賽文莉,姚 敏,姚登福
1.南通大學(xué)附屬醫(yī)院臨床醫(yī)學(xué)研究中心(南通226001);2.南通大學(xué)醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)系(南通 226001)
肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是我國最常見的惡性腫瘤之一。HCC 發(fā)生的主要病原學(xué)因素與慢性持續(xù)性乙肝病毒(HBV)、丙肝病毒(HCV)感染,非酒精性脂肪性肝?。∟AFLD)及毒物攝入等密切相關(guān)[1-3],為多基因參與、多階段進(jìn)展的肝細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化。其機(jī)制復(fù)雜,早期診斷難,治療效果不理想,預(yù)后差[4-5]。臨床與基礎(chǔ)的最新研究顯示,鋅指蛋白家族(zinc finger proteins,ZNFs)是人類基因組中最大的轉(zhuǎn)錄因子家族,是參與調(diào)控細(xì)胞分化、胚胎發(fā)育和多種疾病相關(guān)的功能性蛋白質(zhì)[6]。復(fù)雜的ZNFs及其多達(dá)18種的Krüppel-like轉(zhuǎn)錄因子(KLFs)異常與多種腫瘤進(jìn)展[7]。作為轉(zhuǎn)錄激活因子調(diào)控細(xì)胞周期和增殖分化,在肝細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化或HCC 進(jìn)展中,已發(fā)現(xiàn)有多種ZNFs 和至少7 種KLFs參與HCC 細(xì)胞增殖、分化、侵襲和轉(zhuǎn)移過程[8]。本文綜評了HCC 進(jìn)展密切相關(guān)ZNFs 和KLFs 研究的新進(jìn)展。
由2%人類基因編碼ZNFs具豐富生物多樣性功能,參與調(diào)控細(xì)胞分化、胚胎發(fā)育,參與多種腫瘤進(jìn)展[8]。除與DNA 結(jié)合外,也與RNA、蛋白質(zhì)和脂質(zhì)相互作用的能力[9]。依據(jù)鋅指半胱氨酸(Cys)和組氨酸(His)殘基所圍繞Zn2+空間構(gòu)型,可將ZNFs 分為C2H2樣(C2H2like)、塞結(jié)狀(Gag knuckle)、高音譜號(treble clef)、帶 狀(Zinc ribbon)、Zn2/Cys6型(Zn2/Cys6)、TAZ2樣(TAZ2domain like)、短Zn2+結(jié)合環(huán)(short Zinc binding loops)和金屬硫蛋白(metallothio?nein)等8 種[6]。廣泛研究的是C2H2型,其蛋白羧基端以線性重復(fù)排列,除串聯(lián)鋅指結(jié)構(gòu)外含Krüppel相關(guān)保守盒(Krüppel-associated box)、痘病毒鋅指(poxvi?rus zinc finger)等功能域[7]。KLFs含17個成員(KLF1~17)由73個氨基酸組成,羧基端含3個保守C2H2結(jié)構(gòu)域,鋅指含23~25個氨基酸,不同成員間高度保守,可激活/抑制靶基因轉(zhuǎn)錄,優(yōu)先與“GC box”或“CACCC”位點結(jié)合,含與靶DNA結(jié)合鋅指結(jié)構(gòu)域[10-11]。
