中國科學院植物研究所秦國政課題組報道了番茄完成果實成熟必需的轉錄因子SlDof1，敲除SIDof1將延遲果實成熟的過程。

研究者發(fā)現(xiàn)，在番茄已知的34個Dof轉錄因子中，有29個基因在果實成熟的發(fā)育階段表達，其中5個基因有顯著上調(diào)。通過病毒介導的基因沉默技術，發(fā)現(xiàn)只有SlDof1沉默的植物表現(xiàn)出明顯的果實顏色呈斑片狀表型。SIDof1在番茄成熟期，集中表達在果皮的維管組織，而非果皮中，蛋白則在果皮組織中明顯積累。隨即，研究者證實了SIDof1定位在細胞核中。在RNAi敲除SIDof1的獨立株系中，果實成熟的相關過程，包括番茄紅素的積累和乙烯的積累呈現(xiàn)明顯的減緩，但這一延遲作用不影響果實最終完成成熟。轉錄組測序的比較結果顯示，敲除SIDof1后，有1 728個基因出現(xiàn)差異表達，其中872個基因被上調(diào)，856個基因呈下調(diào)。有多個差異表達基因屬于已知的果實成熟相關基因，并得到了定量試驗的支持。ChIP-seq試驗結果顯示，SIDof1的全基因組結合位點22.4%位于啟動子區(qū)，主要分布在相對于轉錄起始位點–200 bp至+100 bp的區(qū)域，證明了其具有結合DNA，調(diào)控經(jīng)濟基因轉錄的功能。SIDof1主要識別的基序（motif）包括：A（A/G）AGAG、AAA（T/A）GA和AAAAG（A/G）。位于轉錄起始位點2 kb上游區(qū)域內(nèi)的ChIP-seq峰共有2 161個，對應1 937個基因，其中與轉錄組差異表達基因相重疊的基因有312個，這些基因被認為是SIDof1的直接靶基因。GO及KEGG富集分析顯示，SIDof1的直接靶基因主要參與植物激素信號轉導和多種代謝（糖類、類胡蘿卜素合成等）途徑，與轉基因植物的表型相符。

相關研究成果于2021年9月在線發(fā)表在《Molecular Horticulture》上。