丁繁萍,黃躍杰,魚?,|,馬紓薏,孟凡艷,石長青,胡建軍*
(1.塔里木大學動物科學學院,新疆阿拉爾 843300;2.新疆生產建設兵團第一師畜牧獸醫(yī)工作站,新疆阿拉爾 843300)
棘球蚴病(Echinococcosis)又稱包蟲病,是棘球絳蟲的中絳期棘球蚴感染所致,牛、羊、人等為中間宿主,狗、豹、鬣狗等為終末宿主,棘球蚴主要寄生于肝、肺等器官[1]。在分類上屬于帶科棘球屬。棘球屬包含5個種,即細粒棘球絳蟲(Echinococcusgranulosus)、多房棘球絳蟲(Echinococcusmultilocularis)、石渠棘球絳蟲(Echinococcusshiqucus)、少節(jié)棘球絳蟲(Echinococcusoligarthrus)和福氏棘球絳蟲(Echinococcusvogeli),我國以前3個種較為多見,其中對人畜危害最嚴重的為細粒棘球絳蟲[2]。細頸囊尾蚴(Cysticercustenuicollis)俗稱水鈴鐺,是泡狀帶絳蟲的中絳期,綿羊、豬是其中間宿主,在牛和其他野生反芻動物的肝臟、腸系膜及其他器官中有時可見,感染嚴重時還會寄生于腎臟等器官[3-4]。
棘球蚴具有不同的基因型,且形態(tài)學分類方法不統(tǒng)一,為棘球蚴基因型鑒定帶來了困難[5-6]。棘球蚴線粒體基因組中編碼細胞色素C氧化酶亞單位Ⅰ基因(COI基因)和NADH脫氫酶Ⅰ基因(NDI基因)的差異常用于線粒體基因型的變化程度研究[7-8];細頸囊尾蚴的Cytb基因進化速度適中,適用于種內到科間甚至于科間的系列進化關系、種群水平的研究[9]。本研究以傳統(tǒng)分類學為基礎,采用棘球蚴COI基因、NDI基因和細頸囊尾蚴Cytb基因進行分子生物學基因分型鑒定,為包蟲病的分子流行病學和遺傳演化提供參考。
1.1.1 病料來源 新疆南疆某羊場部分羊只出現(xiàn)消瘦、精神萎靡不振。剖檢可觀察肝臟有大小不等的棘球蚴囊泡;肝臟、腸系膜上有雞蛋大小的細頸囊尾蚴囊泡黏附。采集棘球蚴囊泡、細頸囊尾蚴囊泡保存?zhèn)溆谩?/p>
1.1.2 儀器設備 旋渦混合器,三孔三溫水浴鍋,單道微量移液器,超凈工作臺,電泳儀,凝膠成像儀。
1.1.3 主要試劑 血液/細胞/組織DNA提取試劑盒、2×TaqPCR MasterMix、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒,天根生化科技(北京)有限公司產品。
1.2.1 形態(tài)學檢查 剝離肝臟上棘球蚴、細頸囊尾蚴囊泡置于潔凈的平皿,無菌注射器抽取囊泡中囊液,滴加于載玻片,鏡檢。
1.2.2 樣本總DNA提取 參照“血液/細胞/組織DNA提取試劑盒”說明書,提取棘球絳蟲、細頸囊尾蚴蟲體組織總DNA,置-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3 引物設計與合成 參照文獻[10-11]中棘球蚴基因分型特異性引物COI基因引物(COI-F、COI-R)和NDI基因引物(NDI-F、NDI-R)、細頸囊尾蚴基因分型特異性引物Cytb基因引物(Cytb 1、Cytb 2),引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成(表1)。
表1 引物序列
1.2.4 參考序列 文中涉及的棘球蚴、細頸囊尾蚴參考株基因序列均下載于NCBI中GenBank。
1.2.5 PCR反應 棘球蚴COI、NDI基因PCR反應體系(50 μL):2×TaqPCR Master Mix 25 μL,上、下游引物各1 μL,模板DNA 5 μL,ddH2O 18 μL。PCR反應條件:94 ℃預變性4 min;94 ℃ 30 s,54 ℃ 1 min,72 ℃ 1 min,共35個循環(huán); 72 ℃延伸10 min。細頸囊尾蚴Cytb基因PCR反應體系(50 μL):2×TaqPCR Master Mix 25 μL,引物Cytb 1和Cytb 2各1 μL,模板DNA 5 μL,ddH2O 18 μL。PCR反應條件:95 ℃預變性5 min;95 ℃ 30 s,52 ℃ 45 s,72 ℃ 1.5 min,共30個循環(huán);72 ℃延伸10 min。分別取上述5 μL PCR擴增產物經10 g/L瓊脂糖凝膠電泳檢測。
1.2.6 PCR產物純化回收 PCR擴增產物切膠,按照TIAN gel Midi Purification Kit試劑盒說明書純化回收PCR產物,送生工生物工程(上海)股份有限公司測序。
1.2.7 序列分析 測序結果在NCBI中Blast比對,DNA Star軟件進行核苷酸序列同源性分析、系統(tǒng)發(fā)育分析;MEGA 5.0軟件繪制遺傳進化樹。
剖檢可見患羊肝臟表面凹凸不平,表面均有大小不等的棘球蚴囊泡突起,囊泡液呈淡黃色,囊壁分兩層(角質層和生發(fā)層);此外在肝臟、腸系膜上附有雞蛋大小的細頸囊尾蚴囊泡,泡內充滿透明囊液。