ZNFs含通過結(jié)合Zn2+穩(wěn)定的短的可自我折疊形成“手指”結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),具有重復(fù)結(jié)構(gòu)的氨基酸模板,相隔特定距離的胱氨酸結(jié)合鋅指,因其自身結(jié)構(gòu)特點可選擇性結(jié)合特異的靶結(jié)構(gòu)[12-13],與靶分子DNA、RNA、DNA-RNA 序列特異性結(jié)合,在轉(zhuǎn)錄和翻譯水平上調(diào)控靶向基因表達(dá),在基因表達(dá)調(diào)控、細(xì)胞分化、胚胎發(fā)育等過程中發(fā)揮重要作用[14-15]。KLFs通過多種調(diào)控機(jī)制對靶基因進(jìn)行激活或抑制,控制靶基因表達(dá),功能異同,可分為:①與羧基末端結(jié)合蛋白(Ctbp)相互作用的轉(zhuǎn)錄抑制因子KLF3、KLF8和KLF12;②結(jié)合去乙酰酶的轉(zhuǎn)錄激活因子KLF1~2、KLF4~7;③與共同轉(zhuǎn)錄輔助抑制因子sin3A 相互作用而產(chǎn)生抑制因子KLF9~11、KLF13~14和KLF16[6,16-17]。KLFs 可調(diào)節(jié)生長、發(fā)育、分化、增殖和胚胎發(fā)育等,通過多種調(diào)控機(jī)制激活或抑制靶基因表達(dá),具有相對組織特異性,誘導(dǎo)多能干細(xì)胞,參與機(jī)體免疫調(diào)節(jié)和新血管生成,或與不同啟動子結(jié)合后異常轉(zhuǎn)錄,從而影響腫瘤的生物行為[18-19]。
ZNFs/KLFs分布于人體多種組織,在前列腺癌、甲狀腺癌、食管癌、胃癌、肝癌、胰腺癌、腸癌、膀胱癌、乳腺癌和宮頸癌等多種腫瘤中異常表達(dá),發(fā)揮促癌或抑癌作用[20-25]。睪丸組織表達(dá)的ZNF165 為組織特異性抗原(CT-Ag),但三陰性乳腺癌(TNBC)中見CT-Ag表達(dá),與SMAD3結(jié)合調(diào)控轉(zhuǎn)化生長因子-β依賴基因轉(zhuǎn)錄,促進(jìn)TNBC 細(xì)胞增殖和腫瘤生長[26]。原發(fā)性結(jié)腸癌中ZNF281表達(dá)在腫瘤進(jìn)展過程中增加,并與復(fù)發(fā)相關(guān),ZNF281 是EMT 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的一個組成部分,它有助于結(jié)直腸癌的轉(zhuǎn)移形成[27]。膀胱癌中ZNF165 mRNA和蛋白均過表達(dá),可作為一種新的診斷生物標(biāo)志物或用于發(fā)展膀胱腫瘤特異性免疫治療的靶點。KLF6在前列腺癌、神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞瘤、結(jié)直腸癌、肝癌等中是一種腫瘤抑制因子,不同剪接變異體可在不同腫瘤起源、發(fā)展過程中發(fā)揮作用[28-29]。
ZNFs 結(jié)構(gòu)復(fù)雜,功能巨大,調(diào)控機(jī)制形式多樣[12,30],如C2H2型ZNF 在HCC 進(jìn)展中調(diào)控可歸類①轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控:ZNFs 基因啟動子CpG 島區(qū)域被甲基化,從而抑制ZNFs 基因轉(zhuǎn)錄;②轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控:ZNFs 蛋白在腫瘤組織中的表達(dá)差異由癌癥相關(guān)的miRNA 調(diào)控;③翻譯后水平調(diào)控:不同的環(huán)境刺激會激活信號轉(zhuǎn)導(dǎo)級聯(lián)反應(yīng),使ZNFs 發(fā)生翻譯后修飾,如乙酰化、磷酸化等,PTMs 調(diào)控影響ZNFs蛋白與其他蛋白和靶基因DNA結(jié)合的能力;④與序列特異性DNA結(jié)合水平調(diào)控:ZNFs以不同結(jié)構(gòu)域或蛋白翻譯后修飾(protein post-translational modifica?tions,PTMs)結(jié)合方式招募相互作用蛋白[31],包括轉(zhuǎn)錄輔助激活因子/輔助抑制因子、染色質(zhì)修飾因子和其他轉(zhuǎn)錄因子,最終與序列特異性DNA結(jié)合激活或抑制下游基因調(diào)控細(xì)胞的增殖、凋亡、侵襲與轉(zhuǎn)移,且不同調(diào)控層次致ZNFs 在腫瘤發(fā)生中的作用機(jī)制異同[32]。
