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        組學(xué)技術(shù)在產(chǎn)膠植物中的研究進(jìn)展

        2021-11-16 14:22:22張海峰郭傳祺馬春泉
        關(guān)鍵詞:植物

        張海峰,劉 赫,郭傳祺,馬春泉

        (1黑龍江大學(xué)農(nóng)業(yè)微生物技術(shù)教育部工程研究中心,哈爾濱 150500;2黑龍江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院/黑龍江省普通高校分子生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,哈爾濱 150080)

        0 引言

        天然橡膠(NR,natural rubber)是天然高分子化合物,在工業(yè)、國(guó)防等領(lǐng)域有著重要戰(zhàn)略意義,發(fā)展NR產(chǎn)業(yè)是中國(guó)戰(zhàn)略性橡膠資源儲(chǔ)備的重要支柱之一。除巴西橡膠樹外,橡膠草、杜仲、銀膠菊、萵苣等植物陸續(xù)被發(fā)現(xiàn)可作為潛在的產(chǎn)膠替代植物[1],隨著研究的逐漸深入,各種產(chǎn)膠植物通過甲羥戊酸(MVA)和甲基赤蘚糖醇(MEP)途徑共同合成天然橡膠,NR合成機(jī)制逐漸明晰,其合成途徑中關(guān)鍵的調(diào)控基因和關(guān)鍵酶被揭示,為NR的生物合成提供了重要基礎(chǔ)。本研究對(duì)近年來產(chǎn)膠植物的基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)等不同維度的研究進(jìn)展進(jìn)行了系統(tǒng)的梳理和總結(jié),以期為后續(xù)組學(xué)技術(shù)聯(lián)合解析深入挖掘產(chǎn)膠植物中NR合成的重要基因和蛋白質(zhì)以及完善NR合成分子機(jī)制提供借鑒和參考。

        1 產(chǎn)膠植物基因組學(xué)研究

        1.1 巴西橡膠樹基因組研究

        巴西橡膠樹(Hevea brasiliensis)是大戟科橡膠樹屬植物,是目前橡膠樹中產(chǎn)膠能力最強(qiáng)的品種,是NR的主要來源,因而通過反向遺傳學(xué)研究來提高NR含量的策略具有重要意義。2002年張桂和等[2]采用改良CTAB法提取巴西橡膠樹幼嫩葉片總DNA,并構(gòu)建了基因組文庫,從而開始了巴西橡膠樹分子生物學(xué)領(lǐng)域的研究。Rahman等[3]采用全基因組鳥槍法對(duì)巴西橡膠樹高產(chǎn)無性系RRIM600進(jìn)行基因組測(cè)序,報(bào)道了巴西橡膠樹的基因組草圖,預(yù)測(cè)共包含了68955個(gè)基因。2016年Tang等[4]進(jìn)一步對(duì)巴西橡膠樹全基因組進(jìn)行精細(xì)化測(cè)序,覆蓋率達(dá)93.8%,獲得高質(zhì)量的基因組序列1.37 Gb;同時(shí)鑒定了橡膠生物合成的關(guān)鍵基因REF1,為功能基因組學(xué)和優(yōu)良橡膠樹品種育種提供了寶貴的資源。2020年Liu等[5]使用單分子實(shí)時(shí)測(cè)序(SMRT)和三維基因組(HiC)技術(shù)建立了橡膠樹品種GT1參考基因組,該基因組為1.47 Gb,與共同祖先的其他植物相比,發(fā)現(xiàn)在橡膠樹GT1中與橡膠生物合成過程相關(guān)的基因大量擴(kuò)張,為今后橡膠樹GT-1提高NR含量以及NR合成相關(guān)基因的深入研究提供了新的依據(jù)。巴西橡膠樹基因組的測(cè)序或重測(cè)序的工作逐步深入,為尋找提高巴西橡膠樹的產(chǎn)膠量、抗逆性等重要生物性狀的基因奠定基礎(chǔ)。Ding等[6]通過橡膠生物合成基因的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)發(fā)現(xiàn)了橡膠小顆粒蛋白(SRPP,small rubber particle protein)、橡膠延伸因子(REF,rubber elongation factor)和順式戊烯基轉(zhuǎn)移酶(CPT,cis-isoprene transferase)是參與NR生物合成的樞紐基因。同時(shí)Karine等[7]發(fā)現(xiàn)膠乳中REF基因表達(dá)的蛋白含量與橡膠含量呈正比。2018年Retno等[8]發(fā)現(xiàn)過表達(dá)HbERF-IXc5的轉(zhuǎn)基因巴西橡膠樹在組織學(xué)水平上積累了更多的淀粉,分化了更多的乳膠細(xì)胞,提高了產(chǎn)膠含量。這些信息的發(fā)現(xiàn)為進(jìn)一步發(fā)掘橡膠樹產(chǎn)膠途徑中優(yōu)質(zhì)基因資源奠定重要基礎(chǔ)。挖掘更多產(chǎn)膠量高、抗逆性強(qiáng)的優(yōu)良基因并轉(zhuǎn)入巴西橡膠樹以提高NA含量尤為重要。

