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        腫瘤教育血小板聯(lián)合二代測(cè)序技術(shù)在腫瘤診斷中的應(yīng)用

        2021-11-28 11:44:51茍葆城
        醫(yī)藥前沿 2021年7期
        關(guān)鍵詞:肺癌檢測(cè)研究

        茍葆城,李 萍,馬 兵

        (川北醫(yī)學(xué)院 四川 南充 637000)

        惡性腫瘤是威脅人類生命重要疾病[1],實(shí)現(xiàn)腫瘤的早期、高準(zhǔn)確率、微創(chuàng)診斷非常重要?,F(xiàn)階段臨床常用肺癌診斷方法可有螺旋CT、PET-CT、血清腫瘤標(biāo)記物、病理活檢。其中螺旋CT對(duì)早期肺癌診斷的特異性不高,PET-CT對(duì)于直徑小于1cm的肺結(jié)節(jié)缺乏診斷價(jià)值,有輻射且價(jià)格昂貴,血清腫瘤標(biāo)記物對(duì)腫瘤診斷的靈敏度及特異度均不高,有創(chuàng)的病理活檢風(fēng)險(xiǎn)高,且難以重復(fù)取檢,在精準(zhǔn)醫(yī)療趨勢(shì)下的今天已經(jīng)難以滿足更高的診斷需求。在二代測(cè)序技術(shù)支持下的腫瘤教育血小板(tumor educated platelets, TEPs),被認(rèn)為是一種有前景的新型液體活檢材料,其已經(jīng)在部分腫瘤的診斷、鑒別診斷甚至早期診斷相關(guān)研究中顯示出了較好的成果,本文就TEPs聯(lián)合二代測(cè)序在腫瘤診斷中的研究現(xiàn)狀進(jìn)行綜述。

        1.腫瘤教育血小板與腫瘤

        1.1 TEPs的研究背景及來(lái)歷

        從20世紀(jì)開(kāi)始,人們陸續(xù)發(fā)現(xiàn)腫瘤與血小板之間似乎存在著某種聯(lián)系,如研究者發(fā)現(xiàn)深靜脈血栓形成或肺栓塞與隨后的癌癥發(fā)生率增高有關(guān)[2],在肺癌、胃癌、食道癌、宮頸癌、大腸中,血小板增多被認(rèn)為是腫瘤的不良預(yù)后因素[3]。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)表明,腫瘤能在體外聚集血小板,并能夠增加動(dòng)物模型體內(nèi)腫瘤轉(zhuǎn)移,而通過(guò)使用血小板GⅡb/GⅢa復(fù)合物抑制劑或者減少血小板數(shù)量能明顯抑制動(dòng)物模型腫瘤轉(zhuǎn)移[4],進(jìn)一步的研究顯示,血小板賦予的腫瘤轉(zhuǎn)移性增強(qiáng)可能與血小板抑制了自然殺傷細(xì)胞(NK細(xì)胞)活性[5],刺激腫瘤組織血管生成增加[6],促進(jìn)腫瘤的上皮向間質(zhì)轉(zhuǎn)化[7],甚至抑制腫瘤細(xì)胞凋亡等有關(guān)[8]?;蚪M學(xué)及蛋白組學(xué)的研究顯示,腫瘤患者體內(nèi)的血小板內(nèi)的RNA可能因?yàn)槟[瘤組織或腫瘤微環(huán)境的改變而發(fā)生了腫瘤相關(guān)性改變。其機(jī)制可能包括腫瘤組織刺激了血小板內(nèi)premRNA的特異性剪切[9],或血小板吞噬了含有腫瘤基因的腫瘤微囊泡[10]。