ZNFs/KLFs 表達(dá)在HCC 進(jìn)展過程中發(fā)揮調(diào)控作用,包括轉(zhuǎn)錄輔助激活因子/輔助抑制因子、染色質(zhì)修飾因子和其他轉(zhuǎn)錄因子,最終與序列特異性DNA 結(jié)合激活下游基因調(diào)控癌細(xì)胞增殖、抑制凋亡、促進(jìn)侵襲或轉(zhuǎn)移等,肝癌相關(guān)ZNFs/KLFs的促進(jìn)作用歸納詳見表1。
表1 幾種肝癌相關(guān)ZNFs/KLFs的促癌作用[33-48]
由12個鋅指結(jié)構(gòu)域組成的ZNF233在HCC組織中顯著過表達(dá),與患者的腫瘤分期及預(yù)后相關(guān),細(xì)胞研究證實敲除ZNF233基因可抑制癌細(xì)胞增殖[30];定位于1號染色體的ZNF281(ZBP99)由Snail 和miR-34a/b/c共同調(diào)控,參與胚胎干細(xì)胞分化與組織發(fā)育,其表達(dá)促HCC 增殖與轉(zhuǎn)移有關(guān);沉默ZNF281顯著下調(diào)炎癥介質(zhì)(IL-8,IL-1 β,IL-17,IL-23)和上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)信號、TIMP-1、纖維連接蛋白和α-SMA 表達(dá),EMT 誘導(dǎo)因子Snail 直接誘導(dǎo)ZNF281轉(zhuǎn)錄,抑制miR-34a/b/c,緩解ZNF281mRNA被miR-34 下調(diào)[34]。HCC 組織ZNF384 表達(dá),上調(diào)Cy?clin D1促HCC細(xì)胞增殖,且與腫瘤復(fù)發(fā)和總體生存率差明顯相關(guān)[35]。ZNF191 與Wnt8B 啟動子nt1491(ATTAATT)和nt1178(ATTC ATT)結(jié)合,經(jīng)Wnt 通路促進(jìn)HCC增殖;HCC組織中ZNF143過表達(dá),通過與序列特異性DNA結(jié)合,具轉(zhuǎn)錄因子活性在體內(nèi)外促進(jìn)癌細(xì)胞增殖、集落形成和腫瘤生長[36-37]。肝癌ZNF267、ZNF217 和ZNF667 過表達(dá),通過調(diào)節(jié)Bcl-2和Bax表達(dá)促進(jìn)細(xì)胞增殖、侵襲和遷移[38-40];KLF5過表達(dá)上調(diào)CD44 使HCC 細(xì)胞耐藥,小干擾RNA 敲除KLF5,影響HCC細(xì)胞增殖、凋亡、遷移和侵襲等生物學(xué)行為[41]。
ZNF32 定位于10q23-q24 染色體區(qū)域,在HCC顯著上調(diào),在活性氧(ROS)下SP1 靶向激活ZNF32轉(zhuǎn)錄、靶基因補(bǔ)體1q結(jié)合蛋白(C1QBP)活化逃避氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的凋亡;ZNF689 具有致瘤性,與轉(zhuǎn)錄輔助阻遏物TIF1β相互作用,通過抑制Bak/Bax/Bid 通路阻斷促凋亡信號,其表達(dá)與瘤體大小、包膜浸潤及微血管浸潤顯著相關(guān);ZNF689過表達(dá)者總生存時間短、預(yù)后差[42-43]。
