艾一純,袁雪嬌,余益成,呂 敏,陳 楠
(上海師范大學(xué)化學(xué)與材料科學(xué)學(xué)院,上海200234)
核酸(DNA和RNA)在臨床上能否發(fā)揮最大功效一定程度上取決于核酸載體[1].病毒作為早期核酸載體,其作用機理是通過包裝遺傳物質(zhì),保護它們不受核酸酶的影響,并將它們載運到具有高度特異性的靶細胞中.截至2017年,約67%的基因治療臨床試驗是由病毒載體完成的[2].然而,使用病毒作為基因載體仍然存在一些問題,包括免疫原性、插入性突變以及病毒本身的安全性等[3].此外,病毒傳遞基因能力有限,大規(guī)模生產(chǎn)所需成本高,阻礙了其在實際的廣泛應(yīng)用.因此,新型基因載體——非病毒載體的研發(fā)和應(yīng)用成為了當前生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域核酸應(yīng)用方向的前沿焦點[4-5].
納米載體,包括脂質(zhì)體[6]、膠束[7]、樹狀大分子[8]、介孔二氧化硅納米顆粒[9]、金納米粒子[10]、超順磁性氧化鐵納米粒子[11]、碳納米管[12]和量子點[13]等,用于生物分子傳遞的研究被大量報道.近年來,金屬-有機框架(MOF)由于其具有高度有序的孔隙和固有孔徑、較大的比表面積以及能夠進行有效的表面修飾,受到越來越多的關(guān)注,已成為納米載體中的新貴,并被廣泛應(yīng)用于藥物和基因等的載運[14-15].例如,有研究組采用PCN-224納米MOF負載光敏劑卟啉制成超小MOF量子點.在650 nm激光照射下,MOF量子點能產(chǎn)生2倍的活性氧(ROS),大大提高了光動力學(xué)治療(PDT)的效率[16].基于這些特點,納米MOF也可以作為一種有效的納米載體來傳遞核酸分子.
本工作利用熱溶劑法快速合成單分散的鐵基MIL-101-NH2納米MOF[17].MIL-101-NH2具有較低的細胞毒性.如圖1所示,通過靜電作用[18],將單鏈DNA和siRNA核酸分子(NA)分別負載到MIL-101-NH2納米粒子上,制備了MIL-101-NH2-NA,并對其細胞學(xué)行為進行考察.熒光成像表明:MIL-101-NH2-NA能有效進入細胞,且能夠?qū)崿F(xiàn)溶酶體逃逸.在生理條件下,MIL-101-NH2-NA能降解釋放siRNA,有效發(fā)揮基因沉默效應(yīng).總之,MIL-101-NH2作為一種有效的納米遞送系統(tǒng),為核酸運載和應(yīng)用提供了新策略.
圖1 MIL-101-NH2-NA的合成以及體內(nèi)基因沉默示意圖
六水合三氯化鐵(FeCl3·6H2O)、2-氨基對苯二甲酸和N,N-二甲基甲酰胺(DMF),購自上海探索平臺;3-(4,5-二甲基噻唑-2-基)-2,5-二苯四唑溴化銨(MTT)和遺傳霉素(Geneticin,G418),購自Sigma-Aldrich公司;最小必需培養(yǎng)基(MEM)和胎牛血清(FBS),購自Gibco Invitrogen公司;瓊脂糖、總RNA抽提試劑(Trizol試劑)和細胞核染料(Hoechst 33342),購自碧云天公司;溶酶體染料(lysotracker green),購自Life Technology公司;上樣緩沖液(6×loading buffer)和反轉(zhuǎn)錄試劑盒(PrimeScript RT Reagent Kit),購自TakaRa公司;凝膠電泳緩沖液(50×TAE buffer)、焦碳酸二乙酯處理過的水(DEPC水)和DNA-Cy3(5’Cy3-TGGACACTCGGAATG-3’),購自上海生工公司;EGFP siRNA(sense:5’-GCAUCAAGGUGAACUUC AAGA-3’和antisense:5’-UUGAAGUUCACCUUGAUGCCG-3’),購自上海吉瑪公司;超純水用Aquapro系統(tǒng)(18 MΩ·cm)制備.
場發(fā)射掃描電子顯微鏡(FESEM),Hitachi S-4800;動態(tài)光散射(DLS)分析儀,Malvern Nano-ZS 90;超速離心機,Beckman Coulter DU 730;酶標儀,Thermo Multiskan MK 3;激光掃描共聚焦顯微鏡(CLSM),Leica TCS SP 8;離心機,Eppendorf Centrifuge 5424 R;超聲機,XM 300 UHP;二氧化碳細胞培養(yǎng)箱,Thermo Scientific BB150;NanoDrop分光光度計,Thermo Scientific ND-ONEC-W;聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)核酸擴增儀,東勝龍ETC 811;實時熒光定量PCR儀,ABI Quant Studio 3.