        1.2 腫瘤教育血小板概念的提出及用于腫瘤診斷能力的早期嘗試

        進(jìn)入21世紀(jì)后,分子診斷檢查成為一種新的腫瘤診斷方法并逐漸被用于臨床,但依靠病理組織為單一材料來(lái)源的分子診斷受到制約,為了克服組織獲取的局限性,人們開(kāi)始探索基于血液為檢查材料的方法,從而產(chǎn)生了液體活檢技術(shù)[11]。血小板作為人體內(nèi)含量最豐富的無(wú)核細(xì)胞器,其遺傳物質(zhì)主要為來(lái)源于巨核細(xì)胞的premRNA,具有數(shù)量大、易獲取、遺傳物質(zhì)相對(duì)單一優(yōu)勢(shì)。Calverley等[12]人在2010年的研究中運(yùn)用基因芯片技術(shù)對(duì)晚期轉(zhuǎn)移肺癌病人及健康人血小板mRNA進(jìn)行無(wú)陣列分層聚類分析,得出的mRNA表達(dá)譜在基因表達(dá)水平實(shí)現(xiàn)了將轉(zhuǎn)移性肺癌與陰性對(duì)照區(qū)分開(kāi)。2015年,Best等[13]人運(yùn)用高通量測(cè)序?qū)δ[瘤教育血小板mRNA譜的研究實(shí)現(xiàn)了區(qū)分癌癥患者與健康人的準(zhǔn)確率為96%,對(duì)6種腫瘤類型分型,準(zhǔn)確率為71%,在此研究中首次將這些受腫瘤或腫瘤微環(huán)境影響而發(fā)生遺傳物質(zhì)腫瘤化改變的血小板稱為“腫瘤教育的血小板”,由此拉開(kāi)了TEPS對(duì)腫瘤診斷研究的熱幕。

        2.二代測(cè)序技術(shù)與腫瘤診斷的聯(lián)合

        二代測(cè)序(the next generation sequencing, NGS)又稱大規(guī)模并行測(cè)序或高通量測(cè)序,其原理是將DNA分子打斷成長(zhǎng)約幾十至幾百bp的片段,將這些片段放入帶有熒光標(biāo)記的反應(yīng)孔中或固定于芯片上,使用PCR或等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)進(jìn)行DNA擴(kuò)增,通過(guò)檢測(cè)帶有不同熒光標(biāo)記的核苷酸,并將光信號(hào)轉(zhuǎn)變?yōu)殡娦盘?hào)進(jìn)行讀取[14],相較于既往PCR和基因芯片技術(shù)這種“釣魚(yú)式的”單基因模式,二代測(cè)序能實(shí)現(xiàn)“撒網(wǎng)式的”對(duì)某個(gè)組織器官的全基因覆蓋,具有高通量、效率高、價(jià)格相對(duì)低廉優(yōu)點(diǎn),是繼PCR和基因芯片技術(shù)后的基因測(cè)序領(lǐng)域里程碑進(jìn)步。現(xiàn)已被廣泛用于實(shí)體腫瘤驅(qū)動(dòng)基因的檢測(cè)[15],其與傳統(tǒng)免疫組織化學(xué)檢測(cè)、熒光原位雜交、聚合酶鏈反應(yīng)方法相比,能更高效、快速地檢測(cè)出上述方法不能檢測(cè)出得少見(jiàn)的突變基因或者發(fā)現(xiàn)新的基因突變,從而指導(dǎo)精準(zhǔn)用藥。該技術(shù)應(yīng)用逐漸成熟,歐盟與美國(guó)相繼于2015年和2017年發(fā)行了二代測(cè)序技術(shù)應(yīng)用指南。我國(guó)近年來(lái)發(fā)表了NGS在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)、血液腫瘤、肺癌診斷中的專家共識(shí)。其他腫瘤如胃腸腫瘤、肝癌、骨瘤等的二代測(cè)序?qū)<夜沧R(shí)也在形成中。當(dāng)然,二代測(cè)序也有缺點(diǎn),如單次測(cè)量的讀長(zhǎng)較短,引入PCR會(huì)在一定程度上增加測(cè)序的錯(cuò)誤率,并具有系統(tǒng)偏向性,這一缺陷未來(lái)有望在三代測(cè)序中得到彌補(bǔ),其次,二代測(cè)序在技術(shù)操作、數(shù)據(jù)管理以及結(jié)果解釋上有較高的要求,這些都是該技術(shù)能否很好應(yīng)用的關(guān)鍵[16]。