HCC 組 織ZNF687 為C2H2型,其上調(diào)活化NF-kB 靶基因參與調(diào)節(jié)新血管生成[44]。KLF8 為促癌基因,肝癌KLF8 表達(dá)與MMP-9 正相關(guān),MMP-9 是KLF8 下游靶基因,KLF8 表達(dá)致MMP-9 增加,促進(jìn)癌細(xì)胞的浸潤及轉(zhuǎn)移,KLF8 通過PI3K/AKT 通路誘導(dǎo)VEGF 表達(dá),可活化Wnt/β-catenin 通路參與肝癌浸潤和轉(zhuǎn)移,Wnt3a可刺激KLF8表達(dá);另KLF8表達(dá)提高β-catenin 對T-cell factor 4 的招募能力,誘導(dǎo)下游靶基因c-Myc、cyclin D1 及Axin1 活化,促進(jìn)HCC轉(zhuǎn)移與復(fù)發(fā)[45-46]。
胚胎干細(xì)胞(ESC)和造血干細(xì)胞中ZFX 高表達(dá),在51.8%肝癌過表達(dá),體外細(xì)胞水平上,沉默ZFX 基因轉(zhuǎn)錄使癌細(xì)胞發(fā)生G0/G1 期阻滯,而抑制HCC細(xì)胞的自我更新、集落形成和細(xì)胞增殖能力,使HCC對順鉑藥物敏感性增加;ZFX與Nanog和Sox-2啟動子結(jié)合后在HCC細(xì)胞中過表達(dá),體內(nèi)移植模型顯示ZFX過表達(dá)促進(jìn)HCC生長,顯示肝癌細(xì)胞具有干性和多功能性[47]。HCC中表達(dá)的ZNF165核苷酸序列與睪丸中ZNF165相同,以重組ZNF165,測定HCC患者ZNF165,僅5%患者血清檢到ZNF165 抗體,表明ZNF165 為新的CT 抗原,引起體液免疫反應(yīng)參與腫瘤生物學(xué)[48]。
同樣,龐大的ZNFs/KLFs 表達(dá)在HCC 進(jìn)展過程中,發(fā)揮轉(zhuǎn)錄抑制、激活下游抑癌基因、誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡、激活P53、抑制相關(guān)通路關(guān)鍵信號分子阻止癌細(xì)胞EMT 轉(zhuǎn)化,對HCC 侵襲或轉(zhuǎn)移等具有抑制作用,臨床及基礎(chǔ)研究發(fā)現(xiàn)的主要相關(guān)ZNFs/KLFs,見表2。
表2 幾種肝癌相關(guān)ZNFs/KLFs的抑癌作用[49-60]
ZNF307(ZKSCAN4、ZSCAN36 和ZNF427)顯著下調(diào),作為一種腫瘤抑制劑通過誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡抑制癌細(xì)胞增殖。HCC 組織和細(xì)胞中ZNF307 過表達(dá),調(diào)控凋亡關(guān)鍵因子如caspase-3、BAX 和BCL-2,促進(jìn)細(xì)胞凋亡[49]。ZBP89(ZNF148、BFCOL1和BERF-1)與Bak 啟動子靶向結(jié)合促進(jìn)其轉(zhuǎn)錄,抑制干性細(xì)胞更新,誘導(dǎo)癌細(xì)胞凋亡[50]。KLF9為抑癌基因,在肝癌組織表達(dá)下調(diào)。KLF9直接結(jié)合p53啟動子近端區(qū)域內(nèi)GC盒穩(wěn)定p53,其藥理學(xué)或遺傳活化對HCC可能具有治療作用,對SK-Hep1和HepG2細(xì)胞生長有明顯抑制作用,并致細(xì)胞凋亡[51]。位于19q13.13號染色體上ZNF545過表達(dá),可抑制肝癌Snur449和Huh7細(xì)胞增殖、遷移和侵襲,誘導(dǎo)細(xì)胞G1/S期阻滯和凋亡,體內(nèi)、外研究證實其機(jī)制為抑制NF-KB 活化、細(xì)胞增殖和移植瘤生長[52]。