        1.2 橡膠草基因組研究

        NR需求的激增和巴西橡膠樹受病蟲害及生長(zhǎng)環(huán)境限制等因素,致使NR行業(yè)面臨著嚴(yán)峻考驗(yàn),因此尋求巴西橡膠樹替代產(chǎn)膠植物迫在眉睫。橡膠草(Taraxacum kok-saghyz)是菊科蒲公英屬多年生草本植物,因其根部含有的橡膠膠質(zhì)與巴西橡膠樹橡膠成分最為相似,且具有生長(zhǎng)收獲期短、種植地域廣泛、經(jīng)濟(jì)收益可觀的優(yōu)勢(shì),可作為優(yōu)良的產(chǎn)膠替代植物。Lin等[9]運(yùn)用SMRT組裝完成了高質(zhì)量的橡膠草基因組草圖,為NR產(chǎn)膠相關(guān)基因的研究奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

        橡膠草基因組草圖的公布極大地降低了克隆獲得NR生物合成關(guān)鍵基因的難度,對(duì)深入挖掘橡膠草基因功能十分重要。2009年Wahler[10]利用基因沉默技術(shù)沉默引起橡膠草膠乳褐變的多酚氧化酶(PPO)基因,發(fā)現(xiàn)該基因沉默后橡膠草的產(chǎn)膠量增加4~5倍。Wieghaus等[11]通過CRISPR/Cas9技術(shù)敲除了橡膠草抑制根生長(zhǎng)基因TkRALF,發(fā)現(xiàn)敲除該基因后橡膠草更容易形成主根,提高NR產(chǎn)量。趙麗娟等[12]在研究巴西橡膠樹產(chǎn)膠基因REF的基礎(chǔ)上,發(fā)現(xiàn)在橡膠草中過表達(dá)REF基因能有效地提高NR產(chǎn)量。張慧艷等[13]從橡膠草中克隆獲得橡膠合成相關(guān)的TkSRPP3基因,發(fā)現(xiàn)該基因過表達(dá)橡膠草的根部相對(duì)野生型較粗壯,根尖有膨大現(xiàn)象,根部生物量增加,利于提高橡膠產(chǎn)量。同時(shí),橡膠草在應(yīng)對(duì)逆境過程中也表現(xiàn)出許多優(yōu)良性狀,王肖肖等[14]在橡膠草中克隆得到了一個(gè)E2泛素結(jié)合酶基因TkUBC2,該基因在鹽脅迫和紫外輻射處理下上調(diào)表達(dá),在干旱脅迫、滲透脅迫條件下則下調(diào)表達(dá)。江羽宸等[15]以野生型橡膠草為材料,發(fā)現(xiàn)3月齡橡膠草在鹽脅迫處理6 h時(shí)TkJAZ9基因表達(dá)量上調(diào)2.16倍,表明該基因參與橡膠草應(yīng)答鹽脅迫。

