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        miR-16-5p對食管鱗癌的診斷價值和作用機(jī)制研究

        2021-11-17 08:56:12馮巧燕張波張健徐建峰
        浙江醫(yī)學(xué) 2021年20期
        關(guān)鍵詞:血清水平研究

        馮巧燕 張波 張健 徐建峰

        食管癌是世界第七大常見的癌癥,其中食管鱗狀細(xì)胞癌(以下簡稱食管鱗癌)約占90%[1]。由于其發(fā)病隱匿,多數(shù)患者初次診斷時已經(jīng)處于疾病晚期。早期食管癌患者的術(shù)后5年生存率為80%~90%,而晚期患者僅為25%[2]。由此可見,食管癌的早期診斷至關(guān)重要?;铙w組織病理檢查是癌癥診斷的金標(biāo)準(zhǔn),但這種診斷方法不方便且具有侵入性。因此,尋找合適的生物標(biāo)志物輔助腫瘤早期診斷意義重大。microRNA(miRNA)是長度約22個核苷酸的非編碼RNA,通過降解靶mRNA或阻斷其翻譯從而調(diào)控基因表達(dá)[3]。研究表明,特定miRNA的表達(dá)異常對腫瘤增殖、血管生成和轉(zhuǎn)移起關(guān)鍵作用[4-5]。不同類型腫瘤的miRNA表達(dá)譜不盡相同,這種情況不僅存在于患者腫瘤組織內(nèi),患者的血液、唾液等miRNA表達(dá)水平也可能發(fā)生改變[6-7]。因此,檢測特定miRNA是否發(fā)生改變可能對食管癌診斷具有一定的指導(dǎo)作用。基于此,本研究通過基因表達(dá)匯編(gene expression omnibus,GEO)數(shù)據(jù)庫探尋食管鱗癌患者和健康人群血清中差異表達(dá)的miRNA;通過qRT-PCR實驗對浙江省臺州醫(yī)院的35例食管鱗癌患者的血清與健康人群血清中的miR-16-5p進(jìn)行檢測和分析,并通過ROC曲線評估m(xù)iR-16-5p作為食管鱗癌生物標(biāo)志物的潛在可能;下載癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)數(shù)據(jù)分析miR-16-5p在食管鱗癌組織中的表達(dá),初步分析其作用機(jī)制,以期為miR-16-5p成為食管鱗癌生物標(biāo)志物提供理論支持,現(xiàn)報道如下。

        1 對象和方法

        1.1 對象 采集浙江省臺州醫(yī)院2015年9月至2019年6月收治的病理學(xué)檢查確診為食管鱗癌的35例患者的血液標(biāo)本和35例健康體檢者的血液標(biāo)本,標(biāo)本均由中心實驗室規(guī)范保存。35例食管鱗癌患者中男27例,女8例;年齡<60歲22例,≥60歲13例;腫瘤位于食管中段~中上段13例,中下段~下段22例;N0或Nx期21例,N1~2期14例。本研究經(jīng)醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會批準(zhǔn)。

        1.2 方法

        1.2.1 GEO數(shù)據(jù)篩選 從GEO數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)中下載 GSE71043數(shù)據(jù)集,共3例食管鱗癌患者血清和3例健康人血清的miRNA表達(dá)數(shù)據(jù)納入本研究。通過GEO2R工具篩選食管鱗癌患者血清與健康人群血清中的差異表達(dá)miRNA。

        1.2.2 血清miR-16-5p表達(dá)水平檢測 受試者采用普通生化管抽取5 ml靜脈血,在常溫下3 000 r/min離心10 min(離心半徑16 cm)獲得血清標(biāo)本,使用TRIzol試劑(美國賽默飛公司)提取血清標(biāo)本中的總RNA。根據(jù)產(chǎn)品使用說明書使用miRNA逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(美國賽默飛公司)制備cDNA。采用PCR試劑(上海吉瑪公司)配制反應(yīng)體系進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以cel-miR-39為內(nèi)參標(biāo)準(zhǔn)化,使用 2-ΔΔCt方法進(jìn)行相對定量分析。miR-16-5p的上游引物:5'-GATCTTGAAGGGGACCGCAATGGA-3',下游引物:5'-GTGCAGGGTCCGAGGT-3'。cel-miR-39的上游引物:5'-CACTCCGTCACCGGGTGTAAATC-3',下游引物:5'-TCCAGTGCAGGGTCCGAGGT-3'。引物由上海生工生物有限公司(上海生工)合成。