ZNF774是一個轉(zhuǎn)錄抑制因子,親和純化偶聯(lián)質(zhì)譜法顯示ZNF774與胞中Mi-2/核小體重構(gòu)和去乙酰化酶復(fù)合物(NuRD)有關(guān)聯(lián),全基因組鑒定ZNF774/NuRD 復(fù)合體表明,ZNF774 抑制含notch2 肝癌生長和遷移密切相關(guān)基因,體外抑制癌細(xì)胞增殖和侵襲,體內(nèi)抑制癌細(xì)胞生長和轉(zhuǎn)移。ZNF774明顯下調(diào)與高notch2 表達(dá)、晚期病理分期及患者總體生存率低密切相關(guān),提示ZNF774/NuRD-notch 2 軸在肝癌發(fā)生中的關(guān)鍵作用[53]。KLF10 或稱轉(zhuǎn)化生長因子-β誘導(dǎo)早期基因1(TIEG1),為含三C2H2 鋅指結(jié)構(gòu)域的DNA 結(jié)合轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,與DNA 上特異性蛋白1(SP1)位點結(jié)合并與其他調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子相互作用促進(jìn)/抑制基因表達(dá),具有抗增殖作用,誘導(dǎo)多種癌細(xì)胞凋亡[54]。
抑制腫瘤轉(zhuǎn)移和上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)有關(guān)。位于19q13.13 號染色體ZNF382,在HBV 陰性肝組織和HBV 感染肝硬化組織中表達(dá)顯著增高,是mir-6867靶標(biāo),作為一種潛在癌細(xì)胞抑制因子,可激活蛋白1(AP-1)和Wnt/β-catenin 通路活化,激活p53表達(dá),誘導(dǎo)凋亡,抑制原癌基因FOS和JUN等下游靶點發(fā)揮作用,抑制裸鼠癌細(xì)胞增殖、集落形成、遷移、侵襲和致瘤潛能,抑癌基因ZNF382在HBV相關(guān)HCC 中受表觀遺傳機(jī)制調(diào)節(jié)[55]。CD9 和CD81 是KLF4 轉(zhuǎn)錄靶點,調(diào)控KLF4-CD9/CD81-jnk 信號通路,有望抑制HCC發(fā)展[56]。轉(zhuǎn)化生長因子β-1(TGF-β 1)/Smad 信號通路在腫瘤抑制中起重要作用,KLF17調(diào)控Smad3依賴途徑增強(qiáng)TGF-β1/smad信號轉(zhuǎn)導(dǎo),是抗腫瘤轉(zhuǎn)移和抑制腫瘤生長關(guān)鍵環(huán)節(jié)。沉默KLF17 可降低Smad 結(jié)合元件上Smad3-DNA 形成,影響TGF-β1/Smad靶基因表達(dá),調(diào)控該通路經(jīng)EMT抑制HCC侵襲轉(zhuǎn)移[57]。
由4 個外顯子構(gòu)成的KLF6 位于10p15,含有3個剪接變異體(SV1、SV2、SV3)。KLF6為癌胚抗原具有轉(zhuǎn)錄激活功能,不同剪接變異體在腫瘤中發(fā)揮不同作用;肝癌中KLF6 SV1為促癌基因,KLF6 SV2是抑癌因子,分別發(fā)揮促癌細(xì)胞增殖和抗細(xì)胞增殖或凋亡作用[58-59]。脂肪生成被認(rèn)為是肝癌發(fā)生發(fā)展關(guān)鍵,ZHX2 為新生脂肪形成的重要抑制因子,異位表達(dá)顯著抑制HCC 新脂肪生成,降低FASN、ACL、ACC1 和SCD1 轉(zhuǎn)錄,與脂肪調(diào)控因子SREBP1c 呈負(fù)相關(guān)。沉默或過表達(dá)ZHX2,轉(zhuǎn)錄水平上增加mir-24-3p 作用于SREBP1c 靶點致其降解,提示ZHX2 抑制肝癌進(jìn)展新機(jī)制,可為HCC 治療提供新策略[60]。
肝癌相關(guān)ZNFs/KLFs 基因轉(zhuǎn)錄異常,在肝癌組織或循環(huán)血中的表達(dá)水平改變,有助于良惡性肝病診斷、HCC預(yù)后判別或分子靶向治療。
