龔予希,張 響,翟博雅,楊野梵,張智弘
彌漫大B細胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma, DLBCL)是一種具有侵襲性、復(fù)雜性、高致死率的非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin’s lymphoma, NHL),其臨床表現(xiàn)、免疫表型和分子特征異質(zhì)性明顯[1]。近年臨床聯(lián)合應(yīng)用利妥昔單抗與CHOP(環(huán)磷酰胺-阿霉素-長春新堿-強的松)[1],一定程度上提高了DLBCL的治療效果,但仍有部分患者出現(xiàn)復(fù)發(fā)、耐藥甚至死亡。若在診斷初期即能鑒別出高風險患者,就可以對其實施更有效的治療策略,延長其生存期并改善患者生活質(zhì)量。然而,由于DLBCL的異質(zhì)性,國際預(yù)后指數(shù)(international prognostic index, IPI)[2]等臨床預(yù)后模型不能準確地預(yù)測淋巴瘤的臨床病程,具有相同預(yù)后評分的患者也會出現(xiàn)不同的結(jié)果。因此,需要新的生物學(xué)標志物輔助DLBCL的預(yù)后判斷和風險分層。
長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA, LncRNA)是長度超過200個核苷酸,通常具有低序列保守性的RNA[3]。人類基因組中有15 000~60 000種LncRNA存在[4]。根據(jù)LncRNA的定位可將其分為五類:(1)基因間LncRNA;(2)反義LncRNA;(3)內(nèi)含子LncRNA;(4)雙向LncRNA;(5)重疊正義LncRNA[5]。對腫瘤樣本的全基因組關(guān)聯(lián)研究已經(jīng)確定了大量與各種癌癥發(fā)生和轉(zhuǎn)移相關(guān)的LncRNA[6],且已有研究表明LncRNA的表達失調(diào)與DLBCL預(yù)后密切相關(guān)。因此,探討LncRNA在DLBCL預(yù)后中的價值具有重要意義。該文結(jié)合既往文獻報道,對與DLBCL預(yù)后相關(guān)的LncRNA及其作用進行綜述(表1)。
表1 與DLBCL預(yù)后相關(guān)的LncRNA
1.1 PVT1PVT1定位于染色體8p21區(qū)域,屬于基因間LncRNA,是重要的表觀遺傳調(diào)節(jié)因子,可通過調(diào)節(jié)細胞周期進展來影響腫瘤細胞增殖,在多種腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中均發(fā)揮了生物學(xué)作用[7]。Yang等[8]發(fā)現(xiàn)PVT1在DLBCL中的表達顯著增高,且與MYC表達、腫瘤大小和Ki-67增殖指數(shù)和結(jié)外受累器官數(shù)目呈正相關(guān)。PVT1高表達患者的總生存率和5年無進展生存率較PVT1低表達組均更低(61.4%vs82.5%和51%vs72.8%)。此外,Yang等還評估了PVT1表達和IPI系統(tǒng)預(yù)測預(yù)后的能力,發(fā)現(xiàn)伴PVT1低表達和IPI低評分的患者預(yù)后最好,而伴PVT1高表達和IPI高評分的患者預(yù)后最差,提示PVT1是潛在的影響DLBCL預(yù)后的因素。
1.2 PANDAPANDA是基因間LncRNA,位于CDKN1A(p21)轉(zhuǎn)錄起始區(qū)上游5 kb處,具有調(diào)節(jié)細胞增殖和凋亡的功能[9]。研究表明轉(zhuǎn)錄因子p53可與PANDA的啟動子結(jié)合,促使PANDA激活,進而抑制MAPK/ERK通路的活性,參與調(diào)節(jié)腫瘤的增殖和細胞周期[10]。在DLBCL中p53和PANDA表達均降低,且PANDA表達與DLBCL臨床特征(如B癥狀、Ann Arbor分期、IPI評分)及對化療的反應(yīng)性相關(guān)。PANDA在診斷和預(yù)測DLBCL預(yù)后等方面也有重要價值,其診斷的敏感性和特異性分別為60.29%和77.94%;Kaplan-Meier生存分析也發(fā)現(xiàn)PANDA高表達患者的總生存期和無進展生存期更長(P=0.003),且多因素分析也表明PANDA是獨立的預(yù)后因素[10]。
