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        跨膜絲氨酸蛋白酶2與肺腺癌和肺鱗癌預后的關系

        2021-09-26 11:36:06鄧劍雄鐘方炎顧偉國
        南昌大學學報(醫(yī)學版) 2021年4期
        關鍵詞:肺癌數(shù)據(jù)庫水平

        鄧劍雄,鐘方炎,顧偉國,邱 峰

        (南昌大學a.研究生院醫(yī)學部; b.第一附屬醫(yī)院腫瘤科,南昌 330006)

        肺癌是全球發(fā)病率和病死率最高的惡性腫瘤[1],其中80%以上為非小細胞肺癌,主要分為肺腺癌和肺鱗狀細胞癌[2]。盡管近年來非小細胞肺癌的診斷和治療策略在明顯的發(fā)展和進步,如靶向藥和免疫檢查點抑制劑的使用,但非小細胞肺癌的生存預后仍不盡人意[3-4]。因此,探索更加有效的生物標志物和新的治療靶點尤為重要。

        跨膜絲氨酸蛋白酶2(TMPRSS2)是一種蛋白質(zhì)編碼基因,其編碼的蛋白屬于絲氨酸蛋白酶家族蛋白。在前列腺癌細胞中,TMPRSS2基因被雄激素所上調(diào),其激活多種底物,如促肝細胞生長因子、蛋白酶活化受體2和間質(zhì)蛋白酶等,從而導致前列腺癌細胞的細胞外基質(zhì)破壞和癌細胞的轉移[5-7]。然而TMPRSS2在其他腫瘤中研究甚少,本文采用數(shù)據(jù)庫分析的方法探討TMPRSS2在肺腺癌和肺鱗狀細胞癌中的表達及其對患者預后的影響。

        1 資料與方法

        1.1 TMPRSS2的篩選

        在Oncomine數(shù)據(jù)庫(https://www.oncomine.org/)分析TMPRSS2在多種腫瘤中mRNA的表達水平[8]。篩選條件為P-value:0.01;Gene rank:Top 10%;Fold change:2;Data type:mRNA。在GEPIA(https://cistrome.shinyapps.io/timer/)數(shù)據(jù)庫[9]使用RNA測序數(shù)據(jù)進一步分析TMPRSS2在肺腺癌和肺鱗狀細胞癌中的mRNA表達情況。

        1.2 TMPRSS2啟動子甲基化水平的評估

        UALCAN(http://ualcan.path.uab.edu/index.html)數(shù)據(jù)庫[10]是用于分析癌癥組學數(shù)據(jù)的綜合交互式網(wǎng)絡資源。UALCAN基于PERL-CGI構建,可用于評估不同基因的甲基化水平。使用UALCAN數(shù)據(jù)庫分析TMPRSS2在肺腺癌和肺鱗狀細胞癌中的啟動子甲基化水平,探討其差異表達的原因。

        1.3 TMPRSS2表達水平與預后的關系評估

        Kaplan-Meier plotter(https://kmplot.com/)數(shù)據(jù)庫[11]包含21種腫瘤的生存數(shù)據(jù)。使用Kaplan-Meier plotter數(shù)據(jù)對肺腺癌和肺鱗狀細胞癌中TMPRSS2的表達水平與預后的關系進行分析,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。明確TMPRSS2在肺癌中的促進或抑制作用。

        1.4 TMPRSS2表達與免疫浸潤的相關性分析

        通過TIMER(https://cistrome.shinyapps.io/timer/)數(shù)據(jù)庫[12]評估在肺腺癌和肺鱗狀細胞癌中TMPRSS2表達與免疫細胞浸潤水平的相關性,通過多因素Cox比例分析模型進一步分析免疫細胞浸潤水平對預后的影響。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結果

        2.1 TMPRSS2在人類腫瘤中的轉錄表達水平

        Oncomine數(shù)據(jù)庫分析結果顯示,TMPRSS2在膀胱癌、浸潤性乳腺癌間質(zhì)中的mRNA表達水平顯著增高,在乳腺癌、結直腸癌、食管癌、胃癌、頭頸部癌、腎癌、肝癌、肺癌、淋巴瘤和肉瘤中mRNA表達顯著下降(圖1A)。另外,基于TCGA數(shù)據(jù)庫中惡性腫瘤的RNA測序數(shù)據(jù),進一步研究了TMPRSS2在肺腺癌和肺鱗狀細胞癌中的表達水平,結果顯示,相比正常組織TMPRSS2在肺腺癌和肺鱗癌的mRNA表達水平顯著下降(P<0.05)(圖1B)。通過分析以上數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn),相比正常組織TMPRSS2總體上在腫瘤中的呈現(xiàn)低表達,在肺腺癌和肺鱗狀細胞癌中也是表達下降。

