亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接探究三拗片治療急性支氣管炎分子作用機(jī)制△

        2021-10-09 05:38:58滕龍飛陳佳麗周慶偉王鎵
        中國現(xiàn)代中藥 2021年8期
        關(guān)鍵詞:信號

        滕龍飛,陳佳麗,周慶偉,王鎵

        1.河南中醫(yī)藥大學(xué) 第一臨床醫(yī)學(xué)院,河南 鄭州 450046;2.河南中醫(yī)藥大學(xué) 第一附屬醫(yī)院 呼吸內(nèi)科,河南 鄭州 450000;3.河南中醫(yī)藥大學(xué) 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,河南 鄭州 450000

        急性支氣管炎發(fā)病率較高,部分可遷延發(fā)展為慢性支氣管炎、肺氣腫、慢阻肺等多種慢性肺系疾病,加重患者及社會負(fù)擔(dān)。三拗片(SAP)為《太平惠民和劑局方》中三拗湯的加味方,在三拗湯基礎(chǔ)上加入生姜,由君藥麻黃、臣藥苦杏仁、佐藥生姜及使藥甘草4 味中藥構(gòu)成,具有宣肺解表、降氣平喘之功效。生姜具有解表散寒、溫肺鎮(zhèn)咳、溫中止嘔的功效,因此加強(qiáng)了原方溫肺散寒的功效,并能調(diào)和方中麻黃對胃腸道的刺激。SAP劑型為片劑,具有易于服用,方便攜帶、貯藏保管等特點,因此臨床應(yīng)用較多。中醫(yī)臨床研究發(fā)現(xiàn),SAP 對于風(fēng)寒型急性支氣管炎有較好的療效[1]。陳麒等[2]研究表明,SAP對風(fēng)寒襲肺證急性支氣管炎患者的咳、痰、喘三大主癥具有明顯的改善作用,且無明顯不良反應(yīng),其中痊愈占22.50%,顯效占51.25%。SAP 治療兒童急性支氣管炎療效明顯,不良反應(yīng)少[3]。中藥治療疾病具有多成分、多靶標(biāo)、多通路的特點,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的出現(xiàn)使得方藥作用于人體的機(jī)制研究更具整體性和系統(tǒng)性[4]。本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,探討SAP治療急性支氣管炎作用機(jī)制及其物質(zhì)基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 SAP的主要化學(xué)成分及靶點檢索

        利用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(TCMSP,http://tcmspw.com/tcmsp.php),根據(jù)藥代動力學(xué)吸收、分布、代謝、排泄(absorption、distribution、metabolism、excretion,ADME)參數(shù)篩選口服生物利用度(OB)≥30%且類藥性(DL)≥0.18的SAP潛在活性成分及相應(yīng)的靶點,通過UniProt數(shù)據(jù)庫將靶點蛋白轉(zhuǎn)換為基因名,最終得到SAP 潛在活性成分的靶點基因,建立數(shù)據(jù)集。

        1.2 急性支氣管炎靶點基因獲取

        以“Acute bronchitis”為關(guān)鍵詞,在GeneCards(http://www.genecards.org/)、OMIM(https://omim.org/)、DrugBank(https://go.drugbank.com/)數(shù)據(jù)庫中檢索,獲得與急性支氣管炎相關(guān)的基因,重復(fù)基因僅保留1個。

        1.3 SAP治療急性支氣管炎潛在作用靶點預(yù)測

        通過Venny 2.1工具,將藥物潛在活性成分靶點與疾病靶點相映射,最終得到藥物-疾病共同靶點,即為SAP作用于急性支氣管炎的預(yù)測靶點。

        1.4 成分-靶點網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

        利用Cytoscape 3.6.1 軟件構(gòu)建成分-靶點網(wǎng)絡(luò),其中節(jié)點(node)代表SAP 活性成分、預(yù)測靶點,邊(edge)代表SAP活性成分與靶點相互作用關(guān)系。選取度(degree)和介數(shù)中心性(betweenness)大于平均值的化合物用于分子對接。