肝癌ZNF191 過表達(dá)直接轉(zhuǎn)錄調(diào)控,在HCC 增殖中發(fā)揮關(guān)鍵作用[36];KLF4 為誘導(dǎo)HCC分化介質(zhì),可提高HCC 預(yù)測準(zhǔn)確性[61];KLF5 轉(zhuǎn)錄因子在良、惡肝病中的表達(dá)存在顯著差異,有助于良、惡性肝病的診斷與鑒別診斷,初步臨床應(yīng)用(待發(fā)表資料),顯示可特異診斷HCC,優(yōu)于常規(guī)AFP分析。
肝癌患者組織或血ZNF281、ZNF384、KLF5 等表達(dá)升高,與瘤體大小、腫瘤分期、腫瘤復(fù)發(fā)及血管侵襲性等呈正相關(guān),與患者的總體生存率差相關(guān);HCC 組織KLF4 和Sp1 表達(dá)與腫瘤分化顯著相關(guān);KLF6 與HCC 患者淋巴血管空間侵襲呈負(fù)相關(guān),KLF6 陰性患者生存時間短。KLF17 是抑癌基因,能與突變型p53 形成復(fù)合物抑制HCC 患者的EMT 形成。HCC 中ZFHX3 上調(diào),是HIF-1a/VEGFA 的血管生成因子所必需,可見ZNF281、ZNF384、KLF5 等表達(dá)升高,與瘤體大小、腫瘤分期、腫瘤復(fù)發(fā)及血管侵襲性等相關(guān),與患者總體生存率相關(guān),可作為HCC預(yù)后標(biāo)志物[34-35,41,58]。
ZNF267參與調(diào)控發(fā)育、增殖和分化等生物學(xué)過程,在肝硬化及癌組織均升高,靶向ZNF267 可抑制HCC 增殖和遷移[38]。ZNF191 與Wnt8b mRNA 啟動子ATTAATT(nt-1491)和ATTCATT(nt-1178)結(jié)合,直接調(diào)控轉(zhuǎn)錄,在HCC 進(jìn)展中發(fā)揮關(guān)鍵作用[36]。KLF6過表達(dá)抑制了異種移植腫瘤的生長,在體外和體內(nèi)抑制HCC生長和侵襲,具抑癌功能可能用于預(yù)防和治療[58]。KLF5激活PI3K/AKT/Snail通路誘導(dǎo)EMT發(fā)生,是調(diào)控HCC中CSCs關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子[41]。KLF8激活wnt/β-連環(huán)蛋白促干細(xì)胞樣,靶向KLF8可抑制HCC[45]。另ZHX2 表達(dá)增加miR-24-3p,可靶向SREBP1c 抑制HCC進(jìn)展[60]。位于20q13的ZNF217基因與miR101結(jié)合,可促進(jìn)癌細(xì)胞增殖與侵襲,以及ZNF23等調(diào)控HCC增殖和分化,均可望成為HCC治療靶點[30,39,62]。
ZNFs/KLFs作為人類基因組中最大的轉(zhuǎn)錄因子家族,廣泛參與了人體多種生物學(xué)過程,在肝細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化中調(diào)節(jié)下游基因轉(zhuǎn)錄,參與細(xì)胞增殖、凋亡、侵襲與轉(zhuǎn)移,發(fā)揮促癌/抑癌作用。現(xiàn)有資料顯示ZNFs/KLFs的轉(zhuǎn)錄表達(dá),與HCC關(guān)系密切,已引起醫(yī)學(xué)界的高度重視,但因該家族相關(guān)分子種類繁多、結(jié)構(gòu)復(fù)雜,隨著對該家族相關(guān)因子研究的深入,解析HCC 發(fā)病機(jī)制和論證有價值的關(guān)鍵ZNFs/KLFs 分子,將有助于HCC 早期診斷和預(yù)后判斷,以及特異分子靶向干預(yù)技術(shù)開發(fā)與臨床應(yīng)用。