1.3 NONHSAG026900由于DLBCL可以發(fā)生于正常B細胞發(fā)展的任何階段,Zhao等[11]利用GEO數(shù)據(jù)庫將DLBCL樣本與正常B細胞分化的五個階段(初始B細胞、中心母細胞、中心細胞、記憶B細胞和漿細胞)的樣本進行對比,發(fā)現(xiàn)基因間LncRNA NONHSAG026900在DLBCL中表達顯著降低,且其低表達可能是受轉(zhuǎn)錄起始位點上游146 bp的CpG甲基化調(diào)控。研究發(fā)現(xiàn),non-GCB亞組較GCB亞組NONHSAG026900的表達水平更低,且無論接受哪種化療方案(CHOP或R-CHOP),伴NONHSAG026900低表達患者的預(yù)后都更差,表明NONHSAG026900不僅可以用于鑒別DLBCL的細胞起源亞型,也可以用于預(yù)測DLBCL患者的預(yù)后,且輔助證明了“non-GCB型患者比GCB型患者預(yù)后更差”。盡管NONHSAG026900作為獨立預(yù)后因素的預(yù)測能力略次于IPI系統(tǒng)(受試者工作特征曲線下面積分別為0.703、0.715),但聯(lián)合NONHSAG026900和IPI系統(tǒng)可以提高預(yù)測能力。
1.4 HOTAIRHOTAIR位于12號染色體上HOXC基因簇內(nèi),是一種基因間LncRNA,其過表達在多種實體腫瘤中常見,如食管癌、胃癌、腸癌、肝癌、胰腺癌、肺癌、乳腺癌、子宮內(nèi)膜癌等,并且與這些腫瘤的不良預(yù)后相關(guān)[12-13]。Yan等[14]發(fā)現(xiàn)HOTAIR在DLBCL中表達水平顯著升高,并且可以通過PI3K/AKT/NF-κB通路調(diào)節(jié)DLBCL細胞增殖。敲低HOTAIR,PI3K、AKT、NF-κB的磷酸化水平顯著下降,且功能實驗也表明敲低HOTAIR伴隨DLBCL細胞增殖的抑制、細胞周期阻滯于G2/M期及細胞凋亡的增加。此外,HOTAIR表達與DLBCL臨床分期、腫瘤大小、B癥狀和IPI評分等臨床特征呈正相關(guān),但其在DLBCL預(yù)后中的作用仍有爭議。Yan等[14]和葉麗花等[15]的研究均發(fā)現(xiàn),伴HOTAIR高表達的DLBCL患者預(yù)后更差,這與HOTAIR在其他實體腫瘤預(yù)后中的作用一致;但Oh等[16]的研究提出了相反的觀點,他們認為HOTAIR高表達與較好的生存結(jié)果相關(guān)。因此,還需要更多的研究來探討HOTAIR在DLBCL預(yù)后中的作用。
1.5 SNHG12SNHG12定位于染色體1p35.3,屬于基因間LncRNA,與腎細胞癌、子宮頸癌、前列腺癌、肝細胞癌、直腸癌等均有密切關(guān)系。Chen等[17]通過比較80對DLBCL和反應(yīng)性淋巴結(jié)增生樣本中LncRNA的表達水平,發(fā)現(xiàn)SNHG12在DLBCL中高表達,該結(jié)果在DLBCL細胞系中被進一步證明。SNHG12表達與臨床病理特征的相關(guān)性分析表明,SNHG12高表達患者更易出現(xiàn)在Ⅲ+Ⅳ期、結(jié)外受累和伴LDH異常增高中。比較160例患者的生存情況發(fā)現(xiàn),SNHG12低表達組患者具有更高的總生存率和無進展生存率,表明SNHG12是一個有意義的預(yù)后因素。在機制上,SNGH12發(fā)揮內(nèi)源競爭RNA(competing endogenous RNAs, ceRNA)作用,通過吸附miR-195競爭性抑制其表達,從而促進DLBCL細胞的增殖、遷移和侵襲。
1.6 FIRREShi等[18]在DLBCL中發(fā)現(xiàn)了537個表達水平改變的LncRNA,其中基因間LncRNA FIRRE表達水平升高最顯著。Kaplan-Meier生存分析結(jié)果表明,伴FIRRE高表達患者的總生存期較伴FIRRE低表達患者明顯縮短,是潛在的預(yù)測預(yù)后因子。生物信息學(xué)分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),MYC是FIRRE的上游轉(zhuǎn)錄激活子,MYC通過與FIRRE的啟動子結(jié)合正向調(diào)節(jié)FIRRE表達。Wnt/β-catenin通路是FIRRE的下游影響通路,沉默F(xiàn)IRRE不僅導(dǎo)致了β-catenin、Cyclin D1和C-myc的表達下降,還抑制了β-catenin向細胞核的轉(zhuǎn)運,進而抑制DLBCL細胞的增殖,促進其凋亡。
1.7 其他LncRNA研究發(fā)現(xiàn)LUNAR1[19]、HULC[20]和PEG10[21]高表達,LincRNA-p21[22]低表達均與較差的總生存率和無進展生存率相關(guān),且Cox回歸分析表明它們具有獨立的預(yù)測預(yù)后價值。用類似的方法研究LncRNA NEAT1_1[23]、OR3A4[24]、BCAR4[25]、TP73-AS1[26]、MUC5-B-AS1[27]、RP11-513G11.1[28],發(fā)現(xiàn)DLBCL中LncRNA的表達水平均升高,同時也具有獨立的預(yù)測DLBCL預(yù)后價值。利用LncRNA表達與DLBCL預(yù)后的關(guān)系輔助IPI系統(tǒng),一定程度上可以增加預(yù)測的可信度,有助于我們了解DLBCL的發(fā)展規(guī)律,采取最佳治療方案,也可以高效地對治療效果進行評估。