        1.3 杜仲基因組研究

        杜仲(Eucommia ulmoides)屬于杜仲科杜仲屬植物,是中國(guó)特有的名貴經(jīng)濟(jì)樹種,其外果皮、樹皮和樹葉內(nèi)均含有反式-1,4-聚異戊二烯橡膠,該橡膠與巴西橡膠樹橡膠為同分異構(gòu)體[16],由于其耐嚴(yán)寒,在中國(guó)大部地區(qū)均可栽培,適應(yīng)性很強(qiáng),近年來也開始用作替代NR合成的優(yōu)良植物。Wuyun[17]使用Illumina測(cè)序、PacBio測(cè)序和Bionano作圖相結(jié)合的策略獲得杜仲1.2 Gb的高質(zhì)量組裝基因組,預(yù)測(cè)其基因組含有26723個(gè)基因,在此基礎(chǔ)上Tokumoto等[18]對(duì)不同樣本中的杜仲基因進(jìn)行了全基因組分析,發(fā)現(xiàn)27個(gè)參與NR生物合成的關(guān)鍵基因,其中包括編碼MVA和MEP途徑的酶基因,反式-1,4-聚異戊二烯合成酶(TIDS,transisoprenyl diphosphate synthase)基 因 (GPS、FPS和GGPS)、和其他與NR合成相關(guān)的基因,并且TIDS基因的表達(dá)受到這2個(gè)途徑的影響。說明杜仲通過MEP和MVA 2個(gè)途徑及途徑外的多種基因共同調(diào)節(jié)NR合成。Suzuki等[19]分別通過對(duì)杜仲內(nèi)、外莖的EST文庫測(cè)序,分離出6個(gè)參與MVA途徑的FPS基因,并通過對(duì)酵母突變體的功能互補(bǔ)證實(shí)了它們?cè)诋愇煜┗姿?IPP)生物合成中的作用,促進(jìn)NR的生物合成。此外,劉慧敏[20]利用啟動(dòng)子元件分析篩選出杜仲NR生物合成關(guān)鍵基因FPS5表達(dá)調(diào)控相關(guān)的lncRNA和miRNA,構(gòu)建了杜仲NR合成關(guān)鍵基因的調(diào)控系統(tǒng),為提高杜仲NR含量提供了重要的理論依據(jù)和實(shí)踐指導(dǎo)。

        1.4 其他產(chǎn)膠植物基因組研究

        為緩解NR日益累增的消耗問題,除巴西橡膠樹、橡膠草、杜仲等產(chǎn)膠植物外,科學(xué)家們一直致力于拓寬產(chǎn)膠替代植物的范疇,銀膠菊(Parthenium argentatum)和萵苣(Lactuca sativa)陸續(xù)被發(fā)現(xiàn)具有產(chǎn)膠特性,對(duì)于緩解NR消耗壓力具有重大意義。

        銀膠菊屬于菊科銀膠菊屬,其所含的NR與巴西橡膠樹的NR結(jié)構(gòu)和性能類似,但其全基因組序列尚未測(cè)序完成,對(duì)銀膠菊的基因組學(xué)研究有望使其成為有替代潛力的產(chǎn)膠植物[21]。2019年Lakusta等[22]鑒定了銀膠菊中3個(gè)PaCPT(PaCPT1-3)基因和1個(gè)PaCBP基因,發(fā)現(xiàn)這2類基因主要在莖中表達(dá),并受低溫脅迫誘導(dǎo),同時(shí)參與NR的生物合成。2017年Reyes等[23]使用基因組測(cè)序和Illumina測(cè)序,獲得了第一個(gè)基因組大小約為2.5 Gb的高質(zhì)量萵苣參考基因組。目前銀膠菊和萵苣NR合成相關(guān)基因的研究報(bào)道相對(duì)較少,在功能基因組研究和產(chǎn)膠能力提升等方面仍有較大空間。綜上所述,對(duì)產(chǎn)膠植物的研究結(jié)果表明,除了MVA和MEP的產(chǎn)膠途徑關(guān)鍵基因外,還有很多基因能夠提高天然橡膠含量(表1),為補(bǔ)充產(chǎn)膠基因與解析基因功能研究奠定了基礎(chǔ)?;蚪M學(xué)研究促進(jìn)了對(duì)產(chǎn)膠植物復(fù)雜產(chǎn)膠生物系統(tǒng)的理解,從基因水平上解釋了產(chǎn)膠途徑中各個(gè)環(huán)節(jié)重要基因的分子功能,為未來巴西橡膠樹更多產(chǎn)膠基因的發(fā)現(xiàn)提供了寶貴的基因組資源。

        表1 產(chǎn)膠植物不同組織來源的NR合成途徑(MVA和MEP)以外的關(guān)鍵基因

        2 產(chǎn)膠植物的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究

        轉(zhuǎn)錄組學(xué)不僅可以從整體水平上反映組織中基因的表達(dá)情況,而且可以預(yù)測(cè)新基因、解讀基因功能元件[28]。目前RNA-seq、EST及DNA微陣列等轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究技術(shù)在產(chǎn)膠植物研究中廣泛應(yīng)用,特別是在產(chǎn)膠途徑和逆境脅迫的研究中日漸深入。

