汪園園,柯 璟,劉 希,李曉鋒,常紅云,楊 喆,張冠軍
乳腺癌是影響女性身心健康的常見惡性腫瘤之一。我國女性乳腺癌的發(fā)病率居于女性惡性腫瘤的首位,2015年我國乳腺癌新發(fā)病例約30.4萬例,占女性惡性腫瘤發(fā)病的17.10%[1]。環(huán)狀RNA是一種新型非編碼RNA,近期研究表明,環(huán)狀RNA在多種腫瘤中異常表達(dá),如肝癌、胃癌、結(jié)直腸癌,且與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及患者的預(yù)后有關(guān)[2-3]。在乳腺癌中,環(huán)狀RNA也具有重要作用[4]。本實驗主要通過qRT-PCR法檢測環(huán)狀RNA circ_0030777在乳腺癌中的表達(dá),探討其臨床意義及其作為腫瘤分子標(biāo)志物的診斷價值。
1.1 材料
1.1.1組織標(biāo)本 收集2014年6月~2015年12月西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院存檔的手術(shù)標(biāo)本,包含124例乳腺癌、4例癌旁正常乳腺組織及38例良性病變?nèi)橄俳M織。納入標(biāo)準(zhǔn):所有患者均為女性,年齡18~80歲,術(shù)前均未行放、化療及新輔助治療。124例乳腺癌患者年齡35~80歲,平均52歲。其中非特殊型浸潤性癌Ⅱ級19例,非特殊型浸潤性癌Ⅲ級88例,浸潤性小葉癌3例,篩狀癌1例,黏液癌3例,浸潤性微小乳頭狀癌4例,伴髓樣特征的癌6例。38例乳腺良性病變患者年齡16~60歲,平均34.58歲,均為乳腺纖維腺瘤。所有患者均簽署知情同意書,手術(shù)后標(biāo)本立即放入液氮中保存,標(biāo)本經(jīng)過兩位病理醫(yī)師進(jìn)行診斷。
1.1.2 主要試劑鼠抗人ER單克隆抗體、鼠抗人PR單克隆抗體和鼠抗人Ki-67單克隆抗體均購自福州邁新公司,鼠抗人HER-2單克隆抗體購自羅氏公司,GLP HER2/CSP17探針試劑盒購自廣州安必平醫(yī)藥公司,RNA提取試劑TRIzol和qRT-PCR試劑盒SYBR均購自Invitrogen公司,逆轉(zhuǎn)錄試劑盒購自TaKaRa公司,PCR試劑盒購自康為世紀(jì)公司。
1.2 方法
1.2.1HE和免疫組化染色 所有標(biāo)本均經(jīng)10%中性福爾馬林固定,石蠟包埋,HE染色。切取典型病變組織(3 μm厚),根據(jù)說明書進(jìn)行采用Ventana(Roche公司)全自動免疫組化染色儀進(jìn)行EnVision兩步法染色。ER和PR結(jié)果判讀標(biāo)準(zhǔn):計數(shù)100個以上的腫瘤細(xì)胞,≥1%的腫瘤細(xì)胞核陽性判讀為陽性,﹤1%則判讀為陰性[5]。HER-2結(jié)果判讀依據(jù)乳腺癌HER2檢測指南(2019版)[6]。Ki-67增殖指數(shù)為腫瘤細(xì)胞中陽性細(xì)胞所占百分比。
1.2.2FISH 使用HER-2雙色探針對免疫組化HER-2 2+的乳腺癌組織進(jìn)行FISH檢測,操作步驟根據(jù)試劑盒說明書進(jìn)行:石蠟切片3 μm厚,60 ℃烤片2 h,二甲苯脫蠟,乙醇去二甲苯,95 ℃蒸餾水煮片20 min,室溫晾干,37 ℃蛋白酶消化10 min,SSC緩沖液洗滌10 min,梯度乙醇脫水,室溫晾干,后續(xù)實驗步驟均避光操作,滴加HER-2探針,橡膠水泥封固,雜交儀過夜(85 ℃ 5 min;37 ℃過夜)。次日,洗滌切片,滴加DAPI復(fù)染液至組織上,分析熒光信號。HER-2 FISH判讀依據(jù)乳腺癌HER2檢測指南(2019版)[6]。
1.2.3qRT-PCR 采用TRIzol提取組織中的RNA,逆轉(zhuǎn)錄試劑盒將總RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,進(jìn)行PCR。環(huán)狀RNA circ_0030777上游引物:5′-TGACAGACAATAAGGGCGAAG-3′,下游引物:5′-TCGAGAAGCAGGTGGAAACAT-3′;內(nèi)參GAPDH上游引物:5′-GTCAGCCGCATCTTCTTTTG-3′,下游引物:5′-GCGCCCAATACGA CCAAATC-3′。使用普通PCR試劑盒進(jìn)行PCR,反應(yīng)條件:94 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,56 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,41個循環(huán);72 ℃ 5 min;4 ℃下保存。產(chǎn)物跑膠后,送華大基因公司測序;使用SYBR進(jìn)行qRT-PCR檢測,反應(yīng)條件:50 ℃ 2 min;95 ℃ 2 min;95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min,41個循環(huán)。使用2-ΔΔCt法計算mRNA表達(dá)水平。
