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        高產(chǎn)谷氨酸脫羧酶的菌株篩選及鑒定

        2021-11-04 09:06:08柏映國
        飼料工業(yè) 2021年19期

        ■孫 磊 周 成 張 琇 孟 昆 柏映國 涂 濤*

        (1.中國農(nóng)業(yè)科學院北京畜牧獸醫(yī)研究所,動物營養(yǎng)學國家重點實驗室,北京 100193;2.北方民族大學生物科學與工程學院,寧夏特殊生境微生物資源開發(fā)與利用重點實驗室,寧夏銀川 750021;3.中國農(nóng)業(yè)科學院飼料研究所,北京 100081)

        γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)是一種普遍存在于自然界的四碳非蛋白質(zhì)氨基酸。它在人體內(nèi)作為一種抑制性神經(jīng)遞質(zhì),具有鎮(zhèn)靜安神、降血壓、抗癲癇哮喘、抗氧化衰老、調(diào)節(jié)激素分泌等重要的生理功效,因此,它在農(nóng)牧、食品、工業(yè)、醫(yī)療等多種產(chǎn)業(yè)中都具有廣闊的應用前景[1-2]。在畜牧養(yǎng)殖業(yè),研究發(fā)現(xiàn)GABA可以有效改善動物機體熱應激反應,促進動物的生長生殖,因此可以作為一種新型的飼料添加劑,助推畜牧養(yǎng)殖業(yè)綠色健康發(fā)展[3-5]。趙紅霞等[6]的研究發(fā)現(xiàn),飼料中添加GABA能夠提高凡納濱對蝦的攝食率、增重率和抗亞硝酸氮應激的能力;李占占等[7]簡述了γ-氨基丁酸的生物學功能及其在養(yǎng)雞生產(chǎn)中的研究現(xiàn)狀、應用前景;國強[8]在仔豬飼糧中添加20 mg/kg GABA 的研究發(fā)現(xiàn)可以顯著提高仔豬的生產(chǎn)性能,調(diào)節(jié)其血清中激素的分泌,對仔豬的免疫功能和腸道微生物有一定改善的作用;劉巖等[9]在反芻動物體內(nèi)研究了γ-氨基丁酸的生理功能及其在奶牛熱應激中的應用。

        目前GABA的生產(chǎn)制備主要有植物富集、化學合成和微生物發(fā)酵的方式,但是植物富集GABA的方法存在植物生長周期長、效率低的缺點,不能滿足需求,化學合成的方法又存在著底物腐蝕性、副產(chǎn)物多等弊端[10]。相比較來說,微生物具有生長傳代迅速、培養(yǎng)條件簡單、生產(chǎn)成本低廉的優(yōu)勢。微生物生產(chǎn)GABA是通過其體內(nèi)酶——谷氨酸脫羧酶(glutamate decarbox?ylase,GAD; EC 4.1.1.15)催化L-谷氨酸(L-glutamate,L-Glu)或谷氨酸鈉(monosodium glutamate,MSG)脫羧獲得的[11]。隨著生物技術的發(fā)展,通過構(gòu)建表達水平高、生產(chǎn)效率高的基因工程菌來進行細胞轉(zhuǎn)化,使得該方法更有希望應用于GABA的工業(yè)化生產(chǎn)[12]。田靈芝等[13]從植物乳桿菌擴增獲得了GAD 基因lpgad,構(gòu)建了重組質(zhì)粒pET-28a-lpgad 后,在大腸桿菌BL21(DE3)中高效誘導其表達,利用菌體轉(zhuǎn)化L-Glu底物,轉(zhuǎn)化率為97.32%;張六六等[14]通過在枯草芽孢桿菌中優(yōu)化GAD 及輔因子磷酸吡哆醛(pyridoxal 5’-phos?phate,PLP)再生基因的串聯(lián)表達,構(gòu)建了1 株高產(chǎn)GAD 的重組枯草芽孢桿菌,通過24 h 的全細胞轉(zhuǎn)化得到327 g/L GABA 的產(chǎn)量。因此,利用微生物進行發(fā)酵轉(zhuǎn)化生產(chǎn)GABA,逐漸成為具有發(fā)展?jié)摿Φ木G色生產(chǎn)方式[15]。