1.3.1 MIL-101-NH2的制備
將FeCl3·6H2O(0.675 g)與2-氨基對苯二甲酸(0.225 g)混合在15 mL DMF中,充分攪拌后置于20 mL不銹鋼高壓釜內(nèi),110℃熱處理24 h.冷卻至室溫后,離心(4 500 r·min-1,15 min)分離所得顆粒,用DMF和乙醇交替洗滌3次,干燥得到MIL-101-NH2棕黑色固體.
1.3.2 MIL-101-NH2-NA的制備
分散于DEPC水中的MIL-101-NH2(200μL,200μg·mL-1)與NA(10μL,20μmol·L-1)混合,質(zhì)量比為m(MIL-101-NH2)∶m(NA)=16∶1,室溫條件下以轉(zhuǎn)速600 r·min-1混勻30 min.然后,離心(10 000 r·min-1,10 min)去除上清,DEPC水重新分散固體得到MIL-101-NH2-NA.
1.3.3 MIL-101-NH2和MIL-101-NH2-NA的表征
用場發(fā)射掃描電子顯微鏡(FESEM)表征MIL-101-NH2的形貌及粒徑,DLS分析儀表征MIL-101-NH2和MIL-101-NH2-NA的水分散性和Zeta電位.
1.3.4 瓊脂糖電泳
MIL-101-NH2-NA(10μL,20μg·mL-1)、NA(10μL,100 nmol·L-1)分別與6×loading buffer(2μL)混合制備瓊脂糖電泳樣品.稱取1 g瓊脂糖溶于50 mL 1×TAE buffer中,加熱溶解,加入5μL凝膠紅(GelRed)核酸染料制備質(zhì)量濃度為0.02 g·mL-1的瓊脂糖凝膠.在電壓100 V條件下,電泳30 min后分析NA條帶.通過NA的物質(zhì)的量和MIL-101-NH2的質(zhì)量之比,計算出NA的負載率,單位為nmol·mg-1.
1.3.5 Hela-EGFP細胞培養(yǎng)
Hela-EGFP細胞用含有體積分數(shù)為10%的FBS、100 units·mL-1青霉素、100 units·mL-1鏈霉素和500μg·mL-1G418的MEM培養(yǎng)液培養(yǎng).Hela細胞用含有10%FBS、100 units·mL-1青霉素、100 units·mL-1鏈霉素的MEM培養(yǎng)液培養(yǎng).細胞在含有體積分數(shù)為5%的CO2,37℃的培養(yǎng)箱中培養(yǎng),采用對數(shù)生長期的細胞進行所有的實驗.
1.3.6 細胞活力檢測
用MTT分析法評價MIL-101-NH2納米材料對Hela-EGFP細胞活力的影響.細胞接種于96孔板(每孔5 000個細胞),過夜培養(yǎng).用100μL不同質(zhì)量濃度的MIL-101-NH2(20,50,100μg·mL-1)新鮮完全培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng).孵育24 h后,PBS洗2次,加入MTT溶液(100μL,0.5 mg·mL-1),在37℃孵育4 h.然后,去除MTT溶液,加入DMSO(100μL),37℃孵育20 min.最后,用酶標儀測試490 nm處的吸光度,X表示細胞活力,Y表示吸光度值:
1.3.7 熒光成像
使用CLSM研究MIL-101-NH2的細胞攝取.在直徑為35 mm的玻璃底培養(yǎng)皿中接種Hela細胞(每個培養(yǎng)皿含3×104個細胞),過夜培養(yǎng).分別用含有10μg·mL-1和20μg·mL-1的MIL-DNA-Cy3培育細胞,孵育24 h后,用PBS沖洗細胞3次,質(zhì)量分數(shù)為4%的多聚甲醛固定,然后用Hoechst 33342對細胞核進行染色,最后用CLSM進行熒光成像.
使用CLSM研究核酸的溶酶體逃逸.在直徑為35 mm的玻璃底培養(yǎng)皿中接種Hela細胞(每個培養(yǎng)皿含3×104個細胞),過夜培養(yǎng).MIL-DNA-Cy3與細胞共培養(yǎng),分別孵育8 h和16 h后,PBS沖洗細胞,用lysotracker green對溶酶體進行活細胞熒光染色,最后用CLSM進行熒光成像.
使用CLSM研究綠色熒光蛋白(EGFP)的敲除效應(yīng).在直徑為35 mm的玻璃底培養(yǎng)皿中接種Hela-EGFP細胞(每個培養(yǎng)皿含3×104個細胞),過夜培養(yǎng).分別用EGFP siRNA(siEGFP),lipo 3000(轉(zhuǎn)染試劑)轉(zhuǎn)染siEGFP和MIL-si EGFP培育細胞.孵育48 h后,PBS沖洗細胞3次,4%多聚甲醛固定,然后用Hoechst 33342對細胞核進行染色,最后用CLSM進行熒光成像.