1.3 統(tǒng)計學(xué)方法實驗數(shù)據(jù)采用兩獨立樣本的秩和檢驗(Wilcoxon rank test)與χ2檢驗,相關(guān)性分析采用Spearman相關(guān)性分析,應(yīng)用GraphPad Prism 5.0軟件繪圖。雙側(cè)P<0.05時認(rèn)為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 乳腺癌組織中環(huán)狀RNA circ_0030777的表達(dá)根據(jù)HE染色,確定標(biāo)本組織病變類型,分別為乳腺癌、癌旁正常乳腺組織及良性病變?nèi)橄俳M織(圖1)。采用環(huán)狀RNA芯片篩選技術(shù)抽取4例乳腺癌及對應(yīng)癌旁乳腺組織,篩選出在乳腺癌中特異性低表達(dá)的環(huán)狀RNA circ_0030777,作為后續(xù)實驗靶標(biāo)。環(huán)狀RNA circ_0030777在乳腺癌與癌旁組織中表達(dá)量相差56倍(P=0.001)。
本組采用PCR對芯片結(jié)果進(jìn)行進(jìn)一步驗證,測序結(jié)果顯示擴(kuò)增的序列跨越目標(biāo)基因反向剪接序列(圖2),與目標(biāo)基因的序列相符。qRT-PCR結(jié)果顯示,環(huán)狀RNA circ_0030777在124例乳腺癌組織中的表達(dá)低于38例乳腺良性病變組織(P<0.001,圖3),符合芯片表達(dá)結(jié)果。
圖2 環(huán)狀RNA circ_0030777及GAPDH基因qRT-PCR的擴(kuò)增曲線、熔解曲線圖及測序后的環(huán)狀RNA拼接位點示意圖:A.擴(kuò)增曲線;B.熔解曲線,紅色線條為目標(biāo)基因,綠色線條為內(nèi)參基因;C.拼接位點示意圖
圖3 乳腺癌組織及良性病變組織中環(huán)狀RNA circ_0030777的表達(dá)差異
2.2 乳腺癌中環(huán)狀RNA circ_0030777表達(dá)與臨床病理特征的相關(guān)性以組織病理診斷為金標(biāo)準(zhǔn),區(qū)分乳腺癌組織和乳腺良性病變組織,用qPCR檢測環(huán)狀RNA circ_0030777表達(dá)水平所得數(shù)據(jù)制作ROC,得到ROC曲線下面積(area under curve,AUC)為0.866 7(95%CI:0.803 7~0.929 7),根據(jù)約登指數(shù),得到截點cut-off為9.598E-4,靈敏度Sen為0.580 6(95%CI:0.488 7~0.668 6),特異度Spe為0.973 7(95%CI:0.861 9~0.999 3),具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.000 1,圖4)。
圖4 環(huán)狀RNA circ_0030777診斷乳腺癌的ROC曲線
根據(jù)ROC將環(huán)狀RNA circ_0030777表達(dá)水平分成高表達(dá)組和低表達(dá)組,分析環(huán)狀RNA circ_0030777表達(dá)水平與乳腺癌臨床病理特征的關(guān)系。經(jīng)統(tǒng)計學(xué)分析發(fā)現(xiàn),環(huán)狀RNA circ_0030777表達(dá)與ER、PR和Ki-67表達(dá)水平(圖5)有關(guān)(P<0.05),而與患者年齡、腫瘤部位、組織學(xué)分型、HER-2狀態(tài)(圖5、6)、腫瘤大小、TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、分子分型及組織學(xué)分型等均無相關(guān)性(P>0.05)。進(jìn)一步Spearman相關(guān)性分析結(jié)果顯示,hsa_circ_0030777低表達(dá)率與ER表達(dá)狀態(tài)相關(guān)(r=0.243,P=0.046),ER陽性組hsa_circ_0030777低表達(dá)率低;PR陽性組hsa_circ_0030777低表達(dá)率低(r=0.187,P=0.007);Ki-67陽性組hsa_circ_0030777低表達(dá)率低(r=0.179,P=0.047,表1)。