2016年,Sun等[29]分析1 043例GEO數(shù)據(jù)庫DLBCL患者的LncRNA表達譜,發(fā)現(xiàn)6個與生存結(jié)果顯著相關(guān)的LncRNA,并通過風險評分模型方法構(gòu)建了能將DLBCL患者分為具有顯著不同生存結(jié)局的高風險和低風險組six-LncRNA,其中MEE-AS1、CSMD2-AS1、RP11-360F5.1、RP11-25K19.1、CTC-467M3.1多在低風險組中表達,而SACS-AS1多在高風險組中表達。此外,six-LncRNA預(yù)測DLBCL預(yù)后不依賴于傳統(tǒng)臨床因素,提示six-LncRNA可以作為分子水平上的預(yù)后指標輔助IPI系統(tǒng)。
為進一步研究LncRNA的預(yù)后價值,Zhou等[30]于2017年利用GEO數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn)有156個LncRNA在GCB-DLBCL和ABC-DLBCL中表達有顯著差異,其中56個LncRNA在ABC亞組中表達上調(diào),100個LncRNA在GCB亞組中表達上調(diào)。他們在這156個LncRNA中篩選出17個在鑒別GCB和ABC亞組時預(yù)測精度較好的LncRNA(ENTPD1-AS1、SACS-AS1、SH3BP5-AS1、RP11-101C11.1、AC009892.10、RP1-68D18.4、MIR600HG、RP11-278 J6.4、RP11-203B7.2、CSMD2-AS1、CTC-467M3.1、RP4-788P 17.1、RP11-553 L6.5、CRNDE、RP11-519G 16.3、RP11-21 L19.1、MME-AS1),并將其稱為SubSigLnc-17。以SubSigLnc-17為特征的亞組患者臨床結(jié)果差異有顯著性(GCB和ABC亞組患者的5年總生存率分別為69.2%和44.1%),多變量Cox回歸分析證明SubSigLnc-17可以作為獨立的預(yù)測預(yù)后因子。
研究表明LncRNA和mRNA組合在乳腺癌和直腸癌中有較好的預(yù)后價值[31-32]。Gao等[33]為研究LncRNA-mRNA在DLBCL中是否也有風險分層的作用,從5個GEO數(shù)據(jù)集中篩選出11個RNA(包括9個mRNA和2個LncRNA),其mRNA中THOC1、EEF1A1、CCDC78、SLC35F4、SLC43A2和LncRNA中ZNF252P-AS1、SNHG16在長期生存DLBCL中的表達水平升高,而mRNA中CD1E、APBA2、PDK1、NR3C1的表達水平降低。他們將11個RNA整合構(gòu)建了一個MGRS模型,該模型與細胞周期、DNA復(fù)制和修復(fù)相關(guān)。以MGRS=0為截斷值,DLBCL被分為MGRS-high風險組和MGRS-low風險組,MGRS-high風險組患者的總生存率明顯低于MGRS-low風險組。此外,分層分析和多因素Cox回歸分析表明,MGRS可以獨立于IPI評分提供預(yù)后信息,且結(jié)合MGRS與IPI評分的預(yù)測效率更高、更具臨床實用性。
2000年Alizadeh等[34]根據(jù)基因表達譜對DLBCL進行免疫表型分型,2018年Schmitz等[35]、Rosenwald等[36]通過二代測序技術(shù)根據(jù)基因突變情況鑒別DLBCL的遺傳亞型,并進一步對DLBCL進行預(yù)后判斷和風險分層,使我們對DLBCL的臨床、形態(tài)和免疫表型譜的了解以及對DLBCL分子機制的認知均有了較大的深化;而這些知識正被轉(zhuǎn)化為新治療策略的設(shè)計和新型治療藥物的開發(fā)。根據(jù)DLBCL的分子發(fā)現(xiàn)進行預(yù)后分層及設(shè)計個性化的治療方案可能是現(xiàn)在最好的發(fā)展方向。近年研究報道表明,LncRNA可以調(diào)節(jié)DLBCL相關(guān)的代謝通路和基因表達,參與DLBCL細胞的凋亡、遷移、增殖等重要生物學(xué)過程,并且在DLBCL的診斷、預(yù)后中具有顯著價值,甚至影響患者對化療藥物的敏感性和耐藥,提示LncRNA可以作為DLBCL的分子標志物,提供預(yù)后相關(guān)信息并且是潛在的治療靶點。此外,多個LncRNA聯(lián)合、LncRNA與mRNA聯(lián)合、LncRNA與IPI系統(tǒng)聯(lián)合等均被證明具有更好的預(yù)測預(yù)后和進行風險分層的能力。隨著技術(shù)的發(fā)展,實時定量PCR法、表達譜基因芯片技術(shù)和高通量RNA測序技術(shù)等使LncRNA的檢測更加簡便高效。然而,LncRNA的功能和機制并未完全闡明,以及如何將LncRNA高效簡便的應(yīng)用至臨床診治過程中,仍需進一步分析。