        GAD已從多種生物資源中都得以挖掘和表征,而現(xiàn)如今,以微生物細胞為轉(zhuǎn)化平臺并沒有大規(guī)模實際應用的實例報道,歸結(jié)原因主要是:①微生物轉(zhuǎn)化生產(chǎn)GABA 的轉(zhuǎn)化率達不到工業(yè)生產(chǎn)的要求,轉(zhuǎn)化率低;②后期產(chǎn)物的分離純化工藝繁瑣、耗能大,收益低。因此,挖掘優(yōu)良的GAD資源,對于后期構(gòu)建高效率轉(zhuǎn)化性能的細胞平臺,實現(xiàn)大規(guī)模工業(yè)生產(chǎn)GABA具有重要意義。本研究基于現(xiàn)如今產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀,確定了具體的研究目的:挖掘新穎的GAD 蛋白資源,進行菌株的鑒定,為獲得具有產(chǎn)業(yè)價值的GAD 資源奠定基礎。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        1.1.1 土樣

        從寧夏沙坡頭采集地表下5 cm左右的沙漠土壤樣品,將采集的土樣置于無菌自封袋中,保存于-20 ℃冰箱,用于后期的菌株篩選與分離研究工作。

        1.1.2 培養(yǎng)基及試劑配制

        LB液體培養(yǎng)基:酵母粉5 mmol/L,NaCl 10 mmol/L,蛋白胨10 mmol/L,固體培養(yǎng)基另加15~20 mmol/L;發(fā)酵培養(yǎng)基:葡萄糖30.0 mmol/L、蛋白胨30.0 mmol/L、K2HPO40.6 mmol/L、L-Glu 8.0 mmol/L、NaNO33.0 g/L、MgSO4·7H2O 0.5 mmol/L、FeSO4·7H2O 0.01 mmol/L、PLP 0.3 mmol/L,pH 6.0,固體發(fā)酵培養(yǎng)基另加瓊脂粉15 mmol/L;常見菌株生理生化鑒定培養(yǎng)基:依據(jù)東秀珠等[16]的《常見細菌系統(tǒng)鑒定手冊》配制;50×TAE電泳緩沖液:稱取Tris 242 g,冰乙酸57.1 mL/L,0.5 mmol/L EDTA,pH 8.0;甲基紅指示劑:2 mmol/L,純乙醇溶解;溴甲酚綠指示劑:1 mmol/L,純乙醇溶解;甲基紅-溴甲酚綠指示劑:甲基紅和溴甲酚綠指示劑(V/V=1∶3)混合;NaHCO3:40 mmol/L;2, 4-二甲基胺基偶氮苯-4-磺酰氯溶液(4-N, N-dimethylaminoazobenzene-4'-sulfonyl chloride,DABS-Cl):1 mmol/L,純乙腈溶解。

        1.1.3 試劑及試劑盒

        乙酸鈉、L-Glu 和GABA:純度≥99%(Sigma),色譜級乙腈、甲醇:純度≥99%(Thermo Fisher),DABSCl、PLP:純度≥98%(上海麥克林);Ex Taq DNA 聚合酶購自Vazyme 公司;膠回收試劑盒核酸分子量Marker、細菌基因組DNA 提取試劑盒購自天根生化科技(北京)有限公司。其他所用試劑均為國產(chǎn)分析純試劑。

        1.1.4 試驗儀器

        PCR 儀、凝膠成像儀均購自美國Bio-Rad 公司;移液器購自德國Eppendorf 公司;酶標儀購自美國BioTek公司;高效液相SHIMADZU 20A檢測器購自日本島津公司;色譜柱ZORBAX SB-C18(150×4.6 mm,5 μm)購自美國Agilent公司;臺式離心機和立式高速冷凍離心機購自日本HITACHI 公司;核酸電泳儀、無菌操作臺、滅菌鍋、水浴鍋、恒溫搖床、培養(yǎng)箱等為國產(chǎn)儀器。

        1.2 試驗方法

        1.2.1 土樣處理

        根據(jù)梯度稀釋法對土壤中的菌株進行分離。分別稱取4 g采集的土壤樣品3份,放入盛有40 mL無菌生理鹽水和玻璃珠的100 mL 三角瓶中,土壤稀釋度為10-1。于30 ℃、180 r/min振蕩培養(yǎng)30 min。靜置沉淀,吸取500 μL 三角瓶中的上清液置于盛有4.5 mL無菌生理鹽水的Ep 管中,充分振蕩混勻。用滅菌生理鹽水按照上述方法進行三次梯度稀釋,共得到稀釋度為10-1、10-2、10-3、10-4、10-5的土樣稀釋液,分別涂布于含有50 μg/mL 的卡那霉素、50 μg/mL 氨芐西林、100 μg/mL 氯霉素和無抗的4 種LB 固體培養(yǎng)基中,30 ℃培養(yǎng)箱倒置培養(yǎng)12 h,觀察菌株生長情況。