1.3.8 實時熒光定量PCR(RT-qPCR)
為了確定EGFP的表達程度,采用RT-qPCR對EGFP mRNA進行定量分析.6孔板接種Hela-EGFP細胞(每孔15×104個細胞),過夜培養(yǎng).分別用EGFP siRNA,lipo 3000轉(zhuǎn)染siEGFP和MIL-siEGFP培育細胞.孵育48 h后,細胞用PBS洗滌2次.采用Trizol法提取總RNA,每個樣品取1μL,用NanoDrop分光光度計測定RNA的質(zhì)量濃度.將提取的RNA樣品稀釋至相同質(zhì)量濃度(200μg·mL-1),然后用PrimeScript RT Reagent Kit從RNA逆轉(zhuǎn)錄到cDNA.采用SYBR Green Reagents染料法在ABI Quant Studio 3 PCR系統(tǒng)進行實時PCR檢測分析樣品.
以Fe3+作為金屬離子結(jié)點,2-氨基對苯二甲酸作為有機配體,用熱溶劑法合成了MIL-101-NH2,如圖1所示.通過場發(fā)射掃描電子顯微鏡(FESEM)對MIL-101-NH2進行了形貌表征,如圖2(a)所示,MIL-101-NH2表現(xiàn)出八面體形狀,大小約為200 nm.考慮到核酸帶負電荷性質(zhì)和納米MOF帶正電荷特性,可通過靜電吸附作用將NA負載到MIL-101-NH2.DLS分析MIL-101-NH2和MIL-101-NH2-NA,結(jié)果表明:MIL-101-NH2水合直徑約為(274±12)nm,如圖2(b)所示;而修飾NA后的納米粒子水合直徑為(286±10)nm,如圖2(c)所示,說明NA吸附后導(dǎo)致納米粒子的水合粒徑稍大,表明NA的成功修飾.為了進一步驗證MIL-101-NH2-NA的成功制備,對其進行了Zeta電位檢測.如圖2(d)所示,MIL-101-NH2和MIL-101-NH2-NA的Zeta電位分別為+11 mV和-19.7 mV,很好地證明了NA的負載.為了確定NA的負載量,通過質(zhì)量濃度為0.02 g·mL-1的瓊脂糖電泳來進行探究,對siEGFP,MIL-siEGFP,DNA-Cy3和MIL-DNA-Cy3的條帶進行分析,通過計算得到siRNA和DNA的負載量均為7 nmol·mg-1,如圖2(e)和圖2(f)所示.
圖2 MIL-101-NH2-NA的合成及表征.(a)MIL-101-NH2的FESEM圖;(b)MIL-101-NH2的水合粒徑圖;(c)MIL-101-NH2-NA的水合粒徑圖;(d)MIL-101-NH2和MIL-101-NH2-NA的Zeta電位圖;(e)si RNA和MIL-siRNA的2%瓊脂糖電泳圖;(f)DNA和MIL-DNA的2%瓊脂糖電泳圖
為了考察MIL-101-NH2是否影響Hela細胞的活力,采用MTT法分別檢測細胞在質(zhì)量濃度為20,50和100μg·mL-1MIL-101-NH2中培養(yǎng)24 h的存活情況.結(jié)果顯示:3種不同質(zhì)量濃度的MIL-101-NH2不影響Hela細胞的細胞活力,如圖3(a)所示.此外,CLSM的明場成像顯示細胞形態(tài)完好,如圖3(b)所示,也表明MIL-101-NH2-NA不影響細胞活力.
圖3 MIL-101-NH2的良好生物相容性.(a)MIL-101-NH2的MTT細胞活力檢測;(b)對照(Control)組(左)與MIL-101-NH2-NA(右)的CLSM明場(bright field)圖像
有效的細胞攝取是核酸發(fā)揮生物學(xué)功能的首要條件,因此,考察了MIL-101-NH2-NA在Hela細胞中的攝取效率.將修飾Cy3熒光基團的DNA鏈通過靜電作用吸附到MIL-101-NH2上,與Hela細胞共同培養(yǎng)24 h.通過CLSM進行細胞成像,可以看到細胞中出現(xiàn)紅色熒光,表明MIL-101-NH2-NA通過內(nèi)吞作用被傳遞到細胞中,如圖4(a)所示.通過對單個細胞內(nèi)的熒光強度進行定量分析和統(tǒng)計表明:隨著MIL-101-NH2-NA濃度的增加,細胞攝取也相應(yīng)增加,如圖4(b)所示,這證明MIL-101-NH2-NA可以被細胞有效攝取.