        1.5 PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及核心靶點篩選

        將SAP 治療急性支氣管炎的作用靶蛋白導(dǎo)入STRING 11.5(https://string-db.org/)數(shù)據(jù)庫,根據(jù)拓?fù)浞治霭械鞍紫嗷プ饔藐P(guān)系,并利用Cytoscape 3.6.1構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò),根據(jù)度值大小篩選排名前5的靶點作為核心靶點,用于分子對接。

        1.6 基因富集分析

        運(yùn)用DAVID 6.8 對共同靶點所涉及的基因功能和相關(guān)通路進(jìn)行富集分析,并將其結(jié)果可視化。

        1.7 分子對接

        將1.4 項下主要活性成分通過TCSMP 數(shù)據(jù)庫下載MOL2 格式文件,通過AutoDockTools 1.5.6軟件加氫后作為配體保存成pdbqt 文件;通過PDB 數(shù)據(jù)庫下載1.5 項下核心靶點PDB 格式文件,利用PyMOL 軟件刪除水和配體,通過AutoDock 軟件加氫后作為受體,保存成pdbqt 文件,利用AutoDock Vina 進(jìn)行分子對接,篩選結(jié)合能最低的結(jié)構(gòu)為最優(yōu)結(jié)構(gòu)。

        2 結(jié)果

        2.1 SAP活性化合物及潛在靶點篩選

        篩選出SAP 活性化合物共124 個,共預(yù)測靶點103 個;其中麻黃有效成分23 個、苦杏仁有效成分19個、甘草有效成分92個、生姜有效成分5個。

        2.2 急性支氣管炎潛在靶點預(yù)測

        檢索GeneCards、OMIM、DrugBank數(shù)據(jù)庫,剔除重復(fù)靶點后共獲得急性支氣管炎潛在靶點863個。

        2.3 SAP治療急性支氣管炎潛在作用靶點

        將SAP化合物靶點和急性支氣管炎靶點取交集,共得到103 個共同靶點,即SAP 治療急性支氣管炎潛在作用靶點,見圖1。

        圖1 SAP和急性支氣管炎靶點韋恩圖

        2.4 成分-靶點網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

        利用Cytoscape 3.6.1 軟件構(gòu)建出成分-靶點網(wǎng)絡(luò),篩選出活性化合物7 個,度值從大到小依次為槲皮素(quercetin)、山柰酚(kaempferol)、木犀草素(luteolin)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)、柚皮素(naringenin)、芒柄花黃素(formononetin)、甘草查耳酮A(licochalcone A),見圖2。

        圖2 SAP治療急性支氣管炎的成分-靶點網(wǎng)絡(luò)

        2.5 PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

        PPI 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建結(jié)果見圖3,共得到103 個節(jié)點、942條邊,平均節(jié)點度值為18.3,根據(jù)度值大小排名前5的核心靶點為細(xì)胞腫瘤抗原p53(TP53)、蛋白激酶B1(Akt1)、白細(xì)胞介素-6(IL-6)、腫瘤壞死因子(TNF)、血管內(nèi)皮生長因子A(VEGFA),度值分別為59、56、52、50、48。

        圖3 SAP治療急性支氣管炎PPI網(wǎng)絡(luò)

        2.6 GO及KEGG富集分析

        共富集得到GO 生物學(xué)過程575 條、細(xì)胞組分54 條、分子功能85 條。以P<0.05 為篩選條件,選取排名前10 的GO 條目繪制氣泡圖,見圖4,KEGG前10 條通路繪制氣泡圖,見圖5。其中在磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信號通路、TNF信號通路、流感、絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)信號通路、FoxO 信號通路、Toll 樣受體信號通路、缺氧誘導(dǎo)因子1(HIF-1)信號通路、百日咳、p53信號通路、核苷酸寡聚化結(jié)構(gòu)域(NOD)樣受體信號通路等方面靶點富集較為集中。

