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        基于激光散射技術(shù)的血流感染革蘭陽(yáng)性球菌快速檢測(cè)的準(zhǔn)確性分析

        2021-10-27 08:07:16丁毅偉孫希萌
        轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)雜志 2021年5期
        關(guān)鍵詞:錯(cuò)誤率革蘭球菌

        丁毅偉,孫希萌

        血流感染是住院患者發(fā)病和死亡的主要原因[1-2],血流感染患者的生存率與最初給予適當(dāng)?shù)目咕幬镞M(jìn)行經(jīng)驗(yàn)性治療相關(guān)。因此,快速鑒定病原菌尤為重要[3]。有研究表明,接受充分實(shí)證治療的厭氧菌血流感染患者的死亡率顯著低于未接受充分實(shí)證治療的患者[4]。因此,在獲得藥敏試驗(yàn)結(jié)果之前,更早和準(zhǔn)確的病原菌鑒定對(duì)于選擇合適的抗菌藥物非常重要[5]。許多直接從陽(yáng)性血培養(yǎng)樣本中鑒定病原菌的方法表現(xiàn)出了不同的性能[6-8]。

        本研究中HB&L 微生物培養(yǎng)儀國(guó)內(nèi)剛通過(guò)認(rèn)證并且在臨床論證階段,目前僅應(yīng)用于尿液和體液的快速培養(yǎng),可以短時(shí)間內(nèi)診斷樣本陰性或陽(yáng)性。其采用Alifax 專利激光散射技術(shù),原理是將激光作為光源,以檢測(cè)散射光強(qiáng)度、頻移及其角度依賴等而得到粒子的相關(guān)信息。在本研究中基于激光散射技術(shù)用來(lái)監(jiān)測(cè)培養(yǎng)瓶中病原菌的生長(zhǎng),散射信號(hào)被計(jì)算和轉(zhuǎn)化為生長(zhǎng)曲線,實(shí)時(shí)推算培養(yǎng)瓶中的細(xì)菌濃度,當(dāng)達(dá)到預(yù)設(shè)濃度后機(jī)器報(bào)警提示,這個(gè)過(guò)程僅需1~3 h,而傳統(tǒng)的血培養(yǎng)陽(yáng)性樣本平板繼代培養(yǎng)時(shí)間為24 h,大大縮短其時(shí)間,獲得的陽(yáng)性菌液直接離心取沉淀,分別用基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,MALDI?TOF MS)直接鑒定,同時(shí)聯(lián)合VITEK 2 Compact微生物儀直接藥敏試驗(yàn)(簡(jiǎn)稱快速直接法),并以常規(guī)方法為參考,對(duì)快速直接法用于血培養(yǎng)陽(yáng)性樣本革蘭陽(yáng)性球菌鑒定以及藥敏的準(zhǔn)確性進(jìn)行分析。

        1 材料與方法

        1.1 標(biāo)本及其來(lái)源 收集解放軍總醫(yī)院第六醫(yī)學(xué)中心門(mén)診及住院患者141 份革蘭陽(yáng)性球菌血培養(yǎng)陽(yáng)性樣本。本研究經(jīng)中國(guó)人民解放軍總醫(yī)院第六醫(yī)學(xué)中心倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(201917100)。

        1.2 儀器與試劑 Alifax HB&L微生物培養(yǎng)儀(意大利Alifax公司),Bruker MALDI?TOF 質(zhì)譜儀(德國(guó)布魯克公司);全自動(dòng)微生物鑒定和藥敏系統(tǒng)VITEK 2 Compac(t法國(guó)梅里埃公司);血瓊脂培養(yǎng)基、麥康凱瓊脂培養(yǎng)基(鄭州安圖生物工程股份有限公司)。

        1.3 方法

        1.3.1 快速直接法 收集141 例革蘭陽(yáng)性球菌血培養(yǎng)陽(yáng)性樣本,從血培養(yǎng)瓶中取10μL 陽(yáng)性菌液轉(zhuǎn)種于 2 mL 的 HB&L 培養(yǎng)液瓶中,HB&L 微生物培養(yǎng)儀設(shè)定1.5麥?zhǔn)蠞舛葓?bào)警,當(dāng)儀器達(dá)到1.5麥?zhǔn)蠞舛葓?bào)警后,無(wú)菌取出陽(yáng)性培養(yǎng)液,分別置于2 個(gè)1.5 mL的無(wú)菌 EP 管約 1 mL,均 13 000 r/min 離心 2 min 制備沉淀物。2 份沉淀物分別進(jìn)行如下操作:1 份沉淀物MALDI?TOF 質(zhì)譜儀直接細(xì)菌鑒定,操作步驟見(jiàn) 1.3.3;另 1 份沉淀物 VITEK 2 Compact 儀器直接藥敏試驗(yàn),操作步驟見(jiàn)1.3.4。