        1.2.3 TCGA數(shù)據(jù)分析 從TCGA數(shù)據(jù)庫(https://cancergenome.nih.gov/)中下載食管鱗癌高通量基因測序數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù),共95例食管鱗癌組織和13例癌旁正常組織的miRNA表達(dá)數(shù)據(jù)納入本研究。所有miRNA表達(dá)數(shù)據(jù)采用log2進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理。

        1.2.4 京都基因與基因組百科全書(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)和基因本體論(gene ontology,GO)富集分析 從miRTarBase數(shù)據(jù)庫(http://mirtarbase.cuhk.edu.cn)下載miR-16-5p的靶基因。將靶基因上傳至用于注釋、可視化和集成發(fā)現(xiàn)的數(shù)據(jù)庫(database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)(https://david.ncifcrf.gov/)進(jìn)行 EKGG 和GO功能富集分析。

        2 結(jié)果

        2.1 食管鱗癌患者血清與健康人群血清miR-16-5p表達(dá)水平比較 GEO數(shù)據(jù)集數(shù)據(jù)分析結(jié)果和qRTPCR檢測結(jié)果均顯示食管鱗癌患者血清miR-16-5p表達(dá)水平明顯高于健康人群血清,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(均P<0.05),見表 1。

        表1 食管鱗癌患者血清與健康人群血清miR-16-5p表達(dá)水平比較

        2.2 miR-16-5p對食管鱗癌的診斷效能分析 利用Younden指數(shù)的ROC曲線得到能區(qū)分食管鱗癌患者與健康人群的截斷值。miR-16-5p的靈敏度為0.7143,特異度為0.8857,此時最佳截斷值為1.3351,AUC為0.802(95%CI:0.689~0.887),見圖 1。

        圖1 miR-16-5p診斷食管鱗癌組織的ROC曲線

        2.3 不同臨床特征食管鱗癌患者血清miR-16-5p表達(dá)水平比較 35例食管鱗癌患者中,有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者血清中miR-16-5p表達(dá)水平高于無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移或淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移未知患者,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05);但不同性別、年齡、吸煙史、飲酒史和腫瘤位置患者血清中miR-16-5p表達(dá)水平比較差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(均P>0.05),見表 2。

        表2 不同臨床特征食管鱗癌患者血清miR-16-5p表達(dá)水平比較

        2.4 食管鱗癌患者癌組織與癌旁正常組織miR-16-5p表達(dá)水平比較 TCGA數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示食管鱗癌患者癌組織 miR-16-5p表達(dá)水平明顯高于癌旁正常組織,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),見表 3。

        表3 食管鱗癌患者癌組織與癌旁正常組織miR-16-5p表達(dá)水平比較

        2.5 miR-16-5p在食管鱗癌中的作用機(jī)制GO和KEGG富集分析結(jié)果 從miRTarBase數(shù)據(jù)庫獲取已經(jīng)證實的1 557個miR-16-5p的靶基因,對這些靶基因進(jìn)行富集功能富集分析。KEGG富集結(jié)果顯示,miR-16-5p的靶基因顯著富集于PI3K-Akt、p53、Hippo等多條腫瘤相關(guān)信號通路(P<0.05),見表4。GO富集結(jié)果顯示,miR-16-5p的靶基因顯著富集于翻譯、結(jié)合蛋白、細(xì)胞黏附等(P<0.05),見表 5。

