習(xí)(machine learning, ML)方法定量分析HAE病灶及邊緣的異質(zhì)性,評估MR T2WI影像組學(xué)模型預(yù)測HAE病灶邊緣微血管侵犯的價值。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 回顧性收集2012年1月—2020年3月89例于新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院經(jīng)手術(shù)病理證實HAE患者,男38例,女52例,年齡12~65歲,平均(36.8±13.2)歲。納入標(biāo)準(zhǔn):①于術(shù)前3天內(nèi)接受MR檢查,且資料完整;②術(shù)后病理資料完整。排除標(biāo)準(zhǔn):①病理切片未包括病灶邊緣帶與肝正常組織交界帶;②MRI數(shù)據(jù)來自不同機型,影響提取影像組學(xué)特征。檢查前患者或監(jiān)護人均簽署知情同意書。

        1.2 儀器與方法 采用Philips Achieva11.5T MR儀行上腹部掃描,采集T1WI、T2WI,行彌散加權(quán)成像(diffusion-weighted imaging, DWI)。軸位T2WI:TR 477 ms,TE 80 ms,層厚5.5 mm,層間隔1 mm,F(xiàn)OV 375 mm×375 mm,翻轉(zhuǎn)角90°;DWI:采用單次激發(fā)自旋回波平面掃描序列,b值為0和1 000 s/mm2,TR 1 600 ms,TE 88 ms。

        1.3 病理分析 由2名具有3年病理科住院醫(yī)師在1名副主任醫(yī)師指導(dǎo)下評估HAE病灶邊緣帶微血管密度(microvessel density, MVD),并進行MVD計數(shù),計數(shù)誤差≤3時取二者平均數(shù),>3時由副主任醫(yī)師進行核對。首先于光鏡下觀察HE染色或CD34染色切片,以確定邊緣帶區(qū)域;之后參照Weidmer方法先于低倍鏡(40倍)下尋找病灶邊緣微血管密集區(qū)域,即微血管“熱點”區(qū)域,再以高倍鏡(200倍)在微血管最多視野內(nèi)進行微血管計數(shù);每例尋找3個“熱點”進行計數(shù),取平均值作為結(jié)果,以MVD>15為病灶邊緣帶存在微血管侵犯[7]。

        1.4 影像組學(xué)分析 將影像學(xué)數(shù)據(jù)以DICOM格式導(dǎo)入影像組學(xué)Radcloud平臺(http://radcloud.cn/,3.1.0版本,慧影醫(yī)療科技有限公司,北京)。HAE病灶呈T2WI稍低信號或含小囊泡的高混雜信號[8];邊緣帶 DWI呈條帶狀高信號,表觀彌散系數(shù)(apparent diffusion coefficient, ADC)圖呈低信號。由1名具有10年腹部MRI診斷經(jīng)驗的副主任醫(yī)師參考DWI及自動生成的ADC圖,于T2WI上沿病灶及邊緣帶外緣逐層手動勾畫ROI,由另1名具有20年影像學(xué)診斷經(jīng)驗的主任醫(yī)師復(fù)核勾畫結(jié)果,對病灶ROI進行自動插值,獲得其感興趣容積(volume of Interest, VOI),見圖1。

        圖1 患者女,60歲,HAE 于軸位T2WI上勾畫HAE病灶ROI并生成VOI的示意圖 A.腹部軸位T2WI示肝右前葉及方葉巨大混雜短T2信號病灶,內(nèi)見多發(fā)小圓形長T2囊泡; B.于T2WI上沿病灶邊緣勾畫ROI(紅線區(qū)域); C.對病灶ROI進行自動插值,獲得整個病灶VOI

        采用Radcloud平臺python中的函數(shù)包pyradiomics(https://pyradiomics.readthedocs.io/)提取VOI的影像組學(xué)特征。以方差閾值(方差閾值=0.8)和單變量特征選擇法進行特征降維,篩選P<0.05的最優(yōu)特征,剔除與微血管侵犯相關(guān)性較低的特征。