        1.3.2 常規(guī)方法 以上收集的141例血培養(yǎng)陽(yáng)性樣本同時(shí)接種于血瓊脂平板培養(yǎng)基、麥康凱瓊脂培養(yǎng)基,35 ℃,5%CO2中培養(yǎng)24 h,待分離培養(yǎng)出單個(gè)菌落按照1.3.3和1.3.4進(jìn)行革蘭陽(yáng)性球菌的鑒定和藥敏試驗(yàn)。

        1.3.3 MALDI?TOF 質(zhì)譜儀鑒定 將快速直接法的沉淀物吸取1μL涂抹于MALDI?TOF靶板上,常規(guī)方法挑取單個(gè)菌落均勻涂抹在MALDI?TOF靶板上,待上述2份樣本晾干后,在干燥的菌液上加入1μL 甲酸晾干后,再加入IVD HCCA 基質(zhì)溶液1μL,晾干后上機(jī)檢測(cè),每一步試劑均仔細(xì)滴加覆蓋在每個(gè)樣本上。

        1.3.4 VITEK 2 Compact 藥敏操作 將快速直接法的沉淀物吸取適量加入VITEK 2 Compact配套鹽水中,常規(guī)方法是用無(wú)菌拭子挑取單個(gè)菌落放入VITEK 2 Compact 配套鹽水中,以上分別調(diào)至0.5~0.63麥?zhǔn)蠞舛龋缓蟀凑諛?biāo)準(zhǔn)操作進(jìn)行上機(jī)檢測(cè)。

        1.4 鑒定和藥敏試驗(yàn)判讀標(biāo)準(zhǔn)

        1.4.1 鑒定結(jié)果 依據(jù)MALDI?TOF 標(biāo)準(zhǔn):細(xì)菌鑒定分值大于等于2.000分,表示能有效鑒定至種;分值1.990~1.700 分之間,表示能有效鑒定至屬;分值低于1.700分,表示鑒定結(jié)果不可靠。

        1.4.2 藥敏結(jié)果 VITEK 2 Compact 儀器藥敏結(jié)果參照CLSI M100?S29 文件標(biāo)準(zhǔn)報(bào)告為敏感(susceptible, S)、中介(intermediate, I)、耐藥(resistant,R);快速直接方法與常規(guī)方法藥敏比較參照美國(guó)CLSI M23 ? A2 文 件[9]:分 類(lèi) 一 致 性(categorical agreement, CA)指快速直接法與常規(guī)方法的符合率;一般錯(cuò)誤(minor errors,MIE)指參考方法的結(jié)果為R 或S,實(shí)驗(yàn)方法為I,或者參考方法的結(jié)果是I,實(shí)驗(yàn)方法為S 或R;嚴(yán)重錯(cuò)誤(major errors,ME)指參考方法的結(jié)果為S,實(shí)驗(yàn)方法為R;極嚴(yán)重錯(cuò)誤(very major errors,VME)指參考方法的結(jié)果是R,實(shí)驗(yàn)方法為S;它們可接受的誤差范圍分別為CA ≥90%,MIE ≤ 10%,ME ≤ 3%,VME ≤ 1.5%。

        l.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 應(yīng)用SPSS 25.0軟件,率的比較采用χ2檢驗(yàn),P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 快速直接法鑒定率分析 快速直接法對(duì)革蘭陽(yáng)性球菌的鑒定率為93.6%,其中不同菌屬鑒定率分別為葡萄球菌屬91.8%,腸球菌屬94.1%,鏈球菌屬100.0%,其中金黃色葡萄球菌、佩滕科夫葡萄球菌、路登葡萄球菌、里昂葡萄球菌、屎腸球菌、鏈球菌屬鑒定率為100.0%??焖僦苯臃ㄨb定率與常規(guī)方法(>1.700)比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),表1。