        A:TMPRSS2在多種腫瘤中的表達(紅色為高表達,藍色為低表達);B:TMPRSS2在肺癌中的表達。*P<0.01。LUAD:肺腺癌;LUSC:肺鱗狀細胞癌。

        2.2 TMPRSS2在肺癌中的啟動子甲基化水平降低

        UA2CAN數(shù)據(jù)庫分析結果顯示,在TMPRSS2表達水平下降的肺腺癌和肺鱗狀細胞癌中,相比正常組織的TMPRSS2啟動子甲基化水平均顯著增高(P<0.05),見圖2。

        A:肺腺癌;B:肺鱗狀細胞癌。*P<0.001。

        2.3 TMPRSS2高表達與預后的關系

        肺腺癌中TMPRSS2高表達與較好的生存顯著相關(HR=0.49,95%CI0.39~0.63;P=3.9×10-9),而在肺鱗狀細胞癌中TMPRSS2表達水平與預后無顯著相關性(HR=1.15,95%CI0.89~1.48;P=0.28),見圖3。

        t/月 t/月

        2.4 TMPRSS2表達水平與免疫細胞浸潤的相關性分析

        TMPRSS2的表達與免疫浸潤水平的相關性分析顯示,在肺腺癌中TMPRSS2的表達與B細胞、CD4+T細胞、巨噬細胞和樹突狀細胞呈陽性相關(圖4A);在肺鱗狀細胞癌中TMPRSS2與B細胞、CD8+T細胞、CD4+T細胞、巨噬細胞、中性粒細胞和樹突狀細胞均呈陽性相關,并與腫瘤純度呈負相關(圖4B)。

        A:肺腺癌;B:肺鱗狀細胞癌。

        2.5 免疫細胞浸潤水平對預后的影響

        TMPRSS2的表達水平與腫瘤中部分的免疫細胞浸潤存在相關性,因此進一步分析免疫細胞浸潤水平對預后的影響。多因素Cox比例分析模型分析結果顯示,在肺腺癌中,B細胞高浸潤水平和TMPRSS2高表達與較好的預后有關,而CD4+T細胞的高浸潤水平與較差的預后有關(圖5A)。而肺鱗狀細胞癌中相關免疫細胞浸潤水平對預后無顯著影響(圖5B)。

        A:肺腺癌;B:肺鱗狀細胞癌。

        3 討論

        TMPRSS2是一種雄激素反應性絲氨酸蛋白酶,可裂解SARS-CoV-2的刺突蛋白,促進病毒進入和激活[13]。它在肺外的許多組織中表達,并因其在前列腺上皮細胞中的主要表達和在前列腺癌發(fā)生中的重要作用而廣為人知[6-7]。癌癥已被確定為COVID19的危險因素,并且肺癌為最常見類型[14]。然而尚未有TMPRSS2在肺癌中的系統(tǒng)分析,因此本文對TMPRSS2在肺癌中的表達和預后的關系進行了分析。

        本研究發(fā)現(xiàn),在肺腺癌和肺鱗狀細胞癌中,TMPRSS2的轉錄水平相比正常肺組織均顯著下降(P<0.05),為探索TMPRSS2表達下降的原因,對其在肺癌中的甲基化水平進行分析發(fā)現(xiàn),TMPRSS2的啟動子甲基化水平均呈現(xiàn)顯著的增高(P<0.05)。啟動子區(qū)域的高水平甲基化可使基因的轉錄過程沉默[15],因此在肺腺癌和肺鱗狀細胞癌中TMPRSS2啟動子的甲基化高水平可能導致了其轉錄表達水平下降。

        另外,高表達的TMPRSS2與肺腺癌患者的較好預后相關(HR=0.49,95%CI0.39~0.63;P=3.9×10-9),TMPRSS2可能在肺腺癌中扮演抑癌基因的角色。進一步對腫瘤免疫細胞浸潤情況分析發(fā)現(xiàn),肺腺癌中TMPRSS2的表達水平與B細胞和CD4+T細胞的浸潤水平正相關(P<0.05),并且免疫微環(huán)境中的B細胞的浸潤水平增高與肺腺癌的較好預后相關,而CD4+T細胞恰好相反。研究表明,腫瘤浸潤B細胞可通過分泌腫瘤特異性抗原,促進T細胞的反應從而發(fā)揮抗腫瘤效應[16]。而CD4+T細胞的兩個亞群,調(diào)節(jié)性T細胞(Treg)和輔助性T細胞17(Th17)可通過免疫抑制和促炎的機制促進肺癌的進展和轉移[17]。腫瘤微環(huán)境和腫瘤組織間復雜的相互作用,調(diào)節(jié)著腫瘤的生長、侵襲和轉移的過程[18]。根據(jù)本研究結果,TMPRSS2的表達上調(diào)可能促進B細胞的腫瘤浸潤水平,從而延長肺腺癌患者的生存時間。

        總之,TMPRSS2在肺腺癌和肺鱗狀細胞癌中的表達均顯著下降,TMPRSS2的表達水平可能通過免疫細胞的浸潤水平影響肺腺癌患者的預后。本研究僅為生物信息學分析,有必要進行進一步的功能和臨床驗證。

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