圖5 乳腺癌中ER、PR、HER-2、Ki-67的表達(dá),EnVision兩步法:A.ER陰性;B.ER陽性;C.PR陰性;D.PR陽性;E.HER-2 0;F.HER-2 3+;G.Ki-67陰性;H.Ki-67陽性 圖6 乳腺癌免疫組化HER-2 2+行FISH法檢測:A. HER-2陰性;B. HER-2陽性
表1 環(huán)狀RNA circ_0030777表達(dá)與乳腺癌臨床病理特征的關(guān)系
乳腺癌是我國女性發(fā)病率最高的惡性腫瘤,盡管在診斷和治療方面取得了一定進(jìn)展,相對于其他腫瘤的5年生存率(82.0%)較高,但我國與發(fā)達(dá)國家比較還存在較大差距(90.9%)[1,7],其主要原因是臨床早期就診率低,以及晚期病例臨床診治不規(guī)范。因此,早期診斷和及時治療是提高乳腺癌患者生存率與生存質(zhì)量的關(guān)鍵[8]。
近年來,研究發(fā)現(xiàn)環(huán)狀RNA在乳腺癌中穩(wěn)定表達(dá),且越來越多的報道顯示環(huán)狀RNA在乳腺癌中異常表達(dá),并且發(fā)揮重要作用[4]。Lu等[9]對4例乳腺癌腫瘤組織和癌旁正常組織進(jìn)行環(huán)狀RNA微陣列檢測發(fā)現(xiàn),715個在乳腺癌中上調(diào),440個下調(diào)的環(huán)狀RNA。Wang等[10]通過RNA測序和芯片技術(shù)發(fā)現(xiàn)了480個在轉(zhuǎn)移性乳腺癌中較原位癌中有差異的環(huán)狀RNA,5 842個在MDA-MB-231和MCF-7乳腺細(xì)胞中表達(dá)差異的環(huán)狀RNA。CircSKA3高表達(dá)通過侵襲偽足的形成,促使體內(nèi)和體外腫瘤侵襲性增加,促進(jìn)乳腺癌的進(jìn)展[11]。環(huán)狀RNA circANKS1B和circAGFG1在三陰型乳腺癌組織及細(xì)胞中高表達(dá),circANKS1B表達(dá)與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,進(jìn)展期乳腺癌有關(guān),通過與miR-148a-3p和miR-152-3p的海綿作用,促進(jìn)上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化[12]。
本實驗通過環(huán)狀RNA芯片篩選出特異性低表達(dá)的環(huán)狀RNA circ_0030777,通過qRT-PCR和Sanger測序進(jìn)一步驗證發(fā)現(xiàn),與良性病變組織比較,乳腺癌中環(huán)狀RNA circ_0030777表達(dá)明顯下調(diào),通過ROC曲線發(fā)現(xiàn),circ_0030777是乳腺癌中的一種較好的分子標(biāo)志物。以ROC曲線截點為分界點,將環(huán)狀RNA circ_0030777表達(dá)分為高表達(dá)組和低表達(dá)組,進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),環(huán)狀RNA circ_0030777表達(dá)與ER、PR和Ki-67有關(guān)。Ki-67是與細(xì)胞增殖密切相關(guān)的細(xì)胞核蛋白,在有絲分裂時逐漸增加到最大值[13]。腫瘤細(xì)胞中Ki-67表達(dá)水平變化與腫瘤細(xì)胞的增殖活性有關(guān),部分反映了腫瘤的侵襲性,而腫瘤細(xì)胞的侵襲性與疾病預(yù)后密切相關(guān)。歐洲腫瘤標(biāo)志物小組指南中提出,Ki-67表達(dá)升高與乳腺癌患者的不良預(yù)后獨立相關(guān)[14]。ER和PR作為乳腺癌內(nèi)分泌治療的重要指標(biāo),表明了其在乳腺癌發(fā)生、發(fā)展過程中的重要地位。研究顯示,ER在乳腺癌組織中的表達(dá)高于非乳腺癌組織;而乳腺癌高發(fā)人群較低發(fā)人群的乳腺上皮中有更多ER表達(dá),ER可以促進(jìn)乳腺正常和新生上皮細(xì)胞的增殖,從而增加乳腺癌的發(fā)病率及復(fù)發(fā)率[15]。這些證據(jù)均表明circ_0030777在乳腺癌中的重要作用。
綜上所述,環(huán)狀RNA是乳腺癌診斷和預(yù)后的重要生物學(xué)標(biāo)志物。本實驗結(jié)果顯示,環(huán)狀RNA circ_0030777在乳腺癌中低表達(dá),提示其在乳腺癌的發(fā)生、發(fā)展中具有重要作用。Circ_0030777低表達(dá)與ER、PR和Ki-67表達(dá)相關(guān),為其成為高特異性和敏感性的乳腺癌分子標(biāo)志物提供實驗依據(jù)。