        圖4 SAP靶點的GO富集分析

        圖5 SAP治療急性支氣管炎靶點的KEGG通路富集分析

        2.7 分子對接

        分子對接結(jié)果顯示,槲皮素、山柰酚、木犀草素、β-谷甾醇、柚皮素、芒柄花黃素、甘草查耳酮A結(jié)合能均小于-5 kcal·mol-1(1 kcal·mol-1≈4.182 kJ·mol-1),均能較好地與急性支氣管炎靶蛋白結(jié)合,具體結(jié)合能信息見圖6。以上7 個活性化合物與Akt1 結(jié)合能的均值為-8.3 kcal·mol-1,是5個靶蛋白中最小值,因此Akt1 可能是SAP 治療急性支氣管炎的核心靶點。β-谷甾醇分子對接不能與靶蛋白殘基形成氫鍵,故排除,與Akt1 結(jié)合最好的為木犀草素,其次是槲皮素,分子對接模式見圖7。

        圖6 SAP活性成分分子對接結(jié)合能熱圖

        圖7 Akt1與木犀草素、槲皮素的分子對接

        3 討論

        急性支氣管炎是外界抗原感染所致的支氣管黏膜炎癥,發(fā)作以咳嗽、咯痰、喘息為特征,西醫(yī)臨床多從抗感染、止咳、平喘、祛痰等對癥治療為主,其治療方法單一且不良反應(yīng)多,急性期遷延不愈轉(zhuǎn)為慢性支氣管炎更為難治[5]。中西醫(yī)結(jié)合治療急性支氣管炎越來越得到認(rèn)可,大量研究證實了SAP 對于急慢性支氣管炎具有較好的臨床療效及安全性,相較于單純西醫(yī)治療,能夠明顯縮短病程、減少藥物不良反應(yīng)、提高免疫力、降低復(fù)發(fā)率[6-10]。本方源于《太平惠民和劑局方》中三拗湯,三拗來源于制法特點[11]:1)麻黃不去根、節(jié)。發(fā)汗而不過汗,麻黃莖

        在上屬陽,根在地下屬陰,正如肺之宣發(fā)肅降,一宣一降而復(fù)肺氣。2)杏仁不去皮、尖,留尖主發(fā)散,連皮主澀汗,也為發(fā)中有收。3)甘草不炙,取其補(bǔ)中有發(fā)。本方在三拗湯基礎(chǔ)上加入生姜1 味,加強(qiáng)了原方溫肺散寒、溫胃止嘔之功。

        研究顯示,急性毛細(xì)支氣管炎的氣道炎癥細(xì)胞多為中性粒細(xì)胞,其對于機(jī)體防御和炎癥修復(fù)至關(guān)重要,而Akt1 又是中性粒細(xì)胞表達(dá)的重要亞型,在細(xì)菌感染或中性粒細(xì)胞被激活時下調(diào),Akt1 的下調(diào)可減少中性粒細(xì)胞、單核細(xì)胞的炎癥反應(yīng),因此SAP 中的活性化合物可能通過下調(diào)Akt1 起到抗炎作用[12-14]。木犀草素和槲皮素能夠顯著地抑制促炎性細(xì)胞因子TNF-α、IL-6 及IL-1β,表明木犀草素和槲皮素具有良好的體外抗炎效果[15]。槲皮素還是一種廣譜抗菌不易耐藥的植物抗生素[16-17]。山柰酚能夠通過抑制肺組織促炎因子核轉(zhuǎn)錄因子-κB(NF-κB)、IL-1β、TNF-α表達(dá),對急性肺損傷具有保護(hù)作用。β-谷甾醇具有良好的抗炎及免疫調(diào)節(jié)作用[18]。研究顯示,β-谷甾醇可防止肺組織氣道炎癥的發(fā)生[19]。柚皮素能通過NF-κB 顯著抑制炎癥細(xì)胞及介質(zhì)的釋放,減輕脂多糖誘導(dǎo)的肺部炎癥[20]。芒柄花素可增加小鼠淋巴細(xì)胞數(shù)量及細(xì)胞因子的釋放,進(jìn)而調(diào)節(jié)免疫力[21]。甘草查耳酮A 可阻斷細(xì)胞外調(diào)節(jié)蛋白激酶1/2(ERK1/2)/NF-κB 來抑制炎癥因子的表達(dá),保護(hù)急性肺損傷小鼠[22]。PM2.5 觸發(fā)的呼吸系統(tǒng)炎癥可表現(xiàn)為VEGFA 顯著上調(diào)[23],分子對接結(jié)果發(fā)現(xiàn),槲皮素、木犀草素、山柰酚等可能通過調(diào)控VEGFA改善氣道炎癥。