        1.2.2 純化菌種

        根據(jù)單菌分離法對土樣中的菌種進行純化分離。挑選各培養(yǎng)皿中形態(tài)不同且出現(xiàn)頻率高的單菌落作為優(yōu)勢菌種進行分離純化,直至長出形態(tài)均一的菌落為止。將獲得的菌株以1%的接種量接種于LB培養(yǎng)基中,30 ℃過夜培養(yǎng)后,取400 μL菌液添加到等量的40%的甘油于-80 ℃保存。另外,選擇平板和斜面培養(yǎng)基將菌種保存在4 ℃,每周進行一次活化轉(zhuǎn)接。

        1.2.3 產(chǎn)GABA菌株的篩選

        1.2.3.1 顯色法初篩

        調(diào)節(jié)發(fā)酵培養(yǎng)基至不同pH,吸取20 μL甲基紅-溴甲酚綠指示劑加入到200 μL 發(fā)酵培養(yǎng)基中,觀察顏色變化。

        將4 ℃保存的斜面菌用無菌牙簽挑取放入無抗LB 培養(yǎng)基中于30 ℃恒溫培養(yǎng)箱活化12 h,然后吸取10 μL 滴加在固體發(fā)酵培養(yǎng)基上,置于30 ℃過夜培養(yǎng)。將甲基紅-溴甲酚綠指示劑滴加到平板培養(yǎng)基,靜置5 min,觀察顏色變化。

        以1%的接菌量接入液體發(fā)酵培養(yǎng)基30 ℃下培養(yǎng)72 h。裝液量40 mL/100 mL,搖床轉(zhuǎn)速200 r/min。取2 mL 發(fā)酵72 h 后的混合液于12 000 r/min 離心5 min,吸取20 μL 甲基紅-溴甲酚綠指示劑加入到200 μL發(fā)酵上清液中顯色,對比發(fā)酵前后顏色變化。

        1.2.3.2 HPLC復篩

        吸取500 μL發(fā)酵液添加到500 μL 80%的乙醇中終止反應,按照邵金良等[17]的測定方法對樣品進行HPLC測定。將1 mmol/L的L-Glu和GABA的標準溶液以及上述發(fā)酵后樣品離心后的上清分別取500 μL,依次加入100 μL的NaHCO3溶液和200 μL的DABS-Cl溶液,混合后于70 ℃反應20 min,后經(jīng)0.22 μm 的濾膜過濾進行HPLC測定。HPLC檢測條件如下:紫外檢測波長為436 nm;進樣量:10 μL;柱溫為30 ℃;流動相流速為1.0 mL/min;流動相A:乙酸鈉溶液(0.05 mmol/L),35%;流動相B:乙腈,65%;色譜柱為Agilent ZORBAX SB-C18(150 mm×4.6 mm,5 μm)。

        1.2.4 菌株的形態(tài)鑒定

        將分離純化的菌株接種于營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基上,30 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)12 h,挑取生長狀態(tài)良好的單菌落置于載玻片上,光學顯微鏡下觀察菌體的形態(tài)、顏色、邊緣、透明度、表面、有無鞭毛及芽孢著生等。

        1.2.5 基因組的提取和16S rDNA的擴增

        將獲得的菌株以1%的接菌量接到40 mL LB 培養(yǎng)基,于30 ℃培養(yǎng)12 h 后,12 000 r/min 離心1 min,棄上清,收集菌體;采用細菌基因組DNA提取試劑盒分別提取所獲菌株的基因組,提取方法參考試劑盒說明書進行;提取基因組后送蘇州金唯智生物科技有限公司測序分析。

        分別以菌株Z1、Z11、Z20 的基因組DNA 為模板,對菌株的16S rDNA基因片段進行擴增,采用通用的引物,正向引物27F:5’-AGAGTTTGATCCTGGCT?CAG-3’和反向引物1492R:5’-GGTTACCTTGTTAC?GACTT-3’。PCR 反應體系如下(總體積50 μL):dNTP 4 μL;正方向引物各2.5 μL;基因組DNA 1 μL;TaqDNA 聚合酶0.5 μL;10×Buffer 5 μL;最后ddH2O補齊至50 μL。

