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        基于生物膜干涉技術(shù)檢測PDL1抗體與PDL1抗原的親和力

        2021-12-01 10:25:56胡妍陳玲
        生物技術(shù)進(jìn)展 2021年6期
        關(guān)鍵詞:檢測

        胡妍,陳玲

        福建醫(yī)科大學(xué)免疫治療研究院,福州350122

        目前免疫療法廣泛用于癌癥治療,免疫療法能直接作用于腫瘤微環(huán)境,具有低毒、不良反應(yīng)小、對人體傷害少等優(yōu)勢,且利于患者預(yù)后[1]。在腫瘤細(xì)胞表面,有大量程序性死亡配體1(programmed death ligand-1,PD-L1)蛋白表達(dá),其能與T細(xì)胞表面的程序性死亡因子1(programmed death 1,PD-1)蛋白結(jié)合,使得腫瘤細(xì)胞逃避T細(xì)胞殺傷[2-3]。使用PD-L1抗體能阻斷PD-1與PDL1結(jié)合,調(diào)節(jié)T細(xì)胞活性,治療腫瘤效果明顯[4],其完整的單克隆抗體是由2條重鏈和2條輕鏈組成,這種結(jié)構(gòu)的抗體最先應(yīng)于腫瘤的治療。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展和臨床應(yīng)用的需求,研發(fā)出了各種結(jié)構(gòu)的抗體,如單鏈抗體、雙價抗體、串聯(lián)抗體、雙特異性抗體等[5]。單鏈抗體(single-chain variable fragment,scFv)是由抗體重鏈的可變區(qū)和輕鏈的可變區(qū)在一段肽段連接下構(gòu)成的小分子,是具有抗體活性的最小功能結(jié)構(gòu)。scFv由于分子質(zhì)量小(約25 kDa)、穿透力強(qiáng),在靶向治療、影像診斷、細(xì)胞內(nèi)免疫和生物檢測等方面具有重要作用。在靶向治療方面,可將藥物和毒素與scFv鏈接,利用抗原抗體特異性結(jié)合特點,定位于靶細(xì)胞,對靶細(xì)胞進(jìn)行特異性殺傷;在影像診斷方面,scFv由于分子質(zhì)量小,具有體內(nèi)清除率高、對身體傷害小等優(yōu)勢[6]。雙價抗體(diabody)是scFv的二聚體,分子量?。?0~60 kD),與scFv一樣,具有體內(nèi)半衰期短、組織滲透力強(qiáng)、體內(nèi)清除率高等優(yōu)點,diabody與抗原結(jié)合比單價scFv更敏感,且在結(jié)構(gòu)和功能上更接近親本抗體[7]。雙特異性抗體(bispecific antibodies,BsAbs)結(jié)構(gòu)包含2種抗體的可變區(qū),具有2個抗原結(jié)合表位和雙重功能[8-9],BsAbs可將效應(yīng)細(xì)胞直接靶向腫瘤細(xì)胞,增強(qiáng)其細(xì)胞毒性,提高抗體選擇性和功能性,共刺激或抑制受體,避免免疫逃逸機(jī)制進(jìn)而改善治療效果[10]。BsAbs抗體根據(jù)結(jié)構(gòu)中是否帶有Fc片段分為IgG-like BsAb和non-IgG-like BsAb兩類。IgG-like BsAb具有Fc介導(dǎo)的效應(yīng)功能,如誘導(dǎo)抗體依賴細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞毒作用(antibody-dependentcell-mediatedcytotoxicity,ADCC)或補(bǔ)體依賴的細(xì)胞毒作用(complement dependent cytotoxicity,CDC)。這類抗體相對分子量較大,F(xiàn)c片段有助于抗體后期的純化,并提高其溶解性、穩(wěn)定性。此外,F(xiàn)c部分可與受體FcRn結(jié)合,增加抗體血清半衰期。non-IgG-like BsAb因缺乏Fc片段,僅通過抗原結(jié)合力發(fā)揮治療作用,具有免疫原性低、易于生產(chǎn)、分子量小、腫瘤組織滲透性高、治療效果好等特點。目前,已存在幾種相對成熟的雙特異性抗體技術(shù)平臺,可加快BsAbs的發(fā)展[11?12]。