        按8∶2比例將89例患者分為訓(xùn)練集(n=70)和測試集(n=19)。在訓(xùn)練集數(shù)據(jù)中以最優(yōu)特征參數(shù)建立隨機森林(random forest,RF)、極限梯度增強樹(extreme gradient boosting,XGBoost)和邏輯回歸(Logistic regression, LR)三類ML模型,并于測試集數(shù)據(jù)中進行驗證。

        1.5 統(tǒng)計學(xué)分析 采用SPSS 26.0統(tǒng)計分析軟件。以±s表示符合正態(tài)分布的計量資料,采用t檢驗進行組間比較。對計數(shù)資料行χ2檢驗。在Radcloud平臺上進行影像組學(xué)統(tǒng)計分析,采用受試者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲線,計算曲線下面積(area under the curve, AUC),以敏感度、特異度、召回率及F1得分(指基于準(zhǔn)確率與召回率的調(diào)和平均值)評價ML模型預(yù)測HAE病灶邊緣微血管侵犯的效能。

        2 結(jié)果

        病理結(jié)果顯示,89例中,32例病灶邊緣存在微血管有侵犯,男17例,女15例,年齡12~65歲,平均(37.4±15.3)歲;57例無侵犯,男21例,女36例,年齡15~59歲,平均(36.5±12.0)歲;其間患者性別(t=0.28,P=0.77)及年齡差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=2.22,P=0.13)。

        訓(xùn)練集70例中,25例存在微血管侵犯、45例無侵犯;測試集19例中,7例存在微血管侵犯、12例無侵犯。

        共提取1 409個影像組學(xué)特征,以方差閾值方法選出454個特征,再以單變量選擇法篩選,最終得出7個最優(yōu)影像組學(xué)特征(表1),包括1個一階統(tǒng)計特征和6個高階統(tǒng)計特征。

        表1 最終獲得的基于MR T2WI鑒別HAE病灶邊緣微血管侵犯的7個最優(yōu)影像組學(xué)特征

        ROC曲線所示,XGBoost、RF和LR三種ML模型鑒別訓(xùn)練集及測試集中HAE病灶邊緣有無微血管侵犯的AUC、敏感度及特異度見表2、3。XGBoost分類器在訓(xùn)練集及測試集中均表現(xiàn)最佳,AUC分別為0.96和0.89,見圖2。

        表2 各ML模型判斷訓(xùn)練集和測試集中HAE病灶邊緣存在微血管侵犯的ROC曲線分析結(jié)果

        表3 各ML模型判斷訓(xùn)練集和測試集中HAE病灶邊緣無微血管侵犯的ROC曲線分析結(jié)果

        圖2 XGBoost模型鑒別訓(xùn)練集(A)和測試集(B)中HAE病灶邊緣有無微血管侵犯的ROC曲線 紅線為存在微血管侵犯,綠色為無微血管侵犯

        3 討論

        HAE病灶周邊浸潤增殖帶,即“邊緣帶”,為HAE病灶向周圍浸潤生長的基礎(chǔ),該區(qū)域存在具有增殖活性的蟲體,同時存在較為豐富的微血供狀態(tài)。HAE是否具有生物學(xué)活性及微血管侵犯,對臨床制定治療及隨訪計劃具有重要指導(dǎo)意義。李肖紅[7]認為光鏡下MVD>15提示邊緣帶存在微血管侵犯,且部分類型HAE的PET-CT最大標(biāo)準(zhǔn)攝取值與MVD計數(shù)呈正相關(guān)。AZIZI等[9]發(fā)現(xiàn),MRI顯示HAE病變存在小囊泡與其代謝活性存在相關(guān)性。T1WI上,HAE病灶實性成分相對周圍正常肝實質(zhì)呈低信號,液化呈更低信號,對小囊泡顯示不佳,部分病灶邊界顯示不清;T2WI上HAE表現(xiàn)為高、低混雜信號,病灶內(nèi)液化及小囊泡呈高信號,富含纖維組織的實性成分呈稍低信號;高b值(≥800 s/mm2)DWI上,壞死呈高/稍高信號,實性成分常表現(xiàn)為低信號;ADC圖上HAE病灶實性成分相比周圍肝實質(zhì)呈高信號[10],雖易檢出病灶,但圖像分辨率較低;對比劑釓噴酸葡甲胺(Gd-DTPA)增強MRI中正常肝實質(zhì)強化而HAE病灶無強化,病灶邊界清晰,由于周圍纖維炎性反應(yīng),少數(shù)HAE病變可能出現(xiàn)不規(guī)則邊緣強化[11],而小囊泡仍顯示不佳。T2WI能反映HAE病灶的影像學(xué)特征,故本研究基于T2WI勾畫病灶ROI。