        PCR 擴增共進行30 個程序循環(huán):94 ℃預變性3 min;94 ℃變性50 s,55 ℃退火50 s,72 ℃延伸3 min;再72 ℃延伸5 min。PCR 產(chǎn)物測序由北京六合華大基因科技有限公司完成。

        1.2.6 系統(tǒng)發(fā)育分析

        將本研究中的3 個谷氨酸脫羧酶的16S rDNA 序列與NCBI 數(shù)據(jù)庫中的序列進行相似性比對,用MEGA 7.0 軟件中的ClustalW 進行序列對比后,參數(shù)默認;利用鄰接(Neighbour-joining)方法構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,Bootstrap method的設定值為1 000。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 產(chǎn)GABA菌株的篩選

        2.1.1 顯色法初篩

        未進行發(fā)酵的發(fā)酵培養(yǎng)基在不同pH 下,顯示不同的顏色。產(chǎn)GABA 的菌株將底物消耗產(chǎn)生在水溶液中成中性pH的GABA后,培養(yǎng)基pH由酸性轉(zhuǎn)為中性,添加甲基紅-溴甲酚綠酸堿指示劑后,培養(yǎng)基呈現(xiàn)綠色或深綠色顏色(圖1A)。本研究從沙漠土壤樣品中分離到47株菌株,分別接種到發(fā)酵培養(yǎng)基培養(yǎng)72 h后,利用甲基紅-溴甲酚綠酸堿指示劑顯色的方法對GABA產(chǎn)生菌進行初篩。從而初步鑒定出3株具有產(chǎn)GABA能力的菌株,并命名為Z1、Z11、Z20(圖1B)。

        圖1 發(fā)酵培養(yǎng)基在酸堿指示劑下的顏色反應

        2.1.2 HPLC復篩

        利用HPLC 對發(fā)酵過后顯綠色的菌株進行初篩結(jié)果的驗證。首先,如圖2A 所示,經(jīng)HPLC 檢測,L-Glu 的衍生物在0.8 min 左右出峰,而GABA 的衍生物在4.2 min 出峰,推測2.3 min 左右存在的峰是衍生試劑本身的峰。雜質(zhì)峰與GABA 衍生物的峰不存在交叉覆蓋影響,具有良好的峰形。

        HPLC檢測發(fā)酵上清液后發(fā)現(xiàn)3株菌在4.0~4.2 min左右都有GABA吸收峰的出現(xiàn)(圖2B),說明經(jīng)72 h發(fā)酵培養(yǎng)后,3株菌都具有將底物轉(zhuǎn)化生成GABA的能力。1 mmol/L GABA的峰面積在1 435 760左右,憑借GABA標準溶液的濃度和峰面積可以計算出菌株Z1、Z11、Z20所產(chǎn)GABA的濃度,分別為0.80、0.85、0.75 mmol/L。Z1、Z11、Z20所產(chǎn)GABA的峰面積與濃度見表1。

        圖2 GABA液相色譜

        表1 Z1、Z11、Z20所產(chǎn)GABA的峰面積與濃度

        2.2 菌株的鑒定

        2.2.1 形態(tài)鑒定

        菌株Z1、Z11、Z20在營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基上呈淡黃色圓形菌落,表面粗糙不透明,邊緣整齊,革蘭氏染色呈陽性。顯微鏡下菌體呈桿狀,兩端鈍圓,多成串出現(xiàn),有橢圓形芽孢,芽孢囊不膨大,中生或次端生。根據(jù)形態(tài)特征初步判斷菌株Z1、Z11、Z20 為芽孢桿菌屬(Bacillus sp.)。

        2.2.2 16S rDNA序列分析

        以菌株Z1、Z11 和Z20 的基因組DNA 為模板,利用通用引物分別對16S rDNA 保守序列進行PCR 擴增,均獲得1.5 kb大小的序列,見圖3。

        圖3 16S rDNA的PCR產(chǎn)物電泳圖

        將純化后的PCR 產(chǎn)物連接到T 載體,經(jīng)過菌落PCR驗證得到條帶大小正確的轉(zhuǎn)化子,測序結(jié)果表明三條序列大小均為1.5 kb。三條16S rDNA 序列分別與GenBank 數(shù)據(jù)庫中的16S rDNA 核苷酸序列進行同源比較,結(jié)果顯示與黃海芽孢桿菌(Bacillus marisfla?vi)、水生芽孢桿菌(Bacillus aquimaris)、芽孢桿菌CSS-5、芽孢桿菌NH6 等來源的16S rDNA 核苷酸序列相似性最高,可以達到98%。