        通過GO 生物學(xué)過程富集分析發(fā)現(xiàn),SAP 治療急性支氣管炎可能涉及凋亡過程、炎癥反應(yīng)、細(xì)胞增殖、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等生物過程,在急性支氣管炎的治療過程中起到關(guān)鍵作用。通過KEGG 通路富集分析發(fā)現(xiàn),SAP 主要活性成分靶點可能參與了PI3K-Akt信號通路、TNF信號通路、流感、MAPK信號通路、FoxO 信號通路、Toll 樣受體信號通路、HIF-1 信號通路、百日咳、p53 信號通路、NOD 樣受體信號通路,在急性支氣管炎的治療中發(fā)揮作用。人體免疫激活后,T 細(xì)胞分化釋放IL-6、TNF 等促炎因子進(jìn)行免疫[24]。抑制HIF-1α可以降低TNF-α和白細(xì)胞介素的表達(dá),表明HIF-1α對促炎因子的分泌起關(guān)鍵作用。各種Toll 樣受體可調(diào)節(jié)病毒復(fù)制,進(jìn)而影響病毒的發(fā)病[25]。

        綜上所述,SAP 治療急性支氣管炎的有效成分可能是槲皮素、山柰酚、木樨草素、β-谷甾醇、柚皮素、芒柄花黃素、甘草查耳酮A 等,這些成分可能作用 于TP53、Akt1、IL-6、TNF、VEGFA 等 靶點,通過PI3K-Akt、TNF、流感、MAPK、Toll樣受體、HIF-1等多條信號通路,共同參與抗炎、平衡細(xì)胞因子、免疫調(diào)節(jié)、抗病毒、抑菌而起到治療作用。本研究利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法初探SAP 治療急性支氣管炎的機(jī)制,但缺乏動物及體外細(xì)胞實驗驗證預(yù)測結(jié)果,具有一定局限性,有待進(jìn)一步研究。

        猜你喜歡
        信號
        信號
        鴨綠江(2021年35期)2021-04-19 12:24:18
        完形填空二則
        7個信號,警惕寶寶要感冒
        媽媽寶寶(2019年10期)2019-10-26 02:45:34
        孩子停止長個的信號
        《鐵道通信信號》訂閱單
        基于FPGA的多功能信號發(fā)生器的設(shè)計
        電子制作(2018年11期)2018-08-04 03:25:42
        基于Arduino的聯(lián)鎖信號控制接口研究
        《鐵道通信信號》訂閱單
        基于LabVIEW的力加載信號采集與PID控制
        Kisspeptin/GPR54信號通路促使性早熟形成的作用觀察
        久久人人爽天天玩人人妻精品| 亚洲一区二区三区偷拍厕所| 精品香蕉一区二区三区| 欧美精品videossex少妇| 国产中文制服丝袜另类| 亚洲老女人区一区二视频| 美丽的小蜜桃在线观看| 中文亚洲av片在线观看| 国产伦精品一区二区三区视| 免费观看成人稀缺视频在线播放| 日韩美女亚洲性一区二区| 337p日本欧洲亚洲大胆精品| 亚洲精品国产综合一线久久| 开心五月婷婷综合网站| 91三级在线观看免费| 一本色道无码道dvd在线观看| 亚洲激情成人| 久久夜色精品国产亚洲av老牛 | 国产欧美一区二区成人影院| 日韩乱码精品中文字幕不卡| 亚洲一区二区三区特色视频| 中文字幕在线观看亚洲日韩| 99热门精品一区二区三区无码| 亚洲天堂一区二区三区视频| 无码一区二区三区| 亚洲av无码专区在线电影| 久久亚洲国产精品五月天| 国产天堂av在线播放资源| 国产精品人妻一区二区三区四| 免费人成毛片乱码| 亚洲成人黄色av在线观看| 一本色综合网久久| 亚洲av日韩av高潮潮喷无码| 国产在线天堂av| 午夜精品久久99蜜桃| 亚洲国产精品ⅴa在线观看| 亚洲成av人片无码不卡播放器| 青青草视频在线播放观看| 妺妺窝人体色www在线| 91免费永久国产在线观看| 无码一区二区三区网站|