        KD測定是抗體研發(fā)過程中的一項重要質(zhì)控指標(biāo)。KD測定最經(jīng)典的方法為酶聯(lián)免疫法(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA),但ELISA方法操作費(fèi)時費(fèi)力,使用生物膜層干涉(biofilm layer interference,BLI)技術(shù)同樣能提供較為可靠的KD[13],分別使用ELISA和BLI兩種方法測定第1個研制出來的新型冠狀病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)抗體與新型冠狀病毒(severe acute respiratory syndrome corona virus 2,SARS-CoV-2)表面的S蛋白之間的親和力,兩種方法檢測結(jié)果一致[14]。BLI技術(shù)是基于光干涉信號實現(xiàn)對生物分子快速檢測的非標(biāo)記分析檢測技術(shù)[15],當(dāng)生物分子結(jié)合到光纖材質(zhì)的生物傳感器末端會形成一層生物膜,當(dāng)傳感器末端的生物分子與待檢測物結(jié)合時會引起傳感器末端分子量的改變,從而導(dǎo)致生物膜厚度的改變。光通過傳感器的生物膜層后發(fā)生透射和反射形成干涉光波,生物膜厚度的變化導(dǎo)致干涉光波發(fā)生相對位移。生物分子結(jié)合前后的干涉光波被光譜儀檢測到,形成干涉光譜,通過結(jié)合前后光譜位移的變化對待檢測分子進(jìn)行分析[16]。BLI技術(shù)能對親和力進(jìn)行實時、無標(biāo)記的分析,且這種檢測技術(shù)結(jié)果準(zhǔn)確、靈敏度高[17?18]。

        通過選用SA生物傳感器偶聯(lián)biotin標(biāo)記的PDL1抗原,再分別與4類PDL1抗體結(jié)合,并計算相應(yīng)的KD。4類抗體在分子設(shè)計、細(xì)胞培養(yǎng)、緩沖液配比等實驗條件不同時,可能會導(dǎo)致KD值不同,因此測量KD時,對SA傳感器需求量較大,而SA傳感器價格昂貴,本研究通過選用緩沖液再生傳感器,并對再生后的傳感器所測數(shù)據(jù)的穩(wěn)定性、重復(fù)性進(jìn)行考察,以確定傳感器再生條件,并繼續(xù)利用再生后的傳感器測量抗原抗體之間的KD,旨在為SA傳感器的重復(fù)利用提供再生方法和再生依據(jù),以提高SA傳感器的使用效率,節(jié)約檢測成本。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 儀器Octet Red 96分子相互作用分析儀購自美國Pall公司;nanodrop 2000超微量分光光度計購自美國Thermo Scientific公司;SG 23手持式pH測量儀購自瑞士梅特勒?托利多公司;Practum 124-1CN電子分析天平購自德國賽多利斯公司;SA生物傳感器購自Pall公司。

        1.1.2 材料與試劑ScFv、diabody(一個PD-L1結(jié)合位點)、完整單抗、BsAb(PD-L1、TGFbeta 1兩個抗原結(jié)合位點);PD-L1蛋白、5個批次的雙價單鏈抗體DA200(2個PD-L1結(jié)合位點)均由本實驗室提供,純度經(jīng)超高效液相色譜儀檢測,純度均大于98%;生物素(EZ-Link Sulfo-NHS-LC-LC-Biotin)、脫鹽柱購于Thermo Scientific公司;96孔板購于Greiner Bio-One公司;磷酸鹽緩沖溶液購于Corning公司。甘氨酸、吐溫-20、蔗糖購于Sigma公司;鹽酸為國產(chǎn)分析純,實驗用水為Milli-pore超純水。