圖4 MIL-101-NH2-NA的有效細胞攝取.(a)MIL-101-NH2-NA細胞攝取CLSM圖(Merge:合并圖);(b)定量分析不同質(zhì)量濃度下MIL-101-NH2-NA的細胞攝取差異(n=10)
在成功內(nèi)化進細胞后,有效的溶酶體逃逸是核酸發(fā)揮作用的關(guān)鍵[19-20].根據(jù)報道[21],MIL-101-NH2中存在不飽和Fe(Ⅲ)位點,提供了與富電子官能團的內(nèi)在配位性質(zhì).所以,不飽和的Fe(Ⅲ)位點與磷酸鹽離子具有很高的親和力.當MIL-101-NH2內(nèi)化并進入溶酶體時,內(nèi)源性高濃度的磷酸鹽離子會導(dǎo)致MIL-101-NH2的分解.MIL-101-NH2骨架坍塌后,分離的鐵離子與磷酸基團的溶酶體膜結(jié)合,破壞溶酶體結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性,從而可以促進核酸的逃逸和釋放.為了證實NA的逃逸行為,用CLSM觀察MIL-101-NH2-NA的分布與定位.如圖5(a)所示,當MIL-101-NH2-NA與Hela細胞孵育8 h后,有大量的紅色信號(DNA-Cy3)與綠色信號(溶酶體)重疊,表明MIL-101-NH2-NA在Hela細胞的溶酶體內(nèi)聚集.孵育16 h后,細胞質(zhì)中大部分綠色信號(溶酶體)和紅色信號(DNA-Cy3)分離,提示NA逃離溶酶體的包封,并在細胞質(zhì)中積累.如圖5(b)和圖5(c)所示,通過在CLSM圖像上劃線進行熒光定量分析,同樣也表明MIL-101-NH2-NA在8 h和溶酶體共定位較多,而到16 h則共定位減少.該實驗結(jié)果表明:MIL-101-NH2可以載帶核酸分子進入細胞,且能夠逃脫溶酶體并釋放,為核酸發(fā)揮生物學(xué)功能提供了可能.
圖5 MIL-101-NH2載帶核酸的溶酶體逃逸.(a)MIL-101-NH2-NA(紅色)與lysotracker green(綠色)共定位CLSM圖;(b)定量分析8 h和(c)定量分析16 h時MIL-101-NH2-NA(紅色)與lysotracker green(黑色)熒光強度圖
上述結(jié)果表明,MIL-101-NH2可以有效地負載核酸分子進入細胞,并且發(fā)生溶酶體逃逸,提示其可能是一種理想的功能核酸的納米載體,所以用MIL-101-NH2負載EGFP siRNA(MIL-si EGFP)來探究基因沉默效應(yīng).將MIL-si EGFP與Hela-EGFP細胞孵育48 h,用熒光顯微鏡觀察EGFP的熒光強度.結(jié)果表明:MIL-siEGFP顯著地降低了EGFP的熒光強度,與lipo 3000轉(zhuǎn)染siEGFP(lipo-si EGFP)效果相似,而游離的si EGFP沒有這種現(xiàn)象,如圖6(a)所示.為了進一步確定基因沉默效率,通過RT-qPCR定量分析EGFP在mRNA水平的表達.如圖6(b)所示,游離的siEGFP處理的細胞的EGFP mRNA水平和空白組相比沒有變化,而lipo-siEGFP處理的細胞和MIL-siEGFP處理的細胞的EGFP mRNA水平分別表現(xiàn)出60%和40%的基因沉默效率.這表明:MIL-101-NH2-NA能夠在細胞內(nèi)有效地發(fā)揮基因沉默效應(yīng).
圖6 MIL-101-NH2-NA的基因沉默效應(yīng).(a)Hela-EGFP細胞與siEGFP,lipo-siEGFP和MIL-si EGFP孵育48 h的細胞基因敲除CLSM圖;(b)通過RT-qPCR定量分析si EGFP,lipo-siEGFP和MIL-siEGFP處理Hela-EGFP細胞的基因沉默效應(yīng)
綜上所述,本研究制備了納米級含鐵MOF和MIL-101-NH2,并研究其生物相容性以及其作為核酸載體的特性.實驗結(jié)果表明:MIL-101-NH2具有較好的生物相容性,能夠有效地負載核酸進入細胞,定位在溶酶體里,并發(fā)生溶酶體逃逸.通過負載EGFP siRNA證明MIL-101-NH2-NA能夠有效運載si RNA進入細胞發(fā)揮基因沉默效應(yīng).本工作可視化地闡明了鐵基納米MIL-101-NH2的細胞攝取和定位,為其作為納米載體,特別是核酸載體,在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用提供了理論指導(dǎo).