        表4 miR-16-5p靶基因的KEGG信號通路富集結(jié)果

        表5 miR-16-5p靶基因的GO富集結(jié)果

        3 討論

        目前,食管癌仍是當(dāng)今世界最具致命性的癌癥之一。盡管預(yù)防與治療食管癌的方法和手段有所改進(jìn),但對于中晚期食管癌,這些干預(yù)性措施療效有限。尋找新型的診斷方法和合適的生物標(biāo)志物顯得尤為重要。本研究探討了miR-16-5p在食管鱗癌患者血清和癌組織中的表達(dá)情況,并進(jìn)一步分析其作用機(jī)制。

        本研究結(jié)果顯示,血清中miR-16-5p或可作為篩查食管鱗癌患者的生物標(biāo)志物。與健康人群血清相比,食管鱗癌患者血清中的miR-16-5p水平顯著上調(diào),這一結(jié)論得到GEO數(shù)據(jù)分析結(jié)果的支持。ROC曲線分析結(jié)果顯示血清中miR-16-5p檢測食管鱗癌患者的AUC值為0.802,具備較高的靈敏度和特異度。同時,本研究還顯示血清中miR-16-5p的表達(dá)與食管鱗癌進(jìn)展有關(guān),食管鱗癌患者血清中miR-16-5p的表達(dá)水平在有淋巴轉(zhuǎn)移的患者中明顯上調(diào),但這需要擴(kuò)大樣本量進(jìn)一步證實。另外,本研究顯示食管鱗癌組織中miR-16-5p的表達(dá)水平顯著上調(diào),這表明miR-16-5p參與食管鱗癌的發(fā)生。KEGG和GO功能富集分析表明miR-16-5p可能通過調(diào)控翻譯、結(jié)合蛋白、細(xì)胞黏附從而影響食管鱗癌的發(fā)生與發(fā)展,多條腫瘤相關(guān)信號通路或參與該過程。

        一系列研究已經(jīng)證明循環(huán)miRNA在各種癌癥中的診斷價值。在眾多的miRNA中,miR-16-5p是最具代表性的miRNA之一。過去的研究發(fā)現(xiàn)miR-16-5p在非小細(xì)胞癌、肝癌、胃癌等腫瘤患者血清中均有顯著變化。Fan等[8]的研究顯示miR-16-5p診斷非小細(xì)胞肺癌的靈敏度為0.88,特異度為0.86;Qu等[9]發(fā)現(xiàn)miR-16-5p診斷肝癌的靈敏度為0.721,特異度為0.888;而在Wang等[10]的研究中,miR-16-5p診斷胃癌的靈敏度為0.79,特異度為0.78。上述研究表明,miR-16-5p或可作為某些特點腫瘤診斷的潛在生物標(biāo)志物。近些年的研究已經(jīng)證實miR-16-5p在食管鱗癌患者血清中表達(dá)上調(diào)[11-12],這與本研究結(jié)論一致。

        另一方面,大量研究發(fā)現(xiàn)miR-16-5p在多種腫瘤細(xì)胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移中起著重要作用[13-15]。Qu等[13]的研究顯示miR-16-5p通過靶向血管內(nèi)皮生長因子A抑制乳腺癌細(xì)胞的增殖和侵襲并促進(jìn)細(xì)胞凋亡。同時,Cheng等[14]發(fā)現(xiàn)miR-16-5p可通過直接靶向胰島素樣生長因子1受體(IGF1R)蛋白表達(dá)抑制肝癌細(xì)胞的侵襲和遷移。在結(jié)直腸癌,Wu等[15]發(fā)現(xiàn)miR-16-5p通過血管內(nèi)皮生長因子A/血管內(nèi)皮生長因子受體1/蛋白激酶B(VEGFA/VEGFR1/Akt軸起抑癌作用。上述研究表明miR-16-5p是多種腫瘤發(fā)生和進(jìn)展的關(guān)鍵因子。

        綜上所述,miR-16-5p在食管鱗癌患者血清和癌組織中均顯著上調(diào),或可作為食管鱗癌輔助診斷的生物標(biāo)志物。miR-16-5p可能通過調(diào)控翻譯、結(jié)合蛋白、細(xì)胞黏附從而影響食管鱗癌的發(fā)生、發(fā)展,多條腫瘤相關(guān)信號通路或參與該過程。

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