        2.2.3 序列系統(tǒng)發(fā)育分析

        將菌株Z1、Z11 和Z20 的16S rDNA 序列與Gen?Bank 數(shù)據(jù)庫中的16S rDNA 序列做相似性比對,結(jié)果表明3 株菌的16S rDNA 序列均與芽孢桿菌屬(Bacillus sp.)相關菌株的16S rDNA 序列的相似性較高,聚為一簇,構(gòu)建Neighbor-Joining 系統(tǒng)進化樹如圖4 所示。

        圖4 Z1、Z11、Z20與芽孢桿菌屬相關菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹

        結(jié)合形態(tài)特征和系統(tǒng)發(fā)育分析,判定菌株Z1、Z11和Z20均為芽孢桿菌屬,并命名為Bacillus sp. Z1、Bacillus sp. Z11和Bacillus sp. Z20,將所得的菌株保存在中國農(nóng)業(yè)微生物菌種保存中心(Agriculture Culture Collection of China,ACCC),保藏號分別為ACCC 61750、61747和61748。

        2.3 基因組的提取及分析

        基因組測序一般包括提取基因組DNA、打斷基因組、末端修復、加接頭、純化DNA 和上機測序。將原始數(shù)據(jù)去接頭、去除低質(zhì)量數(shù)據(jù)后獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)進行組裝后,便可以進行下一步的編碼基因預測、非編碼RNA 的預測,利用NR、KEGG、COG、CAZy 等數(shù)據(jù)庫對預測出的編碼基因進行功能注釋分析。

        2.3.1 基因組組裝分析

        基因組樣本經(jīng)檢測合格用來構(gòu)建文庫,大片段DNA 將被打斷為約500 bp 的大小片段進行測序,測序得到的序列利用Velvet、SSPACE、GapFiller 等軟件進行拼接組裝和補齊。三株菌的基因組測序數(shù)據(jù)結(jié)果統(tǒng)計顯示,菌株Z1、Z11和Z20的基因組全長分別為4.3、4.8 和4.8 Mb,G+C 含量分別為48.5%、47.5%和47.4%。結(jié)果見表2。

        表2 基因組組裝分析

        2.3.2 基因功能注釋

        利用NCBI 的NR(Non-Redundant Protein Data?base)數(shù)據(jù)庫對芽孢桿菌基因進行注釋,同時注釋的結(jié)果包含了物種信息,可用作物種分類。表3 以Z1、Z11、Z20 每個菌株中的兩個基因片段為例,闡釋NR數(shù)據(jù)庫的功能注釋作用。

        表3 NR數(shù)據(jù)庫的注釋信息

        KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)數(shù)據(jù)庫將生物代謝通路劃分為細胞過程(Cel?lular processes)、遺傳信息處理(Genetic information processing)、新陳代謝(Metabolism)等6類。通過該數(shù)據(jù)庫注釋分析,有助于查看相應基因參與的生物通路和生物功能。菌株Bacillus sp. Z1、Bacillus sp. Z11 和Bacillus sp. Z20的基因主要參與碳水化合物、氨基酸、輔因子和維生素的新陳代謝、信號轉(zhuǎn)導、外源物質(zhì)的轉(zhuǎn)運等代謝通路。

        NR 數(shù)據(jù)庫對基因片段進行注釋時,發(fā)現(xiàn)菌株Z1的6~84 基因片段、Z11 的7~249 片段和Z20 的8~237片段均與來源于蘇云金芽孢桿菌(Bacillus thuringi?ensis)的GAD 具有87%的對比相似度,KEGG 對其功能注釋為具有催化活性的谷氨酸脫羧酶。三個谷氨酸脫羧酶的序列長度均為1 470 bp,編碼489 個氨基酸和1 個終止密碼子,理論分子量55 ku。使用SignalP-5.0 在線軟件進行分析其序列中不含信號肽片段。三條基因序列的相似性較高,gadz1 與gadz11的序列相似性為97.3%,具有58 個不同堿基;與gadz20 之間有103 個不同的堿基,序列相似性為94.5%;gadz11 和gadz20 之間具有106 個堿基的差別,序列相似性為94.5%。將上述3 個谷氨酸脫羧酶的序列信息分別提交至GeneBank 數(shù)據(jù)庫,注冊號分別為:MW 703457、MW 703456和MW 703455。