顯微鏡下觀察可見囊液中原頭蚴上有小鉤吸盤,可見內嵌頭節(jié)、外翻頭節(jié)。
以棘球蚴、細頸囊尾蚴蟲體組織DNA為模板,棘球蚴特異性引物(COI-F、COI-R和NDI-F、NDI-R),細頸囊尾蚴特異性引物(Cytb1/Cytb2),分別擴增出285、510、1 086 bp大小的片段,與預期的目的片段大小相符(圖1)。
M.DNA 標準DL 2 000;1.棘球蚴COI基因PCR擴增產物;2、3.棘球蚴NDI基因PCR擴增產物;4.細頸囊尾蚴Cytb 基因PCR擴增產物
文中棘球蚴樣本分離株命名為GBC,以棘球蚴COI、NDI基因引物(COI-F/COI-R)、(NDI-F/NDI-R),PCR擴增、測序后在NCBI中進行Blast比對,與棘球蚴參考株核苷酸序列同源性分別可達97%、99%以上(圖2和圖3)。
圖2 棘球蚴COI基因核苷酸同源性比較
圖3 棘球蚴NDI基因核苷酸同源性比較
運用DNA Star對棘球蚴COI基因核苷酸序列進行同源性比較;MEGA 5.0軟件用鄰近法(Neighbor-joining,NJ)構建棘球蚴COI基因系統(tǒng)進化樹(圖4)
圖4 以棘球蚴COI基因構建系統(tǒng)進化樹
將細頸囊尾蚴樣本命名為XJNWY,與參考株進行核苷酸同源性比較,運用MEGA 5.0軟件采用鄰近法(NJ)構建系統(tǒng)進化樹。結果顯示,該序列與參考株肯尼亞/獅子(AB905198.1)、湖南/豬(FJ518620.1)、甘肅/羊(GQ228819.1)、攀枝花/山羊(JF720928.1)及中國/山羊(KT258035.1)位于同一進化分支上,序列間核苷酸同源性較高(90.9%~99.5%);而與細頸囊尾蚴參考株芬蘭/豬(AB731727.1)、土耳其/羊(KU925396.1)、意大利/牛(KU925423.1)、希臘/羊(KU925430.1)、墨西哥/豬(KX039965.1)、西班牙/羊(KY766903.1)及土耳其/牛(KY766904.1)同源性較低(74.6%~75.0%)(圖5和圖6)。
圖5 細頸囊尾蚴Cytb基因核苷酸同源性比較
圖6 細頸囊尾蚴Cytb基因構建系統(tǒng)進化樹
棘球蚴病嚴重危害人畜健康,世界性分布,經濟損失嚴重。利用分子生物學技術,分析棘球蚴各地理株間DNA序列差異,可將其分為10個基因型,包括Gl/羊株(Common sheep strain)、G2/塔斯馬尼亞羊株(Tasmanian sheep strain)、G3/水牛株(Buffalo strain)、馬株(Horse strain / G4)、牛株(Ordeppi strain / G5) 、駱駝株(Camel strain / G6)、豬株(Pig strain / G7)、鹿株(Cervid strain / G8)、波蘭株(Polish strain/G9)及麋鹿株(Fennoscandian cevid strain / G10)。其中,G1基因型在世界大部分地區(qū)流行[9]。
我國20多個省區(qū)均有棘球蚴感染的相關報道,新疆、甘肅、寧夏、內蒙古、青海、四川等地為高發(fā)區(qū),占全國范圍的87%[12]。新疆地區(qū)棘球蚴常見為G1基因型,其中Meng Q L等[13]報道新疆羊的感染率為9.8%。此外,Guo B P等[12]首次報道了新疆羊群中存在棘球G3基因型感染。在本研究中,所采樣本被鑒定為細粒棘球蚴G1基因型。
本研究中,細頸囊尾蚴XJNWY與參考株湖南/豬(FJ518620.1)、甘肅/羊(GQ228819.1)、攀枝花/山羊(JF720928.1)及中國/山羊(KT258035.1)的核苷酸同源性高(90.9%~99.5%),說明它們種群間遺傳差異較??;而與部分國外的細頸囊尾蚴參考株芬蘭/豬(AB731727.1)、土耳其/羊(KU925396.1)、意大利/牛(KU925423.1)、希臘/羊(KU925430.1)、墨西哥/豬(KX039965.1)、西班牙/羊(KY766903.1)及土耳其/牛(KY766904.1)同源性較低,僅有74.6%~75.0%。說明相鄰地區(qū)之間的同源性較相隔較遠地區(qū)之間的分離株同源性較高。
棘球蚴、細頸囊尾蚴的宿主眾多,從形態(tài)學上分類,生物表型易受到外界環(huán)境的影響,同種不同分離株,在生物學特征方面存在著一定的差異[14]。隨著分子生物學技術的發(fā)展,從基因水平比較分析同一物種不同分離株的差異,有助于對寄生蟲的分類、種和株的分子鑒定和遺傳演化的研究。
本研究樣本數(shù)量有限,新疆南疆地區(qū)家畜棘球蚴和細頸囊尾蚴其他基因型混合感染情況有待進一步研究。
本研究對分離自新疆南疆某規(guī)模羊場的棘球蚴、細頸囊尾蚴進行基因測序并分析,其結果顯示該病例為羊棘球蚴G1基因型和細頸囊尾蚴的混合感染。