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        SPP1在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)差異及機(jī)制研究

        2021-10-29 06:18:40張丹丹徐健
        臨床肺科雜志 2021年11期
        關(guān)鍵詞:腺癌肺癌數(shù)據(jù)庫

        張丹丹 徐健

        肺癌為一種呼吸系統(tǒng)常見惡性腫瘤,肺癌在全球癌癥發(fā)病率和死亡率中排名第一[1]。肺癌可分為:小細(xì)胞肺癌(SCLC)和非小細(xì)胞肺癌(NSCLC),其中NSCLC占肺癌的80%~85%,主要病理類型為肺腺癌和肺鱗癌[2]。盡管在過去30年中肺癌治療和生存方面取得了進(jìn)展,但肺癌患者生存狀況的改善相對(duì)較小,促使人們對(duì)肺癌治療的新模式進(jìn)行了研究。目前基因靶向治療及免疫治療取得了一定進(jìn)展,但早期診斷和治療對(duì)于肺癌非常重要。因此有必要探索新的治療靶點(diǎn),更能有效改善患者預(yù)后。

        分泌磷蛋白1(SPP1)又稱骨橋蛋白,研究發(fā)現(xiàn),SPP1基因參與消化系統(tǒng)腫瘤發(fā)生及轉(zhuǎn)移[3-4],其高表達(dá)與腫瘤的發(fā)生發(fā)展明顯相關(guān)[5]。有關(guān)SPP1在NSCLC中的表達(dá)以及預(yù)后研究較少,我們擬通過一系列在線數(shù)據(jù)庫,分析SPP1在NSCLC中的作用,探索其內(nèi)在機(jī)制。

        資料和方法

        一、SPP1表達(dá)水平分析

        首先通過Oncomine數(shù)據(jù)庫分析SPP1在不同類別腫瘤中表達(dá)水平,P-value=1E-4,F(xiàn)old change=2。其次,通過GEPIA和Ualcan數(shù)據(jù)庫了解SPP1在NSCLC表達(dá)情況。

        二、SPP1蛋白-蛋白網(wǎng)絡(luò)分析

        通過STRING數(shù)據(jù)庫查找NSCLC中與SPP1表達(dá)關(guān)聯(lián)的蛋白,采用蛋白-蛋白相互作用進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)分析。

        三、通過WebGestalt數(shù)據(jù)庫對(duì)與SPP1相互作用的基因進(jìn)行功能富集分析和KEGG信號(hào)通路分析。

        四、生存分析

        通過Kaplan-Meier plotter分析SPP1基因分別在高表達(dá)和低表達(dá)NSCLC患者中生存情況,以總生存期(Overall Survival,OS)、首次進(jìn)展生存期(First Progression ,F(xiàn)P)為生存分析的指標(biāo)。

        五、免疫浸潤(rùn)分析

        六、統(tǒng)計(jì)分析

        差異表達(dá)、蛋白網(wǎng)絡(luò)等采用在線軟件分析。生存數(shù)據(jù)采用log-rank檢驗(yàn),P<0.05為有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。

        結(jié) 果

        一、SPP1基因表達(dá)

        在Oncomine數(shù)據(jù)庫中,SPP1在大多數(shù)腫瘤中存在高表達(dá)。在GEPIA和Ualcan數(shù)據(jù)庫中,SPP1在肺腺癌和肺鱗癌中表達(dá)也是明顯升高的(圖1)。

        二、SPP1 蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)

        通過STRING在線工具進(jìn)行PPI網(wǎng)絡(luò)分析,找到50個(gè)與SPP1相互作用的蛋白(AFP、AHSG、ALB、AMBN、AMELX、AMTN、APOA1、APOE、BGLAP、BMP4、C3、CD44、CDH2、CP、CSF1、CST3、CYR61、DMP1、ENAM、FAM20A、FAM20C、FBN1、FGF23、FN1、GOLM1、GPC3、IBSP、IGFBP1、IGFBP3、IGFBP5、IGFBP7、IL6、ITGA5、ITGA9、ITGAV、ITGB1、ITGB3、ITGB5、MEPE、MFGE8、MMP3、MMP7、MSLN、PDGFB、RHOA、RUNX2、RUNX3、SPARCL1、TIMP1、VCAN)(圖2)。

        三、富集分析和KEGG分析

        對(duì)與SPP1相互作用的基因進(jìn)行富集分析和KEGG分析結(jié)果顯示,在biological process前三的分別為metabolic process,biological regulation,multicellular organism process在 cellular component前三位的分別為endomembrane system,endoplascmic reticulum,extracellular space。在molecular function方面,protein binding,ion binding,enzyme regulator activity。KEGG分析提示:ECM-receptor interaction,F(xiàn)ocal adhesion,PI3K-Akt signaling pathway排名前三位(圖3)。

        四、生存分析

        在肺腺癌中,SPP1低表達(dá)組患者OS和FP明顯高于高表達(dá)組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P均<0.05)。在肺鱗癌患者中,SPP1高表達(dá)組患者OS低于低表達(dá)組 (P<0.05 )(圖4)。