        PBST:取100 μL吐溫-20溶液加至500 mL PBS緩沖液中,混勻,用于預(yù)濕或中和傳感器;再生液(10 mmol·L?1甘氨酸,pH 1.7):稱取75 mg甘氨酸,加水溶解并定容至100 mL,滴加鹽酸將溶液pH調(diào)至1.7,用于再生傳感器。

        1.2 方法

        1.2.1 biotin-PD-L1的 制 備EZ-Link Sulfo-NHSLC-LC-Biotin通過其氨基基團(tuán),能有效與蛋白結(jié)合。將 現(xiàn) 配 的10 mmol·L?1的biotin溶 液 加 至PD-L1中,兩者按照摩爾比3∶1的比例進(jìn)行結(jié)合,冰上反應(yīng)0.5 h,反應(yīng)結(jié)束后使用脫鹽柱去除游離的biotin,得到biotin化的PD-L1蛋白,使用nanodrop對biotin-PD-L1進(jìn)行濃度測定,得到的biotin-PD-L1置于4℃冰箱保存。

        1.2.2 PD-L1抗體與PD-L1抗原親和力常數(shù)的測定選用SA生物傳感器與biotin-PD-L1偶聯(lián),再利用Octet Red 96分子相互作用分析儀,依次檢測抗原與4類PD-L1抗體的KD值。每次檢測時,取8根SA生物傳感器置于傳感器盤上,于PBST緩沖液中預(yù)濕10 min,將biotin-PD-L1蛋白用PBST溶液稀釋至20 μg·mL?1,將配制的50 nmol·L?1抗體溶液用PBST進(jìn)行倍半稀釋,形成7個濃度梯度的抗體溶液,最后將biotin-PD-L1蛋白、梯度稀釋的抗體、緩沖液和中和液按照表1的設(shè)置加入樣品板中,樣品或溶液量為200 μL·孔?1,檢測溫度為30℃,樣品盤轉(zhuǎn)速400 r·min?1,固定好樣品板和傳感器盤后,按照表2設(shè)置的程序運(yùn)行??贵w類別不同時選用新的傳感器進(jìn)行實驗。

        表1 樣品盤加樣設(shè)置Table 1 Setting of adding samples to sample tray

        表2 儀器運(yùn)行程序設(shè)置Table 2 Settting of instrument operation program

        1.2.3 再生后的傳感器測定KD值的實驗步驟考察將使用后的傳感器按照設(shè)定程序進(jìn)行再生,即在再生液中浸泡5 s,轉(zhuǎn)至中和液中浸泡5 s,再生、中和兩個步驟循環(huán)重復(fù)3次。再生后的傳感器按照1.2.2的方法對樣品進(jìn)行親和力測定,測定結(jié)束后按照再生程序再生一次傳感器,只進(jìn)行平衡、結(jié)合、解離步驟,對樣品進(jìn)行親和力測定,以考察再生后的傳感器測定KD值是否需要重新上樣。

        1.2.4 再生后的傳感器重復(fù)性考察將再生后的傳感器按照考察確定后的實驗方法對原樣品進(jìn)行親和力測定,重復(fù)測3次,計算重復(fù)3次試驗KD值的相對標(biāo)準(zhǔn)偏差(relative standard deviation,RSD),然后將再生傳感器依次對4類抗體進(jìn)行測定,比較同一傳感器測不同抗體KD值的RSD。取1列傳感器按照1.2.2的方法,對5個批次的DA200抗體上清液進(jìn)行親和力測試,計算5次結(jié)果 決 定 系 數(shù)(coefficient of determination,R2)的RSD值。