        3.二代測(cè)序在腫瘤教育血小板中的應(yīng)用

        RNA-seq也稱為轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),利用高通量測(cè)序技術(shù)研究轉(zhuǎn)錄組在全面快速得到基因表達(dá)譜變化的同時(shí),還可以通過(guò)測(cè)定的序列信息精確地分析轉(zhuǎn)錄本的cSNP(編碼序列單核苷酸多態(tài)性)、可變剪接序列,對(duì)檢測(cè)低豐度轉(zhuǎn)錄本和發(fā)現(xiàn)新轉(zhuǎn)錄本具有優(yōu)勢(shì)。運(yùn)用該技術(shù)研究血小板RNA的表達(dá)水平差異及表達(dá)譜的差異成為T(mén)EPs研究的熱門(mén)方向,目前國(guó)內(nèi)外已利用此技術(shù)發(fā)表多篇利用此技術(shù)實(shí)現(xiàn)了血小板內(nèi)RNA成分對(duì)腫瘤的診斷、鑒別診斷有價(jià)值的文獻(xiàn)。得出部分腫瘤的基于二代測(cè)序的TEPS腫瘤標(biāo)記物,最著名的是Best等[13]人研究中用TEPS RNA譜實(shí)現(xiàn)了對(duì)腫瘤與非腫瘤區(qū)分,準(zhǔn)確率為96%,對(duì)包括非小細(xì)胞肺癌、結(jié)直腸癌、膠質(zhì)母細(xì)胞瘤、胰腺癌、肝膽癌和乳腺癌的六種不同腫瘤類型分型,準(zhǔn)確率為71%。另有單獨(dú)的研究用于區(qū)分神經(jīng)膠質(zhì)瘤與健康人的達(dá)到95%的檢測(cè)準(zhǔn)確度[17],區(qū)分肉瘤和非肉瘤樣本診斷準(zhǔn)確率達(dá)到87%[18]的報(bào)道。如我國(guó)學(xué)者薛琳琳等[19]人在2018年發(fā)表的一篇文章中通過(guò)對(duì)5例肺癌患者及5例健康人血小板中差異表達(dá)的RNA譜進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)了204個(gè)差異表達(dá)顯著的RNA,其中185個(gè)在肺癌患者樣本中表達(dá)上調(diào),19個(gè)下調(diào),而且提出這些基因功能注釋可能與轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)和剪接體剪接代謝有關(guān),另有中國(guó)學(xué)者在2019年報(bào)道了TEPs RNA對(duì)早期非小細(xì)胞肺癌診斷與鑒別肺良性結(jié)節(jié)的鑒別中表現(xiàn)出了價(jià)值[20]。

        4.結(jié)論

        綜上所述,血小板是腫瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的中心參與者,已知血小板存在促進(jìn)腫瘤進(jìn)展、轉(zhuǎn)移的能力,但具體機(jī)制尚不完全清楚,通過(guò)基因?qū)用嬲页鲋虏』蛉缓蠓赐破渲虏C(jī)制不失為一個(gè)好的方法,能以高效、快速、低成本實(shí)現(xiàn)對(duì)血小板全部RNA的檢測(cè),二代測(cè)序技術(shù)正好滿足了TEPs肺癌診斷的發(fā)展需求。目前,二代測(cè)序技術(shù)越來(lái)越多的用于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,如上所述,其用于腫瘤的前期研究已經(jīng)取得了很好的效果,接下來(lái)需要更大規(guī)模的臨床研究及數(shù)據(jù)支持這種新的液體活檢方法,二代測(cè)序技術(shù)仍將大大的發(fā)揮它的用處,當(dāng)然,我們也期待第3、4代測(cè)序技術(shù)的普及應(yīng)用的到來(lái)。

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