        五、免疫浸潤(rùn)分析

        討 論

        分泌磷酸蛋白1 (SPP1),又稱骨橋蛋白(OPN),是一種母細(xì)胞蛋白,它是一種磷酸化的富含唾液酸的非膠原骨基質(zhì)蛋白,屬于整合素小結(jié)合N糖蛋白(SIBLING)家族。SPP1蛋白由SPP1基因編碼,該基因位于人類4號(hào)染色體(4q21 4q25)上,由7個(gè)具有高度保守啟動(dòng)子的外顯子組成[6]。大量研究表明,腫瘤中SPP1的表達(dá)與預(yù)后差和總生存期短有關(guān)。它在腫瘤的侵襲、遷移、血管生成、炎癥和轉(zhuǎn)移等過程中,發(fā)揮重要作用[7]。惡性細(xì)胞中調(diào)控SPP1表達(dá)的確切分子機(jī)制尚不清楚。已有研究表明,SPP1通過細(xì)胞ECM(細(xì)胞外基質(zhì))的相互作用以及通過與整合素和CD44結(jié)合來調(diào)節(jié)信號(hào)通路來促進(jìn)腫瘤發(fā)生[5]。

        越來越多研究發(fā)現(xiàn),SPP1在腫瘤和正常組織中表達(dá)存在差異,在多種腫瘤中表達(dá)上調(diào),并且和臨床病理及預(yù)后相關(guān)。Xu等人的研究發(fā)現(xiàn),結(jié)腸癌中SPP1表達(dá)顯著上調(diào),SPP1通過激活EMT促進(jìn)結(jié)腸癌的轉(zhuǎn)移,可能成為結(jié)腸癌患者潛在的治療靶點(diǎn)[8]。Choe等人研究發(fā)現(xiàn),結(jié)腸癌中SPP1表達(dá)是上調(diào)的,SPP1的上調(diào)與結(jié)腸癌生存率下降相關(guān)[9]。Chen等人研究表明,SPP1過表達(dá)與低級(jí)別膠質(zhì)瘤患者較差的總生存率相關(guān)[10]。此外,SPP1被認(rèn)為是低級(jí)別膠質(zhì)瘤的獨(dú)立因素。Liang的研究發(fā)現(xiàn)SPP1與乳腺癌的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)相關(guān),提示調(diào)控SPP1的表達(dá),促進(jìn)BRC的發(fā)生發(fā)展[11]。G?thlin Eremo等人研究發(fā)現(xiàn),SPP1 mRNA是乳腺癌強(qiáng)有力的預(yù)后標(biāo)志物[12]。而SPP1在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)研究較少,我們通過多個(gè)數(shù)據(jù)庫分析SPP1在肺癌中的表達(dá)差異以及SPP1在非小細(xì)胞肺癌中發(fā)生發(fā)展中的內(nèi)在機(jī)制,以期對(duì)非小細(xì)胞肺癌的臨床診治提供新的生物靶點(diǎn)。

        我們研究中發(fā)現(xiàn),在Oncomine數(shù)據(jù)庫中SPP1在膀胱癌、腦及中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤、乳腺癌、子宮內(nèi)膜癌、結(jié)腸癌、食管癌、胃癌、頭頸部癌、腎癌、白血病、肝癌、肺癌、淋巴瘤、黑色素瘤、骨髓瘤、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌、肉瘤中表達(dá)升高。SPP1可能參與多種腫瘤的發(fā)生。通過對(duì)GEPIA和Ualcan數(shù)據(jù)庫的分析,我們發(fā)現(xiàn)SPP1在肺腺癌和肺鱗癌表達(dá)明顯增高,表明SPP1在可能參與非小細(xì)胞肺癌的調(diào)控。對(duì)SPP1進(jìn)行蛋白-蛋白互作分析,我們發(fā)現(xiàn)SPP1與AFP、AHSG、ALB等50種蛋白存在相互作用。為了研究其作用通路,我們對(duì)上述50種蛋白和SPP1進(jìn)行功能富集分析和KEGG分析,我們發(fā)現(xiàn),其主要富集在多種生物過程和代謝調(diào)節(jié),也是符合SPP1在腫瘤中的發(fā)生、發(fā)展中的機(jī)制。生存分析發(fā)現(xiàn),肺腺癌和肺鱗癌中SPP1低表達(dá)患者,OS均增加,預(yù)后較好。因此,SPP1不僅是非小細(xì)胞肺癌發(fā)生的標(biāo)志物,而且也是預(yù)后重要的標(biāo)志物。Tu 等人研究也發(fā)現(xiàn),SPP1在多種腫瘤中表達(dá)升高,也與多種腫瘤預(yù)后相關(guān)[13]。Yang等人對(duì)肺腺癌的基因表達(dá)數(shù)據(jù)集分析發(fā)現(xiàn),SPP1和其共表達(dá)的1個(gè)基因可作為肺腺癌的診斷、治療靶點(diǎn)和預(yù)后指標(biāo)[14]。為了進(jìn)一步研究SPP1在非小細(xì)胞肺癌中的相關(guān)機(jī)制,我們分析了SPP1與腫瘤免疫細(xì)胞浸潤(rùn)的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)SPP1與多種腫瘤免疫細(xì)胞浸潤(rùn)正相關(guān),SPP1影響非小細(xì)胞肺癌患者預(yù)后,可能與SPP1介導(dǎo)的腫瘤免疫細(xì)胞浸潤(rùn)有關(guān)。最后我們通過非小細(xì)胞肺癌的腫瘤免疫浸潤(rùn)細(xì)胞的COX回歸生存分析,也證實(shí)B cell,Dendritic cell和SPP1高表達(dá)與肺腺癌患者生存率下降有關(guān)。Liu等人研究也證實(shí),SPP1在肺癌組織和細(xì)胞系中高表達(dá)。SPP1高表達(dá)可通過抑制肺癌細(xì)胞自噬和凋亡,顯著促進(jìn)肺癌細(xì)胞的生長(zhǎng)[15]。因此SPP1可能是非小細(xì)胞肺癌重要的生物標(biāo)志物,有望成為新的治療靶點(diǎn),但還需要分子生物實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證。

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