        1.2.5 再生后的傳感器穩(wěn)定性考察將再生的傳感器浸泡于20%蔗糖溶液中,5 min后將傳感器37℃烘干過夜,再干燥密封保存。1個月后,按照考察后的實驗方法,再生后傳感器測定抗原抗體的KD值,并與1個月前重復(fù)3次所測KD值進(jìn)行比較,計算RSD值,考察傳感器穩(wěn)定性。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 PD-L1抗原與4類PD-L1抗體親和力

        Octet Red 96分子相互作用分析儀能實時檢測PD-L1抗原與PD-L1抗體之間的相互作用。如圖1所示,Octet Red 96檢測PD-L1抗原與scFv抗體親和力的各個步驟,圖1中的上樣、清洗步驟表明,biotin-PD-L1能與SA傳感器快速結(jié)合,在清洗液中并未出現(xiàn)結(jié)合信號降低的現(xiàn)象,說明biotin-PD-L1能牢固地結(jié)合于SA傳感器上。從結(jié)合、解離步驟可觀察到抗原抗體結(jié)合、解離的動態(tài)全過程,當(dāng)偶聯(lián)了抗原的傳感器與抗體結(jié)合時,抗體濃度越高,結(jié)合高度也越高,另外3列傳感器檢測其他三類抗體的全過程與圖1類似。通過濃度梯度的抗體結(jié)合、解離曲線即可計算出KD值,由表3可知,完整單抗、BS4Ab與抗原的KD值在相同范圍,KD值達(dá)到10?10mol·L?1,scFv、diabody這兩種抗體的KD值接近,KD值為10?9mol·L?1,完整單抗和雙特異性抗體與抗原結(jié)合能力大于其他兩類。

        圖1 傳感器檢測PD-L1抗原與scFv抗體親和力的各個步驟Fig.1 Each step of detecting the affinity of PD-L1 antigen and scFv antibody by sensor

        表3 PD-L1抗原與4類PD-L1抗體親和力Table 3 PD-L1 affinity and four classes of PD-L1 antibodies

        2.2 再生后的傳感器再次測KD值

        SA傳感器與biotin-PD-L1快速、穩(wěn)定結(jié)合,本研究通過是否需要再次上樣步驟,以考察再生液對SA-biotin之間非共價結(jié)合的影響(圖2A)。初次結(jié)合scFv傳感器再生后重新上樣測分子間相互作用時的結(jié)合、解離過程。重新上樣后,不同濃度的抗體均能與PD-L1抗原結(jié)合,根據(jù)結(jié)合、解離曲線能計算出KD值;初始結(jié)合scFv傳感器再生后不經(jīng)過上樣步驟測分子間相互作用時的結(jié)合、解離過程,SA傳感器上的結(jié)合高度為0~0.03 nm,說明不同濃度的抗體不能與PD-L1抗原結(jié)合,且曲線擬合的R2為0,其他3類抗體樣品所測結(jié)果一致(圖2B),說明再生液破壞了SA-biotin之間的非共價結(jié)合,再生后的傳感器重新測KD需再次與biotin標(biāo)記的蛋白結(jié)合。

        圖2 再生后的傳感器再次測KD值Fig.2 The regenerated sensor measured the KD value again

        2.3 再生后的傳感器測KD重復(fù)性試驗

        初次結(jié)合scFv抗體的傳感器再生后重復(fù)測3次與scFv親和力的RSD值為8.18%,其他3種傳感器與3類抗體親和力的RSD值分別為8.23%、2.64%、8.43%,RSD均值為6.87%,由表4可知,同一傳感器再生后測其他種類抗體所測得KD的RSD值在7.28%~32.89%,偏差較大。由表5可知,同一傳感器再生后測5個批次的DA200抗體上清液所測得KD的RSD為0.82%,偏差較小,重復(fù)性好。以上結(jié)果表明,再生后的傳感器再次測自身樣品KD值穩(wěn)定,重現(xiàn)性高,但測其他樣品親和力時,所得結(jié)果的RSD值較大,重現(xiàn)性不高,因此,再生后的傳感器只適用于對原類型的樣品進(jìn)行親和力測定。