        HAE影像學(xué)和臨床表現(xiàn)與惡性腫瘤相似[12],對其進行影像組學(xué)紋理分析有助于診斷。既往研究[13]采用瘤內(nèi)影像組學(xué)及瘤內(nèi)和瘤周聯(lián)合影像組學(xué)方法于術(shù)前預(yù)測肝細胞肝癌微血管侵犯,結(jié)果顯示瘤內(nèi)和瘤周聯(lián)合影像組學(xué)模型的效能較好。HAE病灶邊緣帶生長活躍,結(jié)構(gòu)致密,限制了水分子運動,故DWI呈高信號[14]。本研究參考DWI及ADC圖像,基于T2WI勾畫HAE病灶及邊緣帶,提取與1 049個病灶邊緣微血管侵犯相關(guān)的影像組學(xué)特征,以反映HAE病灶的異質(zhì)性;經(jīng)降維處理,最終篩選出7個最優(yōu)特征,包括1個一階統(tǒng)計特征和6個高階統(tǒng)計特征。一階統(tǒng)計特征包括一階統(tǒng)計量特征、形狀特征及紋理特征;高階統(tǒng)計特征包括小波分析濾波器、平方根濾波器、對數(shù)濾波器及多根濾波器等。一階統(tǒng)計量特征為不考慮空間關(guān)系時個體體素值的分布,經(jīng)過濾波器變換成為高階統(tǒng)計特征,通過鄰域灰度差矩陣計算高階統(tǒng)計量。百分位數(shù)為體素值分布的某個百分位數(shù)的特征值。高灰度行程強調(diào)測量對象為高灰度值的分布,其值越高,則圖像中高灰度值區(qū)域所占比例越大。上述特征代表HAE病灶在圖像中的亮度值及高灰度值,反映HAE病灶邊緣區(qū)域影像的局部變化,可量化評價有、無微血管侵犯的HAE病灶之間的差異。本研究最終所獲7個最優(yōu)特征中,3個(灰度級長度矩陣)為紋理特征,與既往研究[15]采用紋理分析評估前列腺癌腫瘤異質(zhì)性的結(jié)果類似。

        本研究采用XGBoost及RF分類器構(gòu)建的ML模型預(yù)測訓(xùn)練集及測試集HAE病灶邊緣微血管侵犯的AUC均較高,但RF分類器判斷測試集存在微血管侵犯的準(zhǔn)確率較低(0.62)。F1得分為基于精確率與召回率的調(diào)和平均值,F(xiàn)1得分越大,模型性能越好。本研究RF分類器在測試集數(shù)據(jù)中的F1得分均低于XGBoost分類器,綜合考慮,以XGBoost分類器構(gòu)建的ML模型預(yù)測HAE病灶邊緣微血管侵犯的效能較好。

        綜上所述,基于MR T2WI影像組學(xué)XGboost ML模型可有效預(yù)測HAE邊緣微血管侵犯。本研究的局限性:①為回顧性分析,且樣本量偏??;②僅基于T2WI進行分析,有待進一步完善。

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