        3 討論

        γ-氨基丁酸在多個行業(yè)都具有重要的應用價值。相較于反應條件苛刻、能耗高、副產(chǎn)物污染環(huán)境的化學生產(chǎn)方式,以及受限于植物生長周期長、效率低等弊端的植物富集提取,利用微生物發(fā)酵生產(chǎn)GABA 更具有開發(fā)的優(yōu)勢。依靠微生物體內(nèi)的谷氨酸脫羧酶將L-Glu 脫羧轉(zhuǎn)化生成GABA,該方法反應條件更溫和,且微生物生長傳代迅速[18-20]。根據(jù)不同工業(yè)的應用需求,會有不同的菌株應用于生產(chǎn),比如產(chǎn)GABA 的乳酸菌和米曲霉可以分別應用于乳制品和酒品中以增加產(chǎn)品中GABA的含量,使產(chǎn)品更具有保健價值[21-23]。

        GAD為胞內(nèi)酶,其活性的檢測通常需要經(jīng)過細胞收集破碎、粗酶液提取、酶反應、底物減少或產(chǎn)物增加等繁瑣的步驟,因此,建立快捷準確的GAD活性檢測方法具有重要意義。目前對微生物氨基酸脫羧酶的鑒定中,通常是在培養(yǎng)基中添加溴甲酚紫、甲基紅和相應氨基酸,氨基酸脫羧后根據(jù)體系pH會發(fā)生變化,根據(jù)培養(yǎng)基顏色是否變綠可以進行判斷[16]。楊勝遠等[24]建立了一種pH指示劑法用于快速篩選GAD活性的基因,并且與紙層析法和LC/MS 檢測到的結(jié)果相似。本研究中,利用GAD 脫羧反應前后的pH 變化,通過酸堿指示劑從土壤中篩選出產(chǎn)GABA 的疑似菌株,并用HPLC 的方法對初篩的結(jié)果進行了驗證。HPLC檢測GABA具有靈敏度高、準確性大的優(yōu)點,本研究中選擇DABS-Cl作為衍生試劑,獲得的GABA衍生物性質(zhì)穩(wěn)定,在436 nm處有明顯的紫外吸收峰,且出峰時間短,有利于后續(xù)試驗的進行。

        本研究通過菌落形態(tài)鑒定和16S rDNA 序列比對,將3 株篩選到的產(chǎn)GABA 的菌株鑒定為芽孢桿菌屬。并通過基因組測序分析,獲得了編碼GAD 的基因序列。雖然芽孢桿菌作為一種新型的具有潛在藥用價值化合物的產(chǎn)生菌,自1971 年便首次報道可以產(chǎn)GABA,但實際上利用芽孢桿菌進行生物轉(zhuǎn)化生產(chǎn)GABA并沒有突出優(yōu)勢,性質(zhì)最具突出性的GAD多是來源于或異源表達于大腸桿菌[25-27]。因此,本研究中獲得的GAD編碼序列能否在大腸桿菌中進行異源表達,并實現(xiàn)后續(xù)GABA 的高效生物轉(zhuǎn)化,需要進一步的研究。

        4 結(jié)論

        本研究從寧夏沙漠土壤樣品中,篩選到了3株產(chǎn)GABA的菌株,經(jīng)過菌落形態(tài)鑒定和16S rDNA序列比對分析鑒定菌株Z1、Z11和Z20均為芽孢桿菌屬,并命名 為Bacillus sp. Z1、Bacillus sp. Z11 和Bacillus sp.Z20,保藏于中國農(nóng)業(yè)微生物菌種保存中心,保藏號分別為ACCC 61750、61747 和61748。針對3 株菌的全基因組進行測序發(fā)現(xiàn),每株菌含有1個谷氨酸脫羧酶基因,豐富了谷氨酸脫羧酶的基因資源,為構(gòu)建高效生物轉(zhuǎn)化γ-氨基丁酸GABA工程菌提供了有效素材。

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