        表4 初次使用的傳感器再生后與4類抗體樣品KD測定結(jié)果Table 4 KD determination results of the first used sensor and class 4 antibody samples after regeneration

        表5 再生的傳感器與5個批次的DA200樣品測定結(jié)果Table 5 Determination results of regenerated sensor and 5 batches of DA200 samples

        2.4 再生后的傳感器測KD穩(wěn)定性試驗

        通過傳感器在保存1個月后所得KD值與之前進(jìn)行比較,以考察再生后傳感器的穩(wěn)定性。再生后的4列SA傳感器放置1個月后與scFv、diabody、完整單抗、BS4Ab的親和力分別為5.10×10?9、5.56×10?9、2.79×10?10、4.17×10?10mol·L?1,與1個月前比較RSD分別為6.54%、8.34%、2.78%、6.88%,RSD均值為6.13%,說明再生后的傳感器穩(wěn)定性較好。

        3 討論

        親和力常數(shù)測定是抗體研發(fā)過程中的一項重要質(zhì)控指標(biāo),基于BLI技術(shù)研發(fā)出的分子間相互作用平臺自動化程度高、測定速度快、靈敏度高,能提供與ELISA一致的數(shù)據(jù),檢測過程無需標(biāo)記,且能實時顯示抗原抗體反應(yīng)的動態(tài)過程,還可提供結(jié)合速率常數(shù)、解離速率常數(shù)和親和力常數(shù),通過曲線擬合即可計算出抗體的親和力。本研究利用BLI技術(shù)檢測PD-L1抗原與4類抗體之間的親和力,結(jié)果表明,scFv和diabody這兩類抗體因只有1個PD-L1抗原結(jié)合位點、分子量相差較小,因此,2類抗體與抗原的KD值接近,均為10?9mol·L?1,完整單抗因分子量大,解離速度慢,所以親和力大于scFv和diabody這2類抗體,BS4Ab因含有2個PD-L1抗原結(jié)合位點、分子量大等原因,親和力與完整單抗的結(jié)果相似,PD-L1抗原與4類PD-L1抗體的KD值與其他文獻(xiàn)[19?23]報道的結(jié)果一致。說明PD-L1抗原與PD-L1抗體的親和力主要與抗體的結(jié)合位點數(shù)、分子量有關(guān),結(jié)合位點數(shù)越多,結(jié)合速率常數(shù)越大,親和力也越大;分子量越小,解離速率常數(shù)越大,親和力值則越小。SA傳感器用甘氨酸再生后,需再次結(jié)合biotin-PD-L1,才能檢測與抗體的親和力,不結(jié)合biotin-PD-L1的傳感器則檢測不出KD值;進(jìn)行親和力測定時,再生后的傳感器只能用于原樣品的親和力檢測,檢測其他樣品準(zhǔn)確度降低;再生后的傳感器重復(fù)測3次原樣品,4類抗體KD值的RSD均值為6.87%,重復(fù)性較好;再生傳感器測5個批次的抗體,所得擬合曲線R2的RSD均值為0.82%,批間結(jié)果準(zhǔn)確可靠;再生后的傳感器干燥密閉保存后再次進(jìn)行親和力檢測,與之前數(shù)據(jù)比較,4類抗體KD的RSD均值為6.13%,數(shù)據(jù)仍較穩(wěn)定、重現(xiàn)性高。

        綜上所述,當(dāng)抗原抗體親和力≤10?10mol·L?1數(shù)量級時,可以使用甘氨酸再生SA傳感器,再生后的傳感器能繼續(xù)用于原樣品的KD測定,數(shù)據(jù)重現(xiàn)可靠,且能明顯節(jié)約檢測成本,本研究結(jié)果可為今后SA傳感器或其他傳感器的重復(fù)使用提供試驗思路和參考依據(jù)。

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