        表1 快速直接法革蘭陽(yáng)性球菌鑒定率分析

        2.2 快速直接法對(duì)葡萄球菌藥敏CA 和錯(cuò)誤率分析 收集的141 例血培養(yǎng)革蘭陽(yáng)性球菌陽(yáng)性樣本,葡萄球菌屬85 株,占60.3%(85/141),其中金黃色葡萄球菌16 株,占18.8%(16/85),凝固酶陰性葡萄球菌69 株,占81.2%(69/85)。金黃色葡萄球菌CA 為100.0%,無(wú)錯(cuò)誤率;凝固酶陰性葡萄球菌藥敏CA均為90.0%以上,在環(huán)丙沙星、莫西沙星、利福平分別出現(xiàn)1例MIE(1.5%),均是3株表皮葡萄球菌;氯林霉素、四環(huán)素和紅霉素各出現(xiàn)1 例ME(1.5%),分別是1 株人葡萄球菌和2 株頭狀葡萄球菌,復(fù)方新諾明出現(xiàn)2 例ME(2.9%),分別是1 株人葡萄球菌和1 株溶血葡萄球菌;氯林霉素和復(fù)方新諾明各出現(xiàn)1例VME(1.5%),均是人葡萄球菌,表2。

        表2 快速直接法對(duì)葡萄球菌藥敏的CA和錯(cuò)誤率分析

        2.3 快速直接法對(duì)腸球菌藥敏CA 和錯(cuò)誤率分析34例血培養(yǎng)腸球菌陽(yáng)性樣本中,屎腸球菌20株,占58.8%(20/34),糞腸球菌14株,占41.2%(14/34)。腸球菌藥敏CA 均為90.0%以上,在ME 和VME 無(wú)錯(cuò)誤率;在MIE 中屎腸球菌在紅霉素、呋喃妥因分別出現(xiàn)1 例錯(cuò)誤,分別為5.0%;糞腸球菌MIE 在呋喃妥因出現(xiàn)1例錯(cuò)誤,為7.1%,表3。

        表3 快速直接法對(duì)腸球菌藥敏CA和錯(cuò)誤率分析

        2.4 快速直接法對(duì)鏈球菌藥敏CA 和錯(cuò)誤率分析血培養(yǎng)陽(yáng)性樣本分離出的12 例無(wú)乳鏈球菌,CA 為91.7%,僅在替加環(huán)素出現(xiàn)1 例MIE 錯(cuò)誤,占8.3%,錯(cuò)誤為常規(guī)方法I,快速方法R,未出現(xiàn)ME 和VEM錯(cuò)誤,表4。

        表4 快速直接檢測(cè)法對(duì)無(wú)乳球菌藥敏CA和錯(cuò)誤率分析

        2.5 快速直接法對(duì)頭孢西丁和誘導(dǎo)克林霉素耐藥分析 在85株葡萄球菌中,兩種方法共檢測(cè)到頭孢西丁67株陽(yáng)性,16株為陰性,陰性一致率為100.0%(16/16),陽(yáng)性一致率為97.1%(67/69),總體一致率為97.6%(83/85),常規(guī)方法有2株檢測(cè)為陽(yáng)性,但快速直接法為陰性。兩種方法誘導(dǎo)克林霉素耐藥32株陽(yáng)性,47株陰性,陰性一致率為92.2%(47/51),陽(yáng)性一致率為94.1%(32/34),總體一致率為92.9%(79/85)。

        3 討論

        血流感染是臨床由病原菌侵入的一種嚴(yán)重感染癥狀,易引起高發(fā)病率和死亡率[10-12],其中革蘭陽(yáng)性球菌引起的感染為27.9%,金黃色葡萄球菌、凝固酶陰性葡萄球菌居主要分離病原菌的前5 位,對(duì)患者健康有一定影響[13]。血培養(yǎng)快速準(zhǔn)確的病原體鑒定和藥敏對(duì)膿毒癥患者非常重要,可大幅度降低膿毒癥的死亡率[10-12]。目前,血液中的病原菌是先培養(yǎng)后鑒定,陽(yáng)性血培養(yǎng)中微生物鑒定的周期約為24~48 h,在此期間患者接受經(jīng)驗(yàn)性抗菌藥物治療或不接受治療的時(shí)間較長(zhǎng)。近年來(lái),MALDI?TOF MS 已成為一種快速可靠的技術(shù),可直接從陽(yáng)性血培養(yǎng)物中快速鑒定病原菌,鑒定時(shí)間能夠縮短到10 h[14-21],如果直接從血培養(yǎng)物中鑒定容易受到血細(xì)胞影響,從而降低準(zhǔn)確性。同時(shí)藥敏結(jié)果也不能立即獲得,導(dǎo)致患者接受廣譜抗菌藥物治療而不是靶向治療。有研究表明,靶向治療可以縮短患者住院時(shí)間,降低死亡率[22-23]。