        2.1 產(chǎn)膠轉(zhuǎn)錄組研究

        2014年Mantello[29]采用Illumina平臺(tái)對(duì)巴西橡膠樹樹皮進(jìn)行RNA測(cè)序,通過GO、KEGG進(jìn)行注釋共檢測(cè)到17927個(gè)SSRs和404114個(gè)SNPs。SNP標(biāo)記驗(yàn)證參與橡膠生物合成的36個(gè)基因型,共檢測(cè)到78個(gè)SNPs。2019年甘霖等[30]利用已公布的橡膠草75868條轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),檢索并分析了橡膠草SSR序列信息,從RNA水平上揭示了橡膠草SSR分布規(guī)律和特性,為橡膠草遺傳圖譜構(gòu)建、功能基因定位和克隆提供有效分子標(biāo)記。Chow等[31]利用RNA-Seq對(duì)膠乳進(jìn)行測(cè)序,獲得了3441個(gè)特異的轉(zhuǎn)錄本,其中REF和SRPP在膠乳中含量最豐富。2015年Nie等[24]以巴西橡膠樹為材料,對(duì)ATP結(jié)合盒(ABC,ATP-binding cassette)蛋白基因進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和ABC蛋白基因的表達(dá)分析,在膠乳中共鑒定出46個(gè)ABC家族蛋白,進(jìn)一步通過RTPCR驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)HbABCB15、HbABCB19、HbABCD1和HbABCG21的基因表達(dá)與NR生物合成密切相關(guān),為進(jìn)一步研究ABC在膠乳代謝和NR生物合成中的作用奠定了基礎(chǔ)。

        2.2 逆境轉(zhuǎn)錄組研究

        提升產(chǎn)膠植物抗逆水平是提高產(chǎn)膠植物NR含量的重要手段之一,例如乙烯處理巴西橡膠樹樹皮已經(jīng)成為增加乳膠產(chǎn)量的一種常規(guī)措施。安澤偉等[32]以巴西橡膠樹11個(gè)抗寒無性系和12個(gè)不抗寒無性系為研究對(duì)象,利用轉(zhuǎn)錄組cDNA-AFLP技術(shù)對(duì)巴西橡膠樹低溫處理前后的基因表達(dá)譜進(jìn)行差異分析,發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的基因在逆境脅迫下大量表達(dá),從而響應(yīng)低溫脅迫。莊玉粉[33]對(duì)乙烯處理8 h和24 h的巴西橡膠樹樹皮進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組從頭測(cè)序和組裝,分別檢測(cè)到了10216個(gè)和9374個(gè)差異表達(dá)基因,其中糖酵解途徑中的PFK、FBA、PGM等關(guān)鍵酶基因顯著上調(diào),使糖酵解途徑加速運(yùn)行提供充足的NR合成前體,促進(jìn)NR的生物合成。王建霄[34]采用RNA-seq對(duì)橡膠樹進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序共組裝產(chǎn)生167911個(gè)Unigenes,低溫處理時(shí)發(fā)現(xiàn)2403個(gè)Unigenes上調(diào)表達(dá),經(jīng)巴西橡膠樹參考轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)注釋發(fā)現(xiàn),與生長(zhǎng)、應(yīng)激、抗氧化活性相關(guān)的基因在低溫脅迫后顯著上調(diào)表達(dá)。Wu等[35]對(duì)巴西橡膠樹9個(gè)與膠乳代謝相關(guān)的主要基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄水平研究,發(fā)現(xiàn)這些基因上調(diào)表達(dá)與巴西橡膠樹膠乳代謝脅迫下的產(chǎn)膠有關(guān),許多逆境特異基因的表達(dá)模式與產(chǎn)膠植物的NR含量密切相關(guān)(表2)。這些結(jié)果為產(chǎn)膠植物應(yīng)答逆境脅迫以及如何提高逆境下NR產(chǎn)量的研究奠定了理論基礎(chǔ),為后續(xù)培育抗逆產(chǎn)膠植物資源提供了重要參考價(jià)值。

        表2 產(chǎn)膠植物響應(yīng)逆境脅迫的關(guān)鍵基因

        3 產(chǎn)膠植物的蛋白質(zhì)組學(xué)研究

        蛋白質(zhì)組學(xué)研究是基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的有效補(bǔ)充,不僅可以進(jìn)行蛋白質(zhì)表達(dá)水平的測(cè)定,而且可以研究蛋白質(zhì)的相互作用,進(jìn)而提供有關(guān)基因表達(dá)和調(diào)控的重要信息。目前關(guān)于產(chǎn)膠植物的蛋白質(zhì)組學(xué)研究主要集中在膠乳、橡膠粒子產(chǎn)膠與抗逆等方面。

        3.1 產(chǎn)膠蛋白質(zhì)組學(xué)

        作為產(chǎn)膠植物中的模式材料,圍繞巴西橡膠樹產(chǎn)膠主題進(jìn)行了大量蛋白質(zhì)組學(xué)研究。Wang等[40]從巴西橡膠樹不同組織成分中提取蛋白質(zhì),采用雙向凝膠電泳(2-DE)結(jié)合熒光差異凝膠電泳分析(DIGE)技術(shù)進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)研究,首創(chuàng)巴西橡膠樹全蛋白凝膠圖譜。Tong等[41]通過2-DE凝膠電泳對(duì)膠乳的比較蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)多種REF/SRPP家族蛋白質(zhì),而且REF/SRPP家族蛋白質(zhì)在高膠乳的巴西橡膠樹中顯著表達(dá),這一發(fā)現(xiàn)為探究NR生物合成提供重要信息。Wang等[42]對(duì)橡膠顆粒(RP)提取NR產(chǎn)生的洗滌液進(jìn)行質(zhì)譜分析,鑒定到233個(gè)高豐度表達(dá)的蛋白質(zhì),對(duì)RP膜蛋白在NR生物合成中的作用提供了新的證據(jù)。利用DIGE結(jié)合iTRAQ技術(shù)對(duì)乙烯刺激下的RP膜上不同的橡膠顆粒進(jìn)行定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究,發(fā)現(xiàn)REF和SRPP異構(gòu)體的磷酸化修飾是NR生物合成的關(guān)鍵[43]。通過蛋白質(zhì)組學(xué)和比較蛋白質(zhì)組學(xué)方法,全面研究RP膜蛋白和膠乳蛋白中響應(yīng)乙烯脅迫的差異表達(dá)蛋白,有利于揭示NR生物合成及其調(diào)控的分子機(jī)制。2019年Xie等[44]通過2-DE凝膠電泳和質(zhì)譜分析技術(shù)在橡膠草根部鑒定出58個(gè)包括10個(gè)REF/SRPP家族中參與MVA和MEP途徑的蛋白質(zhì),繪制了第一張高分辨率橡膠草根部蛋白質(zhì)圖譜,為進(jìn)一步填補(bǔ)橡膠草合成NR的相關(guān)蛋白提供了新的依據(jù)。在其他產(chǎn)膠植物中,目前還未見蛋白質(zhì)組學(xué)的報(bào)道。

        3.2 抗逆蛋白質(zhì)組學(xué)

        生物和非生物脅迫對(duì)產(chǎn)膠植物造成了極大影響,全面了解脅迫下的蛋白質(zhì)組變化有利于解決脅迫對(duì)產(chǎn)膠植物的危害,提高NR含量。目前關(guān)于巴西橡膠樹抗逆蛋白質(zhì)組學(xué)研究報(bào)道較多,而對(duì)于其他產(chǎn)膠植物的相關(guān)研究則比較少。由于巴西橡膠樹種植于熱帶地區(qū),干旱是影響其生長(zhǎng)的重要脅迫因素之一,巴西橡膠樹葉片在干旱脅迫下蛋白質(zhì)產(chǎn)生的質(zhì)或量變化,為了解巴西橡膠樹響應(yīng)干旱脅迫的分子基礎(chǔ)提供了理論指導(dǎo)[45]。Mohsen等[46]通過質(zhì)譜分析在巴西橡膠樹中鑒定出57種蛋白質(zhì),其中氧化還原蛋白與干旱脅迫高度相關(guān),為培育巴西橡膠樹抗旱種質(zhì)提供了依據(jù)。同樣,乙烯脅迫也會(huì)促進(jìn)多種蛋白合成,加速NR分子合成。王帆[47]采用非標(biāo)記定量技術(shù)(LFQ,label free quantitative technology)對(duì)乙烯脅迫后巴西橡膠樹的樹皮差異表達(dá)蛋白進(jìn)行了定量分析,從蛋白質(zhì)組水平上揭示乙烯脅迫促進(jìn)NR增產(chǎn)的分子機(jī)制。Wang等[48]又進(jìn)行乙烯脅迫下膠乳的蛋白質(zhì)組學(xué)分析,鑒定到287個(gè)高豐度的蛋白質(zhì)以及143個(gè)乙烯響應(yīng)膠乳蛋白,膠乳蛋白主要參與翻譯后修飾、碳水化合物代謝、延長(zhǎng)乳膠流動(dòng)等,與NR生物合成密切相關(guān)。曹志遠(yuǎn)[49]運(yùn)用iTRAQ分析了巴西橡膠樹紅根病菌(Ganoderma pseudoferreum)脅迫下差異表達(dá)蛋白質(zhì),并進(jìn)行了功能和代謝通路的注釋,為巴西橡膠樹病菌防治和提高NR含量奠定了理論基礎(chǔ)。