        基于激光散射技術(shù)的Alifax HB&L 微生物培養(yǎng)儀,使血培養(yǎng)陽(yáng)性樣本培養(yǎng)時(shí)間縮短至2~3 h,本研究中快速直接法鑒定革蘭陽(yáng)性球菌的鑒定率為93.6%,與常規(guī)方法一致但高于血清分離膠促凝管法82.3%[24],不同菌屬鑒定率分別為葡萄球菌屬91.8%,腸球菌屬94.1%,鏈球菌屬100%,其中金黃色葡萄球菌、佩滕科夫葡萄球菌、里昂葡萄球菌、路登葡萄球菌、屎腸球菌、鏈球菌屬鑒定率為100%。表皮葡萄球菌、頭狀葡萄球菌、溶血葡萄球菌和糞腸球菌快速直接法鑒定率低,其原因可能由于MALDI?TOF MS 技術(shù)是檢測(cè)菌體獲得蛋白質(zhì)圖譜,但革蘭陽(yáng)性菌細(xì)胞壁較厚,獲得的病原菌樣本蛋白質(zhì)圖譜與數(shù)據(jù)庫(kù)中圖譜存在差異,因此鑒定分值不高[25]。另有翟鑫[26]等用 MALDI?TOF MS 質(zhì)譜鑒定與核酸擴(kuò)增的基因進(jìn)行對(duì)比,結(jié)果對(duì)凝固酶陰性葡萄鑒定符合率為100%。85株革蘭陽(yáng)性球菌快速直接法雖然有9株鑒定分值<1.700,但菌名鑒定均正確??焖僦苯臃ㄔ诳s短血培養(yǎng)陽(yáng)性樣本培養(yǎng)時(shí)間的基礎(chǔ)上,與常規(guī)方法在鑒定上具有較高的一致率,能夠?yàn)榕R床快速確定患者血培養(yǎng)中為何種病原體感染提高臨床準(zhǔn)確判斷,有方向性針對(duì)用藥。

        臨床革蘭陽(yáng)性球菌引起的血流感染主要是金黃色葡萄球菌[27],快速直接法檢測(cè)葡萄球菌藥敏顯示,金黃色葡萄球菌CA 為100%,并且無(wú)任何錯(cuò)誤率;凝固酶陰性葡萄球菌常為血培養(yǎng)的污染菌,但其也可引起導(dǎo)管相關(guān)性血流感染和感染性心內(nèi)膜炎[28],凝固酶陰性葡萄球菌CA 均為90.0%以上。在人葡萄球菌、溶血葡萄球菌、頭葡萄球菌檢測(cè)氯林霉素、復(fù)方新諾明和紅霉素時(shí)均出現(xiàn)ME 和VME,雖然出現(xiàn)的錯(cuò)誤率較高,但是在標(biāo)準(zhǔn)范圍內(nèi),下一步應(yīng)該加大菌株和藥物的實(shí)驗(yàn)進(jìn)行分析。本研究中腸球菌無(wú)ME 和VME,腸球菌的血流感染以屎腸球菌為主[13],屎腸球菌在紅霉素和呋喃妥因各1例MIE,糞腸球菌在呋喃妥因1例MIE。無(wú)乳鏈球菌替加環(huán)素1例MIE。頭孢西丁和誘導(dǎo)克林霉素耐藥的檢測(cè)準(zhǔn)確性,影響臨床對(duì)葡萄球菌的用藥療效,檢測(cè)顯示頭孢西丁陰性和陽(yáng)性一致率分別為100%和97.1%,誘導(dǎo)克林霉素耐藥陰性和陽(yáng)性一致率分別為92.2%和94.1%。

        快速直接法與常規(guī)方法比較,能夠達(dá)到很好的鑒定率和藥敏分類(lèi)一致性,由于其準(zhǔn)確性高,總報(bào)告時(shí)間大大縮短,將有助于臨床快速直接鑒定血培養(yǎng)陽(yáng)性樣本革蘭陽(yáng)性球菌,指導(dǎo)用藥,提高患者生存率。

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