        產(chǎn)膠植物在基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究下誘導(dǎo)出一系列與產(chǎn)膠途徑和抗逆相關(guān)的蛋白質(zhì),對(duì)RP膜蛋白、逆境脅迫的研究使橡膠產(chǎn)出過程清晰地呈現(xiàn)出來,進(jìn)而使用iTRAQ等技術(shù)進(jìn)行定量研究,以期從蛋白質(zhì)角度闡明產(chǎn)膠植物抗逆以提高NR生物合成的分子機(jī)制,這些研究展示了如何使用蛋白質(zhì)組學(xué)方法,探索膠乳位置、合成途徑、代謝過程、環(huán)境脅迫等生物學(xué)過程中的產(chǎn)膠機(jī)制,使未來在蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)下開拓更多產(chǎn)膠相關(guān)的優(yōu)良蛋白成為可能。

        4 總結(jié)與展望

        組學(xué)時(shí)代的到來,為產(chǎn)膠植物的深入相關(guān)研究提供了良好的思路,為解決NR需求的日益增加以及NR產(chǎn)量偏低等問題提供了重要研究方向。圖1是作者根據(jù)國(guó)內(nèi)外各組學(xué)在產(chǎn)膠植物中最新研究進(jìn)展所總結(jié)的,從圖中可以看出產(chǎn)膠植物在基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域發(fā)展日漸深入,而其他組學(xué)中的研究初露端倪,未來整合多組學(xué)對(duì)產(chǎn)膠植物的評(píng)價(jià)將會(huì)更加客觀和具體,且擁有更廣闊的應(yīng)用前景和科研價(jià)值。產(chǎn)膠植物生長(zhǎng)過程中所附加的代謝產(chǎn)物菊糖和黃酮類化合物等能夠有效提高產(chǎn)膠植物的經(jīng)濟(jì)效益,具有較大的研究?jī)r(jià)值,因而代謝組學(xué)的研究勢(shì)在必行。修飾組學(xué)以探究蛋白質(zhì)翻譯后修飾對(duì)生命活動(dòng)產(chǎn)生的影響為目標(biāo),在未來研究產(chǎn)膠蛋白靶點(diǎn)的鑒定、產(chǎn)膠途徑標(biāo)志物的篩選等方面具有重要意義。而當(dāng)前興起的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)不僅可以研究單個(gè)細(xì)胞內(nèi)的基因表達(dá)情況,同時(shí)可以解決基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等研究中不同組織樣本測(cè)序時(shí)無法解決的細(xì)胞異質(zhì)性難題,使解析單個(gè)細(xì)胞的行為、機(jī)制成為了可能,未來將在產(chǎn)膠植物,特別是膠乳細(xì)胞中的深入研究發(fā)揮不可替代的作用。因此,增加代謝過程產(chǎn)能、鑒定產(chǎn)膠蛋白靶點(diǎn)、單個(gè)細(xì)胞定位產(chǎn)膠基因,培育抗逆性強(qiáng)、高產(chǎn)膠、代謝產(chǎn)物附加值大的產(chǎn)膠植物將成為產(chǎn)膠植物新的研究熱點(diǎn)。

        圖1 產(chǎn)膠植物的多組學(xué)研究現(xiàn)狀與未來

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